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基因芯片技術(shù)在生物研究中的應(yīng)用進(jìn)展

2020-05-11 06:00李筱樂
知識(shí)文庫 2020年5期
關(guān)鍵詞:測序核酸雜交

李筱樂

在高中生物基因工程的學(xué)習(xí)過程中,經(jīng)常會(huì)提到基因芯片的發(fā)展,基因芯片是生物高科技發(fā)展的產(chǎn)物,是一項(xiàng)高新技術(shù),在基因工程方面得到了廣泛的應(yīng)用,基因芯片為基因表達(dá)、基因重組方面做出了重要的貢獻(xiàn)。本篇文章闡述基因芯片技術(shù)在生物研究中的應(yīng)用進(jìn)展,同時(shí)介紹基因芯片的未來發(fā)展方向。

基因芯片技術(shù)是將已知序列的核酸片段進(jìn)行固定,組成的一系列有次序的核酸片段,利用熒光標(biāo)記法將已知片段標(biāo)記,然后利用基因雜交技術(shù),將已知的核酸片段與未知的核酸片段進(jìn)行雜交,然后通過熒光標(biāo)記的部位推測未知核酸片段序列,從而得知核酸樣品的具體信息?;蛐酒梢栽谟邢薜膶?shí)驗(yàn)次數(shù)內(nèi)迅速地獲得樣品的基因變化規(guī)律,利用基因芯片進(jìn)行測序,既方便又高效。

1 基因芯片的概述

1.1 基因芯片的具體概述

基因芯片也稱為DNA芯片,是生物芯片發(fā)展的核心技術(shù)。基因芯片最先出現(xiàn)于美國,其具有高效、準(zhǔn)確的特點(diǎn),基因芯片是在基因的基礎(chǔ)上進(jìn)行操控,是利用基因探針技術(shù)以及核酸雜交技術(shù)對(duì)核酸樣品序列進(jìn)行準(zhǔn)確分析的一項(xiàng)技術(shù)?;蛐酒梢苑譃楹芏喾N,將有機(jī)基質(zhì)作為載體的稱為有機(jī)基因芯片,將無機(jī)基質(zhì)作為載體的稱為無機(jī)基因芯片;同時(shí),基因芯片還有不同的功能,其中包括核酸序列測序,基因差異表達(dá)等。

1.2 基因芯片的主要原理

基因芯片主要利用到基因探針以及核酸雜交技術(shù),將已知序列的核酸片段固定在物體上,成為基因探針,同時(shí)利用堿基互補(bǔ)配對(duì)原則和熒光標(biāo)記法,將被標(biāo)記的基因探針與待測的核酸片段進(jìn)行雜交,通過檢測熒光信號(hào)的有無,測定靶基因的具體信息。

1.3 基因芯片的制備方法

1.3.1 原位合成法

將許多電極固定在硅膠等固體支持物上,根據(jù)電極的特點(diǎn),其上具有許多生物親和性的小孔,其中四種脫氧單糖核苷酸能夠在電機(jī)的小孔上合成DNA的小部分片段。原位合成法的用途較為狹窄,只能合成基因芯片,而不可以合成蛋白質(zhì)芯片。

1.3.2 直接點(diǎn)樣法

直接點(diǎn)樣法與原位合成法相比,具有一定的優(yōu)勢,直接點(diǎn)樣法是將人工合成的核苷酸片段直接固定在硅膠等固體支持物上,其步驟簡單,不僅可以制造基因芯片,還可以制造蛋白質(zhì)芯片,就是操作過程較為復(fù)雜,對(duì)專業(yè)知識(shí)的需求量大。

1.4 基因芯片存在的不足

已知的基因序列有限,已知的基因序列是制備基因芯片的主要材料。但已知的基因序列較少,是阻礙基因芯片技術(shù)發(fā)展的主要因素。此外,比如探針對(duì)雜交體的穩(wěn)定性也會(huì)影響到基因芯片技術(shù)的發(fā)展,環(huán)境對(duì)于基因芯片的影響還有待挖掘,這需要進(jìn)一步的掌握生化性質(zhì),從根本是掌握芯片的應(yīng)用規(guī)律。此外,基因芯片檢測的靈敏度不夠高,在檢測中操作較為復(fù)雜,這也是生物領(lǐng)域工作者應(yīng)該改進(jìn)并研究的重要內(nèi)容。

2 基因芯片在生物研究中的具體應(yīng)用

2.1 可以用來對(duì)基因表達(dá)進(jìn)行分析

生物的致病基因的表達(dá)與生物的階段發(fā)育有關(guān),生物的不同階段,其致病基因的表達(dá)情況不同;同時(shí),致病基因又受到病原微生物的影響。致病基因的表達(dá)情況需要利用基因芯片來獲得,還可以根據(jù)基因的表達(dá)情況來推測基因的功能以及致病的機(jī)理。相關(guān)研究者對(duì)萊姆病原菌在不同環(huán)境下的基因表達(dá)情況做了詳細(xì)研究,根據(jù)實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),將萊姆病原菌放入新環(huán)境中,萊姆病原菌為了適應(yīng)環(huán)境的改變,會(huì)在極短的時(shí)間內(nèi)做出改變,當(dāng)其適應(yīng)之后,萊姆病原菌的基因表達(dá)情況便會(huì)穩(wěn)定不便。由此可以看出,病原微生物能夠在短期內(nèi)適應(yīng)環(huán)境的變化,這也是病原微生物抗藥性的原因之一。

2.2 基因芯片可以進(jìn)行DNA測序

DNA測序是指通過運(yùn)用相關(guān)的生物技術(shù),從而得知脫氧核苷酸的排列順序?;蛐酒夹g(shù)在DNA測序上獲得了巨大的成就。其憑借高效性與準(zhǔn)確性,能夠準(zhǔn)確的DNA進(jìn)行測序,具有很大的發(fā)展空間。利用基因芯片進(jìn)行測序的準(zhǔn)確率極高,將已知基因序列的基因探針與待測的樣品進(jìn)行雜交,兩者的匹配度高,則其雜交信號(hào)就高。基因芯片在測定植物以及病原微生物基因突變的方面,有著較高的成就。其代表著利用基因芯片進(jìn)行測序的效率有著明顯的提高。我國的基因芯片也得到了有效地發(fā)展,在生物領(lǐng)悟的成就非凡。

2.3 為新基因的發(fā)展奠定基礎(chǔ)

基因芯片技術(shù)得到廣泛的應(yīng)用之后,為我國的生物工作者提供了一定的思路去研究新基因,隨著對(duì)基因組的不斷研究,基因組序列被掌握與理解,這為工作者研究未知的基因與功能奠定了一個(gè)良好的基礎(chǔ)。在以往的研究過程中,工作者還無法解釋生物生理過程中基因相互作用的問題?;蛐酒夹g(shù)的出現(xiàn),為解決這一難題提供了可能。從事生物研究的相關(guān)人員利用基因芯片技術(shù),經(jīng)過篩選,從而發(fā)現(xiàn)了果蠅差異表達(dá)基因,在此基礎(chǔ)上,還發(fā)現(xiàn)了很多相關(guān)的新基因。這是我國生物研究的一大成就。此外,松材線蟲的出現(xiàn),是我國生態(tài)環(huán)境面臨的一項(xiàng)巨大挑戰(zhàn),我國相關(guān)研究醫(yī)學(xué)、者已經(jīng)對(duì)松材線蟲的基因進(jìn)行了測序,已經(jīng)研究掌握了松材線蟲的致病基因,能夠有效地防止松材線蟲引起的災(zāi)害。

2.4 基因芯片在農(nóng)業(yè)上的應(yīng)用

基因芯片受到個(gè)各個(gè)國家、各個(gè)行業(yè)的關(guān)注,基因芯片技術(shù)的的發(fā)展成為生物芯片發(fā)展的最重要的課題,目前的基因芯片憑借高通量的檢測能力,成為研究植物基因的重要技術(shù),已經(jīng)廣泛的運(yùn)用于植物生理、植物抗逆境生長、病蟲害檢測、轉(zhuǎn)基因植物研發(fā)等多個(gè)方面,在農(nóng)業(yè)的領(lǐng)悟取得了巨大的成就。就轉(zhuǎn)基因技術(shù)來說,基因芯片具有一定的高效性,可以同時(shí)檢測多種基因,可以同時(shí)準(zhǔn)確的辨別啟動(dòng)子,可以簡單、迅速并且準(zhǔn)確的檢測轉(zhuǎn)基因的農(nóng)產(chǎn)品,此外,基因芯片的出現(xiàn)還能夠提高檢查轉(zhuǎn)基因農(nóng)產(chǎn)品的靈敏度。

2.5 基因芯片在生物醫(yī)學(xué)方面的應(yīng)用

可以利用基因芯片檢測基因的表達(dá)方式以及基因的功能,從而查找到致病基因以及致病的機(jī)理。包括腫瘤在內(nèi)的許多疾病都是由于致病因子刺激基因的內(nèi)部結(jié)構(gòu),從而引起基因結(jié)構(gòu)或者基因序列的改變。因此,利用基因芯片來對(duì)不同的基因進(jìn)行檢查,從基因的程度上對(duì)致病因素進(jìn)行調(diào)控,對(duì)病人進(jìn)行及時(shí)的救治,可以改善病情或者阻礙病情的再次發(fā)生。同時(shí),還可以利用基因芯片技術(shù)篩選出中藥中的有效成分,掌握藥物中有效藥物的分子機(jī)理,力求能夠從基因的水平上解釋治病的機(jī)理,從而提高中藥的使用率,在一定的程度上能夠避免藥物的浪費(fèi)。

2.6 利用基因芯片技術(shù)繪制圖譜

利用基因芯片技術(shù)繪制生物所需的基因圖譜。我國著名的生物學(xué)家張新建,利用基因芯片技術(shù)研究掌握了水稻白葉枯病菌侵染的整個(gè)過程,同時(shí)他分析了水稻的基因表達(dá)圖譜,發(fā)現(xiàn)在水稻基因表達(dá)的過程中,有五個(gè)基因發(fā)生了明顯的變化。同時(shí)我國的生物學(xué)家趙寶存利用新芯片技術(shù),發(fā)現(xiàn)了小麥基因表達(dá)的差異性,并研制出小麥基因差異表達(dá)的圖譜,為相關(guān)人員的提供了技術(shù)上的參考,為我國相關(guān)行業(yè)的發(fā)展奠定了基礎(chǔ)。

3 結(jié)束語

基因芯片能夠快速的分析生物基因表達(dá)的具體信息,在生命科學(xué)的領(lǐng)域中發(fā)揮著巨大的作用。基因芯片從最初被研發(fā)到現(xiàn)在只經(jīng)過了短短十幾年,但是基因芯片技術(shù)的發(fā)展飛速,同時(shí),基因芯片技術(shù)對(duì)生命科學(xué)未來的發(fā)展有著重要的意義?;蛐酒梢苑治龀龌虻木唧w功能,基因芯片技術(shù)的發(fā)展是生物界發(fā)現(xiàn)的必然趨勢,基因芯片技術(shù)將會(huì)在生物的各個(gè)行業(yè)中發(fā)揮巨大的作用,加快我國醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)等相關(guān)各個(gè)行業(yè)的發(fā)展進(jìn)程?;蛐酒夹g(shù)雖然存在一定的不足,但是并不能否定基因芯片對(duì)各個(gè)領(lǐng)域所做出的貢獻(xiàn),DNA測序以及其他基因方面的研究,都是在基因芯片技術(shù)的基礎(chǔ)上進(jìn)行研發(fā)的。

(作者單位:西安交通大學(xué)附屬中學(xué)航天學(xué)校)

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