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抑制PP2Acα促進胃癌進展中WTAP高表達

2021-10-19 07:33程照翔呂純業(yè)
關鍵詞:小室磷酸化引物

程照翔,方 超,呂純業(yè)*

1南京醫(yī)科大學附屬江寧醫(yī)院普通外科,2中心實驗室,江蘇 南京 211100

絲氨酸/蘇氨酸磷酸酶2A(protein phosphatase 2A,PP2A)作為人體細胞中占比最高的磷酸酶,在惡性腫瘤的發(fā)生和轉(zhuǎn)移過程中發(fā)揮重要的作用,通常被作為一種抑癌因子進行研究[1]。流行病學調(diào)查顯示,作為PP2A 核心基礎的催化亞基α亞型PP2Acɑ,其編碼基因PPP2CA突變與胃癌發(fā)生相關[2]。

N6?甲基腺苷(N6?methyladenosine,m6A)修飾是細胞中最為重要且保守的RNA 修飾[3]。生物信息學研究表明,作為m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶復合物的橋接蛋白WTAP,其高表達與胃癌的不良預后密切相關[4]。

PP2A可以通過抑制細胞?髓細胞癥病毒性癌基因(cellular?myelocytomatosis viral oncogene,c?Myc)、B 細胞淋巴瘤/白血病?2 基因(B?cell leukemia/lym?phoma 2,BCL)等癌基因或者癌蛋白的表達[5-7],從而發(fā)揮抑癌作用;WTAP 卻往往會上調(diào)癌基因或者癌蛋白的水平[8-11]。二者在惡性腫瘤中均扮演重要角色,但作用大相徑庭,而且在胃癌中均無相關基礎研究,并缺乏相互關系的探索。因此,本文著重于研究抑制PP2Acα是否會影響胃癌細胞的惡性表型,以及在此過程中WTAP的表達。

1 材料和方法

1.1 材料

人胃癌細胞系BGC?823(人胃腺癌細胞,低分化,上海碧云天生物公司);慢病毒(上海凱基生物公司);結(jié)晶紫染液(上海碧云天生物公司);PCR引物(南京金斯瑞生物公司);劃痕小室(易必迪公司,德國);侵襲小室(康寧公司,美國);RNA 抽提試劑盒(離心柱式,上海碧云天生物公司);RT?qPCR 試劑盒(南京諾唯贊生物公司);抗PP2A?Cα/β抗體(Santa Cruz 公司,美國);抗WTAP 抗體(Proteintech公司,美國);抗β?actin抗體(Santa Cruz公司,美國);二抗(Rockland公司,美國)。

1.2 方法

1.2.1 細胞培養(yǎng)

人胃癌細胞系BGC?823,在補充有10%胎牛血清和1%青霉素/鏈霉素的培養(yǎng)基中培養(yǎng)。各組細胞均在37 ℃、5%CO2加濕培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。

1.2.2 慢病毒介導的shRNA轉(zhuǎn)染細胞

根據(jù)BGC?823 的感染復數(shù)值(multiplicity of in?fection,MOI),BGC?823細胞的MOI值為100,用慢病毒介導的shRNA轉(zhuǎn)染胃癌細胞,敲減PPP2CA基因,進而抑制PP2Acα的表達。轉(zhuǎn)染48 h 后收獲細胞。然后用嘌呤霉素篩選出陽性表達的細胞,嘌呤霉素篩選濃度為2 μg/mL。實驗所用shRNA 序列如下:sh?PPP2CA?1,5′?GATCCGTGGAACTTGACGATA?CTCTAACTCGAGTTAGAGTATCGTCAAGTTCCATT?TTTT?3′;sh?PPP2CA?2,5′?GATCCGCAGATCTTCT?GTCTACATGGTTCAAGAGACCATGTA?GACAGAA?GATCTGCTTTTTTG?3′;sh?PPP2CA?3,5′?GATCCG?GCAAATCACCAGATACAAATTTCAAGAG?AATTT?GTATCTGGTGATTTGCCTTTTTTG?3′。

1.2.3 定量逆轉(zhuǎn)錄PCR

使用RNA 抽提試劑盒(離心柱式)從培養(yǎng)的胃癌細胞中分離總RNA,然后使用Hiscrip?RT 試劑盒,按照手冊將1 μg 總RNA 反轉(zhuǎn)錄為cDNA。使用分光光度計測量RNA 的濃度。用熒光定量PCR 試劑盒在ABI StepOnePlusTM實時PCR 系統(tǒng)上進行qPCR 實驗。引物序列如下:GAPDH,5′?GGAGC?GAGATCCCTCCAAAAT?3′(正向引物),5′?GGCT?GTTGTCATACTTCTCATGG?3′(反向引物);WTAP,5′?CTTCCCAAGAAGGTTCGATTGA?3′(正向引物),5′?TCAGACTCTCTTAGGCCAGTTAC?3′(反向引物);PPP2CA,5′?CAAAAGAATCCAACGTGCAAG?AG?3′(正向引物),5′?CGTTCACGGTAACGAACCTT?3′(反向引物)。

1.2.4 蛋白免疫印跡分析

將蛋白酶抑制劑混合物的裂解緩沖液、1%磷酸酶抑制劑混合物加入胃癌細胞中,冰上裂解30 min,提取蛋白質(zhì)。使用蛋白定量試劑盒(BCA法)對各組蛋白濃度進行檢測。在進行Western blot實驗之前,將5×SDS?PAGE蛋白上樣緩沖液按比例加入蛋白裂解物,煮沸10 min后放入-20 ℃冰箱保存。取蛋白提取物(30~50 μg)用于預制膠電泳,電泳結(jié)束后用PVDF膜進行轉(zhuǎn)膜,然后用5%脫脂奶粉溶液室溫下封閉1 h。TBST 輕微漂洗封閉液后與稀釋后的一抗(β?actin、PP2Acα、WTAP 一抗的稀釋比例均為1∶1 000)在4 ℃下孵育過夜,第2天與相應稀釋后的二抗(二抗稀釋比例為1∶10 000)在室溫下孵育1 h,最后在暗室中滴加適量顯影液后進行曝光條帶。

1.2.5 克隆形成

將穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的胃癌細胞以每孔1 000個細胞的密度接種到6 孔板中,并培養(yǎng)2~3 周,棄去培養(yǎng)基,PBS洗滌2遍,然后將形成的細胞團用4%多聚甲醛固定15 min,最后結(jié)晶紫染色20 min。拍攝細胞團成像,并用Image J 1.8.0 軟件計數(shù)細胞團數(shù)。所有實驗均一式3份進行,并重復至少3遍。

1.2.6 細胞劃痕實驗

配置胃癌細胞懸液,將每組細胞懸液稀釋成5×105個/mL。將上述細胞懸液加入ibidi 雙孔小室中,每個小室加入70 μL 細胞懸液,細胞貼壁后用無菌鑷子取出小室,并加入2 mL完全培養(yǎng)基,在0、12和24 h 時間點,觀察細胞并使用配有照相機的倒置顯微鏡捕獲圖像。

1.2.7 細胞侵襲實驗

使用24孔鋪膠侵襲小室進行細胞侵襲測定,收獲穩(wěn)定轉(zhuǎn)染胃癌細胞,并以1×105個/mL的密度懸浮在無FBS的DMEM培養(yǎng)基中。接下來,將200 μL的細胞懸液加到上室中,同時將500 μL 的含有10%FBS的DMEM添加到底部小室中。于細胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h 后,用棉簽除去上室中未遷移的細胞,并將過濾器底部侵襲的細胞在4%的低聚甲醛中于室溫固定5 min。PBS 洗滌后,用結(jié)晶紫染色,并在相差顯微鏡下在5個隨機選擇的視野中以×10的放大倍數(shù)(物鏡)進行計數(shù)。

1.2.8 裸鼠成瘤實驗

本動物實驗倫理由南京醫(yī)科大學實驗動物中心批準(IACUC?2103060)。為了建立胃癌細胞的異種移植模型,從南京醫(yī)科大學動物實驗中心購買裸鼠(雌性,4 周齡)。在注射之前,在以下標準條件下,將小鼠在無特定病原體的環(huán)境中飼養(yǎng)1 周:光照/黑暗周期12 h,溫度25 ℃,濕度40%~60%,滅菌食物和高壓蒸餾水。用100 μL 的PBS 重懸各組胃癌細胞(細胞數(shù)量均為5×106個),分別皮下注射到每只小鼠的腋下(每組n=4)。4周后,對小鼠實施安樂死,并對腫瘤稱重。

1.3 統(tǒng)計學方法

所有定量數(shù)據(jù)均表示為平均數(shù)±標準差()。使用t檢驗分析正態(tài)分布數(shù)據(jù)之間的統(tǒng)計學差異。P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。統(tǒng)計分析使用的軟件包括Image J 1.8.0,GraphPad Prism 8。

2 結(jié)果

2.1 PPP2CA、WTAP 在胃癌組織中表達異常,二者均與胃癌預后相關

通過癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome At?las,TCGA)數(shù)據(jù)庫(https://www.cancer.gov)比較胃癌組織及癌旁正常胃黏膜組織中的PP2Acα編碼基因PPP2CA 和WTAP 的mRNA 表達水平,發(fā)現(xiàn)PPP2CA在胃癌組織中明顯下降(P=0.037;圖1A),而WTAP在胃癌組織中顯著上升(P<10-12,圖1B)。通過KM?plot網(wǎng)站(http://kmplot.com/analysis/)進行生存率分析,結(jié)果顯示PPP2CA高表達組、WTAP低表達組的預后顯著優(yōu)于各自的對照組(圖1C、D)。以上結(jié)果表明PPP2CA在胃癌組織中表達明顯下降,而WTAP在胃癌組織中卻顯著升高,且二者均與胃癌的預后密切相關。

圖1 PPP2CA、WTAP在胃癌中的表達及其與胃癌預后的關系Figure 1 The expression of PPP2CA and WTAP in gastric cancer and their relationship with the prognosis of gastric cancer

2.2 抑制PP2Acα可導致WTAP 的mRNA 及蛋白水平升高

為了探究PP2Acα與WTAP之間的關系,通過慢病毒介導的shRNA 敲減胃癌細胞BGC?823 中的PPP2CA,抑制PP2Acα的表達。慢病毒轉(zhuǎn)染48 h后,對熒光表達較強的Control 組、shRNA1 組、shRNA3組(圖2A)進行嘌呤毒素篩選,獲得了穩(wěn)定低表達PP2Acα的胃癌細胞。并在mRNA 及蛋白水平驗證敲減成功(圖2B、C)。對穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的胃癌細胞進行RT?qPCR、Western blot 實驗,發(fā)現(xiàn)抑制PP2Acα后,胃癌細胞BGC?823中的WTAP的mRNA及蛋白水平均明顯升高(圖2B、C)。

圖2 在骨癌細胞BGC?823中抑制PP2Acα對WTAP表達的影響Figure 2 Inhibition of PP2ACα could influence WTAP levels in gastric cancer cell BGC?823

2.3 體外實驗表明抑制PP2Acα促進胃癌細胞的增殖、遷移與侵襲

為了探究抑制PP2Acα對胃癌細胞的影響,在離體條件下進行了多種表型實驗。抑制PP2Acα后,胃癌細胞出現(xiàn)明顯的上皮間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)特征,即細胞形態(tài)向梭形改變,同時細胞之間變得松散(圖3A);克隆形成實驗(圖3B)發(fā)現(xiàn)shRNA1、shRNA3組的增殖能力均較Control 組明顯上升(P<0.01)。以相同的細胞密度在ibidi小室內(nèi)鋪板,于貼壁后的0 h、12 h、24 h觀察劃痕愈合情況,發(fā)現(xiàn)shRNA1組、shRNA3 組的愈合能力在12 h 時已顯著快于Control組(圖3C);且Tanswell 侵襲實驗也發(fā)現(xiàn)在培養(yǎng)24 h后,實驗組的侵襲能力明顯強于對照組(P<0.01,圖3D)。上述表型實驗證明了抑制PP2Acα可以促進胃癌細胞的增殖、遷移、侵襲能力。

2.4 在體實驗表明抑制PP2Acα促進胃癌細胞的增殖

將穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的胃癌細胞接種到4周齡雌性裸鼠的腋下(n=4)。4 周后,處死所有裸鼠,并分離出腫瘤。結(jié)果表明,實驗組腫瘤體積較對照組明顯增加(P<0.01,圖4)。裸鼠成瘤實驗表明在活體層面,抑制PP2Acα可以促進胃癌細胞的增殖。

圖4 在體實驗抑制PP2Acα對胃癌細胞增殖能力的影響Figure 4 Inhibition of PP2Acα on the proliferation of gas?tric cancer cells in vivo

2.5 探究PP2Acα與WTAP二者之間的聯(lián)系

通過蛋白互作功能富集分析網(wǎng)站STRING(https://string?db.org/),查詢PP2Acα與WTAP 二者之間的聯(lián)系。發(fā)現(xiàn)PP2Acɑ通過整合因子復合體亞基5(integrator complex subunit 5,INTS5)、RNA 聚合酶Ⅱ亞基2(RNA polymerase Ⅱsubunit B,POLR2B)與WTAP 建立聯(lián)系(圖5A)。但是數(shù)據(jù)庫顯示的證據(jù)不足以明確PP2Acɑ通過INTS5、POLR2B 調(diào)控WTAP 的表達或功能。為了明確PP2Acɑ與WTAP之間的調(diào)控關系,又通過磷酸化位點網(wǎng)站Phospho?site(http://www.phosphosite.org)查詢WTAP 的磷酸化修飾情況,發(fā)現(xiàn)WTAP 的氨基酸序列存在大量磷酸化位點(圖5B)。這也意味著WTAP 上的磷酸化修飾可能會受到PP2Acα的調(diào)控,進而影響WTAP的功能與表達。

圖5 探究PP2Acα與WTAP二者之間的聯(lián)系Figure 5 Explore the relationship between PP2ACα and WTAP

3 討論

PP2A 全酶是由結(jié)構(gòu)亞基A(65 kDa),調(diào)節(jié)亞基B(50~130 kDa)和催化亞基C(36 kDa)組成的異源三聚體。催化亞基C為PP2A全酶的核心結(jié)構(gòu),具有2個亞型:PP2Acα(由PPP2CA基因編碼)和PP2Acβ(由PPP2CB 基因編碼),PP2Acα 的比例遠高于PP2Acβ(約9 倍)[12]。因此,PP2Acα的異常表達會導致PP2A全酶活性降低,影響體內(nèi)磷酸化穩(wěn)態(tài)的維持,進而誘導或促進各種惡性腫瘤的發(fā)生和發(fā)展[13]。

臨床研究發(fā)現(xiàn)PP2Acɑ的低表達與直腸癌的T、N、M分期相關,且PP2Acɑ低表達患者的預后更差[14];PP2Acɑ表達的恢復可逆轉(zhuǎn)EMT,并抑制前列腺腫瘤的生長和轉(zhuǎn)移[15];在肝癌細胞中,PP2Acɑ可以抑制P53 引起的癌細胞凋亡,促進肝癌細胞的增殖[16]。但PP2Acɑ 在胃癌中的作用卻鮮有報道,通過Pubmed 數(shù)據(jù)庫檢索,PP2Acɑ與胃癌的相關研究僅有1篇文章,2017年Huang等[2]發(fā)現(xiàn)PPP2CA的遺傳變異與中國人群胃癌的患病風險相關。但胃癌惡性表型的針對性研究,并未有PP2Acɑ的相關報道,其具體機制仍需進一步研究。

WTAP作為m6A甲基轉(zhuǎn)移酶復合物中的橋接蛋白,具有穩(wěn)定METTL3、METTL14的作用[17]。這一基礎使得WTAP 可參與細胞的許多生命過程,例如選擇性剪接,X 染色體失活和細胞周期調(diào)控[18]。正因為這樣,WTAP 的表達失調(diào)可以促進多種惡性腫瘤的發(fā)展。例如,過表達WTAP 可通過穩(wěn)定周期蛋白依賴性激酶2(cyclin dependent kinase 2,CDK2)轉(zhuǎn)錄本,進而促進腎細胞癌的進展[19];其也可通過Wnt/β?catein 信號通路來增強子宮內(nèi)膜癌的抗藥性[20];還可通過刺激轉(zhuǎn)移相關標志物基質(zhì)金屬蛋白酶7(matrix metallopeptidase 7,MMP7)和基質(zhì)金屬蛋白酶28(matrix metallopeptidase 7,MMP28)的表達來增強膽管癌的侵襲性[21]。所以,WTAP 的表達水平與胃癌進展的關系也是值得深入研究的,但目前僅有生物信息學文章支持WTAP的高表達與胃癌進展相關,相關的基礎實驗仍然缺乏。

因此,本研究初步探究了PP2Acɑ失調(diào)與胃癌進展的聯(lián)系,以及在這一過程中WTAP 表達水平的變化。本研究中,通過慢病毒介導的shRNA抑制胃癌細胞中PP2Acɑ的表達,隨后進行的細胞體外實驗表明,胃癌細胞的形態(tài)出現(xiàn)EMT典型特征,并且增殖、遷移與侵襲能力均得到增強;裸鼠層面的活體實驗,也證明了抑制PP2Acɑ可以促進胃癌細胞的增殖;RT?qPCR、WB實驗表明,WTAP的mRNA與蛋白水平均顯著升高?;谏鲜鲇懻摷皩嶒灲Y(jié)果,推測,抑制PP2Acɑ促進胃癌細胞的惡性表型,可能是通過上調(diào)WTAP的表達水平實現(xiàn)的。

為了探究PP2Acɑ與WTAP之間的調(diào)控關系,筆者首先通過蛋白互作功能富集分析網(wǎng)站STRING,查詢這兩種蛋白之間的聯(lián)系。發(fā)現(xiàn)PP2Acɑ通過INTS5、POLR2B與WTAP建立聯(lián)系。但是數(shù)據(jù)庫顯示的證據(jù)不足以明確PP2Acɑ通過INTS5、POLR2B調(diào)控WTAP 的表達或功能。為了明確PP2Acɑ與WTAP 之間的調(diào)控關系,筆者又通過Phosphosite 網(wǎng)站查詢WTAP 的磷酸化修飾情況,發(fā)現(xiàn)WTAP 的氨基酸序列存在大量磷酸化位點。這表明WTAP的功能會受到磷酸化修飾的影響,而磷酸化修飾往往伴隨蛋白質(zhì)穩(wěn)定性的改變,最終導致蛋白總量的變化。PP2Acɑ對于體內(nèi)磷酸化穩(wěn)態(tài)的維持必不可少,其表達失調(diào)會對蛋白的表達和功能產(chǎn)生重要影響,這或許可以解釋本研究中出現(xiàn)的結(jié)果,即在胃癌細胞中抑制PP2Acɑ可導致WTAP的表達上升,但這一機制需要后續(xù)的實驗深入探究加以完善。

綜上,通過本研究,發(fā)現(xiàn)抑制PP2Acɑ可以促進胃癌的增殖、遷移與侵襲,并且在這一過程中WTAP的表達顯著上調(diào)。這些結(jié)果將有助于進一步對胃癌的深入研究,并對胃癌診療具有重要意義。

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