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氨基-3-氰基丙酸衍生物的合成

2021-01-28 06:16孟祥凱王小龍
合成化學 2021年1期
關鍵詞:柱層析石油醚吡啶

孟祥凱, 王小龍, 薛 鑫

(南京中醫(yī)藥大學 藥學院,江蘇 南京 210046)

Caspase-1屬于Caspase家族,也被稱為IL-1β轉換酶(ICE),水解切割某些蛋白質,如炎性細胞因子IL-1β和IL-18的前體,從而加工pro-IL-1β和pro-IL-18等炎癥因子使其成熟并釋放,誘導細胞的炎癥反應,因此,Caspase-1在炎癥反應中起著核心調控作用[1-4]。此外,Caspase-1還能將甲狀腺激素誘導劑Gasdermin D切割成活性形式,介導一種特殊的促炎癥的程序性細胞凋亡[5-7]。

Chart 1

目前報道的Caspase-1的合成抑制劑分為兩類:一類是針對Caspase-1的生理底物而設計的肽類(Tyr-Val-Ala-Asp)抑制劑,往往在Caspase-1特異識別的天冬氨酸(Asp)處連接一個親電的基團,如醛基、苯甲酮、鹵甲基酮[8-9]。另一類是非肽類小分子有機化合物,由于非肽類小分子抑制劑具有免疫反應小、分子量低、易于穿透血腦屏障,具有較好的藥代動力學的性質,受到廣泛的關注和開發(fā)[10-11]。

Scheme 1

圖1NCGC00183434與Caspase 1結合的分子對接模型:(a)帶狀;(b)填充

肽類Caspase-1抑制劑NCGC00183434具有活性高、易于合成等優(yōu)點,一直作為Caspase-1靶點研究的陽性對照藥,但在臨床研究中發(fā)現(xiàn)對機體有一定的毒性,因此未能成藥[13]。通過研究NCGC00183434的作用方式發(fā)現(xiàn)[12](圖1), S1部分處于溶劑區(qū),與蛋白沒有直接相互作用,而其他部位均有對應口袋,可與半胱氨酸殘基285、精氨酸殘基341和179等殘基形成相應的氫鍵,因此,用骨架躍遷的方法對S1部位改造,用吡啶環(huán)替換了原來的吡咯環(huán),沒有改變分子原來的走向,從而設計出全新結構的非肽類小分子Caspase-1抑制劑(Chart 1)。

陽性藥NCGC00183434的合成主要是4個氨基酸的脫保護縮合過程(Scheme 1),且氨基酸自帶手性,合成過程不需要考慮手性問題,合成比較簡單。目標化合物為非肽小分子,從整體來看,可分為3部分,其中中間部分含有一個手性中心,可引入一個帶有手性且空間位阻較大基團,通過手性誘導的方法保持構型,或者可以通過手性拆分得到所需構型化合物。另外,吡啶5-位溴活性可能較差,直接引入氨基將其取代可能難度較大,嘗試先用碘取代吡啶5-位溴,然后再由氨基進行取代(Scheme 2)。

Scheme 2

1 實驗部分

1.1 儀器與試劑

WRS-1B型數(shù)字熔點儀;Bruker AV 400 MHz/500 MHz型核磁共振儀(DMSO-d6或CDCl3為溶劑, TMS為內標);Thermo ScientificTMQ ExactiveTMFocus型四極桿軌道阱質譜儀;Agilent 1260型系列高效液相色譜儀;Shimadzu-8A型高效液相制備色譜儀;SGW-1型自動旋光儀。

原代巨噬細胞(BMDM),南京醫(yī)科大學提供;其余所用試劑均為分析純。

1.2 合成

(1) 化合物2的合成[14-15]

氮氣保護下,稱取化合物112.0 g(50.7 mmol)溶解于400 mL甲苯中,量取正丁基鋰(2.5 M)24.3 mL(60.9 mmol),-78 ℃下緩慢滴加,滴畢,繼續(xù)反應3 h,再稱取特戊醛5.67 g(66.0 mmol),緩慢滴加,滴畢,繼續(xù)反應1 h?;謴椭潦覝睾缶徛渭铀?0 mL淬滅反應,濃縮,殘余經(jīng)硅膠柱層析(洗脫劑:石油醚/乙酸乙酯=25/1~16/1,V/V) 純化得無色油狀液體9.1 g,產(chǎn)率72.5%;1H NMR(500 MHz, DMSO-d6)δ: 8.07(s, 1H), 7.73(d,J=16.4 Hz, 1H), 6.79(d,J=8.6 Hz, 1H), 5.02(d,J=11.2 Hz, 1H), 2.00(d,J=18.2 Hz, 1H), 0.88(s, 9H); MS(ESI)m/z: 243.9{[M+H]+} 。

(2) 化合物3的合成

稱取化合物29.0 g(36.9 mmol)和PCC 9.54 g(44.3 mmol)溶解于150 mL二氯甲烷中, 反應12 h。反應結束后,抽濾,濃縮濾液,殘余經(jīng)硅膠柱層析(洗脫劑:石油醚/乙酸乙酯=24/1,V/V) 純化得無色油狀液體6.6 g,產(chǎn)率74.1%;1H NMR(400 MHz, CDCl3)δ: 8.68(dd,J=2.3 Hz, 0.6 Hz, 1H), 7.92(dd,J=8.4 Hz, 2.3 Hz, 1H), 7.82(dd,J=8.4 Hz, 0.6 Hz, 1H), 1.43(s, 9H); MS(ESI)m/z: 241.9{[M+H]+} 。

(3) 化合物4的合成[16]

氮氣保護下,稱取化合物36.5 g(26.8 mmol),R-(+)-叔丁基亞磺酰胺3.6 g(29.5 mmol)和鈦酸四乙酯12.2 g(53.6 mmol)溶解于200 mL無水四氫呋喃中,76 ℃反應16 h。反應完畢后,除去大部分四氫呋喃,加入少量水,有大量白色固體析出,加入300 mL乙酸乙酯溶解,抽濾,分液,合并有機相,濃縮,殘余經(jīng)硅膠柱層析(洗脫劑:石油醚/乙酸乙酯= 24/1,V/V) 純化得淡黃色固體6.9 g,產(chǎn)率75.1%;1H NMR(500 MHz, DMSO-d6)δ: 8.72(d,J=2.2 Hz, 1H), 8.09(dd,J=8.3 Hz, 2.3 Hz, 1H), 7.29(d,J=8.3 Hz, 1H), 1.17(s, 9H), 1.13(s, 9H); MS(ESI)m/z: 344.7{[M+H]+}。

(4) 化合物5的合成

(5) 化合物6的合成

稱取化合物55.5 g(22.6 mmol)溶解于60 mL HCl/dioxane(4 N)混合溶劑中,室溫反應5 h。反應結束后,抽濾,濾餅用乙酸乙酯/石油醚(1/1,V/V)洗滌得淡黃色固體5.0 g,產(chǎn)率91.2%;1H NMR(400 MHz, DMSO-d6)δ: 8.76(d,J=2.4 Hz, 1H), 8.52~8.48(m, 2H), 8.14(dd,J=8.3 Hz, 2.4 Hz, 1H), 7.50(d,J=8.4 Hz, 1H), 4.24(q,J=5.8 Hz, 1H), 0.94(s, 9H); MS(ESI)m/z: 242.1 {[M+H]+}。

(6) 化合物7的合成

稱取化合物64.9 g(20.0 mmol),3-氯-4-氨基苯甲酸3.8 g(22.0 mmol), HATU 9.1 g(24.0 mmol)溶解于80 mL DMF中,緩慢滴加DIPEA 7.8 g(60.0 mmol),滴畢,繼續(xù)反應12 h。反應結束后,溶解于200 mL乙酸乙酯中,依次用飽和碳酸氫鈉溶液、飽和食鹽水洗滌,分液,合并有機相,無水氯化鈉干燥,過濾,濃縮濾液,殘余物經(jīng)硅膠柱層析(洗脫劑:石油醚/乙酸乙酯= 7/1~8/1,V/V) 純化得白色固體5.7 g,產(chǎn)率72.1%;1H NMR(400 MHz, DMSO-d6)δ: 8.65(d,J=2.4 Hz, 1H), 8.06~7.97(m, 2H), 7.80(d,J=2.1 Hz, 1H), 7.58(dd,J=8.4 Hz, 2.1 Hz, 1H), 7.52(d,J=8.4 Hz, 1H), 6.79(d,J=8.5 Hz, 1H), 5.90(s, 2H), 5.06(d,J=9.4 Hz, 1H), 0.93(s, 9H); MS(ESI)m/z: 395.2{[M+H]+}。

(7) 化合物8的合成[17-18]

稱取化合物75.5 g(13.9 mmol), CuI 264.7 mg(1.39 mmol), NaI 5.2 g(34.8 mmol),N,N-二甲基乙二胺245.1 mg(2.78 mmol)溶解于60 mL 二氧六環(huán)中,置換氮氣3次后于110 ℃反應16 h。反應結束后,恢復至室溫,抽濾,用50 mL乙酸乙酯洗滌,濃縮,殘余物經(jīng)硅膠柱層析(洗脫劑:石油醚/乙酸乙酯= 7/1~8/1,V/V)純化得白色固體3.8 g,產(chǎn)率61.1%;1H NMR(400 MHz, DMSO-d6)δ: 8.75(d,J=2.2 Hz, 1H), 8.14(dd,J=8.3 Hz, 2.2 Hz, 1H), 7.99(d,J=9.5 Hz, 1H), 7.79(d,J=2.0 Hz, 1H), 7.58(dd,J=8.5 Hz, 2.1 Hz, 1H), 7.39(d,J=8.3 Hz, 1H), 6.79(d,J=8.5 Hz, 1H), 5.90(s, 2H), 5.02(d,J=9.4 Hz, 1H), 0.93(s, 9H); MS(ESI)m/z: 444.1{[M+H]+}。

(8) 化合物9的合成[19-20]

稱取化合物83.6 g(8.1 mmol),T21.7 g(8.9 mmol), CuI 380.6 mg(1.62 mmol),碳酸銫6.7 g(20.25 mmol),L1817.5 mg(4.86 mmol)溶解于50 mL DMF中,置換氮氣3次后于 50 ℃反應12 h。反應結束后,過濾,收集濾液,直接進行下一步反應。

(9) 化合物10的合成

稱取TBTU 7.7 g(24.1 mmol)和DIPEA 4.1 g(31.7 mmol)加入到上一步反應液中,緩慢滴加3.0 mL氨水(wt25%)反應12 h。反應結束后,溶解于150 mL乙酸乙酯中,分別用100 mL飽和食鹽水、純水洗滌,合并有機相,無水硫酸鈉干燥,過濾,濃縮,殘余經(jīng)硅膠柱層析(洗脫劑:石油醚/乙酸乙酯= 3/1,V/V) 純化得棕褐色固體1.8 g,兩步產(chǎn)率46.1%;1H NMR(500 MHz, DMSO-d6)δ: 8.10(d,J=2.3 Hz, 1H), 7.92(d,J=8.8 Hz, 1H), 7.79(d,J=2.3 Hz, 1H), 7.62(dd,J=8.3 Hz, 2.0 Hz, 1H), 7.49(s, 2H),7.21(d,J=8.8 Hz, 1H), 6.93(dd,J=8.1 Hz, 2.4 Hz, 1H), 6.86(d,J=8.7 Hz, 1H), 5.94(s, 2H), 5.68(d,J=6.6 Hz, 1H), 4.91(d,J=7.8 Hz, 1H), 3.66(q,J=5.8 Hz, 1H), 2.62(dd,J=11.6 Hz, 5.2 Hz, 1H), 2.16(dd,J=11.7 Hz, 6.6 Hz, 1H), 1.26(s, 9H), 0.79(s, 9H); MS(ESI)m/z: 504.1{[M+H]+}。

表1 合成化合物5反應條件篩選

(10) 化合物11的合成[21-22]

稱取化合物71.5 g(3.0 mmol),吡啶791 mg(10 mmol)溶解于15 mL二氧六環(huán)中,冰浴下,緩慢滴加三氟乙酸酐1.25 g(6.0 mmol),滴畢,恢復至室溫,繼續(xù)反應5 h。反應結束后,加入冰水淬滅反應,溶解于80 mL乙酸乙酯中,用水(2×50 mL)洗滌,合并有機相,無水硫酸鈉干燥,過濾,濃縮,殘余經(jīng)硅膠柱層析(洗脫劑:石油醚/乙酸乙酯= 5/1,V/V) 純化得白色固體921.5 mg,產(chǎn)率64.3%;1H NMR(500 MHz, DMSO-d6)δ: 7.91(d,J=2.8 Hz, 1H), 7.80(d,J=9.5 Hz, 1H), 7.74(d,J=2.0 Hz, 1H), 7.55(dd,J=8.5 Hz, 2.1 Hz, 1H), 7.11(d,J=8.4 Hz, 1H), 6.87(dd,J=8.4 Hz, 2.8 Hz, 1H), 6.79(d,J=8.4 Hz, 1H), 5.88(s, 2H), 5.56(d,J=6.1 Hz, 1H), 4.88(d,J=9.5 Hz, 1H), 3.68(q,J=6.2 Hz, 1H), 2.58(dd,J=14.6 Hz, 5.5 Hz, 1H), 2.28(dd,J=14.7 Hz, 6.9 Hz, 1H), 1.33(s, 9H), 0.88(s, 9H); MS(ESI)m/z: 486.3{[M+H]+}。

(11) 化合物12的合成[23]

稱取化合物11900 mg(1.8 mmol)溶解于5 mL二氯甲烷中,緩慢滴加三氟乙酸5 mL,滴畢,繼續(xù)反應3 h。反應結束后,濃縮,殘余經(jīng)液相色譜分離(洗脫劑:水/乙腈=3/1,V/V) 純化得白色固體395.8 mg,產(chǎn)率51.1%;1H NMR(500 MHz, DMSO-d6)δ: 8.17(d,J=2.7 Hz, 1H), 8.10(d,J=8.7 Hz, 1H), 7.80(d,J=2.1 Hz, 1H), 7.67(s, 1H), 7.58(dd,J=8.5 Hz, 2.0 Hz, 2H), 6.78(d,J=8.5 Hz, 1H), 5.06(d,J=8.7 Hz, 1H), 4.95(d,J=7.9 Hz, 1H), 3.82(s, 2H), 3.05(dd,J=16.9 Hz, 6.4 Hz, 1H), 2.93(dd,J=16.9 Hz, 7.4 Hz, 1H), 0.95(s, 9H);13C NMR(125 MHz, DMSO-d6)δ: 172.25, 170.60, 166.05, 148.17, 146.64, 143.11, 129.36, 128.26, 125.91, 122.24, 121.89, 119.54, 116.43, 114.49, 60.41, 41.40, 37.25, 35.63, 26.97, 26.97, 26.97; MS(ESI)m/z: 430.1{[M+H]+} 。

2 結果與討論

2.1 合成

以2,5-二溴吡啶為原料合成化合物2,由于吡啶2-位溴的活性明顯優(yōu)于5-位,加入丁基鋰后優(yōu)先與2-位溴反應,實驗表明,得到的化合物2中有85%以上化合物為2-位溴被取代的化合物,僅有少量5-位溴被取代的化合物,且兩者極性有差異,經(jīng)柱層析可將兩者分離。在合成化合物6時,選用了不同的反應條件來合成[24-25],結果見表1,反應條件1和2可直接將化合物3經(jīng)過一步反應合成化合物6且產(chǎn)率均在86%以上,但合成的產(chǎn)物基本為外消旋體,后期進行手性拆分比較繁瑣且收率較低。反應條件3雖然經(jīng)過3步反應才合成化合物6,且產(chǎn)率也僅為60.3%,但是合成的產(chǎn)物中有94.5%的構型是所需要的,后期不需要進行手性拆分,節(jié)約了成本和時間,所以選取了反應條件3來合成。在合成化合物9時(表2),起初以化合物7為底物,L1作為配體,用T2直接取代化合物7中吡啶5-位溴,經(jīng)一步反應得到化合物9。但嘗試了不同溶劑、不同反應溫度及不同反應時間,均沒有得到目標產(chǎn)物,原因可能是化合物7中吡啶5-位的溴反應活性較差。由于碘的反應活性強于溴,因此,考慮先將化合物7中吡啶5-位的溴替換為碘,然后再由T2將其取代,結果成功得到目標化合物9,并且嘗試了不同的反應溶劑,發(fā)現(xiàn)溶劑為DMF時產(chǎn)率最高。

Scheme 3

Scheme 4

表2 合成化合物9反應條件篩選

2.2 反應機理

由化合物4合成化合物5時(Scheme 3),首先化合物4中的氮與DIBAL-H中的鋁配位(3-1),由于化合物4含有手性且體積較大的叔丁基團,DIBAL-H有兩個體積較大的二異丁基團,因此,受到空間位阻的影響,兩者配位時只能從位阻較小側配位,形成構型單一的配位化合物,同時,DIBAL-H中的氫只能從碳氮雙鍵的單側還原雙鍵,隨后,配位化合物結合溶劑中的質子(3-3),DIBAL-H殘基離去,因此可以得到構型單一的化合物5。

由化合物7合成化合物9反應過程比較復雜,提出了一個反應機理。在合成化合物8時(Scheme 4),首先N,N-二甲基乙二胺作為配體與CuI絡合,形成配體絡合物;然后化合物7中溴存在孤對電子,配體絡合物中銅存在空軌道,兩者配位結合,同時,絡合物中的碘進攻吡啶5-位,形成一個四元環(huán)的中間過渡態(tài),最后,溴離子與配體絡合物離去,碘取代吡啶5-位溴,這樣就可以得到化合物8。

2.3 細胞活性

原代巨噬細胞(BMDM)在LPS+ATP的刺激下,活化的Caspase-1將關鍵促炎細胞因子IL-1β從無活性前體加工成熟,并促進其分泌,因此,Caspase-1被認為是炎癥過程的關鍵介質,通過分析IL-1β的分泌量,可間接反映抑制劑對Caspase-1的抑制情況。因此,原代巨噬細胞(BMDM)在LPS+ATP的刺激下,分別加入不同濃度的化合物12,其中,LPS+ATP為空白對照組,ML132和Z-YVAD分別為兩種10 nM和10 μM陽性參照,結果由圖2可見,化合物12對Caspase-1的抑制活性隨濃度的升高而逐漸增強。

圖2化合物12細胞活性

3 結論

采用廉價易得的2,5-二溴吡啶為原料,經(jīng)11步化反應合成了新結構的非肽類小分子化合物12,總收率為2.2%, 收率偏低,合成路線有待于進一步優(yōu)化。采用ELISA法研究發(fā)現(xiàn)合成的化合物12對細胞(BMDM)的Caspase-1活性具有一定的抑制作用,但藥物活性還有待進一步提高,為Caspase-1小分子抑制劑的研究提供了參考。

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