溫度、二硫蘇糖醇、基因定點突變對溶菌酶和肽基脯氨酰順反異構(gòu)酶蛋白交聯(lián)反應(yīng)的影響
徐燕邵世濱董立1閆曉華1高音2
(山東醫(yī)學(xué)高等專科學(xué)校生物化學(xué)教研室,山東臨沂276002)
摘要〔〕目的研究二硫鍵對溶菌酶和肽基脯氨酰順反異構(gòu)酶(PPI)蛋白交聯(lián)聚集作用的影響。方法以人總RNA為模板設(shè)計引物進(jìn)行人類PPI基因的克隆,以獲取的正常型表達(dá)載體為模板,利用PCR定點突變的方法破壞掉PPI 基因中形成二硫鍵的兩個半胱氨酸殘基(Cys),將其構(gòu)建到pTrcHisC-hppI原核表達(dá)系統(tǒng),經(jīng)異丙基硫代半乳糖苷(IPTG)進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá)獲得正常型和突變型PPI蛋白,與溶菌酶在不同溫度、還原劑二硫蘇糖醇(DTT)存在條件下進(jìn)行蛋白聚集反應(yīng),十二烷基磺酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)和Western印跡法分析和鑒定交聯(lián)情況。結(jié)果溶菌酶和PPI在臨界變性溫度時有明顯的二聚體和多聚體條帶;反應(yīng)體系中加入DTT后,幾乎觀察不到交聯(lián)條帶,兩者的異源蛋白交聯(lián)反應(yīng)出現(xiàn)同樣的現(xiàn)象;將突變型PPI置于與正常型PPI完全相同的反應(yīng)條件下,均沒有任何蛋白聚集現(xiàn)象。結(jié)論二硫鍵是蛋白質(zhì)交聯(lián)和多聚化發(fā)生的前提,破壞二硫鍵將導(dǎo)致蛋白結(jié)構(gòu)和交聯(lián)作用的喪失。
關(guān)鍵詞〔〕二硫蘇糖(DTT);二硫鍵;定點突變;肽基脯氨酰順反異構(gòu)酶(PPI)交聯(lián)
中圖分類號〔〕R39〔文獻(xiàn)標(biāo)識碼〕A〔
基金項目:山東省高等學(xué)??萍加媱濏椖?J13LK18)
1山東醫(yī)學(xué)高等專科學(xué)校檢驗系2首都師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院
第一作者:徐燕(1979-),女,碩士,講師,主要從事蛋白質(zhì)工程研究。
人類肽基脯氨酰順反異構(gòu)酶(hPPI)是可以催化脯氨酸殘基發(fā)生構(gòu)象折疊反應(yīng)的酶,參與多種疾病的發(fā)生,特別是病毒性疾病的感染過程〔1~3〕。本實驗利用還原劑二硫蘇糖醇(DTT)處理PPI活性蛋白,破壞其二硫鍵觀察對其蛋白聚集作用的影響。同時,利用PCR定點突變技術(shù),突變PPI中的兩個半胱氨酸殘基為絲氨酸,從而改變蛋白的一級結(jié)構(gòu),檢測對PPI蛋白高級結(jié)構(gòu)以及聚合交聯(lián)作用的影響。
1材料與方法
1.1正常型與突變型PPI蛋白的制備PPI取自實驗室保存的293T細(xì)胞系,于液氮復(fù)蘇后于培養(yǎng)箱培養(yǎng),用含10%的胎牛血清的DMEM完全培養(yǎng)基在5%的CO2條件下進(jìn)行培養(yǎng)。24 h后收集細(xì)胞用Trizol法進(jìn)行總RNA的提取。利用前面提取的人總RNA為模板設(shè)計引物進(jìn)行PPI基因的克隆。序列信息如下:正向引物CTGCAGATGGTCAACCCCACCGTGTTCT和反向引物GAATTCTGACTGTGGACAACTCGAATAA。然后以cDNA為模板和克隆引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增PPI基因的編碼區(qū)序列??寺~@得PPI基因經(jīng)測序正確無誤后,將其構(gòu)建到pTrcHisC-hPPI原核表達(dá)系統(tǒng)的多克隆位點區(qū)域,從而構(gòu)建含6個組氨酸的融合蛋白。載體構(gòu)建成功后,利用終濃度為1 mmol/L的異丙基硫代半乳糖苷(IPTG)(北京鼎國生物科技有限公司)進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá)以獲取大量的目的蛋白,表達(dá)后的產(chǎn)物少量提取后用12%的十二烷基磺酸鈉-丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)進(jìn)行鑒定。鑒定正確后,再進(jìn)行大量蛋白的提取和純化。利用Talon金屬親和層析樹脂純化柱純化目的蛋白,將純化后的蛋白利用BCA法(大連寶生物)進(jìn)行蛋白濃度測定,用于交聯(lián)反應(yīng)。通過分析PPI的編碼區(qū)序列發(fā)現(xiàn)該基因一共含有兩個半胱氨酸(Cys)分別位于52和62位。利用定點突變的方法將這兩個氨基酸突變?yōu)榻z氨酸從而破壞其二硫鍵形成的可能性。以獲取的正常型的表達(dá)載體為模板,設(shè)計定點引物正向引物mu為GTTCCTCCTTTCACAGAATTATTCCAGGGTTTATGTCCCAGGGTG和反向引物mu為CACCCTGGGACATAAACCCTGGAATAATTCTGTGAAAGGAGGAAC進(jìn)行PCR擴(kuò)增,從而實現(xiàn)PCR產(chǎn)物的突變。測序正確后如同正常型載體表達(dá)和純化過程進(jìn)行突變型PPI蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)和純化,用于下一步的交聯(lián)反應(yīng)。
1.2蛋白質(zhì)的體外交聯(lián)反應(yīng)
1.2.1溫度對溶菌酶(Lysozyme)和PPI交聯(lián)的影響將純化的PPI凍干濃縮后,與溶菌酶在4個反應(yīng)體系中培養(yǎng)40 min,SDS-PAGE分析交聯(lián)情況。見表1。
表1溶菌酶和hPPI的熱變性交聯(lián)反應(yīng)(mmol/L)
Tris-clGSHGSSG溶菌酶PPI溫度(℃)130210.2075230210.20.575330210.20.544302100.575
1.2.2變性劑DTT和定點突變對溶菌酶和兩種PPI蛋白交聯(lián)的影響在與上相同的緩沖體系中,熱變性交聯(lián)溫度下,SDS-PAGE分析DTT和點突變對同源和異源蛋白交聯(lián)的影響。
1.3Western印跡鑒定將電泳樣品轉(zhuǎn)移至聚偏二氟乙烯(PVDF)膜,與兔抗人PPI一抗4℃孵育過夜。經(jīng)緩沖液TBST洗滌后,加入辣根過氧化物酶標(biāo)記的羊抗兔PPI抗體,37℃孵育60 min,增強(qiáng)型化學(xué)發(fā)光法(ECL)鑒定交聯(lián)結(jié)果。
2結(jié)果
2.1溫度影響蛋白質(zhì)交聯(lián)溶菌酶和PPI在4℃沒有任何交聯(lián),而在熱變性的75℃有明顯的二聚體和多聚體條帶。PPI的分子量為24 kD,故溶菌酶的三聚體與兩者的異源二聚體分子量相差不大。為排除上述干擾,進(jìn)行Western 印跡鑒定表明,第3條帶為異源二聚體交聯(lián)。見圖1。
蛋白marker分子量分別14.4、20、26、33、45、66.2、94 kD 圖1 溫度對蛋白質(zhì)交聯(lián)影響的SDS-PAGE和 Western印跡分析
2.2變性劑DTT影響蛋白質(zhì)交聯(lián)75℃變性條件下進(jìn)行交聯(lián)實驗,溶菌酶蛋白可以形成同源二聚體和多聚體(第2條帶);但是當(dāng)添加DTT變性劑的條件下,幾乎檢測不到二聚體和多聚體的存在,同源蛋白的聚合作用消失(第3條帶)。同樣,對于PPI蛋白,75℃變性條件下可以檢測到二聚體和多聚體的同源聚合作用(第6條帶),但是在DTT存在的情況下,PPI蛋白出現(xiàn)類似于溶菌酶的結(jié)果,同源蛋白不發(fā)生聚合作用(第7條帶)。兩者的異源蛋白交聯(lián)反應(yīng)出現(xiàn)同樣的結(jié)果(第4、5條帶)。Western印跡分析同樣支持上述結(jié)果。這說明DTT可以破壞二硫鍵的形成,從而阻止同源和異源蛋白的聚合作用,即便在適宜交聯(lián)的溫度下,也不能形成聚合復(fù)合物。見圖2。
2.3定點突變破壞蛋白質(zhì)交聯(lián)正常型的PPI蛋白在臨界變性溫度75℃的交聯(lián)作用下發(fā)生聚合作用,形成二聚體和多聚體(第2條帶)。而突變型PPI蛋白在臨界變性溫度75℃的交聯(lián)作用下不發(fā)生同源聚合作用,SDS-PAGE與Western印跡均未檢測到蛋白的聚合作用(第3條帶)。同樣兩種檢測方法表明,溶菌酶與突變型PPI的混合液僅出現(xiàn)了溶菌酶聚合反應(yīng),未出現(xiàn)異源蛋白交聯(lián)(第3條帶)。這說明,在交聯(lián)反應(yīng)的過程中,二硫鍵起到至關(guān)重要的作用,一旦不可逆地破壞二硫鍵的存在,將導(dǎo)致同源和異源蛋白聚合作用的消失。見圖3。
蛋白marker分子量分別14.4、20、26、33、45、66.2、94 kD。交聯(lián)溫度為75℃ 圖2 變性劑對蛋白交聯(lián)聚合作用的SDS-PAGE和 Western印跡分析
marker為14.4、20、26、33、45、66.2和94 kD。交聯(lián)溫度為75℃ 圖3 兩種PPI蛋白與溶菌酶交聯(lián)反應(yīng)的 SDS-PAGE和Western印跡分析
3討論
蛋白質(zhì)易受外界因素影響而發(fā)生構(gòu)象變化,物理化學(xué)性質(zhì)發(fā)生異常變化,最終導(dǎo)致蛋白活性喪失。而蛋白的構(gòu)象則主要源于蛋白一級結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ)進(jìn)行折疊、聚合等過程,形成有活性的高級結(jié)構(gòu)。而在這個過程中,分子鍵起到關(guān)鍵的作用,特別是二硫鍵。二硫鍵是最為常見的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)修飾,對穩(wěn)定蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu),調(diào)節(jié)蛋白活性有著非常重要的作用。利用PCR技術(shù)對人免疫缺陷病毒I型(HIV-1)囊膜蛋白(Env)七肽重復(fù)區(qū)HRI和HR2之間linker進(jìn)行定點突變破壞二硫鍵的形成,將導(dǎo)致該蛋白活性的改變,不能正確識別和定位〔4〕。通過比較被拆分不同數(shù)目二硫鍵的人轉(zhuǎn)鐵蛋白和正常蛋白的活性,檢測二硫鍵對它們結(jié)合金屬離子和與轉(zhuǎn)鐵蛋白受體的結(jié)合能力,結(jié)果表明隨二硫鍵被拆分?jǐn)?shù)目的增加,其與受體結(jié)合能力比結(jié)構(gòu)金屬離子能力的喪失快〔5〕。在研究朊病毒蛋白分子的活性中發(fā)現(xiàn),重組正常人朊病毒蛋白經(jīng)沉淀實驗顯示經(jīng)過二硫鍵硫醇基團(tuán)的氧化還原之后其蛋白聚集性顯著增加,而二硫鍵破壞的突變體蛋白則沒有明顯變化〔6〕。風(fēng)疹病毒(RV)包膜糖蛋白E1外功能區(qū)的10個二硫鍵對RV的細(xì)胞融合活性都有重要影響,任何一個二硫鍵的去除均導(dǎo)致E1的細(xì)胞融合活性喪失〔7〕。可見,二硫鍵對蛋白活性的發(fā)揮起到至關(guān)重要的作用。同時,二硫鍵很容易被還原而斷裂,但是斷裂后在適當(dāng)?shù)臈l件下又可以氧化反應(yīng)重新形成二硫鍵,因此二硫鍵形成是一個動態(tài)過程。
根據(jù)以往研究〔8〕,溶菌酶和PPI的熱變性交聯(lián)溫度均在75℃左右。此次研究發(fā)現(xiàn),溫度同樣影響異源蛋白質(zhì)交聯(lián)。DTT是一種很強(qiáng)的還原劑,其還原性很大程度上是由于其氧化狀態(tài)六元環(huán)(含二硫鍵)的構(gòu)象穩(wěn)定性。DTT常被用于蛋白質(zhì)中二硫鍵的還原,可用于阻止蛋白質(zhì)中的半胱氨酸之間所形成的蛋白質(zhì)分子內(nèi)或分子間二硫鍵,能夠保護(hù)正常晶體蛋白所含的半胱氨酸等成分不受氧化修飾,減少其變性可能性。二硫鍵在維持蛋白穩(wěn)定性和蛋白聚合過程中發(fā)揮重要作用。本實驗針對PPI蛋白進(jìn)行定點突變,將PPI蛋白中存在的兩個半胱氨酸全部進(jìn)行突變?yōu)榻z氨酸,從而阻斷PPI蛋白二硫鍵的形成,試驗體外研究二硫鍵對PPI蛋白聚合作用的影響。本實驗證實,變性劑DTT通過破壞二硫鍵可以導(dǎo)致同源和異源蛋白的聚合作用,即便是在變性條件下進(jìn)行交聯(lián),依然檢測不到聚合復(fù)合物,說明DTT對二硫鍵的破壞是不可逆作用,同時也表明了化學(xué)變性劑對蛋白交聯(lián)聚合的影響。另一方面,通過定點突變半胱氨酸,破壞PPI蛋白的一級結(jié)構(gòu)進(jìn)而破壞其二硫鍵,導(dǎo)致同源蛋白和異源蛋白都不發(fā)生聚合作用。同時,在異源交聯(lián)反應(yīng)實驗中,檢測到PPI和溶菌酶發(fā)生異源聚合作用,說明聚合反應(yīng)是蛋白的一個非特異性特征,只要條件適當(dāng),異源蛋白同樣會發(fā)生聚合作用。這些實驗再次驗證了前期本課題組所提出的提出了蛋白質(zhì)交聯(lián)機(jī)制的三步假說〔9〕:第一步蛋白質(zhì)構(gòu)象包括二級結(jié)構(gòu)改變;第二步形成分子間二硫鍵;第三步形成分子間異肽鍵。DTT破壞二硫鍵的形成,從而阻斷了交聯(lián)反應(yīng)的第二步導(dǎo)致聚合作用抑制。而蛋白一級結(jié)構(gòu)的改變,特別是半胱氨酸的改變,將直接導(dǎo)致二硫鍵形成受阻,從而改變蛋白的二級結(jié)構(gòu)以及后續(xù)的交聯(lián)作用??梢姡蜴I是蛋白質(zhì)交聯(lián)和多聚化發(fā)生的前提,破壞二硫鍵將導(dǎo)致蛋白結(jié)構(gòu)和交聯(lián)作用的喪失。因此,可以利用二硫鍵的對交聯(lián)作用的影響應(yīng)用于臨床。
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〔2013-12-27修回〕
(編輯苑云杰)