魯影,田鳳麟,劉艷慧,董曉梅,羅雷*
(1.廣州市疾病預(yù)防控制中心 傳染病預(yù)防控制部,廣東 廣州 510440;2.暨南大學(xué) 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與公共衛(wèi)生學(xué)院,廣東 廣州 510632)
流感是由流感病毒引起的呼吸道傳染?。挥捎谒鸩〖?、傳染性強(qiáng)且十分容易發(fā)生病毒變異,故易造成嚴(yán)重的公共衛(wèi)生問題[1]。世界衛(wèi)生組織提醒應(yīng)警惕潛在的新冠-流感雙重流行疊加風(fēng)險(xiǎn)。廣州市地處中國南部,屬于海洋性亞熱帶季風(fēng)氣候,而熱帶和亞熱帶地區(qū)流感的季節(jié)性呈現(xiàn)多樣性,每年可能會(huì)引起多次流行,甚至全年存在[2-3]。流感監(jiān)測是預(yù)防和控制流感流行的有效措施,對(duì)流感疫情進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)測并進(jìn)行及時(shí)預(yù)警十分重要[4]。目前廣州市流感監(jiān)測可分為流感樣病例監(jiān)測、病原學(xué)監(jiān)測以及流感樣病例暴發(fā)疫情監(jiān)測[5]。然而監(jiān)測工作受監(jiān)測數(shù)據(jù)來源、社會(huì)、經(jīng)濟(jì)等各種因素的影響,各種監(jiān)測數(shù)據(jù)能否及時(shí)對(duì)流感疫情預(yù)警,目前研究較少[6-7]。時(shí)效性通常指事件發(fā)生的時(shí)間和該事件的參考標(biāo)準(zhǔn)發(fā)生時(shí)間之間的差異[8]。為了比較廣州市不同流感監(jiān)測數(shù)據(jù)的時(shí)效性,本研究選擇2017年第1周至2021年第52周廣州市流感監(jiān)測數(shù)據(jù),采用時(shí)序圖比較、計(jì)算時(shí)間序列交叉相關(guān)性以及早期異常報(bào)告系統(tǒng)(early aberration reporting system,EARS)中的C3法分析其時(shí)效性。
2017~2021年廣州市每周流感報(bào)告病例數(shù)從中國疾病預(yù)防控制中心“傳染病監(jiān)測系統(tǒng)”獲取,流感樣病例百分比(ILI consultation rate,ILI%)數(shù)據(jù)從“廣州市突發(fā)公共衛(wèi)生事件監(jiān)測與預(yù)警系統(tǒng)”收集,流感病毒檢出率和流感樣病例暴發(fā)疫情數(shù)從“中國流感監(jiān)測信息系統(tǒng)”獲取。
1.2.1 流感報(bào)告病例數(shù)
根據(jù)《流行性感冒診斷標(biāo)準(zhǔn)》(WS285-2008)和《流行性感冒診療方案(2020年版)》,流感主要依據(jù)流行病學(xué)史、臨床表現(xiàn)和病原學(xué)檢查進(jìn)行診斷,分為臨床診斷病例和確診病例。
1.2.2 流感樣病例監(jiān)測
全國流感監(jiān)測技術(shù)指南(2017年版)中定義的流感樣病例(influenza-like illness,ILI)為:發(fā)熱(體溫≥38℃),伴咳嗽或咽痛之一者。廣州市每周通過廣州市突發(fā)公共衛(wèi)生事件監(jiān)測與預(yù)警系統(tǒng)收集19家監(jiān)測點(diǎn)醫(yī)院的流感樣病例數(shù)和門急診就診病例總數(shù)[9]。ILI%為流感樣病例數(shù)占門急診就診病例總數(shù)百分比。
1.2.3 病原學(xué)監(jiān)測
廣州市的4家流感病原學(xué)監(jiān)測點(diǎn)醫(yī)院每周至少采集20份門診病例和5份住院嚴(yán)重急性呼吸道感染患者的呼吸道標(biāo)本,送至廣州市疾病預(yù)防控制中心進(jìn)行檢測。流感病毒檢測陽性率=流感病毒檢測陽性標(biāo)本數(shù)/檢測標(biāo)本數(shù)×100%。
1.2.4 流感樣病例暴發(fā)疫情監(jiān)測
指同一地區(qū)或單位內(nèi)在較短時(shí)間出現(xiàn)異常增多的流感樣病例。1周內(nèi),在同一學(xué)校、托幼機(jī)構(gòu)或其他集體單位出現(xiàn)10例及以上流感樣病例。經(jīng)核實(shí)確認(rèn)的暴發(fā)疫情,通過“中國流感監(jiān)測信息系統(tǒng)”報(bào)告疫情事件的相關(guān)信息。
1.3.1 交叉相關(guān)分析
利用R 語言中的互相關(guān)函數(shù)(CCF)對(duì)ILI%、病毒陽性率與流感報(bào)告病例數(shù)、暴發(fā)疫情數(shù)分別進(jìn)行時(shí)間交叉相關(guān)性分析。CCF是2個(gè)時(shí)間序列(xt和yt)的觀測值之間的相關(guān),用滯后(Lag)k個(gè)時(shí)間單位分隔(yt+k和xt之間的相關(guān))。通過最大相關(guān)系數(shù)所對(duì)應(yīng)k,初步判斷各監(jiān)測數(shù)據(jù)的時(shí)效性差異。
1.3.2 EARS以及CUSUM模型
在流感預(yù)警中,累積和法(cumulative sum,CUSUM)是常用方法之一[10-12],它是通過累積期望值與觀察值之間的差值對(duì)數(shù)據(jù)實(shí)現(xiàn)質(zhì)量控制。由于它累加了歷史數(shù)據(jù)的微小偏差,相對(duì)于傳統(tǒng)控制圖法增加了靈敏性[13]。在CUSUM 的基礎(chǔ)上,美國CDC開發(fā)了EARS,常用于流感預(yù)警研究[14-15]。它包括C1、C2、C3共3種探測方法。其中C1的基線是由時(shí)間點(diǎn)t之前的7個(gè)時(shí)間點(diǎn)(即t-7至t-1)構(gòu)成,而期望值則是基線的平均值。對(duì)于C2,其基線則由時(shí)間點(diǎn)t滯后2 d的之前7個(gè)時(shí)間點(diǎn)(即t-9至t-3)構(gòu)成。C3基于C2,它累積時(shí)間點(diǎn)t和前2個(gè)時(shí)間點(diǎn)的C2值,因此其基線是時(shí)間點(diǎn)是t-11至t-3;當(dāng)實(shí)際值超過預(yù)警方法計(jì)算所得的基線值時(shí)模型將會(huì)發(fā)出預(yù)警。
利用excel 2016建立數(shù)據(jù)庫并對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行整理以及預(yù)處理,數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析利用R 4.1.3完成。
由圖1可知各監(jiān)測數(shù)據(jù)出現(xiàn)高峰的位置大致相同,尤其在2017~2019年,各監(jiān)測數(shù)據(jù)均在冬春季節(jié)(11月至次年1月)出現(xiàn)流感大高峰,同時(shí)在其他時(shí)間出現(xiàn)1個(gè)或多個(gè)小高峰。各監(jiān)測數(shù)據(jù)變化趨勢具有相似性,均具有一定的周期性。除ILI%外的其他3種監(jiān)測數(shù)據(jù)在2020年后則均呈現(xiàn)下降趨勢,在2021年有所回升。
圖1 2017~2021年廣州市流感監(jiān)測數(shù)據(jù)的時(shí)序圖比較結(jié)果Figure 1 Sequence diagram comparison results of influenza surveillance data in Guangzhou from 2017 to 2021
2.2.1 ILI%、病毒陽性率與流感報(bào)告病例數(shù)交叉相關(guān)性
由圖2可知ILI%、病毒陽性率與流感報(bào)告病例數(shù)的交叉相關(guān)系數(shù)均在Lag=1時(shí)取得最大值分別是0.272、0.567,P<0.05。
圖2 ILI%、病毒陽性率與流感報(bào)告病例數(shù)的交叉相關(guān)關(guān)系Figure 2 Cross-correlation between ILI%,virus-positive rate and the number of reported cases of influenza
2.2.2 ILI%、病毒陽性率與暴發(fā)疫情數(shù)交叉相關(guān)性
ILI%、病毒陽性率與暴發(fā)疫情數(shù)的交叉相關(guān)系數(shù)分別在Lag=2、3時(shí)取得最大值0.229、0.435,P<0.05。Lag=0~6,ILI%與暴發(fā)疫情數(shù)交叉相關(guān)系數(shù)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(圖3)。
圖3 ILI%、病毒陽性率與暴發(fā)疫情報(bào)告數(shù)交叉相關(guān)Figure 3 Cross-correlation between ILI%,virus-positive rate and the number of outbreak reports
如圖4所示,在EARS-C3預(yù)警模型中除2020年外,流感報(bào)告病例數(shù)其他4年的11月至次年1月均出現(xiàn)預(yù)警信號(hào),總共發(fā)出預(yù)警信號(hào)共11組;病毒陽性率、ILI%以及暴發(fā)疫情數(shù)在5年間分別發(fā)出9組、15組以及7組預(yù)警信號(hào)。
圖4 各流感監(jiān)測數(shù)據(jù)EARS預(yù)警周次Figure 4 The weeks of early warning of each influenza surveillance data
2.3.1 夏季高峰
ILI%在2017年的第23~29周預(yù)警出夏季高峰,遲于流感報(bào)告病例數(shù)預(yù)警的高峰(第17~30周)但是早于暴發(fā)疫情預(yù)警的高峰(第26~28周);2019年ILI%在第17~22周預(yù)警出夏季高峰,早于流感報(bào)告病例數(shù)預(yù)警的高峰(第18~22周)但是遲于暴發(fā)疫情預(yù)警的高峰(第13~15、18~19周);病毒陽性率在2017年的第17~20周預(yù)警出夏季高峰早于暴發(fā)疫情預(yù)警的高峰,2019年病毒陽性率在第21~23周預(yù)警出夏季高峰,遲于流感報(bào)告病例以及暴發(fā)疫情預(yù)警的高峰;2018年夏季各流感監(jiān)測數(shù)據(jù)均未預(yù)警明顯高峰。
2.3.2 冬季高峰
ILI%在2017~2019年冬季均預(yù)警出明顯的流感高峰,分別發(fā)生于第52周至次年第4周、第52周至次年第5周、第51周至次年第3周,這些預(yù)警均遲于流感報(bào)告病例數(shù)以及暴發(fā)疫情預(yù)警的相應(yīng)年度的冬季高峰。ILI%在2021年冬季未預(yù)警明顯高峰;病毒陽性率在2017~2019年的第48周至次年第5周、第50周至次年第6周、第51周至次年第4周以及2021年的第48~52周預(yù)警出冬季高峰,且均遲于流感報(bào)告病例數(shù)的預(yù)警(表1~3)。
表1 2017~2021年各監(jiān)測數(shù)據(jù)EARS預(yù)警高峰的周次一覽表Table 1 The list of weeks ofmonitoring data ears early warning peak from 2017 to 2021
表2 2017~2021年監(jiān)測數(shù)據(jù)與流感報(bào)告病例數(shù)的預(yù)警時(shí)效性比較Table 2 Timeliness comparison of early warning between themonitoring data and the number of influenza reported cases from 2017 to 2021
表3 2017~2021年監(jiān)測數(shù)據(jù)與暴發(fā)疫情的預(yù)警時(shí)效性相比Table 3 Timeliness comparison of early warning between themonitoring data and the number of outbreaks from 2017 to 2021
本研究顯示廣州市流感流行存在一個(gè)大高峰伴一個(gè)或多個(gè)小高峰的特征,大高峰在每年11月至次年1月左右出現(xiàn),這與以往的研究一致[9]。4種流感監(jiān)測數(shù)據(jù)反映的流行趨勢大體一致,具有一定的相關(guān)性。在2020年后除ILI%以外的3種監(jiān)測數(shù)據(jù)均呈現(xiàn)斷崖式下降,在2021年2月之后有所回升。這與我國大陸流感活動(dòng)在2020年冠狀病毒疾病大流行開始時(shí)急劇下降,并在2021年逐漸增加一致[16],可能得益于新冠防控中公眾戴口罩、洗手等非藥物干預(yù)措施[17]。然而2017~2021年廣州市ILI%未見明顯下降。由于流感樣病例監(jiān)測是癥狀學(xué)監(jiān)測,可能由流感以外的其他病因引起,此外還可能與新冠期間規(guī)范了流感樣病例就診以及出現(xiàn)流感樣癥狀時(shí)公眾尋求醫(yī)療保健行為增加有關(guān)[18]。
本研究顯示各監(jiān)測數(shù)據(jù)均發(fā)出多組預(yù)警信號(hào),其中以ILI%發(fā)出的預(yù)警信號(hào)最多。此外,在大多數(shù)流感報(bào)告病例數(shù)及暴發(fā)疫情預(yù)警信號(hào)的前后,ILI%也發(fā)出預(yù)警信號(hào),且對(duì)于流感報(bào)告病例數(shù)大多為提前預(yù)警或同時(shí)預(yù)警,偶有滯后但其滯后周數(shù)不超過6周。但病毒陽性率在這幾處發(fā)出的預(yù)警信號(hào)相對(duì)較少,較流感報(bào)告病例數(shù)最大滯后周數(shù)較大,這表明ILI%在預(yù)警流感夏季高峰以及其他小高峰時(shí)可能優(yōu)于病毒陽性率,這與秦康等[19]的研究結(jié)論一致。ILI%預(yù)警的冬季流行高峰均滯后于流感報(bào)告病例以及暴發(fā)疫情,相對(duì)于流感報(bào)告病例數(shù)最大滯后周數(shù)為6周,且它與兩者的交叉相關(guān)系數(shù)在Lag=1以及Lag=2取得最大值,故可以認(rèn)為其時(shí)效性存在滯后,這與陳楚瑩等[20]的研究一致。可能與流感報(bào)告病例異常增多或者出現(xiàn)暴發(fā)疫情之后官方發(fā)出警報(bào)、媒體加大宣傳等使ILI病人更關(guān)注自身健康并規(guī)范就診有關(guān)。
病毒陽性率在每年11月至次年1月左右的冬季高峰處均發(fā)出預(yù)警,雖然這些信號(hào)的發(fā)生大多遲于流感報(bào)告病例數(shù)以及暴發(fā)疫情,但其最大滯后周數(shù)不超過兩周,這提示病毒陽性率對(duì)廣州市流感冬季大高峰來臨有較好的提示作用。此外本研究顯示,病毒陽性率預(yù)警時(shí)效性存在滯后,這與YANG等[7]的研究結(jié)果一致。這種滯后可能與流感病毒送樣、實(shí)驗(yàn)室檢測以及結(jié)果錄入所需時(shí)間較長有關(guān)。
本研究選擇2017~2021年共5年的監(jiān)測數(shù)據(jù)。2020~2021年,新冠防控工作占據(jù)大量基層監(jiān)測和防控力量,監(jiān)測數(shù)據(jù)的穩(wěn)定性受到挑戰(zhàn),此外,新冠疫情后廣州市流感流行特征也發(fā)生較大改變,然而廣州市歷年來高度重視流感監(jiān)測工作,目前開展的流感暴發(fā)疫情監(jiān)測、癥狀學(xué)監(jiān)測、病原學(xué)監(jiān)測等均穩(wěn)定運(yùn)行,對(duì)于及時(shí)掌握我市流感流行態(tài)勢有重要作用。
綜上,廣州市4種流感監(jiān)測數(shù)據(jù)反映的流行趨勢大體一致。其中ILI%對(duì)于夏季高峰和其他小高峰有較好的預(yù)警能力,而對(duì)于冬春季節(jié)高峰,病毒陽性率的預(yù)警可能更加準(zhǔn)確。不同監(jiān)測數(shù)據(jù)時(shí)效性存在差異,表明多種監(jiān)測方法相結(jié)合并互補(bǔ)對(duì)于流感疫情防控及預(yù)警十分必要。
作者貢獻(xiàn)聲明
魯影:提出研究思路,撰寫并修改論文;田鳳麟:查閱文獻(xiàn),數(shù)據(jù)分析,撰寫并修改論文;劉艷慧:數(shù)據(jù)收集與處理;董曉梅:指導(dǎo)論文撰寫和修改;羅雷:提出研究框架,指導(dǎo)論文撰寫和修改。
利益沖突聲明
本研究未受到企業(yè)、公司等第三方資助,各作者不存在潛在利益沖突。
暨南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)與醫(yī)學(xué)版)2022年6期