劉艷霞,楊雪松△,付 衛(wèi),姚宏偉
(北京大學(xué)第三醫(yī)院1.消化科, 2.普外科, 北京 100191)
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·論著·
單核苷酸多態(tài)性位點rs6983267與潰瘍性結(jié)腸炎及大腸癌的相關(guān)性
劉艷霞1,楊雪松1△,付 衛(wèi)2,姚宏偉2
(北京大學(xué)第三醫(yī)院1.消化科, 2.普外科, 北京 100191)
目的:探討rs6983267多態(tài)性與散發(fā)性大腸癌發(fā)病風險的相關(guān)性,初步比較rs6983267多態(tài)性在潰瘍性結(jié)腸炎患者和普通人群中的分布差異。方法: 該病例對照研究共納入186例散發(fā)性大腸癌患者、129例潰瘍性結(jié)腸炎患者和189例對照者,采集外周靜脈血并提取基因組DNA,采用基質(zhì)輔助激光解吸電離-飛行時間質(zhì)譜平臺進行基因型分型,采用非條件Logistic回歸方法校正年齡、性別,并比較各組間的等位基因和基因型頻率分布差異。結(jié)果:大腸癌組的G等位基因頻率及GG、GT基因型頻率均高于對照組,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.001)。潰瘍性結(jié)腸炎組的G等位基因頻率及GG、GT基因型頻率均高于對照組,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.041,P=0.006和P<0.001)。結(jié)論: rs6983267多態(tài)性與散發(fā)性大腸癌的發(fā)病風險相關(guān),rs6983267多態(tài)性在潰瘍性結(jié)腸炎患者和普通人群中的分布可能存在差異,且潰瘍性結(jié)腸炎患者中的G風險等位基因頻率可能高于普通人群。
多態(tài)性,單核苷酸;結(jié)腸炎,潰瘍性;結(jié)直腸腫瘤
rs6983267位點位于MYC原癌基因的上游區(qū)域內(nèi),該區(qū)域具有增強子活性且能與轉(zhuǎn)錄因子7類似物2 (transcription factor 7-like 2,TCF7L2)發(fā)生特異性結(jié)合,rs6983267多態(tài)性能夠影響TCF7L2與該增強子區(qū)域的結(jié)合能力,從而影響TCF7L2對MYC原癌基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)作用[1-3]。目前研究認為rs6983267位點可能通過上調(diào)MYC原癌基因的表達水平增強大腸癌的發(fā)病風險[1-2]。
潰瘍性結(jié)腸炎屬于炎癥性腸病的一種,病變好發(fā)于直腸和乙狀結(jié)腸,也可累及全結(jié)腸甚至回腸末端。目前研究認為潰瘍性結(jié)腸炎是遺傳易感性個體在免疫、環(huán)境、精神、腸道菌群等多種因素共同作用下發(fā)生的慢性腸道炎癥,病因尚不十分明確[4]。潰瘍性結(jié)腸炎相關(guān)結(jié)直腸癌是潰瘍性結(jié)腸炎患者的重要死亡原因之一,其發(fā)生可能與潰瘍性結(jié)腸炎的病變范圍、患病時間、炎癥程度、發(fā)病年齡和結(jié)直腸癌家族史等因素有關(guān)[5]。2012年Jess等[6]的研究發(fā)現(xiàn),潰瘍性結(jié)腸炎患者的大腸癌發(fā)病風險是普通人群的2.4倍。目前研究多認為包括潰瘍性結(jié)腸炎在內(nèi)的慢性炎癥能夠增加癌變風險,但與之相關(guān)的分子機制并不清楚[7],部分研究認為潰瘍性結(jié)腸炎炎癥向癌的轉(zhuǎn)變過程可能與腸道上皮反復(fù)發(fā)生炎癥損傷、增生和修復(fù)有關(guān)[8]。作為一種與細胞生長代謝過程相關(guān)的重要轉(zhuǎn)錄因子,MYC參與了腸道上皮的增生和損傷修復(fù)過程,并可能在潰瘍性結(jié)腸炎的炎癥和癌變過程中發(fā)揮一定作用[9-10]。
本研究通過分析和比較rs6983267多態(tài)性在散發(fā)性大腸癌患者和對照人群中的分布差異,進一步探討該位點多態(tài)性與大腸癌發(fā)病風險的相關(guān)性,并通過比較rs6983267多態(tài)性在潰瘍性結(jié)腸炎患者和對照人群中的分布差異,初步探討該位點多態(tài)性與潰瘍性結(jié)腸炎及潰瘍性結(jié)腸炎癌變之間可能存在的相關(guān)性。
1.1 研究對象
該病例對照研究共納入186例散發(fā)性大腸癌患者、129例潰瘍性結(jié)腸炎患者和189例對照者。大腸癌組、潰瘍性結(jié)腸炎組和對照組人群均為2014年至2015年期間就診于北京大學(xué)第三醫(yī)院的患者或體檢者,受檢者之間均不存在血緣關(guān)系。潰瘍性結(jié)腸炎組需排除惡性腫瘤病史,大腸癌組需排除自身免疫性疾病、遺傳性大腸癌和其他惡性腫瘤病史,對照組需排除自身免疫性疾病和惡性腫瘤病史。大腸癌以術(shù)后病理組織學(xué)結(jié)果為診斷依據(jù),潰瘍性結(jié)腸炎的診斷標準參照2012年中華醫(yī)學(xué)會消化病分會《炎癥性腸病診斷與治療的共識意見》中的診斷標準。本研究通過了北京大學(xué)第三醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會的審核(2014176),并獲得所有受檢者的知情同意。臨床信息采集與基因型分型各自獨立進行、互不干擾,臨床信息采集采用問卷調(diào)查和病歷回顧相結(jié)合的方式進行。
1.2 研究方法
采集4 mL EDTA抗凝的外周靜脈血,采用血液基因組DNA提取試劑盒(TIANGEN)提取基因組DNA。所有DNA樣品的濃度需大于25 mg/L,且光密度D260 nm/D280 nm比值介于1.8~2.0之間。
采用Assay Design 3.1軟件設(shè)計并合成引物,正向引物為5′ACG TTG GAT GTC ATC GTC CTT TGA GCT CAG 3′,反向引物為5′ACG TTG GAT GCT CCC TCC CCC ACA TAA AAT 3′,延伸引物為5′GAG CTC AGC AGA TGA AAG 3′。采用中國科學(xué)院北京基因組研究所的基質(zhì)輔助激光解吸電離-飛行時間質(zhì)譜平臺對DNA樣品進行基因型分型,通過系統(tǒng)自帶軟件Typer 4.0對檢測結(jié)果進行判讀,3種基因型的聚類性能(clustering performance)均不低于0.98,基因型分型示意圖如圖1所示。
1.3 統(tǒng)計方法
采用卡方檢驗檢測是否符合Hardy-Weinberg平衡定律,P<0.05為不符合平衡定律。采用非條件Logistic回歸分析方法校正年齡、性別,并計算OR值和95%置信區(qū)間。所有的統(tǒng)計分析均由IBM SPSS Statistics 22.0 軟件實現(xiàn),以雙側(cè)概率P<0.05為標準判斷差異是否具有統(tǒng)計學(xué)意義。多重比較時需采用Bonferroni校正法對檢驗水準進行校正,即以初始檢驗水準除以多重比較的次數(shù)。
Red dots represent negative control and samples of no call which have been removed from further analysis.
圖1 單核苷酸多態(tài)性位點rs6983267的基因型分型結(jié)果
Figure1 The genotyping results of single nucleotide polymorphism rs6983267
2.1 臨床特征和數(shù)據(jù)情況
大腸癌組共納入了186例散發(fā)性大腸癌患者,平均年齡為(62.45±11.18)歲(34~79歲), 其中男性116例(62.4%),女性70例(37.6%);該組共包括80例直腸癌和106例結(jié)腸癌患者,其中有82例患者存在局部淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和遠處器官轉(zhuǎn)移。潰瘍性結(jié)腸炎組共納入129例潰瘍性結(jié)腸炎患者,平均年齡為(42.90±14.16)歲(20~79歲),其中男性71例(55.0%),女性58例(45.0%)。通過腸鏡檢查結(jié)果明確潰瘍性結(jié)腸炎的炎癥累及范圍,其中非廣泛性潰瘍性結(jié)腸炎患者有46例,腸鏡結(jié)果提示炎癥局限于直腸和左半結(jié)腸;廣泛性潰瘍性結(jié)腸炎患者有77例,腸鏡結(jié)果提示腸道炎癥從遠端向近端發(fā)展并累及右半結(jié)腸;此外有6例無法通過腸鏡結(jié)果進行明確分型,因此不納入潰瘍性結(jié)腸炎亞組的分析中。對照組共納入189例體檢者,平均年齡(58.60±13.32)歲(31~79歲),其中男性95例(50.3%),女性94例(49.7%)??ǚ綑z驗結(jié)果提示,rs6983267的基因型頻率分布在對照組中符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05),在潰瘍性結(jié)腸炎組和大腸癌組中不符合Hardy-Weinberg平衡定律(P<0.05)。各組的基本臨床信息可見表1。
表1 大腸癌組和潰瘍性結(jié)腸炎組的臨床資料
CRC, colorectal cancer; UC, ulcerative colitis.Ⅰ, Ⅱ, Ⅲ, Ⅳ, clinicopathological staging of colorectal cancer in 1978.
2.2 rs6983267多態(tài)性在大腸癌組和對照組之間分布的比較
rs6983267位點的3種基因型在大腸癌組中的頻率分別為5.38%(TT)、69.89%(GT)和24.73%(GG),在對照組中的頻率分別為28.04%(TT)、55.03%(GT)和16.93%(GG);大腸癌組的G等位基因頻率(59.68%)高于對照組(44.44%)。通過Logistic回歸分析校正年齡、性別并比較兩組間的等位基因頻率分布差異,結(jié)果提示兩組間的等位基因頻率分布差異具有統(tǒng)計學(xué)意義[P<0.001,OR=1.992(1.429~2.586),表2];進一步通過Logistic回歸分析比較兩組之間的基因型頻率分布差異,檢驗水準為0.025,此時分析結(jié)果顯示兩組之間的基因型頻率分布差異也具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.001,表2)。
在分析過程中,我們根據(jù)癌變部位、是否發(fā)生局部淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和遠處器官轉(zhuǎn)移將大腸癌組進一步劃分為直腸癌組、結(jié)腸癌組、轉(zhuǎn)移癌組和非轉(zhuǎn)移癌組。結(jié)果顯示,直腸癌組和結(jié)腸癌組的G等位基因頻率均高于對照組,分別為59.37%和59.91%;非轉(zhuǎn)移癌組和轉(zhuǎn)移癌組的G等位基因頻率也高于對照組,分別為58.65%和60.98%。比較直腸癌組與對照組之間的等位基因頻率分布差異,檢驗水準為0.025,結(jié)果提示G等位基因在兩組間的頻率分布差異具有統(tǒng)計學(xué)意義[P=0.001,OR=1.875(1.273~2.761)];比較兩組間的基因型頻率分布差異,檢驗水準為0.012 5,結(jié)果提示差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.001,表3)。采用同樣方法比較結(jié)腸癌組、非轉(zhuǎn)移癌組、轉(zhuǎn)移癌組與對照組之間的等位基因和基因型頻率分布差異,結(jié)果提示差異均具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.001,表3、4)。
2.3 rs6983267多態(tài)性在潰瘍性結(jié)腸炎組和對照組之間分布的比較
潰瘍性結(jié)腸炎組的各基因型頻率分別為5.43%(TT)、75.19%(GT)和19.38%(GG),G等位基因頻率(56.98%)高于對照組(44.44%), Logistic回歸分析結(jié)果提示兩組間的等位基因頻率分布差異具有統(tǒng)計學(xué)意義[P=0.041,OR=1.466(1.016~2.116)]。進一步比較基因型頻率分布差異,GG純合基因型在兩組間的頻率分布差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.006), GT雜合基因型頻率分布差異同樣具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.001)。進一步比較非廣泛性潰瘍性結(jié)腸炎組、廣泛性潰瘍性結(jié)腸炎組和對照組之間的等位基因和基因型頻率分布差異,檢驗水準分別為0.025和0.012 5。非廣泛性潰瘍性結(jié)腸炎組、廣泛性潰瘍性結(jié)腸炎組與對照組之間的G等位基因頻率分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.309,P=0.066);非廣泛性潰瘍性結(jié)腸炎組與對照組之間的基因型頻率分布差異也無統(tǒng)計學(xué)意義[P=0.177(GG),P=0.020(GT)];廣泛性潰瘍性結(jié)腸炎組與對照組之間GG純合基因型頻率分布差異不具有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.017),而GT雜合基因型頻率分布差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.002)。潰瘍性結(jié)腸炎各組與對照組之間的比較結(jié)果見表5和表6。
表2 rs6983267多態(tài)性與大腸癌的相關(guān)性
CRC, colorectal cancer. * Logistic regression model, adjusted by age and gender.
表3 rs6983267多態(tài)性與直腸癌、結(jié)腸癌的相關(guān)性
*Logistic regression model, adjusted by age and gender.
表4 rs6983267多態(tài)性與轉(zhuǎn)移癌、非轉(zhuǎn)移癌的相關(guān)性
*Logistic regression model, adjusted by age and gender.
表5 rs6983267多態(tài)性與潰瘍性結(jié)腸炎的相關(guān)性
UC, ulcerative colitis. * Logistic regression model, adjusted by age and gender.
表6 rs6983267多態(tài)性與潰瘍性結(jié)腸炎炎癥范圍的相關(guān)性
*Logistic regression model, adjusted by age and gender.
單核苷酸多態(tài)性位點rs6983267位于染色體8q24區(qū)域。2007年Yeager等[11]的全基因組關(guān)聯(lián)分析研究最初發(fā)現(xiàn)rs6983267多態(tài)性可能與歐洲血統(tǒng)男性的前列腺癌發(fā)病風險相關(guān),在這之后又有3個獨立的全基因組關(guān)聯(lián)分析研究同時發(fā)現(xiàn)rs6983267位點除了與前列腺癌發(fā)病風險相關(guān)外,也與西方人群大腸癌的發(fā)病風險相關(guān)[12-14]。rs6983267多態(tài)性與大腸癌的相關(guān)性存在種族差異,研究發(fā)現(xiàn)rs6983267多態(tài)性與德國人群、美國白種人和中國人群的大腸癌發(fā)病風險均相關(guān),然而并未找到與美國黑人大腸癌發(fā)病風險相關(guān)的證據(jù)[15-17]。目前研究提示,該位點除了與大腸癌和前列腺癌的發(fā)病風險相關(guān)外,與其他多種癌癥的發(fā)病風險也具有相關(guān)性。2008年Wokolorczyk等[18]的研究發(fā)現(xiàn)rs6983267多態(tài)性與腎癌、甲狀腺癌、喉癌的發(fā)病風險相關(guān),2014年Zhou等[19]的研究也提示rs6983267與胃癌發(fā)病風險具有一定的相關(guān)性。本研究對rs6983267多態(tài)性在大腸癌組和對照組之間的分布情況進行比較,結(jié)果顯示大腸癌組的G風險等位基因頻率高于對照組,與已有的研究報道一致。進一步統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn)大腸癌組和對照組之間的等位基因和基因型頻率分布差異均具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.001),且rs6983267位點在直腸癌、結(jié)腸癌、轉(zhuǎn)移癌、非轉(zhuǎn)移癌亞組與對照組之間的等位基因和基因型頻率分布差異也具有統(tǒng)計學(xué)意義。雖然本研究的樣本量相對較小,但考慮到本研究結(jié)果與之前已有的研究報道結(jié)果相符,也可以提示rs6983267多態(tài)性可能與大腸癌的發(fā)病風險相關(guān)。
隨著越來越多的研究發(fā)現(xiàn)rs6983267位點與癌癥發(fā)病風險相關(guān),rs6983267位點的具體作用機制也得到進一步研究。2009年的兩項獨立研究同時發(fā)現(xiàn)rs6983267位點可能參與了Wnt/β-catenin信號通路靶基因MYC的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)[1-2]。rs6983267位點位于距MYC原癌基因約500 kb的上游區(qū)域內(nèi),該區(qū)域除了具有增強子的特性外,也是與TCF7L2轉(zhuǎn)錄因子發(fā)生特異性結(jié)合的區(qū)域,rs6983267位點的G風險等位基因與TCF7L2轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合能力的上調(diào)相關(guān)[1-3]。TCF7L2是Wnt/β-catenin通路中非常關(guān)鍵的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子,可以與β-catenin結(jié)合并促進MYC靶基因的轉(zhuǎn)錄激活。Nan等[20]的細胞水平研究發(fā)現(xiàn),rs6983267多態(tài)性能夠影響MYC原癌基因的表達水平;而Sur等[21]的動物實驗研究也發(fā)現(xiàn),敲除包含rs6983267在內(nèi)的上游區(qū)域可以使小鼠腸道的MYC基因轉(zhuǎn)錄水平降低,并增強小鼠對癌變誘導(dǎo)劑的抵抗能力,提示rs6983267位點可能通過上調(diào)MYC原癌基因的表達水平來增強大腸癌的發(fā)病風險。
MYC是一種能夠影響一系列靶基因表達的轉(zhuǎn)錄因子,正常狀態(tài)下它通過調(diào)節(jié)腸道上皮細胞的增生、遷移、分化和凋亡等功能來維持腸道的平衡狀態(tài)。早期研究發(fā)現(xiàn)MYC在潰瘍性結(jié)腸炎的炎癥組織中存在表達上調(diào)[22],2012年Konsavage等[9]的基因敲除動物實驗發(fā)現(xiàn)MYC的高表達能夠促進潰瘍性結(jié)腸炎模型小鼠的腸道上皮再生和修復(fù),與此同時研究還觀察到MYC高表達的小鼠腸道組織存在較明顯的異型增生改變。2014年Konsavage等[10]進一步對潰瘍性結(jié)腸炎癌變小鼠模型進行了研究,發(fā)現(xiàn)MYC高表達狀態(tài)的小鼠更容易發(fā)生潰瘍性結(jié)腸炎相關(guān)結(jié)直腸癌,提示MYC基因的高表達狀態(tài)可能在腸道炎癥和癌變中具有雙重作用,調(diào)節(jié)MYC基因的表達水平對維持腸道的正常狀態(tài)具有相對重要的作用。rs6983267作為連接Wnt/β-catenin信號通路中TCF7L2轉(zhuǎn)錄因子和MYC靶基因的重要節(jié)點,其突變狀態(tài)可能會在一定程度上影響TCF7L2轉(zhuǎn)錄因子對MYC基因表達水平的調(diào)控,進而影響MYC基因的表達水平和功能作用。
本研究通過比較rs6983267位點在潰瘍性結(jié)腸炎和對照組中的分布狀態(tài),發(fā)現(xiàn)潰瘍性結(jié)腸炎組的G等位基因頻率(56.98%)高于對照組(44.44%),進一步分析發(fā)現(xiàn)兩組之間的等位基因和基因型頻率分布差異均具有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.041,P=0.006和P<0.001),此外,研究還發(fā)現(xiàn)廣泛性潰瘍性結(jié)腸炎組的GT雜合基因型頻率高于對照組(P=0.002),以上分析結(jié)果初步提示,rs6983267位點在潰瘍性結(jié)腸炎患者和普通人群中的分布可能存在差異。
潰瘍性結(jié)腸炎患者的大腸癌發(fā)病風險要高于普通人群,但與之相關(guān)的分子機制并不清楚[6],部分研究認為潰瘍性結(jié)腸炎炎癥向癌的轉(zhuǎn)變過程可能與腸道上皮反復(fù)發(fā)生炎癥損傷、增生和修復(fù)有關(guān)[7-8]。MYC作為一種與細胞生長代謝過程相關(guān)的重要轉(zhuǎn)錄因子,在腸道損傷上皮的增生和修復(fù)過程中發(fā)揮了較重要的調(diào)控作用。基于目前已有的研究現(xiàn)狀和本研究的分析結(jié)果,我們初步假設(shè)rs6983267位點在潰瘍性結(jié)腸炎患者和普通人群中的分布可能存在差異,且rs6983267位點可能通過上調(diào)MYC基因的表達水平在一定程度上增加潰瘍性結(jié)腸炎患者的癌變風險。由于本研究存在樣本量不足的問題,并沒有對潰瘍性結(jié)腸炎癌變?nèi)巳哼M行多態(tài)性分析,所以并不足以證明rs6983267位點與潰瘍性結(jié)腸炎及潰瘍性結(jié)腸炎癌變具有相關(guān)性。在后續(xù)研究中,我們希望通過擴大樣本量和收集潰瘍性結(jié)腸炎癌變病例對該假設(shè)進行進一步探討。
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(2016-01-22收稿)
(本文編輯:趙 波)
Association of single nucleotide polymorphism rs6983267 with ulcerative colitis and colorectal cancer
LIU Yan-xia1, YANG Xue-song1△, FU Wei2, YAO Hong-wei2
(1. Department of Gastroenterology, 2.Department of General Surgery, Peking University Third Hospital, Beijing 100191, China)
Objective: To investigate the association of rs6983267 polymorphism with risk of sporadic colorectal cancer; to compare the distribution of rs6983267 polymorphism between ulcerative colitis and general population. Methods: 186 patients with sporadic colorectal cancer, 129 patients with ulcerative colitis and 189 healthy donors were recruited in the case-control study. Peripheral venous blood was obtained, and genomic DNA was extracted. All samples were genotyped using matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry techniques. Allelic and genotypic frequencies were compared and adjusted for age and gender using unconditional Logistic regression. Results: The allelic frequency of G and the genotypic frequencies of GG and GT were predominant in colorectal cancer group compared with control group, which were statistically significant after adjustment for age and gender (P<0.001). The allelic frequency of G and the genotypic frequencies of GG and GT were predominant in ulcerative colitis group compared with control group, which were statistically significant as well (P=0.041,P=0.006 andP<0.001). Conclusion: rs6983267 polymorphism was associated with risk of sporadic colorectal cancer. The distribution of rs6983267 may be different between ulcerative colitis and general population,and the frequency of risk allele G may be higher in ulcerative colitis patients compared with general population.
Polymorphism, single nucleotide; Colitis, ulcerative; Colorectal neoplasms
國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃(863計劃,2012AA02A204)資助Supported by the National High Technology Research and Development Program of China (863 Program, 2012AA02A204)
時間:2016-6-29 11:25:33
http://www.cnki.net/kcms/detail/11.4691.R.20160629.1125.002.html
R574.62
A
1671-167X(2016)06-0994-06
10.3969/j.issn.1671-167X.2016.06.013
△Corresponding author’s e-mail, yangxuesong@bjmu.edu.cn