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DNA引物合成起始的分子基礎(chǔ)

2023-01-04 11:40趙林
關(guān)鍵詞:復(fù)合物結(jié)構(gòu)域引物

在DNA 復(fù)制開始期間,寡核苷酸引物由引物酶從頭合成,隨后由復(fù)制聚合酶延伸以完成基因組復(fù)制。引物酶-聚合酶(Prim-Pol)超家族是一組多樣性的引物酶,包括復(fù)制型引物酶和參與適應(yīng)性免疫的與CRISPR相關(guān)的引物酶-聚合酶(CAPPs)。盡管對(duì)這些酶的活性了解很多,但引物酶用于啟動(dòng)引物合成的精確機(jī)制尚未闡明。在此,研究人員確定了通過CAPP啟動(dòng)引物合成的分子基礎(chǔ),并表明這一機(jī)制在復(fù)制型引物酶中也是保守的。引物起始復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu)揭示了在合成第1個(gè)磷酸二酯鍵之前,進(jìn)入的核苷酸是如何定位于活性位點(diǎn)內(nèi),與金屬輔因子相鄰,并與模板單鏈DNA 鏈配對(duì)。此外,具有雙鏈DNA 的Prim-Pol復(fù)合物的結(jié)構(gòu)顯示了該酶隨后如何以聚合酶過程模式延伸引物。此處介紹的結(jié)構(gòu)和機(jī)理研究確定了Prim-Pol 蛋白如何促進(jìn)引物合成,揭示了催化域內(nèi)引物合成必需的分子決定因素。這項(xiàng)工作還確定了Prim-Pol酶的催化結(jié)構(gòu)域,包括復(fù)制性引物酶,足以催化引物形成。

(來源:Nature,2022,https://doi.org/10.1038/s41586-022-04695-0 趙林編譯)

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