高晶晶,方雪,張晨陽,于志豪,李梟晗,韓松,張瑩
沈陽醫(yī)學院公共衛(wèi)生學院流行病學教研室,沈陽 110034
近年來腫瘤的發(fā)病率和病死率均逐年上升,已成為世界范圍內(nèi)的主要公共衛(wèi)生問題,同樣也成為中國人死亡的主要原因[1]。雖然近年來腫瘤的診斷和治療取得了很大的進展,但腫瘤患者的預后仍然很差,即使是相同部位、相同病理類型的腫瘤患者,其預后仍有較大差異。因此,探索腫瘤特異性生物標志物用于腫瘤預后判斷顯得尤為重要。長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一類長度超過200個核苷酸的轉(zhuǎn)錄RNA分子,不具有編碼蛋白質(zhì)的能力[2]。越來越多的證據(jù)表明,lncRNA表達失調(diào)與惡性腫瘤的病理特征、預后及各種生物學過程有關[3-5],并且預示著lncRNA可能是腫瘤特異性的預后生物標志物和治療靶點[6]。lncRNA FOXP4-AS1位于染色體6p21.1,編碼588 bp的轉(zhuǎn)錄本[7]。以往的研究表明,lncRNA FOXP4-AS1與各種腫瘤的預后具有相關性,但由于研究方案及樣本量的限制,lncRNA FOXP4-AS1對腫瘤預后的預測價值尚未確定。本研究對12項包含1506例腫瘤患者的研究進行Meta分析,旨在探討lncRNA FOXP4-AS1表達與腫瘤患者預后的關系,現(xiàn)報道如下。
通過 PubMed、Embase、Cochrane Library、Web of Science、CNKI、萬方數(shù)據(jù)庫、維普數(shù)據(jù)庫、中國生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫檢索符合條件的出版文獻,檢索時間為建庫至2022年1月20日。英文文獻檢索詞為“Neoplasm”“Tumor”“Neoplasia”“Cancer”“FOXP4 antisense RNA 1”“l(fā)ong non-coding RNA FOXP4-AS1”“l(fā)ncRNA FOXP4-AS1”“FOXP4-AS1 lncRNA”“prognosis”“prognostic”“outcome”“survival”“recurrence”。中文文獻檢索詞為“腫瘤”“癌癥”“長鏈非編碼RNA FOXP4-AS1”“l(fā)ncRNA FOXP4-AS1”“預后”“生存”。
納入標準:①觀察性研究;②有關lncRNA FOXP4-AS1在惡性腫瘤中預后的關系;③報告總生存期(overall survival,OS)、無病生存期(diseasefree survival,DFS)或無復發(fā)生存期(relapse-free survival,RFS)。排除標準:①綜述;②會議摘要;③重復出版物;④細胞實驗;⑤動物實驗;⑥數(shù)據(jù)不足的文獻。
數(shù)據(jù)提取由兩名研究者獨立完成,并根據(jù)預先設計的數(shù)據(jù)提取準則提取相關數(shù)據(jù)。如果出現(xiàn)分歧則與第3個研究者進行討論或協(xié)商。研究資料包括第一作者姓名、發(fā)表年份、地理區(qū)域、樣本量、腫瘤類型、RNA檢測方法、生存分析類型、結局指標、風險比(hazard ratio,HR)及其95%置信區(qū)間(confidence interval,CI)。當所包含的文獻只有生存曲線時,使用Engauge Digitizer軟件及Tierney等[8]描述的方法提取生存信息。
采用Newcastle-Ottawa量表(Newcastle-Ottawa scale,NOS)評價納入文獻的質(zhì)量,包括研究人群選擇、組間可比性和結果測量3個類別的8個條目。質(zhì)量評估得分為0~9分,6分及以上表明文獻質(zhì)量較好。質(zhì)量評估同樣由兩名研究者獨立完成,通過討論解決分歧。
采用Review Manager 5.3軟件和Stata SE 12.0(Stata,College Station,TX)軟件進行Meta分析,應用HR及相應的95%CI評估lncRNA FOXP4-AS1與各種腫瘤預后的關系。采用χ2值和I2值評價各研究之間的異質(zhì)性,當I2≤50%或P﹥0.05時,采用固定效應模型進行分析;當I2﹥50%或P≤0.05時,采用隨機效應模型進行分析;采用漏斗圖以及Egger檢驗驗證發(fā)表偏倚,P﹤0.05時表明具有較明顯的發(fā)表偏倚;采用敏感性分析評估檢驗結果的穩(wěn)健性;此外,對OS進行亞組分析,以P﹤0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
本研究初步檢索文獻66篇(中文文獻12篇,英文文獻54篇),經(jīng)過剔重、閱讀摘要、全文復篩等最終納入文獻12篇,共1506例腫瘤患者。(圖1)
圖1 文獻檢索及篩選流程圖
納入的12篇文獻[9-20]均為英文文獻,9項研究[10-12,15-20]的研究對象來自中國,2項研究[13-14]的研究對象來自美國,其余1項研究[9]未交代研究對象來源;這些研究的樣本量最少為24例,最多為384例;9項研究[10-12,15-20]采用實時熒光定量聚合酶鏈反應(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)檢測RNA表達情況,其余3項研究[9,13-14]未交代檢測方法;10項研究[9-11,13-14,16-20]采用了中位數(shù)作為截斷值,其余2項研究[12,15]沒有詳細介紹截斷值;其中l(wèi)ncRNA FOXP4-AS1高表達患者736例,lncRNA FOXP4-AS1低表達患者770例;12項研究均采用了OS作為評估患者預后的指標,6項研究[9,11-13,16,18]采用了DFS作為評估患者預后的指標,1項研究[15]采用了RFS作為評估患者預后的指標;納入的12篇文獻NOS評分均≥6分,文獻質(zhì)量較好。(表1)
表1 納入12篇文獻的基本情況及質(zhì)量評價
12項研究報告了OS,因此均納入分析。異質(zhì)性檢驗結果顯示,I2=87%,存在異質(zhì)性,采用隨機效應模型,結果顯示,lncRNA FOXP4-AS1高表達患者的OS明顯短于lncRNA FOXP4-AS1低表達患者,差異有統(tǒng)計學意義(HR=1.65,95%CI:1.26~2.16,P﹤0.01)(圖2);敏感性分析結果顯示,逐個排除各項研究后結論未發(fā)生改變,說明Meta分析的結果是穩(wěn)健的(圖3);應用Egger檢驗進行發(fā)表偏倚檢測,結果顯示P=0.0051,漏斗圖的分布也顯示了不對稱性(圖4),提示存在一定的發(fā)表偏倚。
圖2 lncRNAFOXP 4-AS 1與腫瘤患者OS關系的森林圖
圖3 OS研究的敏感性分析
圖4 OS研究的漏斗圖
為探索異質(zhì)性來源,根據(jù)上述研究的樣本量、腫瘤類型和分析類型對OS進行亞組分析。結果顯示,不同樣本量亞組中,樣本量﹤100亞組(HR=1.78,95%CI:1.21~2.62,I2=89%)和樣本量﹥100亞組(HR=1.49,95%CI:1.00~2.22,I2=85%)中l(wèi)ncRNA FOXP4-AS1表達均與OS有關(P﹤0.05);不同腫瘤類型亞組中,消化系統(tǒng)腫瘤(HR=1.63,95%CI:1.06~2.51,I2=82%)和其他類型腫瘤(HR=1.68,95%CI:1.17~2.42,I2=91%)中l(wèi)ncRNA FOXP4-AS1表達均與OS有關(P﹤0.05);不同分析類型的亞組中,多變量分析(HR=1.75,95%CI:1.35~2.26,I2=80%)和單變量分析(HR=1.65,95%CI:1.12~2.42,I2=86%)中l(wèi)ncRNA FOXP4-AS1表達均與OS有關(P﹤0.05)。(表2)
表2 腫瘤患者OS的亞組分析結果
6項研究[9,11-13,16,18]被納入DFS的Meta分析中,結果顯示,lncRNA FOXP4-AS1表達與DFS無關(HR=1.27,95%CI:0.83~1.94,P=0.27,I2=86%);1項研究[15]被納入RFS的Meta分析中,結果顯示,lncRNA FOXP4-AS1高表達與較短的RFS有關(HR=2.67,95%CI:1.45~4.91,P﹤0.01)(圖 5)。漏斗圖的分布顯示一定的不對稱性(圖6),說明本研究納入的文獻存在一定的發(fā)表偏倚,DFS研究的Egger檢驗結果也驗證了這一結果(P=0.0379)。
圖5 lncRNAFOXP 4-AS 1與腫瘤患者DFS和RFS關系的森林圖
圖6 DFS和RFS研究的漏斗圖
通過閱讀大量文獻發(fā)現(xiàn),lncRNA在各種腫瘤中發(fā)揮促癌基因或抑癌基因的作用[21-23]。lncRNA通過與DNA、RNA或蛋白質(zhì)相互作用發(fā)揮分子支架、海綿或輔助活化劑的功能。許多l(xiāng)ncRNA在腫瘤的發(fā)展過程中具有至關重要的作用,它們參與了腫瘤的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移過程[24]。因此,鑒定腫瘤相關lncRNA對于了解其在腫瘤發(fā)生中的作用以及為腫瘤患者提供有希望的治療靶點具有重要意義。
本研究發(fā)現(xiàn),與lncRNA FOXP4-AS1低表達患者相比,lncRNA FOXP4-AS1高表達腫瘤患者的OS和RFS更短。lncRNA FOXP4-AS1表達與腫瘤患者的DFS無關(P﹥0.05),這可能是由于納入研究數(shù)較少且納入研究的結論不一致。本研究結果提示,lncRNA FOXP4-AS1高表達可能是影響腫瘤患者預后的不利因素,說明lncRNA FOXP4-AS1高表達可用于預測各種類型腫瘤的不良預后。OS的亞組分析也能夠驗證以上結論,根據(jù)分析類型進行亞組分析時,各亞組合并的I2均小于總體合并時的I2,提示納入研究的不同分析類型可能是異質(zhì)性較高的原因。其次,納入的12項研究定義lncRNA FOXP4-AS1表達高低的標準不同,其中還有2項研究未對定義標準進行交代,這也有可能是造成本研究異質(zhì)性較高的原因。此外,納入研究的結論不一致、不同類型腫瘤預后有一定差異也可能是本研究異質(zhì)性較高的原因。OS及DFS研究的漏斗圖和Egger檢驗均提示存在一定的發(fā)表偏倚,這可能是由于納入的陰性結果(lncRNA FOXP4-AS1的表達是腫瘤的保護因素)文獻數(shù)較少或者是缺少相關中文文獻。
雖然許多研究已經(jīng)探索了lncRNA FOXP4-AS1的表達與人類腫瘤預后的關系,但lncRNA FOXP4-AS1的作用機制仍然不清楚。國內(nèi)的一項研究發(fā)現(xiàn),lncRNA FOXP4-AS1可以通過競爭性結合微小RNA(microRNA,miRNA)-298上調(diào)TMPO基因表達,從而促進尤文肉瘤細胞的增殖、遷移、侵襲過程[25]。國外的一項研究結果顯示,lncRNA FOXP4-AS1可通過抑制miRNA-423-5p的表達,上調(diào)NACC1基因的表達,從而促進被套區(qū)細胞淋巴瘤細胞的增殖、遷移和侵襲過程[16]。到目前為止,只有少數(shù)研究探索了lncRNA FOXP4-AS1在腫瘤中的作用機制。此外,很少進行活體動物實驗。因此,還需要進行更多的基礎研究來闡明lncRNA FOXP4-AS1在腫瘤中的預后價值。
此外,本研究存在一定的局限性。首先,lncRNA FOXP4-AS1表達沒有公認的臨界值,這可能會影響研究結論在臨床上的應用,本研究只是初步研究,lncRNA FOXP4-AS1在腫瘤中的確切作用仍有待隨機對照試驗的進一步證實。其次,部分文獻沒有直接提供HR值,本研究根據(jù)Tierney等[8]描述的生存曲線提取方法間接獲得了幾篇文章中OS的HR和相應的95%CI,結果可能受到一定的影響。
綜上所述,lncRNA FOXP4-AS1高表達與腫瘤患者較短的OS和RFS有關,其可能成為腫瘤患者的預后標志物和潛在的治療靶點。