于健鵬 綜述,孫李斌,魏江浩,尚芝群,牛遠(yuǎn)杰 審校
(天津市泌尿外科研究所/天津醫(yī)科大學(xué)第二醫(yī)院泌尿外科 300211)
長(zhǎng)鏈非編碼RNA與mTOR在腫瘤中的相關(guān)研究進(jìn)展
于健鵬 綜述,孫李斌,魏江浩,尚芝群,牛遠(yuǎn)杰△審校
(天津市泌尿外科研究所/天津醫(yī)科大學(xué)第二醫(yī)院泌尿外科 300211)
長(zhǎng)鏈非編碼RNA;哺乳動(dòng)物雷帕霉素靶蛋白;腫瘤
哺乳動(dòng)物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)是一種相對(duì)保守的絲/蘇氨酸蛋白激酶(AKT),與細(xì)胞凋亡、自噬、遷移黏附等密切相關(guān),尤其是參與了腫瘤細(xì)胞的增殖和凋亡過程而得到普遍的關(guān)注[1],其異?;罨?jīng)常出現(xiàn)在腫瘤細(xì)胞中。在臨床腫瘤治療中,mTOR是重要的治療靶點(diǎn),也在某些中草藥治療中發(fā)揮作用[2],然而,mTOR抑制劑并不能使腫瘤得到很好的控制。近幾年基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)的飛速發(fā)展,使得長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在正常組織和腫瘤組織中的差異性表達(dá)逐步被人們所重視,數(shù)量眾多的lncRNA表達(dá)異常與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān),其中部分lncRNA與mTOR相關(guān)通路密切相關(guān),mTOR可以調(diào)控lncRNA的表達(dá)水平,促進(jìn)或者抑制腫瘤的發(fā)展。本文就二者緊密關(guān)系的最新進(jìn)展進(jìn)行綜述,為mTOR抑制劑及相關(guān)靶向治療提供新的思路。
mTOR是1994年從酵母中分離得到的一種AKT,相對(duì)分子質(zhì)量為289×103,為磷酸肌醇激酶3(PI3K)相關(guān)激酶(PIKKs)家族一員,由HEAT重復(fù)序列、FAT結(jié)構(gòu)域、FRB激酶結(jié)構(gòu)域、CD結(jié)構(gòu)域、NRD及FATC結(jié)構(gòu)域構(gòu)成。在細(xì)胞內(nèi)mTOR通過形成兩種復(fù)合體mTORC1和mTORC2而發(fā)揮作用,其中mTORC1由mTOR、Raptor、mLST8、PRAS40、Deptor和Tti1/Tel2復(fù)合物組成,mTORC2由mTOR、mLST8、Deptor、Rictor、mSIN1、Protor1/2和Tti1/Tel2復(fù)合物組成,mTOR為兩種復(fù)合物共同的催化亞單位。mTORC1對(duì)雷帕霉素(RAPA)敏感,可在營(yíng)養(yǎng)因素、能量、氧含量等刺激后調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的翻譯和細(xì)胞的代謝活動(dòng),相對(duì)地,mTORC2對(duì)RAPA耐受,對(duì)于營(yíng)養(yǎng)、能量信號(hào)刺激也不敏感[3],并且對(duì)調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的翻譯無(wú)直接作用[4]。
mTOR為PI3K-AKT-mTOR信號(hào)通路的關(guān)鍵激酶[5],包括RTK-PI3K-PKB/AKT-TSC2/TSC1-Rheb-mTOR1/mTOR2-S6K s/4E-BP1[6],該通路通過促進(jìn)缺氧誘導(dǎo)因子(HIF)的表達(dá)刺激腫瘤血管形成的方式,促進(jìn)腫瘤的增殖轉(zhuǎn)移和調(diào)控腫瘤細(xì)胞的凋亡等多種途徑參與機(jī)體腫瘤的發(fā)生、發(fā)展。多種信號(hào)刺激能夠激活細(xì)胞表面的酪氨酸蛋白激酶受體(receptor tyrosine kinases,RTK)[7],進(jìn)而激活PI3K將細(xì)胞外信號(hào)傳至細(xì)胞內(nèi)。PI3K被激活后可以將二磷酸肌醇(PIP2)磷酸化為三磷酸肌醇(PIP3),進(jìn)而完全激活A(yù)KT?;罨腁KT通過磷酸化TSC2阻礙了TSC2與TSC1形成復(fù)合體,減弱了對(duì)Rheb的抑制,從而激活mTOR,另外AKT也能夠直接激活mTOR。活化的mTOR磷酸化S6Ks和4E-BP1兩個(gè)靶蛋白而發(fā)揮作用[8]。
全基因組和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)的廣泛應(yīng)用,使得非編碼RNA(ncRNA)進(jìn)入人們關(guān)注的視野,其中IncRNA在個(gè)體正常發(fā)育和疾病發(fā)生中的重要作用更是被重視。IncRNA是真核細(xì)胞中發(fā)生轉(zhuǎn)錄但不翻譯且轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度在200 nt以上的ncRNA分子,約占RNA總量的98%。根據(jù)lncRNA與蛋白質(zhì)編碼基因的位置關(guān)系,可以將lncRNA分為以下幾種類型:(1)外顯子lncRNA,是指lncRNA外顯子與蛋白質(zhì)編碼基因外顯子有交叉;(2)內(nèi)含子lncRNA,是指其一個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因的內(nèi)含子中,不與外顯子交叉;(3)重疊lncRNA,是指lncRNA的內(nèi)含子中包含了蛋白質(zhì)編碼基因;(4)基因間lncRNA,是指lncRNA位于兩個(gè)相鄰的蛋白質(zhì)編碼基因之間[9-10]。
近年研究發(fā)現(xiàn),lncRNA可通過表觀遺傳調(diào)控、轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控多個(gè)層面來(lái)調(diào)節(jié)基因的表達(dá),通過X 染色體失活、基因印記、染色質(zhì)重塑、轉(zhuǎn)錄激活與干擾等機(jī)制發(fā)揮其生物學(xué)功能,在生物體生長(zhǎng)、發(fā)育和衰老等過程中發(fā)揮重要作用[11]。研究表明lncRNA可能通過以下機(jī)制調(diào)節(jié)基因的表達(dá):(1)與轉(zhuǎn)錄因子或者RNA聚合酶作用促進(jìn)或者抑制靶基因的表達(dá);(2)lncRNA招募染色質(zhì)修飾復(fù)合體或者其他因子到特異性的基因位點(diǎn)發(fā)揮作用;(3)從某基因的啟動(dòng)子區(qū)轉(zhuǎn)錄的lncRNA可結(jié)合到該啟動(dòng)子區(qū)調(diào)節(jié)該基因的表達(dá);(4)lncRNA與剪切調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合,影響靶RNA的可變剪切;(5)lncRNA能夠被剪成miRNA發(fā)揮作用;(6)lncRNA作為“miRNA海綿”來(lái)調(diào)節(jié)基因的表達(dá);(7)lncRNA與翻譯因子相互作用抑制或促進(jìn)翻譯過程;(8)lncRNA可連接它的靶mRNA來(lái)影響mRNA的穩(wěn)定性,從而調(diào)節(jié)靶基因的表達(dá)水平[12]。若lncRNA出現(xiàn)異常表達(dá),則可引起多種疾病的發(fā)生,特別是腫瘤的發(fā)生、發(fā)展,還能夠用于腫瘤預(yù)后的評(píng)價(jià)。
3.1 growth arrest-specific 5(GAS5) GAS5的基因是一種核仁小分子RNA(snoRNA)的宿主基因,位于人類染色體1q25,長(zhǎng)度630 nt[13-14],屬于 5′-terminal oligopyrimidine tract(5′-TOP)基因家族成員[15],5′末端的寡聚核糖核苷酸序列決定了其生物學(xué)特性。近年來(lái)研究發(fā)現(xiàn),GAS5在乳腺癌、結(jié)直腸癌、前列腺癌、膀胱癌等中表達(dá)水平明顯降低,其過表達(dá)可以誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,抑制腫瘤的生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移。有研究在雄激素依賴(LNCaP)、雄激素敏感(22Rv1)及雄激素非依賴(PC-3和DU145)的細(xì)胞系中加入mTOR抑制劑,進(jìn)行RT-PCR分析,結(jié)果表明mTOR抑制劑提高了內(nèi)生GAS5的轉(zhuǎn)錄水平,促進(jìn)了細(xì)胞的凋亡,抑制了腫瘤的生長(zhǎng)[16]。沉默GAS5的LNCaP和22Rv1對(duì)mTOR抑制劑的敏感性降低,轉(zhuǎn)染GAS5的PC-3和DU145對(duì)mTOR抑制劑的敏感性增高。因此,GAS5很可能能夠反饋調(diào)節(jié)mTOR抑制劑的活性,在給予mTOR抑制劑治療的同時(shí)靶向提高GAS5的轉(zhuǎn)錄水平可能會(huì)提高前列腺癌患者對(duì)mTOR抑制劑的敏感性,為提高mTOR抑制劑對(duì)前列腺癌化療療效提供了新的輔助策略。Williams等[17]研究也表明,mTOR抑制劑能夠提高GAS5的表達(dá)水平,并且沉默GAS5能使得白血病T細(xì)胞和原代人T細(xì)胞的增殖免受mTOR抑制劑的抑制,說(shuō)明GAS5參與了mTOR抑制劑的作用過程。
3.2 colorectal neoplasia differentially expressed(CRNDE) CRNDE位于人類第16號(hào)染色體上,全長(zhǎng)約200 kb,為結(jié)直腸癌中表達(dá)升高最明顯的基因[18]。CRNDE不僅具有組織特異性,也表現(xiàn)出時(shí)序特點(diǎn),在成人結(jié)直腸黏膜、肝和白細(xì)胞中極少表達(dá),卻在睪丸、乳腺和皮膚中高表達(dá)[19]。而且CRNDE在某些正常組織細(xì)胞中不表達(dá),僅在癌細(xì)胞中被發(fā)現(xiàn),說(shuō)明其在腫瘤發(fā)生中發(fā)揮了關(guān)鍵作用。Wang等[20]通過qRT-PCR測(cè)定了37例神經(jīng)膠質(zhì)瘤患者的標(biāo)本,CRNDE升高最多可達(dá)50倍,并且研究發(fā)現(xiàn)CRNDE能夠促進(jìn)神經(jīng)膠質(zhì)瘤細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲。給予神經(jīng)膠質(zhì)瘤細(xì)胞RAPA處理,抑制mTOR,可使細(xì)胞增殖率下降,同時(shí)c-myc和細(xì)胞周期蛋白D1等增殖相關(guān)的表達(dá)會(huì)明顯下調(diào),而p53、PTEN等腫瘤抑制基因則明顯上調(diào)。若敲除CRNDE,mTOR信號(hào)通路下游的P70S6K的磷酸化水平降低,細(xì)胞增殖率下降,與RAPA處理結(jié)果相似,說(shuō)明CRNDE表達(dá)升高可能參與了mTOR對(duì)其下游分子的磷酸化,促進(jìn)腫瘤的進(jìn)展。此外,Ellis等[21]研究顯示,PI3K/AKT/mTOR信號(hào)通路能夠調(diào)節(jié)CRNDE的核轉(zhuǎn)錄水平,抑制其轉(zhuǎn)錄。因此,在給予mTOR抑制劑的同時(shí)可能增強(qiáng)了CRNDE的轉(zhuǎn)錄,又一次激活mTOR下游分子的生物學(xué)活性,影響了mTOR抑制劑的作用效果。
3.3 基因間長(zhǎng)鏈非編碼RNA-p21(large intergenic non-coding RNA-p21,lincRNA-p21) lincRNA-p21的功能具有多潛能性[22-23],是瓦伯格效應(yīng)的一個(gè)調(diào)節(jié)因子,還能調(diào)節(jié)血管內(nèi)皮的形成,血管平滑肌的增殖凋亡[24]。Chou等[25]通過蛋白過表達(dá)、siRNA轉(zhuǎn)染等方式發(fā)現(xiàn)mTOR能夠在乳腺癌細(xì)胞中磷酸化熱休克因子(HSF1),提高HSF1依賴的HuR的表達(dá),進(jìn)而控制lincRNA-p21的表達(dá),促進(jìn)腫瘤的發(fā)生。因此,在給予mTOR抑制劑的同時(shí)靶向lincRNA-p21可能會(huì)增強(qiáng)腫瘤的抑制作用。
3.4 尿路上皮癌相關(guān)抗原1(urothelial cancer-associated 1,UCA1) UCA1是通過去抑制雜交技術(shù)從同一個(gè)患者的膀胱移形細(xì)胞癌標(biāo)本BLS-211和BLZ-211兩個(gè)細(xì)胞系中篩查克隆出來(lái)的。有研究發(fā)現(xiàn),UCA1在膀胱癌中高表達(dá)并且增強(qiáng)了膀胱癌細(xì)胞體內(nèi)體外的腫瘤性行為[26-27],說(shuō)明UCA1在膀胱癌進(jìn)展中起到了致瘤作用。Li等[28]通過qPCR和Western blot等方法發(fā)現(xiàn)UCA1能夠經(jīng)mTOR-STAT3信號(hào)通路誘導(dǎo)己糖激酶2(hexokinase 2,HK2)的表達(dá),進(jìn)而調(diào)節(jié)腫瘤細(xì)胞的糖酵解,使得人們對(duì)于腫瘤代謝機(jī)制有了更深入的認(rèn)識(shí),說(shuō)明UCA1作為臨床治療的潛在靶點(diǎn),其致瘤作用可能被mTOR抑制劑部分阻斷。
3.5 FLJ11812 FLJ11812位于TGF-β2轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子-β2(transforming growth factor,TGF-β2)的3′非轉(zhuǎn)錄區(qū)。Ge等[29]通過基因芯片、RNA-ChiP等技術(shù)發(fā)現(xiàn)3-benzyl-5-((2-nitrophenoxy) methyl)-dihydrofuran-2(3H)-one(3BDO)能夠靶向FK506連接蛋白1A(FK506-binding protein 1A,FKBP1A 12 ×103)來(lái)激活mTOR,并且3BDO在激活mTOR后可以增強(qiáng)T細(xì)胞限制性的細(xì)胞內(nèi)抗原1(T-cell-restricted intracellular antigen-1,TIA1)的磷酸化,降低FLJ11812的細(xì)胞內(nèi)水平,使得自噬相關(guān)基因13(autophagy-related 13,ATG 13)蛋白表達(dá)降低,減少細(xì)胞自我吞噬的發(fā)生,說(shuō)明了抑制mTOR可以增強(qiáng)FLJ11812的表達(dá),抑制細(xì)胞的增殖,從而抑制腫瘤的發(fā)展轉(zhuǎn)移。
靶向mTOR的腫瘤治療雖然日趨成熟,但仍然存在一些不足,僅僅對(duì)腎細(xì)胞癌、鞘狀細(xì)胞淋巴瘤和子宮內(nèi)膜癌的治療效果較為明顯。而且,對(duì)mTOR抑制劑發(fā)揮作用的相關(guān)具體機(jī)制仍不夠清楚。近年隨著分子生物學(xué)新技術(shù)的大量出現(xiàn),lncRNA在腫瘤發(fā)生、發(fā)展中的作用逐漸清晰化。其中,部分lncRNA與mTOR相互作用,為研究mTOR在腫瘤發(fā)生、發(fā)展中的相關(guān)機(jī)制提供了新的思路,有可能將mTOR相關(guān)作用機(jī)制闡述清楚,從而為mTOR相關(guān)治療的改進(jìn)提供理論基礎(chǔ),優(yōu)化mTOR抑制劑在臨床中的應(yīng)用策略以提高療效。隨著對(duì)mTOR相關(guān)通路認(rèn)識(shí)的深入及參與的相關(guān)lncRNA的不斷發(fā)現(xiàn),可為腫瘤治療提供更多的思路和理論依據(jù)。
[1]Yang H,Rudge DG,Koos JD,et al.mTOR kinase structure,mechanism and regulation[J].Nature,2013,497(7448):217-223.
[2]Zhang L,Wang H,Zhu J,et al.Mollugin induces tumor cell apoptosis and autophagy via the PI3K/AKT/mTOR/p70S6K and ERK signaling pathways[J].Biochem Biophys Res Commun,2014,450(1):247-254.
[3]Populo H,Lopes JM,Soares P.The mTOR signalling pathway in human cancer[J].Int J Mol Sci,2012,13(2):1886-1918.
[4]Tan HK,Moad AI,Tan ML.The mTOR signalling pathway in cancer and the potential mTOR inhibitory activities of natural phytochemicals[J].Asian Pac J Cancer Prev,2014,15(16):6463-6475.
[5]Yentrapalli R,Azimzadeh O,Sriharshan A,et al.The PI3K/Akt/mTOR pathway is implicated in the premature senescence of primary human endothelial cells exposed to chronic radiation[J].PloS One,2013,8(8):e70024.
[6]Djukom C,Porro LJ,Mrazek A,et al.Dual inhibition of PI3K and mTOR signaling pathways decreases human pancreatic neuroendocrine tumor metastatic progression[J].Pancreas,2014,43(1):88-92.
[7]Badura S,Tesanovic T,Pfeifer H,et al.Differential effects of selective inhibitors targeting the PI3K/AKT/mTOR pathway in acute lymphoblastic leukemia[J].PloS One,2013,8(11):e80070.
[8]張穎,郝進(jìn).mTOR Complex1-S6K1信號(hào)通路在2型糖尿病發(fā)生發(fā)展中的作用[J].重慶醫(yī)學(xué),2012,41(31):3333-3335.
[9]Shi X,Sun M,Liu H,et al.Long non-coding RNAs:a new frontier in the study of human diseases[J].Cancer Lett,2013,339(2):159-166.
[10]Derrien T,Johnson R,Bussotti G,et al.The GENCODE v7 catalog of human long noncoding RNAs:analysis of their gene structure,evolution,and expression[J].Genome Res,2012,22(9):1775-1789.
[11]Lee JT,Bartolomei MS.X-inactivation,imprinting,and long noncoding RNAs in health and disease[J].Cell,2013,152(6):1308-1323.
[12]Sang H,Liu H,Xiong P,et al.Long non-coding RNA functions in lung cancer[J].Tumor Biol,2015,36(6):4027-4037.
[13]Isin M,Ozgur E,Cetin G,et al.Investigation of circulating lncRNAs in B-cell neoplasms[J].Clin Chim Acta,2014,431(3):255-259.
[14]Yin D,He X,Zhang E,et al.Long noncoding RNA GAS5 affects cell proliferation and predicts a poor prognosis in patients with colorectal cancer[J].Med Oncol,2014,31(11):253-256.
[15]Pickard MR,Mourtada-Maarabouni M,Williams GT.Long non-coding RNA GAS5 regulates apoptosis in prostate cancer cell lines[J].Biochim Biophys Acta,2013,1832(10):1613-1623.
[16]Yacqub-Usman K,Pickard MR,Williams GT.Reciprocal regulation of GAS5 lncRNA levels and mTOR inhibitor action in prostate cancer cells[J].Prostate,2015,75(7):693-705.
[17]Williams GT,Mourtada-Maarabouni M,Farzaneh F.A critical role for non-coding RNA GAS5 in growth arrest and rapamycin inhibition in human T-lymphocytes[J].Biochem Soc Trans,2011,39(2):482-486.
[18]Kumar A,Suthers PF,Maranas CD.MetRxn:a knowledgebase of metabolites and reactions spanning metabolic models and databases[J].BMC Bioinformatics,2012,13(1):6-10.
[19]Ellis BC,Molloy PL,Graham LD.CRNDE:a long non-coding RNA involved in cancer,neurobiology,and development[J].Front Genet,2012(3):270-276.
[20]Wang Y,Wang Y,Li J,et al.CRNDE,a long-noncoding RNA,promotes glioma cell growth and invasion through mTOR signaling[J].Cancer Lett,2015,367(2):122-128.
[21]Ellis BC,Graham LD,Molloy PL.CRNDE,a long non-coding RNA responsive to insulin/IGF signaling,regulates genes involved in central metabolism[J].Biochim Biophys Acta,2014,1843(2):372-386.
[22]Bao X,Wu H,Zhu X,et al.The p53-induced lincRNA-p21 derails somatic cell reprogramming by sustaining H3K9me3 and CpG methylation at pluripotency gene promoters[J].Cell Res,2015,25(1):80-92.
[23]Dimitrova N,Zamudio JR,Jong RM,et al.LincRNA-p21 activates p21 in cis to promote Polycomb target gene expression and to enforce the G1/S checkpoint[J].Mol Cell,2014,54(5):777-790.
[24]Yang F,Zhang H,Mei Y,et al.Reciprocal regulation of HIF-1alpha and lincRNA-p21 modulates the Warburg effect[J].Mol Cell,2014,53(1):88-100.
[25]Chou SD,Murshid A,Eguchi T,et al.HSF1 regulation of beta-catenin in mammary cancer cells through control of HuR/elavL1 expression[J].Oncogene,2015,34(17):2178-2188.
[26]Yang C,Li X,Wang Y,et al.Long non-coding RNA UCA1 regulated cell cycle distribution via CREB through PI3-K dependent pathway in bladder carcinoma cells[J].Gene,2012,496(1):8-16.
[27]Wang Y,Chen W,Yang C,et al.Long non-coding RNA UCA1a(CUDR) promotes proliferation and tumorigenesis of bladder cancer[J].Int J Oncol,2012,41(1):276-284.
[28]Li Z,Li X,Wu S,et al.Long non-coding RNA UCA1 promotes glycolysis by upregulating hexokinase 2 through the mTOR-STAT3/microRNA143 pathway[J].Cancer Sci,2014,105(8):951-955.
[29]Ge D,Han L,Huang S,et al.Identification of a novel MTOR activator and discovery of a competing endogenous RNA regulating autophagy in vascular endothelial cells[J].Autophagy,2014,10(6):957-971.
于健鵬(1990-),在讀碩士研究生,主要從事前列腺癌病因?qū)W相關(guān)方面研究。△
,E-mail:yuanjieniu01@outlook.com。
0.3969/j.issn.1671-8348.2017.18.042
R730.23
A
1671-8348(2017)18-2569-03
2017-01-14
2017-03-18)