福建 何紅星
PCR 技術(shù)(多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))是高中生物人教版教材選修3“基因工程”中“目的基因體外擴增”的重要學(xué)習(xí)內(nèi)容。在DNA 測序、表達圖譜及腫瘤檢測等方面應(yīng)用廣泛,為生物學(xué)命題提供大量的素材,更重要的是能搭建學(xué)生科學(xué)探究和理性思維的平臺。但在教材中有關(guān)PCR 技術(shù)的學(xué)習(xí)內(nèi)容呈現(xiàn)較為簡單,在許多命題中學(xué)生感到很抽象,教師在教學(xué)時深度和廣度往往把握不好,使得本部分知識的教學(xué)及學(xué)習(xí)存在一定的困難。
模型建構(gòu)是學(xué)習(xí)生物學(xué)的一種重要的科學(xué)方法,有利于學(xué)生主動學(xué)習(xí)相關(guān)知識,體驗科學(xué)探究過程,增加思維強度,延伸思維寬度,拓展思維深度,從而培養(yǎng)學(xué)生的理性思維,提高學(xué)習(xí)效率。
【探究活動1】PCR 技術(shù)是人工體外DNA 擴增的一項技術(shù),據(jù)圖1 回答下列問題:
圖1
(1)加熱雙鏈打開_______鍵,解旋又稱為__________,溫度降低時,引物與模板的對應(yīng),在DNA 聚合酶作用下引物沿模板鏈延伸,DNA 聚合酶具備__________的特點。
(2)PCR 技術(shù)的原理是___________,需要遵循_______原則,PCR 技術(shù)需要______________等條件,此外還需要液體環(huán)境、適宜的______________、_____________,前者由自動控溫儀控制,后者借助_________________維持。
(3)圖1 中的變性和延伸分別是指___________________________、_______。根據(jù)圖1 概括PCR 技術(shù)的過程:__________________。
【答案】(1)氫 高溫變性 熱穩(wěn)定性
(2)DNA 半保留復(fù)制 堿基互補配對 模板、引物、原料(四種脫氧核苷酸dNTP)、熱穩(wěn)定性聚合酶(Taq 酶)
溫度 酸堿度 緩沖液(3)高溫解旋過程 以DNA 單鏈為模板,隨引物在DNA 聚合酶作用下進行延伸合成新的子鏈過程 變性→復(fù)性→延伸
【建議】對于PCR 技術(shù)的相關(guān)知識,教師可建立思維導(dǎo)圖(如圖2),引導(dǎo)學(xué)生梳理知識脈絡(luò),幫助學(xué)生對核心概念有序?qū)W習(xí)。
圖2
【探究活動2】(1)若要用PCR 技術(shù)擴增“X 基因”,需在PCR 反應(yīng)中加入_____________________種引物,加入引物的原因是_________________________________ 。
(2)引物及其與模板鏈的結(jié)合位置如圖3 中甲所示。觀察DNA 雙鏈一條是5' → 3'方向,另一條是3'→5'方向得出的結(jié)論是_____________________________。經(jīng)四輪循環(huán)后產(chǎn)物中有五種不同的DNA 分子,如圖3 中乙所示,其中第⑤種DNA 分子有______個。
(3)PCR 技術(shù)一般要到第___________輪才出現(xiàn)等長的第⑤種DNA。
圖3
【答案】(1)2 DNA 聚合酶無法單獨開始復(fù)制,即無法憑空開始向模板上添加對應(yīng)的核苷酸,它必須有一段引物與模板形成雙鏈后在DNA 聚合酶的作用下繼續(xù)鏈的延伸(2)DNA 的兩條鏈?zhǔn)欠聪蚱叫械?8 (3)三
【分析】PCR 技術(shù)擴增時,由兩種引物決定所擴增片段的特定序列,上一次循環(huán)的產(chǎn)物為下一次循環(huán)的模板。第一次循環(huán)形成①和②,第二次循環(huán)形成①②③④四個DNA,以此類推四次循環(huán)后共形成16 分子的DNA,其中①②各1 分子,③④各3 分子,⑤共8 分子。這樣解釋學(xué)生感到很抽象,不利于學(xué)生的理解,尤其不利于對學(xué)生思維的訓(xùn)練,筆者嘗試引導(dǎo)學(xué)生在讀圖的基礎(chǔ)上進行模型構(gòu)建,每兩人為一組相互配合用卡紙剪出并用透明膠粘貼第一次循環(huán)或根據(jù)引物、堿基互補關(guān)系畫出第一次循環(huán),依次構(gòu)建第二次循環(huán)、第三次循環(huán)的結(jié)果圖,配合復(fù)制過程的本質(zhì)內(nèi)容再展開過程的解析,幫助學(xué)生理解習(xí)題本質(zhì)功能——思維的訓(xùn)練。
圖4 第二次循環(huán)示意圖
由此假設(shè)DNA 的兩條母鏈為A 鏈(長鏈),以A 鏈為模板合成的含有引物DNA 的子鏈為B 鏈(中等長度鏈);以B 鏈為模板合成的含有引物DNA 的子鏈為C 鏈(最短鏈);且以C 鏈為模板合成的含有引物DNA 的子鏈永遠(yuǎn)為C 鏈(最短鏈)。由于DNA 復(fù)制是半保留復(fù)制,2 條A 鏈保留且在四次復(fù)制過程中作為模板,共形成8 條B 鏈(第1 輪結(jié)束的時候形成了2 條B 鏈;第2 輪結(jié)束的時候除保留的2 條B 鏈外共有4 條B 鏈;第3 輪結(jié)束的時候除保留的4 條B 鏈外共有6 條B 鏈,第3 輪第一次出現(xiàn)等長的第⑤種DNA;第4 輪結(jié)束的時候除保留的6 條B 鏈外共有8 條B 鏈),最后一次形成的兩條B 鏈與兩條A 鏈構(gòu)成DNA 分子(如圖3 乙中的①和②),其他6 條B 鏈一定只能與C 鏈形成DNA 分子(如圖3 乙中的③和④)。即有2 條AB 鏈的DNA,6 條BC 鏈的DNA,而復(fù)制4 輪合計形成了16 條DNA 分子,所以必然有8 條CC 鏈構(gòu)成的DNA 分子。進一步根據(jù)模型觀察,可以知道子鏈合成是沿5'→ 3'方向延伸合成互補鏈的(對應(yīng)模板鏈3'→5'方向),可以解決常見的標(biāo)出引物位置的題型。
【探究活動3】圖5 是PCR 技術(shù)擴增某目的基因過程中,引物對與模板DNA 片段結(jié)合示意圖,則由一個該模板DNA片段擴增n次后,只含目的基因的DNA片段數(shù)為( )
圖5 引物對與模板結(jié)合示意圖
A.2nB.2n-2C.2n-2n D.2n
【答案】C
【分析】DNA 片段擴增n 次后共形成2n個DNA 分子,其中2n 個含有引物,所以只含目的基因的DNA 片段數(shù)為2n-2n。
根據(jù)模擬建構(gòu)過程歸納推理得出N 次循環(huán)后含有引物1 和引物2 的DNA 分子數(shù)均為2n-1;既含有引物1 又含有引物2 的DNA 分子數(shù)為2n-2;擴增N 次后的DNA 分子片段類型歸納如下。
類型1:只含引物1,兩鏈不等長,引物1 延伸與母鏈互補,無論循環(huán)多少次始終只有1 條,如圖6 ①;
類型2:只含引物2,兩鏈不等長,引物2 延伸與母鏈互補,無論循環(huán)多少次始終也只有1 條,如圖6 ②;
類型3:既含有引物1 又含有引物2,含引物1 鏈較含引物2 鏈長,N 次循環(huán)后有N-1 條,如圖6 ③;
類型4:既含有引物1 又含有引物2,含引物2 鏈較含引物1 鏈長,N 次循環(huán)后有N-1 條,如圖6 ④;
類型5:既含有引物1 又含有引物2,兩鏈等長,N 次循環(huán)后有2n-2n 條,如圖6 ⑤。
圖6 N 次循環(huán)后DNA 種類歸納
結(jié)合物理模型分析可知,細(xì)胞內(nèi)DNA 復(fù)制結(jié)果一般形成等長的DNA,復(fù)制結(jié)果DNA 類型只有一種,而PCR 技術(shù)一般要到第三輪才出現(xiàn)等長的DNA,如果引物也從最端部開始,則DNA 類型也只有一種。
應(yīng)用PCR 擴增產(chǎn)物的電泳可得到不同DNA 的條帶,從而進行個人辨認(rèn)和親子鑒定,結(jié)合遺傳圖譜分析DNA 親緣關(guān)系、確定遺傳圖譜中基因型等是遺傳命題設(shè)計應(yīng)用的部分內(nèi)容。
【探究活動4】(2015 年,江蘇卷,第30 題節(jié)選)由苯丙氨酸羥化酶基因突變引起的苯丙氨酸代謝障礙,是一種嚴(yán)重的單基因遺傳病,稱為苯丙酮尿癥(PKU),正常人群中每70 人有1 人是該致病基因的攜帶者(顯、隱性基因分別用A、a 表示)。圖7 是某患者的家族系譜圖,其中Ⅱ1、Ⅱ2、Ⅱ3及胎兒Ⅲ1(羊水細(xì)胞)的DNA 經(jīng)限制酶Msp I 消化,產(chǎn)生不同的片段(kb 表示千堿基對),經(jīng)電泳后用苯丙氨酸羥化酶cDNA 探針雜交,結(jié)果如圖8。請回答下列問題:
(2)依據(jù)cDNA 探針雜交結(jié)果,胎兒Ⅲ1的基因型是_______________ 。
【答案】Aa
【分析】根據(jù)題意判斷此病為常染色體隱性遺傳病,Ⅱ1基因型為aa,由電泳圖比較可知,Ⅱ2、Ⅱ3及胎兒Ⅲ1的基因型均為Aa。
通過模型建構(gòu),學(xué)生可親身體會知識的形成過程,加強學(xué)生的思維訓(xùn)練。動手動腦進行科學(xué)探究,可實現(xiàn)跨學(xué)科學(xué)習(xí),踐行學(xué)科核心素養(yǎng)的生命觀念和STEM 教育觀,構(gòu)建生物課堂“活化能”,讓學(xué)生在成長的道路上走得更遠(yuǎn),飛得更高。