楊彩霞,陸 超
南京醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院兒科,江蘇 南京 210029
急性T 細(xì)胞淋巴細(xì)胞白血?。═-cell acute lymphoblastic leukemia,T-ALL),是惡性程度較高的血液?。?],由于逐漸累積的基因突變破壞了正常的胸腺細(xì)胞發(fā)育過程,包括細(xì)胞生長、增殖、存活和分化的正??刂?,導(dǎo)致T 細(xì)胞祖細(xì)胞發(fā)生轉(zhuǎn)化[2]。染色質(zhì)解旋酶DNA 結(jié)合蛋白4(recombinant chromodomain helicase DNA binding protein 4,CHD4),屬于核小體重構(gòu)和組蛋白脫乙酰酶復(fù)合體的重要成員之一[3],涉及許多致癌過程,與表觀遺傳密切相關(guān),包括控制細(xì)胞周期進(jìn)展,加速實(shí)體腫瘤轉(zhuǎn)移,發(fā)動和維持多種腫瘤抑制基因沉默等[4-6]。CHD4在T細(xì)胞發(fā)育過程中積極參與轉(zhuǎn)錄激活和抑制[7],CHD4可能對于T-ALL 的發(fā)生發(fā)展很重要,但是具體的影響以及作用機(jī)制目前還不清楚。因此,本研究通過流式細(xì)胞技術(shù)檢測和CCK-8檢測探討干擾CHD4基因表達(dá)對T-ALL 細(xì)胞增殖和凋亡的影響,通過構(gòu)建人CHD4基因啟動子重組質(zhì)粒,進(jìn)一步探討CHD4基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控,為了解T-ALL的發(fā)病機(jī)制提供新視角。
T-ALL 細(xì)胞(Jurkat)和人胚胎腎T 細(xì)胞(HEK 293T)均購于中國科學(xué)院上海細(xì)胞庫。pGL3-Basic、內(nèi)參報告基因質(zhì)粒pRL-TK由本實(shí)驗(yàn)室保存。基因組DNA 提取試劑盒、感受態(tài)大腸埃希菌(北京天根公司)。DMEM 培養(yǎng)基、RPMI-1640 培養(yǎng)基、青霉素和鏈霉素(Multicell公司,美國),進(jìn)口胎牛血清(Scien Cell公司,美國);細(xì)胞凋亡檢測試劑盒(杭州聯(lián)科生物公司),細(xì)胞周期檢測試劑盒、CCK-8 檢測試劑盒(南京福麥斯公司);流式細(xì)胞儀(BD Biosciences公司,美國);限制性內(nèi)切酶KpnⅠ、BglⅡ、T4 DNA連接酶(Thermo Fisher 公司,德國);rTaq DNA 聚合酶、DNA 聚合酶TaKaRa LA Taq and GC buffer、雙熒光素酶報告檢測試劑盒、實(shí)時定量PCR試劑盒(TaKa-Ra公司,日本);5000 DNA標(biāo)準(zhǔn)參照物、2000 DNA標(biāo)準(zhǔn)參照物、核心啟動子區(qū)NF-κB轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)突變質(zhì)粒pGL-mNF-κB(北京擎科公司),NF-κB 表達(dá)質(zhì)粒pcDNA3-NF-κB(吉凱基因);質(zhì)粒提取試劑盒、切膠回收試劑盒(Omega 公司,美國),TRIzol、LipofectamineTM3000(Invitrogen 公司,美國);雙熒光素酶報告分析系統(tǒng)(Promega 公司,美國);CHD4、GAPDH 和NF-κB 兔單克隆抗體(Abcam 公司,美國);ECL 化學(xué)發(fā)光試劑盒(Biosharp 公司,美國),PVDF(聚偏氟乙烯)膜(GE Healthcare 公司,美國);EZ-Magna CHIP tm A試劑盒(Millipore公司,美國)。
1.2.1 細(xì)胞培養(yǎng)
Jurkat 細(xì)胞用RPMI 1640 培養(yǎng)基,HEK293T 細(xì)胞用DMEM 培養(yǎng)基培養(yǎng),兩種培養(yǎng)基均含有10%的胎牛血清(fetal bovine serum,F(xiàn)BS)以及1%青霉素(100 U/mL)-鏈霉素(100 mg/mL)溶液。兩種細(xì)胞均置于具有一定濕度、37 ℃、5% CO2的細(xì)胞培養(yǎng)箱中。所有實(shí)驗(yàn)均在細(xì)胞生長對數(shù)期進(jìn)行。
1.2.2 流式細(xì)胞技術(shù)
流式細(xì)胞術(shù)檢測Jurkat 細(xì)胞凋亡百分率。經(jīng)qRT-PCR 分析確定siRNA-CHD4 轉(zhuǎn)染Jurkat 細(xì)胞24 h 后敲低效率最高,所以轉(zhuǎn)染24后收集細(xì)胞,PBS洗滌3 次,加入V-APC 和7-AAD 各5 μL,室溫避光15 min,使用流式細(xì)胞儀檢測。細(xì)胞周期檢測:采用細(xì)胞周期檢測試劑盒,細(xì)胞轉(zhuǎn)染siRNA-CHD4 24 h后收集,95%乙醇4 ℃固定過夜,PBS洗滌3次,PI染色,37 ℃水浴30 min,流式細(xì)胞儀檢測。
1.2.3 CCK-8增殖分析
將Jurkat 細(xì)胞以4×103個/孔鋪于96 孔板,每組5 個復(fù)孔,加10 μL CCK-8 試劑,在5%CO2、37 ℃條件下孵育2 h后用酶標(biāo)儀測量每個孔在450 nm波長下的吸光度值,相同條件下連續(xù)測量4 d。
1.2.4 CHD4基因候選啟動子區(qū)生物信息學(xué)分析及克隆
CHD4 基因候選啟動子區(qū)生物信息學(xué)分析:從NCBI 數(shù)據(jù)庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/)GenBank 中獲取人CHD4 基因序列(編號:NC_000012.12)。利用UCSC 網(wǎng)站(http://genome.ucsc.edu/)進(jìn)行對比,取轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游2 000 bp,下游100 bp 通過Neural Network Promoter Prediction(http://fruitfly.org/cgi bin/seq_tools/promoter.pl)進(jìn)行預(yù)測;再使用JASPAR(jaspar.genereg.net/)數(shù)據(jù)庫5.0版對CHD4基因核心啟動子的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測。
引物設(shè)計:以預(yù)測的CHD4 基因候選啟動子序列為模板,用Prime5.0設(shè)計引物,再對該區(qū)域5′側(cè)翼區(qū)截短序列設(shè)計引物。上下游引物5′端分別加入限制性內(nèi)切酶KpnⅠ和BglⅡ的酶切位點(diǎn)及保護(hù)堿基。共用下游引物:5′-GGAAGATCTGAGGGGCGTCTCTTTG-3′。上游引物分別是P1(pGL-1974/+117):5′-CGGGGTACCAGTATCATCTTCCAGCCTCTAGA-3′;P2(pGL-918/+117):5′-CGGGGTACCTGTGGGGCGACAGTAGGG-3′;P3(pGL-428/+117):5′-CGGGGTACCAGGGTTAGTTGCAAAAGGTCTG-3′;P4(pGL-233/+117):5′-CGGGGTACCTGCCCAGGTGACGCGCGCGC-3′;P5(pGL-13/+117):5′-CGGGGTACCGCCGGAGCCATTTTCCCC-3′(下劃線部分為限制性酶切位點(diǎn),斜體部分為保護(hù)堿基)。引物合成由上海英駿公司完成。
Jurkat細(xì)胞全基因組DNA提?。篔urkat細(xì)胞全基因組DNA 提取按照基因組DNA 提取試劑盒的說明書操作。
質(zhì)粒構(gòu)建:以Jurkat細(xì)胞全基因組DNA為模板,根據(jù)TaKaRa LA TaqandGC buffer 催化酶說明書條件進(jìn)行催化擴(kuò)增,條件如下:94 ℃1 min;94 ℃30 s,60 ℃30 s,72 ℃2 min,30個循環(huán)。用1%的瓊脂糖凝膠對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行電泳檢測。切膠回收試劑盒回收瓊脂糖電泳產(chǎn)物。回收產(chǎn)物與pGL3-Basic 載體均用限制性內(nèi)切酶KpnⅠ、BglⅡ在37 ℃水浴條件下進(jìn)行雙酶切1 h,酶切產(chǎn)物用切膠回收純化試劑盒純化,純化產(chǎn)物用T4 DNA連接酶在37 ℃水浴中連接30 min。將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α中,轉(zhuǎn)化條件為4 ℃3 min,42 ℃水浴1 min 20 s,4 ℃30 min。取轉(zhuǎn)化好的菌液加入1 mL不含氨芐青霉素的LB培養(yǎng)液,置于37 ℃搖床倒置擴(kuò)增1 h,將擴(kuò)增好的菌液涂于含有氨芐青霉素的固體LB 培養(yǎng)板,于37 ℃、5%CO2培養(yǎng)箱中倒置培養(yǎng)過夜。在長出菌落的LB板上挑取單克隆菌落,加入含有氨芐青霉素的LB培養(yǎng)液中,37 ℃搖床倒置擴(kuò)增3 h,以擴(kuò)增后的菌液為模板進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,PCR 反應(yīng)條件同前。用1%瓊脂糖凝膠對PCR 產(chǎn)物電泳30 min,選取陽性菌液進(jìn)行測序,將經(jīng)測序鑒定正確的菌液加入含氨芐青霉素的LB 培養(yǎng)液中于37 ℃搖床擴(kuò)增過夜,擴(kuò)增后的菌液用質(zhì)粒提取試劑盒提取含有目的片段的質(zhì)粒標(biāo)記為P1(pGL-1974/+117)。以構(gòu)建成功的質(zhì)粒序列為模板,共用同一下游引物,上游引物分別為P2~P5 進(jìn)行PCR,構(gòu)建CHD4 基因候選啟動子區(qū)5′側(cè)翼區(qū)截短序列質(zhì)粒,方法同上。
1.2.5 基因敲低分析
雙鏈siRNA的設(shè)計與合成由廣州銳博生物科技有限公司完成,siRNA 序列和陰性對照序列如下:siRNA-CHD4:5′-GCATGTCCTTACTAGAATT-3′(正義鏈),5′-TAATTCTAGTAAGGACATGC-3′(反義鏈);siRNA-NF-κB:5′-GCACCTAGCTGCCAAAGAA-3′(正義鏈),5′-TTCTTTGGCAGCTAGGTGC-3′(反義鏈);陰性對照:5′-UUCUCCGAACGUGUCACGUTT-3′(正義鏈),5′-ACGUGACACGUUCGGAGAATT-3′(反義鏈)。
1.2.6 瞬時轉(zhuǎn)染
Jurkat 細(xì)胞以2×105個/孔鋪12 孔板,12 h 后以500 ng/mL siRNA或表達(dá)質(zhì)粒轉(zhuǎn)染細(xì)胞,轉(zhuǎn)染24 h后收取RNA,48 h后收取蛋白質(zhì)。啟動子雙熒光素酶檢測,轉(zhuǎn)染前18 h將生長狀態(tài)良好的細(xì)胞置于96孔板(1×104個/孔),使用LipofectamineTM3000將100 ng CHD4 啟動子熒光素酶報告質(zhì)粒和4 ng pRL-TK 質(zhì)粒共同轉(zhuǎn)染細(xì)胞。18 h后采用雙熒光素酶報告基因檢測系統(tǒng)檢測啟動子活性。
1.2.7 免疫印跡法(Western blot)
用8%~12%的SDS-PAGE 電泳分離總蛋白,在轉(zhuǎn)移緩沖液中將樣品電轉(zhuǎn)移到PVDF(聚偏氟乙烯)膜上。用5%脫脂牛奶在室溫下封閉PVDF 膜2 h,CHD4、GAPDH、NF-κB 抗體在搖床上孵育目的條帶4 ℃過夜。TBST緩沖液充分洗滌條帶3次,將這些條帶與相應(yīng)的二抗在室溫下孵育2 h,TBST緩沖液充分洗滌條帶3次后用電化學(xué)發(fā)光檢測系統(tǒng)觀察條帶。
1.2.8 實(shí)時定量聚合酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR)
用TRIzol 法提取總RNA,用Prime Script RT Master Mix Perfect Real Time Kit 系列逆轉(zhuǎn)錄試劑將RNA 逆轉(zhuǎn)錄為cDNA,以該cDNA 為擴(kuò)增模板,用實(shí)時定量PCR試劑盒進(jìn)行qRT-PCR擴(kuò)增。引物序列:GAPDH 5′-GATCATCAGCAATGCCTCCT-3′(正義鏈),5′-TGAGTCCTTCCACGATACCA-3′(反義鏈);CHD4 5′-CAAAATGGCGGGAGTTCAGTA-3′(正義鏈),5′-CTCTCCACCACAGCTACCG-3′(反義鏈);NF-κB 5′-AACAGAGAGGATTTCGTTTCCG-3′(正義鏈),5′-TTTGACCTGAGGGTAAGACTTCT-3′(反義鏈)。qRT-PCR擴(kuò)增條件:94 ℃預(yù)變性5 min;90 ℃變性15 s,60 ℃退火15 s,72 ℃延伸1 min,循環(huán)40 次;72 ℃延伸5 min。反應(yīng)儀器為Step One Plus Quantitative Realtime PCR System。記錄各反應(yīng)孔對應(yīng)Ct值以計算mRNA 相對表達(dá)量。內(nèi)參基因?yàn)镚APDH,目的基因?yàn)槿薈HD4,CHD4 mRNA 的相對表達(dá)量(2-ΔΔCt)=CHD4 mRNA 拷貝數(shù)/GAPDH mRNA 拷貝數(shù);ΔΔCt=(Ct刺激組CHD4-Ct刺激組GAPDH)-(Ct對照組CHD4-Ct對照組GAPDH)。設(shè)對照組mRNA 相對表達(dá)量為1。
1.2.9 雙熒光素酶活性測定
收集96 孔培養(yǎng)板中的細(xì)胞,棄去原培養(yǎng)基,用1×PBS洗滌3次,棄去PBS加入1×裂解緩沖液,室溫振蕩30 min 充分裂解細(xì)胞。按照雙熒光素酶活性檢測試劑盒說明書,每孔取20 μL裂解液,分別加入20 μL底物緩沖液和20 μL終止緩沖液,混合后分別測定螢火蟲熒光值和海腎熒光值。
1.2.10 CHIP實(shí)驗(yàn)檢測
使用EZ-Magna CHIP tm A 試劑盒,根據(jù)其說明書進(jìn)行分析。將1×107個Jurkat細(xì)胞在1%甲醛中室溫固定10 min,超聲檢測細(xì)胞裂解產(chǎn)物,產(chǎn)生200~1 000 bp 的DNA 片段。然后用anti-IgG 抗體、anti-NF-κB 抗體(Abcam ab194729)和anti-acetyl 組蛋白H3抗體進(jìn)行免疫沉淀反應(yīng)。經(jīng)反向交聯(lián)和DNA純化后,使用SYBR Green 進(jìn)行qRT-PCR 分析。引物如下:上游引物5′-GGGTTGGAGTTGGTTGAGGT-3′,下游引物5′-GGGTTGGAGTTGGTTGAGGT-3′。qRT-PCR擴(kuò)增條件:94 ℃預(yù)變性5 min;90℃變性15 s,60 ℃退火15 s,72 ℃延伸1 min,循環(huán)40次;72 ℃延伸5 min。反應(yīng)儀器為Step One Plus Quantitative Realtime PCR System。記錄各反應(yīng)孔對應(yīng)Ct值以計算mRNA 相對表達(dá)量。用rTaq DNA 聚合酶進(jìn)行PCR反應(yīng)。反應(yīng)條件:94 ℃變性3 min;94 ℃30 s,58 ℃30 s,72 ℃30 s,熱循環(huán)35 次;最后72 ℃延伸5 min。取PCR 產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳鑒定。
對實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)應(yīng)用Graphpad Prism7.0 和SPSS 軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,實(shí)驗(yàn)結(jié)果以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差()表示,多組比較采用單因素方差分析,組間兩兩比較采用SNK法。P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
通過qRT-PCR 和Western blot 檢測siRNACHD4的敲低效率。CCK-8實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)CHD4對Jurkat細(xì)胞的增殖有促進(jìn)作用。流式細(xì)胞術(shù)檢測,與對照組相比,轉(zhuǎn)染siRNA-CHD4 的Jurkat 細(xì)胞凋亡率(55%~60%)明顯上升。說明CHD4對Jurkat細(xì)胞的凋亡具有抑制作用。與對照組比較,轉(zhuǎn)染siRNACHD4 的Jurkat 細(xì)胞G0/G1 期比例顯著升高,而S 期比例下降7%~10%(圖1)。
首先在NCBI 網(wǎng)站及UCSC 網(wǎng)站比對確認(rèn)CHD基因的啟動子區(qū)域。運(yùn)用Promoter 2.0 Prediction Serve(http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/)預(yù)測轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游約2 000 bp、下游100 bp區(qū)域,結(jié)果表明該區(qū)域具有啟動子活性,再通過Neural Network Promoter Prediction(http://fruitfly.org/cgibin/seq_tools/promoter.pl)對該區(qū)域進(jìn)行預(yù)測(圖2)。
CHD4基因預(yù)測啟動子經(jīng)PCR擴(kuò)增,產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳顯示有特異性條帶出現(xiàn),長度為2 091 bp,與預(yù)測片段大小相符(圖3)。
各截短序列質(zhì)粒經(jīng)KpnⅠ、BglⅡ酶切,可見pGL3-Basic載體片段(4 818 bp)和長度分別為2 091、1 035、546、350、130 bp的序列片段(圖4)。
在HEK293T 細(xì)胞和Jurkat 細(xì)胞中進(jìn)行熒光素酶檢測,發(fā)現(xiàn)與陰性對照質(zhì)粒pGL-3Basic相比,重組質(zhì)粒P1(pGL-1947/+117)的熒光素酶相對活性明顯增高,P1~P4的活性無明顯差異(P>0.05),P5(pGL-13/+117)與其他截短節(jié)段質(zhì)粒相比,啟動子活性明顯降低(P<0.05),與陰性對照pGL-3Basic相近。因此認(rèn)為,CHD4基因啟動子最小活性區(qū)域位于其5′側(cè)翼區(qū)的-233 bp至-13 bp(圖5)。
圖1 人CHD4基因促進(jìn)Jurkat細(xì)胞的增殖及抑制其凋亡Figure 1 CHD4 induces proliferation and inhibits apoptosis in Jurkat cells
圖2 生物信息學(xué)分析人CHD4基因候選啟動子區(qū)域Figure 2 Analysis of candidate promoter region of human CHD4 gene
圖3 人CHD4基因候選啟動子區(qū)擴(kuò)增Figure 3 Amplification of the candidate promoter region of human CHD4 gene
使用JASPAR(jaspar.genereg.net/)數(shù)據(jù)庫5.0版,發(fā)現(xiàn)在-233~-13 bp之間存在NF-κB、MZF1等轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)(圖6)。
為進(jìn)一步確定轉(zhuǎn)錄因子NF-κB 與CHD4 啟動子區(qū)是否可以結(jié)合,進(jìn)行了染色質(zhì)免疫沉淀實(shí)驗(yàn)(CHIP),根據(jù)啟動子區(qū)的NF-κB 結(jié)合位點(diǎn),設(shè)計了相應(yīng)的引物。PCR 證實(shí)NF-κB 結(jié)合的基因組DNA包含CHD4 啟動子區(qū)的NF-κB 結(jié)合位點(diǎn)區(qū)域。因此,在Jurkat 細(xì)胞中,轉(zhuǎn)錄因子NF-κB 能與人CHD4基因啟動子結(jié)合(圖7)。
圖4 人CHD4基因候選啟動子區(qū)5′側(cè)翼區(qū)截短序列質(zhì)粒雙酶切鑒定Figure 4 Identification of the 5′ flanking region of the candidate promoter region of human CHD4 gene in luciferase report gene recombinant plasmid by double enzyme digestion
首先用siRNA-NF-κB和pcDNA3-NF-κB分別轉(zhuǎn)染Jurkat 細(xì)胞,分析其轉(zhuǎn)染效率。用結(jié)合位點(diǎn)突變質(zhì)粒、siRNA-NF-κB 和pcDNA3-NF-κB 分別瞬時轉(zhuǎn)染Jurkat細(xì)胞。檢測其熒光素酶活性,發(fā)現(xiàn)抑制NFκB 后,CHD4 基因的啟動子活性下降;反之,當(dāng)過表達(dá)NF-κB 時,CHD4 基因的啟動子活性明顯增加。同時,與野生型相比,轉(zhuǎn)染含有轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)突變序列的質(zhì)粒后,CHD4 基因啟動子活性明顯下降,這些結(jié)果說明人類CHD4基因啟動子活性受NFκB的正向調(diào)控(圖8)。
圖5 人CHD4基因候選啟動子區(qū)活性檢測Figure 5 Relative luciferase activities of candidate plasmids of CHD4 promote
圖6 人CHD4基因啟動子核心區(qū)域轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)Figure 6 Putative consensus binding sites of transcription factors in CHD4 promote
T-ALL的發(fā)生和發(fā)展是一個多基因突變的多階段過程,其中最顯著的變化之一是對細(xì)胞凋亡的抑制。雖然已經(jīng)在誘導(dǎo)白血病細(xì)胞分化和促進(jìn)其凋亡方面做了很多努力,但是治愈率并沒有顯著提高[8]。CHD4是NuRD的核心亞基,參與許多疾病的發(fā)展和進(jìn)展,包括腫瘤發(fā)生、病毒感染、神經(jīng)退行性變等,但其在這些疾病中的作用尚未完全了解[5,9]。在某些情況下,它通過對抗染色質(zhì)重構(gòu)來對抗轉(zhuǎn)錄活性因子[6,10]。在某些條件下CHD4可以促進(jìn)轉(zhuǎn)錄,與促癌功能相關(guān)[11]。鑒于這些調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄活性的特點(diǎn),我們猜測CHD4可能與T-ALL細(xì)胞凋亡有關(guān)。
圖7 NF-κB與CHD4基因啟動子區(qū)最小活性區(qū)域結(jié)合Figure 7 NF-κB binds to the minimal promoter of CHD4 in vivo
CCK-8 檢測、流式細(xì)胞計數(shù)檢測發(fā)現(xiàn)CHD4 可以促進(jìn)Jurkat細(xì)胞的增殖,抑制其凋亡,與之前的一些研究結(jié)果一致,異常表達(dá)的CHD4 在T-ALL 中起著原癌基因的作用[12]?;虻霓D(zhuǎn)錄調(diào)控是由啟動子決定的。啟動子通過與一些蛋白質(zhì)結(jié)合來決定基因的活性,這些蛋白質(zhì)被稱為影響基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子?;騿幼硬糠值母淖儗?dǎo)致基因表達(dá)調(diào)控紊亂,常導(dǎo)致惡性腫瘤的發(fā)生[13-14]。因此,本研究分析了CHD4基因啟動子區(qū)域,以更好地理解CHD4在T-ALL 中的內(nèi)在機(jī)制。本研究克隆了其啟動子,分析了Jurkat 和HEK293T 細(xì)胞的啟動子區(qū)域結(jié)構(gòu)和啟動子活性。通過產(chǎn)生一系列5′缺失質(zhì)粒,確定了核心啟動子相對于TSS 位于-233/-13 bp 區(qū)域。為進(jìn)一步分析CHD4基因啟動子最小活性區(qū)域內(nèi)重要的調(diào)控元件,本研究通過轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測,發(fā)現(xiàn)NF-κB、MZF1 等轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)。NFκB在多種信號通路中與腫瘤發(fā)生和發(fā)展有關(guān),其中細(xì)胞增殖和凋亡的信號通路被認(rèn)為是最重要的通路之一[15]。已有研究表明,NF-κB 與成人T-ALL 細(xì)胞的激活有關(guān)[16]。因此,本研究進(jìn)一步通過點(diǎn)突變技術(shù)分析CHD4 啟動子區(qū)的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn),證實(shí)NF-κB對CHD4基因的啟動子活性具有正向調(diào)控作用;通過熒光素酶測試發(fā)現(xiàn)NF-κB 表達(dá)降低時,人CHD4 啟動子活性降低,而NF-κB 表達(dá)增高時,CHD4啟動子活性明顯增高。染色質(zhì)共沉淀試驗(yàn)發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄因子NF-κB 與CHD4 基因啟動子相結(jié)合,進(jìn)一步分析了CHD4 基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的分子機(jī)制,為進(jìn)一步研究T-ALL提供了新方向。
圖8 NF-κB對人CHD4基因的啟動子活性具有正向調(diào)控作用Figure 8 NF-κB positively regulates the promoter activity of CHD4