于金玲,高蓓敏,沈衛(wèi)達(dá),崔 靜,王浩峰,朱江帆
(1.同濟(jì)大學(xué)附屬東方醫(yī)院普外科,上海 200120;2.上海市長(zhǎng)寧區(qū)婦幼保健院乳腺科,上海 200051)
目前,乳腺癌仍位居女性惡性癌腫發(fā)病首位[1]。三陰性乳腺癌(thriple?negative breast cancer,TNBC)是一種特殊類型的乳腺癌亞型,雌激素受體(estrogen receptor,ER)、孕激素受體(progesterone receptor,PR)及人表皮生長(zhǎng)因子受體(human epi?dermal growth factor receptor 2,HER2)表達(dá)均陰性,缺乏治療靶點(diǎn),容易復(fù)發(fā)及內(nèi)臟轉(zhuǎn)移,5年生存率不足 30%[2]。除化療外,尚缺乏其他有效治療措施。因此,迫切需要尋求新的靶標(biāo)治療分子[3]。環(huán)狀 RNAs(circRNAs)是一類特殊的非編碼RNA,具有高度穩(wěn)定性和組織特異性[4]。而微小RNA(miRNA)在真核細(xì)胞的基因表達(dá)、細(xì)胞發(fā)育分化等發(fā)揮重要的調(diào)控作用[5]。近期研究表明,circRNA 具有 miRNA 應(yīng)答元件(microRNA response elements,MREs),通 過(guò) 與 靶 miRNA 結(jié) 合,作 為miRNAs 海綿體,發(fā)揮競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑作用,調(diào)控相關(guān)RNA 的表達(dá)[6]。研究發(fā)現(xiàn),miR?182?5p 在 TNBC 中高表達(dá)可下調(diào)MTSS1 水平,促進(jìn)TNBC 轉(zhuǎn)移,并通過(guò)高通量測(cè)序發(fā)現(xiàn),hsa_circ_USP42 在 TNBC 中差異下調(diào)表達(dá);靶miRNA 預(yù)測(cè)軟件分析發(fā)現(xiàn),環(huán)狀RNA hsa_circ_USP42 在 371~377 堿基具有 miR?182?5p 可能的結(jié)合位點(diǎn)[7]。本研究通過(guò)分析 hsa_circ_USP42對(duì)TNBC 細(xì)胞株體外增殖、凋亡的影響,初步探討circ_USP42 靶向結(jié)合 miR?182?5p 在 TNBC 中發(fā)揮的相關(guān)分子機(jī)制。
本研究獲得上海長(zhǎng)寧區(qū)婦幼保健院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)(批準(zhǔn)號(hào) CNFBLLQKW?2016003)。收集完整的TNBC 患者臨床及病理資料,并收集石蠟包埋的癌及癌旁組織;納入患者共30 例,為2010年1月至2015年12月期間在上海市長(zhǎng)寧區(qū)婦幼保健院接受乳腺癌改良根治的患者。所有患者均獲得知情同意?;颊呋€資料:年齡 30 ~70 歲,平均(48.67±9.65)歲;絕經(jīng)18 例,未絕經(jīng)者12 例;淋巴結(jié)陰性患者9 例,淋巴結(jié)陽(yáng)性患者 21 例;腫瘤病理分期:Ⅰ期和Ⅱ期患者共24 例,Ⅲ期患者6 例。入選標(biāo)準(zhǔn):術(shù)前未接受過(guò)放療及化療,全部標(biāo)本經(jīng)兩位病理科副主任醫(yī)師讀片,組織病理學(xué)確診浸潤(rùn)性導(dǎo)管癌。有同側(cè)腋窩淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移1 枚以上或者腫瘤直徑>5 cm 者,術(shù)后給予放療。排除標(biāo)準(zhǔn):術(shù)前接受過(guò)放療及新輔助化療者;有遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移患者;特殊病理類型乳腺癌。
MDA?MB?231 細(xì)胞株購(gòu)于中國(guó)上海中科院細(xì)胞庫(kù);DMEM 培養(yǎng)基購(gòu)于 Gibco 公司(貨號(hào) 16000?044);LipofectAMINETM3000 購(gòu)于 Invitrogen 公司(貨號(hào) L3000015);CCK8 試劑購(gòu)于同仁化工研究所;RNA 反轉(zhuǎn)錄試劑盒購(gòu)于 TaKaRa 公司(貨號(hào)9109)。
CO2培養(yǎng)箱購(gòu)于 Thermo 公司(貨號(hào) 3111);熒光定量 PCR 儀購(gòu)自 ABI 公司(貨號(hào) ViiA7/7500);RT?PCR 反應(yīng)膜購(gòu)自ABI(貨號(hào)4311971);電熱恒溫水槽購(gòu)自精宏科技(貨號(hào)DK?8D);酶標(biāo)儀購(gòu)自TECAN 公司(M100 PRO);倒置顯微鏡購(gòu)于Olympus 公司(貨號(hào) IX73)。
構(gòu)建帶有目的基因 hsa_circ_0007823 circRNA至 psiCHECK2 載體和 pLCDH?ciR 載體中。將提取的質(zhì)粒 pUC57?hsa_circ_0007823 與載體 pLCDH?ciR分別通過(guò)EcoRI/BamHI 進(jìn)行雙酶切;轉(zhuǎn)化到大腸桿菌,小量提取質(zhì)粒,進(jìn)行酶切鑒定,選取酶切正確的質(zhì)粒進(jìn)行測(cè)序,將測(cè)序正確的質(zhì)粒進(jìn)行大量提取。
1.5.1 CCK8 實(shí)驗(yàn) 收集細(xì)胞,加入適量的新鮮完全培養(yǎng)液輕輕吹打細(xì)胞至均勻的細(xì)胞懸液,計(jì)數(shù),按1×104/孔的細(xì)胞密度將細(xì)胞懸液鋪于96 孔板中,四周用 100 μL PBS 填充。將鋪好的 96 孔板放于37 ℃、5% CO2培養(yǎng)箱培養(yǎng) 24 h。實(shí)驗(yàn)分為 2 組,空載轉(zhuǎn)染組和circRNA 過(guò)表達(dá)質(zhì)粒轉(zhuǎn)染組,每組6 復(fù)孔。將 96 板在 37 ℃、5%CO2培養(yǎng)箱孵育 48 h,孵育時(shí)間結(jié)束,每孔加入10 μL CCK8 溶液,將培養(yǎng)板在培養(yǎng)箱內(nèi)孵育2 h,用酶標(biāo)儀測(cè)定450 nm 吸光度(A450),繪制細(xì)胞活力曲線。
1.5.2 細(xì)胞遷移實(shí)驗(yàn) 細(xì)胞轉(zhuǎn)染質(zhì)粒24 h 后,棄去6 孔板原有培養(yǎng)基,加胰酶消化細(xì)胞,收集細(xì)胞并計(jì)數(shù),用0.1% BSA 培養(yǎng)基重懸,細(xì)胞密度為2×105/mL,取上述細(xì)胞懸液 200 μL 接種于 Transwell小室中,下室放置含2.5% FBS 的培養(yǎng)基,放置細(xì)胞培養(yǎng)箱,常規(guī)培養(yǎng)24 ~48 h 后取出,棄掉上清液,加入無(wú)菌PBS,洗2 次,室溫下用4%多聚甲醛固定10 min,然后棄除4%多聚甲醛,無(wú)菌PBS 洗2次,室溫下再用結(jié)晶紫染色20 min,用蒸餾水洗掉小室上多余的結(jié)晶紫,室溫干燥,倒置顯微鏡觀察細(xì)胞、計(jì)數(shù)并拍照。
1.5.3 細(xì)胞侵襲實(shí)驗(yàn) 將人工基質(zhì)膠(20 μg)包被于8 μm 孔徑的Transwell 侵襲小室聚碳酯微孔膜的上表面,置于37 ℃細(xì)胞培養(yǎng)箱中靜止30 min,使其聚成凝膠。收集轉(zhuǎn)染24 h 后的細(xì)胞,計(jì)數(shù),用0.1% FBS 的培養(yǎng)液制備成 1×106/mL 細(xì)胞懸液,在Transwell 上室中加入200 μL 細(xì)胞懸液,下室中加入 600 μL 含 10% FBS 的培養(yǎng)液,37 ℃、5% CO2細(xì)胞培養(yǎng)箱中靜止培養(yǎng)48 h 后取出Transwell 小室,PBS 潤(rùn)洗,用棉簽去除上室中的基質(zhì)膠和細(xì)胞,加入4%多聚甲醛固定30 min,PBS 潤(rùn)洗后,結(jié)晶紫室溫染色15 min,蒸餾水沖洗浸泡,顯微鏡下觀察拍照。
將 circRNA hsa_circ_USP42 與 hsa?miR?182?5p的結(jié)合位點(diǎn)前后200 bp 序列克隆構(gòu)建至報(bào)告基因載體psicheck2,同時(shí)合成上述預(yù)測(cè)到的miR?182?5p mimics。收集培養(yǎng)好的 293T 細(xì)胞,用無(wú) PS 的完全培養(yǎng)液重懸細(xì)胞,按每孔4×104個(gè)細(xì)胞,接種至24孔板中,放置細(xì)胞培養(yǎng)箱中靜置培養(yǎng)過(guò)夜。細(xì)胞換成無(wú)血清培養(yǎng)基 a(3 μL LipofectamineTM3000+25 μL無(wú)血清OMEM 培養(yǎng)液,室溫靜置5min)和無(wú)血清OMEM 培養(yǎng)基 b(100 nmol miRNA?182?5p mi?mics/mimic NC + 500 ng psicheck2 /psicheck2?ciicRN A+25 μL)室溫靜置 5 min。將上述中的 a 和 b 混合,室溫靜置20 min。加入制備的轉(zhuǎn)染混合液于細(xì)胞中。去細(xì)胞上清液,加入裂解液充分裂解細(xì)胞后,12 000×g離心 5 min,取上清液。加入 100 μL 螢火蟲螢光素酶檢測(cè)試劑,混勻后測(cè)定RLU(relative light unit)。以報(bào)告基因細(xì)胞裂解液為空白對(duì)照。
(1) 收集培養(yǎng)好的 TNBC 細(xì)胞 MDA?MB?231,過(guò)表達(dá)hsa_circ_USP42。取處理好的細(xì)胞,用 TRIzol試劑(大連寶生物工程有限公司)提取總RNA。以DEPC H2O 為對(duì)照測(cè)定 RNA 純度和定量,取 2 μL RNA 溶液,在酶標(biāo)儀上測(cè)定樣本的濃度和質(zhì)量。
(2) 用 PrimeScriptTMRT Master 試劑盒(日本TaKaRa 公司)按照說(shuō)明書對(duì)總RNA 進(jìn)行提取并反轉(zhuǎn)錄為 cDNA。qRT?PCR 在 Bio?Rad CFX96 系統(tǒng)(Bio?Rad 公 司) 上 使 用 TB GreenTMPremix Ex TaqTM(TAKARA 公司)進(jìn)行。GAPDH 用作定量circRNA 和 mRNA 的內(nèi)部參考,U6 作為 miRNA 的內(nèi)部參考。結(jié)果與計(jì)算:各樣品的目標(biāo)RNA 和內(nèi)參分別進(jìn)行 real?time PCR 反應(yīng)?;虻南鄬?duì)表達(dá)數(shù)據(jù)采用2-ΔΔCt法進(jìn)行分析。引物及序列見(jiàn)表1。
表1 各基因的引物及引物序列Tab.1 Primers sequences of each gene
RIPA 裂解液裂解細(xì)胞,置于冰上放置30 min,4 ℃,12 000×g離心 10 min,取上清液。使用 BCA試劑盒(Thermo Fisher Scientific 公司)測(cè)定蛋白濃度。將蛋白液與loading buffer 混勻,放入100 ℃水浴6 min。離心,放置冰上,配制 SDS?PAGE 分離膠。將等量的蛋白加載到凝膠上,電泳后使用轉(zhuǎn)膜儀將蛋白轉(zhuǎn)移到PVDF 膜上,然后用5%脫脂牛奶在37 ℃封閉 2 h。P 孵育一抗,內(nèi)參(1 ∶5 000),目的蛋白(均按1 ∶1 000稀釋),4 ℃,過(guò)夜。孵育二抗(1 ∶5 000),37 ℃,2 h?;瘜W(xué)發(fā)光顯影(Millipore ECL 發(fā)光液),記錄并拍照。
采用GraphPad Prism 7.0 軟件作圖。采用SPSS 19.0 軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。定量資料用±s表示(符合正態(tài)分布)或者中位數(shù)與四分位數(shù)間距(不符合正態(tài)分布)的形式表示。組間均值比較使用t檢驗(yàn)。P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
qPCR 結(jié)果顯示,TNBC 癌組織中 circRNA USP42 相對(duì)定量(5.969±3.076)低于癌旁組織(20.284±5.444),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=-16.469,P=0.000),見(jiàn)圖1。circRNA USP42 在淋巴結(jié)陽(yáng)性組表達(dá)(3.575±1.612)低于淋巴結(jié)陰性組(6.995±2.999),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=4.039,P=0.003)。
過(guò)表達(dá)質(zhì)粒 circRNA hsa_circ_USP42 的細(xì)胞遷移數(shù)量減少(P=0.028),過(guò)表達(dá)質(zhì)粒 circRNA hsa_circ_USP42 的細(xì)胞侵襲數(shù)量減少(P<0.000 1),見(jiàn)圖1。
圖1 circ_USP42 過(guò)表達(dá)對(duì)TNBC 細(xì)胞遷移及侵襲的影響Fig.1 Effects of circ_USP42 expression on cell migration and invasion of TNBC cells
CCK?8 檢測(cè)結(jié)果顯示,過(guò)表達(dá)質(zhì)粒circRNA hsa_circ_USP42 的細(xì)胞活力水平降低(P=0.000 8),見(jiàn)圖2。
通過(guò)網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù),預(yù)測(cè)環(huán)狀 RNA hsa_circ_USP42 在 371~377 片段有 hsa?miR?182?5p 靶結(jié)合點(diǎn)。熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)發(fā)現(xiàn),將質(zhì)粒circRNA hsa_circ_USP42 與 miR?182?5p mimics 共轉(zhuǎn)染至TNBC 細(xì)胞系 MDA?MB?231,熒光素酶活性降低,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.000 1)表明 circRNA circ_USP42 與 miR?182?5p 為有效結(jié)合,見(jiàn)圖3。
圖2 hsa_circ_USP42 過(guò)表達(dá)對(duì) TNBC 細(xì)胞株增殖的影響Fig.2 Effects of hsa_circ_USP42 expression on cell proliferation of TNBC cells
圖3 熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)結(jié)果Fig.3 The results of luciferase report assay
在 MDA?MB?231 中過(guò)表達(dá)環(huán)狀 RNA hsa_circ_USP42,qPCR 驗(yàn)證 miR?182 及 MTSS1 靶基因表達(dá)水平,Western 印跡法檢測(cè)MTSS1 的蛋白表達(dá)水平。qPCR 結(jié)果表明,與對(duì)照組比較,過(guò)表達(dá)質(zhì)粒circRNA hsa_circ_USP42 轉(zhuǎn)染細(xì)胞后,circRNA hsa_circ_USP42 的表達(dá)水平升高(P=0.002 2);miR?182?5p 的表達(dá)水平降低(P=0.036),MTSS1 的表達(dá)水平升高(P=0.001 7),差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,見(jiàn)圖4。
Western 印跡法檢測(cè)結(jié)果顯示,過(guò)表達(dá)質(zhì)粒circRNA hsa_circ_USP42 細(xì)胞的 MTSS1 蛋白表達(dá)水平升高,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.035 4),見(jiàn)圖5。
圖4 hsa_circ_USP42 過(guò)表達(dá)后 miR?182?5p 及 MTSS1mRNA 水平變化Fig.4 The expression of miR?182?5p and MTSS1 mRNA in hsa_circ_USP42 overexpression cells
圖5 hsa_circ_USP42 過(guò)表達(dá)后 MTSS1 蛋白水平變化及灰度分析Fig.5 The expression of MTSS1 protein and gray value in hsa_circ_USP42 overexpression cells
TNBC 是一類具有高度異質(zhì)性的乳腺癌,嚴(yán)重危害女性健康。15%~20%的乳腺癌患者為TNBC[8]。在過(guò)去的幾十年中,乳腺癌治療取得了顯著進(jìn)展,總體死亡率下降。然而,TNBC 病理組織學(xué)分級(jí)差,腫瘤侵襲性強(qiáng),容易發(fā)生內(nèi)臟轉(zhuǎn)移。目前TNBC 治療仍以化療為主,尚缺乏內(nèi)分泌及抗HER2 治療靶點(diǎn),3年后復(fù)發(fā)率可達(dá) 40%~50%[9],預(yù)后仍然很差。因此,鑒定更多用于治療TNBC 的抗癌分子靶標(biāo)具有重要意義。
CircRNA 是一類以共價(jià)閉環(huán)為特征的非編碼RNA,廣泛存在于真核生物中,來(lái)源于基因的外顯子或內(nèi)含子,具有物種保守性及組織特異性。隨著高通量測(cè)序技術(shù)和計(jì)算分析的發(fā)展,越來(lái)越多的circRNA 被發(fā)現(xiàn),其在疾病發(fā)生中的調(diào)控作用也越來(lái)越被重視[10]。相比線性 RNA 分子,circRNA 具有封閉的環(huán)狀結(jié)構(gòu),沒(méi)有 5′?3′的極性和 polyA 尾巴,因此不容易被RNA 核酸外切酶或者RNaseR 降解,更穩(wěn)定[11]。大多 circRNAs 來(lái)源于外顯子,具有可以結(jié)合 miRNA 的 MREs。circRNAs 主要存在于細(xì)胞質(zhì)中,其表達(dá)豐度較高,具有組織特異性,相對(duì)保守。circRNAs 的上述特性決定了它們?cè)谵D(zhuǎn)錄后的重要作用,可作為疾病診斷及治療的潛在靶點(diǎn)。
CircRNA 可作為內(nèi)源性競(jìng)爭(zhēng)RNA(ceRNA)分子,可能通過(guò)影響靶miRNA 與下游靶mRNA 結(jié)合而發(fā)揮作用[12]。有研究證明,在不同物種中,circRNA 可以發(fā)揮miRNA 海綿體的作用,通過(guò)與miRNA 競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合,作為ceRNA,調(diào)控靶mRNA 的表達(dá)[13?14],在疾病調(diào)控中發(fā)揮重要作用,作為潛在的疾病預(yù)后因子及治療靶點(diǎn)[15]。約 30%以上的circRNA 發(fā)揮 miRNA 的 ceRNA 作用,形成 circRNA?miRNA?mRNA 多維調(diào)控網(wǎng)絡(luò),調(diào)控基因的表達(dá)。Piwecka 等[16]驗(yàn)證了環(huán)狀 RNA Cdr1as 大約有 1 500個(gè)核苷酸,可能發(fā)揮海綿作用吸附miRNA 的作用。
microRNA 是較短的 RNA 分子,通常結(jié)合到mRNA 的互補(bǔ)序列上,因而控制著細(xì)胞產(chǎn)生的特定蛋白數(shù)量,發(fā)揮抑癌或促癌作用[17?18]。研究探索了miR?182 對(duì) TNBC 細(xì)胞行為的作用,表明 miR?182在TNBC 組織和細(xì)胞中上調(diào),可促進(jìn)TNBC 細(xì)胞的增殖和侵襲,并證明 miR?182 可能通過(guò)下調(diào)靶mRNA 表達(dá)促進(jìn) TNBC 細(xì)胞增殖和遷移[19?20]。本課題組前期進(jìn)行了 TNBC circRNA 測(cè)序,建立了circRNA 差異表達(dá)譜,挑選出差異表達(dá)顯著的circ_USP42 作為進(jìn)一步研究對(duì)象。靶miRNA 預(yù)測(cè)結(jié)果表明,miR?182?5p 是與 hsa?circ?USP42 結(jié)合力最強(qiáng)的5 個(gè)miRNA 之一。進(jìn)一步通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)hsa_circ_USP42 在 371 ~377 及 412 ~419 兩個(gè)堿基序列與 miR?182?5p 有潛在結(jié)合位點(diǎn)。熒光素酶報(bào)告基因質(zhì)粒 circRNA hsa_circ_USP42 與 has?mir?182?5p共轉(zhuǎn)染至細(xì)胞后熒光素酶活性顯著降低,說(shuō)明circRNA circ_USP42 與 miR?182 有效結(jié)合。在本研究中,hsa_circ_USP42 在 TNBC 癌組織中的表達(dá)明顯低于癌旁組織;在TNBC 淋巴結(jié)陽(yáng)性組表達(dá)更低。在 TNBC 細(xì)胞株 MDA?MB?231 中過(guò)表達(dá) hsa_circ_USP42,細(xì)胞的侵襲和遷移明顯受到抑制,提示hsa_circ_USP42 可能發(fā)揮 miR?182?5p 的海綿調(diào)控作用,影響TNBC 的發(fā)生發(fā)展。熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)證實(shí) hsa_circ_USP42 與 miR?182?5p 有效結(jié)合;過(guò)表達(dá) hsa_circ_USP42 后,靶 miRNA miR?182?5p顯著下調(diào),而靶基因MTSS1 在轉(zhuǎn)錄水平及蛋白水平均升高,提示 hsa_circ_USP42 可能發(fā)揮 miR?182?5p海綿作用,上調(diào)MTSS1 表達(dá),抑制TNBC 侵襲及轉(zhuǎn)移,在TNBC 發(fā)生發(fā)展過(guò)程中發(fā)揮抑癌作用;hsa_circ_USP42 與 miR?182?5p 的靶結(jié)合位點(diǎn)可能是TNBC 的潛在治療靶點(diǎn)。
未來(lái)需要體內(nèi)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步闡明hsa_circ_USP42 作為 miR?182?5p 海綿調(diào)控體內(nèi)機(jī)制。hsa_circ_USP42/miR?182?5p/MTSS1 軸對(duì) TNBC 復(fù)發(fā)、轉(zhuǎn)移的影響,有待進(jìn)一步研究。
同濟(jì)大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版)2020年2期