蔣玉鳳 周德江 張建軍 黃 飛 史小玲
轉(zhuǎn)化生長因子β(transforming growth factorβ,TGF-β)及其信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑在肝纖維化發(fā)生機制中起著關(guān)鍵作用[1,2]。結(jié)締組織生長因子(connective tissue growth factor,CTGF) 與金屬蛋白酶組織抑制因 子 1(tissue inhibitor of metalloproteinase 1,TIMP-1)都是TGF-β信號傳導(dǎo)途徑的下游信號介質(zhì)[3,4], 針對CTGF和 TIMP-1的小RNA干擾阻斷TGF-β下游信號途徑,將有望成為一種更特異和更有效的長期防治肝纖維化的手段。本研究旨在設(shè)計并構(gòu)建同時含CTGF和TIMP-1靶基因片段的雙重RNA干擾重組質(zhì)粒,并轉(zhuǎn)染到大鼠肝星狀細(xì)胞,為進一步研究其對肝星狀細(xì)胞細(xì)胞因子和細(xì)胞外基質(zhì)分泌做準(zhǔn)備。
一、材料 真核表達(dá)載體psiRNA-DUO-GFPzeo、感受態(tài)大腸桿菌Lyo Comp GT115、Fast-Medi aRZeoX-Gal、Fast-MediaRZeoX-GUS、lipofectamine( 脂質(zhì)體)2000試劑、Zeocin抗生素購自InvivoGen公司;限制性內(nèi)切酶ACC 65I、Hind III、 BbsI、MakerO'RangeR μlerTM1000bpDNALadder、MakerO'RangeRμlerTM50bp DNA Ladder與T4 DNA連接酶購自Fermentas公司;少量質(zhì)粒提取試劑盒購自O(shè)MEGA公司;胎牛血清購自天津TBD公司;目標(biāo)OligoDNA由上海生工合成;大鼠肝HSC-T細(xì)胞株由我院中心實驗室凍存。
二、CTGF和TIMP-1短發(fā)卡RNA(short hairpin RNA,shRNA)序列的設(shè)計與合成 在線查詢大鼠CTGF和TIMP-1基因序列,設(shè)計3個RNA干擾靶位,化學(xué)合成雙鏈RNA(dsRNA),各自轉(zhuǎn)染或不同組合轉(zhuǎn)染經(jīng)TGF-β1刺激活化的大鼠肝星狀細(xì)胞。篩選出對Ⅲ型膠原、透明質(zhì)酸、粘連蛋白抑制作用最強的RNA干擾候選靶位[5](前期研究中已完成),即 CTGF:5’-GCCAGGAGAAAGACAGGUACU 和TIMP-1:5’-GCCUUCGUAAAGACCUAUAGU。 為便于克隆和鑒定,shRNA干擾序列的5'端和3'端分別引入ACC 65I和Hind III酶切位點,反義片段后接終止信號TTTTT以終止轉(zhuǎn)錄。形成ACC 65I+正義鏈+Loop+反義鏈+終止信號+Hind III的靶序列結(jié)構(gòu)模式。在真核表達(dá)質(zhì)粒psiRNA-DUO-GFPzeo(6046bp)中插入CTGFshRNA序列,再用BbsI雙酶切(質(zhì)粒中含兩個BbsI酶切位點),再插入TIMP-1shRNA序列,形成BbsI+正義鏈+Loop+反義鏈+終止信號+BbsI的靶序列結(jié)構(gòu)模式。針對CTGF和TIMP-1基因的shRNA片段序列見表1。
表1 針對大鼠CTGF和TIMP-1基因的shRNA靶序列
三、重組質(zhì)粒 psiRNA-GFP-CTGF和 psiRNA-GFP-TIMP-1的構(gòu)建及鑒定用內(nèi)切酶ACC 65I和Hind III雙酶切空載質(zhì)粒psiRNA-DUO-GFPzeo,膠回收目的線性DNA;用滅菌三蒸水將shRNA片段溶解,終濃度為25μM。按以下條件完成退火:正義鏈2μl, 反義鏈 2μl,NaCl 6μl, 加三蒸水到總體積30μl,80℃ 水 浴 2min。將線性載體質(zhì)粒psiRNA-DUO-GFPzeo與退火shRNA片段用T4 DNA連接酶連接,轉(zhuǎn)化感受態(tài)大腸桿菌,接種到含博萊霉素( zeocin)的 Fast-MediaRZeoX-Gal固體培養(yǎng)基,做藍(lán)白篩選后提取重組質(zhì)粒psiRNA-GFP-CTGF、psiRNA-GFP-TIMP-1,分別用ACC 65I和Hind III雙酶切,通過電泳圖初步鑒定重組質(zhì)粒是否構(gòu)建成功,并各取20μl重組質(zhì)粒送上海生物工程公司測序。
四、重組質(zhì)粒psiRNA-GFP-Com(含有C TGF和TIMP-1)的構(gòu)建及鑒定 將測序確定構(gòu)建成功的重組質(zhì)粒psiRNA-GFP-CTGF用內(nèi)切酶BbsI雙酶切(內(nèi)切質(zhì)粒中兩個不同位置的BbsI位點),膠回收目的線性質(zhì)粒,psiRNA-GFP-CTGF與退火shRNA片段連接,轉(zhuǎn)化感受態(tài)大腸桿菌,并接種至Fast-MediaRZeo GUS固體培養(yǎng)基,將藍(lán)白篩選后提取的重組質(zhì)粒psiRNA-GFP-Com與空載質(zhì)粒psiRNA-DUO-GFPzeo分別用內(nèi)切酶BbsI雙酶切(內(nèi)切質(zhì)粒中兩個不同位置的BbsI位點),酶切產(chǎn)物電泳顯示重組質(zhì)粒構(gòu)建成功后,取20μl重組質(zhì)粒送上海生工測序鑒定。
五、重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染肝星狀細(xì)胞 取肝星狀細(xì)胞培養(yǎng),應(yīng)用Lipofectamine 2000將質(zhì)粒轉(zhuǎn)染細(xì)胞,每組兩孔。分組如下:CTGF組(轉(zhuǎn)染質(zhì)粒psiRNA-GFP-CTGF)、TIMP-1組(轉(zhuǎn)染質(zhì)粒psiRNA-GFP-TIMP-1)、CTGF+TIMP-1組( 轉(zhuǎn)染質(zhì)粒psiRNA-GFP-CTGF和 psiRNA-GFP-TIMP-1)、Com組【轉(zhuǎn)染質(zhì)粒psiRNA-GFP-Com(含有C TGF和TIMP-1)】、空質(zhì)粒組(轉(zhuǎn)染空載質(zhì)粒psiRNA-DUO-GFPzeo)與空白對照組(以等量無血清培養(yǎng)基代替質(zhì)粒與脂質(zhì)體混合)。在轉(zhuǎn)染24小時和48小時后,在顯微鏡下觀察綠色熒光,并使用流式細(xì)胞儀檢測每組細(xì)胞中熒光蛋白(GFP)表達(dá)情況,并以GFP表達(dá)的比率來確定轉(zhuǎn)染效率。
一、重組質(zhì)粒psiRNA-GFP-CTGF和psiRNA-GFP-TIMP-1酶切電泳鑒定 重組質(zhì)粒psiRNA-GFP-CTGF和 psiRNA-GFP-TIMP-1用ACC 65I和Hind III雙酶切,其產(chǎn)物經(jīng)電泳符合預(yù)期,重組質(zhì)粒psiRNA-GFP-CTGF和psiRNA-GFP-TIMP-1雙酶切產(chǎn)物均有一大小約5711bp(6046-335+23-23)片段( 圖1)。
二、重組質(zhì)粒 psiRNA-GFP-CTGF和psiRNA-GFP-TIMP-1測序鑒定 經(jīng)測序顯示重組質(zhì)粒psiRNA-GFP-CTGF和psiRNA-GFP-TIMP-1中siRNA編碼序列與設(shè)計片段完全一致,表明載體構(gòu)建成功( 圖 2、圖 3)。
三、psiRNA-GFP-Com酶切電泳鑒定 psiRNA-GFP-Com經(jīng)BbsI雙酶切(內(nèi)切質(zhì)粒中兩個不同位置的BbsI位點)產(chǎn)物電泳符合預(yù)期,電泳圖譜中顯示重組質(zhì)粒psiRNA-GFP-Com雙酶切產(chǎn)物中有一大小約 3782bp(5711-1929+23-23)片段( 圖 4)。
四、重組質(zhì)粒psiRNA-GFP-Com測序分析 經(jīng)測序結(jié)果顯示重組質(zhì)粒psiRNA-GFPCom(同時含有C TGF和TIMP-1,將psiRNA-GFP-CTGF重組質(zhì)粒用BbsI雙酶切后連接上TIMP片段)中siRNA編碼序列與設(shè)計片段完全一致,表明重組質(zhì)粒psiRNA-GFP-Com構(gòu)建成功(圖5)。
五、轉(zhuǎn)染效率測定情況 經(jīng)流式細(xì)胞儀測定,空白對照組無GFP表達(dá),空質(zhì)粒和各組重組質(zhì)粒均有熒光蛋白表達(dá),初步證實各重組質(zhì)粒均能轉(zhuǎn)染肝星狀細(xì)胞。同時,在24小時和48小時,空質(zhì)粒組、CTGF組、TIMP-1組與CTGF+TIMP-1組轉(zhuǎn)染效率無統(tǒng)計學(xué)差異(P>0.05),而它們的轉(zhuǎn)染效率均低于質(zhì)粒psiRNA-GFP-Com轉(zhuǎn)染組(Com組),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),說明Com組轉(zhuǎn)染效率最高(表2)。
表2 各組質(zhì)粒的轉(zhuǎn)染效率(%,)
表2 各組質(zhì)粒的轉(zhuǎn)染效率(%,)
與Com組比,①P<0.05
24h 48h空白對照 無 無空質(zhì)粒 15±2① 10±2①CTGF 13±1① 9±1①TIMP-1 15±1① 8±2①CTGF+TIMP-1 14±2① 10±1①Com 20±2 15±2
RNA干擾是作用于mRNA水平的基因沉默技術(shù),細(xì)胞內(nèi)雙鏈RNA在Dicer酶的作用下,可形成21~23bp大小的小干擾 RNA(small interfering RNA,siRNA),精確降解與 siRNA序列相同的mRNA,能特異性抑制靶基因的轉(zhuǎn)錄,進而抑制該基因在細(xì)胞內(nèi)的翻譯,達(dá)到轉(zhuǎn)錄后水平的基因靜默[6,7]。由于siRNA表達(dá)載體成功轉(zhuǎn)染后可進行瞬時或穩(wěn)定的基因沉默,因此相對于化學(xué)合成的siRNA更有應(yīng)用價值和前景[8]。
CTGF是新近發(fā)現(xiàn)的一種促器官纖維化的重要細(xì)胞因子。在TGF-β的誘導(dǎo)下,由成纖維細(xì)胞等間質(zhì)細(xì)胞產(chǎn)生,反過來又介導(dǎo)TGF-β對間質(zhì)的作用,被認(rèn)為是TGF-β的下游部分生物學(xué)功能介質(zhì),CTGF在TGF-β誘導(dǎo)下的異常高表達(dá)在肝纖維化的發(fā)生、發(fā)展過程中始終起著關(guān)鍵作用[9,10]。
基質(zhì)金屬蛋白酶(Matrix mealloproteiuases,MMP)在ECM降解過程中起主要作用,而其活性可特異性地被TIMP所抑制,其中TIMP-1對MMP的活性抑制作用最強[11]。TGF-β及其信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑可誘導(dǎo)TIMP-1產(chǎn)生,從而阻斷MMPs對ECM的降解[12]。因此,TIMP-1也是TGF-β1生物學(xué)作用的下游效應(yīng)介質(zhì)。
從理論上講,通過靶向抑制CTGF和TIMP-1表達(dá)可抑制纖維化的發(fā)生和發(fā)展。本研究篩選出對CTGF和TIMP-1具有干擾作用的RNA序列,構(gòu)建了雙重RNA干擾重組質(zhì)粒psiRNA-GFP-Com(同時含有C TGF和TIMP-1siRNA編碼序列),并成功轉(zhuǎn)染肝星狀細(xì)胞。下一步研究擬采用針對CTGF和TIMP-1的RNA雙重干擾,力求從阻斷CTGF對ECM形成和解除TIMP-1對ECM的降解抑制(促進降解)兩方面著手,研究雙重RNA干擾重組質(zhì)粒psiRNA-GFP-Com對肝星狀細(xì)胞細(xì)胞因子表達(dá)及ECM分泌的影響。
本次實驗質(zhì)粒轉(zhuǎn)染效率不是太高,而質(zhì)粒轉(zhuǎn)染效率與堿基數(shù)目有一定的關(guān)系[13]。
[1]劉平.重視肝纖維化的病理生理機制與治療學(xué)研究.中華肝臟病雜志,2010,18( 8):561-562.
[2]徐列明.肝纖維化的研究進展.中華肝臟病雜志,2010,18(8):563-565.
[3]Gressner OA,Gressner AM.Connective tissue growth factor:a fibrogenic master switch in fibrotic liver diseases.Liver Int,2008,28( 8):1065-1079.
[4]孫華麗,張建軍.組織金屬蛋白酶及其抑制因子與肝纖維化.西南軍醫(yī),2010,12( 1):81-83.
[5]蔣玉鳳,黃飛,張建軍,等.結(jié)締組織生長因子和金屬蛋白酶組織抑制因子-1RNA干擾靶位的篩選.實用肝臟病雜志,2011,14( 4),246-248.
[6]Bora RS,Gupta D,Mukkur TK,et al. RNA interference therapeutics for cancer:Challenges and opportunities.Mol Med Report,2012,6( 1):9-15.
[7]Tomari Y,Zamore PD.Perspective:Machines for RNAi.Genes Dev,2005,19( 5):517.
[8]李曙芳,劉田福.RNA干擾技術(shù)的應(yīng)用新進展.中國實驗動物學(xué)報,2009,17( 1):76-79.
[9]張馨,汪茂榮,馬勇,等.慢性乙型肝炎患者肝組織PDGF表達(dá)與肝竇病變的關(guān)系.實用肝臟病雜志,2012,15( 1):1-3.
[10]Tche D,Boqdan F,Pisoschi C,et al.Evidence for the involvement of TGF-β1-CTGF axis in liver fibrogenisis secondary to hepatic viral infection. Rom J Morphol Embryol,2011,52( 1suppl) :409-412.
[11]Murphy G.Tissue inhibitors of metalloproteinases.Genome Biol,2011,12( 11):233.
[12]Hemmann S,Graf J,Roderfeld M,et al.Expression of MMPs and TIMPs in liver fibrosis-asystematic review with special emphasis on anti-fibrotic strategies.J Hepatol,2007,22( 5):955-975.
[13]Rudolph C,Rosenecker J.Formation of solid lipid nanoparticle(SLN)-gene vector complexes for transfection of mammalian cells in vitro.Cold Spring Harb Protoc,2012,25( 3):357-360.