李彥林,張蔚,李曉玉,魯心怡,曹鈺*
1(江南大學(xué) 生物工程學(xué)院,江蘇 無錫,214122) 2(教育部工業(yè)生物技術(shù)重點實驗室(江南大學(xué)),江蘇 無錫,214122)
當(dāng)前,全球表面活性劑的使用量大幅增加,每年化學(xué)和生物表面活性劑的全球市場價值超過200億美元[1-2]。和化學(xué)表面活性劑相比,生物表面活性劑是微生物發(fā)酵產(chǎn)生的生物活性分子,具有較低的毒性和較高的生物降解性,并且能夠在極端的溫度、pH和鹽度下保持表面活性[3]。
Surfactin是由C12—C17長鏈脂肪酸和7個氨基酸構(gòu)成的環(huán)狀脂肽,為研究最多的脂肽類表面活性劑之一,具有保濕[4]、抑菌[5]、抗炎[6]、抗腫瘤[7]等活性,甚至可以輔助治療人類免疫缺陷病[8],在化妝品、食品、醫(yī)藥等領(lǐng)域具有廣闊的應(yīng)用前景。但其工業(yè)化進程受制于較高的生產(chǎn)成本。通常在發(fā)酵類產(chǎn)品的生產(chǎn)中,原材料成本約占總成本的41%[9]。因此使用廉價的工農(nóng)業(yè)廢棄物作為碳源來發(fā)酵生產(chǎn)surfactin,在降低生產(chǎn)成本方面扮演重要角色。目前已有以梨汁[10]、橄欖油場廢料[11-12]、木薯廢水[13]、白酒糟[14]、過期糖蜜[15]、豆渣[3]作為碳源的文獻報道。啤酒糟(brewer's spent grain,BSG)是在啤酒生產(chǎn)環(huán)節(jié)麥芽汁加工過程殘留的固體物質(zhì)。全球每年BSG產(chǎn)量約3 860萬t[16],其中我國年產(chǎn)量約1 000萬t[17],具有豐富的資源。目前BSG主要用于動物飼料[18],亟待高附加值的開發(fā)利用。
本研究主要根據(jù)surfactin的表面活性性質(zhì),以及生產(chǎn)菌株具備的surfactin合成調(diào)控基因srfA,開展surfactin合成菌株的定向篩選,通過薄層層析(thin layer chromatography,TLC)和超高效液相色譜-電噴霧四級桿飛行時間質(zhì)譜(ultra performance liquid chromatography/electrospray ionization quadrupole time-of-flight high-resolution/mass spectrometry,UPLC-ESI/Q-TOF/MS)進行產(chǎn)物的定性驗證和定量分析,篩選利用BSG酶解液為碳源的surfactin高產(chǎn)菌株,并進行分子生物學(xué)鑒定。
無錫雪浪山附近篩選得到的247株芽孢桿菌,實驗室保藏。
surfactin(≥98%)標(biāo)準品S3 523,美國sigma公司;甲醇、乙腈(HPLC級),賽默飛世爾科技有限公司;三氟乙酸(HPLC級),上海麥克林生化科技有限公司;普通PCR制劑,Takara公司;其他試劑,國藥集團(上海)化學(xué)試劑有限公司。
LB培養(yǎng)基(g/L):蛋白胨10,酵母膏5,NaCl 10。制備固體培養(yǎng)基時添加2%營養(yǎng)瓊脂,pH 7.0。
MSM培養(yǎng)基(g/L):葡萄糖40,NH4NO38,KH2PO44.08,Na2HPO45.68,MgSO4·7H2O 2.46×10-2,CaCl21.03×10-3,F(xiàn)eSO41.11×10-3,EDTA 1.18×10-3,pH7.0。
發(fā)酵培養(yǎng)基:用5 g/L預(yù)處理BSG的酶解液替代MSM培養(yǎng)基中葡萄糖。
LDZX-50KBS高壓蒸汽滅菌鍋,上海申安醫(yī)療機械廠;T100 PCR儀,美國Bio-Rad公司;TGL-16C高速離心機,上海安亭科學(xué)儀器廠;GSP-9050MBE隔水式電熱恒溫培養(yǎng)箱,上海博迅實業(yè)有限公司;ZQZY-70B振蕩培養(yǎng)箱,上海知楚儀器;PA2014N電子天平,梅特勒-托利多國際貿(mào)易(上海)有限公司;SW-CJ-2FD潔凈工作臺,蘇凈安泰空氣技術(shù)有限公司;DCAT21表面張力動態(tài)接觸角測量儀,德國Dataphysics公司;Chromaster高效液相色譜儀,日本日立公司;MALDI SYNAPT MS超高效液相色譜串聯(lián)四極桿飛行時間質(zhì)譜聯(lián)用儀,美國waters公司。
1.4.1 發(fā)酵上清液性質(zhì)測定
基于surfactin的表面活性特性,通過無細胞發(fā)酵上清液排油活性、乳化指數(shù)及表面張力性質(zhì)的測定,初步篩選產(chǎn)生物表面活性劑的菌株。即將篩選得到的247株芽孢桿菌接種于MSM培養(yǎng)基中30 ℃,200 r/min搖瓶培養(yǎng)96 h,發(fā)酵液于10 000 r/min離心5 min得到無細胞上清,進行性質(zhì)測定。
1.4.1.1 排油活性(ODA)測定
取30 mL蒸餾水于培養(yǎng)皿中,加20 μL大豆油于蒸餾水表面,形成油層之后,滴加10 μL無細胞上清液,若能夠形成透明圈,說明有表面活性物質(zhì)產(chǎn)生,并記錄透明圈直徑大小。
1.4.1.2 乳化指數(shù)(E24)測定
以乳化指數(shù)來表征無細胞上清液的乳化能力。取2 mL大豆油于試管中,然后加入2 mL無細胞上清液,旋渦高速振蕩2 min后,在室溫下靜置24 h,計算乳化指數(shù)E24:
(1)
式中:h1,乳化層高度;h2,液體總高度。
1.4.1.3 表面張力(SFT)測定
利用德國Dataphysics公司表面張力動態(tài)接觸角測量儀測定無細胞上清液表面張力。取40 mL無細胞上清液于燒杯中,放置到張力計檢測品臺上,按照說明書方法進行操作。測定不同樣品之間需用無菌的MSM培養(yǎng)基進行洗滌后測定。
1.4.2srfA基因特異PCR分析
經(jīng)過發(fā)酵液性質(zhì)測定,選擇初步確定能產(chǎn)表面活性劑的菌株。進行srfA基因檢測,進一步確定菌株是否具有合成surfactin合成酶的能力。PCR擴增引物及條件參照文獻[19]。
1.4.3 發(fā)酵產(chǎn)物分析
向無細胞上清液中添加5 mol/L的HCl調(diào)節(jié)pH至2.0,放于4 ℃冰箱過夜,10 000 r/min離心5 min,棄上清,沉淀用甲醇溶解后備用。
1.4.3.1 薄層層析(TLC)
通過TLC初步半定性半定量surfactin的產(chǎn)生,使用Merck硅膠60熒光薄層層析鋁箔板F254進行薄層層析,流動相為V(氯仿)∶V(甲醇)∶V(乙酸)=80∶10∶10,surfactin標(biāo)品作為對照。
1.4.3.2 UPLC-ESI/Q-TOF MS條件
液相條件:使用Waters C18色譜柱(100 mm×2.1 mm,1.7 μm);流動相A為含有體積分數(shù)為0.1%甲酸的色譜乙腈溶液,流動相B為含有體積分數(shù)為0.1%甲酸的水溶液,V(A)∶V(B)=90∶10等度洗脫;柱溫30 ℃,流速為0.3 mL/min;進樣體積5 μL。
質(zhì)譜條件:電噴霧離子源(ESI),正離子檢測模式;離子源溫度為20 ℃;毛細管電壓3 000 V;錐孔電壓30 V;去溶劑氣體流速500 L/h;去溶劑溫度500 ℃;錐孔氣流50 L/h;范圍m/z500~1 500,檢測時間20 min。
1.4.4 surfactin定量檢測
采用高效液相色譜儀對surfactin進行定量測定。色譜柱:Agilent C18色譜柱(250 mm×4.6 mm,5 μm);流動相A為含有體積分數(shù)為0.1%三氟乙酸的色譜乙腈溶液,流動相B為含有體積分數(shù)為0.1%三氟乙酸水溶液,V(A)∶V(B)=90∶10等度洗脫;柱溫30 ℃,流速為1 mL/min;檢測波長205 nm;進樣體積20 μL。
1.4.5 利用預(yù)處理BSG酶解液中發(fā)酵生產(chǎn)surfactin
參考文獻[20]BSG酶解條件,酶解完成后,100 ℃滅酶10 min,酶解液處理方式分為2種,一種是10 000 r/min離心5 min,得到BSG酶解上清液(supernatant of enzymatic hydrolysate of BSG,SEH-BSG),另一種紗布過濾得到BSG酶解濾液(filtrate of enzymatic hydrolysate of BSG,F(xiàn)EH-BSG),配制發(fā)酵培養(yǎng)基,121 ℃滅菌20 min。按照10%接種量接入菌株,30 ℃,200 r/min培養(yǎng)96 h,測定surfactin產(chǎn)量,選出利用BSG酶解液最好的菌株。
1.4.6 發(fā)酵產(chǎn)物純化及保濕性測定
發(fā)酵產(chǎn)物純化方法參照文獻[21],保濕性測定參照文獻[22]。
1.4.7 菌株鑒定
1.4.7.1 菌株形態(tài)觀察
活化菌株,挑取芽孢桿菌新鮮培養(yǎng)物,進行革蘭氏染色和芽孢桿菌顯微形態(tài)觀察;同時在LB平板劃線,培養(yǎng)觀察菌落形態(tài)。
1.4.7.2 菌株16S rDNA分析
采用細菌基因組抽提盒提取芽孢桿菌總DNA,使用通用引物27F和1 492R對菌株16S rDNA進行PCR擴增,目標(biāo)片段1 500 bp左右,PCR條件為:95 ℃預(yù)變性5 min,94 ℃變性30 s,58 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,進行30個循環(huán),72 ℃修復(fù)延伸5 min,10 ℃保溫。PCR產(chǎn)出純化后,由蘇州金唯智生物科技有限公司進行測序。
2.1.1 基于發(fā)酵上清液表面活性特性的初篩
Surfactin是一種生物表面活性劑,具有表面活性劑的典型特征,即排油活性(ODA)、乳化指數(shù)(E24)和降低水表面張力(SFT),SFT值越低,表明表面活性越強,ODA與E24值越大。據(jù)此,從247株芽孢桿菌的MSM培養(yǎng)基發(fā)酵培養(yǎng)上清液中共篩選出17株同時具有上述3種特性的菌株,測定結(jié)果如圖1。
圖1 不同菌株發(fā)酵上清液的表面活性特性分析Fig.1 The surface activity parameters of different strains’ fermentation supernatant
以無菌的MSM培養(yǎng)基為對照,發(fā)現(xiàn)菌株41-3發(fā)酵液降低培養(yǎng)基SFT值,提高培養(yǎng)基ODA和E24值效果最好,表明該菌株合成生物表面活性劑能力最強,有可能是surfactin高產(chǎn)菌株。
2.1.2 基于菌株srfA基因特異PCR的復(fù)篩
由于srfA是編碼surfactin合成酶的基因,缺失srfA基因,surfactin將不能合成。具有表面活性劑典型特征的17株芽孢桿菌進行srfA基因檢測,如圖2所示,發(fā)現(xiàn)有8株芽孢桿菌srfA基因陽性,編號分別為20-2,41-3,43-3,44-3,47-3,49-5,50-1,56-2。
M-maker2000;1~17分別代表菌株9-1,19-1,34-2,41-3,20-2,43-3,44-3,15-1,44-1,47-3,49-5,51-5,46-3,68-1,50-1,56-2,60-1圖2 不同菌株srfA基因特異性PCR分析Fig.2 Analysis of srfA gene specific PCR in different strains
將srfA基因檢測陽性的8株芽孢桿菌接種到基礎(chǔ)培養(yǎng)基中30 ℃培養(yǎng)96 h,經(jīng)酸沉,甲醇溶解,通過TLC和UPLC-ESI/Q-TOF MS定性分析菌株的發(fā)酵產(chǎn)物中是否含有surfactin。通過HPLC定量測定surfactin。
2.2.1 發(fā)酵產(chǎn)物的定性分析
2.2.1.1 TLC法定性分析發(fā)酵產(chǎn)物
如圖3所示,菌株41-3發(fā)酵液提取物和sigma公司surfactin標(biāo)品(S3 523)經(jīng)薄層層析板的條帶一致,有相同的Rf值。表明發(fā)酵液中含有surfactin。故進一步進行UPLC-ESI/Q-TOF MS分析,以明確該產(chǎn)物是否為surfactin。
1- surfactin標(biāo)品(S3 523);2-菌株41-3發(fā)酵液提取物圖3 紫外254nm波長下樣品的TLC分析結(jié)果Fig.3 TLC results of samples at UV 254 nm
2.2.1.2 菌株41-3發(fā)酵液提取物中surfactin定性分析
利用UPLC-ESI/Q-TOF MS液質(zhì)連用法,對菌株41-3發(fā)酵液提取物中的surfactin進行定性分析。結(jié)果見圖4。從圖4可見,surfactin標(biāo)品(S3 523,Sigma公司)和菌株41-3發(fā)酵提取物均為一些同系物,其[M+H]+峰均位于1 008、1 022、1 036、1 050、1 064m/z,[M+Na]+峰均位于在m/z1 030、1 044、1 058、1 072、1 086,分別代表C13—C17surfactin同系物。
a-surfactin標(biāo)準品;b-菌株41-3發(fā)酵提取物圖4 液質(zhì)聯(lián)用分析樣品的[M+H]+和[M+Na]+質(zhì)譜圖Fig.4 Comparison of [M+H]+ and [M+Na]+ spectra of samples by LC/MS analysis
2.2.2 surfactin高產(chǎn)菌株的篩選
根據(jù)不同濃度的surfactin標(biāo)品配置的標(biāo)準溶液,繪制出surfactin標(biāo)準曲線。得到surfactin濃度與峰面積的對應(yīng)關(guān)系:
Y=2×10-5X峰面積-0.966 7,R2=0.999 1
(2)
式中:Y,surfactin濃度質(zhì)量濃度,g/L;X,峰面積。
對8株產(chǎn)surfactin的菌株以MSM培養(yǎng)30 ℃,200 r/min發(fā)酵96 h,HPLC測定其產(chǎn)量,結(jié)果見圖5。其中菌株41-3 surfactin產(chǎn)量最高,達到541.32 mg/L。其次為菌株43-3,其surfactin產(chǎn)量達到258.39 mg/L,其余菌株發(fā)酵產(chǎn)量均不到100 mg/L。據(jù)文獻報道,通常天然分離的芽孢桿菌surfactin產(chǎn)量為100 mg/L左右,而菌株41-3 surfactin產(chǎn)量達到541.32 mg/L,故選用菌株41-3作進一步研究。
圖5 不同菌株在MSM中surfactin產(chǎn)量Fig.5 Surfactin production of different strains in MSM
2.2.3 利用BSG產(chǎn)surfactin菌株surfactin產(chǎn)量及同系物成分分析
2.2.3.1 利用BSG產(chǎn)surfactin菌株surfactin產(chǎn)量
為考察菌株對BSG的發(fā)酵利用情況,采用10 g/L的NaOH稀堿溶液預(yù)處理BSG,去除木質(zhì)素便于纖維素酶更好地水解纖維素,以酶解液中的還原糖供菌株生長和發(fā)酵并生產(chǎn)surfactin。選取菌株在MSM培養(yǎng)基中surfactin產(chǎn)量最高的菌株41-3和43-3,進行BSG發(fā)酵試驗,結(jié)果見表1。
表1 菌株利用BSG酶解液發(fā)酵試驗Table 1 Fermentation results by using BSG enzymatic hydrolysate
從表1中看出,相比于MSM培養(yǎng)基,菌株41-3和43-3在SHE-BSG酶解液(無固形物)中培養(yǎng),surfactin產(chǎn)量分別下降了34.93 mg/L、26.89 mg/L。然而,菌株41-3和43-3在FEH-BSG酶解液(含固形物)中培養(yǎng),surfactin產(chǎn)量相比于MSM培養(yǎng)基均有提高,特別是菌株41-3 surfactin產(chǎn)量達到746.35 mg/L,提高了1.38倍,同時生物量和MSM培養(yǎng)基培養(yǎng)相比,也從1.85×107CFU/mL提高到7.15×107CFU/mL??赡茉蚴荁SG酶解完成后,F(xiàn)EH-BSG酶解液含有固體BSG顆粒,而且有報道稱,固體物質(zhì)能夠使菌體吸附,提高生物量,進而提高surfactin產(chǎn)量[23]。
2.2.3.2 不同碳源條件下發(fā)酵產(chǎn)物中surfactin同系物分析
根據(jù)UPLC-ESI/Q-TOF MS樣品出峰時間和質(zhì)荷比對應(yīng)關(guān)系,對發(fā)酵產(chǎn)物中的surfactin各同系物的相對含量進行分析,結(jié)果見表2。
表2 利用不同碳源發(fā)酵產(chǎn)的surfactin同系物分析Table 2 Analysis of surfactin homologues produced by fermented with different carbon sources
從表2可以看出,菌株41-3產(chǎn)生的surfactin同系物中,以脂肪酸鏈為C14和C13的surfactin為主,兩者含量約占75%。利用FEH-BSG酶解液和利用葡萄糖發(fā)酵生產(chǎn)surfactin相比,surfactin的合成向更長鏈脂肪酸surfactin遷移。有文獻報道,surfactin的表面活性會隨著脂肪酸鏈的增長而顯著提高,同時其乳化,保濕性能也有所增強[24-25]。分別以FEH-BSG酶解液和葡萄糖為碳源發(fā)酵,對獲得的surfactin進行表面活性特性分析,結(jié)果見表3。利用前者生產(chǎn)的surfactin同系物的表面張力、乳化指數(shù)以及保濕性均優(yōu)于后者,其中,表面張力降低了6.31%,乳化指數(shù)和保濕性分別提高了7.53%和48.04%。因此,F(xiàn)EH-BSG酶解液作為碳源時不僅提高了surfactin產(chǎn)量,也增強了surfactin的表面活性性能,可以作為葡萄糖的替代品用來發(fā)酵生產(chǎn)surfactin。
表3 利用不同碳源發(fā)酵產(chǎn)的surfactin表面活性分析Table 3 Surface activity analysis of surfactin produced by fermented with different carbon sources
2.2.4 高產(chǎn)surfactin菌株鑒定
2.2.4.1 菌株41-3形態(tài)觀察
菌株41-3為革蘭氏陽性菌,菌落易挑起,呈白色,表面粗糙不透明。菌體細胞呈桿狀,能夠形成芽孢,芽孢呈橢圓狀,位于細胞中央。圖6-a為菌株平板形態(tài),圖6-b為菌株細胞革蘭氏染色后油鏡下的顯微鏡形態(tài)。
a-平板菌落形態(tài);b-細胞顯微形態(tài)圖6 菌株41-3平板菌落形態(tài)和細胞顯微形態(tài)Fig.6 Colony morphology and cell microscopic morphology of strain 41-3
2.2.4.2 菌株41-3分子生物學(xué)鑒定
以通用引物27F和1 492R對41-3菌株16s rDNA進行PCR擴增,擴增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,得到大約為1 500 bp的條帶,如圖7。
1- DNA分子標(biāo)記;2- PCR產(chǎn)物圖7 菌株41-3 16S rDNA的PCR結(jié)果Fig.7 16S rDNA PCR results of strain 41-3
PCR產(chǎn)物經(jīng)純化后,送樣測序,經(jīng)過NCBI數(shù)據(jù)庫BLAST序列進行同源性比對,發(fā)現(xiàn)41-3菌株與Bacillussubtilis具有99%的同源性,親緣關(guān)系最近,由此可確定菌株41-3菌株為Bacillussubtilis(枯草芽孢桿菌)。在NCBI數(shù)據(jù)庫中下載相似度高的序列,利用MEG6軟件構(gòu)建進化樹,如圖8。
圖8 菌株41-3進化樹Fig.8 The phylogenetic tree of strain 41-3
Surfactin是目前發(fā)現(xiàn)的最有效的生物表面活性劑,但生產(chǎn)成本過高限制了其工業(yè)化生產(chǎn),篩選高產(chǎn)surfactin生產(chǎn)菌株及降低生產(chǎn)原料成本勢在必行。
本研究根據(jù)surfactin性質(zhì)及其編碼基因,通過TLC和UPLC-ESI/Q-TOF MS定性定量分析,篩選分離得到1株surfactin產(chǎn)量較高的菌株41-3。經(jīng)過形態(tài)學(xué)觀察和16S rDNA分子生物學(xué)實驗,菌株41-3為枯草芽孢桿菌(Bacillussubtilis)。另外,在MSM培養(yǎng)基中,枯草芽孢桿菌41-3surfactin產(chǎn)量為541.32 mg/L。然而,使用BSG酶解液作為碳源發(fā)酵生產(chǎn)surfactin,surfactin產(chǎn)量提高了1.38倍,達到746.35 mg/L。經(jīng)過同系物分析比較,以BSG酶解液為碳源生產(chǎn)surfactin,長脂肪鏈的同系物含量提高,意味著BSG不僅僅可以作為碳源生產(chǎn)surfactin,而且surfactin的生物活性也隨著長脂肪鏈的同系物含量提高而增強。