伍義文,曹健斌,黃維佳,何凌云(柳州市人民醫(yī)院心胸外科,廣西柳州 545006)
非小細(xì)胞肺癌(non small cell lung cancer cells,NSCLC)是肺癌中最常見(jiàn)的類(lèi)型,是根據(jù)腫瘤主體的生物學(xué)特性和對(duì)治療的敏感性來(lái)進(jìn)行區(qū)分的,大約占肺癌的80%~85%[1]。早期肺癌的發(fā)病人群大多是男性,但近年來(lái)研究發(fā)現(xiàn),女性非小細(xì)胞肺癌的發(fā)病比例也逐年增加,并逐漸趨于年輕化[2]。因此,探索非小細(xì)胞肺癌靶向分子標(biāo)志物,闡明其發(fā)生發(fā)展機(jī)制,對(duì)于臨床治療非小細(xì)胞肺癌具體方案的制定有十分重要的意義。甲基轉(zhuǎn)移酶3(methyltransferase-like 3,METTL3)是哺乳動(dòng)物N6 腺苷甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合體的關(guān)鍵組成部分,在mRNA,tRNA,rRNA,microRNA 前體和長(zhǎng)非編碼RNA等多種基因中對(duì)N6甲基腺苷(m6A)進(jìn)行修飾,可作為m6A甲基化的編碼器,通過(guò)不同的調(diào)控途徑參與腫瘤的發(fā)生發(fā)展[3-4]。有研究發(fā)現(xiàn)METTL3可以通過(guò)甲基化CCNE1 mRNA 3’非翻譯區(qū)(UTR)中的m6A 位點(diǎn)來(lái)促進(jìn)直腸癌細(xì)胞增殖,下調(diào)METTL3和相關(guān)細(xì)胞周期蛋白cyclin E1的表達(dá)來(lái)抑制細(xì)胞增殖,阻滯細(xì)胞周期,是治療直腸癌的一種有效策略[5]。miR-127 作為具有調(diào)控作用的非編碼微小RNA,與多種疾病的發(fā)生密切相關(guān)[6]。如研究百令膠囊通過(guò)下調(diào)miR-127 抑制巨噬細(xì)胞的增殖和吞噬作用,減少炎性細(xì)胞因子TNF-α,IL-1和IL-6的釋放,從而減輕狼瘡性腎炎的進(jìn)一步發(fā)展[7]。目前,關(guān)于METTL3和miR-127 在非小細(xì)胞肺癌中的表達(dá)及調(diào)控關(guān)系鮮有報(bào)道,故本研究著重分析了METTL3和miR-127 在非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系中的表達(dá)及它們之間的關(guān)系,探討METTL3介導(dǎo)miR-127對(duì)非小細(xì)胞肺癌自噬的調(diào)控機(jī)制。
1.1 研究對(duì)象 正常肺上皮細(xì)胞BEAS-2B,非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞HCC827,A549和H460(均購(gòu)自中國(guó)科學(xué)院細(xì)胞庫(kù))。
1.2 試劑與儀器 RPMI1640 培養(yǎng)液、胎牛血清(Gibico 公司);PCR 引物(上海生工生物工程公司合成);RNA 提取盒,RNA 逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(北京全式金生物技術(shù)有限公司);吖啶橙,Lyso-Tracker Red(上海碧云天生物技術(shù)有限公司);PTEN,p-AKT,p-mTOR,ULK1,Beclin-1抗體(Cell signaling technology 公司);LipofectAMINE 2000 細(xì)胞轉(zhuǎn)染試劑(美國(guó)Invitrogen 公司)。
1.3 方法
1.3.1 細(xì)胞培養(yǎng):BEAS-2B,HCC827,A549和H460 細(xì)胞均用10ml/dl 胎牛血清配置的RPMI1640培養(yǎng)液,培養(yǎng)于37 ℃ 5ml/dl CO2孵育箱中,用80%的細(xì)胞密度進(jìn)行傳代,待細(xì)胞長(zhǎng)至取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期后,進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。
1.3.2 qRT-PCR 檢測(cè)各細(xì)胞系中METTL3和miR-127的表達(dá):分別取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的各組細(xì)胞,嚴(yán)格按照試劑盒相關(guān)步驟進(jìn)行總RNA的提取,提取結(jié)束后吸取2 μl RNA 樣品用來(lái)檢測(cè)其純度,A260nm/A280nm的比值一般在1.6~1.8 之間即可;使用反轉(zhuǎn)錄試劑盒合成第一鏈cDNA ,反應(yīng)體系20 μl ,逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)條件:37℃ 15 min(反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)),85℃ 5 s(反轉(zhuǎn)錄酶的失活反應(yīng));用逆轉(zhuǎn)錄合成的cDNA作為模板進(jìn)行RT-PCR 擴(kuò)增,擴(kuò)增體系為20 μl,其中SYBR Premix ExTaq Ⅱ(2×)10 μl,cDNA 2 μl,上下游引物各1 μl,ROX Reference Dye Ⅱ(50×)0.5 μl,ddH2O 5.5 μl,實(shí)時(shí)PCR 條件:94 ℃ 5 min,94℃ 30 s,60℃ 30 s,72℃ 20 s,循環(huán)35 次,4℃保存?zhèn)溆?;采用熒光定量PCR 儀進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光PCR 檢測(cè),分別以β-actin和U6 作為METTL3和miR-127 內(nèi)參,根據(jù)RT-PCR 反應(yīng)結(jié)果中的Ct值,采用2-ΔΔCt相對(duì)定量法分析目的基因相對(duì)表達(dá)。
1.3.3 METTL3和miR-127 相關(guān)性研究:利用Linked Domic 數(shù)據(jù)庫(kù)查找在肺癌中與miR-127表達(dá)具有相關(guān)性的靶基因,分析其與METTL3 間的相關(guān)性。檢索文獻(xiàn)篩選出miR-127與自噬相關(guān)的下游因子,構(gòu)建METTL3介導(dǎo)miR-127調(diào)控非小細(xì)胞肺癌自噬的通路。
1.3.4 細(xì)胞轉(zhuǎn)染:取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的H460 細(xì)胞接種于6 孔板,待細(xì)胞生長(zhǎng)至融合時(shí),隨機(jī)分為三組,即轉(zhuǎn)染沉默載體(METTL3-siR 組)、陰性表達(dá)載體(NC-siR 組)及空白對(duì)照(Control 組),按LipofectAMINE 2000 轉(zhuǎn)染試劑說(shuō)明書(shū)進(jìn)行瞬時(shí)轉(zhuǎn)染,轉(zhuǎn)染6 h 后換新鮮的培養(yǎng)液繼續(xù)培養(yǎng),轉(zhuǎn)染48h后采用qRT-PCR 法驗(yàn)證轉(zhuǎn)染情況。
1.3.5 抑制METTL3表達(dá)對(duì)細(xì)胞自噬的影響:吖啶橙染色:取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的H460 細(xì)胞接種于6 孔板,培養(yǎng)48 h 后,棄去培養(yǎng)液,加入用PBS 稀釋至0.01%的吖啶橙染液,室溫避光染色5 min,熒光顯微鏡下520 nm 激發(fā)光觀察酸性自噬小體并拍照。Lyso-Tracker Red 染色:取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的H460 細(xì)胞接種于6 孔板,培養(yǎng)48 h 后,棄去培養(yǎng)液,加入50nmol/L的Lyso-Tracker Red 染料,37℃條件下避光染色1 h,PBS 潤(rùn)洗2 次后,加入Hoechst 33342染液避光復(fù)染20 min,PBS 清洗后熒光顯微鏡觀察自噬溶酶體數(shù)量并拍照。
1.3.6 Western blot 檢測(cè)自噬相關(guān)蛋白的表達(dá):取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期各組細(xì)胞,加入細(xì)胞裂解液充分裂解后,4℃,12 000 r/min 離心取上清液,BCA 試劑盒檢測(cè)樣品中蛋白濃度。若蛋白濃度相差過(guò)大,需要將樣品的蛋白濃度調(diào)至一致。將調(diào)整后樣品加入loading buffer,混勻煮沸10 min,恢復(fù)至室溫后離心,配置8%分離膠,在分離膠上面距頂端3 cm 處加入濃縮膠,加入蛋白樣品后,80 V 濃縮,120 V分離,電泳結(jié)束后轉(zhuǎn)NC 膜2 h,脫脂奶粉室溫封閉2 h,PBST 洗膜、加入一抗4℃孵育過(guò)夜,PBST 洗膜三次后加入二抗,室溫孵育2 h,PBST 漂洗3 次后采用化學(xué)發(fā)光法進(jìn)行顯色,凝膠成像儀觀察拍照,并用Image-J 軟件分析各組蛋白相對(duì)表達(dá)。
1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 應(yīng)用SPSS 22.0分析數(shù)據(jù),計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,多組間比較采用單因素方差分析,組間兩兩比較采用LSD-t檢驗(yàn);相關(guān)性分析用Pearson 法。以P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 正常肺上皮細(xì)胞和非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系中METTL3和miR-127表達(dá)情況 qRT-PCR 檢測(cè)顯示,非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系HCC827,A549和H460中METTL3相對(duì)表達(dá)分別為1.35±0.17,1.54±0.11,1.78±0.21,較正常肺上皮細(xì)胞BEAS-2B 中表達(dá)(0.91±0.11)顯著升高,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=34.037,P=0.002)。HCC827,A549,H460 細(xì)胞系中miR-127 相對(duì)表達(dá)分別為1.56±0.21,1.85±0.19和2.11±0.25,較正常肺上皮細(xì)胞BEAS-2B 中表達(dá)(1.02±0.20)亦顯著升高,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=28.152,P=0.005)。
2.2 METTL3和miR-127 相關(guān)性研究 見(jiàn)圖1。經(jīng)Linked Domics 數(shù)據(jù)庫(kù)篩選發(fā)現(xiàn),METTL3與miR-127在肺癌中表達(dá)呈正相關(guān)性(r=0.452,P<0.001)。
圖1 肺癌中METTL3和miR-127表達(dá)相關(guān)性
2.3 細(xì)胞轉(zhuǎn)染效果驗(yàn)證 轉(zhuǎn)染METTL3 抑制劑培養(yǎng)48 h 后,qRT-PCR 驗(yàn)證發(fā)現(xiàn),METTL3-siR 組METTL3 基因表達(dá)水平為0.61±0.15,較Control組(1.71±0.28)和NC-siR 組(1.65±0.19)顯著下降,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=78.357,P<0.001)。METTL3-siR 組細(xì)胞中miR-127表達(dá)水平為0.48±0.15,較Control 組(2.02±0.33)和NC-siR 組(1.97±0.25)miR-127表達(dá)水平顯著下降,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=105.216,P<0.001),說(shuō)明轉(zhuǎn)染成功,并且抑制METTL3表達(dá)可下調(diào)miR-127表達(dá)水平。
2.4 抑制METTL3表達(dá)對(duì)細(xì)胞自噬的影響 吖啶橙染色發(fā)現(xiàn),細(xì)胞內(nèi)綠色熒光減弱,紅色熒光增強(qiáng),說(shuō)明抑制METTL3表達(dá),使得自噬小泡增多,見(jiàn)圖2A;Lyso-Tracker Red 染色結(jié)果發(fā)現(xiàn),METTL3-siR 組出現(xiàn)紅色熒光,說(shuō)明自噬小體與細(xì)胞內(nèi)溶酶體結(jié)合,形成的自噬溶酶體增多見(jiàn)圖2B。
圖2 抑制METTL3表達(dá)對(duì)細(xì)胞自噬的影響
2.5 METTL3介導(dǎo)miR-127 對(duì)自噬相關(guān)蛋白表達(dá)的影響 Western blot 檢測(cè)表明,與Control 組和NC-siR 組相比,METTL3-siR 組細(xì)胞中PTEN,ULK1,Beclin1蛋白表達(dá)水平顯著升高,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=62.420~175.615,均P<0.001),p-AKT和p-mTOR 蛋白表達(dá)水平顯著下降,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=148.781,87.147,均P<0.001),見(jiàn)圖3和表1。
表1 抑制METTL3 對(duì)miR-127 下游自噬蛋白表達(dá)的影響(±s)
表1 抑制METTL3 對(duì)miR-127 下游自噬蛋白表達(dá)的影響(±s)
注:各時(shí)間點(diǎn)③組與①②組比較,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義P <0.05;①②組比較差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P >0.05)。
類(lèi)別Control①NC-siR 組②METTL3-siR 組③FP PTEN0.59±0.0170.62±0.0211.17±0.009112.165<0.001 p-AKT1.20±0.0231.14±0.0170.60±0.012148.781<0.001 p-mTOR0.95±0.0260.91±0.0280.53±0.01987.147<0.001 ULK10.63±0.0270.68±0.0311.22±0.030175.615<0.001 Beclin10.44±0.0120.50±0.0150.87±0.02662.420<0.001
圖3 Western blot 檢測(cè)自噬相關(guān)蛋白表達(dá)
據(jù)統(tǒng)計(jì),非小細(xì)胞肺癌的發(fā)病率和死亡率位列所有癌癥首位,由于其早期癥狀與普通肺炎相似,不易被重視,診斷時(shí)往往已經(jīng)發(fā)展成中晚期,導(dǎo)致錯(cuò)失最佳治療時(shí)間,術(shù)后5年生存率較低,嚴(yán)重威脅著患者的預(yù)后[8-9]。METTL3 作為RNA甲基轉(zhuǎn)移酶,控制m6A的修飾以影響mRNA的生物合成、衰變和翻譯,迄今為止已經(jīng)有許多研究證實(shí)了METTL3 調(diào)控miRNA 參與腫瘤進(jìn)程[10]。BI等[11]探討了METTL3介導(dǎo)的miR-126-5p 在卵巢癌進(jìn)展中的調(diào)控作用,結(jié)果發(fā)現(xiàn)敲低METTL3 抑制了miR-126-5p 上調(diào)PTEN的作用,阻止了PI3K/Akt/mTOR 途徑的激活,從而抑制了卵巢癌的發(fā)展,這些發(fā)現(xiàn)突出了未來(lái)卵巢癌治療的潛在目標(biāo)以及m6A 修飾介導(dǎo)的致瘤機(jī)制。ZHA 等[12]研究發(fā)現(xiàn)METTL3 過(guò)表達(dá)以微處理器蛋白質(zhì)DGCR8 依賴(lài)性的方式增加了RPE 細(xì)胞中miR-25-3p的水平,此外PTEN 可能受到miR-25-3p的負(fù)調(diào)控,而METTL3的過(guò)表達(dá)通過(guò)靶向miR-25-3p/PTEN 軸而增加了磷酸化的Akt(p-Akt)水平引起級(jí)聯(lián)反應(yīng),共同拯救了高糖處理的RPE 細(xì)胞中的細(xì)胞活力。SUN等[13]研究了METTL3 在胃癌中對(duì)非編碼RNA的作用機(jī)制,結(jié)果發(fā)現(xiàn)METTL3 在胃癌患者中呈高表達(dá),且預(yù)后差、惡性程度高,其機(jī)制可能是依賴(lài)于m6A/DGCR8的途徑促進(jìn)了miR-17-92的加工,進(jìn)而通過(guò)靶向PTEN 激活了AKT/mTOR 通路。
miR-127 作為miRNA的一員,在腫瘤細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),細(xì)胞分化、凋亡和自噬等過(guò)程中發(fā)揮著重要作用[14]。有研究發(fā)現(xiàn),miR-127 在肺癌組織和肺癌細(xì)胞中均異常高表達(dá),其過(guò)表達(dá)可以促進(jìn)癌細(xì)胞遷移、侵襲及上皮間質(zhì)細(xì)胞轉(zhuǎn)化,其調(diào)控機(jī)制可能是miR-127 作用于NF-κB 通路,影響肺癌的發(fā)生發(fā)展[15]。ZHANG 等[16]研究了新生兒缺血缺氧損傷中miR-127 引起異常自噬的作用機(jī)制,通過(guò)體外實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),miR-127-3p 敲除的新生兒損傷皮質(zhì)中自噬相關(guān)蛋白ATG12,P62,Beclin-1和LC3II的表達(dá)顯著降低,自噬液泡消失;此外miR-127-3p 對(duì)自噬過(guò)程中另一個(gè)至關(guān)重要的分子CISD1表達(dá)具有特定的調(diào)節(jié)作用,CISD1的過(guò)表達(dá)有效抑制了損傷腦中的自噬細(xì)胞死亡和生理功能障礙,靶向CISD1信號(hào)的miR-127-3p 可能被認(rèn)為是預(yù)防和治療新生兒缺血缺氧損傷的新策略。還有學(xué)者發(fā)現(xiàn)PTEN 是miR-127的直接結(jié)合位點(diǎn),miR-127 高表達(dá)可以負(fù)向調(diào)控PTEN表達(dá),進(jìn)而對(duì)其下游因子AKT 起到活化作用,AKT/mTOR 通路作為細(xì)胞自噬的經(jīng)典途徑,對(duì)癌癥的發(fā)生發(fā)展起到催化作用,因此通過(guò)降低miR-127表達(dá)來(lái)誘導(dǎo)癌細(xì)胞自噬和凋亡,可能是一種更特異、更有效治療癌癥的新方法[17]。
本研究通過(guò)體外實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),METTL3和miR-127 在非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系中表達(dá)水平顯著升高,兩者在肺癌中呈正性共表達(dá),提示METTL3和miR-127與非小細(xì)胞肺癌發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),扮演促癌基因角色。經(jīng)轉(zhuǎn)染介導(dǎo)敲低METTL3表達(dá),發(fā)現(xiàn)METTL3和miR-127表達(dá)水平均顯著下降,說(shuō)明利用脂質(zhì)體2000 轉(zhuǎn)染非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞是安全可行的,并且抑制METTL3 確實(shí)可以下調(diào)miR-127,進(jìn)一步說(shuō)明兩者之間存在一定的介導(dǎo)關(guān)系。另有研究通過(guò)吖啶橙染色和Lyso-Tracker Red 染色發(fā)現(xiàn)METTL3-siR 組細(xì)胞內(nèi)自噬小體增多,與溶酶體結(jié)合形成的自噬溶酶體也增多,提示抑制METTL3表達(dá)可以促使細(xì)胞發(fā)生自噬,誘導(dǎo)凋亡。同時(shí)還發(fā)現(xiàn),METTL3-siR 組PTEN表達(dá)升高,原因可能與PTEN作為miR-127的直接結(jié)合位點(diǎn)有關(guān),抑制METTL3導(dǎo)致miR-127 下調(diào),進(jìn)而上調(diào)PTEN表達(dá);AKT 作為PTEN的下游因子,激活PTEN 可以抑制AKT 磷酸化水平,進(jìn)而下調(diào)p-mTOR,ULK1和Beclin1 是mTOR 下游的自噬蛋白,表達(dá)水平與p-mTOR 呈負(fù)相關(guān),提示通過(guò)抑制METTL3表達(dá)來(lái)下調(diào)miR-127,進(jìn)而激活PTEN/AKT/mTOR 通路是促進(jìn)細(xì)胞發(fā)生自噬的重要途徑。
綜上所述,METTL3和miR-127 在非小細(xì)胞肺癌中起到促癌作用,抑制METTL3表達(dá)可以下調(diào)miR-127,促使癌細(xì)胞發(fā)生自噬,其調(diào)控機(jī)制可能與激活PTEN/AKT/mTOR 信號(hào)通路有關(guān)。但本研究還存在一定的局限性,首先只做了體外實(shí)驗(yàn),METTL3和miR-127 在體內(nèi)實(shí)驗(yàn)的表達(dá)水平及調(diào)控機(jī)制還有待進(jìn)一步驗(yàn)證;其次miR-127 是否還通過(guò)其他途徑來(lái)調(diào)控非小細(xì)胞肺癌的發(fā)生發(fā)展還需進(jìn)行深入研究,以期為非小細(xì)胞肺癌的治療提供更可靠的實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
現(xiàn)代檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志2022年2期