馬妮,張昌軍,3,刁紅錄,3*
表觀遺傳學(xué)是指在不改變DNA序列的前提下研究基因在轉(zhuǎn)錄能力及表觀遺傳性方面的變化[1]。在哺乳動物胚胎發(fā)育過程中父系和母系基因組必須經(jīng)歷表觀基因重塑及轉(zhuǎn)錄模式的改變從而才能促進胚胎的正常發(fā)育。在受精過程中雌、雄配子各自表達其表觀遺傳特異型,受精卵是一種比較獨特的細(xì)胞,因為它有從一個細(xì)胞分化發(fā)育為任何一種組織的能力,為了實現(xiàn)多能性,生殖細(xì)胞的表觀遺傳經(jīng)歷重設(shè)后胚胎基因組必須被轉(zhuǎn)錄因子在空間狀態(tài)下被高度修飾。胚胎著床同樣需要呈現(xiàn)接受態(tài)的子宮才能保證胚胎的順利植入,影響子宮內(nèi)膜接受態(tài)的形成因素眾多,以下我們主要介紹表觀遺傳修飾在胚胎發(fā)育及著床過程中的影響。
表觀遺傳學(xué)修飾包括組蛋白修飾、DNA甲基化、基因印記、非編碼RNA和X染色體失活等[2]?,F(xiàn)在研究主要集中于組蛋白修飾和DNA甲基化與胚胎發(fā)育的關(guān)系,首先簡要介紹表觀遺傳修飾在胚胎發(fā)育中的作用。
1.組蛋白修飾與胚胎發(fā)育
在真核生物中,染色體內(nèi)DNA和組蛋白結(jié)合所形成的染色質(zhì)中有一個重復(fù)的核小體單位,它是由146對堿基纏繞八個組蛋白后卷曲和壓縮后形成的[3]。核心組蛋白包括H2A,H2B,H3和H4,連接組蛋白包括H1和H5,核心組蛋白形成組蛋白的核心,連接組蛋白是連接DNA的。組蛋白有多種轉(zhuǎn)錄后修飾包括組蛋白上一些氨基酸乙?;?、甲基化、磷酸化、泛素化等修飾[4]。組蛋白氨基酸末端突出于核小體表面,為了基因的轉(zhuǎn)錄它必須從物理結(jié)構(gòu)上發(fā)生改變使DNA可以容易或者不容易結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子從而實現(xiàn)基因的表達。
(1)組蛋白乙?;c胚胎發(fā)育:在胚胎著床前組蛋白不同殘基發(fā)生乙?;揎椩谂咛グl(fā)育時間窗中對染色質(zhì)重構(gòu)有重要的作用,H3不同殘基乙?;谂咛ブ睬暗淖兓遣煌?,在胚胎卵裂時可以檢測到H3K64ac,H3K56ac的豐富表達,但是H3K122ac僅有微弱的表達,說明不同組蛋白修飾在胚胎早期發(fā)育中發(fā)揮的作用不同[5]。蛋白修飾中研究最多的是組蛋白乙?;阴;蠼M蛋白與DNA結(jié)合疏松,這樣有利于DNA與轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合,相反,組蛋白去乙?;菇M蛋白與DNA緊密結(jié)合不利于基因的轉(zhuǎn)錄,這兩種狀態(tài)是由組蛋白乙酰化轉(zhuǎn)移酶(HAT)和組蛋白去乙?;?HDAC)相互作用而達到生物學(xué)平衡[6]。組蛋白乙?;梢哉T導(dǎo)DNA復(fù)制和轉(zhuǎn)錄,HDAC1可以影響小鼠胚胎的發(fā)育,如果在胚胎發(fā)育早期缺乏HDAC1就會使胚胎發(fā)育延遲或停止[7]。
(2)組蛋白甲基化與胚胎發(fā)育:組蛋白翻譯后修飾被廣泛研究,例如在胚胎基因組激活中H3K9me3和H3K27me3被認(rèn)為是轉(zhuǎn)錄活性的一種抑制性標(biāo)志,而H3K4me3、H3K36me3和H3K9ac被認(rèn)為是轉(zhuǎn)錄活性的一種激活性標(biāo)志[8]。在早期發(fā)育的胚胎中H3K4me3高表達且表達于父系基因組[9],而胚胎發(fā)育為1細(xì)胞到4細(xì)胞是胚胎基因激活期,H3K4me3是從配子融合形成胚胎開始出現(xiàn)的,在受精卵中表達降低,隨后在胚胎發(fā)育為2細(xì)胞時表達升高直至囊胚期[8]。在母系基因組及卵母細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)有一種非經(jīng)典的H3K4me3(nc H3K4me3)存在,并可以與大部分DNA甲基化區(qū)域重復(fù),在2細(xì)胞胚胎時經(jīng)典H3K4me3開始建立而nc H3K4me3的表達慢慢消失,說明在胚胎發(fā)育早期H3K4me3在父系基因組和母系基因組都發(fā)揮一定的生物學(xué)功能,與DNA甲基化有一定的聯(lián)系并且在哺乳動物早期發(fā)育中是動態(tài)變化的[9]。在胚胎發(fā)育過程中的囊胚期前H3K27me3表達較囊胚期后低,說明H3K27me3在分化的細(xì)胞中表達高于分裂細(xì)胞,可能的原因是多能性基因的啟動子處被甲基化而無法轉(zhuǎn)錄[10]。
合子基因激活(ZGA)主要發(fā)生在1細(xì)胞和2細(xì)胞階段,這對正常個體的發(fā)育是非常重要的,胚胎植入前基因激活(MGA)主要發(fā)生在4細(xì)胞到8細(xì)胞階段,轉(zhuǎn)錄因子主要在這個階段開始表達并調(diào)控內(nèi)外胚層的發(fā)育[11]。CHD1(chromodomain helicase DNA binding protein 1)是ATP酶依賴性染色質(zhì)重塑因子家族的成員,它可以使H3K4三甲基化,并促進mRNA的轉(zhuǎn)錄,對維持小鼠胚胎干細(xì)胞多能性必不可少[12]。在外胚層發(fā)育過程中CHD1可以促進基因轉(zhuǎn)錄使外胚層快速發(fā)育,如果敲除Chd1基因后小鼠胚胎就會在第6.5天的時候因為外胚層發(fā)育障礙而停止發(fā)育[13]。在小鼠胚胎中敲除Chd1基因后會使植入的胚胎死亡,有研究認(rèn)為,在小鼠胚胎早期發(fā)育中如果抑制Chd1基因的轉(zhuǎn)錄因子Pou5f1、Nanog和Cdx2,基因激活(MGA)就開始急劇下降,而調(diào)節(jié)以上轉(zhuǎn)錄因子的Hmgpi和Klf5在ZGA期被顯著抑制,Hmgpi的表達被抑制直至囊胚期,而Klf5的表達抑制在桑葚胚期被解除,說明在基因激活階段主要是通過Hmgpi和Klf5調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄因子而影響CHD1的表達進而控制小鼠胚胎的發(fā)育與存活[13],還有研究認(rèn)為,CHD1通過改變?nèi)旧w結(jié)構(gòu)而影響基因的表達,說明CHD1對于小鼠早期胚胎的正常發(fā)育必不可少。
在核心組蛋白中H2A是變化最多的一種核心蛋白,而在H2A中H2A.Z是研究最多的一種,H2A.Z是最先發(fā)現(xiàn)與哺乳動物發(fā)育有密切關(guān)系組蛋白變體,雖然其序列高度保守,但是它在不同生物中扮演的角色不同。H3K36me3可能與基因轉(zhuǎn)錄延長有關(guān),H3K36甲基化轉(zhuǎn)移酶通過Rbp1最大的亞基CTD與RNA聚合酶II相互作用影響基因轉(zhuǎn)錄[14]。早期胚胎發(fā)育的特點是細(xì)胞的多能性和染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的動態(tài)變化,在小鼠胚胎發(fā)育為2細(xì)胞階段,H2A.Z乙?;胶虷3K36me3表達水平下降,2細(xì)胞胚胎為胚胎基因組主要的激活時間(在牛胚胎發(fā)育時胚胎基因組激活時間為8細(xì)胞階段),說明這些活性標(biāo)志與胚胎基因組轉(zhuǎn)錄激活有關(guān)系,如果小鼠缺乏H2A.Z會使胚胎內(nèi)細(xì)胞團增殖和分化有缺陷而導(dǎo)致胚胎著床前死亡[15]。
2.DNA甲基化與胚胎發(fā)育
DNA甲基化是DNA復(fù)制后的一個共價修飾調(diào)節(jié),一個甲基化基團結(jié)合到核苷酸的CpG島處(位于鳥嘌呤后的胞嘧啶),它作為DNA和轉(zhuǎn)錄因子之間的物理屏障,或者吸引酶和蛋白從而減少轉(zhuǎn)錄因子和DNA之間的結(jié)合[16]。
DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶(DNMTs)對促進DNA甲基化必不可少,一旦DNA序列被甲基化那么就會有一些蛋白識別甲基化的胞嘧啶并使染色質(zhì)重塑從而抑制基因轉(zhuǎn)錄,與組蛋白修飾一樣,DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶對于胚胎的正常發(fā)育必不可少,DNA甲基化在胚胎著床前也會發(fā)生一系列變化,成熟的精子和卵母細(xì)胞中DNA都被高度甲基化幾乎沒有轉(zhuǎn)錄活性,在內(nèi)細(xì)胞團中DNA甲基化水平高于外胚層,說明甲基化可以調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄活性,影響細(xì)胞的多能性及分化能力[17-18]。在人類輔助生殖技術(shù)中發(fā)現(xiàn)異常胚胎和冷凍胚胎中DNMTs的表達比新鮮胚胎中低,說明異常發(fā)育和低溫保存可能影響胚胎中DNMTs的表達[19]。在哺乳動物中最常發(fā)生的DNA甲基化是在DNA結(jié)構(gòu)中第5個鍵發(fā)生甲基化(5mC),盡管在小鼠卵母細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)非CpG甲基化水平表達顯著但是其功能未知,5mC的作用在各個方面研究較多,在哺乳動物發(fā)生發(fā)育過程中,DNA甲基化是表觀遺傳作用中比較重要的一種修飾,當(dāng)細(xì)胞分化發(fā)育為不同譜系時5mC將會引導(dǎo)細(xì)胞分化并作為一種障礙阻止其向未分化細(xì)胞分化[20]。
3.基因印記與胚胎發(fā)育
是指來自父系或母系的等位基因在子代中有不同的表達方式。在父系基因印記中父系等位基因被表觀遺傳修飾而不發(fā)生轉(zhuǎn)錄,這樣就會使在子代中只有單母系等位基因的表達;而在母系印記基因中,母系等位基因被表觀遺傳修飾而不發(fā)生轉(zhuǎn)錄,這樣就會使在子代中只有單父系等位基因的表達,基因印記通常被組蛋白修飾[21]。哺乳動物每次生殖周期中配子將會重新建立印記基因,在受精后的第11.5天原始生殖細(xì)胞將會發(fā)生去甲基化以抹去遺傳父母的印記,在第13天印記被完全抹去后會根據(jù)胎兒性別等特征重新發(fā)生基因印記[22]。
4.非編碼RNA與胚胎發(fā)育
非編碼RNA是指不翻譯成蛋白即不參與基因轉(zhuǎn)錄的RNA,包括很多種如snRNA、snoRNA、microRNA,主要功能是參與DNA轉(zhuǎn)錄后表達的調(diào)節(jié),非編碼RNA中當(dāng)前研究最多的是miRNA,它主要是結(jié)合到mRNA序列上阻止其翻譯從而抑制DNA的表達[23]。在早期胚胎中發(fā)現(xiàn)母系遺傳的miRNA相當(dāng)豐富,小鼠胚胎2細(xì)胞階段時miRNA的表達明顯升高[24],在小鼠胚胎發(fā)育中如果缺乏Dicer酶(是RNAi發(fā)揮作用過程中重要的物質(zhì))那么miRNA將無法發(fā)揮作用,這樣就會減少小鼠胚胎干細(xì)胞的數(shù)量,說明miRNA可以維持干細(xì)胞的多能性,參與胚胎的發(fā)育[25]。
5. X染色體失活與胚胎發(fā)育
在女性胚胎中有2條X染色體,其中將會隨機選擇一條失活,而參與X染色體失活的表觀遺傳包括不同的組蛋白修飾和DNA甲基化,它可以參與胚胎干細(xì)胞多能性的維持[26]。
子宮內(nèi)膜容受性是胚胎著床和成功妊娠的先決條件,子宮內(nèi)膜接受態(tài)的形成包括很多復(fù)雜的轉(zhuǎn)錄過程,該過程由雌孕激素以及眾多分子的相互作用完成的,其中一些精細(xì)調(diào)節(jié)是由表觀遺傳修飾所調(diào)控的。容受性的子宮內(nèi)膜是一種正常的生理狀態(tài),它主要是為胚胎順利著床做準(zhǔn)備,在人類、小鼠和牛的發(fā)情周期中子宮內(nèi)膜變化都涉及以上分子的表達[27],體內(nèi)和體外產(chǎn)生的胚胎分別在形態(tài)、功能和轉(zhuǎn)錄水平都有差異,它們成功植入需要激活子宮內(nèi)膜不同的基因和轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)機制,這些調(diào)控可能是通過基因的表觀遺傳學(xué)實現(xiàn)的。
在月經(jīng)周期中,子宮內(nèi)膜發(fā)生蛻膜化(子宮內(nèi)膜基質(zhì)細(xì)胞形態(tài)和功能上的改變)對于其接受態(tài)的形成和胚胎植入必不可少,而表觀遺傳修飾可能影響月經(jīng)周期中子宮內(nèi)膜相關(guān)基因的表達從而導(dǎo)致基質(zhì)細(xì)胞發(fā)生蛻膜化,異常的表觀遺傳修飾可能會導(dǎo)致蛻膜化異常影響胚胎植入。體外表觀遺傳修飾HDAC(修飾組蛋白去乙?;?參與月經(jīng)周期的變化,HDAC抑制劑Trichostatin A(TSA)作用于子宮內(nèi)膜后可使上皮細(xì)胞凋亡、基質(zhì)細(xì)胞發(fā)生形態(tài)學(xué)變化及蛻膜化標(biāo)志蛋白的表達,例如:胰島素樣生長因子(IGFBP-1)、催乳素等都可以促進基質(zhì)細(xì)胞發(fā)生蛻膜化[28],在蛻膜化中發(fā)現(xiàn)H3、H4發(fā)生乙?;⑶襀4乙酰化與卵巢類固醇激素密切相關(guān)可以激活I(lǐng)GFBP-1的啟動子[29]。DNA甲基化可以調(diào)節(jié)一些與子宮內(nèi)膜接受態(tài)相關(guān)基因的表達,例如可以使Cdh1,Pgr,Esr,Lif等基因啟動子處甲基化,影響子宮內(nèi)膜接受態(tài)的形成[30]。有研究認(rèn)為E-cadherin對于子宮內(nèi)膜接受態(tài)的形成至關(guān)重要,而它的表達又受到DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶的調(diào)節(jié),單獨抑制DNMT-1、-3A、-3B分子后對E-cadherin的表達無影響,但是聯(lián)合抑制三種DNMT-1、-3A、-3B分子后就會使E-cadherin的表達上升并促進子宮內(nèi)膜向接受態(tài)轉(zhuǎn)變,說明了不同價甲基化轉(zhuǎn)移酶均參與了子宮內(nèi)膜接受態(tài)的形成[31]。
在細(xì)胞分化發(fā)育過程中PRC1可以調(diào)節(jié)一些基因的表達,多梳抑制復(fù)合體1(Polycomb repressive complex 1,PRC1)成員(Cbx2、Cbx4、Ring1B和Rybp)可以調(diào)節(jié)組蛋白修飾(H3K27me3和H2AK119ub1)影響子宮組織蛻膜化中多倍體的發(fā)育,在小鼠胚胎著床前體外注射PRC1抑制劑PRT4165后觀察小鼠胚胎著床情況,發(fā)現(xiàn)藥物處理組和對照組無明顯的區(qū)別,說明PRC1對于胚胎與子宮黏著的影響較小,但是發(fā)現(xiàn)在PRT4165處理后小鼠早期妊娠蛻膜化中的多倍體形成被破壞[32]。
miRNA是重要的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)者可以編碼高度進化的RNAs,長度大約有22個核苷酸,可以通過降解或抑制目標(biāo)mRNA的表達,也是子宮內(nèi)膜容受性的潛在調(diào)節(jié)者,miRNA-mRNA調(diào)控系統(tǒng)與胚胎著床有關(guān),有研究認(rèn)為miR-30b,miR-30d,miR-494在子宮內(nèi)膜容受性形成過程中發(fā)揮著重要的作用,在接受態(tài)的子宮內(nèi)膜中miR-30b,miR-30d高表達,而miR-494和miR-923低表達,miRNA在調(diào)節(jié)子宮內(nèi)膜接受態(tài)形成過程中通過不同的途徑參與其中,例如Wnt信號通路、軸突傳導(dǎo)信號、ERK/MAPK信號通路、TGF-β信號通路、p53信號和白細(xì)胞外滲信號傳導(dǎo)途徑等[33-34]。
幾種良性的婦產(chǎn)科疾病如子宮內(nèi)膜異位癥、子宮肌瘤、輸卵管積水、多囊卵巢綜合征等都可以導(dǎo)致生殖能力下降和影響子宮內(nèi)膜接受態(tài)的形成,而DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶與組蛋白乙?;揎椏梢杂绊懪咛ブ踩胂嚓P(guān)基因的表達,例如LIF、HOXA10等[35]。在上面所提的幾種疾病中都發(fā)現(xiàn)在胚胎著床窗口期的內(nèi)膜中HOXA10(孕激素作用的靶基因)的表達較正常降低,有研究認(rèn)為在子宮內(nèi)膜異位癥當(dāng)中DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶表達升高,它可以沉默HOXA10的啟動子使HOXA10的表達下降,HOXA10的缺乏可以導(dǎo)致胚胎著床失敗和子宮內(nèi)膜接受態(tài)的形成受阻[36]。有研究認(rèn)為在胚胎植入子宮的過程是HOXA10調(diào)控的兩個過程,第一個過程是胚胎著床前HOXA10高表達有利于基質(zhì)細(xì)胞轉(zhuǎn)變?yōu)橥懩せ?xì)胞,第二個過程是蛻膜化細(xì)胞中HOXA10的表達下降有利于胚胎的浸潤,研究認(rèn)為在滋養(yǎng)層細(xì)胞中LIF和IL6大量產(chǎn)生后以旁分泌的形式刺激STAT3和MMP的產(chǎn)生以降低HOXA10的表達,STAT3和MMP的高表達有利于促進滋養(yǎng)細(xì)胞向子宮內(nèi)膜的浸潤[37]。 所以可以認(rèn)為表觀遺傳修飾中的DNA修飾 、組蛋白修飾、非編碼RNA參與子宮內(nèi)膜蛻膜化的形成對子宮內(nèi)膜接受態(tài)的形成有重要的作用。
盡管在哺乳動物著床前基因的轉(zhuǎn)錄序列已經(jīng)被確認(rèn),但是理解分子的相互作用可以更好的認(rèn)識在胚胎著床前轉(zhuǎn)錄的進行。精子和卵母細(xì)胞發(fā)育并形成受精卵的過程中它們各自的基因高度甲基化后發(fā)生轉(zhuǎn)錄沉默,這就保持了受精卵的全能性,受精卵發(fā)育過程中基因發(fā)生表觀遺傳修飾后又恢復(fù)了轉(zhuǎn)錄活性,從而行使生物學(xué)功能。哺乳動物精卵融合過程中原始生殖細(xì)胞發(fā)生時間和空間的表觀遺傳修飾,DNA修飾和染色質(zhì)修飾決定哪些基因區(qū)域先開放發(fā)生轉(zhuǎn)錄,哪些先關(guān)閉發(fā)生沉默。但是有關(guān)表觀遺傳學(xué)在哺乳動物生殖,尤其是在子宮內(nèi)膜容受性建立的過程還需深入探索,這樣才會更好地為輔助生殖技術(shù)提供理論基礎(chǔ),才能提高妊娠率,造福于人類不孕不育事業(yè)。