王蓮萍 王博 楊春雨 國(guó)會(huì)艷 任如意
摘要:根據(jù)白樺MYB基因編碼區(qū)設(shè)計(jì)引物,以白樺的cDNA為模板,擴(kuò)增出8個(gè)MYB基因,純化回收后與T載體進(jìn)行連接并利用熱激法轉(zhuǎn)入大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞中,后經(jīng)PCR檢測(cè)成功將8個(gè)MYB基因構(gòu)建到T載體上。對(duì)8個(gè)MYB基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析,結(jié)果表明,8個(gè)MYB蛋白質(zhì)的分子量在27.2~38.8 ku之間,等電點(diǎn)在5.38~8.66之間;并且,8個(gè)MYB均為核蛋白質(zhì),但都沒(méi)有跨膜結(jié)構(gòu)域,屬于非跨膜蛋白質(zhì);系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析結(jié)果預(yù)測(cè)8個(gè)MYB基因在植物生長(zhǎng)發(fā)育的各個(gè)方面發(fā)揮著重要的作用,為后續(xù)研究8個(gè)MYB基因在白樺中的功能以及通過(guò)優(yōu)良基因改良白樺的品質(zhì)性狀提供前期數(shù)據(jù)支持。
關(guān)鍵詞:白樺;MYB基因;序列分析
中圖分類(lèi)號(hào): S188文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A
文章編號(hào):1002-1302(2019)18-0093-05
收稿日期:2018-05-15
基金項(xiàng)目:黑龍江省教育廳項(xiàng)目(編號(hào):1352MSYYB002);研究生創(chuàng)新項(xiàng)目(編號(hào):kjcx2018-80mdjnu)。
作者簡(jiǎn)介:王蓮萍(1994—),女,黑龍江省鶴崗人,碩士研究生,主要從事植物分子生物學(xué)與基因工程研究。E-mail:928718821@qq.com。
通信作者:任如意,博士,教授,主要從事植物分子生物學(xué)與基因工程研究。E-mail:swxrry@126.com。
轉(zhuǎn)錄因子也稱(chēng)反式作用因子,是指能夠與基因啟動(dòng)子區(qū)域中順式作用元件發(fā)生特異性相互作用的DNA結(jié)合蛋白質(zhì),通過(guò)它們之間以及與其他相關(guān)蛋白質(zhì)之間的相互作用激活或抑制某些基因的轉(zhuǎn)錄[1]。根據(jù)轉(zhuǎn)錄因子保守域可分為很多家族,如bZIP、bHLH、MYB等。
MYB蛋白質(zhì)普遍存在與動(dòng)植物中,是植物最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,它參與植物次生代謝調(diào)控、激素和環(huán)境的應(yīng)答、并對(duì)細(xì)胞分化、細(xì)胞周期、器官的形成以及植物葉片的形態(tài)建成具有重要的調(diào)節(jié)作用[2-3]。自Paz-ares等首次報(bào)道玉米轉(zhuǎn)錄因子C1基因的克隆[4]以來(lái),從番茄[5]、月季[6]、水稻[7]等多種植物中都分離克隆了MYB基因,并體現(xiàn)出MYB蛋白質(zhì)功能的多樣性。植物體中大多數(shù)MYB蛋白質(zhì)有2個(gè)重復(fù)MYB結(jié)構(gòu)域(R2、R3),根據(jù)C端保守氨基酸序列的不同R2R3-MYB可分為22個(gè)亞類(lèi),同一亞類(lèi)的基因往往具有相對(duì)保守的功能[8],有學(xué)者推測(cè)在擬南芥中有130多個(gè)R2R3-MYB基因[9],玉米中至少有80個(gè)MYB基因[10]。MYB家族轉(zhuǎn)錄因子有很多的成員被鑒定為是次生壁合成重要的調(diào)控因子[11],MYB轉(zhuǎn)錄因子在植物應(yīng)答生物脅迫中具有重要的作用,在植物的生長(zhǎng)過(guò)程中,幾乎參與了植物的發(fā)育和代謝的各個(gè)方面。楊樹(shù)的PtrMYB092和PtrMYBJ52基因參與了植物中木質(zhì)素合成的調(diào)控,并能通過(guò)激活下游轉(zhuǎn)錄因子和關(guān)鍵酶基因的表達(dá)提高木質(zhì)素的合成速率,促進(jìn)植物細(xì)胞次生壁發(fā)生木質(zhì)化[12]。有學(xué)者從桉樹(shù)克隆到了參與調(diào)控樹(shù)木木質(zhì)部形成的關(guān)鍵基因,桉樹(shù)中的Eg MYB2基因可以調(diào)控木質(zhì)素合成基因的轉(zhuǎn)錄,從而影響了桉樹(shù)木質(zhì)素和次生壁的形成[13]。Zhong等研究表明擬南芥的AtMYB58和AtMYB63過(guò)表達(dá)時(shí),植物細(xì)胞壁的木質(zhì)素含量顯著增加,而其他細(xì)胞壁成分沒(méi)有變化[14]。擬南芥中HbMYB85a/b過(guò)表達(dá)都能使導(dǎo)管、木質(zhì)纖維和維管束間纖維的細(xì)胞壁厚度增加,木質(zhì)素含量升高,木質(zhì)素合成相關(guān)酶基因表達(dá)升高,葉片量加厚,抽薹開(kāi)花延遲[15]。McCarthy等在楊樹(shù)中克隆了MYB46、MYB83的同源基因Ptr MYB3、Ptr MYB20,最后通過(guò)功能分析證實(shí)了Ptr MYB3、Ptr MYB20參與了次生木質(zhì)部的合成[16]。小麥中的TaMYB33受ABA介導(dǎo)的逆境響應(yīng)信號(hào)調(diào)控,通過(guò)積累滲透壓調(diào)節(jié)物和提高細(xì)胞活性氧清除能力來(lái)提高植物對(duì)干旱和鹽的耐受性[17]。Yang等研究發(fā)現(xiàn)OsMYB2過(guò)表達(dá)植株中可溶性糖和脯氨酸含量上升,并發(fā)現(xiàn)其細(xì)胞內(nèi)脯氨酸合成酶和轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因等逆境相關(guān)基因表達(dá)量上升,同時(shí)抗氧化酶的活性升高,對(duì)低溫、鹽害和干旱逆境脅迫的耐受性都明顯增強(qiáng)[18]。擬南芥中的MYB68基因在根中柱鞘細(xì)胞中特異型表達(dá),在高溫脅迫下,根中MYB68表達(dá)會(huì)明顯增強(qiáng),并且MYB68突變體的生長(zhǎng)活力比野生型低,說(shuō)明MYB68參與了擬南芥高溫脅迫的應(yīng)答反應(yīng)[19]。水稻Osmyb4基因的過(guò)表達(dá)大大提高了轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)干旱、高鹽、紫外輻射等的耐受能力[20]。從以往研究中不難發(fā)現(xiàn),MYB轉(zhuǎn)錄因子在植物中起著關(guān)鍵性作用,但其作用的詳細(xì)分子機(jī)理還沒(méi)有被完全闡述清楚,因此,有必要對(duì)MYB轉(zhuǎn)錄因子的功能和作用機(jī)制繼續(xù)進(jìn)行深入研究。
白樺(Betula platyphylla Suk.)為樺木屬的落葉喬木,其木材可供一般建筑及制作器具,樹(shù)皮可以提煉樺油,樹(shù)汁在保健藥用上有抗衰老止咳等功效,植株本身可用于園林景觀。隨著對(duì)白樺不斷深入的研究,它的經(jīng)濟(jì)市場(chǎng)價(jià)值也將不斷地被開(kāi)發(fā)出來(lái)。本研究從白樺轉(zhuǎn)錄組中找到8個(gè)MYB基因,并以白樺cDNA為模板將其克隆出來(lái),與T載體進(jìn)行連接,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌中。并對(duì)8個(gè)MYB基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析,為后續(xù)利用試驗(yàn)手段深入研究這8個(gè)MYB基因的功能提供前期依據(jù)。
1?材料與方法
1.1?材料
1.1.1?試驗(yàn)材料
白樺組培苗,由牡丹江師范學(xué)院生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院提供。
1.1.2?試驗(yàn)試劑
大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞、2×Power Taq PCR MasterMIX混合酶(百泰克生物技術(shù)公司)、DL2000 DNA marker。膠回收試劑盒、PMD18-T載體試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒(天根生物技術(shù)有限公司)。
1.1.3?培養(yǎng)基
培養(yǎng)基配方。1/2 MS固體培養(yǎng)基:1/2 MS粉(不含瓊脂粉和蔗糖)2.47 g,瓊脂粉8 g,蔗糖30 g,加蒸餾水定容至1 g,調(diào)節(jié)pH值為5.8。LB液體培養(yǎng)基:10 g蛋白胨、10 g NaCl、5 g酵母粉,加蒸餾水定容至1 L,調(diào)節(jié)pH值為7.0。
3?結(jié)論與討論
MYB作為最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,根據(jù)所含保守結(jié)構(gòu)域的不同分為1R、2R、3R、4R多個(gè)亞家族,不同的亞家族也具有著不同的結(jié)構(gòu)特征和功能。從白樺轉(zhuǎn)錄組中找到8個(gè)MYB基因,在從白樺的cDNA中克隆出這8個(gè)基因,與擬南芥MYB家族基因進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析,暗示這8個(gè)白樺MYB基因在白樺生長(zhǎng)發(fā)育的各個(gè)方面具有不同的功能,但這只是一種預(yù)測(cè),后續(xù)還需要進(jìn)行轉(zhuǎn)基因試驗(yàn)來(lái)證實(shí),本研究為進(jìn)一步利用試驗(yàn)手段分析MYB基因在白樺中的功能提供前期基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
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