序列分析
- 麥魚線粒體基因組序列測定與結(jié)構(gòu)特征分析
粒體基因組；序列分析；系統(tǒng)發(fā)育進化；物種鑒定 麥魚（Rhinogobius sp.） 屬鱸形目（Perciformes），鰕虎魚亞目（Gobioidei），鰕虎魚科（Gobiidae），吻鰕虎魚屬（Rhinogobius），為安徽省池州市東至縣所特有的小型魚類之一，因盛產(chǎn)于刈麥季節(jié)而定名，與著名的廬山石魚屬于同一種類[1]。迄今對于麥魚的研究甚少，麥魚準確的物種鑒定、分類地位及遺傳多樣性尚未確定，現(xiàn)僅有根據(jù)形態(tài)學特征進行的分類研究，其養(yǎng)殖潛力尚待評估與開
河北漁業(yè) 2023年9期2023-09-28
- 河南省一例番鴨源小鵝瘟病毒株的鑒定及VP1基因序列分析
鴨；小鵝瘟；序列分析中圖分類號：S858.32 文獻標識碼：B 文章編號：1673-1085（2023）08-0054-05小鵝瘟（Gosling plague）是由小鵝瘟病毒（Gosling plague virus，GPV）引起的一種急性或亞急性的敗血性傳染病。該病具有傳播快、發(fā)病率高及致死率高等特點，給水禽生產(chǎn)造成巨大的經(jīng)濟損失。小鵝瘟病毒主要侵害30日齡以內(nèi)的雛鵝或雛番鴨，而隨著雛鵝或雛番鴨日齡的增大，其發(fā)病率及致死率會顯著下降[1-3]。GP
家禽科學 2023年8期2023-08-28
- 信息化創(chuàng)新課堂的實踐診斷與優(yōu)化之道
進行特征環(huán)節(jié)序列分析，借助樣本數(shù)據(jù)中教學課例的信息技術應用特征進行分析以了解課堂教學中的技術應用特點，依據(jù)課堂教學課例視頻對教師的TPACK知識能力進行評分。通過研究獲取技術支持下的課堂教學特點、課堂技術應用特點、教師的TPACK知識能力現(xiàn)狀及未來的改進提升路向，為持續(xù)推進教師數(shù)字素養(yǎng)提升培訓、技術與課堂教學的深度融合提供數(shù)據(jù)支撐和學理建議。關鍵詞：創(chuàng)新課堂；技術應用；序列分析；TPACK中圖分類號：G434 文獻標識碼：A本文系教育部教育技術與資源發(fā)展中
中國電化教育 2023年8期2023-08-26
- 教師間接語言助力課堂“提質(zhì)增效”
過聚類分析和序列分析對教師間接語言的數(shù)量結(jié)構(gòu)進行了探索。此外，研究選取接納情感、表揚、接受或利用學生想法三類研究不足且數(shù)量較少的間接語言，結(jié)合定量數(shù)據(jù)對其語句本身的教學意義進行了歸納與總結(jié)。研究發(fā)現(xiàn)，教師間接語言促進了課堂互動質(zhì)量提升和學生高效學習。文章最后提出了三類間接語言的設計和使用策略：及時接納學生感受、深度利用學生觀點、多運用描述式表揚，以期為教師課堂教學提供具體的教學指導。[關鍵詞] 自然語言處理； 話語分析； 教師間接語言； 聚類分析； 序列分
電化教育研究 2023年7期2023-07-21
- 小麥光溫敏雄性不育系BS237ω-黑麥堿基因克隆及序列分析
：基因克?。?span id="syggg00" class="hl">序列分析：乳糜瀉中圖分類號：S512.1：Q785 文獻標識號：A 文章編號：1001-4942（2023） 03-0001-08黑麥（Secale cereale L.）1R染色體短臂（1RS）取代普通小麥1B染色體短臂（1BS）形成的1BL/1RS易位系攜帶了抗葉銹、條銹和白粉病等優(yōu)良基因，具有抗性好、豐產(chǎn)性好、適應性廣等優(yōu)點，在育成的小麥品種中占有30％以上的比例。黑麥種子中的醇溶性儲藏蛋白被稱作黑麥堿（seca-lin），1RS的引入使
山東農(nóng)業(yè)科學 2023年3期2023-05-30
- 紡織品霉變微生物的分離純化與鑒定
NA-ITS序列分析，并在NCBI核酸序列數(shù)據(jù)庫里比較序列同源性，鑒定為5個種，分別為謝瓦式曲霉、指狀青霉、聚曲多霉、米根霉和黑曲霉。文章利用形態(tài)學方法結(jié)合ITS序列分析鑒定霉菌種類，使得獲取結(jié)果更加快速和精準，為紡織品防霉基礎研究與抗霉材料研發(fā)提供參考。 關鍵詞： ?棉織物;霉菌;形態(tài)學;序列分析;純化與鑒定中圖分類號： TS117.6 文獻標志碼： A文章編號： 1001 7003（2022）03 0040 05引用頁碼： 031106DOI： 10.
絲綢 2022年3期2022-03-19
- 雞傳染性喉氣管炎實驗室診斷與序列分析
斷;PCR;序列分析中圖分類號：S816.7 文獻標識碼：B文章編號：1673-1085（2022）01-0006-06傳染性喉氣管炎（infectious laryngotracheitis， ILT）是由傳染性喉氣管炎類病毒（infectious laryngotracheitis virus， ILTV）引起的雞的一種急性、高度接觸性呼吸道傳染病。該病主要侵害雞喉頭和氣管的上皮細胞，同時也對鼻竇、氣囊和肺等組織產(chǎn)生影響，其特征為呼吸困難、咳嗽，喉和氣
家禽科學 2022年1期2022-03-17
- 黃獨微型塊莖環(huán)阿屯醇合酶基因克隆與序列分析
序列，并進行序列分析。通過黃獨微型塊莖轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫篩選得到 CAS基因的核心片段，利用RT-PCR 技術獲得CAS 基因保守片段，采用cDNA末端快速擴增（RACE）技術獲得CAS 基因的 3′及 5′末端序列，并采用生物信息學方法進行序列分析。結(jié)果表明，黃獨微型塊莖CAS基因編碼序列長2 280 bp，編碼814 bp的氨基酸序列，相對分子量為86 665.17 u，等電點為 6.21。CAS蛋白主要是由α螺旋（3366%）、延伸鏈（21.62%）以及無
江蘇農(nóng)業(yè)科學 2022年4期2022-03-11
- 侵染廣西番茄的番茄黃化曲葉病毒的分子鑒定
分子鑒定; 序列分析中圖分類號： S 436.412.11文獻標識碼： ADOI： 10.16688/j.zwbh.2020278Molecular identification of Tomato yellow leaf curl virus in Guangxi provinceSU Qin1#， CUI Lixian1#， CHEN Qimin2， XIE Huiting1， CHEN jinqing1，QIN Bixia1， ZHU Yingzhi
植物保護 2021年5期2021-10-12
- “SH6”蘋果矮化中間砧SnRK2基因的克隆及生物信息學分析
征。[結(jié)果]序列分析表明，SnRK2的CDS序列長度：SnRK2.6為956 bp，SnRK2.7為1 013 bp，SnRK2.8為1 072 bp，分別編碼318、337和357個氨基酸的蛋白質(zhì);SnRK2蛋白無明顯的疏水性，主要定位于細胞質(zhì);3種SnRK2序列相似性較高，都具有PKc_like超級家族和S_TKc家族特有的結(jié)構(gòu)。[結(jié)論]這3種SnRK2基因可能在蘋果非生物脅迫方面發(fā)揮重要作用。關鍵詞?“SH6”;SnRK2;非生物脅迫;基因克隆;序列
安徽農(nóng)業(yè)科學 2021年9期2021-06-22
- 芒果細菌性角斑病菌內(nèi)切葡聚糖酶基因的克隆與表達分析
糖酶;克隆;序列分析中圖分類號：S435? ? ? 文獻標識碼：ACloning and Expression Analysis of Endo-1，4-β-D-glucanase Gene of Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicaeYAO Quansheng， YANG Qian， LIU Feng*， ZHAN RulinSouth Subropical Crops Research Institute， Ch
熱帶作物學報 2021年4期2021-06-15
- 毛頭鬼傘漆酶基因的預測及其生物信息學分析
生物信息學;序列分析;三維結(jié)構(gòu)中圖分類號： S188文獻標志碼： A文章編號：1002-1302（2021）05-0067-08漆酶（laccase，E.C.1.10.3.2）也稱對苯二酚氧化還原酶，能對酚類物質(zhì)進行單電子氧化，利用氧作為最終的電子受體，生成水作為唯一副產(chǎn)品。漆酶主要參與生物合成、木質(zhì)素降解、形態(tài)發(fā)生及色素的生物合成等過程[1]。漆酶廣泛存在于植物[2]、真菌[3]、細菌[4]和昆蟲[5]中，真菌漆酶參與黑色素的產(chǎn)生、子實體的形成及植物發(fā)病
江蘇農(nóng)業(yè)科學 2021年5期2021-04-22
- 新西蘭兔RBM4基因的克隆、序列分析及組織表達
基因;克隆;序列分析;表達;新西蘭兔中圖分類號： S852.2文獻標志碼： A文章編號：1002-1302（2021）02-0033-04收稿日期：2020-11-09基金項目：現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術體系建設專項（編號：CARS-43-C-1）。作者簡介：魏后軍（1986—），男，江蘇南京人，碩士，助理研究員，主要從事家兔疾病防治與獸醫(yī)生物技術研究。E-mail：whj280941235@126.com。通信作者：王芳，博士，研究員，主要從事家兔重要疫病致病機制
江蘇農(nóng)業(yè)科學 2021年2期2021-03-22
- 廚余垃圾堆肥腐熟降解菌株的篩選與鑒定
S rDNA序列分析進行菌株種屬的鑒定，菌株Y1、Y3均屬于芽孢桿菌菌屬（Bacillus），其中菌株Y1為枯草芽孢桿菌（Bacillus subtilis），菌株Y3為貝萊斯芽孢桿菌（Bacillus velezensis）。關鍵詞：腐熟降解菌;纖維素酶活性;序列分析;芽孢桿菌中圖分類號：S182;S141.4?? 文獻標志碼： A文章編號：1002-1302（2021）23-0213-06收稿日期：2021-07-02基金項目：國家自然科學基金面上項目
江蘇農(nóng)業(yè)科學 2021年23期2021-01-02
- 癭蚊科3種昆蟲核糖體DNA的克隆及序列分析
克隆、測序及序列分析，并對ITS-1在麥紅吸漿蟲4個地理種群中的遺傳變異情況進行分析。結(jié)果表明，從3種昆蟲中獲得的核糖體DNA序列包括：部分的18S rDNA（44 bp）、28S rDNA（37 bp），全部的ITS-1（487～535 bp），5.8S rDNA（121 bp）及ITS-2（336～352 bp）序列。3種昆蟲ITS序列的堿基差異百分比在17.21%～29.59%之間，共含有206個變異位點。ITS-1序列在麥紅吸漿蟲4個地理種群中比較
植物保護 2020年6期2020-12-28
- 基于數(shù)據(jù)場與3-D圖形表示的DNA序列分析
-I基因? 序列分析中圖分類號：Q78 ? ? ? ? ? 文獻標識碼：A 文章編號：1672-3791（2020）07（c）-0027-03DNA Sequence Analysis Based on Data Field and 3-D Graphical RepresentationZHENG Zhuo1? ZHAO Jialing1? LI Chun2*（1.School of Mathematics and Physics， Bohai Univ
科技資訊 2020年21期2020-12-24
- 番茄黃化曲葉病毒侵染危害海南番茄及其分子特征
;分子鑒定;序列分析;海南中圖分類號： S432.41? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 文獻標志碼： A 文章編號：2095-1191（2020）08-1970-07Tomato yellow leaf curl virus infecting tomato in Hainanand its molecular characteristicsTANG Ya-fei1，2， ZHOU Yang3， ZHANG Li1， LI Zheng-g
南方農(nóng)業(yè)學報 2020年8期2020-11-02
- 基于rDNA-ITS序列的甘肅甘南野生羊肚菌遺傳多樣性分析
S;羊肚菌;序列分析;甘肅甘南中圖分類號： S646.701 ?文獻標志碼： A ?文章編號：1002-1302（2020）17-0081-04羊肚菌（Morchella spp.）是羊肚菌科羊肚菌屬所有種類的總稱，是一類經(jīng)濟價值很高的珍稀野生食（藥）用真菌，具有較高的營養(yǎng)價值和藥用價值[1]。據(jù)有關資料顯示，羊肚菌含有多種生理活性物質(zhì)，尤其是蛋白質(zhì)含量極為豐富，同時還含有人體必需的各類氨基酸、維生素和鐵、鋅等多種礦質(zhì)元素[2-3]。在羊肚菌的分類學研究中
江蘇農(nóng)業(yè)科學 2020年17期2020-10-26
- 長春花茉莉酸-異亮氨酸合成酶CrJAR1生物信息學分析與原核表達
酸合成酶， 序列分析， 三級結(jié)構(gòu)預測， 原核表達中圖分類號：Q943文獻標識碼：A文章編號：1000-3142（2020）08-1181-07Abstract：Catharanthus roseus can produce a variety of terpeniod indole alkaloids， including a variety of natural anti-cancer， but the biosynthesis content is v
廣西植物 2020年8期2020-10-20
- 雞皮刺螨病的PCR診斷及18S rRNA·ITS·28S rRNA基因序列分析
刺螨;診斷;序列分析中圖分類號 S831.7 ?文獻標識碼 A文章編號 0517-6611（2020）18-0104-03Abstract An ectoparasite infection occurred in a laying hen farm in Jiangsu Province. It was suspected to be Dermanyssus gallinae disease by clinical inspection and micr
安徽農(nóng)業(yè)科學 2020年18期2020-10-09
- 柑橘大實蠅NPC2基因的序列分析和組織表達模式
C2基因; 序列分析; 組織表達模式中圖分類號： Q 966， S 436.66文獻標識碼： ADOI： 10.16688/j.zwbh.2019235Sequence analysis and tissue expression pattern of Niemann-Pick type C2 gene in Bactrocera minaxCHEN Jian， WANG Zhaoxiang， YANG Ling， YE Haixia， MAO Li， G
植物保護 2020年4期2020-08-25
- “自上而下”高分辨串聯(lián)質(zhì)譜法分析德谷胰島素的序列
自上而下”的序列分析策略，采用高分辨串聯(lián)質(zhì)譜法對德谷胰島素的氨基酸序列及B鏈C末端側(cè)鏈非蛋白修飾序列進行了全面的分析。優(yōu)化了德谷胰島素的還原條件及串聯(lián)質(zhì)譜的碰撞條件，結(jié)果表明，聯(lián)合使用50 mmol/L三（2-羧乙基）膦及6 mol/L鹽酸胍，在45℃下反應40 min即可充分還原德谷胰島素為兩條獨立的肽鏈;還原產(chǎn)物經(jīng)Accucore C18色譜柱分離，采用靜電場軌道阱高分辨串聯(lián)質(zhì)譜分析，當高能碰撞誘導裂解能量分別為20（A鏈）與25（B鏈）時，可獲得最豐
分析化學 2020年8期2020-08-21
- 蝴蝶蘭PhNAC1基因序列分析及對低溫脅迫的響應
低溫脅迫， 序列分析中圖分類號： Q785;Q786 ?文獻標識碼： A文章編號： 1000-3142（2020）06-0845-09開放科學（資源服務）標識碼（OSID） ：Abstract： NAC transcription factors are involved in many processes of plant development， which play an important role in stress response. The
廣西植物 2020年6期2020-07-30
- 羰基鐵對小鼠腸道大腸桿菌豐度的影響
物;胃腸道;序列分析，DNA;大腸桿菌;小鼠[中圖分類號] R574.4;R378.21 ?[文獻標志碼] A ?[文章編號] 2096-5532（2020）02-0137-03doi：10.11712/jms.2096-5532.2020.56.072 [開放科學（資源服務）標識碼（OSID）][網(wǎng)絡出版] http：//kns.cnki.net/kcms/detail/37.1517.R.20200417.1001.020.html;2020-04-1
青島大學學報（醫(yī)學版） 2020年2期2020-06-08
- 兔出血癥病毒2型的分離鑒定與序列分析
vp60基因序列分析和病毒復制試驗，對采集的病死家兔肝臟樣本進行病原鑒定。HA結(jié)果顯示，部分病死家兔的肝臟樣本不能引起血凝現(xiàn)象;RT-PCR結(jié)果顯示，樣品中出現(xiàn)了RHDV2的特異性條帶。對新發(fā)現(xiàn)毒株cDNA的RT-PCR產(chǎn)物進一步分析發(fā)現(xiàn)，所擴增vp60基因核苷酸序列與經(jīng)典RHDV vp60基因核苷酸序列的一致性為77.5%～80.1%，與RHDV2 vp60基因核苷酸序列的一致性為93.6%～96.1%，并且與RHDV2處于同一個進化分支。病毒復制試驗結(jié)
江蘇農(nóng)業(yè)學報 2020年2期2020-05-27
- 百日菊白粉菌的分子檢測與鑒定
轉(zhuǎn)錄間隔區(qū);序列分析中圖分類號：S435.672? 文獻標志碼： A? 文章編號：1002-1302（2020）06-0098-06百日菊（Zinnia elegans Jacq.）別稱百日草，為中藥材，以全草入藥。百日菊也是一年生草花主栽品種之一，其色彩豐富，花大、艷麗，花期長達百日，故得百日菊之美名。白粉病是百日菊常見的最重要病害之一，在生長區(qū)幾乎每年都普遍發(fā)生[1-3]。百日菊被白粉菌侵染后，最初葉片出現(xiàn)白色粉狀斑點，后病斑擴大或相連成片，發(fā)病后期葉
江蘇農(nóng)業(yè)科學 2020年6期2020-05-21
- 16種微生物蛋白酶的生物信息學分析
物;蛋白酶;序列分析;生物信息學;理化性質(zhì);蛋白結(jié)構(gòu);信號肽中圖分類號： S188+.3文獻標志碼： A文章編號：1002-1302（2020）04-0065-08收稿日期：2018-12-14基金項目：北京市自然科學基金（編號：2182019）;北京市教育委員會項目（編號：1-PXM2018-014306-000057/7）;國家自然科學基金青年科學基金（編號：51708005）;北京電子科技職業(yè)學院重點課題（編號：2019-KXZ）;北京市優(yōu)秀人才資助
江蘇農(nóng)業(yè)科學 2020年4期2020-04-16
- 交互行為分析軟件GSEQ在課堂觀察中的應用
的規(guī)律。滯后序列分析法能解決這一問題，交互行為分析軟件GSEQ能夠有效地處理行為序列數(shù)據(jù)，幫助分析課堂中的師生交互模式。本文以小學科學課的觀察數(shù)據(jù)為例，通過數(shù)據(jù)獲取、數(shù)據(jù)處理、數(shù)據(jù)分析三個步驟完成交互行為分析?！娟P鍵詞】序列分析;GSEQ;數(shù)據(jù)處理;數(shù)據(jù)分析【中圖分類號】G434? 【文獻標識碼】A【論文編號】1671-7384（2020）02、03-116-04GSEQ軟件介紹GSEQ是一種用于分析基于時間先后順序的觀測數(shù)據(jù)的計算機程序。它可以計算各種簡
中小學信息技術教育 2020年3期2020-04-03
- 白樺8個MYB基因的克隆及其序列分析
MYB基因;序列分析中圖分類號： S188文獻標志碼： A文章編號：1002-1302（2019）18-0093-05收稿日期：2018-05-15基金項目：黑龍江省教育廳項目（編號：1352MSYYB002）;研究生創(chuàng)新項目（編號：kjcx2018-80mdjnu）。作者簡介：王蓮萍（1994—），女，黑龍江省鶴崗人，碩士研究生，主要從事植物分子生物學與基因工程研究。E-mail：928718821@qq.com。通信作者：任如意，博士，教授，主要從事植
江蘇農(nóng)業(yè)科學 2019年18期2019-11-28
- 一株新城疫病毒Ｆ基因的克隆及其遺傳進化分析
基因;克隆;序列分析;遺傳進化;雞中圖分類號：Q78? ? ? ? ?文獻標識碼：A文章編號：0439-8114（2019）15-0132-04DOI：10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2019.15.031? ? ? ? ? ?開放科學（資源服務）標識碼（OSID）：Cloning and genetic evolution analysis of one strain of newcastle disease virusXU
湖北農(nóng)業(yè)科學 2019年15期2019-09-15
- 苧麻BnNramp2基因的克隆與生物信息學分析
基因;克隆;序列分析;苧麻中圖分類號：S563.101文獻標識碼：A文章編號： 1000-4440（ 2019） 03-0749-04重金屬是主要的環(huán)境污染物之一，所有重金屬對生物都有潛在的危害作用[1-6]。天然抗性相關巨噬細胞蛋白家族（Natural resistance-associated macrophage protein， NRAMP）是一類廣泛存在于微生物、植物、動物中的古老且高度保守的膜整合蛋白家族，參與大多數(shù)有機體的金屬離子（如Fe2+
江蘇農(nóng)業(yè)學報 2019年3期2019-09-10
- 青花菜BoMYB基因的克隆與序列分析
息學手段進行序列分析，包括尋找同源序列、同源序列蛋白質(zhì)翻譯比對、分析翻譯所得蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)和二級結(jié)構(gòu)，預測結(jié)構(gòu)域和構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。從青花菜中克隆得到的BoMYB基因，其編碼263個氨基酸，蛋白序列中具有2個SANT結(jié)構(gòu)域。對比在擬南芥中的研究推測，該基因可能在滲透脅迫響應中起作用。系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果表明，BoMYB與歐洲油菜的MYB聚為一組，它們與擬南芥的MYB處于不同分支。對BoMYB基因的克隆與序列進行分析，為探究青花菜MYB基因的表達、功能及抗逆機理
種子科技 2019年1期2019-09-10
- 亞麻COBRA基因家族的鑒定與生物信息學分析
A基因家族;序列分析;系統(tǒng)進化分析中圖分類號：S565.9 ? ? ?文獻標志碼：A ? ? ?文章編號：1001-1463（2019）09-0033-06doi：10.3969/j.issn.1001-1463.2019.09.009Abstract：The COBRA gene encodes the glycosylphosphatidylinositol anchoring protein， which is a regulator of seco
甘肅農(nóng)業(yè)科技 2019年9期2019-09-10
- 小麥TaBESl/BZR1基因的克隆及其在祖先種和六倍體小麥中的序列比較
/BZRl;序列分析中圖分類號：$512.1 文獻標識碼：A 文章編號：1000-4440（2019）01-0238-03高溫、凍害、土壤鹽漬化等非生物脅迫已經(jīng)成為小麥穩(wěn)產(chǎn)高產(chǎn)的重要限制因素。解決這一問題的根本途徑在于培育抗逆性強的小麥新品種，并在生產(chǎn)上進行大面積應用，而挖掘和利用與抗逆性密切相關的關鍵基因能夠為培育抗逆性強的小麥品種提供重要的基因資源，因而與抗逆性相關的信號通路及信號通路上的關鍵基因的功能及序列特征的解析業(yè)已成為研究人員關注的熱點。油菜素
江蘇農(nóng)業(yè)學報 2019年1期2019-09-10
- 菜粉蝶HSP20基因的克隆及溫度脅迫下表達分析
;基因克隆;序列分析;溫度脅迫;表達分析中圖分類號： S433.4? ? ? ? ? ? ? ? ? ?文獻標志碼： A 文章編號：2095-1191（2019）02-0286-06Abstract：【Objective】Heat shock protein 20 gene（HSP20） from Pieris rapae was cloned and its expression under temperature stress was detected
南方農(nóng)業(yè)學報 2019年2期2019-09-10
- 高活性纖溶酶菌株篩選與基因克隆表達
基因克隆; 序列分析; 表達中圖分類號：Q939.9 文獻標識碼：A 文章編號：1008-0457（2019）02-0001-07 ? ? 國際DOI編碼：10.15958/j.cnki.sdnyswxb.2019.02.001Abstract： In this study， 13 Maotai-flavor producing strains isolated from samples such as daqu， fermented grains and
山地農(nóng)業(yè)生物學報 2019年2期2019-09-10
- 大花杓蘭親環(huán)素基因的克隆及生物信息學分
統(tǒng)發(fā)育樹， 序列分析中圖分類號：Q949.95文獻標識碼：A文章編號：1000-3142（2019）05-0633-08Cloning and bioinformatics analysis of cyclophilin gene（CmCyP） from Cypripedium macranthumFU Yajuan1，2， ZHANG Jian3， LIU Huan1， HOU Xiaoqiang1，2*（ 1. College of Life Scie
廣西植物 2019年5期2019-09-10
- 廣東省番茄黃化曲葉病毒的分子鑒定及序列分析
分子鑒定; 序列分析中圖分類號： S 432.41文獻標識碼： ADOI： 10.16688/j.zwbh.2018333番茄黃化曲葉病是世界范圍內(nèi)嚴重影響番茄生產(chǎn)的一種重要病害，已給熱帶和亞熱帶地區(qū)的番茄生產(chǎn)造成嚴重損失[1]。在我國，蔡健和等1994年首次在廣西報道了該病害的發(fā)生[2]。2006年以來，番茄黃化曲葉病在全國范圍大面積暴發(fā)和流行。在廣東，何自福等2003年率先報道番茄黃化曲葉病危害番茄[3]，到目前為止，廣東省幾乎所有番茄產(chǎn)區(qū)均有該病害的
植物保護 2019年4期2019-09-04
- 侵染‘舞美’蘋果的蘋果銹果類病毒檢測與全序列分析
-PCR; 序列分析中圖分類號： S 432.1文獻標識碼： ADOI： 10.16688/j.zwbh.2018233蘋果銹果病在遼寧[1]、新疆[2]、山東[3]、河北[4]等蘋果主產(chǎn)區(qū)均有發(fā)生，近年來呈不斷蔓延趨勢，已成為制約我國蘋果產(chǎn)業(yè)健康發(fā)展的主要限制因子。該病的病原為蘋果銹果類病毒Apple scar skin viroid （ASSVd），屬于馬鈴薯紡錘塊莖類病毒科Pospiviroidae蘋果銹果類病毒屬Apscarviroid[5]。AS
植物保護 2019年4期2019-09-04
- 椰子織蛾CSP基因的克隆與序列分析
;基因克隆;序列分析;系統(tǒng)進化樹中圖分類號： S433.4? 文獻標志碼： A? 文章編號：1002-1302（2019）03-0043-03高度發(fā)達的化學感受系統(tǒng)對昆蟲與環(huán)境中的化學信息聯(lián)系具有重要作用。昆蟲在長期進化過程中，發(fā)展演變出復雜的化學信息感受機制。例如，在覓食、尋偶、產(chǎn)卵等行為中，通過敏銳的嗅覺、味覺、觸覺等功能，感受各種環(huán)境化學因子的刺激，從而進行精巧的化學通信，以適應環(huán)境選擇，保持種群繁衍[1]。昆蟲發(fā)達的化學感受系統(tǒng)功能的發(fā)揮是基于昆蟲
江蘇農(nóng)業(yè)科學 2019年3期2019-08-10
- 豬流行性腹瀉毒株S基因分離鑒定及序列分析
毒;S基因;序列分析中圖分類號：S858.285.3?? 文獻標志碼： A? 文章編號：1002-1302（2019）11-0071-03豬流行性腹瀉病毒（porcine epidemic diarrhea virus，PEDV）引起的豬流行性腹瀉?。╬orcine epidemic diarrhea，PED）是一種高死亡率的腸道傳染病，會在豬群中引起各個年齡段豬暴發(fā)急性腹瀉，多發(fā)于仔豬和胎豬，其臨床癥狀主要以豬水樣腹瀉、嘔吐和脫水為主。1971年，英國首
江蘇農(nóng)業(yè)科學 2019年11期2019-07-22
- 中華鱘免疫分子CD22的克隆及生物信息學挖掘
;CD22;序列分析;功能預測中圖分類號? ? S917.4? ? ? ? 文獻標識碼? ? A? ? ? ? 文章編號? ?1007-5739（2019）09-0204-03Abstract? ? In order to study the structure of CD22 and its possible corresponding functions，the Acipenser sinensis CD22 cDNA（CsCD22）was clone
現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技 2019年9期2019-07-03
- 江蘇省揚州市水仙病毒檢測鑒定與序列分析
經(jīng)克隆測序和序列分析發(fā)現(xiàn)，所得序列包含3種不同的類型，分別與水仙普通潛隱病毒 Narcissus common latent virus （NCLV）、水仙退化病毒 Narcissus degeneration virus （NDV）和水仙黃條病毒Narcissus yellow stripe virus （NYSV）有93%、98%和99%的相似性，表明江蘇水仙受到了NCLV、NDV、NYSV 3種病毒侵染。這是江蘇水仙上第一次發(fā)現(xiàn)NCLV、NDV、NY
植物保護 2019年6期2019-02-10
- 豬流行性腹瀉病毒ＨＢ２０１６０２株的分離鑒定及Ｓ１基因序列分析
;分離鑒定;序列分析;系統(tǒng)發(fā)育樹;遺傳變異中圖分類號：S852.65+1 ? ? ? ? 文獻標識碼：A文章編號：0439-8114（2019）24-0227-05DOI：10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2019.24.055 ? ? ? ? ? 開放科學（資源服務）標識碼（OSID）：Isolation and identification of HB201602 strain of porcine epidemicdiarr
湖北農(nóng)業(yè)科學 2019年24期2019-02-06
- 杜梨響應鹽脅迫CIPK01的克隆及表達分析
IPK基因;序列分析;基因表達;抗逆基因;抗逆機制中圖分類號： S661.201文獻標志碼： A文章編號：1002-1302（2019）21-0115-05收稿日期：2018-08-03基金項目：國家自然科學基金（編號：31372051、31772287）;江蘇省自然科學基金（編號：BK20151361）。作者簡介：王影（1993—），女，安徽宿州人，碩士研究生，主要從事果樹種質(zhì)資源與分子育種研究。E-mail：1759068060@qq.com。通信作者
江蘇農(nóng)業(yè)科學 2019年21期2019-01-03
- 一株犬瘟熱病毒部分基因片段的特性分析
測；L基因；序列分析犬瘟熱（canine distemper，CD）是一種由犬瘟熱病毒（can‘inedistemper virus，CDV）引起的多宿主的烈性、急性、高度接觸性的病毒性傳染病。CDV可引發(fā)多種動物患病，致死率極高。CD分布全球，很多國家和地區(qū)均有報道家養(yǎng)或野生動物感染CD的案例，同時在過去的幾十年中，其感染宿主范圍在不斷擴大。我國很多地區(qū)大型毛皮動物養(yǎng)殖場、動物園甚至保護區(qū)內(nèi)均有動物感染CD而死亡的報道。同時國寶大熊貓、旗艦物種東北虎等多
中國動物保健 2018年3期2018-12-27
- 大白菜、蘿卜蕪菁花葉病毒系統(tǒng)進化及CP序列分析
；系統(tǒng)進化；序列分析中圖分類號：S436.341.1+1+S436.31 文獻標識號：A 文章編號：1001-4942（2018）08-0100-06Phylogenetic Evolution and CP Nucleotide Sequence Analysis ofTuMV in Chinese Cabbage and RadishWu Bin1， Zhang Mei1， Jiang Shanshan1， Zhang Ansheng1，Cui Han
山東農(nóng)業(yè)科學 2018年8期2018-11-22
- 云南切梢小蠹熱激蛋白20基因克隆及序列分析
）進行克隆和序列分析，為研究該蟲在高溫環(huán)境下的抗逆機制打下基礎。【方法】采用cDNA末端快速擴增技術（Rapid amplification of cDNA ends，RACE）克隆云南切梢小蠹成蟲TynHSP20基因cDNA序列，并對其序列進行生物信息學分析?！窘Y(jié)果】克隆獲得的TynHSP20基因cDNA序列長671 bp，含開放閱讀框597 bp，5'端非編碼序列和部分3'端非編碼序列分別為44和33 bp。該基因編碼198個氨基酸，預測蛋白質(zhì)分子量為
南方農(nóng)業(yè)學報 2018年12期2018-09-10
- 芒果乙烯受體ETR1和ERS1基因的克隆及序列分析
；基因克?。?span id="syggg00" class="hl">序列分析中圖分類號： S667.703.6 文獻標志碼：A 文章編號：2095-1191（2018）06-1053-08Abstract：【Objective】Ethylene receptor ETR1 and ERS1 genes（MiETR1 and MiERS1） from mango（Mangnifera indica L.） were cloned，and bioinformatics analysis was conducted
南方農(nóng)業(yè)學報 2018年6期2018-09-10
- 沙田柚生長素響應基因SAUR的鑒定及序列分析
53。氨基酸序列分析表明，該基因編碼的氨基酸與克萊門柚和甜橙SAUR基因編碼的氨基酸的同源性分別為100%、99%。系統(tǒng)進化樹顯示，沙田柚SAUR基因與克萊門柚和甜橙的親緣關系很近，屬同一進化分支。[結(jié)論]研究結(jié)果可為今后深入研究沙田柚自交不親和機理提供參考。關鍵詞 沙田柚；自交不親和；SAUR基因；序列分析中圖分類號 S188 文獻標識碼 A 文章編號 0517-6611（2018）22-0081-04Abstract[Objective]To stud
安徽農(nóng)業(yè)科學 2018年22期2018-05-14
- 大鼠MKK3蛋白的生物信息學分析
；MKK3；序列分析；生物信息學分析中圖分類號 Q789 文獻標識碼A 文章編號 0517-6611（2018）13-0114-04Bioinformatic Analysis of Rat MKK3 ProteinZHAO Xiaofeng，WU Guimei，JIN Lei et al（National Demonstration Center for Experimental Basic Medical Science Education， Xuzh
安徽農(nóng)業(yè)科學 2018年13期2018-05-14
- 青楊天牛觸角味覺受體基因的鑒定
；味覺受體；序列分析中圖分類號 S763.38 文獻標識碼 A 文章編號 0517-6611（2018）13-0111-03Identification of Saperda populnea Antennal Gustatory Receptor GeneWANG Jiatong1， ZHANG Jian2， CHENG Bin2 et al（1.School of Life Sciences， Northeast Normal University，
安徽農(nóng)業(yè)科學 2018年13期2018-05-14
- 青稞核糖體蛋白基因HbRPL11的克隆、序列分析及原核表達
了測序鑒定和序列分析，同時構(gòu)建了原核表達載體pET28a（+）-RPL11，轉(zhuǎn)化入大腸桿菌BL21（DE3）后利用IPTG 誘導外源蛋白質(zhì)表達并利用SDS-PAGE凝膠電泳檢測?！窘Y(jié)果】成功擴增出了青稞核糖體蛋白基因HbRPL11的CDS全長序列，得到了重組蛋白?！窘Y(jié)論】青稞核糖體蛋白基因HbRPL11的CDS全長序列大小為543 bp。經(jīng)生物信息學分析，HbRPL11編碼的蛋白質(zhì)含有181個氨基酸，相對分子質(zhì)量為24KD，理論等電點（pI）為5.17，總
農(nóng)家科技下旬刊 2017年9期2017-11-12
- 大鯢泛素結(jié)合酶玞gsUBE2L3基因克隆及其在免疫應答中的表達分析
BE2L3；序列分析；免疫應答中圖分類號S966.6文獻標識碼A文章編號0517-6611（2017）22-0093-05Abstract[Objective] To study the role of ubiquitinconjugating enzyme cgsUBE2L3 gene during the immune response in Chinese giant salamander （Andrias davidianus）. [Method]
安徽農(nóng)業(yè)科學 2017年22期2017-10-14
- 沙田柚GDSL酯酶/脂肪酶基因的鑒定及序列分析
脂肪酶基因；序列分析；鑒定中圖分類號： S666.301文獻標志碼： A文章編號：1002-1302（2017）11-0045-04[HS）][HT9.SS]植物自交不親和是指具有完全花且能夠產(chǎn)生雌雄配子，雌蕊的柱頭或花柱能特異性識別與自體基因型相同的花粉，導致花粉不萌發(fā)或花粉管停止生長的一種現(xiàn)象[1]。在高等植物中，據(jù)估計有超過一半的顯花植物表現(xiàn)出自交不親和性，這種現(xiàn)象在被子植物中尤其明顯[2]。自交不親和對植物保持遺傳多樣性以及雜種優(yōu)勢有著極其重要的作
江蘇農(nóng)業(yè)科學 2017年11期2017-08-12
- 新城疫病毒SD強毒株全長cDNA克隆的構(gòu)建及序列分析
的成功構(gòu)建和序列分析為后續(xù)的反向遺傳操作奠定了關鍵的技術基礎。關鍵詞：新城疫病毒；基因組全長cDNA；重組質(zhì)粒；序列分析中圖分類號：S852.65+9.5：Q781 文獻標識號：A 文章編號：1001-4942（2017）07-0012-04Abstract The whole genomic cDNA sequence of SD virulent strain of Newcastle disease virus was amplified in se
山東農(nóng)業(yè)科學 2017年7期2017-07-29
- 山東省芋花葉病毒病的田間調(diào)查及鑒定
病病原鑒定、序列分析和遺傳進化分析。結(jié)果顯示，芋花葉病毒的檢出率為55.9%，在5個地區(qū)皆有分布。5個DsMV分離物cp基因的核苷酸序列相似性為88.5%～91.9%，氨基酸序列相似性為93.4%～97.5%；與國內(nèi)外已報道代表性DsMV分離物cp基因的核苷酸與氨基酸的序列相似性分別為74.8%～99.4%、79.7%～99.1%。遺傳進化分析顯示，DsMV山東分離物與日本分離物（Ds23）、中國分離物（ND和ZAN）和美國分離物（DsMV-U2）親緣關系
中國蔬菜 2017年7期2017-07-10
- 新疆油雞禽流感病毒Xj14分離株PA基因的克隆與序列分析
基因；克?。?span id="syggg00" class="hl">序列分析中圖分類號： S852.65+7文獻標志碼： A文章編號：1002-1302（2017）08-0020-03禽流感（avian influenza，AI）是由A型流感病毒（avian influenza virus，AIV）引起的病毒性傳染病。自Homme等1966年從威斯康辛州患有溫和呼吸道疾病的火雞中分離到第1株H9N2亞型禽流感病毒之后，該亞型病毒在世界范圍內(nèi)呈廣泛流行的趨勢[1-4]。我國1994年首次從廣東省的發(fā)病雞群中分離到
江蘇農(nóng)業(yè)科學 2017年8期2017-06-30
- 洋蔥AcPME基因的克隆及序列分析
E）；克?。?span id="syggg00" class="hl">序列分析中圖分類號：S633.201文獻標識號：A文章編號：1001-4942（2017）06-0007-07AbstractThe sequence of AcPME gene was obtained through rapid amplification of cDNA ends （RACE） based on the sample of onion flower bud. The GenBank accession number was
山東農(nóng)業(yè)科學 2017年6期2017-06-29
- 廣西家蠶核型多角體病毒株gp64基因克隆與序列分析
基因；克隆；序列分析；微進化；廣西中圖分類號： S884.51 文獻標志碼：A 文章編號：2095-1191（2017）02-0328-08Abstract：【Objective】This research aimed to understand gp64 gene conservation of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus（BmNPV） Guangxi isolates and master the specific
南方農(nóng)業(yè)學報 2017年2期2017-05-30