張宗欣,趙紀(jì)元,孫紅賓
鄭州輕工業(yè)大學(xué)食品與生物工程學(xué)院,河南 鄭州 450002
根據(jù)世界衛(wèi)生組織發(fā)布的2020 年全球結(jié)核病報告,2019 年全球新診斷并報告的結(jié)核病患者約710萬,每年至少有100萬兒童患結(jié)核病,其中約20萬死亡病例,結(jié)核病仍是威脅全球人類健康的重要公共衛(wèi)生問題之一[1-2]。目前,感染多重耐藥結(jié)核桿菌人數(shù)的持續(xù)增加及結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuber-culosis,Mtb)在人體內(nèi)休眠期的延長均給結(jié)核病的治療帶來極大挑戰(zhàn)[3-4]。尋找新靶點以開發(fā)新的抗結(jié)核藥物成為急需解決的問題。
熱休克蛋白(heat shock proteins,HSPs)是一類廣泛存在于原核和真核生物中的熱應(yīng)激蛋白,根據(jù)其同源程度和相對分子質(zhì)量,可分為HSP110、HSP90、HSP70、HSP60 及小分子熱休克蛋白(small HSPs,sHSPs)[5-6]。Mtb中的sHSPs高度保守,且可顯著增強機(jī)體抗Mtb感染的細(xì)胞免疫應(yīng)答能力[7]。Mtb 在不同應(yīng)激狀態(tài)下可高表達(dá)兩類sHSPs:一類為hspX基因編碼的Acr1蛋白(又稱Hsp16.3、16 ku抗原或HspX),另一類為acr2基因編碼的Acr2 蛋白[8],這兩類蛋白具有相似的sHSPs 特征,均含有保守的α-晶體結(jié)構(gòu)域(α-crystalline domain,ACD),該結(jié)構(gòu)域可形成大的寡聚復(fù)合物,且在體外具有不依賴ATP的伴侶功能[9-10]。據(jù)報道,ACD 與Mtb 長期潛伏在人體內(nèi)導(dǎo)致的持續(xù)感染有關(guān)[11]。在缺氧或存在一氧化氮的條件下,可誘導(dǎo)Mtb 表達(dá)Hsp16.3 蛋白[12-13];在熱休克、氧化應(yīng)激和巨噬細(xì)胞攝取條件下,可誘導(dǎo)Mtb 表達(dá)Acr2 蛋白,且在體外具有分子伴侶活性[14-16]。Acr2 蛋白表達(dá)調(diào)控在Mtb 的發(fā)病機(jī)制中發(fā)揮重要作用,其上調(diào)可顯著提高機(jī)體抗Mtb 感染的細(xì)胞免疫應(yīng)答能力,降低Mtb 在感染期間的存活率[7]。大多數(shù)蛋白在高溫下變性并發(fā)生熱聚集,如作為測定sHSPs分子伴侶功能的底物,包括檸檬酸合成酶(citrate synthase,CS)、胰島素和蘋果酸激酶(malate dehydrogenase,MDH)等[17]。本研究通過E.coli表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)Acr2,經(jīng)Ni-NTA 層析及SuperdexTM200 10/300 GL 凝膠過濾層析后,采用底物結(jié)合試驗檢測其在體外的分子伴侶活性,以期為制備具有天然活性的結(jié)核桿菌蛋白抗原提供新策略。
1.1 質(zhì)粒及菌株 重組質(zhì)粒pET-28a-Acr2由鄭州輕工業(yè)大學(xué)食品與生物工程學(xué)院蛋白純化實驗室構(gòu)建(經(jīng)南京金斯瑞生物科技有限公司測序鑒定,證明構(gòu)建正確);感受態(tài)E.coliBL21(DE3)購自生工生物工程(上海)股份有限公司。
1.2 主要試劑及儀器 MDH購自美國Sigma公司;IPTG、硫酸卡那霉素(Kan)、DTT、Ni-NTA 樹脂及其他化學(xué)試劑均購自生工生物工程(上海)股份有限公司;天然Acr2蛋白由鄭州輕工業(yè)大學(xué)食品與生物工程學(xué)院蛋白純化實驗室制備;凝血酶購自北京索萊寶科技有限公司;SuperdexTM200 10/300 GL 凝膠過濾層析柱購自美國GE Healthcare 公司;圓二色譜儀購自英國Chirascan公司。
1.3 Acr2 的表達(dá)及純化 將重組質(zhì)粒pET-28a-Acr2轉(zhuǎn)化感受態(tài)E.coliBL21(DE3),當(dāng)A600達(dá)0.6 時,加入IPTG 至終濃度為1 mmo/L,37 ℃誘導(dǎo)4 h;于4 ℃,2 920×g離心15 min,收集重組菌,用裂解緩沖液A(25 mmo/L Tris-HCl,500 mmo/L NaCl,1%甘油,10 mmo/L 咪唑,1 mmo/L PMSF,pH 8.0)重懸,經(jīng)高壓破菌儀裂解細(xì)胞后,4 ℃,7 592×g離心30 min;取上清,經(jīng)Ni-NTA 層析柱純化,依次采用含30、80、150、250、350、500 mmol/L 咪唑的緩沖液A 進(jìn)行梯度洗脫。收集含有目標(biāo)蛋白洗脫液,置緩沖液B(50 mmo/L 磷酸緩沖液,100 mmo/L NaCl,pH 7.0)中,于4 ℃濃縮透析過夜至2.5 mL;用凝血酶切除His標(biāo)簽,經(jīng)緩沖液B預(yù)平衡的SuperdexTM200 10/300 GL凝膠過濾層析柱進(jìn)一步純化,純化樣品經(jīng)超濾離心管超濾濃縮至500μL,紫外吸收光譜法檢測蛋白濃度。取各步驟樣品,經(jīng)還原型16.5%SDS-PAGE分析。
1.4 變性對Acr2蛋白二級結(jié)構(gòu)影響的檢測
1.4.1 Acr2 的變性及復(fù)性 將純化Acr2 蛋白樣品按1∶1 的體積分?jǐn)?shù)溶于緩沖液B,100 ℃溫浴15 min(熱變性),立即置于冰上冷卻5 min。另將純化Acr2蛋白按1∶1 的體積分?jǐn)?shù)溶于8 mol/L 尿素中,37 ℃溫浴4 h(化學(xué)變性);置200 倍體積緩沖液B 中透析12 h,去除變性劑。
1.4.2 圓二色性光譜法 將Acr2 蛋白熱變性、化學(xué)變性及其復(fù)性樣品分別用緩沖液B 稀釋至濃度為0.5 mg/mL,采用圓二色譜儀于200~260 nm 光譜范圍內(nèi)進(jìn)行掃描,間隔時間為0.1 min,掃描速率為100 nm/min。
1.4.3 非還原型SDS-PAGE 分析 將Acr2 蛋白兩種變性后的復(fù)性樣品,以Tris-甘氨酸為緩沖系統(tǒng),于4 ℃進(jìn)行非還原型6%SDS-PAGE分析。
1.5 Acr2 蛋白體外分子伴侶活性檢測 采用底物結(jié)合試驗。將MDH(13.4 μmol/L)分別與天然Acr2蛋白和兩種變性后復(fù)性的Acr2蛋白(50μmol/L)混合,置25和48 ℃溫控水浴中孵育2 h;于4 ℃,7 008×g離心5 min,取上清,對其進(jìn)行分子排阻色譜分析(size exclusion chromatography,SEC),即上樣至預(yù)填充柱SuperdexTM200 10/300 GL,流動相為50 mmol/L 磷酸鹽緩沖液(含100 mmol/L NaCl,pH 7.0),流速為0.5 mL/min,溫度為4 ℃。收集各峰樣品,進(jìn)行還原型16.5%SDS-PAGE分析。
1.6 數(shù)據(jù)采集及分析 應(yīng)用UNICRONTM7 軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)采集及分析,Origin 8.0 軟件作圖。
2.1 Acr2 蛋白純化產(chǎn)物的鑒定 80、150、250、350、500 mmol/L咪唑緩沖液洗脫樣品中的His-Acr2蛋白相對分子質(zhì)量約23 000,大小與預(yù)期相符,且純度較高,見圖1。His-Acr2 蛋白經(jīng)SuperdexTM200 10/300 GL 凝膠過濾層析柱純化后,于7 mL體積處被洗脫出來,相對分子質(zhì)量約為232 000,與理論值相差較大,表明Acr2在溶液中以多聚體形式存在,見圖2。目的峰蛋白純度達(dá)90%以上,濃度約為2 mg/mL,見圖3。
圖1 Ni-NTA 層析柱純化His-Acr2 蛋白的還原型SDSPAGE分析Fig. 1 Reduced SDS-PAGE analysis of His-Acr2 protein purified by Ni-NTA chromatographic column
圖2 Acr2蛋白凝膠過濾層析純化圖譜Fig.2 Profile of Acr2 protein purified by gel filtration chromatography
圖3 凝膠過濾層析純化Acr2 蛋白的還原型SDS-PAGE分析Fig. 3 Reduced SDS-PAGE analysis of Acr2 protein purified by gel filtration chromatography
2.2 變性對Acr2二級結(jié)構(gòu)的影響
2.2.1 圓二色性光譜法 熱變性及化學(xué)變性的Acr2的圓二色性光譜顯示,其不再是以β 折疊為核心的特征光譜,表明兩種變性條件可導(dǎo)致Acr2 蛋白天然的二級結(jié)構(gòu)喪失,兩種復(fù)性蛋白的圓二色性光譜與天然Acr2 蛋白一致,表明變性后復(fù)性的Acr2 蛋白可恢復(fù)其原來的二級結(jié)構(gòu)。見圖4。
圖4 Acr2蛋白的圓二色性光譜分析Fig.4 Circular dichroism spectroscopy analysis of Acr2 protein
2.2.2 非變性SDS-PAGE 分析 兩種復(fù)性Acr2 蛋白經(jīng)非還原型6%SDS-PAGE 分析,可見目的蛋白與天然Acr2 蛋白大小一致,見圖5。表明Acr2 的二級結(jié)構(gòu)在變性條件下發(fā)生的變化是完全可逆的。
圖5 Acr2蛋白的非還原型SDS-PAGE分析Fig.5 Non-reduced SDS-PAGE analysis of Acr2 protein
2.3 Acr2蛋白的體外分子伴侶活性
2.3.1 天然Acr2 蛋白 將天然Acr2 蛋白與MDH 48 ℃混合,經(jīng)SEC 色譜分析,于體積8.5 mL 處可見1個清晰的峰(峰1),該峰由MDH 和天然Acr2 蛋白組成,峰2 和峰3 由天然Acr2 蛋白組成,峰4 由MDH組成;經(jīng)25 ℃混合后,于體積14.5 mL處可見1個清晰的峰(峰4),該峰由MDH 組成,峰1、峰2 和峰3 由天然Acr2 蛋白組成。經(jīng)還原型16. 5% SDS-PAGE 分析,可見4 個洗脫峰對應(yīng)的條帶大小與理論值均相符。見圖6 和圖7。表明天然的Acr2 蛋白可與MDH 在高溫條件下形成復(fù)合物,防止MDH形成熱聚集。
圖7 天然Acr2蛋白與MDH混合物(25 ℃)的鑒定Fig. 7 Identification of mixture of natural Acr2 protein and MDH(25 ℃)
2.3.2 復(fù)性Acr2 蛋白 將兩種復(fù)性Acr2 蛋白與MDH 48 ℃混合,經(jīng)SEC 色譜分析,于體積8.5 mL 處可見1個清晰的峰(峰1),該峰由MDH和兩種復(fù)性Acr2蛋白組成,峰2 和峰3 由兩種復(fù)性Acr2 蛋白組成,峰4由MDH 組成;經(jīng)25 ℃混合后,于體積14.5 mL處可見1 個清晰的峰(峰4),該峰由MDH 組成,峰1、峰2和峰3 為兩種復(fù)性Acr2 蛋白組成。經(jīng)還原型16.5%SDS-PAGE 分析,可見4 個洗脫峰對應(yīng)條帶的大小與理論值相符。見圖8~11。表明變復(fù)性后的Acr2 蛋白具有體外分子伴侶活性。
圖8 熱變性-復(fù)性Acr2蛋白與MDH混合物(48 ℃)的鑒定Fig.8 Identification of mixture of Acr2 protein and MDH after thermal denaturation-renaturation(48 ℃)
圖9 熱變性-復(fù)性Acr2蛋白與MDH混合物(25 ℃)的鑒定Fig.9 Identification of mixture of Acr2 protein and MDH after thermal denaturation-renaturation(25 ℃)
圖10 化學(xué)變性-復(fù)性Acr2蛋白與MDH混合物(48 ℃)的鑒定Fig. 10 Identification of mixture of Acr2 protein and MDH after chemical denaturation-renaturation(48 ℃)
Mtb是引發(fā)結(jié)核病的病原體,可潛伏在肺部巨噬細(xì)胞達(dá)數(shù)十年,且在該狀態(tài)下,Mtb 的復(fù)制與機(jī)體的免疫系統(tǒng)應(yīng)答處于動態(tài)平衡狀態(tài),導(dǎo)致結(jié)核病較難根治[18]。Mtb 感染早期采取的一種免疫逃逸策略是為了延緩?fù)淌审w的成熟及免疫識別。研究發(fā)現(xiàn),Acr2 的早期表達(dá)不僅可保護(hù)處于潛伏狀態(tài)的Mtb 免受體內(nèi)環(huán)境的攻擊,還可使Mtb 暴露于免疫應(yīng)答之中。因此Acr2 可能成為新型抗結(jié)核病藥物的理想靶點[19]。
本研究在E.coli中成功表達(dá)了重組蛋白Acr2,經(jīng)純化獲得了較高純度的蛋白。通過洗脫峰色譜圖發(fā)現(xiàn),相對分子質(zhì)量與理論值差異較大,推斷Acr2蛋白具有多聚性,形成相對分子質(zhì)量較大的多聚體。由于SDS-PAGE 具有解聚性,使Acr2 蛋白在電泳圖中的相對分子質(zhì)量與其單體大小相符。熱變性和化學(xué)變性是使蛋白變性的最常用方法。二級結(jié)構(gòu)大多以β-折疊為核心是sHSPs 家族成員的典型特征之一,Acr2蛋白分別經(jīng)高溫加熱和高濃度尿素兩種途徑變性,復(fù)性過程在無其他輔助蛋白參與下,通過自發(fā)再折疊和再組裝,可恢復(fù)至其二級結(jié)構(gòu)的天然構(gòu)象,這對維持Acr2蛋白的生物學(xué)活性和功能十分重要。本研究結(jié)果表明,由于Acr2 蛋白自身所具有的聚合特性,經(jīng)變性-復(fù)性后的Acr2蛋白可在48 ℃熱激條件下與變性的MDH 形成穩(wěn)定的復(fù)合物。根據(jù)Acr2 蛋白的多聚性使Acr2 蛋白及其與MDH 形成的復(fù)合物出峰位置與單體蛋白的出峰位置差異較大,SDS-PAGE的解聚性使電泳圖中Acr2蛋白及其復(fù)合物的蛋白條帶均顯示以單體形式存在。表明經(jīng)變性-復(fù)性后的Acr2蛋白在體外也能與底物結(jié)合發(fā)揮其分子伴侶活性。本研究制備的Mtb 分子伴侶Acr2 蛋白有望作為有效診斷Mtb 潛伏感染的靶標(biāo)蛋白,對治療人類Mtb 潛伏期感染藥物的研發(fā)具有重要意義。