王艷麗,王宇光 ,梁乾德,馬增春,肖成榮,譚洪玲,湯響林,張伯禮,高 月
(1.解放軍醫(yī)學院,北京 100853;2.軍事醫(yī)學科學院放射與輻射醫(yī)學研究所藥理毒理研究室,北京 100850;3.天津中醫(yī)藥大學,天津 300193)
藜蘆為百合科藜蘆屬植物,根及根莖入藥,有大毒。藜蘆所含化學成分中有多種甾體生物堿。據(jù)報道,藜蘆生物堿可以作用于中樞神經(jīng)系統(tǒng),使大腦先興奮后抑制,出現(xiàn)意識障礙癥狀如痙攣、抽搐以及昏睡昏迷[1]等。已有研究顯示藜蘆生物堿是鈉通道失活門的抑制劑,浸浴藜蘆生物堿可使大鼠初級感覺神經(jīng)元產(chǎn)生一種可能與觸發(fā)痛的發(fā)作有關的觸發(fā)性振蕩[2]。小劑量的藜蘆生物堿具有一定的降壓作用,而劑量較大時能使分離的神經(jīng)細胞內Ca2+升高,成為一種脂溶性神經(jīng)毒素[3]。
以往的研究多集中于藜蘆對神經(jīng)細胞離子通道或電生理的影響及其與神經(jīng)毒性的關系,但其對神經(jīng)細胞相關基因表達的影響尚未見文獻報道。藜蘆定堿有可能通過改變神經(jīng)細胞相關基因的表達,進而影響神經(jīng)細胞相關信號通路,造成亞急性或慢性損傷。
SH-SY5Y細胞系來源于人神經(jīng)母細胞瘤細胞,形態(tài)及生理生化功能與正常神經(jīng)元相似,是目前國際上研究神經(jīng)系統(tǒng)功能公認的一種細胞模型[4],常用于神經(jīng)毒性、帕金森病、阿爾采末?。?]等的研究。
基因芯片技術可代替?zhèn)鹘y(tǒng)的動物毒理學實驗進行早期的毒性篩查和線索發(fā)現(xiàn),其最顯著的特點是在毒性線索發(fā)現(xiàn)階段可以給出海量的信息[6],有助于更深入的毒性機制研究。從基因組水平上研究藜蘆定堿與相關基因表達的關系,通過基因表達圖譜改變發(fā)現(xiàn)藜蘆定堿的毒性作用機制不失為一種有效的技術手段。
1.1 材料
1.1.1 細胞株 SH-SY5Y細胞購買于協(xié)和細胞中心。
1.1.2 實驗藥物 藜蘆定堿(veratridine,批號:D00114760)購自Merck公司。
1.1.3 主要試劑 RPMI 1640培養(yǎng)基(批號:C11875500BT)由Gibco BRL公司提供,新生胎牛血清(FBS,批號:NXF0650)和0.25%胰蛋白酶(批號:SLBC1656)購自 Hyclone公司,TRIzol(批號:15596018)購自Invitrogen公司;基因芯片檢測試劑盒Amino Allyl Message AmpTMⅡaRNA Amplification Kit(Ambion#AM1753,CA,USA);HOA 5.1基因芯片 (Phalanx Biotech Group,Inc,Taiwan)。
1.1.4 儀器與軟件 CO2培氧箱(Thromeo公司),倒置顯微鏡(重慶光學儀器廠);圖像掃描儀AX-ON4000B(Molecular Device,CA,USA);數(shù)據(jù)處理軟件 Rosetta Resolver?System(Rosetta Biosoftware,USA)。
1.2 方法
1.2.1 SH-SY5Y細胞培養(yǎng)、處理和收集 將 SHSY5Y細胞培養(yǎng)于RPMI 1640(含15%滅活FBS,100 U/mL青霉素和100 U/mL鏈霉素),37℃、5%CO2孵育,2~3 d換液,取對數(shù)生長期細胞進行實驗。將藜蘆定堿分別以終濃度為50,200,800 μmol·L-1加入SH-SY5Y細胞中,分別標記為低濃度(L)組、中濃度(M)組、高濃度(H)組;另外設置正常對照組加空白培養(yǎng)液,標記為N組,加藥作用8 h。
1.2.2 電泳檢測 RNA品質 TRizol法提取 SHSY5Y細胞的總RNA,將純化的總RNA樣品置于70℃水浴保溫1 h,各取5 μl用 RNase-free Water稀釋50倍,用甲醛變性膠電泳檢測提取的RNA純度,觀察18和28 s rRNA條帶的強弱和有無拖尾現(xiàn)象,同時計算兩條帶的灰度比,并在220~320 nm紫外波長范圍內進行掃描,定量[7]。
1.2.3 cDNA的合成及其探針標記 使用基因芯片檢測試劑盒 Amino AllylMessageAmpTMⅡ aRNA Amplification Kit(Ambion#AM1753,CA,USA)進RNA反轉錄、細胞外轉錄放大與標記。以1 μg總RNA起始反轉錄為cDNA探針,熒光染料Cy5接dUTP上,在細胞外轉錄放大同時摻入進行標記成為Cy5 標記的 aRNA[8]。
1.2.4 基因芯片雜交與洗滌 取10 μg Cy5標記的aRNA,以試劑盒Ambion#AM8740進行片段化后,加入120 μl的1.5倍OneArray雜交液中?;蛐酒?HOA 5.1(Phalanx Biotech Group,Inc,Taiwan)以100%無水酒精進行變性20 s后加入OneArray?預雜交緩沖液 (5x SSPE,0.1%SDS,1%BSA)于42℃靜置2 h完成芯片預雜交。將已片段化的Cy5-aRNA加入1.5 x OneArray?雜交緩沖液至總反應體積180 μl于95℃反應5 min變性后,加入已完成預雜交的芯片,50℃反應16 h。完成雜交后以清洗液Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ(清洗液I:2x SSC+0.2%SDS;清洗液Ⅱ:2x SSC;清洗液Ⅲ:0.2x SSC)分別于42℃,42℃,25℃清洗 5,5 min,5 s 后甩干[9]。
1.2.5 圖像掃描與數(shù)據(jù)處理 用 AXON4000B(Molecular Device,CA,USA)掃描儀掃描雜交后芯片,利用GenePixTM4提取基因表達的熒光信號強度值擷取,獲得初級數(shù)據(jù)格式gpr檔案為原始數(shù)據(jù)。將gpr導入 Rosetta Resolver?System(Rosetta Biosoftware,USA)軟件進行數(shù)據(jù)前處理與均一化,剔除在所有芯片中flag值皆為-50的探針后,對三樣本重復進行median scaling校正后的均值,即為每一樣本均一化后的訊號值。接下來套用Rosetta Resolver的error model計算兩兩實驗樣本間的Cy5熒光訊號的log2比值及P-value。挑選|log2比值|≥1P-value<0.05的基因為顯著差異表達基因。
2.1 細胞形態(tài)變化 SH-SY5Y細胞受藜蘆定堿作用后細胞體積收縮、變圓,樹突數(shù)量減少,細胞連接明顯減少,細胞增殖率降低,高劑量組出現(xiàn)細胞體積收縮、變圓,樹突融解、消失,細胞連接明顯減少,細胞增殖率明顯降低。
Fig 1 Cell morphology of the different treated groups(100×)
2.2 電泳檢測RNA純度 由RNA電泳圖可以看RNA在28S和18S有兩條清晰的表達條帶,沒有拖尾,說明無DNA殘留;并且28S與18S的表達均約為2∶1。因此可知細胞中提取的RNA完整性好,品質合格,可以進行后續(xù)實驗。
2.3 SH-SY5Y細胞受藜蘆定堿毒性作用前后的顯著差異表達基因 SH-SY5Y細胞受藜蘆定堿作用后L、M、H組與N組相比較,顯著差異表達基因分別有71、182、77 條,其中上調基因分別有 45、81、45條,下調基因分別為26、101、32條。在差異表達基因中包括GSH相關基因,RNA功能、DNA修復及蛋白合成相關基因,細胞物質與能量代謝 、線粒體功能相關基因,細胞周期、細胞分化、細胞凋亡相關基因,蛋白氧化磷酸化作用、細胞信號傳導相關基因,以及一些代謝相關酶類相關基因。
2.4 差異表達基因聚類分析 用Cluster 3.0軟件對4組差異表達基因進行處理,選擇傳統(tǒng)聚分析方法,聚類結果如Fig 3所示。由聚類分析可知,N組與L組可以聚為一類,M組與H組可以聚為一類。在前一類中差異表達基因較少,而后一類差異表達基因較多。表明差異表達基因可以很好的區(qū)分藜蘆定堿不同濃度處理組。
Tab 1 Part of the significant upregulated genes in SH-SY5Y treated by veratridine 50 mmol·L -1
Tab 3 Part of the significant upregulated genes in SH-SY5Y treated by veratridine 200 μmol·L -1
Tab 4 Part of the significant downregulated genes in SH-SY5Y treated by veratridine 200 μmol·L -1
Tab 5 Part of the significant upregulated genes in SH-SY5Y treated by veratridine 800 μmol·L -1
基因芯片技術是一種新的基因表達研究方法,它利用核酸雜交的原理,在固體支持物上一次檢測成百上千乃至上萬種基因的表達水平,具有傳統(tǒng)方法無可比擬的高通量特點,達到了一定意義上的全基因表達譜的檢測。本文采用基因芯片技術篩選藜蘆定堿對神經(jīng)細胞毒性作用的差異表達基因,試圖初步揭示其毒性發(fā)生機制。
Tab 6 Part of the significant downregulated genes in SH-SY5Y treated by veratridine 800 μmol·L -1
本研究通過利用表達譜基因芯片篩選藜蘆定堿對SH-SY5Y細胞神經(jīng)毒性相關基因,發(fā)現(xiàn)神經(jīng)細胞受藜蘆定堿毒性作用過程中,相關基因表達水平有顯著變化。本實驗對表達差異基因運用系統(tǒng)聚類分析,按照藜蘆定堿不同處理濃度與基因表達的關系,將藥物處理濃度各視為一類,在此基礎上考察藜蘆定堿對神經(jīng)細胞毒性作用的基因表達結果,并將結果進行合并分析。
Fig 3 Cluster analysis result of differentially expressed genes
在神經(jīng)細胞SH-SY5Y的基因表達譜中,藜蘆定堿低濃度組與對照組比較顯著性差異表達基因共有71條,其中上調基因45條,下調基因26條;中濃度組與對照組比較顯著性差異表達基因共有182條,其中上調基因81條,下調基因101條;高濃度作用組與對照組比較顯著性差異表達基因共有77條,其中上調基因45條,下調基因32條。在差異表達基因中,涉及GSH相關基因(DCAF12),RNA修復及蛋白合成相關基因(RPS11,RPS27A,RPSAP58),RNA功能相關基因(RN7SK,RN28S1),細胞物質與能量代謝相關基因(ATP1A1),線粒體功能相關基因(MRPL16),蛋白氧化磷酸化相關基因(PPP1R),細胞信號傳導相關基因(MAPKAP1,MAP4K4,RNF),細胞周期相關基因(CCNL1),細胞分化相關基因(ZNF),細胞凋亡相關基因(USP38,ANXA3),以及一些代謝相關酶類相關基因(GLT,GCAT)。
GSH在生命活動中起著直接或間接的作用,參與對細胞的保護、基因表達調控、酶活性和物質代謝、氨基酸轉運、免疫功能調節(jié)等,且在中樞神經(jīng)系統(tǒng)中可以充當神經(jīng)遞質發(fā)揮神經(jīng)遞質的作用;GSH是機體主要的抗氧化劑之一[10],其含量的降低是一種潛在的凋亡早期激活信號,因為隨后產(chǎn)生的氧自由基可促使細胞發(fā)生凋亡。
細胞凋亡過程中線粒體也發(fā)揮著相當重要的作用,在外部刺激作用下,線粒體能夠釋放促凋亡因子如細胞色素C,激活凋亡蛋白酶Caspase;活化后的Caspase可以反作用于線粒體,引發(fā)更大量的細胞色素C的釋放,形成細胞色素C釋放的正向反饋調節(jié)機制,從而激發(fā)下游的凋亡執(zhí)行者,最終導致細胞凋亡。
從研究結果中,我們看到與細胞信號傳導有關的基因如蛋白激酶和MAPK相關基因也有差異性表達,MAPK蛋白激酶途徑是一種重要的信號轉導途徑,該信號通路廣泛參與多種神經(jīng)系統(tǒng)疾病的發(fā)生發(fā)展過程,且MAPK蛋白激酶在細胞周期調控中發(fā)揮著重要的作用。
上述基因的變化可能與藜蘆定堿對SH-SY5Y細胞毒性作用有關,同時推測,這些基因參與了毒性作用過程。在聚類分析結果圖中我們看到,藜蘆定堿200 μmol·L-1處理后,基因表達普遍上升,而800 μmol·L-1處理時,基因表達又有所降低,此現(xiàn)象,從生物學意義上來說是可能的。由于聚類分析圖所表示出來的只是一部分差異較顯著的基因,在聚類分析結果里,變化的模式有很多種,從研究結果中我們能達到利用基因芯片技術篩選藜蘆定堿對SH-SY5Y細胞神經(jīng)毒性的相關基因的目的,而后續(xù)研究將挑選具體變化模式做進一步的驗證工作。綜上,該實驗結果為研究藜蘆定堿對SH-SY5Y毒性作用的機制提供了實驗依據(jù),為臨床安全合理應用藜蘆和藜蘆神經(jīng)中毒救治提供參考。
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