染色質(zhì)
- 探究染色質(zhì)調(diào)節(jié)因子在胃癌進(jìn)展中的作用及潛在治療靶點(diǎn)
的目的[2]。染色質(zhì)可及性作為與特定位點(diǎn)腫瘤功能相關(guān)的基因組特征之一,可通過與轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合調(diào)節(jié)與癌癥進(jìn)展和侵襲相關(guān)的多個(gè)基因。最近,研究者開始探索染色質(zhì)狀態(tài)變化對癌癥發(fā)展的影響。染色質(zhì)可及性失調(diào)可能會改變下游癌基因或抑癌基因的轉(zhuǎn)錄活性,從而影響惡性腫瘤的進(jìn)展。染色質(zhì)重塑是基因調(diào)控的關(guān)鍵機(jī)制[3]。染色質(zhì)重塑是所有DNA相關(guān)核心細(xì)胞過程的經(jīng)典步驟,一些染色質(zhì)重塑決定了細(xì)胞的存亡,包括與癌癥發(fā)病和發(fā)展有關(guān)的細(xì)胞過程。過去10年中,染色質(zhì)重塑在細(xì)胞轉(zhuǎn)化和癌癥發(fā)展
實(shí)用藥物與臨床 2023年6期2023-07-03
- 新冠病毒或能改變?nèi)祟惣?xì)胞基因組
遺傳物質(zhì)儲存在染色質(zhì)結(jié)構(gòu)中。此前有研究稱，一些病毒會劫持或改變?nèi)梭w的染色質(zhì)，從而在細(xì)胞內(nèi)成功繁殖。但新冠病毒是否以及如何影響人體內(nèi)的染色質(zhì)一直是未解之謎。在最新研究中，科學(xué)家們使用前沿方法，全面描述了感染新冠病毒后人類細(xì)胞內(nèi)的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)。最新研究發(fā)現(xiàn)，感染新冠病毒后，正常細(xì)胞內(nèi)許多原本結(jié)構(gòu)良好的染色質(zhì)會變形。例如，人體感染新冠病毒后，一種名為a/B區(qū)的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的陰陽兩部分會開始混合在一起，這種混合可能導(dǎo)致被感染細(xì)胞內(nèi)一些關(guān)鍵基因發(fā)生變化，其中包括關(guān)鍵的炎
家庭醫(yī)學(xué) 2023年8期2023-05-30
- 組蛋白修飾調(diào)控53BP1與染色質(zhì)結(jié)合功能的研究進(jìn)展
DNA 濃縮成染色質(zhì)［1］。染色質(zhì)的核心單位是核小體，它由146 bp的DNA纏繞組蛋白八聚體1.75圈而形成［2］。組蛋白八聚體由組蛋白H2A、H2B、H3和H4各2個(gè)分子構(gòu)成，它是真核細(xì)胞染色體中核小體的核心顆粒［3］。DNA在代謝的過程中，會受到外源性損傷因子和內(nèi)源性DNA損傷的影響，如電離輻射、紫外線輻射、化學(xué)試劑、DNA 去嘌呤化等。一旦DNA發(fā)生損傷而不能被及時(shí)修復(fù)時(shí)，細(xì)胞將發(fā)生衰老、自噬和凋亡［4］。DSB 是引發(fā)基因組不穩(wěn)定的最主要因素，而
- 研究發(fā)現(xiàn)基因組DNA 壓縮成染色體的機(jī)制
及體外重組的純染色質(zhì)的進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)，以及通過探測各種可溶性大分子的染色質(zhì)可及性，研究人員發(fā)現(xiàn)不混溶的染色質(zhì)形成了一個(gè)密集的負(fù)電荷結(jié)構(gòu)，從而將帶負(fù)電荷的大分子和微管排斥在外。當(dāng)細(xì)胞分裂時(shí)， 它們需要準(zhǔn)確地將一個(gè)基因組拷貝運(yùn)送到兩個(gè)子細(xì)胞中的每一個(gè)。 忠實(shí)的基因組分離需要將極長的染色體DNA 分子包裝成離散的小體， 以便它們能被有絲分裂紡錘體——一種由成千上萬的微管組成的纖維系統(tǒng)——有效地移動(dòng)。 Gerlich DW 團(tuán)隊(duì)的這些新發(fā)現(xiàn)闡明了有絲分裂染色體如何抵御
生物醫(yī)學(xué)工程與臨床 2022年5期2022-12-19
- 染色質(zhì)重塑復(fù)合物與基因表達(dá)調(diào)控的研究進(jìn)展
610041)染色質(zhì)中的基因在不同的細(xì)胞或不同的內(nèi)外環(huán)境里均可隨著染色質(zhì)重塑而被調(diào)控進(jìn)入相應(yīng)的活化或抑制狀態(tài)，從而導(dǎo)致疾病的發(fā)生或產(chǎn)生對生物體自身有益的變異。染色質(zhì)重塑復(fù)合物被認(rèn)為是染色質(zhì)活化的動(dòng)力，與組蛋白修飾、DNA甲基化、RNA干擾等一起重塑染色質(zhì)結(jié)構(gòu)，成為與經(jīng)典遺傳密碼不同的表觀遺傳調(diào)控。本文將對染色質(zhì)重塑復(fù)合物對基因表達(dá)的調(diào)控研究及進(jìn)展進(jìn)行綜述，分類討論各種類型染色質(zhì)重塑復(fù)合物在基因表達(dá)中可能具有的重要作用，為深入研究染色質(zhì)重塑復(fù)合物在胚胎發(fā)育、
實(shí)用醫(yī)院臨床雜志 2022年1期2022-12-06
- 中科院描繪擬南芥芽再生染色質(zhì)狀態(tài)動(dòng)態(tài)圖譜
度的芽再生過程染色質(zhì)狀態(tài)圖譜，將擬南芥基因組各個(gè)區(qū)段分別用15種不同的染色質(zhì)狀態(tài)標(biāo)記。結(jié)合公共數(shù)據(jù)庫的ChIP-seq數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)大多數(shù)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合基序主要富集在由ATAC-seq數(shù)據(jù)所注釋的染色質(zhì)開放（open chromatin）區(qū)域。不同時(shí)間節(jié)點(diǎn)的染色質(zhì)狀態(tài)轉(zhuǎn)變分析進(jìn)一步表明，染色質(zhì)開放區(qū)域的狀態(tài)轉(zhuǎn)換與細(xì)胞命運(yùn)重塑密切相關(guān)，提示這些區(qū)域在再生過程基因表達(dá)調(diào)控中處于中心地位。課題組對染色質(zhì)可及性數(shù)據(jù)進(jìn)行深入挖掘，發(fā)現(xiàn)高生長素濃度的CIM（Computer
蔬菜 2022年3期2022-11-11
- 染色質(zhì)轉(zhuǎn)座酶可及性測序及其在木本植物中的應(yīng)用前景
域被稱為可及性染色質(zhì)區(qū)域(accessibility chromatin regions, ACRs)或開放染色質(zhì)(open chromatin)。真核生物可及性染色質(zhì)區(qū)域占總基因組 DNA 序列的 2%～3%，且該區(qū)域超過 90%與轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合相關(guān)。染色質(zhì)這種允許其他調(diào)控因子結(jié)合的特性稱為染色質(zhì)可及性(chromatin accessibility)[4]。植物作為固著生物，可以通過形態(tài)、生理和生化過程的調(diào)控等多種方式來適應(yīng)環(huán)境的變化[5]，其中轉(zhuǎn)錄水
- 中國科學(xué)院發(fā)現(xiàn)低磷調(diào)控根系重構(gòu)的表觀遺傳新機(jī)制
現(xiàn)擬南芥中一個(gè)染色質(zhì)重塑因子BRM，低磷條件下染色質(zhì)重塑因子BRM的部分功能缺失的突變體brm-3和brm-20的主根伸長區(qū)積累了過多的鐵，影響了細(xì)胞的伸長。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，BRM通過直接互作，招募去乙酰化酶HDA6，使LPR1/2位點(diǎn)的組蛋白H3去乙?；?。而在低磷條件下，BRM通過26S蛋白酶體途徑降解，抑制了HDA6在LPR1/2位點(diǎn)的富集，導(dǎo)致組蛋白H3乙酰化水平升高而促進(jìn)基因表達(dá)，從而抑制主根的伸長。因此，該研究闡明了一個(gè)染色質(zhì)重塑因子在調(diào)控低磷下
蔬菜 2022年9期2022-09-23
- 組蛋白變體在植物表觀遺傳調(diào)控中的研究進(jìn)展
列、表達(dá)模式或染色質(zhì)定位存在差異的成員，稱為組蛋白變體。組蛋白變體和組蛋白翻譯后修飾共同參與表觀遺傳調(diào)控，極大增強(qiáng)了染色質(zhì)的多樣性。目前研究表明，除了H4之外，其它組蛋白家族均存在變體，其中H2A和H3變體的研究較多。組蛋白變體在其特異分子伴侶的作用下組裝到染色質(zhì)，參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA損傷修復(fù)和異染色質(zhì)濃縮等生命過程。在植物中，組蛋白變體不僅參與發(fā)育過程，也調(diào)控植物對環(huán)境的響應(yīng)。由于組蛋白變體種類較多且功能復(fù)雜，本文將按照組蛋白家族進(jìn)行分類，分別介紹同一家
生物技術(shù)通報(bào) 2022年7期2022-09-14
- Hi-C技術(shù)：探究三維基因組迷宮
展進(jìn)程。高通量染色質(zhì)構(gòu)象捕獲（High-throughput/resolution chromosome conformation capture，Hi-C）技術(shù)的出現(xiàn)，幫助我們深入探究基因組三維結(jié)構(gòu)之謎，為基因研究提供了強(qiáng)大的推動(dòng)力，是一把名副其實(shí)的基因鑰匙。以我們自身為例，人類體細(xì)胞的核內(nèi)存在著彼此獨(dú)立又相互聯(lián)系的46 條染色體，它們主要由遺傳物質(zhì)DNA 和組蛋白組成。其中，DNA 一般以染色質(zhì)絲的形式存在，染色質(zhì)絲纏繞在組蛋白復(fù)合物上，形成串珠樣結(jié)構(gòu)
張江科技評論 2022年4期2022-09-14
- 染色質(zhì)可及性分析的研究進(jìn)展*
成核小體（構(gòu)成染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位）。核小體核心由147 bp的DNA組成，以左手超螺旋的方式包裹著一個(gè)球狀蛋白八聚體，該八聚體由4種核心組蛋白H2A、H2B、H3和H4各兩分子組成［1］。每個(gè)核心組蛋白都有一個(gè)與DNA結(jié)合的結(jié)構(gòu)域和一個(gè)無序的N端尾巴。核小體的核心顆粒再由10～80 bp左右的游離DNA與組蛋白H1共同連接形成串珠式的染色質(zhì)細(xì)絲，染色質(zhì)細(xì)絲通過緊密折疊并高度壓縮形成螺旋化的染色體結(jié)構(gòu)［2］。這些高度螺旋化的染色體結(jié)構(gòu)在復(fù)制和轉(zhuǎn)錄時(shí)需要暴露
生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展 2022年8期2022-08-20
- G-四鏈體與染色質(zhì)結(jié)構(gòu)相互作用關(guān)系的研究進(jìn)展
具有調(diào)控功能的染色質(zhì)區(qū)域,在生物體內(nèi)具有重要的調(diào)控功能,與染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、表觀調(diào)控、基因組穩(wěn)定性、人類疾病等密切相關(guān)。1910年,Bang[1]首次發(fā)現(xiàn)鳥嘌呤核苷酸在高濃度下能夠形成凝膠,這表明DNA中富含鳥嘌呤的序列可能形成更高階的結(jié)構(gòu)。1962年,Gellert等[2]使用X射線衍射實(shí)驗(yàn)證明,鳥嘌呤可以組裝成四聚體結(jié)構(gòu)。隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展,G4檢測技術(shù)經(jīng)歷了從體外到體內(nèi)檢測的發(fā)展過程。2015年,劍橋大學(xué)Balasubramanian團(tuán)隊(duì)提出G4-s
生命科學(xué)研究 2022年2期2022-05-15
- 三維基因組學(xué)概述及其在家畜生物育種方面的研究進(jìn)展
控因子可以通過染色質(zhì)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)達(dá)到空間上的近距離調(diào)控。細(xì)胞核中染色質(zhì)的存在位置不是無序的，而是受精密的調(diào)控，它們之間有千絲萬縷的聯(lián)系，并且其存在方式和位置都對基因表達(dá)調(diào)控起著重要的作用。隨著染色質(zhì)捕獲技術(shù)的發(fā)展，染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)逐漸被揭示，按照結(jié)構(gòu)單元大小和分辨率被分為4個(gè)層級：染色質(zhì)疆域(chromosome territories，CTs)、染色質(zhì)區(qū)室(chromatin compartments)、拓?fù)潢P(guān)聯(lián)結(jié)構(gòu)域(topologically associ
中國牛業(yè)科學(xué) 2022年6期2022-04-07
- 染色質(zhì)開放性與動(dòng)物胚胎發(fā)育關(guān)系的研究進(jìn)展
650000)染色質(zhì)開放性(chromatin accessibility)也被稱為染色質(zhì)可及性，可以廣義的理解為與未被組蛋白或其他大分子封閉的DNA分子，這一特性能夠反映轉(zhuǎn)錄活性。真核生物中，DNA與組蛋白組裝為核小體，經(jīng)過進(jìn)一步折疊在細(xì)胞核中形成確定結(jié)構(gòu)的染色質(zhì)[1-2]，高度壓縮的染色質(zhì)極大阻礙了DNA的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄等功能。DNA轉(zhuǎn)錄依賴于染色質(zhì)開放，轉(zhuǎn)錄是眾多轉(zhuǎn)錄因子(transcription factors，TF)富集到染色質(zhì)開放的增強(qiáng)子、上游激
畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào) 2022年3期2022-03-30
- 哺乳動(dòng)物合子基因組激活過程中的染色質(zhì)重塑
傳重編程，包括染色質(zhì)高級結(jié)構(gòu)、染色質(zhì)可及性(chromatin accessibility)、DNA甲基化在內(nèi)的表觀遺傳信息的廣泛變化，其正在重構(gòu)胚胎表觀基因組[1-2]。隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展，研究人員可以在單細(xì)胞和單堿基的分辨率下，從全基因組水平研究哺乳動(dòng)物早期胚胎發(fā)育過程中表觀遺傳信息的動(dòng)態(tài)變化和作用機(jī)制。因此，研究ZGA過程中發(fā)生的染色質(zhì)重塑能夠加深對早期胚胎發(fā)育的了解，對于解決胚胎體外培養(yǎng)過程中早期胚胎發(fā)育阻滯、難以發(fā)育至囊胚期的難題，改善胚胎
中國畜牧獸醫(yī) 2022年1期2022-02-15
- 染色質(zhì)重塑調(diào)控因子與心血管疾病研究進(jìn)展
多的研究表明，染色質(zhì)重塑在心血管疾病過程中起到重要作用。染色質(zhì)重塑是重要的表觀遺傳學(xué)機(jī)制，是由染色質(zhì)重塑復(fù)合物介導(dǎo)的一系列以染色質(zhì)上核小體變化為特征的生物學(xué)過程。在染色質(zhì)重塑過程中，染色質(zhì)重塑調(diào)控因子發(fā)揮著舉足輕重的作用[2]。本文就染色質(zhì)調(diào)控因子在心血管疾病中的作用展開論述。一、染色質(zhì)重塑及其調(diào)控因子染色質(zhì)的基本單位是核小體，后者由DNA和被其緊密包裹的組蛋白八聚體構(gòu)成。核小體的形成在基因組DNA壓縮成染色質(zhì)中起著重要作用。然而，組蛋白-DNA的相互作用
醫(yī)學(xué)研究雜志 2021年10期2021-12-02
- 中科院和廈門大學(xué)揭示植物基因內(nèi)異染色質(zhì)組分調(diào)控基因表達(dá)新機(jī)制
在對染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的探索中，研究人員發(fā)現(xiàn)定位于轉(zhuǎn)錄起始區(qū)域的異染色質(zhì)組分往往起轉(zhuǎn)錄沉默的功能，但對富集于基因內(nèi)含子區(qū)或基因體區(qū)的異染色質(zhì)的功能還知之甚少。在之前對模式植物擬南芥的遺傳篩選中，段成國與朱健康課題組發(fā)現(xiàn)了一類蛋白復(fù)合體ASI1-AIPP1-EDM2（AAE復(fù)合體），結(jié)合特定基因的內(nèi)含子異染色質(zhì)區(qū)域并參與mRNA可選擇性多聚腺苷酸化（APA）過程；然而，該復(fù)合體如何在基因組水平發(fā)揮功能仍不得而知。中科院上海植物逆境中心（中科院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心
蔬菜 2021年2期2021-11-27
- HOXD基因簇內(nèi)一系列CTCF位點(diǎn)反轉(zhuǎn)揭示絕緣子功能
)是一種重要的染色質(zhì)架構(gòu)蛋白，其與絕緣子的方向性結(jié)合在哺乳動(dòng)物基因組三維空間結(jié)構(gòu)形成和維持中起著至關(guān)重要的作用。正向–反向相對方向的CTCF結(jié)合位點(diǎn)(簡稱CTCF位點(diǎn))可以在染色質(zhì)黏連蛋白(cohesin)的協(xié)助下，形成染色質(zhì)環(huán)，介導(dǎo)遠(yuǎn)距離DNA元件之間的相互作用；而在染色質(zhì)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)域邊界區(qū)域的CTCF位點(diǎn)呈現(xiàn)反向–正向相背方向分布，發(fā)揮絕緣子的功能。為進(jìn)一步研究CTCF介導(dǎo)染色質(zhì)環(huán)的形成與其絕緣功能之間的關(guān)系，本研究采用DNA片段編輯方法通過設(shè)計(jì)成對sg
遺傳 2021年8期2021-08-25
- CAF-1在體細(xì)胞重編程中的作用機(jī)制
712100)染色質(zhì)組裝因子 1 (chromatin assembly factor-1，CAF-1)，是由p150、p60、p48 三個(gè)亞單位按1∶ 1∶1組合構(gòu)成的三聚體組蛋白伴侶[1-2]。CAF-1主要功能是在DNA復(fù)制中與增殖細(xì)胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)相互作用，負(fù)責(zé)募集組蛋白 H3、H4 沉積在新合成的DNA 上以促進(jìn)核小體裝配。CAF-1不僅參與 DNA復(fù)制和修復(fù)后染色質(zhì)裝配，
畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào) 2021年7期2021-07-26
- 染色質(zhì)重塑調(diào)控生物溫度適應(yīng)性的研究進(jìn)展
研究備受關(guān)注。染色質(zhì)重塑是表觀遺傳學(xué)重要的組成部分之一。在真核生物中，將DNA包裝到染色質(zhì)對于其基因組的組織和表達(dá)至關(guān)重要(Coronaetal.,2007)，染色質(zhì)構(gòu)型整體和局部的動(dòng)態(tài)改變是基因功能調(diào)控的重要因素。為了保證染色質(zhì)中DNA與蛋白質(zhì)的動(dòng)態(tài)結(jié)合，細(xì)胞內(nèi)進(jìn)化產(chǎn)生了一系列特異的染色質(zhì)重塑因子。在生物體受到逆境脅迫時(shí)，這些重塑因子可以介導(dǎo)體內(nèi)染色體的重塑過程，它們通過調(diào)控脅迫相關(guān)基因的表達(dá)來改變生物體的生理狀態(tài)，最終達(dá)到使生物體適應(yīng)環(huán)境的目的。本文從
生物安全學(xué)報(bào) 2021年2期2021-06-16
- 科研人員攻克冷凍樣本染色體三維構(gòu)象難題
員李付廣介紹，染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)在基因調(diào)控、發(fā)育和多種疾病病因?qū)W中發(fā)揮著重要功能。隨著3C、4C、Hi-C和CHEA-PET等技術(shù)發(fā)展，科學(xué)工作者可直觀地從染色質(zhì)三維構(gòu)象角度解析基因的表達(dá)調(diào)控。然而，染色質(zhì)結(jié)構(gòu)研究需要對樣本進(jìn)行及時(shí)交聯(lián)固定和解交聯(lián)，以防止樣本外界因素（如：高溫、低溫）影響染色質(zhì)構(gòu)象，導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)無法反映樣本的真實(shí)天然構(gòu)象。目前常用Hi-C技術(shù)難以克服這一問題，導(dǎo)致Hi-C技術(shù)在低溫冷凍樣本尤其是長期低溫保存的珍貴樣品的應(yīng)用難以實(shí)現(xiàn)。因此，如何
中國科學(xué)探險(xiǎn) 2021年2期2021-06-01
- 基于深度學(xué)習(xí)的染色質(zhì)交互作用預(yù)測
65）0 引言染色質(zhì)是由DNA、組蛋白、非組蛋白等多種物質(zhì)組成的遺傳物質(zhì)，其結(jié)構(gòu)復(fù)雜，難以直接觀察，但對細(xì)胞遺傳過程的基因表達(dá)有重要影響。自3C 技術(shù)問世以來，眾多方法被陸續(xù)報(bào)道用于捕獲染色質(zhì)構(gòu)象，其中Hi-C 技術(shù)是捕獲染色質(zhì)相互作用頻次的最新最常用方法[1]。Hi-C 原始互作數(shù)據(jù)可以通過交互頻次的讀取序列映射到對稱矩陣中，并且利用這種矩陣熱圖可以表示并構(gòu)造為染色質(zhì)的高級結(jié)構(gòu)TAD[2]、隔間和染色質(zhì)環(huán)等。染色質(zhì)的高級結(jié)構(gòu)與其功能密切相關(guān)，對基因表達(dá)和
現(xiàn)代計(jì)算機(jī) 2021年8期2021-05-13
- 動(dòng)物染色質(zhì)三維基因組及轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究進(jìn)展
前提，而基因組染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)是基因精準(zhǔn)表達(dá)調(diào)控的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)[1]。哺乳動(dòng)物細(xì)胞內(nèi)長約2 m的DNA分子，以高度折疊濃縮成染色質(zhì)的方式存儲于直徑大約8 μm的細(xì)胞核內(nèi)，形成復(fù)雜有序的三維結(jié)構(gòu)，使得在線性基因組上相距很遠(yuǎn)的基因表達(dá)調(diào)控元件與其靶基因在三維空間上充分接近，從而發(fā)揮功能元件的精細(xì)調(diào)控作用[2-3]。研究表明，基因組染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的變化會導(dǎo)致基因表達(dá)及其調(diào)控模式發(fā)生異常，進(jìn)而引起表型變化[4]。隨著測序深度的增加和三維基因組學(xué)研究的不斷深入，不同層次的
中國牛業(yè)科學(xué) 2020年3期2020-07-08
- 擬南芥中染色質(zhì)重塑因子的功能
體為基本單位的染色質(zhì)中。染色質(zhì)的高級結(jié)構(gòu)在壓縮細(xì)胞核DNA的同時(shí)，其致密結(jié)構(gòu)也嚴(yán)重影響DNA復(fù)制、基因表達(dá)等細(xì)胞過程[1]。因此，生物體進(jìn)化出一系列的染色質(zhì)重塑酶類和相關(guān)蛋白因子，調(diào)節(jié)局部染色質(zhì)的開放性，使轉(zhuǎn)錄因子等蛋白能夠直接結(jié)合核小體DNA，保障這些生命活動(dòng)的順利進(jìn)行。這種動(dòng)態(tài)調(diào)控染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的過程稱為染色質(zhì)重塑（chromatin remodeling）。真核生物中廣泛存在一類染色質(zhì)重塑復(fù)合體（chromatin remodeling complex）
新農(nóng)民 2020年9期2020-05-26
- 染色質(zhì)結(jié)構(gòu)與腎臟疾病遺傳風(fēng)險(xiǎn)解析
各個(gè)領(lǐng)域，基于染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的生物學(xué)信息為明確GWAS遺傳變異位點(diǎn)的位置及調(diào)控機(jī)制提供了有效途徑。因此，通過染色質(zhì)結(jié)構(gòu)解析GWAS對闡述腎臟疾病的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)及發(fā)生機(jī)制具有重要意義。GWAS在腎臟疾病的應(yīng)用發(fā)展現(xiàn)狀人類個(gè)體間的基因序列99.9%是相同的，而0.1%的差異則與復(fù)雜疾病的易感性及臨床表現(xiàn)多樣性密切相關(guān)。單核苷酸多態(tài)性(SNPs)是指基因組中單個(gè)堿基變異引起的DNA序列多態(tài)性，約占基因序列差異的90%以上。GWAS可在全基因組范圍內(nèi)找出變異位點(diǎn)，并從中篩
腎臟病與透析腎移植雜志 2020年2期2020-05-15
- 《科學(xué)》發(fā)表復(fù)旦大學(xué)徐彥輝課題組在染色質(zhì)重塑機(jī)制方面取得的新進(jìn)展
成果報(bào)道了人源染色質(zhì)重塑復(fù)合物BAF 結(jié)合核小體的冷凍電鏡結(jié)構(gòu)，對染色質(zhì)重塑機(jī)制和BAF 高頻突變致癌機(jī)制的理解起到重要推動(dòng)作用。作為真核生物遺傳物質(zhì)的載體，染色質(zhì)結(jié)構(gòu)高度致密，這種致密結(jié)構(gòu)有利于機(jī)體更加有效地儲存遺傳物質(zhì)，同時(shí)也對基本生命活動(dòng)的正常進(jìn)行設(shè)置了屏障。因此，染色質(zhì)的動(dòng)態(tài)調(diào)控與基因表達(dá)以及基因損傷修復(fù)等密切相關(guān)。為了更好地調(diào)控染色質(zhì)狀態(tài)，真核細(xì)胞發(fā)展出了一系列調(diào)控機(jī)制。染色質(zhì)重塑是染色質(zhì)表觀遺傳調(diào)控的重要方式，染色質(zhì)重塑復(fù)合物（chromati
煙草科技 2020年2期2020-04-27
- 《科學(xué)》發(fā)表同濟(jì)大學(xué)高亞威教授團(tuán)隊(duì)聯(lián)合研究成果
6A 修飾參與染色質(zhì)狀態(tài)與轉(zhuǎn)錄活性的調(diào)控)。該研究首次揭示了RNA 的m6A 修飾調(diào)控染色質(zhì)狀態(tài)和轉(zhuǎn)錄活性的重要機(jī)制，刷新了對m6A 功能的認(rèn)識。對于生命體來說，細(xì)胞是最小的功能單位，而在細(xì)胞中，DNA 是遺傳物質(zhì)，它與自身纏繞的組蛋白共同形成染色質(zhì)。DNA 可以轉(zhuǎn)錄生成RNA，RNA 隨后被運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞核外后，通過翻譯作用可以形成不同的蛋白質(zhì)。細(xì)胞就像是一個(gè)大的生產(chǎn)工廠，DNA 和染色質(zhì)就是工廠里面的核心生產(chǎn)線，不同生產(chǎn)線是不同的基因，可以生產(chǎn)出不同的模具
煙草科技 2020年2期2020-04-27
- 人X染色質(zhì)制備方法改進(jìn)
個(gè)有活性，呈常染色質(zhì)狀態(tài)，另一個(gè)無活性，螺旋化呈異固縮狀態(tài)，緊貼核膜內(nèi)緣，形成直徑約為1μm的橢圓形濃染小體，稱為X染色質(zhì)，亦稱Barr小體（Barr body）[1]。該失活的X染色體可以來自父方，也可以來自母方，失活發(fā)生于胚胎發(fā)育第16天，一旦失活，那么由此細(xì)胞增殖產(chǎn)生的所有子代細(xì)胞也總是這一條X染色體失活[1]。間期核內(nèi)X染色質(zhì)數(shù)目等于X染色體數(shù)目減1，正常女性每個(gè)體細(xì)胞中應(yīng)見到1個(gè)X染色質(zhì)，正常男性體細(xì)胞中見不到X染色質(zhì)。失活X染色體上的基因不是全
遼寧高職學(xué)報(bào) 2020年2期2020-04-22
- 基于一維序列的三維染色質(zhì)相分離：驅(qū)動(dòng)力、過程與功能
的。過去人們對染色質(zhì)在較小尺度的分層組裝結(jié)構(gòu)已經(jīng)有了較多認(rèn)識。在真核生物中，DNA與蛋白質(zhì)共同構(gòu)成染色質(zhì)，其中一類較為重要的蛋白質(zhì)是組蛋白。DNA-組蛋白復(fù)合形成的核小體核心顆粒(nucleosome core particle，NCP)由雙鏈DNA沿組蛋白八聚體纏繞1.7圈構(gòu)成，其DNA長度約為147 bp (base pair，堿基對)2，相鄰的NCP由長度范圍為20-60 bp的連接(linker)DNA相連，形成寬度約為10 nm的“beadson
物理化學(xué)學(xué)報(bào) 2020年1期2020-04-02
- 豚鼠卵母細(xì)胞體外成熟過程中生發(fā)泡染色質(zhì)構(gòu)型的變化
母細(xì)胞通過改變染色質(zhì)結(jié)構(gòu)來調(diào)節(jié)基因的表達(dá)，在卵母細(xì)胞生長發(fā)育過程中生發(fā)泡染色質(zhì)構(gòu)型發(fā)生明顯的變化，這在許多動(dòng)物上均有報(bào)道[6]。已經(jīng)表明，一些動(dòng)物卵母細(xì)胞的生發(fā)泡（GV）染色質(zhì)構(gòu)型與卵母細(xì)胞發(fā)育能力相關(guān)[7]，所以卵母細(xì)胞GV染色質(zhì)構(gòu)型可能作為判定多種動(dòng)物卵母細(xì)胞質(zhì)量的標(biāo)準(zhǔn)。目前關(guān)于牛[8]，羊[7]，豬[9]和小鼠[10]的GV染色質(zhì)構(gòu)型已經(jīng)有許多研究。然而與人類生殖生理學(xué)有更多相似的豚鼠[11]，GV染色質(zhì)構(gòu)型的系統(tǒng)研究未見報(bào)道。對于其他動(dòng)物的研究表明
世界最新醫(yī)學(xué)信息文摘 2020年19期2020-03-31
- 植物三維染色質(zhì)構(gòu)型研究進(jìn)展
磊綜述植物三維染色質(zhì)構(gòu)型研究進(jìn)展董芊里，王金賓，李曉寵，宮磊東北師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院，分子表觀遺傳學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，長春 130024染色質(zhì)在細(xì)胞核內(nèi)的纏繞、折疊及其在細(xì)胞核內(nèi)的空間排布是真核生物染色質(zhì)構(gòu)型的主要特征。在經(jīng)典DNA探針熒光原位雜交顯微觀察的基礎(chǔ)上，基于新一代測序技術(shù)的Hi-C及ChIA-PET染色質(zhì)構(gòu)型捕獲技術(shù)已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于動(dòng)物及植物細(xì)胞核染色質(zhì)構(gòu)型的研究中，并以新的角度定義了包括：染色體(質(zhì))域(chromosome territor
遺傳 2020年1期2020-03-04
- 染色質(zhì)構(gòu)象與基因功能
清，張玉波綜述染色質(zhì)構(gòu)象與基因功能黃其通，李清，張玉波中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)基因組研究所，“嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)”廣東省實(shí)驗(yàn)室，深圳 518120在真核細(xì)胞中，DNA序列以染色質(zhì)為載體，高度凝縮并存儲于細(xì)胞核內(nèi)，其復(fù)制、修復(fù)和轉(zhuǎn)錄表達(dá)等過程受到染色質(zhì)構(gòu)象的精準(zhǔn)調(diào)控。越來越多的研究表明，特定的染色質(zhì)構(gòu)象可選擇性激活或沉默基因，從而控制細(xì)胞自我維持或定向分化，決定細(xì)胞的組織特異性和細(xì)胞命運(yùn)。因此，對染色質(zhì)構(gòu)象的深入研究已成為準(zhǔn)確解析基因功能的一個(gè)關(guān)鍵切入點(diǎn)，也是當(dāng)前基因組
遺傳 2020年1期2020-03-04
- 生物大分子“液–液相分離”調(diào)控染色質(zhì)三維空間結(jié)構(gòu)和功能
液相分離”調(diào)控染色質(zhì)三維空間結(jié)構(gòu)和功能高曉萌1,2，張治華1,21. 中國科學(xué)院北京基因研究所, 基因組科學(xué)與技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，北京 100101 2. 中國科學(xué)院大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院, 北京 100049生物大分子的相分離聚集(簡稱相分離)是驅(qū)動(dòng)細(xì)胞內(nèi)無膜細(xì)胞器形成的主要機(jī)制，參與眾多生物學(xué)過程并和多種人類疾病密切相關(guān)，如神經(jīng)退行性疾病等。近年來，研究人員圍繞相分離現(xiàn)象的分子機(jī)制和生物學(xué)功能，發(fā)現(xiàn)了相分離與信號傳導(dǎo)、染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、基因表達(dá)、轉(zhuǎn)錄調(diào)控等一系列生物學(xué)
遺傳 2020年1期2020-03-04
- 染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)及其應(yīng)用
锏摘? ?要：染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)是一種利用抗原抗體結(jié)合的特異性來檢測蛋白質(zhì)與基因互作的技術(shù)，具有高效率但是低重復(fù)性的特點(diǎn)，影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果分辨率的因素包括檢測樣品使用量、DNA片段斷裂程度、抗體親和性等。隨著該技術(shù)的不斷發(fā)展，其應(yīng)用范圍也逐漸擴(kuò)大到如DNA測序、蛋白質(zhì)修飾、對細(xì)胞類型特異性串聯(lián)染色質(zhì)表觀遺傳修飾研究等方面，并逐步與如高通量測序技術(shù)、免疫熒光技術(shù)等其他研究手段相結(jié)合，在蛋白質(zhì)尤其是組蛋白及其修飾產(chǎn)物與DNA互作研究領(lǐng)域發(fā)揮作用。關(guān)鍵詞：染色質(zhì)免疫
科技創(chuàng)新導(dǎo)報(bào) 2019年19期2019-11-30
- 染色質(zhì)可接近性在前列腺癌研究中的作用
在細(xì)胞核內(nèi)且以染色質(zhì)的形式存在。染色質(zhì)主要由DNA與組蛋白組成[1]。先前的研究普遍認(rèn)為解碼DNA攜帶的遺傳信息就可以解釋整個(gè)基因表達(dá)調(diào)控規(guī)律。隨著對組蛋白修飾研究的深入,人們認(rèn)識到在基因表達(dá)的動(dòng)態(tài)平衡調(diào)控中,組蛋白所處的修飾狀態(tài),染色質(zhì)的高級結(jié)構(gòu)變化及染色質(zhì)可接近程度的變化也發(fā)揮著重要作用[2-4]。因此,對前列腺癌遺傳規(guī)律的解碼,將從染色質(zhì)層面揭示其發(fā)生變化規(guī)律,從而更深入的認(rèn)識腫瘤的基因表達(dá)調(diào)控[5-7]。1 染色質(zhì)可接近性的定義基因的表達(dá)調(diào)控瞬息萬
現(xiàn)代泌尿外科雜志 2019年10期2019-10-31
- 哺乳動(dòng)物卵母細(xì)胞生發(fā)泡染色質(zhì)構(gòu)型的研究進(jìn)展*
。 生發(fā)泡內(nèi)的染色質(zhì)通過重塑、修飾等方式調(diào)控基因表達(dá)，進(jìn)而決定了卵母細(xì)胞能否獲得減數(shù)分裂的能力。大量的研究表明，卵母細(xì)胞生發(fā)泡染色質(zhì)構(gòu)型的狀態(tài)與其發(fā)育能力密切相關(guān)。1 GV 染色質(zhì)構(gòu)型的分類在大多數(shù)哺乳動(dòng)物卵母細(xì)胞GV 中， 染色質(zhì)分布與核仁密切相關(guān)， 一種是染色質(zhì)不包圍核仁型（NSN），另一種是染色質(zhì)包圍核仁型（SN）。小鼠的GV 可分為3 種構(gòu)型： 第1 種是NSN型，染色質(zhì)不分布在核仁周圍；第2 種是少部分染色質(zhì)凝集，但圍繞在核仁周圍；第3 種是染色
生物學(xué)通報(bào) 2019年2期2019-06-15
- Alu元件在染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)層次上的生物信息學(xué)分析
?Alu元件在染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)層次上的生物信息學(xué)分析何超1,2，沈文龍2，李平2，張彥2，曾晶1，殷作明1，趙志虎21. 西藏軍區(qū)總醫(yī)院，拉薩 850000 2. 軍事科學(xué)院軍事醫(yī)學(xué)研究院生物工程研究所，北京 100071染色質(zhì)在細(xì)胞核內(nèi)三維高級結(jié)構(gòu)包括最底層的核小體、核小體組成的“串珠”結(jié)構(gòu)、螺線管纖維結(jié)構(gòu)、染色質(zhì)/DNA環(huán)結(jié)構(gòu)(chromatin/DNA loop)、拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)域(topologically associated domain, TAD)等
遺傳 2019年3期2019-03-19
- 水稻基因組有了更清晰的三維圖譜
活躍基因以及異染色質(zhì)參與的高分辨率三維基因組圖譜，揭示了水稻三維基因組結(jié)構(gòu)對基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控，以及遺傳變異對三維基因組結(jié)構(gòu)及基因表達(dá)的影響。8月13日，相關(guān)成果在線發(fā)表于《自然-通訊》。近年來，利用傳統(tǒng)的Hi-C 技術(shù)，水稻三維基因組研究獲得了多項(xiàng)重要發(fā)現(xiàn)。然而，受限于分辨率不高等因素，Hi-C 方法很難精確地檢測到基因啟動(dòng)子-啟動(dòng)子交互（PPI）、染色質(zhì)環(huán)等精細(xì)的三維基因組結(jié)構(gòu)?？蒲腥藛T利用改進(jìn)的Long-read ChIA-PET 技術(shù)，構(gòu)建了RNA 聚
中國食品學(xué)報(bào) 2019年8期2019-01-18
- “魔法藥水”讓細(xì)胞“返老還童”
的“信息中樞”染色質(zhì)的狀態(tài)控制，細(xì)胞染色質(zhì)的開放（1）與關(guān)閉（0）狀態(tài)總和，決定了細(xì)胞命運(yùn)狀態(tài)。這種情況猶如計(jì)算機(jī)二進(jìn)制的“密碼串”，可以將細(xì)胞“鎖”在特定狀態(tài)。在成體細(xì)胞的開放染色質(zhì)位點(diǎn)周圍，由AP-1及ETS等轉(zhuǎn)錄因子家族成員看守著；而在干細(xì)胞中，則由OCT、SOX和KLF等轉(zhuǎn)錄因子家族成員看守。細(xì)胞的“返老還童”，也就是成體細(xì)胞看守的染色質(zhì)由開放到關(guān)閉，而干細(xì)胞看守的染色質(zhì)則由關(guān)閉到開放的更替過程。這項(xiàng)研究采用藥物來調(diào)節(jié)細(xì)胞染色質(zhì)的“密碼串”，先用一
戀愛婚姻家庭·養(yǎng)生版 2018年8期2018-08-18
- 三維基因組學(xué)近年來的研究進(jìn)展
存在長片段的核染色質(zhì)區(qū)間（包括異染色質(zhì)和常染色質(zhì)）和染色質(zhì)疆域，同時(shí)存在短片段的增強(qiáng)子——啟動(dòng)子連接區(qū)域，這些染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)對細(xì)胞正常的基因表達(dá)和調(diào)控有重要影響[1]。啟動(dòng)子不但與鄰近調(diào)控元件結(jié)合，而且與調(diào)控元件借助染色體三維結(jié)構(gòu)存在長距離遠(yuǎn)程調(diào)控機(jī)制。例如：Fullwood等人于2009發(fā)現(xiàn)在人乳腺癌細(xì)胞系MCF7中存在大量遠(yuǎn)程調(diào)控元件參與乳腺癌關(guān)聯(lián)基因的調(diào)控。Li等人于2012年在對多類癌癥細(xì)胞系的研究后發(fā)現(xiàn)，大量的啟動(dòng)子與啟動(dòng)子的遠(yuǎn)程相互作用、基因的
今日畜牧獸醫(yī) 2018年9期2018-02-13
- Hi-C的干細(xì)胞染色質(zhì)多重相互作用特征分析
i-C的干細(xì)胞染色質(zhì)多重相互作用特征分析張 峰，劉亞軍，謝建明，孫 嘯，劉宏德*(生物電子學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(東南大學(xué))，南京 210096)染色質(zhì)高級結(jié)構(gòu)是基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)的重要因素，染色質(zhì)多重相互作用是高級結(jié)構(gòu)中的一種，是多個(gè)(≥3)染色質(zhì)片段在空間上相互接觸而形成的緊湊結(jié)構(gòu)。為了解染色質(zhì)多重相互作用這類高級結(jié)構(gòu)的特征及其在干細(xì)胞中分化中起到的作用，通過對Hi-C數(shù)據(jù)進(jìn)行相關(guān)分析并計(jì)算基因的FPKM表達(dá)量，研究了染色質(zhì)多重相互作用。分析發(fā)現(xiàn)：多重相互作用約占
生物信息學(xué) 2017年3期2017-11-01
- Chromatin Remodeling and DNA Repair
ail.com染色質(zhì)重構(gòu)與DNA損傷修復(fù)楊春英1,2(1. 上海市普陀區(qū)人民醫(yī)院， 上海 200060; 2. 美國康奈爾大學(xué)衛(wèi)理醫(yī)院 放射腫瘤學(xué)系， 休斯頓 77030)外界環(huán)境毒素和細(xì)胞內(nèi)源DNA復(fù)制和代謝過程中的錯(cuò)誤及活性氧都會造成DNA的損傷。如果這些DNA損傷得不到修復(fù)，會造成基因組不穩(wěn)定，進(jìn)而導(dǎo)致癌癥、衰老、免疫系統(tǒng)失調(diào)和神經(jīng)退行性疾病。目前研究最為詳細(xì)的有4種DNA修復(fù)途徑，即DNA雙鏈斷裂修復(fù)、核苷酸切除修復(fù)、堿基切除修復(fù)和錯(cuò)誤配對修復(fù)。所
生物學(xué)雜志 2017年3期2017-04-10
- 首屆染色質(zhì)生物學(xué)大會
首屆染色質(zhì)生物學(xué)大會會議消息會議名稱(中文)：所屬學(xué)科：細(xì)胞生物學(xué)開始日期：2017-04-14結(jié)束日期：2017-04-16所在城市：廣東省 深圳市具體地點(diǎn)：深圳市新年酒店主辦單位：中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)會染色質(zhì)生物學(xué)分會承辦單位：上海博生會展有限公司、深圳大學(xué)議題：染色質(zhì)的裝配、結(jié)構(gòu)、修飾和生物學(xué)功能組織委員會主席：朱冰、朱衛(wèi)國聯(lián)系人：胡月、趙志琛聯(lián)系電話：021-54922865/49E-MAIL：meeting@cscb.org.cn會議網(wǎng)站：http:
食品與生物技術(shù)學(xué)報(bào) 2017年2期2017-04-09
- 日觀察到DNA在細(xì)胞中呈不規(guī)則結(jié)構(gòu)的證據(jù)
的緊湊塊狀物(染色質(zhì)域)的動(dòng)態(tài)情形，而非有規(guī)律的染色質(zhì)纖維；核小體之間的結(jié)合與染色質(zhì)捆綁所需要的黏附蛋白質(zhì)極為重要；細(xì)胞的多數(shù)活動(dòng)是從DNA檢索遺傳信息開始的。據(jù)此結(jié)果，研究人員推斷：由于檢索領(lǐng)域龐大，從細(xì)胞核檢索遺傳信息效率很低，染色質(zhì)域形成塊狀提高了信息檢索及控制效率；由于DNA折疊異常會出現(xiàn)細(xì)胞癌化等各種疾病，這項(xiàng)研究成果對理解與細(xì)胞異常相關(guān)的疾病具有重要意義。相關(guān)研究論文發(fā)表在美國《分子細(xì)胞》雜志上。據(jù)介紹，在構(gòu)成身體的每一個(gè)細(xì)胞中，有全長可達(dá)2
生物學(xué)教學(xué) 2017年12期2017-02-18
- 熱應(yīng)激對豬卵母細(xì)胞葡萄糖-6-磷酸脫氫酶活性及染色質(zhì)構(gòu)型的影響
酸脫氫酶活性及染色質(zhì)構(gòu)型的影響劉 勇，張 領(lǐng)，吳曉慶，衛(wèi)朝輝，王艷紅，王啟磾，高 迪，丁 彪，吳風(fēng)瑞，王 榮，李文雍(阜陽師范學(xué)院 胚胎發(fā)育與生殖調(diào)節(jié)安徽省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，安徽 阜陽 236037)將屠宰場采集的豬卵巢分為熱應(yīng)激組和對照組，分別檢測兩組未成熟卵母細(xì)胞的各項(xiàng)指標(biāo)。利用亮甲酚藍(lán)染色法研究葡萄糖-6-磷酸脫氫酶活性，對比分析熱應(yīng)激對細(xì)胞代謝活性的影響；利用Hoechst33342標(biāo)記DNA區(qū)分染色質(zhì)構(gòu)型，對比分析熱應(yīng)激對細(xì)胞染色質(zhì)構(gòu)型的影響。結(jié)果表明
浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2016年1期2016-10-31
- 染色質(zhì)重塑及其參與植物病害防御應(yīng)答的研究進(jìn)展
)?專論與綜述染色質(zhì)重塑及其參與植物病害防御應(yīng)答的研究進(jìn)展洪林1,魏召新1,魏文輝2,譚平1*(1. 重慶市農(nóng)業(yè)科學(xué)院果樹研究所, 重慶402260; 2. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所,農(nóng)業(yè)部油料作物生物學(xué)與遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 武漢430062)轉(zhuǎn)錄相關(guān)因子與特異DNA位點(diǎn)結(jié)合受染色質(zhì)空間構(gòu)象變化的調(diào)節(jié),通過染色質(zhì)重塑機(jī)制可以解除染色質(zhì)高度緊密的折疊狀態(tài),改變組蛋白與DNA鏈間的作用力,控制基因的表達(dá)與沉默。ATP依賴的染色質(zhì)重塑復(fù)合物、組蛋白的乙?；?/div>
植物保護(hù) 2016年4期2016-09-14
- 認(rèn)知過程中的表觀遺傳學(xué)機(jī)制
下降。關(guān)鍵詞：染色質(zhì)；表觀遺傳學(xué)；認(rèn)知功能；組蛋白和DNA修飾；認(rèn)知功能障礙；RNA干擾doi:10.3969/j.issn.1001-1978.2015.01.001文章編號：文獻(xiàn)標(biāo)志碼：A1001-1978(2015)01-0001-07收稿日期:2014-09-19,修回日期:2014-11-05作者簡介：張均田(1931-)，男，研究員，教授，研究方向：神經(jīng)藥理，Tel:010-63165179，E-mail：zhangjt@imm.ac.cnAb中國藥理學(xué)通報(bào) 2015年1期2016-01-11
- 植物染色質(zhì)組蛋白H3變體的研究進(jìn)展
蛋白H3是構(gòu)成染色質(zhì)的重要成分之一。高等真核生物中，組蛋白H3的氨基酸序列較為保守，在染色質(zhì)動(dòng)態(tài)變化中，有著非常重要的作用。除共價(jià)修飾外，如組蛋白H3甲基化、乙酰化，近期研究表明，動(dòng)物組蛋白H3變體（H3 variants）也是一種重要的染色質(zhì)功能調(diào)節(jié)手段，但對植物中組蛋白H3的報(bào)道較少。根據(jù)近年最新研究成果，對植物組蛋白H3變體種類及其相關(guān)功能進(jìn)行了總結(jié)和討論。關(guān)鍵詞 H3變體;組蛋白;染色質(zhì);植物中圖分類號 S188 ?文獻(xiàn)標(biāo)識碼 A ?文章編號 05安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2015年3期2015-10-21
- 金柑DNA結(jié)合蛋白的分離及染色質(zhì)體外組裝研究
合蛋白的分離及染色質(zhì)體外組裝研究李夢蕓1，李光鋒1,2，楊 華1，黎子云1，吳小平1，饒力群1（1. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)生物科學(xué)技術(shù)學(xué)院，湖南長沙 410128；2. 湖南食品藥品職業(yè)學(xué)院，湖南長沙410208）為了研究DNA與DNA結(jié)合蛋白的相互作用，以及無細(xì)胞的染色質(zhì)體外組裝過程，從金柑葉片中提取總DNA，利用微晶纖維素得到DNA-纖維素層析配體，經(jīng)DNA-纖維素層析分離得到DNA結(jié)合蛋白，再將純化的DNA和DNA結(jié)合蛋白在低鹽條件下按一定比例混合，并進(jìn)行電湖南農(nóng)業(yè)科學(xué) 2015年8期2015-03-23
- 精子DNA損傷對生殖結(jié)局影響的研究進(jìn)展
摘要：人類精子染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的完整性是影響精子生育能力和子代安全性的重要因素，與生殖結(jié)局密切相關(guān)，可導(dǎo)致并預(yù)測男性不育及自然流產(chǎn)，亦可評估人工授精(IUI)的預(yù)后情況，并且影響體外受精-胚胎移植(IVF-ET)及卵胞漿內(nèi)單精子注射(ICSI)的受精率、著床率、妊娠率、活產(chǎn)率等。而精子DNA損傷的增加與流產(chǎn)的增加有關(guān)，對后代健康的不良影響也是通過DNA損傷的精子遺傳的，因此，精子DNA損傷閾值的確定對改善輔助生殖的治療結(jié)局非常重要。關(guān)鍵詞：精子；DNA損傷；染色醫(yī)學(xué)綜述 2015年24期2015-02-09
- 中美科學(xué)家揭示人類衰老的關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)力
示，一種叫做異染色質(zhì)的致密型染色體結(jié)構(gòu)失去穩(wěn)定，可能是關(guān)鍵原因。這項(xiàng)成果為延緩衰老及防治衰老相關(guān)疾病提供了新思路。中國科學(xué)院生物物理研究所劉光慧實(shí)驗(yàn)室、北京大學(xué)湯富酬實(shí)驗(yàn)室以及美國索爾克研究所胡安?卡洛斯?伊斯皮蘇亞?貝爾蒙特實(shí)驗(yàn)室于2015年4月30日在美國《科學(xué)》雜志上發(fā)表了他們有關(guān)干細(xì)胞衰老機(jī)理的突破性研究成果。劉光慧說，當(dāng)前的衰老理論認(rèn)為，衰老主要源于細(xì)胞內(nèi)不斷聚集的DNA損傷，而新發(fā)現(xiàn)是對這一理論的補(bǔ)充。他說：“我們提出了‘異染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)失序’是自然雜志 2015年3期2015-01-28
- 染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP)
染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP)染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)(chromatin immunoprecipitation assay，CHIP)是目前唯一研究體內(nèi)DNA與蛋白質(zhì)相互作用的方法。它的基本原理是在活細(xì)胞狀態(tài)下固定蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物，并將其隨機(jī)切斷為一定長度范圍內(nèi)的染色質(zhì)小片段，然后通過免疫學(xué)方法沉淀此復(fù)合體，特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA片段，通過對目的片斷的純化與檢測，從而獲得蛋白質(zhì)與DNA相互作用的信息。ChIP具體操作流程：第一天：一、細(xì)胞的甲醛交中華結(jié)直腸疾病電子雜志 2015年5期2015-01-21
- 一個(gè)新的時(shí)代正在到來
項(xiàng)關(guān)于30nm染色質(zhì)高級結(jié)構(gòu)解析的重大成果，這一突破為破譯上述“生命信息”建立和調(diào)控的難題向前邁出了重要的一步。2米與20微米之迷——一道30年未解的難題每個(gè)人體細(xì)胞中，基因組DNA長度加起來長達(dá)2米。這么長的基因組DNA到底是如何被“塞”到平均直徑僅有幾微米的細(xì)胞核里去的呢？在現(xiàn)代生物學(xué)的教科書里，這一過程是通過染色質(zhì)分四步折疊來完成的，分別對應(yīng)著染色質(zhì)的四種結(jié)構(gòu)：第一級結(jié)構(gòu)是核小體，它是DNA雙螺旋“繩子”纏繞在組蛋白上而形成的；第二級結(jié)構(gòu)是核小體進(jìn)一科學(xué)中國人 2014年9期2014-08-24
- 染色質(zhì)相互作用研究進(jìn)展
白結(jié)合。每一條染色質(zhì)線都是由眾多核小體組成。這種念珠狀的結(jié)構(gòu)，經(jīng)過多重折疊，并依附于染色體骨架上，形成更緊密高級的結(jié)構(gòu)[1-2]。這種復(fù)雜的組織結(jié)構(gòu)解決了將大約2 m長的DNA-組蛋白復(fù)合物壓縮進(jìn)直徑約6μm的微小細(xì)胞核的組織結(jié)構(gòu)問題，但同時(shí)也對如何將以線性方式攜帶的遺傳信息在一定的時(shí)間和空間進(jìn)行恰當(dāng)表達(dá)提出了難題。因此了解染色體在細(xì)胞核內(nèi)的組織結(jié)構(gòu)及拓?fù)渥兓?guī)律，以及這種結(jié)構(gòu)變化對基因表達(dá)的調(diào)節(jié)控制，仍然是研究的熱點(diǎn)之一。近年發(fā)展起來的各種研究染色質(zhì)相互遵義醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào) 2014年5期2014-08-13
- 30nm染色質(zhì)纖維高級結(jié)構(gòu)的研究進(jìn)展
10130nm染色質(zhì)纖維高級結(jié)構(gòu)的研究進(jìn)展董立平①陳萍②李國紅③①博士研究生，②副研究員，③研究員，中國科學(xué)院生物物理研究所生物大分子國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，北京 10010130nm染色質(zhì)纖維；螺線管模型；Z字結(jié)構(gòu)模型；左手雙螺旋；冷凍電鏡技術(shù)；核小體；組蛋白H 1真核生物的遺傳物質(zhì)DNA以染色質(zhì)形式通過逐級折疊壓縮存在于細(xì)胞核中。DNA纏繞組蛋白八聚體形成核小體，相鄰的核小體由連接DNA串聯(lián)起來形成染色質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)：核小體串珠結(jié)構(gòu)(beads-on-a-str自然雜志 2014年4期2014-04-30
- X染色質(zhì)標(biāo)本制作方法的改進(jìn)
530001X染色質(zhì)標(biāo)本制作方法的改進(jìn)李景云劉紹良廣西中醫(yī)藥大學(xué)生物教研室， 廣西 南寧 530001為提高制作X染色質(zhì)標(biāo)本的質(zhì)量，對原有的方法進(jìn)行了改進(jìn)。新方法將口腔黏膜細(xì)胞直接涮入固定液中，以滴片法制片，自來水流水沖洗玻片，用甲苯胺藍(lán)染色，取得了良好的實(shí)驗(yàn)效果。X染色質(zhì)，制作方法，改進(jìn)X染色質(zhì)是女性間期細(xì)胞核膜內(nèi)側(cè)邊緣輪廓清楚的濃染小體，大小約為1μm，一般呈平凸、圓形、扁平或三角形[1]。制作X染色質(zhì)標(biāo)本相對于染色體的制備來說更簡單易行，在鑒定性別及中國民族民間醫(yī)藥 2014年7期2014-01-25
- 染色質(zhì)修飾調(diào)節(jié)植物成花機(jī)理研究
育過程。擬南芥染色質(zhì)機(jī)制通過調(diào)控成花關(guān)鍵基因表達(dá)在成花時(shí)間上起關(guān)鍵作用，各種保守的染色質(zhì)修飾因子、植物特異因子和長的非編碼RNAs都參與到FLOWERING LOCUS C （FLC）基因染色質(zhì)調(diào)節(jié)過程中，F(xiàn)LC是植物成花的負(fù)調(diào)控因子。FLC調(diào)控機(jī)制的研究已為以染色質(zhì)調(diào)控為基礎(chǔ)的其他發(fā)育基因的研究提供了一個(gè)范本。同時(shí)，染色質(zhì)修飾在FLOWERING LOCUS T （FT）的表達(dá)調(diào)控中也同樣起著重要作用；FT是編碼植物成花素的基因，在被子植物中高度保守。此長江大學(xué)學(xué)報(bào)(自科版) 2013年29期2013-04-01
- 認(rèn)知過程中的表觀遺傳學(xué)機(jī)制