孔博,張宏瑞,和淑琪,谷星慧,楊碩媛,張立猛,李正躍
1 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院,云南昆明 650201;2 云南省煙草公司玉溪市公司,云南玉溪 653100
蚜繭蜂科(Aphidiidae)隸屬昆蟲(chóng)綱(Insecta)膜翅目(Hymenoptera)姬蜂總科(Ichneumonoidea),許多種類(lèi)廣泛分布于世界各地[1]。蚜繭蜂作為蚜蟲(chóng)的一種重要寄生性天敵,一些種類(lèi)在蚜蟲(chóng)的生物防治中已被廣泛應(yīng)用。其中燕麥蚜繭蜂(Aphidius evenaeHaliday)、麥蚜繭蜂(Ephedrus plagiator(Nees))、粗脊蚜繭蜂(A.colemaniVicreck)、和煙蚜繭蜂(A.gifuensisAshmead)對(duì)麥蚜、棉蚜(Aphis gossypiiGlover)和煙蚜(Myzus persicae(Sulzer))的防治效果顯著[2-5]。
深入研究蚜繭蜂的分類(lèi)鑒定及其起源和進(jìn)化,對(duì)利用蚜繭蜂防治蚜蟲(chóng)具有重要的指導(dǎo)意義。由于蚜繭蜂體型微?。ù蠖嘣?.0 ~ 2.4 mm之間),種間相似度高,種內(nèi)還存在體色、觸角節(jié)數(shù)等變異,僅依靠外部形態(tài)特征難以對(duì)其種類(lèi)進(jìn)行準(zhǔn)確鑒定。此外,田間采集到僵蚜后,必須帶回室內(nèi)等蚜繭蜂成蟲(chóng)羽化后才能進(jìn)行形態(tài)鑒定,對(duì)僵蚜內(nèi)的蛹或其寄生蚜體內(nèi)的蚜繭蜂幼蟲(chóng)則很難進(jìn)行形態(tài)鑒定,因此,迫切需要開(kāi)展蚜繭蜂的分子鑒定,并探討其物種的起源及進(jìn)化。
目前,研究人員已成功利用DNA條形碼對(duì)蚜蟲(chóng)類(lèi)[6]、雙翅目[7]、鱗翅目[8]、鞘翅目[9]等昆蟲(chóng)進(jìn)行種類(lèi)鑒定及系統(tǒng)發(fā)育研究。對(duì)于體型較大的昆蟲(chóng),一般可以利用蟲(chóng)體較小的部分(如左前足脛節(jié))提取DNA,從而保留標(biāo)本用于形態(tài)鑒定或種類(lèi)核對(duì)。對(duì)于蚜繭蜂這類(lèi)小型昆蟲(chóng)來(lái)說(shuō),一般采用常規(guī)試劑盒提取DNA的方法(柱離心法),研磨整個(gè)蟲(chóng)體提取DNA,但該方法無(wú)法保留標(biāo)本做形態(tài)鑒定及種類(lèi)核對(duì)。在保留蟲(chóng)體標(biāo)本的前提下,找到一種適宜的提取方法從單個(gè)個(gè)體中獲得較高質(zhì)量的DNA,是利用分子手段進(jìn)行物種鑒定和系統(tǒng)發(fā)育研究的關(guān)鍵。因此,本研究在參考前人工作的基礎(chǔ)上[10-13],對(duì)DNA提取的柱離心法進(jìn)行改進(jìn),建立了穿刺昆蟲(chóng)腹部DNA提取方法,并通過(guò)DNA產(chǎn)量、質(zhì)量和線(xiàn)粒體DNA COI基因序列擴(kuò)增對(duì)其進(jìn)行評(píng)價(jià)。旨在為進(jìn)一步研究蚜繭蜂的親緣關(guān)系及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系提供一定的基礎(chǔ)資料。
蚜繭蜂標(biāo)本采集信息見(jiàn)表1,用于實(shí)驗(yàn)的7種蚜繭蜂標(biāo)本,均為75%乙醇浸泡并冷藏于4℃冰箱中,一些蚜繭蜂保存時(shí)間超過(guò)2年。
表1 蚜繭蜂標(biāo)本的來(lái)源及保存方式Tab.1 The sources and ways of preservation of Aphidiidae specimens
提取7種蚜繭蜂的基因組DNA,除菜蚜繭蜂和煙蚜繭蜂各提取2頭外,其余每種均提取1頭,共9個(gè)樣品。參照HiPure Tissue DNA Kits(昆明速科生物科技有限公司,Magen)試劑盒提取方法,部分步驟有改進(jìn)。
(1)將蚜繭蜂從75%乙醇儲(chǔ)存液中取出置于載玻片上,待蟲(chóng)體上的乙醇揮發(fā)后,向蟲(chóng)體上滴加2 μL Buffer ATL消化液,解剖鏡下,用滅菌的“00”號(hào)昆蟲(chóng)針由蚜繭蜂腹部4 ~ 5節(jié)間膜穿刺。將穿刺過(guò)的蚜繭蜂移入1.5 mL離心管,移液槍吸取50 μL Buffer ATL消化液滴入離心管,再取178 μL Buffer ATL消化液來(lái)回沖洗載玻片上穿刺蚜繭蜂的位置,連同之前的Buffer ATL消化液一同吸入離心管中。最后加入20 μL Proteinase K,低速渦旋混勻。55℃水浴3 h,水浴期間偶爾輕微搖晃離心管,使標(biāo)本充分與消化液接觸。
(2)轉(zhuǎn)移步驟(1)中得到的消化液至1.5 mL離心管中,將蚜繭蜂取出保存于75%乙醇中,以便制作玻片標(biāo)本進(jìn)行形態(tài)鑒定。
(3)加入250 μL Buffer DL至消化液中,最高速度渦旋混勻30 s,70℃水浴10 min。之后向消化液中加入250 μL無(wú)水乙醇,最高速度渦旋混勻30 s。
(4)將柱子放入2 mL收集管,轉(zhuǎn)移上一步驟(3)所得到的混合液至柱子中,10000×g離心1 min。
(5)棄慮液,將柱子放入收集管,加500 μL Buffer GW1入柱子中,10000×g 離心1 min。
(6)棄慮液,將柱子放入收集管,加650 μL Buffer GW2入柱子中,10000×g離心1 min。該步驟重復(fù)2次。
(7)棄慮液,將柱子放入收集管中,10000×g離心2 min。
(8)將柱子裝于新的1.5 mL離心管中,加90 μL預(yù)熱至70℃的Buffer AE入柱子中。放置3 min,10000×g離心1 min。
(9)棄柱子,把含蚜繭蜂DNA的濾液保存于4℃冰箱中。
對(duì)4種蚜繭蜂進(jìn)行研磨提取DNA。除菜蚜繭蜂和煙蚜繭蜂各提取2頭外,豆柄瘤蚜繭蜂和麥蚜繭蜂各提取1頭,共6個(gè)樣品。參照HiPure Tissue DNA Kits(昆明速科生物科技有限公司,Magen)試劑盒的提取方法。
(1)將蚜繭蜂從75%乙醇液中取出,置于載玻片上,待蟲(chóng)體上的乙醇充分揮發(fā)后,將蚜繭蜂移至1.5 mL離心管中,用滅菌的研磨棒研磨蚜繭蜂。磨碎后用230 μL Buffer ATL消化液沖洗研磨棒,沖洗液進(jìn)入離心管,加入20 μL Proteinase K,渦旋混勻。55℃水浴3 h,水浴期間偶爾輕微搖晃離心管,使標(biāo)本充分與消化液接觸。
(2)10000×g 離心3 min,轉(zhuǎn)移上清液至新的1.5 mL離心管中。
之后的步驟與1.2.1中步驟(3)—(9)相同。
取2 μL DNA提取物,無(wú)菌水稀釋100倍,充分混勻,紫外分光光度計(jì)測(cè)定在260 nm和280 nm處的吸光度值(OD值)。通過(guò)OD260和OD280的比值來(lái)評(píng)價(jià)所提取DNA的產(chǎn)量和純度。
利用COI基因的通用引物L(fēng)CO1490(5'-GGTCAA CAAATCATAAAGATATTGG-3')和HCO2198(5'-TA AACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA-3')[14]提取的總DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR反應(yīng)體系:DNA模板5 μL、10 pmol/L的上游和下游引物各1 μL、15 μL Master Mix、用ddH2O定容至30 μL。擴(kuò)增的條件:94℃預(yù)變性2 min,94℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸45 s,共35個(gè)循環(huán),最后在72℃充分延伸10 min。
配制1%的瓊脂糖凝膠,內(nèi)含5 μL GoldView I型核酸染色劑。Marker采用的是DL-1000,電泳緩沖液為0.5×TBE(PH 8.0),電壓80 V,室溫下電泳1.5 h,紫外分析儀下觀(guān)察、拍照。
將穿刺法獲得的擴(kuò)增產(chǎn)物送昆明碩擎生物有限公司測(cè)序。采用MEGA5.1對(duì)所得序列進(jìn)行整理,通過(guò)GenBank的blast功能進(jìn)行COI序列比對(duì)。
兩種方法提取蚜繭蜂DNA的OD值及DNA質(zhì)量和濃度如表2所示。穿刺法提取的DNA提取物的OD260/OD280在1.51 ~ 1.91之間,研磨法提取的DNA提取物的OD260/OD280在1.63 ~ 1.82之間,兩種DNA提取物的純度OD260/OD280無(wú)顯著性差異,均在正常范圍內(nèi)。兩種方法的DNA提取物濃度分別在29 ~ 55 ng/μL、85 ~ 116 ng/μL之間,平均濃度分別為41 ng/μL、100 ng/μL。提取物濃度存在顯著性差異,研磨法提取的DNA產(chǎn)量明顯高于穿刺法提取的DNA產(chǎn)量。
表2 蚜繭蜂基因組DNA的OD比值和質(zhì)量濃度Tab.2 OD value and concentration of Aphidiidae genomic DNA
DNA提取物進(jìn)行PCR擴(kuò)增的電泳檢測(cè),結(jié)果如圖1所示。實(shí)驗(yàn)所獲得的DNA條帶完整清晰,DNA提取物片段在500 ~ 700 bp之間,不存在雜帶??梢?jiàn)穿刺法提取的DNA質(zhì)量較好,PCR擴(kuò)增結(jié)果穩(wěn)定。
圖1 利用引物L(fēng)CO1490和HCO2198的穿刺法提取(A)和研磨法提?。˙)擴(kuò)增結(jié)果Fig.1 Amplification pattern of genomic DNA using the primer pairs of LCO1490 and HCO2198 by puncturing extraction (A) and grinding extraction (B)
通過(guò)GenBank中的Blast功能,穿刺法獲得蚜繭蜂COI序列的比對(duì)結(jié)果如表3所示。通過(guò)測(cè)序公司測(cè)序獲得菜蚜繭蜂序列2條,與GenBank中其它菜蚜繭蜂序列的相似度為99%,同時(shí)GenBank中還顯示與其他蚜繭蜂種類(lèi)的比對(duì)結(jié)果(表3)。豆柄瘤蚜繭蜂序列1條,與GenBank中其它豆柄瘤蚜繭蜂序列的相似度為99% ~ 100%。翼蚜外繭蜂序列1條,與GenBank中其它翼蚜外繭蜂序列的相似度為95% ~ 99%。麥蚜繭蜂序列1條,在GenBank中與黍蚜繭蜂(E.nacheri)序列的相似度很高,達(dá)到99%,標(biāo)本進(jìn)行形態(tài)學(xué)核對(duì)后鑒定為麥蚜繭蜂。煙蚜繭蜂序列2條,在GenBank中無(wú)相似序列,目前GenBank上只下載到1條煙蚜繭蜂序列,標(biāo)本進(jìn)行形態(tài)學(xué)核對(duì)后鑒定為煙蚜繭蜂。通過(guò)序列比對(duì)可以看出實(shí)驗(yàn)獲得序列均為相應(yīng)蚜繭蜂的序列,從而說(shuō)明DNA提取物的PCR擴(kuò)增條帶正確。
表3 蚜繭蜂COI序列在GenBank中的比對(duì)結(jié)果Tab.3 Blast result of Aphidiidae COI sequence in GenBank
通過(guò)對(duì)比穿刺法和研磨法提取蚜繭蜂DNA,探尋既能有效獲得蚜繭蜂DNA用以PCR擴(kuò)增,又能保留蟲(chóng)體進(jìn)行標(biāo)本核對(duì)的DNA提取方法。結(jié)果表明,兩種方法提取的DNA產(chǎn)量都能滿(mǎn)足PCR擴(kuò)增要求,但穿刺法既能提取到質(zhì)量較好的DNA,同時(shí)還能保留蚜繭蜂的重要形態(tài)鑒定特征。蚜繭蜂寄生于蚜蟲(chóng)體內(nèi)形成僵蚜,從化蛹到羽化無(wú)需取食,因此腹部穿刺提取的DNA模板絕大部分屬于蚜繭蜂DNA,外源DNA極少。本實(shí)驗(yàn)得出的所有PCR產(chǎn)物沒(méi)有經(jīng)過(guò)克隆,直接進(jìn)行PCR產(chǎn)物測(cè)序,而得出序列的峰圖是單峰無(wú)雜質(zhì)背景的。因此,即便含有外源DNA,對(duì)擴(kuò)增蚜繭蜂的COI基因并沒(méi)有影響。用于實(shí)驗(yàn)的一些蚜繭蜂浸液標(biāo)本保存超過(guò)2年,也能提取出質(zhì)量較好的DNA,這與常虹等[15]的研究結(jié)果一致,超過(guò)2年的浸液標(biāo)本,只有動(dòng)物組織DNA提取試劑盒提取到的DNA擴(kuò)增后能得到清晰的單一擴(kuò)增條帶。
在提取DNA的過(guò)程中,需要利用緩沖液對(duì)標(biāo)本進(jìn)行預(yù)處理,有利于細(xì)胞溫和地部分恢復(fù)原有的生理環(huán)境,使細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)分子與DNA之間交聯(lián)得以解離,為后期提取DNA創(chuàng)造條件[16-17]。由于腹部第一節(jié)(腹柄節(jié))是蚜繭蜂的主要形態(tài)鑒定特征,微針穿刺法采用從蚜繭蜂腹部的第二節(jié)起用無(wú)菌微針穿刺。目前,本實(shí)驗(yàn)室還利用這種方法在保留標(biāo)本進(jìn)行形態(tài)鑒定的前提下,成功提取薊馬的基因組DNA[18],表明該方法適用于各類(lèi)體型較小昆蟲(chóng)的DNA提取。
本研究采用改進(jìn)的柱離心法,適用于從保存年限較長(zhǎng)的標(biāo)本中提取符合PCR擴(kuò)增條件的DNA。此外,對(duì)于數(shù)量較少的標(biāo)本,能夠提取到適宜擴(kuò)增的DNA進(jìn)行分子鑒定,并保留蟲(chóng)體標(biāo)本進(jìn)行種類(lèi)核對(duì)。
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