周炎,丁松爽,趙莉,趙世民,史宏志,楊惠娟
1 河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 國(guó)家煙草栽培生理生化基地,河南 鄭州 450002;2 河南省煙草公司 洛陽市公司,河南 洛陽 471026
隨著全球的氣候變暖,人類及動(dòng)植物所面臨的生態(tài)問題愈加嚴(yán)峻。對(duì)于作物生長(zhǎng)來說,水資源短缺導(dǎo)致的干旱問題正是亟待解決的問題之一[1]。干旱導(dǎo)致植物失水,體內(nèi)活性氧積累,對(duì)組織造成傷害,造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失。煙草是我國(guó)重要的經(jīng)濟(jì)作物,也是常用的模式植物。研究煙草對(duì)干旱脅迫的生理響應(yīng)可為培育煙草耐旱品種提供理論依據(jù),也可為其他作物的抗旱研究提供思路。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)近年來在多領(lǐng)域均有廣泛應(yīng)用,植物的干旱脅迫也是較為熱門的研究領(lǐng)域,但目前以煙草為對(duì)象,以轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?yàn)槭侄窝芯科鋵?duì)干旱脅迫信號(hào)響應(yīng)的文章尚不多見。
LY1306是由系統(tǒng)選育的G80變異株系依次與K326、89112雜交育成的適應(yīng)性強(qiáng)、抗性好、易烘烤的烤煙品系,該品系較適應(yīng)丘陵山區(qū)的氣候條件,在干旱少雨、灌溉不充分的地區(qū)生長(zhǎng)較好,表現(xiàn)出明顯的抗旱特性[2]。對(duì)LY1306品系的抗旱機(jī)理的研究可以深入了解該品系的抗旱特性。本文通過PEG模擬干旱條件并結(jié)合轉(zhuǎn)錄組分析,闡述了干旱脅迫條件下LY1306品系煙葉的生理變化及應(yīng)激響應(yīng)基因表達(dá)組學(xué)特征,繼而為煙草抗旱育種奠定基礎(chǔ)。
實(shí)驗(yàn)于2015年至2016年于河南農(nóng)業(yè)大學(xué)國(guó)家煙草栽培生理生化基地實(shí)施, 供試品系為L(zhǎng)Y1306,設(shè)置3個(gè)處理,分別是15%PEG-6000處理0 h、16 h、24 h,每個(gè)處理3個(gè)重復(fù)。運(yùn)用漂浮育苗培育LY1306 46 d,煙草幼苗長(zhǎng)至4片葉后移栽至珍珠石中,以MS培養(yǎng)基(不含糖,不含瓊脂)為營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)培養(yǎng)。移栽后23 d,選取長(zhǎng)勢(shì)相同的煙株進(jìn)行處理。分別在移入15%PEG-6000前和移入后16 h、24 h時(shí),選取煙草葉片(統(tǒng)一選取大于5 cm葉片,從上往下數(shù)第4和第5片葉子),液氮速凍后,保存于-70℃ 冰箱。并將3個(gè)重復(fù)樣品等量混合,提取RNA,對(duì)其進(jìn)行后續(xù)的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析。另外選取長(zhǎng)勢(shì)相同的未處理煙苗作為對(duì)照組(CK),在每次取樣前分別拍照記錄實(shí)驗(yàn)組和處理組的葉片狀態(tài)。
采用小液流法測(cè)定葉片水勢(shì)。
超氧化物歧化酶(SOD),過氧化物酶(POD)和過氧化氫酶(CAT)的活性測(cè)定均采用蘇州科銘生物技術(shù)有限公司生產(chǎn)的相應(yīng)微量法試劑盒。
分別采用蘇州科銘生物技術(shù)有限公司的丙二醛(malondialdehyde,MDA)微量法試劑盒和脯氨酸(PRO)微量法試劑盒測(cè)定樣品中MDA和PRO含量。
樣品總RNA提取由上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司進(jìn)行。DNase消化DNA后,用帶有Oligo(dT)的磁珠富集真核生物mRNA;加入打斷試劑將mRNA打斷成短片段,以打斷后的mRNA為模板, 用六堿基隨機(jī)引物合成一鏈cDNA,二鏈合成反應(yīng)體系合成二鏈cDNA,在cDNA二鏈合成時(shí)以dUTP代替dTTP,連接不同接頭,再利用UNG酶法將含有dUTP的一條鏈進(jìn)行消化,只保留連接不同接頭的cDNA一鏈;采用試劑盒純化cDNA一鏈;純化的cDNA一鏈進(jìn)行末端修復(fù)、加A尾并連接測(cè)序接頭,再進(jìn)行片段大小選擇,最后進(jìn)行PCR擴(kuò)增;構(gòu)建好的文庫(kù)用Agilent 2100 Bioanalyzer質(zhì)檢合格后,使用Illumina HiSeqTM 2500測(cè)序儀進(jìn)行測(cè)序。
由Illumina HiSeqTM2500測(cè)序所得的數(shù)據(jù)經(jīng)質(zhì)控(QC)過濾得到clean reads,用tophat/bowtie2將clean reads比對(duì)到參考序列。再通過統(tǒng)計(jì)reads在參考序列上的分布情況及覆蓋度,判斷比對(duì)結(jié)果是否通過第二次質(zhì)控(QC of alignment)。通過后進(jìn)行一系列后續(xù)分析,依據(jù)DESeq[3]軟件包中的NB(負(fù)二項(xiàng)分布檢驗(yàn)的方式)對(duì)reads數(shù)進(jìn)行差異顯著性檢驗(yàn),并采用basemean值來估算表達(dá)量。并從基因表達(dá)結(jié)果中,篩選FC>2,且P<=0.05的基因?yàn)闃悠烽g差異表達(dá)的基因。
對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行GO(Gene Ontology)富集分析,結(jié)合GO注釋結(jié)果對(duì)其功能進(jìn)行描述。統(tǒng)計(jì)每個(gè)GO條目中所包括的差異基因個(gè)數(shù),并用超幾何分布檢驗(yàn)方法計(jì)算每個(gè)GO條目中差異基因富集的顯著性。利用KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)差異基因進(jìn)行Pathway分析,并用超幾何分布檢驗(yàn)的方法計(jì)算每個(gè)Pathway條目中差異基因富集的顯著性。分析結(jié)果top20按照每個(gè)條目對(duì)應(yīng)的-log10Pvalue排序,同時(shí)過濾掉包含差異基因數(shù)目小于3的條目。
經(jīng)過對(duì)比可以看出(圖1),PEG處理16 h后,烤煙LY1306品系葉片出現(xiàn)少量失水癥狀,葉尖發(fā)軟。處理24 h后,葉尖葉緣出現(xiàn)失水萎蔫癥狀。但總體來說,與對(duì)照組相比萎蔫癥狀不明顯。
圖1 15%PEG-6000處理不同時(shí)間對(duì)烤煙LY1306品系葉片狀態(tài)的影響Fig.1 Influence of 15% PEG-6000 treatment of different duration on leaf status
在實(shí)驗(yàn)中,葉片水勢(shì)隨著干旱處理時(shí)間的延長(zhǎng)而降低,且前16 h水勢(shì)下降較多,比0 h下降了20.6%,16 h后水勢(shì)下降較少,24 h比0 h降低了26.5%(圖2)。
圖2 15%PEG-6000處理不同時(shí)間對(duì)烤煙LY1306品系葉片水勢(shì)的影響Fig.2 Influence of 15% PEG-6000 treatment of different duration on leaf water potential
實(shí)驗(yàn)表明(圖3,圖4),隨干旱脅迫時(shí)間的延長(zhǎng),SOD和POD活性隨干旱脅迫時(shí)間的延長(zhǎng)均呈現(xiàn)出上升趨勢(shì),但上升速率不同。SOD活性前期上升緩慢,后期迅速上升,16 h與24 h時(shí)分別是0 h的1.13倍和2.75倍。POD活性隨干旱脅迫時(shí)間的延長(zhǎng)逐漸增強(qiáng),且前期上升速度與SOD相比更快。16 h、24 h時(shí)POD活性分別為0 h的2.56倍和4.2倍。與SOD、POD相反,CAT活性隨干旱脅迫時(shí)間的延長(zhǎng)逐漸下降,且下降速度先慢后快(圖5)。16 h與24 h的CAT活性分別比0 h下降了4.7%和22.8%。
圖3 15%PEG-6000處理下LY1306葉片中SOD活性變化Fig.3 changes of SOD activity in LY1306 leaves under the treatment of 15%PEG-6000
圖4 15%PEG-6000處理下LY1306葉片中POD活性變化Fig.4 changes of POD activity in LY1306 leaves under the treatment of 15%PEG-6000
圖5 15%PEG-6000處理下LY1306葉片中CAT活性變化Fig.5 changes of CAT activity in LY1306 leaves under the treatment of 15%PEG-6000
LY1306葉片中的丙二醛(MDA)含量呈現(xiàn)出先上升后下降的趨勢(shì)(圖6),其峰值出現(xiàn)在16 h。葉片中脯氨酸含量隨著干旱處理時(shí)間的延長(zhǎng)呈現(xiàn)出先上升后趨于平穩(wěn)的趨勢(shì)(圖7)。具體表現(xiàn)為24 h>16 h>0 h。脯氨酸含量在干旱脅迫前16 h迅速增長(zhǎng),比0 h增加了2.8倍;16 h后增長(zhǎng)緩慢,處理24 h葉片脯氨酸含量?jī)H略高于16 h,這與葉片水勢(shì)的變化趨勢(shì)基本吻合。
圖6 15%PEG-6000處理下LY1306葉片中丙二醛(MDA)含量變化Fig.6 changes of MDA content in LY1306 leaves under the treatment of 15%PEG-6000
圖7 15%PEG-6000處理下LY1306葉片中脯氨酸(PRO)含量變化Fig.7 changes of PRO content in LY1306 leaves under the treatment of 15%PEG-6000
上述結(jié)果表明,15%PEG模擬的干旱脅迫下,烤煙品系LY1306葉片中POD和SOD升高較為明顯,但對(duì)干旱信號(hào)的響應(yīng)速度不同;脯氨酸在干旱脅迫發(fā)生后迅速響應(yīng)并大量積累。
3個(gè)樣本(15%PEG-6000處理0 h、16 h、24 h)經(jīng)測(cè)序后分別得到原始序列52493886,53206758,53175198條,經(jīng)質(zhì)控過濾后分別得到干凈序列51423972,51969504,52153830條,其中比對(duì)上參考序列的分別有49135898,49576507,49257835條,占總干凈序列的百分比分別為95.55%,95.39%,94.44%,說明測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量良好。
經(jīng)差異表達(dá)分析,相比于0 h,15%PEG處理16 h的樣本共篩選出3547個(gè)差異表達(dá)基因,其中1589個(gè)基因表達(dá)上調(diào),1958個(gè)基因表達(dá)下調(diào);PEG處理24 h的樣本共篩選出3141個(gè)差異表達(dá)基因,其中1579個(gè)基因表達(dá)上調(diào),1562個(gè)基因表達(dá)下調(diào)。
差異表達(dá)基因GO分類,共對(duì)應(yīng)到生物過程(Biological process,BP)、細(xì)胞組成(Cellular component,CC)和分子功能(Molecular Function,MF)3大類。15%PEG處理16 h樣本的差異基因中,上調(diào)基因共注釋到1331個(gè)條目(圖8)。其中注釋到生物過程、細(xì)胞組成和分子功能的條目數(shù)量分別為741、138和452個(gè)。15%PEG處理24 h的樣本中上調(diào)基因共注釋到1507個(gè)條目(圖9),其中注釋到生物過程、細(xì)胞組成、分子功能的條目數(shù)分別為839、189、479個(gè)。
從圖中可以看出,生物過程中的鹽脅迫響應(yīng)(response to salt stress)、赤霉素響應(yīng)(response to gibberellin),細(xì)胞成分中的細(xì)胞質(zhì)核周區(qū)(perinuclear region of cytoplasm)和分子功能中的轉(zhuǎn)錄因子活性(transcription factor activity)在處理16 h和24 h樣本中均表現(xiàn)為上調(diào)。
經(jīng)過KEGG代謝通路分析(圖10),15%PEG處理16 h的樣本中,差異表達(dá)基因被富集到184個(gè)代謝通路,其中112個(gè)通路發(fā)生上調(diào),141個(gè)通路發(fā)生下調(diào);顯著富集(P<0.05)的通路為36個(gè),其中28個(gè)上調(diào),31個(gè)下調(diào)。PEG處理24 h的樣本差異表達(dá)基因被富集到164個(gè)通路,其中上調(diào)通路117個(gè),下調(diào)通路128個(gè);其中P<0.05發(fā)生顯著富集的共有38個(gè),30個(gè)上調(diào)通路,35個(gè)下調(diào)通路??煽闯鲭S著干旱脅迫時(shí)間的延長(zhǎng),顯著富集的通路數(shù)目無論上調(diào)還是下調(diào)均有所增加。
圖8 15%PEG-6000處理16 h后烤煙LY1306品系相對(duì)于0 h上調(diào)表達(dá)基因GO分析Fig.8 GO analysis of up-regulated genes in LY1306 the flue-cured tobacco line under the treatment of 15%PEG-6000 for 16 h
圖9 15%PEG-6000處理24 h后烤煙LY1306品系相對(duì)于0 h上調(diào)表達(dá)基因GO分析Fig.9 GO analysis of up-regulated genes in LY1306 the flue-cured tobacco line under the treatment of 15%PEG-6000 for 24 h
經(jīng)分析,15%PEG處理16 h的樣品中,苯丙烷生物合成(Phenylpropanoid biosynthesis)、苯丙氨酸代謝(Phenylalanine metabolism)、亞油酸代謝(Linoleic acid metabolism)、萜類合成(Monoterpenoid biosynthesis)、植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)(Plant hormone signal transduction)、氮代謝(Nitrogen metabolism)和α-亞麻酸代謝(alpha-Linolenic acid metabolism)等通路上調(diào)。
苯丙烷生物合成(ko00940)和苯丙氨酸代謝(ko00360)通路中苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase,PAL)、等發(fā)生上調(diào)。亞油酸代謝(ko00591)和α-亞麻酸代謝(ko00592)通路中,脂氧合酶(lipoxygenase,LOX2S)等基因表達(dá)上調(diào)。植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)(ko04075)中的脫落酸、乙烯、茉莉酸途徑均上調(diào)表達(dá)。氮代謝(ko00910)中碳酸酐酶(carbonic anhydrase,CA)基因表達(dá)上調(diào)。
15%PEG處理24 h的樣品中,發(fā)生上調(diào)的代謝通路為植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)(Plant hormone signal transduction)、抗原加工提呈(Antigen processing and presentation)、淀粉蔗糖代謝(Starch and sucrose metabolism)、磷脂酰肌醇信號(hào)系統(tǒng)(Phosphatidylinositol signaling system)和精氨酸脯氨酸代謝(Arginine and proline metabolism)等。
植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)(ko04075)中,脫落酸途徑明顯表達(dá)上調(diào)。生長(zhǎng)素途徑中的生長(zhǎng)素響應(yīng)因子(auxin response factor,ARF)基因和茉莉酸途徑的MYC2轉(zhuǎn)錄因子基因表達(dá)上調(diào)。抗原加工提呈(ko04612)通路中免疫系統(tǒng)的核轉(zhuǎn)錄因子(nuclear transcription factor Y,NFY)等表達(dá)上調(diào)。淀粉蔗糖代謝(ko00500)中6-磷酸海藻糖合成酶(trehalose 6-phosphate synthase,2.4.1.15,otsA)、α-淀粉酶(alpha-amylase ,amyA )、β-淀粉酶(beta-amylase)等表達(dá)上調(diào)。精氨酸脯氨酸代謝(ko00330)中的谷氨酸-5-激酶(glutamate 5-kinase,proB)、δ-1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(delta-1-pyrroline-5-carboxylate synthetase,P5CS)、1-吡咯啉-5-羧酸脫氫酶(1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase)、脯氨酸脫氫酶( proline dehydrogenase,putA)等基因表達(dá)上調(diào)。
圖10 15%PEG處理后烤煙LY1306品系相對(duì)于0 h上調(diào)表達(dá)基因KEGG代謝通路分析Fig.10 KEGG pathway analysis of up-regulated genes in LY1306 the flue-cured tobacco line under the treatment of 15%PEG-6000.
當(dāng)植物遭受干旱脅迫時(shí),體內(nèi)原有的氧化平衡被破壞,細(xì)胞膜脂發(fā)生強(qiáng)烈的過氧化作用,MDA大量積累,對(duì)細(xì)胞產(chǎn)生毒害,導(dǎo)致植株失水甚至死亡[4],SOD、POD、CAT這幾種酶彼此協(xié)調(diào)作用,提高了植株對(duì)活性氧清除的能力[5]。SOD是活性氧清除的第一步,它將活性氧歧化成H2O2,再由POD和CAT進(jìn)一步分解[6]。有研究表明,適度的干旱脅迫誘導(dǎo)能夠提高植物體內(nèi)抗氧化酶活性,降低植物細(xì)胞膜脂過氧化程度[7-8]。
脯氨酸是植物體內(nèi)最有效的一種滲透調(diào)節(jié)物質(zhì),有助于植物細(xì)胞和組織的持水和防止脫水。Kramble等最早在萎蔫的黑麥草葉片中發(fā)現(xiàn)脯氨酸大量積累。有研究表明,水稻幼苗在干旱脅迫下脯氨酸含量增加,并與丙二醛和質(zhì)膜透性呈極顯著相關(guān),脯氨酸還具有清除活性氧的作用[9-11]。
總的來說烤煙LY1306品系中POD、SOD是響應(yīng)PEG模擬干旱的主要抗氧化酶。脯氨酸能迅速響應(yīng)外界信號(hào)并大量積累,其產(chǎn)生機(jī)制受反饋調(diào)節(jié),將葉片水勢(shì)維持在較低水平,防止大量失水并清除部分活性氧,減少細(xì)胞損傷。水勢(shì)的變化與脯氨酸變化基本吻合。
15%PEG處理16 h的葉片中,影響光合作用放氧反應(yīng)和固碳過程的半乳糖脂及碳酸酐酶(CA)表達(dá)上調(diào),維持了干旱脅迫下光合速率的相對(duì)穩(wěn)定[12-13]。
L-苯丙氨酸代謝通路中上調(diào)的苯丙氨酸解氨酶(PAL)是連接初級(jí)代謝和苯丙烷類代謝、催化苯丙烷類代謝第一步反應(yīng)的酶,也是苯丙氨酸代謝途徑的關(guān)鍵酶和限速酶[14],還可以參與植保素的合成,包括酚類、異黃酮類和萜烯類,提高植物防御反應(yīng)。許多植物激素如生長(zhǎng)素、赤霉素和乙烯都可誘導(dǎo)植物PAL基因的表達(dá)。GO及KEGG分析顯示赤霉素等植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑表達(dá)上調(diào)。研究擬南芥幼苗對(duì)滲透脅迫的耐受性發(fā)現(xiàn),赤霉素可響應(yīng)非生物脅迫信號(hào),使植物生長(zhǎng)停滯以增強(qiáng)脅迫耐受性[15-16]。
在亞油酸和α-亞麻酸代謝通路中上調(diào)表達(dá)的脂氧合酶(LOX)在響應(yīng)干旱脅迫過程中有重要作用。在植物中,LOX主要以亞油酸、亞麻酸為底物,參與調(diào)控與生成一些抗性信號(hào)分子如ABA、茉莉酸(JA)及植物揮發(fā)性物質(zhì)等[17-22]。JA不僅本身作為信號(hào)分子參與了對(duì)干旱脅迫的防御反應(yīng),還能誘導(dǎo)PAL等抗逆相關(guān)酶基因的表達(dá),同時(shí)能提高植物體內(nèi)PRO含量和SOD、POD等抗氧化酶活性,提高滲透調(diào)節(jié)能力[23-24]。
本實(shí)驗(yàn)16 h處理中KEGG植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中ABA途徑上調(diào)表達(dá)。ABA是干旱脅迫下植物體內(nèi)主要的信號(hào)傳導(dǎo)物質(zhì),與JA相似的是,ABA也能夠促進(jìn)PRO的積累,清除部分活性氧;同時(shí),ABA能夠促使蔗糖轉(zhuǎn)化為葡萄糖和果糖,有利于提高植物的滲透調(diào)節(jié)能力[25-29],也有研究表明,在非生物脅迫條件下,ABA可以促進(jìn)碳水化合物的積累[30],GO結(jié)果中上調(diào)的糖原(淀粉)合酶活性與之相符。此外ABA還可以通過促進(jìn)氣孔關(guān)閉減少蒸騰失水。
PEG處理24 h樣本的轉(zhuǎn)錄組結(jié)果顯示,植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中ABA、 JA、IAA等上調(diào),與PEG處理16 h的樣本相似。此外,樣本上調(diào)表達(dá)通路還有脯氨酸代謝、糖類合成及代謝、轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控等。
KEGG分析表明,精氨酸脯氨酸代謝通路中參與脯氨酸合成的谷氨酸激酶、δ-1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(P5CS)和負(fù)責(zé)脯氨酸代謝為谷氨酸的1-吡咯啉-5-羧酸脫氫酶(P5CDH)、脯氨酸脫氫酶基因發(fā)生上調(diào)。谷氨酸途徑合成脯氨酸主要是通過谷氨酸激酶(GK)催化生成中間產(chǎn)物△1-吡咯啉-5-羧酸(P5C),再經(jīng)由P5CS和P5CR催化生成脯氨酸[31]。合成途徑中的關(guān)鍵酶GK和P5CS受到脯氨酸的反饋調(diào)控,將脯氨酸濃度控制在適當(dāng)水平[32]。脯氨酸代謝過程中,先經(jīng)由脯氨酸脫氫酶催化為△1-二氫吡咯-5-羧酸(P5C),再由P5CDH催化下氧化為谷氨酸。同時(shí)Iyers等[33]研究發(fā)現(xiàn),P5C等脯氨酸代謝中間產(chǎn)物可誘導(dǎo)水稻細(xì)胞中部分滲透調(diào)節(jié)基因的高效表達(dá)。
GO分類及KEGG代謝通路分析顯示,PEG處理24 h樣本中,糖類合成及代謝活性也發(fā)生上調(diào)。蔗糖合酶、6-磷酸海藻糖合成酶、β-葡萄糖苷酶、α-淀粉酶、β-淀粉酶和葡萄糖6-磷酸異構(gòu)酶(GPI)基因表達(dá)上調(diào)。蔗糖、海藻糖合成量升高,大分子淀粉、纖維素被降解為還原糖,參與植物的滲透調(diào)節(jié)。PEG處理16 h的樣本淀粉合酶活性在ABA誘導(dǎo)下上升,隨著干旱脅迫時(shí)間的延長(zhǎng),大分子糖類逐漸分解,作為滲調(diào)物質(zhì)抵抗干旱脅迫。同時(shí),GPI參與的糖酵解過程可為植株供能。
此外,GO分析顯示CCAAT-盒結(jié)合因子(CBF)的核轉(zhuǎn)錄因子NFY基因表達(dá)量上調(diào)。NFY廣泛存在于植物中,并可參與調(diào)節(jié)多種生理進(jìn)程,如逆境脅迫、葉綠體發(fā)育和光合作用等[34]。有研究發(fā)現(xiàn)[35],與野生型對(duì)照相比,遺傳轉(zhuǎn)化NF-Y家族轉(zhuǎn)錄因子TaNFYB3;1的轉(zhuǎn)基因煙草植株,在干旱和鹽分脅迫處理后,植株的形態(tài)和干物質(zhì)重均顯著提高,葉綠素、可溶性蛋白含量明顯增加,SOD、POD活性顯著增強(qiáng)。
同時(shí)有研究表明[36-37],一些植物激素如乙烯、赤霉素、脫落酸等也能誘導(dǎo) SOD 、POD基因的表達(dá), 其中 ABA對(duì)基因表達(dá)調(diào)控的作用尤為明顯;此外,轉(zhuǎn)錄因子對(duì)SOD、POD基因的表達(dá)調(diào)控作用也十分顯著。GO及KEGG分析表明,不同處理時(shí)間的LY1306葉片中植物激素及轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控發(fā)生上調(diào),與SOD,POD活性的上升趨勢(shì)相符。
綜上所述,植物激素轉(zhuǎn)導(dǎo)、糖類合成代謝、轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控是兩個(gè)處理時(shí)間共同上調(diào)的代謝通路,直接或間接地調(diào)控了SOD、POD及脯氨酸等抗旱相關(guān)物質(zhì)基因的表達(dá)。除此之外,15%PEG-6000處理16 h時(shí),烤煙LY1306品系還主要通過脯氨酸生成和糖類合成調(diào)節(jié)滲透勢(shì),亞油酸代謝和次生代謝來響應(yīng)干旱脅迫;PEG處理24 h時(shí),LY1306主要通過脯氨酸、磷脂、糖類代謝等途徑來響應(yīng)干旱脅迫。可以看出,LY1306有多種應(yīng)對(duì)干旱脅迫的方式,各通路互為補(bǔ)充,互相串聯(lián),共同對(duì)抗不同程度的干旱脅迫。
在15%PEG模擬的干旱脅迫條件下,烤煙LY1306品系能迅速通過植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、亞油酸代謝和次生代謝等多種方式放大并傳遞脅迫信號(hào),誘導(dǎo)SOD、POD和脯氨酸的表達(dá),導(dǎo)致干旱脅迫下煙葉SOD、POD活性和脯氨酸含量大大增加。同時(shí)轉(zhuǎn)錄因子等途徑也被激活,對(duì)抵御干旱起到一定的作用。但烤煙LY1306品系的具體抗旱機(jī)制仍有待深入研究。
[1]邵艷軍,山侖.植物耐旱機(jī)制研究進(jìn)展[J].中國(guó)生態(tài)農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào),2006,(04):16-20.SHAO Yanjun,SHAN Lun.Advances in the studies on drought tolerance mechanism of plants[J].Chinese Journal of Eco-Agriculture, 2006, 14(4): 16-20.
[2]趙莉, 楊惠娟, 趙世民, 等.烤煙新品系LY1306煙葉質(zhì)量評(píng)價(jià)與分析[J].江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào), 2017, 29(01): 57-61,68.ZHAO Li,YANG Huijuan,ZHAO Shimin, et al.Leaf Quality Evaluation and Analysis of Flue-cured Tobacco New Line LY1306[J].Acta Agriculturae Jiangxi, 2017, 29(01): 57-61,68.
[3]Anders S,Huber W.Differential expression of RNA-Seq data at the gene level-the DESeq package.2012.
[4]邵艷軍,山侖,李廣敏.干旱脅迫與復(fù)水條件下高粱、玉米苗期滲透調(diào)節(jié)及抗氧化比較研究[J].中國(guó)生態(tài)農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào),2006,14(1).68-70.SHAO YanJun,SHAN Lun,LI Guangmin.Comparison of osmotic regulation and antioxidation between sorghum and maize seedlings under soil drought stress and water recovering conditions[J].Chinese Journal of Eco-Agriculture, 2006, 14(1).68-70.
[5]夏新莉, 鄭彩霞, 尹偉倫.土壤干旱脅迫對(duì)樟子松針葉膜脂過氧化、膜脂成分和乙烯釋放的影響[J].林業(yè)科學(xué), 2000, 36(3):8-12.XIA Xinli,ZHENG Caixia,YIN Weilun.Effect of drought stress on the peroxidation of membrane lipids, the composition of membrane fatty acids and ethylene evolutionof needles of pinus sylvestris var.mongolica litv[J].Scientia Silvae Sinicae, 2000,36(3): 8-12.
[6]鐘鵬, 朱占林, 李志剛, 等.PEG處理對(duì)大豆幼苗活力及膜系統(tǒng)修復(fù)的影響[J].中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào), 2004, (3):126-128+164.ZHONG Peng, ZHU Zhanlin, LI Zhigang, et , al.Effect of PEG on vigour index and membrane systems repair in different genetypical soybean seedings[J].Chinese Agricultural Science Bulletin, 2004,(3):126-128+164.
[7]楊春雷,林國(guó)平,楊久紅,等.煙草種子滲透調(diào)節(jié)技術(shù)及機(jī)理研究[J].中國(guó)煙草學(xué)報(bào), 2009, 15(02): 50-54.YANG Chunlei,LIN Guoping,YANG Jiuhong,et al.Study on technique and mechanism of osmocondition in tobacco seed[J].Acta Tabacaria Sinica, 2009, 15(02): 50-54.
[8]LIU Zhiling,CHENG Dan.Plant drought-resistant physiology research progress and breeding[J].Chinese Agricultural Science Bulletin, 2011, 27(24): 249-252 (in Chinese).
[9]宗會(huì),劉娥娥,郭振飛,等.干旱、鹽脅迫下LaCl3和 CPZ 對(duì)稻苗脯氨酸積累的影響[J].作物學(xué)報(bào), 2001, (02): 173-177.ZONG Hui,LIU E’e,GUO Zhenfei,et al.Effects of LaCl3 and CPZ on proline accumulation of rice seedling under drought and salt stresses[J].Acta Agronomica Sinica, 2001, (02): 173-177.
[10]劉娥娥,宗會(huì),郭振飛,等.干旱、鹽和低溫脅迫對(duì)水稻幼苗脯氨酸含量的影響[J].熱帶亞熱帶植物學(xué)報(bào), 2000, (03): 235-238.LIU E’e,ZONG Hui,GUO Zhenfei,et al.Effects of drought,Salt and chilling stresses on proline accumulation in shoot of rice seedlings[J].Journal of Tropical and Sub tropical Botany, 2000,(03): 235-238.
[11]Jiang MY,Guo SC,Zhang XM.Proline accumulation in rice seedings exposed to hydroxylradical stress in relation to antioxidation [J].Chin.Sci.Bull,1997, 42.
[12]陽振樂.光合膜雙半乳糖脂與光系統(tǒng)Ⅱ核心復(fù)合物的相互作用[A].中國(guó)生物物理學(xué)會(huì).第九次全國(guó)生物物理大會(huì)學(xué)術(shù)會(huì)議論文摘要集[C].中國(guó)生物物理學(xué)會(huì), 2002:1.YANG Zhenle.The interaction between photosynthetic membrane Bi gal and photosystem II core complex[A].Biophysical Society of China, 2002:1.
[13]蔣春云,馬秀靈,沈曉艷,等.植物碳酸酐酶的研究進(jìn)展[J].植物生理學(xué)報(bào),2013, 49(06):545-550.JIANG Chunyun,MA Xiuling,SHEN Xiaoyan,et al.Progress in research on plant Carbonic Anhydrase[J].Plant Physiology Journal.2013, 49(06): 545-550.
[14]高雪.植物苯丙氨酸解氨酶研究進(jìn)展[J].現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技, 2009,(01): 30-33.GAO Xue.Advances in plant phenylalanine ammonia lyase[J].Modern Agricultural Science And Technology, 2009, (01): 30-33.
[15]SkiryczA, ClaeysH, DeBodtS, et al.Pause-and-stop:the effectsofosm otic stress on cell proliferation during early leaf development in Arabidopsis and a role for ethylene signaling in cell cyclearrest[J].Plant Cell, 2012, (5): 1876-1888.
[16]崔建東,李艷,牟德華.苯丙氨酸解氨酶(PAL)的研究進(jìn)展[J].食品工業(yè)科技, 2008, (07): 306-308.CUI Jiandong,LI Yan,MOU Dehua.Research progress of Phenylalanine ammonia lyase[J].Science and Technology of Food Industry, 2008, (07): 306-308.
[17]Feussner I,Wasternack C.The lipoxygenase pathway[J].AnnuRev Plant Biol, 2002, 53: 275-297.
[18]蔣科技,皮妍,侯嶸,等.植物內(nèi)源茉莉酸類物質(zhì)的生物合成途徑及其生物學(xué)意義[J].植物學(xué)報(bào), 2010, 45(02): 137-148.JIANG Keji,PI Yan,HOU Rong,et al.Jasmonate biosynthetic pathway: its physiological role and potential application in plant secondary metabolic engineering[J].Chinese Bulletin of Botany,2010, 45(02): 137-148.
[19]劉華山,陳平華,楊素勤,等.茉莉酸對(duì)烤煙煙苗生長(zhǎng)的影響[J].中國(guó)煙草學(xué)報(bào), 2000, (01):36-39.LIU Huashan,CHEN Pinghua,YANG Suqin,et al.Effect of jasmonic acid on the growth of tobacco seedlings[J].Acta Tabacaria Sinica, 2000, (01):36-39.
[20]葛云俠,姚允聰,張杰,等.干旱脅迫對(duì)杏脂氧合酶活性的影響[J].果樹學(xué)報(bào), 2007, (01): 102-104.GE Yunxia,YAO Yuncong,ZHANG Jie,et al.Relationship between lipoxygenase activity and senescence in apricotleaves under drought stress.Journal of Fruit Science, 2007, (01): 102-104.
[21]Yang XY, Jiang WJ, Yu HJ.The expression profiling of the lipoxygenase (LOX) family genes during fruit development, abiotic stress and hormonal treatments in cucmber (Cucumis sativus L.) [J].Int J Mol Sci, 2012, 13: 2481-2500.
[22]曹嵩曉,張沖,湯雨凡,等.植物脂氧合酶蛋白特性及其在果實(shí)成熟衰老和逆境脅迫中的作用[J].植物生理學(xué)報(bào), 2014,50(08): 1096-1108.CAO Songxiao,ZHANG Chong,TANG Yufan,et al.Protein characteristic of the plant lipoxygenase and the function on fruit ripening and senescence and adversity stress[J].Plant Physiology Journal, 2014, 50(08): 1096-1108.
[23]潘瑞熾,古煥慶.茉莉酸甲酯對(duì)花生幼苗生長(zhǎng)和抗旱性的影響[J].植物生理學(xué)報(bào), 1995, (03): 215-220.PAN Ruichi,GU Huanqing.Effect of methyl jasmonate on the growth and drought resistance, in peanut seedlings.Acta Phytophysiologica Sinica, 1995, (03): 215-220.
[24]汪新文.茉莉酸參與植物逆境脅迫的研究進(jìn)展[J].安徽農(nóng)學(xué)通報(bào), 2008, (06): 29-35+24.WANG Xinwen.Advances in research on jasmonic acid participating in plant stress[J].Anhui Agricultural Science Bulletin,2008, (06): 29-35+24.
[25]王霞,候平,尹林克,等.土壤緩慢水分脅迫下檉植物內(nèi)源激素的變化[J].新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào), 2000, 23(4): 41- 43.WANG Xia,HOU Ping,YIN Linke,et al.Change of hormone of tamarix under slow soil-water stress[J].Journal of Xinjiang Agricultural University, 2000, 23(4): 41- 43.
[26]史吉平,李廣敏,池書敏.鈣對(duì)水分脅迫條件下玉米幼苗內(nèi)源激素含量的影響[J].河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào), 1994, 17(3): 48- 51.SHI Jiping,LI Guangmin,CHI Shumin.The effect of Ca2+on endogenous hormones of maize seedlings under water stress[J].Journal of Hebei Agricultural University, 1994, 17(3): 48- 51.
[27]陳立松,劉星輝.水分脅迫對(duì)荔枝葉片內(nèi)源激素含量的影響[J].熱帶作物學(xué)報(bào), 1999, 20(3): 31- 35.CHEN Lisong,LIU Xinghui.Effect of water stress on endogenous hormone content in litchi leaves[J].Chinese Journal of Tropical Crops, 1999, 20(3): 31- 35.
[28]潘根生,吳伯千,沈生榮,等.水分脅迫過程中茶樹新梢內(nèi)源激素水平的消長(zhǎng)及其與耐旱性的關(guān)系[J].中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué), 1996,29(5): 9-15.PAN Gensheng,WU Boqian,SHEN Shengrong,et al.Fluctuation of endogenous plant hormone levels inleaves of tea plant (Camellia sinensisl.) during waterstress and Its relation to drought tolerance[J].Scientia Agricultura Sinica, 1996, 29(5): 9-15.
[29]李宗庭.植物激素及其免疫檢測(cè)技術(shù)[M].南京:江蘇科學(xué)技術(shù)出版社, 1996.LI Zongting.Plant hormones and their immunological detection techniques[M].Nanjing: Jiangsu science and Technology Press,1996.
[30]Kempa S,Krasensky J,Dal Santo S,et al.A central role of abscisic acid in stress-regulated carbohydrate metabolism[J].Plos One 2008, 3: e3935.
[31]Roosens N H, Bitar F A, Loenders K, et al.Overexpression of ornithine-δ-aminotransferase increases proline biosynthesis and confers osmotolerance in transgenic plants[J].Molecular Breeding,2002, 9(2): 73-80.
[32]Hu C A, Delauney A J, Verma D P S.Anovel bifunctional enzyme(Δ’-pyrroline-5-carboxylate synthetase) catalyzesthe first two steps inproline biosynthesis[J].Proc Natl Acad Sci USA, 1992, 89: 9354-9358.
[33]Iyer S, Caplan A. Products of Proline Catabolism Can InduceOsmotically Regulated Genes in Rice[J].Plant Physiology,1998, 116: 203-211.
[34]李文濱,李勝暢,王志坤.核因子Y在植物中的分類及其功能概述[J].東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào), 2012, (01):12-18.LI Wenbin,LI Shengchang,WANG Zhikun.Review of structure and function of nuclear factor Y in plant[J].Journal of Northeast Agricultural University, 2012, (01): 12-18.
[35]張珉.小麥NF-Y家族轉(zhuǎn)錄因子TaNF-YB3;1分子特征及介導(dǎo)植株抵御干旱和鹽分逆境的功能研究[D].河北農(nóng)業(yè)大學(xué), 2013.ZHANG Min.The Molecular Characterization of Wheat NF-Y Family Member Ta NF-YB3;1 and Its Roles in Mediating Plant Tolerance to Stresses of Drought and Salt[D].Agricultural University of Hebei, 2013
[36]馬旭俊,朱大海.植物超氧化物歧化酶(SOD)的研究進(jìn)展[J].遺傳, 2003, (02): 225-231.MA Xujun,ZHU Dahai.Functional Roles of the Plant Superoxide Dismutase[J].HEREDITAS( Beijing) 25(2): 225~231, 2003
[37]顧雯雯,胡亞婷,韓英,等.植物過氧化物酶同工酶的研究進(jìn)展[J].安徽農(nóng)業(yè)科學(xué), 2014, 42(34): 12011-12013.GU Wenwen,HU Yating,HAN Ying,et al.Research Progress of Peroxidase Isozymes in Plants[J].Journal of Anhui Agri.Sci.2014, 42(34): 12011-12013