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shRNA穩(wěn)定干擾Raptor基因表達的小鼠胸腺上皮細胞系的建立

2019-04-29 02:09閔玉嬌吳皓杰王薈潘子輝邵啟祥
關鍵詞:雷帕胸腺孵育

閔玉嬌,吳皓杰,王薈,潘子輝,邵啟祥

(1.江蘇大學醫(yī)學院免疫學與免疫學檢驗教研室,江蘇 鎮(zhèn)江212013;2.江蘇大學生殖醫(yī)學科學研究院,江蘇 鎮(zhèn)江212001)

哺乳動物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)信號途徑是普遍存在于細胞中的一條重要信號途徑,可調(diào)節(jié)細胞周期進程、細胞增殖和代謝[1-2]。mTOR 激酶分為雷帕霉素敏感的mTORC1和雷帕霉素不敏感的mTORC2。mTOR和mLST8均存在于兩種mTOR激酶中,此外mTORC1中還包含Raptor、PRAS40等分子。研究表明,mTORC1在個體、組織和細胞的生長發(fā)育和退化中發(fā)揮重要作用[3]。mTORC1與T細胞的發(fā)育分化關系密切,胸腺上皮細胞(thymic epithelial cells,TECs)作為構(gòu)成胸腺微環(huán)境的重要組分對T細胞的發(fā)育有很大影響。本課題組前期研究發(fā)現(xiàn)mTORC1可能參與TECs的退化過程(未發(fā)表),本研究擬通過構(gòu)建Raptor shRNA慢病毒載體穩(wěn)定轉(zhuǎn)染小鼠胸腺上皮細胞系(mouse thymic epithelial cell line 1,mTEC1),敲降Raptor基因,觀察mTORC1在TECs中的作用,從而闡明TECs衰老和退化機制。

1 材料與方法

1.1 試劑與材料

慢病毒載體質(zhì)粒pLKO.1-puro由上海交通大學醫(yī)學院、上海市免疫學研究所李斌教授惠贈;ps-PAX2及PMD2.0G慢病毒包裝質(zhì)粒為我院龔愛華教授贈予;感受態(tài)DH5α細菌由本實驗室杜鳳移老師饋贈;限制性內(nèi)切酶AgeⅠ和Eco RⅠ購自寶生物工程(大連)有限公司;膠回收試劑盒以及質(zhì)粒提取試劑盒為生工生物工程(上海)股份有限公司產(chǎn)品;DMEM培養(yǎng)液、胎牛血清和Lip2000為美國Thermo公司產(chǎn)品;牛血清白蛋白購自湖州英創(chuàng)生物科技有限公司;哺乳動物蛋白抽提試劑RIPA購自上海碧云天生物技術有限公司;蛋白酶抑制劑混合物為瑞士Roche公司產(chǎn)品;抗磷酸化mTOR(phosphomTOR,p-mTOR)、抗mTOR、抗Raptor、抗磷酸化核糖體S6激酶(phospho-p70S6k,p-p70S6k)、抗核糖體S6激酶總蛋白(t-p70S6k)和HRP偶聯(lián)的羊抗兔IgG抗體均為美國CST公司產(chǎn)品;抗β-肌動蛋白抗體為美國Santa Cruz公司產(chǎn)品;ECL檢測試劑盒為德國Merck公司產(chǎn)品。

1.2 細胞培養(yǎng)

1.3 Raptor基因shRNA目的片段的合成

從Sigma網(wǎng)站檢索Raptor基因的shRNA序列,并在其5′端和3′端分別加入AgeⅠ和Eco RⅠ限制性核酸酶切位點序列,具體序列如下:正義鏈,5′-CCGGGCCCGAGTCTGTGAATGTAATCTCGAGATT ACATTCACAGACTCGGGCTTTTTG-3′;反義鏈,5′-A ATTCAAAAAGCCCGAGTCTGTGAATGTAATCTCGA GATTACATTCACAGACTCGGG-3′;由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。

1.4 pLKO.1-puro慢病毒載體質(zhì)粒酶切

慢病毒載體質(zhì)粒pLKO.1-puro經(jīng)感受態(tài)DH5α細菌擴增后,用限制性內(nèi)切酶AgeⅠ和EcoRⅠ進行酶切,體系如下:AgeⅠ2.5μL,Eco RⅠ2.5μL,pLKO.1-puro 2.5μg,緩沖液5μL,以無菌雙蒸水補足至50μL。酶切反應條件:37℃4 h。

1.5 膠回收酶切后pLKO.1-puro載體

將“1.4”產(chǎn)物行1%瓊脂糖凝膠電泳,并于長波紫外檢測儀中檢測,切取目的位置相應的條帶并稱重。按照生工生物工程(上海)股份有限公司膠回收試劑盒操作步驟進行膠回收。

1.6 載體酶切及與目的片段的連接

將Raptor基因shRNA目的片段的正義鏈與反義鏈1∶1混合,退火后按下述體系加樣,16℃連接過夜,將shRNA連接到膠回收的pLKO.1-puro載體中。體系如下:10×緩沖液2μL,pLKO.1-puro酶切純化載體1μL,Raptor shRNA目的片段16μL,T4連接酶1μL。

1.7 pLKO.1-puro-shRNA-Raptor轉(zhuǎn)化感受態(tài)細菌

取“1.6”中連接產(chǎn)物1μL加入感受態(tài)DH5α中,輕輕混勻置于冰上孵育30 min;42℃孵育90 s,期間勿搖動EP管;休克結(jié)束后迅速移至冰上,加入LB液體培養(yǎng)基400μL,于37℃搖床250 r/min擴增2 h;4 000 r/min室溫離心4 min,棄去一半上清液后混勻,將菌液均勻涂布于含有氨芐西林的LB固體平板上,37℃培養(yǎng)16 h;然后挑取單個菌落接種于含有氨芐西林的LB液體培養(yǎng)基中,于37℃搖床250 r/min孵育過夜。

1.8 質(zhì)粒的提取和測序

按照試劑盒說明書提取質(zhì)粒,送生工生物工程(上海)股份有限公司測序,分析shRNA序列(含AgeⅠ和Eco RⅠ兩個酶切位點)是否正確,確認是否成功構(gòu)建pLKO.1-puro-shRNA-Raptor載體。

1.9 病毒的包裝與感染

將HEK-293T細胞接種于60 mm培養(yǎng)皿中,當細胞生長至匯合度為70%且狀態(tài)良好時,加入6μg質(zhì)粒進行轉(zhuǎn)導,即pMD2G、psPAX2和pLKO.1-puroshRNA-Raptor載體按質(zhì)量比1∶2∶3比例混勻,加入高糖DMEM至250 mL;同時另取高糖DMEM 232 mL,加入18μL Lip2000混勻,室溫靜置5 min;最后將含有質(zhì)粒的DMEM 加入至含有Lip 2000的DMEM中,混勻,室溫靜置20 min;加入到HEK-293T細胞培養(yǎng)皿中,補充培養(yǎng)基體系至3 mL,置于37℃,5% CO2培養(yǎng)箱培養(yǎng)8 h;棄培養(yǎng)液,加入3 mL含10%胎牛血清的無雙抗高糖DMEM繼續(xù)培養(yǎng)24 h;收集培養(yǎng)上清液,用0.22μm除菌濾器過濾,即為病毒懸液;同時將轉(zhuǎn)染的HEK-293T細胞更換新鮮培養(yǎng)基孵育24 h,再次收獲病毒懸液。將收獲的病毒懸液和含10%胎牛血清的DMEM以1∶1加入到匯合度為30%左右的mTEC1中,加入聚凝胺(5μg/mL)培養(yǎng)24 h;重復此步驟再次培養(yǎng)24 h后更換正常的無雙抗DMEM并加入嘌呤霉素(2~5 μg/mL)篩選穩(wěn)定感染的細胞。待細胞生長穩(wěn)定,完全抵抗嘌呤霉素后,收集部分細胞提取蛋白進行免疫印跡法鑒定,另一部分繼續(xù)傳代培養(yǎng)。

1.10 免疫印跡法檢測各組細胞相關蛋白的表達

將野生型mTEC1和穩(wěn)定感染shRNA-Raptor病毒的mTEC1以每孔2×105接種于6孔板,前者接種2孔,后者接種1孔,37℃5% CO2培養(yǎng)24 h,分別記作mTEC1組,shRNA-Raptor組。在其中1孔野生型mTEC1中以1∶1 000加入50μmol/L雷帕霉素,記作mTEC1-雷帕霉素組。繼續(xù)培養(yǎng)12 h,收集各組細胞提取蛋白;mTEC1-雷帕霉素組作為mTOR及其下游被抑制的陽性對照。

蛋白行SDS-PAGE,70 V 2 h;350 mA轉(zhuǎn)膜2 h;PVDF膜洗滌后用5% BSA封閉1 h;抗Raptor、mTOR、p-mTOR、p70S6k、p-p70S6k和內(nèi)參β-肌動蛋白等一抗按說明書用封閉液按1∶1 000稀釋,4℃孵育過夜;TBST洗膜3次,每次10 min;加入HRP偶聯(lián)的羊抗兔IgG抗體(TBST稀釋,均為1∶10 000),室溫孵育1 h;TBST洗膜3次,每次10 min;采用ECL檢測試劑盒曝光檢測各蛋白表達情況并進行灰度掃描,使用Graph-Pad Prism 5軟件進行統(tǒng)計學分析。

1.11 連續(xù)計數(shù)法檢測mTEC1-shRNA-Raptor細胞的增殖

將野生型mTEC1與穩(wěn)定感染shRNA-Raptor病毒的mTEC1以每孔5 000個細胞的初始密度接種于12孔板,各接種7個復孔。每天各計數(shù)兩種細胞其中一個孔的細胞數(shù),計數(shù)7 d;重復3次。

1.12 TUNEL法檢測mTEC1-shRNA-Raptor細胞的凋亡

將野生型mTEC1與穩(wěn)定感染shRNA-Raptor病毒的mTEC1以5 000個/孔接種于96孔板,5% CO237℃培養(yǎng)48 h,根據(jù)羅氏公司Tunel試劑盒說明書染色。主要步驟如下:棄去96孔板中培養(yǎng)基,PBS洗2次;每孔加100μL 4%低聚甲醛(pH=7.4),室溫固定20 min;PBS洗2次;加入新鮮配制的滲透液100μL置于冰上破膜10 min;PBS洗滌2次;將標記溶液與酶濃縮液以9∶1比例混合,每孔加入50 μL,37℃孵育1 h;PBS洗滌2次,滴加1滴PBS置于熒光顯微鏡下觀察,陽性細胞可見綠色熒光。最后計算出陽性細胞比例。

1.13 統(tǒng)計學方法

所有實驗數(shù)據(jù)采用GraphPad Prism 5軟件行統(tǒng)計學分析,計量數(shù)據(jù)采用均數(shù)±標準差(±s)表示,3組間均數(shù)比較采用單因素方差分析,進一步兩兩比較采用SNK-q檢驗;2組間均數(shù)比較采用t檢驗,以P<0.05判斷差異有統(tǒng)計學意義。

2 結(jié)果

2.1 載體質(zhì)粒pLKO.1-puro酶切和電泳鑒定

pLKO.1-puro慢病毒載體經(jīng)酶切后,瓊脂糖凝膠電泳顯示在1 900 bp和7 000 bp左右處出現(xiàn)條帶,表明載體質(zhì)粒酶切成功。見圖1。

2.2 Raptor shRNA目的片段與載體連接產(chǎn)物的鑒定

測序結(jié)果與插入的Raptor基因的shRNA序列5′-CCGGGCCCGAGTCTGTGAATGTAAT-CTCGAGATTACATTCACAGACTCGGGCTTTTTG-3′完全一致(第261~318位),表明成功構(gòu)建pLKO.1-puro-shRNARaptor載體。見圖2。

2.3 pLKO.1-puro-shRNA-Raptor穩(wěn)定轉(zhuǎn)染mTEC1細胞系的建立

由圖3可見,與mTEC1組相比,shRNA-Raptor組Raptor蛋白、p-mTOR以及p-p70S6k表達量均明顯降低(P均<0.05);與mTEC1組相比,mTEC1-雷帕霉素組p-mTOR以及p-p70S6k表達量也明顯降低,但二者間Raptor蛋白表達差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。由此進一步說明,shRNA-Raptor組pmTOR以及p-p70S6k表達降低是由Raptor基因抑制造成的。

圖1 p LKO.1-puro載體酶切電泳鑒定

圖2 pLKO.1-puro-shRNA-Raptor載體鑒定

圖3 免疫印跡檢測各組細胞相關蛋白的表達

2.4 mTEC1-shRNA-Raptor和野生型mTEC1細胞數(shù)變化

如圖4所示,mTEC1-shRNA-Raptor和mTEC1培養(yǎng)7 d,2種細胞同一天的細胞數(shù)間差異均無統(tǒng)計學意義(P均>0.05)。

圖4 mTEC1-shRNA-Raptor和mTEC1細胞計數(shù)

2.5 Tunel細胞凋亡試驗陽性率統(tǒng)計

如圖5所示,mTEC1-shRNA-Raptor和野生型mTEC1細胞Tunel試驗陽性率均很低,二者差異無統(tǒng)計學意義(t=1.27,P>0.05),表明2種細胞正常培養(yǎng)時很少發(fā)生凋亡。由此說明,Raptor基因敲降并不引起mTEC1明顯的凋亡。

3 討論

圖5 mTEC1與mTEC1-shRNA-Raptor細胞Tunel試驗陽性率比較

自噬是細胞清除其損傷的細胞器或錯誤折疊蛋白的重要方式。自噬減弱時,細胞內(nèi)錯誤折疊的蛋白堆積,導致細胞衰老死亡。mTOR信號通路是細胞內(nèi)重要的信號通路,其可抑制自噬[4]。大量文獻報道,mTOR活化增加可致細胞衰老和退化[5-9]。胸腺是機體最重要的中樞免疫器官,TECs是胸腺中最為重要的基質(zhì)細胞之一,是胸腺微環(huán)境的重要組成部分。本實驗室研究發(fā)現(xiàn),隨著小鼠年齡的增長,胸腺mTOR表達上調(diào)(未發(fā)表)。為進一步研究mTOR在TECs退化中的作用,本研究通過建立mTORC1與下游作用的重要分子Raptor基因穩(wěn)定敲降的mTEC1細胞,成功構(gòu)建Raptor基因的pLKO.1-puro-shRNA慢病毒質(zhì)粒,并成功感染mTEC1。免疫印跡結(jié)果表明,轉(zhuǎn)染后的mTEC1-shRNA-Raptor細胞Raptor和p-mTOR以及p-p70S6k蛋白表達水平明顯降低,說明已成功構(gòu)建Raptor基因敲降的mTEC1細胞系。mTOR參與細胞的增殖和凋亡,本實驗采用連續(xù)計數(shù)法以及Tunel法檢測細胞增殖與凋亡,結(jié)果顯示,Raptor基因的敲降并不影響mTEC1增殖和凋亡。Foxn1是轉(zhuǎn)錄叉頭因子家族成員,在胸腺發(fā)育中起重要作用。已有文獻報道,敲除mTORC1/Raptor并不會引起胸腺的明顯萎縮和胸腺細胞的凋亡,只有聯(lián)合敲除Foxn1后,胸腺才發(fā)生明顯的退化和萎縮[10]。本實驗結(jié)果也證明這一點。盡管mTORC1信號通路參與細胞的生長增殖,但其對mTEC1的作用還未闡明,在胸腺退化過程中mTOR信號和Foxn1之間以何種方式發(fā)揮作用,尚有待深入研究。

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