仲津漫,丁健科,鄧 蕾,向 穎,劉朵朵,楊全新
(1.西安交通大學(xué)第二附屬醫(yī)院醫(yī)學(xué)影像科,陜西西安 710004;2.空軍軍醫(yī)大學(xué)第一附屬醫(yī)院整形外科,陜西西安 710032)
前列腺癌是嚴(yán)重威脅男性健康的泌尿生殖系惡性腫瘤[1]。早期多數(shù)前列腺癌患者對雄激素剝奪治療有效,但在歷經(jīng)3~5年的緩解期后,約20%的患者會由激素依賴性前列腺癌(androgen-dependent prostate cancer,ADPC)發(fā)展為去勢抵抗性前列腺癌(castra?tion-resistant prostate cancer,CRPC)[2]。CRPC患 者極易發(fā)生骨轉(zhuǎn)移,生存率較低。在前列腺癌發(fā)展為CRPC早期,如能在分子水平及早發(fā)現(xiàn)并給予有效治療方案,可延緩腫瘤進(jìn)展速度,延長患者生存期,提高患者終末期生活質(zhì)量。
適配體是一段由短鏈RNA或單鏈DNA(singlestranded DNA,ssDNA)折疊形成的具有特定二維或三維結(jié)構(gòu)的寡聚核苷酸[3]。與抗體類似,適配體能以高親和力、高特異性結(jié)合相應(yīng)靶標(biāo),此外,適配體還具有分子量小、低免疫原性、高組織滲透性、高穩(wěn)定性等獨(dú)特優(yōu)勢。適配體通過指數(shù)富集配基的系統(tǒng)進(jìn)化技術(shù)(system?atic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX)篩選[4]。細(xì)胞SELEX(Cell-SELEX)是以完整活細(xì)胞為靶標(biāo)篩選適配體,Cell-SELEX無需預(yù)先確定分子靶標(biāo)就可篩選出靶向該種細(xì)胞的特異性適配體。本研究利用Cell-SELEX技術(shù)篩選特異性靶向CRPC細(xì)胞的適配體,并應(yīng)用流式細(xì)胞術(shù)等一系列實(shí)驗,研究所篩選的適配體對CRPC組織細(xì)胞的靶向性和親和性,以期為CRPC的早期診斷和靶向治療提供新方向。
1.1 主要儀器和試劑人前列腺癌細(xì)胞系LNCap(ADPC細(xì)胞系)、C4-2(CRPC細(xì)胞系)購自中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究所細(xì)胞庫,鏈霉親和素磁珠購自蘇州海貍納米科技有限公司,RPMI-1640培養(yǎng)基、DMEM培養(yǎng)基均購自Gibco公司,進(jìn)口胎牛血清購自ZETA LIFE公 司,DNA Marker(DL 2000)購 自TaKaRa公司,其他試劑均為進(jìn)口分裝或國產(chǎn)分析純試劑。
PCR儀(Bio-Rad美國),磁性分離器(西安金磁納米生物技術(shù)有限公司),流式細(xì)胞儀(BD美國),激光共聚焦熒光顯微鏡(Nikon日本),熒光顯微鏡及照相系統(tǒng)(Olympus日本)。1.2 CRPC適配體篩選設(shè)計隨機(jī)單鏈DNA文庫及上、下游引物,其序列分別如下:DNA文庫TGCG?GCAGTTGAAGCAAGGC(N40)ACGGCAGCACCAGAGAACCA;上 游 引 物5’-TGCGGCAGTT?GAAGCAAGGC-3’;下游引物5’-TGGTTCTCTG?GTGCTGCCGT-3’;上游引物的5’端用FITC標(biāo)記,下游引物的5’端用生物素標(biāo)記;DNA文庫和引物由北京奧科鼎盛生物科技有限公司合成,采用固相亞磷酸酰胺合成法,經(jīng)HPLC純化。
分別制備ADPC細(xì)胞系LNCap和CRPC細(xì)胞系C4-2的細(xì)胞懸液,置于超聲破碎儀作用60 min,所得產(chǎn)物作為PCR模板,行PCR擴(kuò)增。以C4-2細(xì)胞基因組作為正篩選的PCR模板,以LNCap細(xì)胞基因組作為負(fù)篩選的PCR模板,將每一輪次篩選得到的DNA產(chǎn)物為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增、純化。用生物素-鏈霉親和素磁珠分離法將PCR產(chǎn)物分離后所獲得的產(chǎn)物用于下一輪次的篩選,共擴(kuò)增14個循環(huán)。用流式細(xì)胞儀監(jiān)測Cell-SELEX篩選進(jìn)程。
1.3 CRPC適配體的鑒定將最后一輪次篩選所得的DNA產(chǎn)物行PCR擴(kuò)增純化,PCR產(chǎn)物與pTOPO載體連接,然后轉(zhuǎn)化至大腸桿菌感受態(tài)DH5a中進(jìn)行擴(kuò)增。隨機(jī)挑取60個單克隆,分別置于LB培養(yǎng)基中培養(yǎng)12 h后行菌液PCR。PCR產(chǎn)物經(jīng)核酸凝膠電泳鑒定。將出現(xiàn)明顯目的條帶的菌液樣品送北京奧科鼎盛生物科技有限公司進(jìn)行DNA測序。用mfold預(yù)測目的DNA及核酸適配體的二級結(jié)構(gòu)。
采用單點(diǎn)吸附測定法獲得適配體的平衡解離常數(shù)。以流式細(xì)胞術(shù)熒光幾何平均值為縱坐標(biāo),以適配體濃度為橫坐標(biāo),根據(jù)公式Y(jié)=Bmax×X/(Kd+X)方程模擬曲線,分別計算所篩選適配體CRPC-1和CRPC-2的平衡解離常數(shù)。
1.4 檢測篩選出的適配體特異性靶向CRPC細(xì)胞的能力
1.4.1流式細(xì)胞術(shù)常規(guī)培養(yǎng)人前列腺癌細(xì)胞系LNCap和C4-2。取對數(shù)生長期的前列腺癌細(xì)胞,用胰酶消化,800 r/min離心5 min,棄上清,加入流式洗液重懸細(xì)胞,1 000 r/min離心5 min,胎牛血清封閉30 min,加入200 pmol FITC標(biāo)記的適配體CRPC-1/CRPC-2溶液,充分重懸細(xì)胞,置于冰上孵育30 min,用流式細(xì)胞儀檢測各細(xì)胞系分別與所篩選適配體的特異性結(jié)合情況。
1.4.2細(xì)胞免疫熒光檢測同樣取對數(shù)生長期的前列腺癌細(xì)胞LNCap和C4-2,分別接種于20 mm激光共聚焦培養(yǎng)皿中,置于細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng),待細(xì)胞完全伸展并生長至培養(yǎng)皿底面積約75%時,吸棄上清液,PBS洗滌,向培養(yǎng)皿中加入40 g/L多聚甲醛固定15 min,50 g/L BSA室溫封閉1 h,用PBS洗滌后加入200 pmol FITC標(biāo)記的適配體CRPC-1/CRPC-2溶液,置于4℃避光孵育6~8 h,加入DAPI(1∶1 000)孵育5 min襯染細(xì)胞核,封片后置于激光共聚焦熒光顯微鏡下,觀察各細(xì)胞的熒光顯示比例。
1.5 檢測適配體CRPC-1對CRPC組織特異性結(jié)合的能力收集臨床確診的良性前列腺增生、早期前列腺癌及CRPC患者各2例,取各組患者病理組織浸泡于40 g/L多聚甲醛固定后,石蠟包埋組織塊,制作4 μm厚切片。經(jīng)抗原修復(fù)后,滴加適量50 g/L BSA完全覆蓋切片組織,室溫封閉1 h,然后滴加標(biāo)記FITC熒光基團(tuán)的適配體CRPC-1溶液,4℃避光孵育過夜;加入適量DAPI(1∶1 000)室溫孵育5 min襯染細(xì)胞核,封片后置于激光共聚焦熒光顯微鏡下,觀察3種前列腺病理組織的熒光顯示比例。
2.1 CRPC適配體的篩選情況利用Cell-SELEX技術(shù)從隨機(jī)單鏈DNA文庫中篩選與C4-2細(xì)胞特異性結(jié)合,而不與LNCap細(xì)胞結(jié)合的DNA序列,共篩選14輪;對每一輪篩選得到的DNA產(chǎn)物行流式細(xì)胞術(shù)檢測,觀察DNA產(chǎn)物與靶細(xì)胞特異性結(jié)合的相對熒光強(qiáng)度與相對細(xì)胞計數(shù)的結(jié)果顯示,隨著篩選次數(shù)的增加,DNA產(chǎn)物與C4-2細(xì)胞結(jié)合的熒光強(qiáng)度呈逐漸增強(qiáng)趨勢,而與LNCap細(xì)胞結(jié)合的熒光強(qiáng)度始終較低;相對熒光強(qiáng)度量化結(jié)果顯示熒光強(qiáng)度差異有統(tǒng)計學(xué)意義(圖1)。
圖1 CRPC特異性適配體Cell-SELEX的篩選Fig.1 The selection process of CRPC aptamer generation by Cell-SELEX
2.2 CRPC適配體的鑒定結(jié)果將經(jīng)過14輪次篩選后所得的DNA產(chǎn)物進(jìn)行PCR擴(kuò)增、連接、轉(zhuǎn)化并隨機(jī)挑取60個單克隆行菌液PCR及電泳鑒定,將出現(xiàn)明顯目的條帶的樣本送公司測序,去除未檢出、非單克隆序列、同源性序列,余下序列送上海生工生物工程有限公司合成,最后經(jīng)非變性核酸凝膠電泳鑒定,選取兩條序列作為目的適配體,分別命名為CRPC-1和CRPC-2,其序列及預(yù)測的二級結(jié)構(gòu)示意圖如圖2所示。計算所篩選適配體的解離常數(shù),分別為CRPC-1的解離常數(shù)為(4.9±1.6)nmol/L,CRPC-2的解離常數(shù)為(33.26±4.1)nmol/L(圖3)。
圖2 Cell-SELEX篩選所獲得的核酸適配體CRPC-1(A)和CRPC-2(B)的序列及二級結(jié)構(gòu)示意圖Fig.2 Sequence and secondary structure prediction of aptamer CRPC-1(A)and CRPC-2(B)selected by Cell-SELEX
圖3 Cell-SELEX篩選所獲得的核酸適配體CRPC-1(A)和CRPC-2(B)的的解離常數(shù)Fig.3 Dissociation constants of aptamer CRPC-1(A)and CRPC-2(B)selected by Cell-SELEX
2.3 檢測適配體對CRPC細(xì)胞特異性結(jié)合的能力
2.3.1流式細(xì)胞術(shù)檢測結(jié)果顯示,F(xiàn)ITC標(biāo)記的適配體特異性靶向前列腺癌細(xì)胞的CRPC-1和CRPC-2均可以與C4-2細(xì)胞特異性結(jié)合,結(jié)合熒光強(qiáng)度較高,而不能結(jié)合LNCap細(xì)胞;作為對照的隨機(jī)DNA文庫,對2種細(xì)胞均不能結(jié)合;相對熒光強(qiáng)度量化結(jié)果顯示,熒光強(qiáng)度組間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(圖4)。這提示篩選出的兩條適配體對CRPC細(xì)胞具有良好的靶向親和性。
2.3.2細(xì)胞免疫熒光將FITC標(biāo)記的適配體CRPC-1和CRPC-2分別與LNCap和C4-2細(xì)胞共孵育的激光共聚焦熒光顯微鏡下的觀察結(jié)果顯示,C4-2細(xì)胞表面可見明顯的熒光標(biāo)記,而LNCap細(xì)胞表面未見特異性熒光顯示(圖5),表明篩選出的2個適配體均能特異性結(jié)合CRPC細(xì)胞。
圖4流式細(xì)胞術(shù)檢測核酸適配體CRPC-1、CRPC-2對CRPC細(xì)胞的靶向親和性Fig.4 Binding affinity of aptamer CRPC-1 and CRPC-2 to CRPC cell lines detected by flow cytometry
圖5細(xì)胞免疫熒光實(shí)驗檢測核酸適配體CRPC-1、CRPC-2對CRPC細(xì)胞的靶向親和性Fig.5 Binding affinity of aptamer CRPC-1 and CRPC-2 to CRPC cell lines detected by immunofluorescence assay
2.4 檢測適配體CRPC-1對CRPC組織特異性結(jié)合的能力對3種前列腺病理組織的免疫熒光染色的分析發(fā)現(xiàn)適配體CRPC-1能使CRPC組織特異性染色,而對良性前列腺增生組織及早期前列腺癌組織染色不明顯(圖6)。提示篩選出的適配體CRPC-1能特異性識別并結(jié)合CRPC組織。
最新數(shù)據(jù)表明,前列腺癌居全球男性癌癥發(fā)病率第三位,死亡率第五位,嚴(yán)重影響了男性的生命健康[5]。雄激素剝奪治療是目前前列腺癌治療的標(biāo)準(zhǔn)方法,其對于減少腫瘤負(fù)荷、降低前列腺特異性抗原(prostate-specific antigen,PSA)水平具有重要意義[6]。但雄激素剝奪治療不能治愈前列腺癌,多數(shù)進(jìn)展期前列腺癌最終都會發(fā)展為CRPC[7]。
歐洲泌尿外科協(xié)會將CRPC定義為去勢后血清睪酮水平<50 ng/dL并且合并三項之一的(生化進(jìn)展:1周內(nèi)連續(xù)3次PSA升高并且PSA>2 ng/mL;或者影像學(xué)進(jìn)展出現(xiàn)新的轉(zhuǎn)移灶;或者患者癥狀進(jìn)展惡化[2])。盡管體外細(xì)胞實(shí)驗可以明確鑒別激素依賴性與激素非依賴性前列腺癌細(xì)胞,但在體內(nèi)難以實(shí)現(xiàn)CRPC的早期發(fā)現(xiàn)與診斷。多數(shù)CRPC患者在確診時已有明顯癥狀或出現(xiàn)生化進(jìn)展。由于發(fā)現(xiàn)時間晚,這類患者極易產(chǎn)生耐藥性,病情進(jìn)展快、死亡率高[8-9]。因此,從細(xì)胞分子水平早期診斷CRPC對于及時調(diào)整臨床用藥、改善前列腺癌患者預(yù)后、提高患者生存質(zhì)量至關(guān)重要。
圖6組織免疫熒光實(shí)驗檢測核酸適配體CRPC-1的CRPC組織特異性Fig.6 Binding affinity of aptamer CRPC-1 to CRPC tissues detected by immunohistofluorescence assay
腫瘤在進(jìn)展過程中伴隨的基因或蛋白的變異使得癌變細(xì)胞與正常細(xì)胞或其他腫瘤細(xì)胞之間存在分子水平上的差異,這些差異正是SELEX技術(shù)篩選適配體的分子基礎(chǔ)。傳統(tǒng)的SELEX需要預(yù)先選定相應(yīng)靶標(biāo)才能進(jìn)一步行適配體篩選,而Cell-SELEX不需要準(zhǔn)確了解細(xì)胞表面的分子及其結(jié)構(gòu)信息,可以在未知標(biāo)志物的情況下用完整的活細(xì)胞作為靶標(biāo)獲取高特異性、高親和性的適配體[4,10]。因此,Cell-SELEX技術(shù)在疾病的早期診斷和靶向治療中極具應(yīng)用前景。目前,國內(nèi)外已有學(xué)者利用Cell-SELEX成功篩選出源于肝細(xì)胞癌、小細(xì)胞肺癌以及結(jié)直腸癌細(xì)胞的適配體[11-15],為后續(xù)相關(guān)腫瘤特異性診療方案的研究奠定了實(shí)驗基礎(chǔ)。
當(dāng)前,尚未見CRPC特異性分子靶點(diǎn)的報道,以CRPC特異性分子為靶點(diǎn)篩選CRPC適配體的方法難以實(shí)現(xiàn)。本課題利用Cell-SELEX技術(shù),以激素非依賴性前列腺癌細(xì)胞C4-2為靶細(xì)胞,以其同源激素依賴性前列腺癌細(xì)胞LNCap為負(fù)篩細(xì)胞,從隨機(jī)單鏈DNA文庫中篩選出可特異性結(jié)合CRPC細(xì)胞而不結(jié)合ADPC細(xì)胞的適配體,即特異性靶向CRPC細(xì)胞的適配體CRPC-1和CRPC-2,并經(jīng)一系列實(shí)驗研究證實(shí)CRPC-1和CRPC-2均能特異性結(jié)合CRPC組織細(xì)胞,而不與ADPC組織細(xì)胞結(jié)合。本研究證實(shí)這兩種適配體對CRPC組織細(xì)胞具有良好的靶向性和親和性,有望在分子細(xì)胞學(xué)水平將ADPC與CRPC相鑒別,進(jìn)而早期識別CRPC狀態(tài),并為早期篩查CRPC提供了新思路和理論依據(jù),為CRPC的早期診斷和靶向治療提供新方法,對及時調(diào)整前列腺癌治療方案、延緩腫瘤進(jìn)展速度、改善患者預(yù)后具有重要意義。