宋江勤,熊之強(qiáng),周焰升,李健,李小龍,陸材亮,李榮華(1.天門市第一人民醫(yī)院a.檢驗(yàn)科,b.信息科,湖北天門 431700;. 武漢華萊信軟件有限公司,武漢 430070)
由于微生物檢驗(yàn)的專業(yè)性、多樣性、特殊性,標(biāo)本處理工作多為人工操作,標(biāo)本檢測(cè)時(shí)間長(zhǎng),檢測(cè)周轉(zhuǎn)流程復(fù)雜,并涉及分段計(jì)費(fèi)、多級(jí)結(jié)果、分級(jí)報(bào)告等特殊流程,業(yè)務(wù)工作信息化難度較大,因此,我國(guó)臨床微生物實(shí)驗(yàn)室信息化較其他亞專業(yè)發(fā)展慢[1]。很多實(shí)驗(yàn)室目前基本上仍采用手工操作和紙質(zhì)記錄的方式,占用大量的時(shí)間,嚴(yán)重影響工作效率,且存在諸多質(zhì)量和生物安全隱患。國(guó)內(nèi)微生物實(shí)驗(yàn)室的信息化水平參差不齊,以沿海地區(qū)發(fā)展較好,國(guó)內(nèi)臨床微生物實(shí)驗(yàn)室信息化和數(shù)字化建設(shè)偶見報(bào)道[2],部分地區(qū)實(shí)現(xiàn)條碼化的全流程管理,其中上海、浙江兩地醫(yī)院相關(guān)的報(bào)道較多[3]。天門市第一人民醫(yī)院微生物實(shí)驗(yàn)室信息系統(tǒng)(microbiology laboratory information system, MLIS)通過近十年的不斷升級(jí)改造,從最初的純手工模式到目前的第三代MLIS,實(shí)現(xiàn)了從標(biāo)本接收分類、編號(hào)、實(shí)驗(yàn)流程全程智能化、信息化,并做到了實(shí)驗(yàn)過程記錄、微生物檢驗(yàn)報(bào)告等功能模塊的無紙化。
1.1基礎(chǔ)設(shè)施 數(shù)據(jù)庫服務(wù)器為雙路2 U機(jī)架式Dell PowerEdge R720,CPU為Intel(R) Xeon(R)Gold 5120 CPU @2.20GHz 2.19 GHz(4處理器),操作系統(tǒng)為64位版本的Windows Server 2012 R2;數(shù)據(jù)庫使用Oracle 12C。
微生物檢驗(yàn)儀器包括:BacT/ALERT3D 480全自動(dòng)血培養(yǎng)儀、Vitek 2 Compact全自動(dòng)細(xì)菌鑒定及藥敏分析系統(tǒng)、Vitek MS全自動(dòng)快速微生物質(zhì)譜檢測(cè)系統(tǒng)以及配套MYLA軟件系統(tǒng)(法國(guó)生物梅里埃公司)。
1.2PC終端 計(jì)算機(jī)軟件操作系統(tǒng)采用美國(guó)微軟公司W(wǎng)indows 7電腦操作系統(tǒng),使用Inter Celeron處理器、4 G內(nèi)存、500 G硬盤或以上配置,配備帶網(wǎng)絡(luò)功能的斑馬ZDesigner GK888t(EPL)條形碼打印機(jī)(上海斑馬打印科技公司)。
1.3移動(dòng)終端 采用11英寸小米平板作為移動(dòng)終端(北京小米科技公司,型號(hào):小米5),使用高通驍龍TM860位雙核處理器,前置800萬攝像頭、后置1 300萬攝像頭攝像輔助自動(dòng)對(duì)焦功能,實(shí)驗(yàn)室部署無線訪問接入點(diǎn)(AP)設(shè)備(新華三技術(shù)公司,型號(hào):H3C UAP300-S1),維融藍(lán)牙條碼掃描槍(浙江維融電子科技公司,型號(hào):WR-LP1)。
1.4臨床MLIS 現(xiàn)有版本為V3.0,自2012年開始使用至今,由武漢華萊信軟件公司和天門市第一人民醫(yī)院聯(lián)合研發(fā)。
1.5研究方法 微生物檢驗(yàn)包括樣本接收、實(shí)驗(yàn)流程和報(bào)告審核3個(gè)過程。微生物檢驗(yàn)全流程使用移動(dòng)端記錄實(shí)驗(yàn)過程和中間結(jié)果,實(shí)現(xiàn)微生物檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)過程記錄的無紙化管理。
2.1樣本接收 微生物檢驗(yàn)樣本接收包括簽收、分類和編號(hào)3個(gè)步驟。首先,對(duì)微生物檢驗(yàn)醫(yī)囑按照檢驗(yàn)項(xiàng)目及標(biāo)本類型進(jìn)行分類,將不同的微生物檢驗(yàn)醫(yī)囑分配到各虛擬儀器,各虛擬儀器按照檢驗(yàn)項(xiàng)目不同定義起始編號(hào)及編號(hào)周期,見表1。通過以上方式,實(shí)現(xiàn)從最初的全手工方式到現(xiàn)在樣本接收的智能化。
表1 微生物實(shí)驗(yàn)室樣本分類及編號(hào)規(guī)則
通過對(duì)微生物檢驗(yàn)項(xiàng)目進(jìn)行檢驗(yàn)方案的設(shè)置,將每個(gè)微生物檢驗(yàn)項(xiàng)目需要用到的培養(yǎng)基進(jìn)行對(duì)應(yīng),在樣本接收的同時(shí)打印相應(yīng)的培養(yǎng)基條碼,培養(yǎng)基條碼示意圖見圖1,條形碼包括患者信息、樣本信息、LIS條碼號(hào)、樣本條碼、培養(yǎng)基名稱等信息。
圖1 培養(yǎng)基條碼示意圖
2.2實(shí)驗(yàn)流程 微生物檢驗(yàn)樣本接收后的實(shí)驗(yàn)過程包括涂片鏡檢、菌落觀察、菌種鑒定和藥敏試驗(yàn)4個(gè)過程。通過平板電腦、藍(lán)牙掃描槍、網(wǎng)絡(luò)條形碼打印機(jī)及配套MLIS軟件,實(shí)現(xiàn)微生物檢驗(yàn)全流程的無紙化。平板移動(dòng)端界面設(shè)計(jì)示意圖見圖2,左側(cè)為患者列表區(qū),不激活情況下自動(dòng)隱藏,中間部分上部為患者及樣本信息區(qū),下部為涂片鏡檢、菌落觀察/陰性報(bào)告、菌種鑒定和藥敏試驗(yàn)4個(gè)選項(xiàng)卡,中間部分為實(shí)驗(yàn)室過程記錄區(qū)。
圖2 平板移動(dòng)端界面示意圖
2.2.1涂片鏡檢/危急值報(bào)告 該選項(xiàng)卡記錄區(qū)需要具有以下信息錄入功能,如標(biāo)本外觀、性狀、采集量、涂片結(jié)果、標(biāo)本質(zhì)量是否合格等信息,另外還需要具備標(biāo)記危急值和發(fā)送初級(jí)報(bào)告的功能。
2.2.2菌落觀察/陰性報(bào)告 該選項(xiàng)卡記錄區(qū)用于記錄菌落觀察結(jié)果,可以手工輸入觀察記錄,也可以從字典獲取,如培養(yǎng)時(shí)間未達(dá)到,則記錄菌落觀察后下一步操作。如果培養(yǎng)時(shí)間達(dá)到,則根據(jù)醫(yī)囑類型自動(dòng)輸入默認(rèn)陰性結(jié)果或手工輸入陰性結(jié)果并審核。
2.2.3菌種鑒定 因各實(shí)驗(yàn)室的菌種鑒定方法各有不同,所以這個(gè)功能區(qū)域應(yīng)根據(jù)各實(shí)驗(yàn)室個(gè)性化需求進(jìn)行設(shè)計(jì)。本實(shí)驗(yàn)室多數(shù)情況下采用的是法國(guó)生物梅里埃公司基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜儀Vitek MS進(jìn)行菌種鑒定,質(zhì)譜無法鑒定時(shí)采用法國(guó)生物梅里埃公司細(xì)菌鑒定系統(tǒng)或手工生化鑒定方法進(jìn)行。該功能區(qū)主要作用是給質(zhì)譜儀靶板進(jìn)行樣本排布,讓樣本號(hào)以一維碼的形式集中顯示,便于質(zhì)譜儀的前處理系統(tǒng)進(jìn)行靶板樣本編號(hào)。最后鑒定結(jié)果通過梅里埃MYLA系統(tǒng)接口回傳給LIS,移動(dòng)端與PC端進(jìn)行交互,實(shí)時(shí)顯示鑒定結(jié)果,便于下一步選擇藥敏試驗(yàn)方案。
2.2.4藥敏試驗(yàn) 菌種鑒定結(jié)果返回給移動(dòng)端后,人工選擇相應(yīng)的藥敏卡及補(bǔ)充的K-B法藥敏,儀器藥敏結(jié)果通過MYLA接口傳輸至LIS,K-B藥敏結(jié)果通過人工測(cè)量后手工錄入移動(dòng)客戶端,移動(dòng)端將K-B法藥敏數(shù)據(jù)交互給PC端。另外,該區(qū)域還具備藥敏計(jì)費(fèi)功能,按照實(shí)際報(bào)告抗菌藥物藥敏結(jié)果數(shù)量,實(shí)現(xiàn)一鍵將收費(fèi)信息推送給醫(yī)院信息系統(tǒng)。
2.3報(bào)告審核 因微生物培養(yǎng)藥敏報(bào)告涉及標(biāo)本性質(zhì)、涂片結(jié)果、細(xì)菌鑒定結(jié)果、菌量、耐藥表型、抗菌藥物名稱、抗菌藥物敏感性、最低抑菌濃度(MIC)或抑菌圈直徑、單位、判斷折點(diǎn)、備注說明等多個(gè)字段信息需要填寫,在移動(dòng)端進(jìn)行相關(guān)操作比較繁瑣,所以本實(shí)驗(yàn)室暫時(shí)采用PC端進(jìn)行報(bào)告審核工作,待其他功能完善后再逐步開發(fā)移動(dòng)端的審核功能。臨床MLIS移動(dòng)端界面見圖3。
圖3 臨床微生物實(shí)驗(yàn)室信息系統(tǒng)移動(dòng)端界面
2.4周轉(zhuǎn)時(shí)間(turnaround time, TAT) 經(jīng)歷約10年的時(shí)間,本實(shí)驗(yàn)室實(shí)現(xiàn)從最初的全手工模式到目前的第三代MLIS。在臨床微生物檢驗(yàn)的簽收、分類、樣本編號(hào)、培養(yǎng)基編號(hào)、藥敏補(bǔ)費(fèi)過程中,手工方式、第一代、第二代、第三代信息系統(tǒng)消耗的總時(shí)長(zhǎng)分別為1 813 s、1 809 s、36 s、4 s,在實(shí)驗(yàn)流程單、報(bào)告單發(fā)放、危急值/多重耐藥菌/傳染病報(bào)告的過程中消耗的總時(shí)長(zhǎng)分別為10 835 s、7 232 s、33 s、3 s。見表2。
表2 手工方式及三代信息系統(tǒng)工作各流程操作方式及消耗時(shí)間分析
2.5數(shù)據(jù)安全 在本實(shí)驗(yàn)室MLIS的網(wǎng)絡(luò)環(huán)境部署中,通過網(wǎng)閘將網(wǎng)絡(luò)隔離為公網(wǎng)和內(nèi)網(wǎng)2個(gè)部分,床旁設(shè)備均部署在醫(yī)院的內(nèi)網(wǎng)環(huán)境中。網(wǎng)閘遵循單一服務(wù)原則、定向交換原則、不支持協(xié)議解析原則這3個(gè)基本安全原則,從物理上實(shí)現(xiàn)對(duì)內(nèi)外網(wǎng)的隔離,即內(nèi)網(wǎng)無法直接訪問外網(wǎng),外網(wǎng)也無法直接訪問內(nèi)網(wǎng)。內(nèi)外網(wǎng)的信息交互必須通過網(wǎng)閘。同時(shí),網(wǎng)閘還可以通過黑白名單對(duì)交互進(jìn)行限制,從而保證院內(nèi)數(shù)據(jù)的安全性。在內(nèi)網(wǎng)環(huán)境中,移動(dòng)端設(shè)備所有的數(shù)據(jù)交互(包括第三方數(shù)據(jù))必須經(jīng)過MLIS智能交互系統(tǒng)的服務(wù)端。服務(wù)端使用Spring Security軟件安全框架,從權(quán)限和授權(quán)2個(gè)維度保證數(shù)據(jù)獲取的安全可控,同時(shí)使用HTTPS協(xié)議保證傳輸安全可靠。
針對(duì)敏感數(shù)據(jù)的傳輸,MLIS服務(wù)端采用了多種對(duì)稱和非對(duì)稱加密手段,保護(hù)數(shù)據(jù)和賬戶的安全可靠。數(shù)據(jù)傳輸采用SSL協(xié)議進(jìn)行加密數(shù)據(jù)傳輸。通過SSL協(xié)議進(jìn)行數(shù)據(jù)傳輸,確保數(shù)據(jù)發(fā)送到正確的客戶機(jī)和服務(wù)器,傳輸間的數(shù)據(jù)被加密防止數(shù)據(jù)中途被竊取,維護(hù)數(shù)據(jù)的完整性,確保數(shù)據(jù)在傳輸過程中不被改變。本MLIS在本實(shí)驗(yàn)室內(nèi)近10年的使用過程中,未發(fā)生系統(tǒng)被非法登錄或入侵、數(shù)據(jù)被非法泄露或篡改等嚴(yán)重安全事件。
本實(shí)驗(yàn)室第三代MLIS在TAT、工作效率以及節(jié)約紙張等方面有明顯的優(yōu)勢(shì)。特別是本系統(tǒng)中的智能簽收編號(hào)系統(tǒng),由最初的全手工方式到現(xiàn)在只需掃描標(biāo)本容器上的條形碼即可完成,實(shí)現(xiàn)了分類、簽收、編號(hào)的智能化,再配合檢驗(yàn)方案的培養(yǎng)基條形碼打印功能,使得標(biāo)本接收接種的前處理環(huán)節(jié)變得智能化和標(biāo)準(zhǔn)化。PAD等移動(dòng)客戶端,可隨時(shí)帶入標(biāo)本處理、涂片鏡檢、細(xì)菌鑒定等操作現(xiàn)場(chǎng),脫離PC端,便捷安全,實(shí)現(xiàn)培養(yǎng)結(jié)果、形態(tài)觀察等全程電子化記錄管理。
與劉厚明等[4]和羅嘉俊等[5]的研究相比,本研究中采用預(yù)置檢驗(yàn)方案打印條形碼粘貼在培養(yǎng)基上的方式,整個(gè)檢驗(yàn)過程中通過使用藍(lán)牙條碼槍掃描培養(yǎng)基條形碼,實(shí)現(xiàn)樣本的識(shí)別并記錄檢驗(yàn)結(jié)果,而其他檢驗(yàn)過程未打印條形碼。還有張煜禮等[6]設(shè)計(jì)的預(yù)制條形碼實(shí)現(xiàn)微生物檢驗(yàn)全流程智能化和無紙化,也值得借鑒。
在菌株保存模塊方面,本系統(tǒng)僅在PC端實(shí)現(xiàn)了菌株的保存日期、菌株流水號(hào)、儲(chǔ)存位置、菌株保存盒以及菌株和患者信息的記錄,但該模塊與林雪峰等開發(fā)的臨床微生物實(shí)驗(yàn)室菌株管理系統(tǒng)[7]相比,還需要繼續(xù)完善,另外針對(duì)移動(dòng)端的菌株保存功能仍在開發(fā)中。
與上海地區(qū)郭建等[8]設(shè)計(jì)的MLIS相比,本研究主要集中在開發(fā)臨床微生物實(shí)驗(yàn)過程記錄的無紙化,旨在擺脫P(yáng)C端固定不靈活的束縛,讓實(shí)驗(yàn)室的工作人員可以隨時(shí)隨地開展相關(guān)工作,真正實(shí)現(xiàn)檢驗(yàn)全過程操作的電子化記錄,減少手工錄入環(huán)節(jié),保證檢驗(yàn)質(zhì)量和實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性,減輕醫(yī)護(hù)人員工作量,節(jié)省人力資源,提高工作效率,大大縮短報(bào)告時(shí)間,降低人為誤差和生物安全隱患,并提升微生物檢驗(yàn)水平,取得了較好的社會(huì)效益和經(jīng)濟(jì)效益。