鄭爽 何麗清 儲(chǔ)開博
山西中醫(yī)藥大學(xué) 山西,晉中 030619
小青龍湯是《傷寒論》中治療外寒里飲的經(jīng)典方劑,臨床多用于治療肺系疾病[1]。除此之外,小青龍湯在臨床上也可治療與肺、脾、腎三臟相關(guān)的水液代謝疾病,例如痰飲、水腫、泄瀉等[2],也有醫(yī)家運(yùn)用小青龍湯治療慢性腎臟疾病的相關(guān)案例[3-4]。
慢性腎小球腎炎(chronic glomerulonephritis,CGN),簡稱慢性腎炎,是臨床常見的慢性腎臟病,以蛋白尿、血尿、水腫等為基本癥狀[5],具有起病隱匿、病程遷延的特點(diǎn),現(xiàn)代醫(yī)學(xué)尚無有效方法根治。CGN在中醫(yī)沒有專門的病名,根據(jù)臨床癥狀的不同,可將其歸為“尿血”“水腫”“痰飲”等范疇,中藥治療歷史悠久,而且效果顯著。
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)這一概念由英國藥理學(xué)家Andrew于2007年提出,是基于系統(tǒng)生物學(xué)理論,通過網(wǎng)絡(luò)分析技術(shù)分析藥物、基因、疾病之間的復(fù)雜關(guān)系。在臨床上面對(duì)復(fù)雜疾病時(shí),從網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)角度審視藥物的作用能夠?yàn)閷ふ抑委煼椒ㄌ峁┬碌囊暯荹6]。
通過文獻(xiàn)查閱,筆者了解到目前對(duì)于小青龍湯的研究多集中于肺系疾病,有少部分文獻(xiàn)報(bào)道小青龍湯對(duì)CGN具有治療作用,但相關(guān)的臨床以及實(shí)驗(yàn)研究均較少,其藥理作用與作用機(jī)制尚未明確。本文旨在通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析,從分子水平上闡明小青龍湯的化合物成分靶點(diǎn)與CGN的疾病靶點(diǎn)之間的潛在關(guān)系,預(yù)測小青龍湯治療CGN的潛在作用靶點(diǎn),為進(jìn)一步深入研究小青龍湯治療CGN的作用機(jī)制提供理論基礎(chǔ)。
1.1 小青龍湯化學(xué)成分與靶點(diǎn)的收集 利用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(tái)(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP) (https://tcmspw.com/tcmsp.php),分別以“麻黃、桂枝、芍藥、干姜、細(xì)辛、半夏、五味子、甘草”為關(guān)鍵詞,檢索小青龍湯組方中藥物的化學(xué)成分。以藥物口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%和類藥性(drug likeness,DL)≥0.18為篩選條件進(jìn)行篩選,得到小青龍湯的候選化合物以及這些成分所作用的靶點(diǎn),重復(fù)靶點(diǎn)僅保留1個(gè)。
1.2 小青龍湯治療CGN的潛在靶點(diǎn)的獲取 以“chronic glomerulonephritis”為檢索詞,分別從在線人類孟德爾遺傳(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)數(shù)據(jù)庫、基因組注釋數(shù)據(jù)平臺(tái)(genome annotation database platform,Genecard)中搜索已報(bào)道的CGN的相關(guān)基因,去除重復(fù)基因和假陽性基因,將收集到的基因與上述成分靶點(diǎn)上傳至韋恩圖2.1(http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html)進(jìn)行匹配分析,得到小青龍湯治療CGN相關(guān)的潛在作用靶點(diǎn)。
1.3 預(yù)測潛在核心成分以及核心靶點(diǎn) 將小青龍湯治療CGN的潛在作用成分與靶點(diǎn)導(dǎo)入Cytoscape 3.7.2軟件構(gòu)建“化合物-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖。通過軟件分析節(jié)點(diǎn)自由度(Degree),對(duì)各節(jié)點(diǎn)進(jìn)行拓?fù)浞治?,篩選出小青龍湯治療CGN的核心成分與核心靶點(diǎn)。
1.4 蛋白質(zhì)相互作用(protein protein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建 將小青龍湯的核心作用靶點(diǎn)上傳至String 11.0平臺(tái)(https://string-db.org)得到核心靶點(diǎn)的PPI網(wǎng)絡(luò),并構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)圖。
1.5 潛在作用靶點(diǎn)的通路富集分析 將小青龍湯治療CGN的潛在作用靶點(diǎn)上傳至生物學(xué)信息注釋數(shù)據(jù)庫DAVID(https://david.ncifcrf.gov/),進(jìn)行基因本體(gene ontology,GO)富集分析和京都基因與基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信號(hào)通路富集分析,GO分析包括生物過程(biological process,BP)、細(xì)胞成分(cellular component,CC)、分子功能(molecular function,MF)。 以P<0.01為篩選條件篩選GO條目,以P<0.05為條件篩選KEGG條目,最后將GO和KEGG富集分析結(jié)果進(jìn)行可視化。
2.1 小青龍湯藥物化合物和靶點(diǎn)的篩選 在TCMSP中檢索小青龍湯中8味中藥的化合物及其對(duì)應(yīng)的作用靶點(diǎn),得到1 534種化合物,以O(shè)B≥30%、DL≥0.18篩選后去掉重復(fù)化學(xué)成分,得到小青龍湯的有效化合物149種,作用靶點(diǎn)288個(gè)。
2.2 小青龍湯治療CGN潛在靶點(diǎn)的獲取 通過數(shù)據(jù)庫檢索,得到CGN相關(guān)基因共有2 425個(gè)。通過與小青龍湯的288個(gè)作用靶點(diǎn)進(jìn)行比對(duì),篩選出154個(gè)可能與治療CGN相關(guān)的作用靶點(diǎn)。見圖1。
圖1 小青龍湯與CGN靶點(diǎn)的韋恩圖Fig.1 Venn diagram of Xiaoqinglong Decoction and CGN
2.3 預(yù)測潛在核心成分以及核心靶點(diǎn) 通過Cytoscape 3.7.2軟件構(gòu)建“化合物-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)。見圖2。圖中菱形節(jié)點(diǎn)代表小青龍湯治療CGN的核心化合物,圓形節(jié)點(diǎn)代表小青龍湯治療CGN的核心靶點(diǎn),顏色深淺表示Degree大小,顏色越深則Degree值越大。以化合物和靶點(diǎn)為節(jié)點(diǎn)(Node),相互關(guān)系為邊(Edge),利用軟件分析各個(gè)節(jié)點(diǎn)的自由度(Degree)進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治觯A(yù)測小青龍湯治療CGN的核心成分與核心靶點(diǎn),共篩選出40個(gè)潛在核心成分和40個(gè)潛在核心靶點(diǎn)。部分信息見表1。
表1 部分小青龍湯治療CGN核心化合物及其所對(duì)應(yīng)的核心靶點(diǎn)Tab.1 Some core components and related targets of Xiaoqinglong Decoction Treating CGN
圖2 小青龍湯治療CGN的“化合物-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖Fig.2 The component-target network diagram of Xiaoqinglong Decoction and CGN
2.4 PPI網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建 將小青龍湯治療CGN的核心靶點(diǎn)導(dǎo)入String 11.0平臺(tái),在線構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)圖。見圖3。網(wǎng)絡(luò)中有40個(gè)節(jié)點(diǎn)發(fā)生相互作用,相互作用的邊有155條,平均自由度(Degree)為7.75。
圖3 PPI網(wǎng)絡(luò)圖Fig.3 PPI network diagram
2.5 潛在靶點(diǎn)的GO、KEGG富集分析 將小青龍湯治療CGN的潛在核心靶點(diǎn)導(dǎo)入生物學(xué)信息注釋數(shù)據(jù)庫DAVID 6.7在線進(jìn)行GO富集分析,共獲得GO條目279條,其中BP 275條、CC 31條、MF 46條。 以P<0.01為條件進(jìn)行篩選,對(duì)前10項(xiàng)進(jìn)行可視化。見圖4。小青龍湯治療CGN涉及血管生成、血管內(nèi)皮細(xì)胞遷移的正調(diào)控、脂多糖介導(dǎo)的信號(hào)通路、類固醇激素受體活性、細(xì)胞外調(diào)節(jié)蛋白激酶1(extracellular regulated protein kinases 1,ERK1)和ERK2級(jí)聯(lián)的正調(diào)控等過程。
圖4 GO功能分析可視化結(jié)果Fig.4 Visualization result of GO
將小青龍湯治療CGN的潛在核心靶點(diǎn)導(dǎo)入DAVID 6.7進(jìn)行KEGG通路富集分析,得到KEGG通路條目89條,以P<0.05為條件,對(duì)前25條通路進(jìn)行可視化分析。見圖5。KEGG通路富集分析結(jié)果中包括血管內(nèi)皮生長因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)信號(hào)通路、缺氧誘導(dǎo)因子-1(hypoxia-inducible factor-1,HIF-1)信號(hào)通路、腫瘤壞死因子(tumor necrosis factor,TNF)信號(hào)通路、磷脂酰肌醇激酶-蛋白激酶 B (phosphatidylinositide 3-kinases-protein kinase B,PI3K-Akt)信號(hào)通路和Toll樣受體(Toll-like receptors,TLR)信號(hào)通路等,說明小青龍湯治療CGN的機(jī)制可能與調(diào)節(jié)這些信號(hào)通路相關(guān)。
圖5 KEGG通路富集分析可視化結(jié)果Fig.5 Visualization result of KEGG pathway
中醫(yī)認(rèn)為CGN的病位主要在肺脾腎三臟。脾主運(yùn)化,脾氣虧虛,則不能運(yùn)化水濕;腎主水,腎氣虧虛,則不能氣化水濕、宣通水氣。根據(jù)五行生克的原理,肺屬金能生水,為腎水之母,子病治母是中醫(yī)的治法之一;且肺主氣行治節(jié),明代張介賓[7]認(rèn)為,水腫“蓋水為至陰,故其本在腎;水化于氣,故其標(biāo)在肺”。肺主宣發(fā)肅降,能夠肅降水液,下輸至腎與膀胱,肺失宣降導(dǎo)致氣機(jī)不調(diào),精微不升,出現(xiàn)蛋白尿和尿血等癥狀。CGN在中醫(yī)屬“尿血”“水腫”“痰飲”等范疇,《金匱要略》中提出“痰飲”“水腫”可通過發(fā)汗、利尿等方法治療。小青龍湯主治外寒里飲證,以麻黃、桂枝為君,發(fā)
汗散寒解表、溫陽化氣,以化腎水;細(xì)辛、干姜為臣,助麻桂解表的同時(shí)亦能溫腎行水;白芍五味子味酸收斂,以免辛散肺氣太過,亦為臣;半夏為使,降氣散水飲;甘草為佐使,益氣和中、調(diào)和諸藥。故CGN辨證外寒里飲兼有水腫時(shí),可用小青龍湯治療。從現(xiàn)代醫(yī)學(xué)角度分析,CGN合并感染,誘發(fā)機(jī)體免疫反應(yīng),日久造成腎損傷,引發(fā)或加重CGN[8]。根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道,小青龍湯治療CGN寒飲蘊(yùn)肺證大鼠,能夠降低大鼠尿蛋白水平,保護(hù)腎功能,防止腎組織病理變化,故小青龍湯治療CGN有充足的理論依據(jù)[9]。
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是一種通過綜合分析和篩選各種基因、蛋白、藥物數(shù)據(jù)庫,利用網(wǎng)絡(luò)分析軟件構(gòu)建“化合物-靶點(diǎn)-疾病”網(wǎng)絡(luò),系統(tǒng)揭示三者之間關(guān)聯(lián)的藥理研究方法[10]。中藥治療CGN所具有的整體性、多靶點(diǎn)、多通路的特點(diǎn),適合應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法進(jìn)行研究,因此本研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué),探討了小青龍湯治療CGN的潛在作用機(jī)制。
本研究通過構(gòu)建“化合物-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖,找到了小青龍湯治療CGN的潛在核心化合物,這些化合物均能作用于多個(gè)靶點(diǎn),包括槲皮素(quercetin)、山奈酚(kaempferol)、 豆甾醇 (stigmasterol)、β-谷甾醇 (βsitosterol)、柚皮素(naringenin)、木犀草素(luteolin)、黃芩苷(baicalein)、卡維?。–avidine)、隱品堿(cryptopin)、花旗松素(taxifolin)等。其中β-谷甾醇為麻黃、桂枝、白芍、干姜、半夏的活性成分,山奈酚在麻黃、白芍、細(xì)辛、甘草中均有分布,豆甾醇在麻黃、半夏中分布,兒茶素在麻黃、桂枝、白芍中分布,花旗松素為麻黃、桂枝的活性成分,可以看出君藥麻黃、桂枝中含有多種相同的化合物,由此筆者認(rèn)為麻黃、桂枝解表散寒、溫化陽氣的功效可能與這些化合物有關(guān)。槲皮素是一種黃酮醇類化合物,其作用機(jī)制可能是通過抑制表皮生長因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR)磷酸化激活過程,進(jìn)而抑制其下游蛋白激酶B/哺乳動(dòng)物雷帕霉素靶蛋白(protein kinase B/mammalian target of rapamycin,AKT/mTOR)通路的信號(hào)傳導(dǎo),同時(shí)抑制該通路下游的增殖相關(guān)基因VEGF[11]。實(shí)驗(yàn)研究表明,槲皮素能夠減輕高糖條件下人腎小球內(nèi)皮細(xì)胞的損傷[12],也能夠減輕放射性對(duì)比劑引起的腎損傷,起到保護(hù)腎臟的作用[13]。山奈酚也被證實(shí)能夠抑制人腎小球內(nèi)皮細(xì)胞氧化應(yīng)激和凋亡[14]。β-谷甾醇可能通過誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄激活因子1(signal transducer and activator of transcription 1,STAT1) 和核因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB) 失活,從而發(fā)揮抗炎作用[15]。柚皮素則通過抑制半胱天冬酶-3(caspase-3,CASP3)等凋亡相關(guān)蛋白的表達(dá),抑制腎小球系膜細(xì)胞凋亡[16]。木犀草素能夠減輕單側(cè)輸尿管梗阻大鼠腎臟的炎癥反應(yīng),改善腎功能[17]。黃芩苷可能通過調(diào)控TLR2/4信號(hào)通路和線粒體應(yīng)激,抑制促炎反應(yīng)和線粒體介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡,從而減輕腎臟缺血再灌注造成的損傷[18]。綜合分析提示,小青龍湯通過各組成藥物之間的協(xié)同作用,多靶點(diǎn)而并非單一靶點(diǎn)治療CGN,其核心成分能夠通過調(diào)節(jié)相關(guān)通路,從而減輕腎臟炎癥反應(yīng),抑制內(nèi)皮細(xì)胞氧化應(yīng)激和細(xì)胞凋亡,緩解腎損傷。
通過分析PPI網(wǎng)絡(luò)以及“化合物-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖,進(jìn)一步確定了40個(gè)核心靶點(diǎn),包括前列腺素G/H合酶2(prostaglandin G/H synthase 2,PTGS2)、CASP3、雌激素受體1(estrogen receptor 1,ESR1)、一氧化氮合酶2(nitric oxide synthase 2,NOS2)、雄激素受體(androgen receptor,AR)、絲裂原活化蛋白激酶14(mitogenactivated protein kinase 14,MAPK14)。 PTGS2也被稱為環(huán)氧合酶2(cyclooxygenase,COX-2)。 研究證實(shí),COX-2是前列腺素合成的關(guān)鍵誘導(dǎo)酶,參與炎癥反應(yīng)、血管緊張度維持、電解質(zhì)平衡和腎素釋放過程,且與蛋白尿誘導(dǎo)的足細(xì)胞損傷有關(guān)[19]。Yang等[20]研究證實(shí),CASP3能夠?qū)δI纖維化以及微血管內(nèi)皮細(xì)胞凋亡起到調(diào)節(jié)作用。腎小球系膜細(xì)胞的增殖失控是腎臟疾病的共同特征,ESR1作為樞紐蛋白在腎小球膜細(xì)胞增殖中具有重要作用,目前被認(rèn)為是腎臟疾病的潛在靶標(biāo)之一[21]。AR在許多細(xì)胞和組織中廣泛表達(dá),研究表明AR可能通過調(diào)節(jié)血管內(nèi)皮生長因子/缺氧誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄因子-2α(vascular endothelial growth factor/hypoxia-inducible transcription factor-2α,VEGF/HIF-2α)信號(hào)通路的信號(hào)傳導(dǎo)來促進(jìn)腎癌細(xì)胞遷移[22]。MAPK14參與多種信號(hào)通路的過程,與細(xì)胞增殖分化以及炎癥反應(yīng)密切相關(guān)。研究表明,MAPK14在腎小管細(xì)胞炎癥和增殖反應(yīng)的調(diào)節(jié)中具有重要作用,通過促進(jìn)炎癥和細(xì)胞死亡,導(dǎo)致急性腎損傷[23]。
GO及KEGG富集分析結(jié)果顯示,小青龍湯治療CGN主要涉及血管生成、血管內(nèi)皮細(xì)胞遷移的正調(diào)控、脂多糖介導(dǎo)的信號(hào)通路、類固醇激素受體活性、細(xì)胞外調(diào)節(jié)蛋白激酶的正調(diào)控等過程,參與調(diào)控的信號(hào)通路包括VEGF信號(hào)通路、HIF-1信號(hào)通路、TNF信號(hào)通路、PI3K-Akt信號(hào)通路和TLR信號(hào)通路,表明小青龍湯的多種活性化合物通過參與調(diào)控多種信號(hào)通路,協(xié)同發(fā)揮療效。VEGF信號(hào)通路通過抑制足細(xì)胞中VEGF和Nephrin蛋白的表達(dá),造成蛋白尿[24]。抑制HIF-1信號(hào)通路能夠改善腎間質(zhì)纖維化大鼠腎功能,緩解腎組織腎小球硬化[25]。TNF信號(hào)通路、PI3K-Akt信號(hào)通路則能夠通過調(diào)節(jié)細(xì)胞周期,抑制細(xì)胞凋亡和炎癥反應(yīng)[26]。
綜上所述,本次研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)網(wǎng)絡(luò)化、可視化的特征,初步研究小青龍湯治療CGN潛在的作用機(jī)制,找到了其治療機(jī)制中的核心化合物與核心靶點(diǎn),分析了相關(guān)生物過程和信號(hào)通路,但網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是基于數(shù)據(jù)庫的綜合分析和篩選,并未進(jìn)行實(shí)際的實(shí)驗(yàn)研究,故本研究的結(jié)論仍需要進(jìn)一步的體外和體內(nèi)研究加以證明。