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非小細胞肺癌患者中EGFR突變、ALK和ROS1融合基因表達變化及其臨床病理學意義

2019-04-22 12:20白冬雨張海萍索文昊高德宏鐘山
關(guān)鍵詞:突變率外顯子腺癌

白冬雨,張海萍,索文昊,高德宏,鐘山

(廈門大學附屬第一醫(yī)院病理科,廈門 361003)

肺癌隨著其發(fā)病率和死亡率的逐年攀升,已躍居惡性腫瘤之首,其中80%以上是非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)。近年來,以分子靶向治療為核心的個體化治療已成為肺癌治療的研究熱點。目前NSCLC的治療使用最多的是針對表皮生長因子受體(epidermic growth factor receptor,EGFR)突變的分子靶向藥物,即小分子的酪氨酸激酶抑制劑(tyrosine kinase inhibitors,TKIs),其對存在EGFR突變的NSCLC患者具有明顯的臨床療效。繼發(fā)現(xiàn)EGFR基因突變之后,棘皮動物微管相關(guān)蛋白樣4(echinoderm microtubule-associated protein-like 4, EML4)與間變性淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase,ALK)融合基因EML4-ALK[2-4]和原癌基因蛋白酪氨酸激酶ROS(ROS1)被發(fā)現(xiàn),對于存在ALK基因融合和ROS1基因融合的患者給予ALKTKI克唑替尼(crizotinib)靶向治療,可取得較好的療效。因此靶向治療前檢測EGFR、ALK和ROSl基因突變對于靶向治療療效預測和適宜患者篩選具有重要意義。

本研究通過檢測379例NSCLC患者的EGFR、ALK、ROS1基因表達情況,分析陽性患者的臨床病理特征,為篩選分子靶向治療適宜人群提供一定的數(shù)據(jù)支持。

材料與方法

1 標本及一般資料

收集我院379例手術(shù)切除經(jīng)病理確診的NSCLC患者石蠟包埋組織。其中男性250例,女性129例;年齡范圍19~87歲,中位年齡60歲,按中位年齡分2組,<60歲:179例,≥60歲:200例。有吸煙史172例,無吸煙史207例。腺癌215例,鱗癌95例,腺鱗癌24例,其他類型45例。

2 實驗方法

2.1 DNA和RNA提取

取≥5片5μm厚度石蠟切片,置于1.5ml EP管內(nèi)。使用廈門艾德生物醫(yī)藥有限公司的甲醛固定石蠟包埋樣本DNA/RNA共分離試劑盒(離心柱型)提取DNA和RNA。具體步驟按試劑盒操作說明。

2.2 EGFR、ALK和ROS1融合基因檢測

按照人類EGFR基因突變定性檢測試劑盒(廈門艾德生物醫(yī)藥科技有限公司),人類ALK/ROS1基因融合聯(lián)合檢測試劑盒(廈門艾德生物醫(yī)藥科技有限公司)及人類EGFR/ALK/ROS1基因融合聯(lián)合檢測試劑盒(廈門艾德生物醫(yī)藥科技有限公司)說明書提供的方法,在Mx3000P實時熒光定量PCR儀(美國Stratagene公司)中進行擴增,基因檢測位點見使用說明書。將從石蠟包埋組織中提取的RNA按照試劑盒說明書操作逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,然后連同提取的DNA一起進行實時熒光PCR。

2.3 Sanger DNA測序試驗

PCR引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,所用PCR引物序列。每個樣品分別經(jīng)EGFR/ALK/ROS1的測序引物和斷裂點的上下游引物進行擴增,將擴增出的PCR產(chǎn)物送至上海生工生物工程公司純化、測序。

3 統(tǒng)計學分析

所有數(shù)據(jù)采用SPSS19.0軟件進行統(tǒng)計分析。結(jié)果運用χ2檢驗及Fisher確切概率法,檢驗水準α=0.05,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義(雙側(cè)檢驗)。

結(jié) 果

1 非小細胞肺癌的病理學特征

HE染色顯示,肺鱗狀細胞癌腫瘤細胞排列呈實性巢狀,部分區(qū)域呈基底樣排列,細胞核增大,核染色質(zhì)粗,胞漿略豐富,可見核仁及核分裂像,局部可見不良角化(圖1A);肺腺癌腫瘤細胞排列呈腺泡狀和腺管狀,由立方或柱狀細胞組成,核增大深染(圖1B)。免疫組織化學染色顯示,肺鱗狀細胞癌腫瘤細胞CK5/6陽性(圖1C),肺腺癌腫瘤細胞CK7陽性(圖1D)。

2 EGFR基因突變檢測結(jié)果及其與臨床病理特征的關(guān)系

379例NSCLC患者肺癌組織,EGFR突變率為36.15%(137/379),其中18外顯子突變率0.73%(1/137),19外顯子突變率39.42%(54/137),20外顯子突變率3.65%(5/137),21外顯子突變率56.20%(77/137)。其中發(fā)現(xiàn)6例兩個位點同時突變的病例,包括4例21外顯子L858R位點突變合并20外顯子T790M位點突變,2例19外顯子缺失突變合并21外顯子L858R位點突變。

在379例NSCLC患者中,女性患者EGFR突變率(56.59%,73/129)顯著高于男性患者(25.60%,64/250);腺癌患者EGFR突變率(60.00%,129/215)顯著高于鱗癌患者(6.32%,6/95),非吸煙患者EGFR突變率(54.23%,109/201)顯著高于吸煙患者(15.73%,28/178),年齡<60歲患者EGFR突變率(39.11%,70/179)略高于年齡≥60歲患者(33.50%,67/200),但差異無統(tǒng)計學意義(χ2=1.286,P>0.05)。

圖1 非小細胞肺癌的病理學特征。A,鱗狀細胞癌HE染色;B,腺癌HE染色;C,鱗狀細胞癌中CK5/6表達的免疫組織化學染色;D,腺癌中CK7表達的免疫組織化學染色;比例尺,100μmFig. 1 Pathological features of non-small cell lung cancer. A, HE staining of squamous cell carcinoma; B, HE staining of adenocarcinoma; C, immunohistochemical staining of CK5/6 expression in squamous cell carcinoma; D, immunohistochemical staining of CK7 expression in adenocarcinoma; scale bar, 100μm

表1 非小細胞肺癌患者EGFR/ALK/ROS1基因突變與臨床特征的相關(guān)性Tab.1 Correlation between EGFR/ALK/ROS1 gene mutations and clinical features in patients with non-small cell lung cancer

3 ALK融合基因表達及其與臨床病理特征的關(guān)系

379例NSCLC患者肺癌組織,ALK融合基因陽性率3.43%(13/379),其中M1型[EML4-ALK(E13;A20)]4例、M2型[EML4-ALK(E6;A20)]3例、M3型[EML4-ALK(E20;A20)]3例、M4型[EML4-ALK(E15del60;del71A20)]1例、M6型 [EML4-ALK(E18;A20)]2例,未檢測到M5、M7、M8、M9、M10、M11、M12、M13和 M14 型。

379例NSCLC患者中女性患者ALK融合基因陽性率(4.65%,6/129)略高于男性患者(2.80%,7/250),但差異無顯著性(χ2=0.88,P>0.05);腺癌患者ALK融合基因陽性率(4.65%,10/215)略高于鱗癌患者(1.05%,1/95),但無統(tǒng)計學意義(χ2=2.493,P>0.05);年齡<60歲患者ALK融合基因陽性率(4.47%,8/179)高于年齡≥60歲患者(2.50%,5/200),但兩者差異無統(tǒng)計學意義(χ2=1.106,P>0.05);非吸煙患者ALK融合基因陽性率(4.98%,10/201)高于吸煙患者(1.69%,3/178),但差異也無顯著性(χ2=3.084,P>0.05)。

4 ROS1融合基因檢測結(jié)果及其與臨床病理特征的關(guān)系

379例NSCLC患 者 肺 癌 組 織,ROS1融合基因陽性率3.17%(12/379),其中M8型 [CD74-ROS1(CD6;R34)]9例、M3型 [CD74-ROS1(CD6;R32)]1例(其中1例為M3和M8雙融合陽性)、M7型[SLC34A2-ROS1(SL14del;R34)]1例、M12型 [LRIG3-ROS1(LR16;R35)]1例、M14型[GOPC-ROS1(GO4;R36)]1例,未檢測到M1、M2、M4、M5、M6、M9、M10、M11 和 M13 型。

379例NSCLC患者中女性患者ROS1融合基因陽性率(5.43%,7/129)高于男性患者(2.00%,5/250),兩者差異無統(tǒng)計學意義(χ2=3.258,P>0.05);腺癌患者ALK融合基因陽性率(2.79%,6/215)高于鱗癌患者(2.11%,2/95),兩者差異無統(tǒng)計學意義(χ2=0.123,P>0.05);年齡<60歲患者ALK融合基因陽性率(3.91%,7/179)高于年齡≥60歲患者(2.50%,5/200),兩者差異無統(tǒng)計學意義(χ2=0.613,P>0.05);非吸煙患者ALK融合基因陽性率(3.98%,8/201)高于吸煙患者(2.25%,4/178),兩者差異無統(tǒng)計學意義(χ2=0.925,P>0.05)。

5 EGFR/ALK/ROS1基因融合聯(lián)合檢測

379例NSCLC患者中,對其中77例采用EGFR/ALK/ROS1基因融合聯(lián)合檢測試劑盒進行檢測,發(fā)現(xiàn)EGFR突變率為35.06%(27/77),ALK融合基因陽性率為1.30%(1/77),未檢測出ROS1融合基因。

討 論

據(jù)國家癌癥中心公布的2015年癌癥統(tǒng)計數(shù)據(jù)顯示,我國新發(fā)肺癌患者例數(shù)和死亡例數(shù)已居所有惡性腫瘤之首[1]。近十年來,隨著分子醫(yī)學的進展和靶向藥物的不斷發(fā)現(xiàn),非小細胞肺癌的治療已進入到一個個體化分子靶向精準治療的時代。隨著治療靶點EGFR的發(fā)現(xiàn)和相應靶向藥物EGFR-TKIs的問世,其后針對ALK與ROS1突變的相應的靶向藥物crizotinib也投入臨床NSCLC的靶向治療中。研究表明[2-4],存在EGFR、ALK和ROS1基因突變的NSCLC患者可在相應的靶向治療中獲益,因此檢測EGFR、ALK和ROS1基因突變對于篩選靶向治療適宜患者具有重要的臨床意義。

EGFR是一種跨膜受體酪氨酸激酶,該區(qū)域的激活即磷酸化對癌細胞增殖、生長的相關(guān)信號傳遞具有重要意義。EGFR突變主要包括4種類型:外顯子19缺失突變、外顯子21點突變、外顯子18點突變和外顯子20插入突變,其中19外顯子缺失突變(19del)和21外顯子點突變(L858R)是最常見的對EGFR-TKI治療敏感的突變。本研究檢測379例NSCLC患者, EGFR突變也是以19外顯子和21外顯子突變?yōu)橹鳎瑫r發(fā)現(xiàn)6例兩個位點同時突變的病例,包括4例21外顯子L858R位點突變合并20外顯子T790M位點突變,2例19外顯子缺失突變合并21外顯子L858R位點突變。大量研究結(jié)果顯示[5-7],EGFR突變的發(fā)生率在女性、非吸煙者、腺癌、亞裔人群中發(fā)生頻率較高,本研究發(fā)現(xiàn)女性、腺癌、非吸煙者的EGFR突變率明顯高于男性、鱗癌和吸煙者,且兩者差異有統(tǒng)計學意義。

2007年Rikova等[8]和Soda等[9]分別發(fā)現(xiàn)肺癌中存在EML4-ALK融合基因變異現(xiàn)象,且該基因變異具有致癌性,明確了EML4-ALK融合基因是肺癌的驅(qū)動基因之一。肺癌另一個驅(qū)動基因ROS1與ALK二者氨基酸序列上具有近49%的相似性,而在激酶催化區(qū)的ATP結(jié)合位點同源性高達77%[10]。

國內(nèi)外研究數(shù)據(jù)表明[11-13],ALK融合基因在非小細胞肺癌患者中的陽性率為3%-7%。ROS1融合基因在非小細胞肺癌中的陽性率為1.0%-3.4%[14],且ALK與ROS1兩個基因型的肺癌在臨床特征上也非常相似。本研究檢測結(jié)果顯示,ALK融合基因陽性率3.43%,ROS1融合基因陽性率3.17%,女性、腺癌、年齡<60歲、非吸煙者的ALK融合基因陽性率比較高,但差異無統(tǒng)計學意義,我們認為造成不同差異的原因可能與人種選擇、研究人群的篩選及不同的檢測方法有關(guān)[15],也與本研究中樣本量不夠大有關(guān)。

實驗數(shù)據(jù)顯示E13;A20、E6ins33;A20、E20;A20這三種融合類型的例數(shù)最多,與Sasaki等[16]研究相一致。而ROS1中CD74 exon6;ROS1 exon34融合類型最多,與國內(nèi)學者研究相一致[17]。

本實驗中有77例采用了EGFR、ALK、ROS1聯(lián)合檢測試劑盒,EGFR多基因檢測結(jié)果與單基因檢測結(jié)果基本一致,ALK、ROS1多基因檢測結(jié)果低于單基因檢測結(jié)果,可能與病例數(shù)較少有關(guān)。完成多基因聯(lián)合檢測多需的標本量與單基因檢測所需的標本量相同,同時檢測周期可縮短1天。

目前非小細胞肺癌中需要檢測靶點越來越多,為了提高檢測的有效性同時兼顧技術(shù)的可行性,專家組推薦使用經(jīng)過認證的多靶點檢測技術(shù),對EGFR、ALK、ROS1同時檢測[18]。本研究中有77例使用了EGFR、ALK、ROS1聯(lián)合檢測試劑盒,與以往的單獨分別檢測比較既節(jié)約了組織,又提高了檢測效率、縮短了檢測時間,是一種適用于臨床的高效、經(jīng)濟、快速的NSCLC驅(qū)動基因突變檢測平臺。

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