王玉龍,張 卿,趙永廉,劉建玲,秦 嶺,曹慶芹,邢 宇*
(1a.北京農(nóng)學(xué)院植物科學(xué)技術(shù)學(xué)院/北京林果業(yè)生態(tài)環(huán)境功能提升協(xié)同創(chuàng)新中心/農(nóng)業(yè)應(yīng)用新技術(shù)北京重點實驗室,1b. 北京農(nóng)學(xué)院生物與資源環(huán)境學(xué)院/農(nóng)業(yè)農(nóng)村部華北都市農(nóng)業(yè)重點實驗室,北京 102206;2.北京市懷柔區(qū)板栗試驗站,北京101405)
板栗(CastaneamollissimaBlume)是殼斗科(Fagaceae)栗屬(Castanea)植物,分布于中國26個省(市、區(qū)),適應(yīng)性強(qiáng),是重要的生態(tài)經(jīng)濟(jì)兼用樹種[1]。作為以堅果為主要經(jīng)濟(jì)來源的物種,堅果的產(chǎn)量及品質(zhì)成為種質(zhì)資源評價的重要指標(biāo)。而淀粉是板栗堅果的主要成分,是影響堅果口感和加工品質(zhì)的主要因素之一。淀粉在板栗堅果干物質(zhì)中含量較大,占干重46%~64%[2]。其中直鏈淀粉和支鏈淀粉的比例對板栗加工的口感有較大的影響??剐缘矸?Resistant Starch, RS)是種新型的膳食纖維,它指的是“在健康者小腸中不被吸收的淀粉及淀粉的降解物”[3]。板栗中的抗性淀粉含量較高,可以達(dá)到68.93%,吃板栗可以調(diào)養(yǎng)人體健康狀況[4]。
淀粉合成是一個復(fù)雜的生化過程,其主要以光合作用所產(chǎn)生的蔗糖為碳源,經(jīng)水解后以1-磷酸葡萄糖(G1P)的形式進(jìn)入造粉體中[5]。在直鏈淀粉合成酶的催化下,G1P單體的葡糖基通過α1-4糖苷鍵連接至直鏈淀粉非還原性末端,支鏈淀粉的合成是在淀粉分支酶催化下通過α1-6糖苷鍵將葡糖基連接至分支點處。這其中還有淀粉脫支酶,異淀粉酶,磷酸化酶等的參與。淀粉的生物合成是多種酶共同作用的結(jié)果。
雖然淀粉在生物體中合成的機(jī)理目前已經(jīng)有比較深入的研究,但是板栗淀粉合成酶基因的功能目前還沒有得到驗證。由于板栗屬于木本植物,生長周期長,不易獲得轉(zhuǎn)基因植株;另外,板栗胚性愈傷組織誘導(dǎo)困難、數(shù)量少、周期長,限制栗屬植物重要基因功能的驗證[6]。本試驗將水稻作為轉(zhuǎn)基因材料的受體,通過將板栗可溶性淀粉合成酶(soluble starch synthase, SSS)、淀粉分支酶(starch branching enzyme, SBE)和淀粉去分支酶(pullulanase, PUL)的編碼基因在水稻中過量表達(dá),測定其對水稻籽粒淀粉含量的影響,以期為板栗淀粉合成酶基因功能的驗證提供試驗參考。
過表達(dá)中國板栗SSSII、SSSIII、SSSIV、SBEI、SBEII和PUL基因的轉(zhuǎn)基因水稻‘日本晴(Oryzasativa, Nipponbare)’種子,發(fā)芽后40 d水稻葉片,用于DNA檢測和RNA表達(dá)量的檢測,成熟水稻種子,用于淀粉含量測定。
水稻種植地點為海南陵水四川農(nóng)業(yè)大學(xué)水稻南繁育種基地。其中過表達(dá)載體為PBW(1300改進(jìn))載體,轉(zhuǎn)化菌種為EHA105根癌農(nóng)桿菌。
1.2.1 侵染轉(zhuǎn)化 利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)法將植物過表達(dá)載體PBW轉(zhuǎn)化到水稻成熟胚愈傷組織獲得轉(zhuǎn)基因水稻幼苗,經(jīng)卡那抗性篩選和PCR擴(kuò)增檢測獲得轉(zhuǎn)基因陽性苗,并收獲F1代種子[7]。
1.2.2 試驗樣品及處理 分別取轉(zhuǎn)基因株系F1代種子以及轉(zhuǎn)空載體對照株系種子做催芽處理,每個株系取催芽萌發(fā)的幼苗200株種植田間。取發(fā)芽后40 d的葉片2~3片作為轉(zhuǎn)基因植株鑒定的材料,采集后迅速置于干冰凍存,置于-80 ℃冰箱保存。水稻成熟后,收割成熟期水稻種子,曬干后保存?zhèn)溆谩?/p>
干種子樣品制備:剝?nèi)シN子穎殼,磨粉后過0.45 mm篩子,45 ℃烘干備用[8]。每個樣本3次重復(fù)。
1.2.3 轉(zhuǎn)基因植株檢測 剪取1 cm左右的水稻葉片,快速提取基因組DNA[9],進(jìn)行PCR鑒定。其中PCR引物設(shè)計使用DNAMAN軟件,上游引物為插入基因序列,下游引物為載體序列,引物信息如表1所示;擴(kuò)增體系為:95 ℃預(yù)變性5 min,95 ℃變性1 min,退火30 s,72 ℃延伸30 s,25個循環(huán)。擴(kuò)增產(chǎn)物用2%瓊脂糖凝膠電泳檢測。
1.2.4 轉(zhuǎn)基因植株葉片RNA提取及熒光定量PCR檢測 葉片總RNA提取使用Plant RNA Kit(OMEGA),DNA消化使用RapidOut DNA Removal Kit(Thermo Scientific),cDNA的合成使用Reverse transcriptase M-MLV (RNase H)(Takara)。實時熒光定量PCR引物的設(shè)計利用Primer Premier 5軟件,內(nèi)參基因選用水稻18S rRNA基因[10],引物如表2所示。實時熒光定量PCR使用羅氏Light Cycler96 Real Time PCR系統(tǒng)。
實時熒光定量PCR采用10 μL反應(yīng)體系,其中SYBR?Premix Ex Taq (Takara)5 μL, ddH2O 2.5 μL,稀釋60倍cDNA 2 μL,上游、下游引物各0.25 μL。反應(yīng)程序:第一步預(yù)變性:95 ℃ 10 min;第二步擴(kuò)增:95 ℃ 20 s,退火20 s,72 ℃ 20 s,39個循環(huán);第三步溶解:95 ℃ 10 s,65 ℃ 30 s,97 ℃ 1 s。每個反應(yīng)3次重復(fù)。
表1 PCR引物列表Tab.1 PCR Primer
表2 實時熒光定量PCR引物列表Tab.2 Real-time Quantitative PCR primer
1.2.5 水稻種子淀粉含量測定
經(jīng)熒光定量PCR檢測得到的轉(zhuǎn)基因陽性植株,分別檢測陽性植株籽粒的直鏈淀粉、支鏈淀粉、總淀粉和抗性淀粉的含量,并與轉(zhuǎn)空載體對照株系進(jìn)行比較。直鏈淀粉和支鏈淀粉含量測定采用Megazyme Amylose/Amylopectin kit檢測試劑盒[11],總淀粉含量測定采用Megazyme total starch kit檢測試劑盒[12],抗性淀粉含量測定采用Megazyme Resistant starch kit檢測試劑盒[13],每個轉(zhuǎn)基因株系測定3株,每個樣品測量3次,取平均值。
采用Microsoft Excel繪制圖表,計算平均數(shù);利用SPSS20.0軟件進(jìn)行方差分析和顯著性分析。
PCR擴(kuò)增檢測F2代水稻葉片外源基因,檢測結(jié)果見圖1。CmSSSII、CmSSSIV、CmSBEI和CmPUL轉(zhuǎn)基因水稻株系均擴(kuò)增出相應(yīng)片段大小的條帶,且檢測到3個以上陽性植株,表明這些植株均攜帶外源基因。而CmSSSIII和CmSBEII轉(zhuǎn)基因水稻株系未擴(kuò)增出目的條帶,表明植株為非陽性植株,未攜帶外源基因。
注:M表示Marker,1-3表示樣本。Note:M is Marks , 1-3 means every sample.圖1 轉(zhuǎn)基因水稻葉片的PCR檢測Fig.1 PCR detection of transgenic rice leaves
為了檢測外源基因在轉(zhuǎn)基因水稻中的表達(dá)情況,采用實時熒光定量PCR技術(shù),對陽性轉(zhuǎn)基因水稻葉片進(jìn)行檢測。外源基因CmSSSII、CmSSSIV、CmSBEI和CmPUL對應(yīng)轉(zhuǎn)基因水稻植株葉片的表達(dá)量顯著高于轉(zhuǎn)空載體水稻葉片的表達(dá)量。同時,外源基因在轉(zhuǎn)空載體水稻葉片中均有少量的表達(dá)(圖2),可能是由于水稻基因組中含有與板栗同源性較高的基因序列。
在F2代轉(zhuǎn)基因水稻發(fā)芽后60 d(圖3),統(tǒng)計水稻植株的株高、穗長、劍葉長、劍葉寬、分蘗數(shù)和籽粒千粒重(表3)。與轉(zhuǎn)空載體對照株系相比,CmSSSII轉(zhuǎn)基因株系分蘗數(shù)顯著升高、籽粒千粒重顯著降低,CmSSSIV轉(zhuǎn)基因株系分蘗數(shù)顯著升高,CmSBEI轉(zhuǎn)基因株系籽粒千粒重顯著降低,CmPUL轉(zhuǎn)基因株系的株型沒有顯著變化。
注:每組柱形圖分別為轉(zhuǎn)空載體和三個轉(zhuǎn)基因樣本;**表示與轉(zhuǎn)空載體對比差異極顯著(P<0.01)。Note:Each group of column means the trans empty vector and three transgenic samples ; ** indicates a highly significant level of variation compared to the trans empty vector transgenic rice line (P<0.01).圖2 目的基因在轉(zhuǎn)基因水稻植株中的相對表達(dá)量Fig.2 Relative expression level of target genes in transgenic rice samples
圖3 轉(zhuǎn)基因水稻的株型Fig.3 Plant shape of transgenic rice
名稱Name株高/cmPlant height穗長/cmEar length劍葉長/cmFlag leaf length劍葉寬/cmFlag leaf width分蘗數(shù)/(個/穴)Tiller number籽粒千粒重/g1000-grain weight轉(zhuǎn)空載體Trans empty vector 62.83±5.5610.57±1.5615.67±1.370.80±0.0643.00±3.4722.9±0.15SSS II53.80±4.49**10.64±0.3615.20±1.300.90±0.0753.60±4.04**20.1±0.35**SSS IV62.40±3.6411.64±1.7016.80±0.840.90±0.1266.00±6.32**22.4±0.28SBE I59.00±2.2410.14±0.3115.00±0.710.84±0.0947.00±5.2421.3±0.39**PUL58.40±2.7012.64±0.8414.40±0.550.96±0.1850.60±3.0523.3±0.28
注:**表示轉(zhuǎn)空載體相比差異極顯著(P<0.01)。
Note:** indicates a highly significant level of variation compared to the trans empty vector transgenic rice line (P<0.01).
收獲轉(zhuǎn)基因水稻成熟種子,測定其直鏈淀粉、支鏈淀粉、總淀粉和抗性淀粉含量。CmSSSII轉(zhuǎn)基因水稻種子直鏈淀粉含量顯著高于轉(zhuǎn)空載體水稻種子直鏈淀粉含量,而CmSBEI轉(zhuǎn)基因水稻種子直鏈淀粉含量顯著低于轉(zhuǎn)空載體水稻種子直鏈淀粉含量;CmSSSII和CmSBEI轉(zhuǎn)基因水稻種子支鏈淀粉含量顯著高于轉(zhuǎn)空載體水稻種子支鏈淀粉含量;CmSSSII、CmSBEI和轉(zhuǎn)基因水稻種子總淀粉含量顯著高于轉(zhuǎn)空載體對照水稻種子總淀粉含量,其中CmSSSII轉(zhuǎn)基因水稻株系總淀粉含量升高的原因是由于直鏈淀粉和支鏈淀粉均升高所致,而CmSBEI轉(zhuǎn)基因水稻株系總淀粉含量升高的原因是由于支鏈淀粉含量的升高程度大于直鏈淀粉含量的降低;CmSSSII和CmSBEI轉(zhuǎn)基因水稻種子抗性淀粉含量顯著高于轉(zhuǎn)空載體水稻種子抗性淀粉含量(圖4)。
注:**表示與轉(zhuǎn)空載體株系相比差異極顯著(P<0.01)。Note:** indicates a highly significant level of variation compared to the trans empty vector transgenic rice line (P<0.01).圖4 不同轉(zhuǎn)基因水稻株系種子直鏈淀粉、支鏈淀粉、總淀粉和抗性淀粉含量Fig.4 Percentage content of amylase, amylopectin, total starch and resistant starch in the grain of different transgenic rice lines
淀粉含量是評價板栗品質(zhì)的重要指標(biāo),直鏈淀粉和支鏈淀粉的比例對板栗的口感有較大的影響,梁麗松等系統(tǒng)研究板栗淀粉糊化特性與直鏈淀粉含量及淀粉粒粒徑之間的關(guān)系[14],陳良珂等研究板栗堅果不同發(fā)育時期的淀粉積累規(guī)律及其特性,同時挖掘影響支鏈淀粉合成的關(guān)鍵基因[15],但對于板栗淀粉合成關(guān)鍵酶的基因功能未進(jìn)行相關(guān)驗證工作。SSS基因作為淀粉合成酶的關(guān)鍵基因,主要參與直鏈淀粉的合成[16],在本試驗中,CmSSSII基因過量表達(dá)使水稻籽粒直鏈淀粉含量和總淀粉含量顯著升高,這與Bin Tian等[17]對SSS基因的功能驗證相符合。
SBE為支鏈淀粉合成酶,不但參與催化支鏈淀粉分支的形成,而且在分支的非還原末端添加單糖殘基,決定淀粉分支的類型和支鏈淀粉含量[18],在本研究中,CmSBEI基因過量表達(dá)使水稻種子支鏈淀粉含量、總淀粉含量和抗性淀粉含量顯著增高,直鏈淀粉含量顯著降低。與David A Brummell等[19]的相關(guān)報道相符合。
在水稻中,PUL屬于DBE即淀粉脫支酶家族的成員,主要參與支鏈淀粉的去分支化[20],在本研究中,CmPUL基因過量表達(dá)對水稻種子淀粉含量沒有顯著影響。
CmSSSII和CmSBEI基因的功能與其他物種中的同源基因功能驗證的結(jié)果相符合。CmSSSIII和CmSBEII轉(zhuǎn)基因株系未能鑒定到轉(zhuǎn)基因陽性植株,可能是該基因在水稻中過量表達(dá)導(dǎo)致水稻的敗育,無法獲得下一代水稻轉(zhuǎn)基因株系。CmSSSIV、CmPUL轉(zhuǎn)基因株系已鑒定到陽性植株卻沒有表型上的變化,可能是該基因在不同宿主中未表達(dá),導(dǎo)致該基因未能發(fā)揮功能。本試驗僅初步探討板栗淀粉合成酶基因的功能,為了更進(jìn)一步驗證問題,還需深入的研究。