孔德慶,秦 箐,張崇妍,劉治辰,徐曉龍,蘭茗熙,王一川,張景文,趙 丹,王志新,李金泉,劉志紅
(1.內蒙古農業(yè)大學動物科學學院,內蒙古 呼和浩特 010018;2.內蒙古自治區(qū)動物遺傳育種與繁殖重點實驗室,內蒙古 呼和浩特 010018;3.農業(yè)農村部肉羊遺傳育種重點實驗室,內蒙古 呼和浩特 010018;4.內蒙古自治區(qū)山羊遺傳育種工程技術研究中心,內蒙古 呼和浩特 010018)
畜牧業(yè)是我國的重要行業(yè),畜牧業(yè)發(fā)展中提高畜禽產品產量及質量是重要環(huán)節(jié)。骨骼肌是畜禽機體主要組成部分,骨骼肌發(fā)育的研究利于在遺傳育種中改良畜禽生長性狀,進而在實際生產應用中提高肉產量等畜禽生產水平。肌纖維構成骨骼肌,骨骼肌發(fā)育的本質是肌纖維發(fā)育,研究肌纖維發(fā)育的目的是促進肌纖維發(fā)育,使肌纖維的體積或數(shù)量擴增[1]。畜禽肌纖維發(fā)育早已研究到基因層面,相關基因之間是存在協(xié)同或拮抗作用的。一些物質(如信號通路需要的酶)在畜禽機體內不存在或不足,需要通過外源性物質的添加來調控肌纖維發(fā)育相關基因,進而促進肌纖維發(fā)育。
外源性物質的添加方式主要有植入和飼喂等,可通過人工合成來提供原料,再植入或飼喂到畜禽體內?;虻任⒂^物質可以采用植入方法進行添加,植入外源性物質主要通過注射或基因編輯等方式來進行。若能永久性改變基因,可選基因突變產生的優(yōu)良種質進行育種,進而應用到畜禽生產中。該文以近5 年研究文獻為材料,對影響肌纖維發(fā)育的不同外源性物質進行綜述,為畜禽的育種及改善肉質提供思路。
肌纖維也稱肌細胞,它是骨骼肌主要組成部分。肌纖維按類別可分成Ⅰ型(耐酸而堿不穩(wěn)定)肌纖維和Ⅱ型(耐堿而酸不穩(wěn)定)肌纖維,肌纖維發(fā)育的不同時期中Ⅰ型肌纖維和Ⅱ型肌纖維比例和變化都不同[2]。肌纖維發(fā)育時期可分為胚胎發(fā)育期和出生后發(fā)育期,其中胚胎發(fā)育期主要是:生成肌祖細胞,形成肌細胞,肌管分化成肌纖維,以及肌纖維發(fā)育至成熟。而肌纖維的大部分發(fā)育在胚胎發(fā)育期就已經完成,其在出生后數(shù)量通常不變,所以出生后發(fā)育期研究重點是如何增加肌纖維的體積[3-6]。
生 肌 調 節(jié) 因 子 (muscle regulatory factors,MRFs)是參與肌纖維發(fā)育調控的重要基因家族,其家族成員主要包括生肌決定因子(myogenic determining factor,MyoD)、肌細胞生成素(myogenin,MyoG)、生肌調節(jié)因子4 (muscle regulatory factor 4,MRF4)和生肌調節(jié)因子5 (myogenic factor 5,Myf5),在肌纖維發(fā)育過程中參與肌肉前體細胞增殖、肌纖維形成、出生后肌肉功能調節(jié)等[7]。配對盒基因(paired box gene,Pax)也是肌纖維發(fā)育調控中不可或缺的基因家族,其家族成員主要包括Pax3 與和Pax7,而Pax3 和Pax7 在肌發(fā)生中部分功能有相同之處,可共同調控肌纖維發(fā)育[8]。此外還有其他負調控肌纖維發(fā)育的基因,如肌生長抑制素(myostatin)基因MSTN 等,敲除MSTN 可促進肌纖維發(fā)育,對肌纖維發(fā)育的研究也十分重要。Wnt 信號通路和音猬因子(sonic hedgehog,Shh)信號通路是2 個功能相似的信號通路,兩者起協(xié)同作用可共同激活Myf5[9-10]。
對肌纖維發(fā)育基因及信號通路有影響的外源性物質主要分成以下6 類:①與甲基化相關外源性物質:其影響的基因有MRFs 家族、Pax7 等。這類物質主要包括IGF-Ⅰ的DNA 甲基化狀態(tài)、含甲基供體的營養(yǎng)素、Mll1 等。甲基結合在某些促生長因子特定部位,可與生肌因子相互作用促進肌纖維發(fā)育。②與有機酸相關外源性物質:其影響的基因有MRFs 家族、Pax3 與Pax7 等。這類物質主要包括氨基酸(Ile、Leu、Met 等)和其他有機酸(油酸等)。某些氨基酸可促進肌肉蛋白合成,其他某些有機酸可激活或促進信號通路轉導。③與催化調節(jié)相關外源性物質:其影響的基因有MRFs 家族、Pax7 等。這類物質主要包括酶(PRMT1 等)、激素 (睪酮、ISO 等);其影響的信號通路有Wnt 和Shh 信號通路等。這類物質主要包括酶(ENPP2、JARID2、ADAMTS5 等)、激素相關物質(TEST-E、TREN 等)。某些酶能促進肌原蛋白表達,某些激素相關物質能促進肌纖維發(fā)育相關基因表達。④與轉錄相關外源性物質:其影響的基因有MRFs家族、Pax3 與Pax7 等。這類物質主要包括轉錄因子(lncMGPF、EGR1、HEYL、KLF4、Ldb1、MRTF-A等),miRNA(miR-27b、miR206、miR-204、miR145、miR181 等);其影響的信號通路有Wnt 和Shh 信號通路。這類物質主要包括轉錄因子(TGFβ 等)和其他蛋白(FNDC4、Plec、Podocan 等)。某些轉錄因子可輔助聚合RNA,其與某些miRNA 起協(xié)同作用共同調控肌原細胞,某些蛋白起轉錄后調控作用。⑤與基因相關外源性物質:其影響的信號通路有Wnt 和Shh 信號通路。這類物質主要包括MyD88、MFCS4 等。這類物質較少,但其相關研究比較重要,其本身就可能具有調控肌纖維發(fā)育作用的某些基因,其與其他正調控因子起協(xié)同作用,或與負調控因子起拮抗作用,以促進肌纖維發(fā)育。⑥其他外源性物質:其可能不屬于主流研究或研究較少不便于分類的某些外源性物質。其影響的基因有MRFs 家族、Pax3 與Pax7 等。其主要包括FMN、硅酸鹽、穿心蓮內酯、小球藻、二甲雙胍、維生素A、白細胞介素4 等;其影響的信號通路有Shh 信號通路等。其主要包括紫黃嘌呤等。其可能直接影響肌纖維發(fā)育相關基因或信號通路,也可能通過影響甲基化相關外源性物質、轉錄相關外源性物質來間接影響肌纖維發(fā)育相關基因或信號通路。
與甲基化相關外源性物質:MyoD 與類胰島素一號生長因子(insulin-like growth factors-Ⅰ,IGF-Ⅰ)的DNA 甲基化狀態(tài)相互作用于不同發(fā)育階段來調控肌肉生長,因此可植入IGF-Ⅰ來促進MyoD 表達[11]。飼喂含甲基供體的營養(yǎng)素可使Ⅱ型肌纖維增多,可增加肌纖維橫切面積,上調Myf5 等,以及促進線粒體合成相關基因的表達[12]。甜菜堿屬于含甲基供體的營養(yǎng)素,飼喂甜菜堿可通過影響NFATc1 信號通路來增強成肌細胞分化,通過負調控MyoD 的表達來抑制成肌細胞增殖,整體上促進肌纖維發(fā)育[13]。植入混合譜系白血病蛋白-1 (mixed lineage leukemia-1,MLL1)可通過介導其啟動子上的組蛋白第三亞基四號賴氨酸的三甲基化 (trimethylation of lysine 4 on histone H3 protein subunit,H3K4me3)進而調控Myf5,來促進Pax7 的表達以及成肌細胞的增殖[14]。
與有機酸相關外源性物質:飼喂異亮氨酸(isoleucine,Ile)可 上 調 肌 球 蛋 白 重 鏈(myosin heavy chain,MyHC)、MyoD、MyoG、過氧化物酶體增殖物激活受體γ(peroxisome proliferator-activated receptor gamma,PPARg)以及脂肪酸合酶(fatty acid synthase,F(xiàn)AS)蛋白等物質的水平[15]。飼喂亮氨酸(leucine,Leu)可調控IGF mRNA、肌肉生長相關基因的表達,通過調節(jié)AKT/TOR 信號通路增加肌肉蛋白合成,并通過調節(jié)AKT/FOXO3a 信號通路減弱蛋白降解,從而促進肌纖維發(fā)育[16]。
與催化調節(jié)相關外源性物質:植入蛋白精氨酸甲基轉移酶1(proteinargininemethyltransferase1,PRMT1)使MyoD 介導的肌原蛋白表達得到促進,使MyoD R121 位點的精氨酸甲基化對其DNA 結合活性和反轉錄活性得到增強[17]。飼喂睪酮可增加成纖維細胞生長因子2 (fibroblast growth factor 2,F(xiàn)GF2)的表達,而降低MRF4 和肌生成抑制素的表達[18]。脂素lipin1 的缺失抑制了蛋白激酶PKC 亞型活性,也抑制了Ⅱ類去乙?;窰DAC5功能,從而抑制肌細胞特異性增強因子2C(recombinant myocyte specific enhancer factor 2C,MEF2C)和MyoD 的表達,反之其植入對MEF2c和MyoD 有促進作用[19]。
與轉錄相關外源性物質:lncMGPF 作為長鏈非編碼RNA,是miR-135a-5p 的分子海綿,其植入可使肌細胞增強因子2C(myocyte enhancer factor 2C,MEF2C)表達增加,也可使MyoD 和MyoG的信使RNA 穩(wěn)定性增強,進而促進肌肉分化[20]。植入早期生長應答因子1(recombinant early growth response protein 1,EGR1)可以正向調控MyoG,進而調控肌纖維發(fā)育[21]。
其他外源性物質:植入芒柄花素(formononetin,F(xiàn)MN)可抑制肌肉生長抑制素的表達,可增加磷酸激酶的磷酸化,可增加肌原性增殖分化標志物數(shù)量,也可促進MyoD 和肌原蛋白的表達[22]。飼喂適量硅酸鹽,其中的硅離子可促進MyoG、MyoD、神經生長因子(neurturin,NRTN)和γ-氨基丁酸(aminobutyric acid,GABA)的表達,進而促進肌纖維發(fā)育[23]。飼喂穿心蓮內酯可促進MyoD、MyoG、成肌細胞融合蛋白Myomaker、肌原調節(jié)蛋白1(myozenin 1,Myoz1)和Myoz3 等與肌管分化相關基因表達,也可促進H3K4Me2、H3K4Me3 和H3K36Me2 等組蛋白修飾[24]。飼喂小球藻可促進miR-133b 和miR-206 的表達,即調節(jié)微小核糖核酸(microRNAs,myomiRs)的表達,也可促進成肌細胞的增殖分化[25]。
與甲基化相關的外源性物質:Pax7 在Mll1 成肌細胞中的重新表達可恢復H3K4me3 在Myf5 啟動子上的富集并促進Myf5 的表達,所以植入Mll1可促進Pax7 在體內的表達并增強衛(wèi)星細胞的功能[26]。
與有機酸相關外源性物質:飼喂蛋氨酸(methionine,Met)可使Myf5 調控的陽性衛(wèi)星細胞密度有下降的趨勢,而使Pax7 表達的細胞密度有增加的趨勢,總體上還是起促進肌纖維發(fā)育的作用[27]。在沒有激活劑噻唑烷二酮的情況下,油酸可使Pax3 和MyOD1 表達降低,但使Pax7 和MyoG 表達升高,總體上飼喂油酸可以促進肌肉發(fā)育[28]。
與催化調節(jié)相關外源性物質:注射異丙腎上腺素(ISOprenaline,ISO)可激活β-腎上腺素信號,誘導成肌細胞增殖,增加Pax7 調控的陽性成肌細胞百分比和骨骼肌纖維大小[29]。飼喂睪酮能夠促進腿肌中雄激素受體(androgen receptor,AR)的表達,增加p-Akt 激酶的含量,上調Pax7 的表達,進而促進肌纖維的增殖[30]。
與轉錄相關外源性物質:植入轉錄因子HEYL 和Krupple 樣因子4(Kruppel-like factor 4,KLF4)可促進從成纖維細胞衍生的Pax3 調控的陽性肌原性祖細胞表達[31]。LIM-結構域結合蛋白1(LIM domain binding protein 1,Ldb1)被獨立于蛋白復合物Ctcf-Cohesin 招募到Pax3 結合元件上,這是H3K4me1 在這些位點和染色質環(huán)上有效沉積所必需的,即植入Ldb1 對Pax3 有一定促進作用[32]。植入轉錄因子心肌相關轉錄因子-A(myocardin related transcription factor A,MRTF-A)可通過與其遠端CArG 盒序列結合,作為一種新的Pax7 調節(jié)因子參與Pax7 介導的成肌細胞增殖分化[33]。miR-27b 與Pax3 作用相反,miR-27b 直接靶向Pax3 mRNA 的3'-非翻譯區(qū),植入miR-27b可負調控Pax3 因子的表達來抑制骨骼肌衛(wèi)星細胞的增殖,但促進骨骼肌衛(wèi)星細胞的分化,整體來說其對肌纖維發(fā)育也有促進作用[34]。Pax3'非翻譯區(qū)不同的Pax3 信使RNA 的亞型易受miR206 的調控,植入miR206 可導致體內Pax3 因子的水平不同[35]。Pax7、IGF-Ⅰ和MEF2C 分別是miR-204在成肌細胞增殖分化過程中的靶基因,植入miR-204 可促進Pax7 表達[36]。miR145 可以上調Pax3、Pax7、MyoD1、MyoG 和MyHC2,而miR181 可以觸發(fā)Myf5 和MyHC2 等肌原性因子表達,所以可植入這兩種miRNA 以促進肌肉發(fā)育[37]。
其他外源性物質:飼喂二甲雙胍可使Pax7 因子水平及其陽性細胞數(shù)量顯著增加,也可使衛(wèi)星細胞增殖[38]。飼喂VA 可促進Pax7 陽性衛(wèi)星細胞和 肌 原 性 標 記 基 因 包 括Pax7、Myf5、MyoD 和MyoG 的表達。VA 也增加了氧化型Ⅰ型和ⅡA 型纖維的比例,降低了乙醇型IIX 型纖維,其整體上起促進肌纖維發(fā)育作用[39]。植入白細胞介素4 可促進胚胎干細胞分化過程中早期肌原基因如Mesogenin1、Pax3 和Pax7 的表達[40]。
與催化調節(jié)相關外源性物質:外核苷磷酸二酯酶Ⅱ型 (recombinant ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2,ENPP2)受WNT/ β-Catenin 信號調節(jié)因子的調控,其植入可促進肌纖維肌源性分化[41]。植入組蛋白去甲基化酶(jumonji,AT rich interactive domain 2,JARID2)和多梳抑制復合物2 (polycomb repression complex 2,PRC2)復合物可通過抑制Wnt 拮抗劑而促進Wnt信號通路來調節(jié)肌肉分化[42]。血小板反應蛋白解整合素金屬肽酶5 (recombinant A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin 5,ADAMTS5)和Shh 協(xié)同調控MyoD 的表達,作用并不依賴于ADAMTS5 的催化活性,即植入ADAMTS5 可調節(jié)影響肌肉發(fā)育的重要細胞信號通路中的非酶功能[43]。飼喂庚酸睪酮(testosterone enanthate,TEST-E)和群勃龍(trenbolone,TREN)可增加雄激素敏感的提肛肌/球海綿體肌中的Wnt5a 蛋白,即芳香化和非芳香化雄激素增加了骨骼肌中Wnt5a 蛋白的表達[44]。
與轉錄相關外源性物質:植入轉化生長因子β 活化激酶(TGF-β activated kinase,TAK1)可使Shh 和轉錄因子Gli2 的轉錄本顯著上調[45]。植入含纖維連接蛋白Ⅲ型結構域4 (fibronectin typeⅢdomain-containing protein 4 ,F(xiàn)NDC4)可以通過轉錄后調控作用激活Wnt/β-連環(huán)蛋白信號轉導,進而影響成肌細胞C2C12 的分化[46]。血小板及白細胞C 激酶底物(platelet and leukocyte C kinase substrate,Plec)和肌成纖維細胞(myofibroblast,MyoF)的轉錄后調控作用可以保護蓬亂蛋白Dsh 同源物2(dishevelled,dsh homolog 2,Dvl-2)免受自噬介導的降解來保持穩(wěn)定狀態(tài),即植入Plec 可通過激活Wnt/β-連環(huán)蛋白信號通路促進骨骼肌發(fā)育[47-48]。Podocan 蛋白是正常C2C12 分化所必需的,其植入可通過轉錄后調控作用增強Wnt/β-連環(huán)蛋白通路進而促進肌生成[49]。
與基因相關外源性物質:植入髓樣分化因子(myeloid differentiation factor 88,MyD88)可在肌生成過程中調節(jié)非典型的NF-κB 信號通路和典型的Wnt 信號通路,促進小鼠骨骼肌生長,以及促進過負荷誘導的肌纖維肥大[50]。缺乏Shh 順式增強子(ShhMFCS4/—,MFCS4)的小鼠,會減少舌背上皮Shh,擾亂舌隔肌腱的形成,破壞了內在肌肉模式,反之說明植入MFCS4 可促進肌肉生成[51]。
其他外源性物質:飼喂紫黃嘌呤可激活Shh信號,或促進嗎啉基(morpholino,MO)表達進而激活轉錄抑制因子Gli3 的敲除,挽救了miR-133 敲除(knock-down,KD)表型,參與構建Shh/MRF/miR-133/Gli3 軸[52]。
與有機酸相關外源性物質:飼喂丁酸能增加PPAR γ 共激活因子1α (PPAR-γ coactivator 1 alpha,PGC-1α)水平,增加靶TEA 結構域轉錄因子1(TEA domain transcription factor 1,TEAD1)基因水平,以及增加miR-208b 和miR-499-5p 水平,以達到促進肌纖維發(fā)育的目的[53]。飼喂N-氨甲酰谷氨酸(N-carbamylglutamate,NCG)可轉化相關基因(MSTN、PPAR-γ 和PGC-1α)表達,增加Ⅰ型肌纖維比例,提高肌肉抗氧化機能,從而改善肌肉品質[54]。飼喂丁酸、辛酸和棕櫚酸可能通過促進AMPK 信號通路和Ca2+依賴的信號通路來增加肌纖維密度以及較小直徑肌纖維比例[55]。飼喂較低水平二十二碳六烯酸(docosahexaenoic acid,DHA)可通過激活AMPK/Sirtl 信號通路途徑促進白肌增生和肌纖維發(fā)育,但高水平的DHA 可通過激活P53/Cycling 信號通路途徑誘導細胞周期停滯而抑制生長,所以需要控制用量[56]。
與轉錄相關外源性物質:植入miR-499-5p可能通過下調轉錄因子豬Sox6 (porcine Sox6,pSox6)的表達來促進氧化肌纖維的形成[57]。miR-152 直接靶向解偶聯(lián)蛋白3 (uncoupling protein 3,UCP3)的30 個非翻譯區(qū) (unique taxpayer reference,3'-UTR),導致其在蛋白水平上轉錄后抑制,而UCP3 相關信號通路介導了miR-152 在慢收縮肌纖維形成中的作用。即植入miR-152 可促進慢收縮肌纖維形成和骨骼肌生成來調控肉質[58]。Vgll3 蛋白過表達可降低Hippo 信號通路負反饋回路的活性,可影響肌肉調節(jié)基因Myf5、Pitx2 和Pitx3 等基因的表達,以及可編碼某些Wnts 和IGFBP 蛋白相關基因的表達。即植入Vgll3 可作為一種轉錄基因輔助因子與Hippo 信號通路一起控制肌生成[59]。
與基因相關外源性物質:FSIII 基因使Smad和Erk 通路被抑制,使PI3k/Akt 通路激活。MyoD、Myf5 和MyoG 轉錄水平上調,而MRF4 轉錄水平下調。即植入FSIII 基因可通過調控與MSTN 相關的信號通路,以及調控肌原性調節(jié)因子的表達,進而整體上介導骨骼肌肥大[60]。
其他外源性物質:飼喂原花青素B2(proanthocyanidin B2,PB2)可通過調控AMPK 信號通路來促進C2C12 肌管中慢收縮肌相關基因的表達[61]。植入MST1/2 激酶的抑制劑XMU-MP-1 可刺激YAP 相關信號通路在成肌細胞和肌管中的核定位,可上調肌原蛋白,進而促進成肌細胞融合[62]。酶解大豆蛋白效應物Ala-Phe 二肽可通過激活ERK1 和ERK2 信號通路來促進成肌細胞增殖和分化,Glu-Tyr 二肽可通過激活ERK1 信號通路促進成肌細胞增殖和分化,而Glu-Tyr 和Ala-Phe 二肽都能通過激活TOR 信號通路促進成肌細胞蛋白質合成。所以可通過飼喂酶解大豆蛋白來促進肌纖維發(fā)育[63]。飼喂蘿卜硫素(sulforaphane,SFN)可激活Akt 蛋白,可通過Foxo 蛋白依賴的信號通路增強蛋白質合成,進而增加肌管直徑[64]。
由于存在一些負調控肌纖維發(fā)育的因子,需要使用敲除或消融手段消除這類因子,以達到促進肌纖維發(fā)育的目的。這類因子包括基因(MSTN、Sox6 等)、蛋白(Hes1、TMEM182 等)。在胎兒時期敲除功能性MSTN 可通過促進肌纖維的增生和肥大導致肌肉質量的顯著增加[65]。Sox6 是體內慢肌相關基因表達的肌纖維富集抑制因子,敲除Sox6可使慢肌的纖維數(shù)量增加[66]。在干細胞中消融轉錄調節(jié)因子Hes1 振蕩器可干擾穩(wěn)定的MyoD 振蕩,也可導致MyoD 持續(xù)表達時間延長,進而導致分化傾向的增加[67]??缒さ鞍?82(transmembrane protein 182,TMEM 182)可在功能上抑制成肌細胞的分化和融合,其與整合素β 1 (integrin beta 1,ITGB1)可相互作用。TMEM182 的肌原性缺失可提高ITGB1 與層粘連蛋白的結合活性,在肌發(fā)生過程中可誘導FAK-ERK 和FAK-Akt 信號軸的激活。所以敲除TMEM182 可促進肌纖維發(fā)育[68]。
綜上所述,肌纖維生長發(fā)育相關基因相互影響,而基因也受到外源性物質的調控。雖然已經探索發(fā)現(xiàn)了許多外源性物質對基因的影響,但還有很多方面問題亟待解決。比如MSTN 突變體與MSTN 作用相反,是否其他負調控因子突變也有類似情況? 比如不同外源性物質若同時添加到畜禽體內,是否起協(xié)同作用而更好地促進肌纖維發(fā)育,具體還需要加以驗證。今后,還需加強肌纖維基因的研究,找到更多對肌纖維發(fā)育影響的基因以及相關外源性物質,并將其應用到畜禽育種和生產中。