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染色體微陣列技術(shù)在復(fù)發(fā)性流產(chǎn)病因診斷中的應(yīng)用*

2018-11-15 07:32:44熊佳麗王晶董一善劉建兵虞斌顧建東
關(guān)鍵詞:三體數(shù)目絨毛

熊佳麗,王晶,董一善,劉建兵,虞斌,顧建東

(南京醫(yī)科大學(xué)附屬常州婦幼保健院1.婦產(chǎn)科,2.實驗室,江蘇 常州 213000)

自然流產(chǎn)在妊娠人群中的發(fā)生率達10%~15%[1],多為妊娠12周前的早期流產(chǎn)。復(fù)發(fā)性流產(chǎn)指同一性伴侶連續(xù)發(fā)生3次及3次以上的自然流產(chǎn)。復(fù)發(fā)性流產(chǎn)患者隨著流產(chǎn)次數(shù)的增加,月經(jīng)失調(diào)、宮腔粘連、繼發(fā)不孕的發(fā)生風(fēng)險不斷增加,患者及其家庭的悲傷、焦慮等不良情緒顯著增加,故目前普遍認(rèn)為連續(xù)發(fā)生2次流產(chǎn)即應(yīng)當(dāng)重視并進行評估。自然流產(chǎn)常見的原因包括胚胎染色體異常、免疫失衡、內(nèi)分泌異常、血栓形成傾向、生殖道畸形或發(fā)育不良、生殖道感染及宮頸機能不全等,其中胚胎染色體異常率在早期自然流產(chǎn)中約占50%~60%[2-3]。因此,胚胎或絨毛組織的染色體檢測分析對本次自然流產(chǎn)的病因診斷具有重要意義,為今后的生育指導(dǎo)提供重要信息。

染色體微陣列分析(chromosomal microarray analysis, CMA)是一項新興的以微陣列為基礎(chǔ)的染色體分析技術(shù),對全基因組進行掃描,可檢出拷貝數(shù)變異(copy number variation, CNV)<1 kb的微缺失和微重復(fù),突破了以往的細(xì)胞核型分析只能發(fā)現(xiàn)5 mb以上遺傳物質(zhì)改變的技術(shù)局限性,且無需組織或細(xì)胞培養(yǎng),避免母體污染,故而將CMA技術(shù)應(yīng)用在自然流產(chǎn)的病因診斷中是很有指導(dǎo)意義的。本研究采用CytoScan 750K基因芯片(美國Affymetrix公司)對61例自然流產(chǎn)患者(流產(chǎn)次數(shù)≥2次)的胚胎絨毛組織進行CMA檢測分析,探討CMA技術(shù)在復(fù)發(fā)性流產(chǎn)病因診斷中的臨床應(yīng)用價值,并對夫妻雙方再次生育進行遺傳風(fēng)險評估和指導(dǎo),現(xiàn)報道如下。

1 資料與方法

1.1 研究對象

選取2015年9月-2017年6月南京醫(yī)科大學(xué)附屬常州婦幼保健院婦科就診,自然流產(chǎn)次數(shù)≥2次,經(jīng)陰道超聲確認(rèn)胚胎停止發(fā)育需行清宮術(shù)的孕婦61例,選取無菌清宮術(shù)取出的胚胎絨毛組織進行CMA(芯片)檢測。患者年齡22~42歲,平均29.9歲;孕周6.43~13周,平均8.86周;流產(chǎn)次數(shù)2~4次。所有患者均簽署CMA(芯片)檢測知情同意書。

1.2 材料與試劑

人類組織DNA提取試劑盒(德國Qiagen公司),NspⅠ酶、T4連接酶、PCR純化試劑盒、片段化及標(biāo)記試劑盒、CytoScan 750K(55萬個CNV探針+20萬個SNP探針)芯片試劑盒(美國Affymetrix公司),PCR擴增試劑盒(美國Clontech公司)。

1.3 儀器與設(shè)備

雜交儀Genechip hybridization oven 645、洗滌工作 站GeneChip?Fluidics Station、 掃 描 儀GeneChip?Scanner GCS 3000Dx v.2 System均采用美國Affymetrix公司生產(chǎn)。

1.4 實驗方法

無菌清宮術(shù)中獲取的新鮮胚胎組織,經(jīng)生理鹽水沖洗后,用清潔、鋒利的手術(shù)剪剪取絨毛組織約20~100 mg,置于裝有生理鹽水的1.5 ml離心管中,并于1 h內(nèi)送實驗室檢測。所有胚胎絨毛組織采用人類組織DNA提取試劑盒提取全基因組DNA。CMA檢測均嚴(yán)格按照Affymetrix公司提供的標(biāo)準(zhǔn)流程進行,具體步驟簡列如下:取250 ng胚胎絨毛組織DNA經(jīng)Nsp I酶消化為短片段,將NspⅠ消化產(chǎn)物末端補齊后經(jīng)T4連接酶連接上共同引物,并進行PCR擴增、純化,經(jīng)片段化及標(biāo)記后與雜交液混合均勻,變性后加載于Cyto Scan 750K芯片并置于雜交儀中50℃ 60 r/min,雜交16~18 h;經(jīng)洗滌工作站洗脫染色后用掃描儀捕獲圖像,獲取原始數(shù)據(jù)。

1.5 結(jié)果判讀

CMA獲得的原始數(shù)據(jù)應(yīng)用Affymetrix Chromosome Analysis Suite Software 進行分析。參照國際基因組CNV多態(tài)性數(shù)據(jù)庫DGV(http://dgv.tcag.ca/dgv/app/home)、OMIM(http://www.omim.org)、DECIPHER(http://decipher.sanger.ac.uk)、ISCA(http://clinicalgenome.org)等數(shù)據(jù)庫以及相關(guān)文獻判讀CNVs。CMA結(jié)果解讀報告嚴(yán)格按照美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)會對基因芯片拷貝數(shù)變異結(jié)果解讀指南[5],將CNV分為3個等級:①致病性CNV;②不確定臨床意義的CNV;③非致病性CNV。

1.6 統(tǒng)計學(xué)方法

數(shù)據(jù)分析采用SPSS 17.0統(tǒng)計軟件,計數(shù)資料采用頻數(shù)及率表示,比較采用χ2檢驗或者Fisher確切概率法,P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 染色體異常的類型及各類型分布

篩選入組的61例自然流產(chǎn)患者胚胎絨毛組織樣本進行CMA檢測,均獲得診斷結(jié)果,檢測成功率為100%,其中36例樣本CMA檢測發(fā)現(xiàn)異常結(jié)果,陽性率59.0%,包括染色體數(shù)目異常31例(86.1%),染色體結(jié)構(gòu)異常4例(11.1%),整套染色體單親二倍體1例(2.7%)。首先,在31例染色體數(shù)目異常結(jié)果中發(fā)現(xiàn)常染色體三體23例、性染色體數(shù)目異常3例、嵌合體3例及三倍體2例。本研究中發(fā)現(xiàn)的常染色體數(shù)目異常中以16三體最為多見,其次為9三體、21三體及22三體;3例性染色體數(shù)目異常均為X單體。其次,本研究中發(fā)現(xiàn)4例染色體結(jié)構(gòu)異常,包括貓叫綜合征1例、Y染色體微缺失1例及2P24.3微重復(fù)1例,另有1例12q微重復(fù)(780 kb)經(jīng)數(shù)據(jù)庫查詢臨床意義不確定,該例患者共自然流產(chǎn)3次,前兩次孕2個月經(jīng)陰道B超均未探及胎心。見表1。

表1 36例自然流產(chǎn)患者胚胎絨毛組織CMA檢測異常結(jié)果

2.2 染色體異常在不同孕周中的分布情況

61例樣本中,以8周前的復(fù)發(fā)性流產(chǎn)最為多見,占34.4%,經(jīng)CMA檢測,其異常率也最高,達85.7%。同時,流產(chǎn)時間發(fā)生越早,胎兒染色體異常率呈增高的趨勢。見表2。

2.3 不同年齡階段的染色異常情況

高齡婦女流產(chǎn)組織染色體數(shù)目異常率高達81.8%,高于低齡婦女(81.8% vs 26.0%)(P<0.05)。見表3。

2.4 流產(chǎn)次數(shù)與染色體異常分布情況

61例樣本中,流產(chǎn)次數(shù)為2次的患者共46例、3次為13例、4次為2例。其中以2次流產(chǎn)中出現(xiàn)染色體異常最為多見,異常率達60.9%,隨著流產(chǎn)次數(shù)的增加,異常率呈逐漸下降趨勢。見表4。

表2 不同孕周染色體異常分布情況

表3 不同年齡階段染色體異常比較

表4 不同流產(chǎn)次數(shù)與染色體核型異常分布情況

3 討論

CMA這一遺傳學(xué)診斷技術(shù),最大特點的就是一次檢測即能夠?qū)φ麄€基因組拷貝數(shù)進行高通量、高分辨率、高敏感性掃描和分析,能夠精確定位變異區(qū)段的位置、清除顯示該區(qū)段的內(nèi)的基因含量,并能夠?qū)蜻M行分析,在基因水平上解釋患者的臨床表現(xiàn),并評估預(yù)后,故CMA 能夠較其他染色體分析技術(shù),能更有效地檢出由于染色體導(dǎo)致的流產(chǎn),并通過對夫妻雙方相應(yīng)位點的檢測,對再次生育進行遺傳風(fēng)險評估,具有其他染色體分析技術(shù)所無法比擬的優(yōu)越性[6]。

本研究對61例流產(chǎn)樣本進行了CMA檢測,成功率達100%。發(fā)現(xiàn)染色體異常36例,陽性率為59.0%,其中數(shù)目異常31例,占86.1%,是導(dǎo)致胚胎流產(chǎn)的主要原因。絕大多數(shù)染色體非整倍體為胚胎期致死性,其中16三體所占比例最高,其次為Turner綜合征,9、22和21三體也占較大的比例,而其他染色體三體所占比例較低。非整倍體多數(shù)在孕早期發(fā)生流產(chǎn),16三體一般在孕早期流產(chǎn),少數(shù)9、21三體及Turner綜合征病例流產(chǎn)可發(fā)生于孕中期甚至晚期[2-3,7]。若流產(chǎn)胚胎存在非整倍異常,那么這將是導(dǎo)致流產(chǎn)的根本原因。絕大多數(shù)染色體非整倍體為新發(fā)或者偶發(fā),因此建議患者自然妊娠,做好常規(guī)檢查、早中孕篩查、產(chǎn)前診斷。而13、15號染色體和21、22號染色體有發(fā)生羅伯遜易位的可能,再發(fā)風(fēng)險高,故建議夫妻雙方做核型分析,以排除羅伯遜易位,對再發(fā)風(fēng)險進行評估[8]。孕婦年齡常為染色體數(shù)目異常的高危因素,而本組患者年齡>35歲發(fā)生染色體數(shù)目異常共21例。因此對染色體數(shù)目異常的篩查不應(yīng)該僅僅關(guān)注高齡人群,因為這些異常應(yīng)該是由于非年齡因素所致。

本研究共檢出4例染色體結(jié)構(gòu)異常,占13.8%,遠(yuǎn)高于以往研究6%的結(jié)論[9],其原因為核型分析分辨率低,對染色體結(jié)構(gòu)異常的檢出率遠(yuǎn)低于CMA。2例樣本在染色體發(fā)生部分缺失和(或)重復(fù)。其中1例檢測結(jié)果顯示:①arr[hg19]5p15.33p15.2(113 576-10 720 924)×110 607 kb致病性變異;②arr[hg19]11p15.5p15.4(230 680-9 273 889)×39 043 kb 致病性變異。該患者染色體在5p15.33p15.2區(qū)段有10 607 kb片段缺失,內(nèi)含8個致病基因,11p15.5p15.4區(qū)段有9 043 kb片段重復(fù)。其臨床表現(xiàn)為:出生后尖銳的貓叫樣哭聲,智力低下,整體發(fā)育遲緩,小頭畸形及異常面容,語言發(fā)育遲緩,生長發(fā)育遲緩,并可能伴有先天性心臟病、神經(jīng)及腎臟相關(guān)的異常和畸形[10-11]。針對此類患者,考慮為流產(chǎn)兒父母雙方一方可能為4號、9號染色體的平衡易位的攜帶者。故建議雙方均需行染色體檢查,以此來確認(rèn)胎兒異常的來源并為再次妊娠提供產(chǎn)前診斷依據(jù)。

綜上所述,CMA技術(shù)用于自然流產(chǎn)胚胎組織的染色體分析成功率高,分辨率高,>5 Mb的CNV亦能檢測出,在常規(guī)染色體核型分析中很難或不能被發(fā)現(xiàn)而導(dǎo)致漏診;其次CMA檢測對標(biāo)本取材要求遠(yuǎn)低于傳統(tǒng)染色體核型分析技術(shù),不需要活細(xì)胞,可以直接提取流產(chǎn)絨毛及死胎組織,能夠提供快速、準(zhǔn)確的流產(chǎn)物全基因組分析,能夠檢測染色體數(shù)目異常、結(jié)構(gòu)異常、嵌合體等,且無需標(biāo)本培養(yǎng)。其有效克服了現(xiàn)有其他染色診斷技術(shù)的缺點,準(zhǔn)確地檢驗出常規(guī)核型能發(fā)現(xiàn)的非平衡染色體變異,以后核型技術(shù)無法檢測到的拷貝數(shù)變異,將染色體的診斷水平提高到基因水平,在遺傳學(xué)分析中表現(xiàn)出明顯優(yōu)勢,可以讓那些發(fā)生復(fù)發(fā)性流產(chǎn)的患者減少不必要的檢查和治療,為流產(chǎn)病因分析和對夫妻雙方再次生育指導(dǎo)提供更有價值的信息。

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