趙燕燕,劉勇,李乾
[1.空軍特色醫(yī)學(xué)中心(原空軍總醫(yī)院)眼科,北京 100142;2.國(guó)家衛(wèi)生健康委科學(xué)技術(shù)研究所,北京 100081]
青光眼是一組復(fù)雜的慢性進(jìn)行性視神經(jīng)損害性疾病,臨床特點(diǎn)為眼壓升高、視盤(pán)凹陷和萎縮、視野缺損,是目前全球視力損害和致盲的第二大疾病。原發(fā)性開(kāi)角型青光眼(primary openangle glaucoma,POAG)是青光眼的主要類(lèi)型之一,有青光眼家族史的患者發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)比普通人群高7~10倍。POAG的發(fā)病機(jī)制目前尚不清楚,遺傳因素和環(huán)境因素均可影響該病的發(fā)生,而遺傳因素是POAG的主要因素。目前已發(fā)現(xiàn)與POAG相關(guān)的基因突變位點(diǎn)至少有20個(gè)。全外顯子測(cè)序技術(shù)具有快速準(zhǔn)確、高通量及高速度等特點(diǎn),被越來(lái)越多地應(yīng)用于臨床基因篩查和診斷中。本研究對(duì)1個(gè)POAG家系患者進(jìn)行臨床表型的研究,并應(yīng)用全外顯子測(cè)序技術(shù)對(duì)致病基因進(jìn)行了篩查,現(xiàn)報(bào)告如下。
選擇2017年在空軍特色醫(yī)學(xué)中心(原空軍總醫(yī)院)就診的1例POAG患者,通過(guò)詳細(xì)詢問(wèn)及遺傳學(xué)調(diào)查,分析其家系遺傳特征,繪制系譜圖。對(duì)該患者及其可獲得的家系成員進(jìn)行全面的眼科檢查,包括視力、最佳矯正視力、眼壓(Goldman非接觸眼壓計(jì))、裂隙燈顯微鏡、眼底檢查、前房角鏡、視野(Humphrey自動(dòng)視野計(jì))、相干光斷層掃描檢查。POAG診斷標(biāo)準(zhǔn)(參照中華醫(yī)學(xué)會(huì)青光眼學(xué)組推薦標(biāo)準(zhǔn)):1)兩眼中至少1只眼眼壓持續(xù)>21 mmHg(1 mmHg=0.133 kPa);2)前房角鏡檢測(cè)為開(kāi)角;3)眼底存在青光眼特征性視網(wǎng)膜視神經(jīng)損害和視野損害;4)沒(méi)有與眼壓升高相關(guān)的病因性眼部或全身其他異常。
1.2.1 DNA提取
抽取各受試者外周血5 mL,進(jìn)行EDTA抗凝,于-20 ℃冰箱中保存。采用全血基因組DNA提取試劑盒提取DNA。本研究經(jīng)空軍特色醫(yī)學(xué)中心(原空軍總醫(yī)院)醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)審核批準(zhǔn),受試者均簽署知情同意書(shū),并遵循赫爾辛基宣言涉及人類(lèi)受試者的醫(yī)學(xué)倫理學(xué)原則。
1.2.2 全外顯子測(cè)序
基因組DNA送北京貝瑞和康生物有限公司,進(jìn)行人類(lèi)全基因組外顯子高通量基因測(cè)序。測(cè)序原始數(shù)據(jù)凈質(zhì)量控制后,應(yīng)用BWA軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行比對(duì),采用GATK和VarScan軟件對(duì)單個(gè)核苷酸多態(tài)位點(diǎn)、小的缺失和插入進(jìn)行分析,應(yīng)用dbSNP數(shù)據(jù)庫(kù)、HapMap數(shù)據(jù)庫(kù)、ExAC數(shù)據(jù)庫(kù)、千人基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(1 000 g)及100名正常對(duì)照人群SNP數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行過(guò)濾,將突變頻率<0.01的變異視為可疑變異,應(yīng)用Polyphen-2和SIFT軟件對(duì)可疑突變進(jìn)行致病性預(yù)測(cè),同時(shí)使用基因突變相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)HGMD和Clinvar進(jìn)一步對(duì)可疑致病位點(diǎn)進(jìn)行確認(rèn),找出致病位點(diǎn)肌纖蛋白(myocilin,MYOC)基因的c.754G>A。
1.2.3 Sanger測(cè)序驗(yàn)證
根據(jù)全外顯子測(cè)序結(jié)果,采用Sanger測(cè)序?qū)ο茸C者及其家系成員進(jìn)行突變結(jié)果驗(yàn)證。針對(duì)MYOC基因的c.754G>A突變,應(yīng)用Primer3軟件設(shè)計(jì)引物,并合成基因引物。
1.2.4 PCR擴(kuò)增目標(biāo)片段
采用聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)擴(kuò)增DNA,擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后,將產(chǎn)物進(jìn)行純化,應(yīng)用美國(guó)ABI公司的3730xl型測(cè)序儀進(jìn)行測(cè)序。測(cè)序結(jié)果與GenBank中的MYOC基因第3外顯子正常序列(GenBank NM_000261)進(jìn)行BLAST比對(duì),記錄對(duì)比結(jié)果。
患者,女,39歲,反復(fù)頭疼17年,2017年5月23日于空軍特色醫(yī)學(xué)中心(原空軍總醫(yī)院)眼科首診。體格檢查:右眼視力1.2,左眼視力1.2;右眼眼壓21.5 mmHg,左眼眼壓25.7 mmHg。雙角膜透明,前房中深,晶體透明,瞳孔對(duì)光反射靈敏,眼底見(jiàn)視盤(pán)界清,色正,C/D 0.8~0.9,視網(wǎng)膜血管走形比例可,黃斑中反清晰。房角鏡檢查:雙眼360°寬角,無(wú)房角粘連和房角發(fā)育異常。動(dòng)態(tài)視野:右眼鼻下與生理盲點(diǎn)相連的視野缺損,左眼顳側(cè)和鼻下視野缺損。視盤(pán)光學(xué)相干斷層掃描(optical coherence tomography,OCT):右眼上方神經(jīng)纖維層變薄,左眼鼻側(cè)和上方神經(jīng)纖維層變薄。視神經(jīng)纖維變薄區(qū)與視野缺損區(qū)相對(duì)應(yīng)(圖1)。24 h眼壓監(jiān)測(cè)陽(yáng)性(最低:右眼10.3 mmHg,左眼11.7 mmHg;最高:右眼29.3 mmHg,左眼31 mmHg;壓差:右眼19 mmHg,左眼19.3 mmHg)。臨床診斷:雙眼POAG。給予“曲伏前列腺素滴眼液,點(diǎn)雙眼,每晚1次;卡替洛爾滴眼液,點(diǎn)雙眼,每日2次”治療,定期復(fù)查眼壓均位于正常范圍,隨訪至2019年8月,視神經(jīng)纖維層輕度變薄,視野損害略有進(jìn)展(圖2,圖3)。
圖1 初次及末次就診時(shí)眼底像、視盤(pán)OCT及視野圖Figure 1 Optic disc appearance,optical coherence tomography and visual field findings of the proband at the initial and final visits
該家系4代共18人,其中POAG患者共8人,男3人,女5人。本家系連續(xù)4代發(fā)病,以垂直方式從一代傳到下一代連續(xù)傳遞,男女均發(fā)病,符合常染色體顯性遺傳方式(圖4)。該家系中,先證者之姐(III13,48歲)、母親(II5,73歲)、外祖母(I2),其母親的一個(gè)姐姐(II4,75歲),3個(gè)弟弟(II7,72歲;II8,70歲;II9,67歲)均患有POAG?;颊?III14)確診年齡為39歲,確診時(shí)視野已出現(xiàn)顯著損害,其姐姐(III13)42歲因頭疼就診,確診為POAG(晚期),行小梁切除手術(shù)治療,但目前(48歲)已致盲(管狀視野)。
圖2 視盤(pán)OCT示神經(jīng)纖維層厚度3年隨訪變化Figure 2 OCT revealing RNFL changes in 3-year follow-up
圖3 視野損害指數(shù)MD及PSD值3年隨訪變化Figure 3 Changes in MD and PSD in 3-year follow-up
圖4 該譜系中的主要個(gè)體Figure 4 Principal individuals from this pedigree
經(jīng)dbSNP137,ESP6500,千人基因組數(shù)據(jù)庫(kù),ExAC等數(shù)據(jù)庫(kù)的過(guò)濾篩選以后,在先證者1號(hào)染色體MYOC基因第3外顯子發(fā)現(xiàn)點(diǎn)突變c.754G>A,該突變?cè)斐傻鞍踪|(zhì)翻譯在252位氨基酸由甘氨酸變?yōu)榫彼?p.Gly252Arg)。該變異已被HGMD數(shù)據(jù)庫(kù)收錄,且Clin Var數(shù)據(jù)庫(kù)將其定義為致病性突變。Sanger測(cè)序驗(yàn)證先證者攜帶的MYOC基因c.754G>A(p.Gly252Arg)突變,在另外2個(gè)非患病家系成員(IV18,20歲;III11,50歲)中未發(fā)現(xiàn)該突變(圖5)。
圖5 先證者(III14)及其家族成員(IV18,III11)的測(cè)序結(jié)果Figure 5 Sequencing results in the proband (III14) and her family members (IV18,III11)
目前已發(fā)現(xiàn)與POAG相關(guān)的基因約20個(gè),MYOC基因是發(fā)現(xiàn)的第一個(gè)[1]、也是最常見(jiàn)的一個(gè)致病基因[2]。MYOC基因位于1號(hào)染色體lq21-31的GLClA位點(diǎn)[3],該基因編碼長(zhǎng)為504個(gè)氨基酸的一種多肽糖蛋白[4]。MYOC基因變異至少有270多種,超過(guò)半數(shù)的MYOC基因變異導(dǎo)致青光眼[5],MYOC基因突變占POAG患者的2%~4%[6]和J-POAG的22%~36%[7]。多數(shù)致病突變集聚在第3個(gè)外顯子上,較少位于第1、第2外顯子,啟動(dòng)子、內(nèi)含子1、內(nèi)含子2也有基因突變的報(bào)道[8]。MYOC普遍存在人的各種組織中,在眼組織特別是小梁、睫狀體中濃度較高[9],可能在細(xì)胞外基質(zhì)相互作用[10]、細(xì)胞遷移[11]、線粒體功能[12]方面發(fā)揮作用。變異型MYOC基因的產(chǎn)生改變了蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu),導(dǎo)致其功能受到影響[13],基因變異可以導(dǎo)致蛋白在小梁網(wǎng)表面的錯(cuò)誤折疊和積聚,導(dǎo)致不溶性蛋白在小梁網(wǎng)細(xì)胞中的聚集[14],致組織裂解或細(xì)胞死亡,引起細(xì)胞外基質(zhì)組成的改變[15],通過(guò)改變細(xì)胞骨架的性狀,影響小梁網(wǎng)細(xì)胞的正常功能,使房水流出通道受阻[16],眼壓升高最終誘導(dǎo)POAG的產(chǎn)生。Kalrali等[17]還發(fā)現(xiàn):MYOC在鞏膜篩板及視網(wǎng)膜的視神經(jīng)節(jié)細(xì)胞軸突及星狀膠質(zhì)細(xì)胞中都有表達(dá),因此還可能通過(guò)影響鞏膜篩板及視網(wǎng)膜的視神經(jīng)節(jié)細(xì)胞的功能和存活性,來(lái)促進(jìn)青光眼的發(fā)生。
本研究通過(guò)對(duì)1個(gè)POAG常染色體顯性遺傳家系研究,發(fā)現(xiàn)先證者攜帶MYOC基因的c.754G>A(p.Gly252Arg)突變,而在另外2個(gè)非患病家系成員中未發(fā)現(xiàn)該突變。c.754G>A位于MYOC基因第3外顯子,在以往的研究[6-7]中,正常人群均未發(fā)現(xiàn)該變異,因此被認(rèn)為是致病突變而非基因多態(tài)性。
c.754G>A(p.Gly252Arg)突變?cè)徽J(rèn)為與青少年起病的POAG(J-POAG)表型相關(guān)。該突變最先由Richards等[18]通過(guò)對(duì)一個(gè)美國(guó)的高加索人家系研究發(fā)現(xiàn);之后Booth等[19]報(bào)道了1個(gè)蘇格蘭人大家系;Willoughby等[20]報(bào)道了1個(gè)兩代的新加坡華人家系。但攜帶MYOC Gly252Arg基因突變的患者并非為青少年時(shí)發(fā)病,有1例日本裔患者于49歲時(shí)確診POAG。Hewitt等[21]報(bào)道了1個(gè)澳大利亞大家系,該家系患者平均確診年齡為31~60(46.3±11.4)歲。Booth等[19]通過(guò)房角鏡檢查,發(fā)現(xiàn)攜帶該突變的患者房角存在異常血管,即中胚層組織殘留,但Hewitt等[21]的研究并沒(méi)有類(lèi)似發(fā)現(xiàn),且家系的患者病情較輕,發(fā)病年齡明顯大于之前報(bào)道的家系患者[18-19],其原因可能為上述房角結(jié)構(gòu)的差異。
本研究首次在中國(guó)人POAG家系中發(fā)現(xiàn)MYOC基因的c.754G>A(p.Gly252Arg)突變,該家系患者年齡明顯大于之前報(bào)道的華人家系[20]的年齡??赡苡幸恍┪粗囊蛩?,如環(huán)境或表觀遺傳因素,導(dǎo)致了這種表型上的差異。本研究擴(kuò)展了中國(guó)人群POAG致病基因變異譜,研究結(jié)果為家系的遺傳診斷提供了實(shí)驗(yàn)依據(jù)。下一步擬進(jìn)一步擴(kuò)大篩查范圍,對(duì)可采集的所有家系成員均進(jìn)行基因突變的篩查工作,進(jìn)一步證實(shí)該變異位點(diǎn)的致病性。