張嘉蔚,袁 琴,徐賢榮,方學(xué)賢,曹亦菲,楊 軍,*
(1.杭州師范大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院營養(yǎng)與毒理學(xué)系,浙江 杭州 311121;2.四川大學(xué)華西公共衛(wèi)生學(xué)院勞動(dòng)衛(wèi)生與環(huán)境衛(wèi)生學(xué)系,四川 成都610041)
前列腺癌(prostate cancer,PCa)是世界范圍內(nèi)男性發(fā)病率高居第2位的惡性腫瘤,其發(fā)病率具有明顯的地理和種族差異,在歐美國家明顯高于亞洲國家[1]。隨著人口老齡化,前列腺癌在我國男性中的發(fā)病率呈明顯上升趨勢,居男性泌尿系統(tǒng)腫瘤之首,已成為近十年來增速最快的男性惡性腫瘤之一,嚴(yán)重影響我國男性健康。
對于前列腺防治而言,尋找能夠用于前列腺癌早期篩查的生物標(biāo)志物至關(guān)重要。目前,前列腺特異性抗原(prostate specific antigen,PSA)是前列腺癌臨床使用最廣泛的無創(chuàng)腫瘤生物標(biāo)志物。但PSA在前列腺炎癥和良性前列腺增生患者中也會(huì)高表達(dá),導(dǎo)致假陽性結(jié)果,繼而可能會(huì)造成前列腺癌過度診斷或過度治療[2]。因此,臨床上需要更加靈敏和特異的生物學(xué)標(biāo)志物對前列腺癌進(jìn)行檢測。
有研究發(fā)現(xiàn)跨膜絲氨酸蛋白酶2(transmembrane protease,serine 2,TMPRSS2)和E-Twenty-Six(ETS)轉(zhuǎn)錄因子家族基因的融合(TMPRSS2::ETS)可能與前列腺癌的發(fā)生和進(jìn)展有關(guān)[3]。TMPRSS2基因是一種定位于染色體21q22.3的前列腺特異性和雄激素反應(yīng)基因,編碼絲氨酸蛋白酶家族蛋白質(zhì),對細(xì)胞生長和維持正常形態(tài)具有重要作用。在前列腺癌中與TMPRSS2發(fā)生融合的成員中,ETS家族成員ERG(ETS-related gene)最常見。研究表明TMPRSS2::ETS融合基因在歐美人群中的發(fā)生率高達(dá)50%[3],而在中國不同的研究中,TMPRSS2::ETS基因融合的頻率范圍廣,從7.5%~90%均有報(bào)道[4-7]。我們前期在對27例中國前列腺癌患者的分析中也僅發(fā)現(xiàn)有6例存在TMPRSS2::ERG融合基因(22.2%)[8],因此,基于不同的研究設(shè)計(jì)、檢測方法或樣本量等,該融合基因在中國患者中的結(jié)論尚不統(tǒng)一。
在歐美等國家已將TMPRSS2::ERG融合基因檢測納入前列腺癌患者診斷標(biāo)志物清單中[9],而在我國患者中是否應(yīng)將TMPRSS2::ERG融合基因檢測作為診斷標(biāo)志物還有待進(jìn)一步確認(rèn)。在此之前,明確我國前列腺癌患者中TMPRSS2::ETS融合基因發(fā)生率及可能的影響因素是后續(xù)相關(guān)工作開展的基礎(chǔ)。因此,本研究就中國前列腺癌患者中TMPRSS2::ETS融合基因發(fā)生率進(jìn)行meta分析,以闡明TMPRSS2::ETS融合基因在前列腺癌中的發(fā)生情況及可能的影響因素,為前列腺癌的診斷及預(yù)后研究提供新思路。
使用醫(yī)學(xué)主題詞條術(shù)語(MeSH)和關(guān)鍵詞“Gene Fusion”和“Prostatic Neoplasms”的組合在PubMed、Web of Science和Google Scholar中進(jìn)行無語言和時(shí)間限制的檢索。在中文萬方醫(yī)學(xué)在線數(shù)據(jù)庫、中國知識資源總庫(CNKI)和維普數(shù)據(jù)庫中檢索期刊文章,檢索詞為“前列腺癌”或“前列腺腫瘤”和“融合基因”或“TMPRSS2”或“跨膜絲氨酸蛋白酶2”等,限定文章語言種類為中文和英文。在PubMed數(shù)據(jù)庫和中國知識資源總庫中通過相關(guān)文章或類似文章檢索到的文章進(jìn)行檢索。同時(shí)篩選所有相關(guān)文章的參考文獻(xiàn),以獲得更多相關(guān)研究。
納入標(biāo)準(zhǔn):①所有參與研究的患者均經(jīng)診斷試驗(yàn)(如經(jīng)病理證實(shí)的針吸活檢或前列腺切除組織標(biāo)本)驗(yàn)證;②研究對象為中國人群;③可以獲得TMPRSS2融合基因發(fā)生率、患者臨床病理指標(biāo);④患者年齡在18歲以上的病例-對照研究、隊(duì)列研究、橫斷面研究;⑤當(dāng)在多于一篇文章中呈現(xiàn)數(shù)據(jù)或數(shù)據(jù)子集時(shí),選擇具有最詳細(xì)信息的文章或最近的文章。排除標(biāo)準(zhǔn):①不是原始文獻(xiàn);②動(dòng)物實(shí)驗(yàn);③晚期前列腺癌患者;④術(shù)前經(jīng)激素治療、化療、放療者;⑤患有其他與融合基因相關(guān)疾病,比如白血病、尤文因肉瘤、淋巴瘤患者;⑥TMPRSS2融合基因發(fā)生率資料無法提取或不完整;⑦未通過金標(biāo)準(zhǔn)診斷驗(yàn)證的患者;⑧樣本小于50例,質(zhì)量評價(jià)結(jié)果較差(無明確的TMPRSS2::ETS基因融合檢測結(jié)果判讀標(biāo)準(zhǔn)等)的研究。
資料信息是通過標(biāo)準(zhǔn)化的數(shù)據(jù)表格提取的,含:1)原始研究的基本信息,包括發(fā)表年份、第一作者、文獻(xiàn)出處、研究中心、卷期號、頁碼、資金資助。2)研究對象的基本信息。①研究人群的人口學(xué)特征,包括年齡、地區(qū)、樣本數(shù)量;②臨床病理特征,包括PSA水平、Gleason評分、TNM分期、樣本類型和來源。3)檢測技術(shù)方法。4)TMPRSS2融合基因發(fā)生率和融合類型。
根據(jù)Cochrane的建議,每項(xiàng)研究的質(zhì)量使用診斷研究質(zhì)量評估(QUADAS-2)工具進(jìn)行評估,QUADAS-2工具是為診斷準(zhǔn)確性設(shè)計(jì)的質(zhì)量評估工具[10]。由兩位評審員提取數(shù)據(jù),并獨(dú)立評估研究質(zhì)量。任何分歧都是通過協(xié)商一致解決的。如果分歧不能解決,則由第三位審查員進(jìn)行調(diào)解。
對于TMPRSS2::ETS基因融合率的研究應(yīng)用Stata 12.0和Review Manager 5.3進(jìn)行單純率的meta分析,并根據(jù)預(yù)期的異質(zhì)性對這些信息選擇隨機(jī)效應(yīng)模型。在森林圖中以95%的置信區(qū)間(95%CI)估計(jì)納入研究的效果。異質(zhì)性評價(jià)采用I2檢驗(yàn)。為方便解釋,將異質(zhì)性的低、中、高程度分別用I2統(tǒng)計(jì)量25%、50%、75%表示。使用漏斗圖和Egger’s系數(shù)定性和定量評估發(fā)表偏倚的程度。從樣本類型、檢測技術(shù)、地理環(huán)境三方面進(jìn)行亞組分析。
本研究通過檢索共獲得828篇相關(guān)文獻(xiàn),在閱讀文題和摘要以后,因重復(fù)和其他原因排除768篇文獻(xiàn)。對全文進(jìn)行仔細(xì)閱讀后排除44篇文章。最后有16項(xiàng)符合所有納入標(biāo)準(zhǔn)的研究被考慮用于分析。Meta分析中研究選擇的詳細(xì)程序如圖1所示。
圖1 文獻(xiàn)篩選流程
納入文章的患者基線特征和研究設(shè)計(jì)變量總結(jié)如表1所示。使用QUADAS-2工具進(jìn)行質(zhì)量分析的結(jié)果如圖2所示。所有研究均無適用性問題,并且流程和時(shí)間的偏倚風(fēng)險(xiǎn)低。
圖2 QUADAS-2條目評價(jià)文獻(xiàn)質(zhì)量
表1 納入研究的基本特征
2.3.1TMPRSS2::ETS融合基因與前列腺癌的相關(guān)性Meta分析結(jié)果顯示,中國前列腺癌患者中TMPRSS2::ERG融合基因?yàn)橹饕愋?,其發(fā)生率為16.7%,95%CI(14.5%,18.8%),I2=58%(見表2),異 質(zhì) 性 較 高(I2>50%),未 檢 出ETV1(ETS variant transcription factor 1)和ETV4基因(見表3)。
表2 TMPRSS2::ERG融合基因與前列腺癌的相關(guān)性
表3 納入研究的TMPRSS2::ETS基因融合頻率
2.3.2 敏感性分析依次剔除單個(gè)研究后發(fā)現(xiàn),在剔除Mao Xuying等[5]的文獻(xiàn)后,對分析結(jié)果略有影響??傮w來說,結(jié)果具有穩(wěn)健性。
2.3.3 基于樣本來源的亞組分析當(dāng)基于樣本類型進(jìn)行分析時(shí)(見表4),使用根治切除樣本的研究中TMPRSS2::ERG融合基因發(fā)生率為12.4%,95%CI(7.8%,18.0%),I2=44%(2項(xiàng)研究);使用活檢樣本的研究中TMPRSS2::ERG融合基因發(fā)生率為17.9%,95%CI(15.8%,20.1%),I2=20%(6項(xiàng)研究);既含根治標(biāo)本又含活檢標(biāo)本的研究中TMPRSS2::ERG融合基因發(fā)生率為16.4%,95%CI(13.6%,19.3%),I2=0(1項(xiàng)研究);使用尿道電切樣本的研究中TMPRSS2::ERG融合基因發(fā)生率為23.7%,95%CI(18.3%,29.1%),I2=0(2項(xiàng)研究);樣本來源未知的研究中TMPRSS2::ERG融合基因發(fā)生率為14.0%,95%CI(9.3%,18.8%),I2=54%(5項(xiàng)研究)。
表4 TMPRSS2::ERG融合基因在中國前列腺癌患者中的發(fā)生率(樣本類型)
2.3.4 基于檢測技術(shù)的亞組分析當(dāng)基于檢測技術(shù)和方法進(jìn)行分析時(shí)(見表5),使用FISH的研究中TMPRSS2::ERG融合基因發(fā)生率為16.7%,95%CI(13.4%,19.9%),I2=72%(9項(xiàng)研究);使用IHC的研究中TMPRSS2::ERG融合基因發(fā)生率為16.6%,95%CI(13.0%,20.2%),I2=39%(5項(xiàng)研究);使用qPCR/IHC的研究中TMPRSS2::ERG融合基因發(fā)生率為14.9%,95%CI(9.7%,20.2%),I2=0(1項(xiàng)研究);使用RNA-seq的研究中TMPRSS2::ERG融合基因發(fā)生率為19.1%,95%CI(9.8%,28.5%),I2=0(1項(xiàng)研究)。
表5 TMPRSS2::ERG融合基因在中國前列腺癌患者中的發(fā)生率(檢測技術(shù))
2.3.5 基于地理環(huán)境的亞組分析當(dāng)基于地理環(huán)境進(jìn)行分析時(shí)(見表6),中國北方TMPRSS2::ERG融合基因發(fā)生率為22.4%,95%CI(17.8%,27.0%),I2=0(3項(xiàng)研究);中國南方TMPRSS2::ERG融合基因發(fā)生率為25.5%,95%CI(18.4%,32.6%),I2=0(1項(xiàng)研究);中國東部TMPRSS2::ERG融合基因發(fā)生率為15.3%,95%CI(12.4%,18.2%),I2=47%(7項(xiàng) 研 究);中 國 西 部TMPRSS2::ERG融合基因發(fā)生率為15.2%,95%CI(12.0%,18.4%),I2=56%(5項(xiàng)研究)。
表6 TMPRSS2::ERG融合基因在中國前列腺癌患者中的發(fā)生率(地理環(huán)境)
2.3.6 發(fā)表偏倚使用Egger’s檢驗(yàn)(P=0.192,P=0.495),不存在發(fā)表偏倚(見圖3)。通過漏斗圖定性判斷,可能存在發(fā)表偏倚(見圖4)。
圖3 發(fā)表偏倚的Egger’s漏斗圖
圖4 發(fā)表偏倚檢測漏斗圖
自20世紀(jì)60年代Peter Nowell和David Hungerford在慢性粒細(xì)胞白血病(chronic myeloid leukemia,MCL)中報(bào)道了Bcr-Abl1融合基因以來,基因融合已經(jīng)被認(rèn)為是包括癌癥在內(nèi)的疾病的常見事件[25]。在2005年,Tomlins等[3]首次報(bào)道了前列腺癌中TMPRSS2基因和ERG、ETV1基因的融合。作為一種異質(zhì)性疾病,前列腺癌中TMPRSS2融合基因的發(fā)展使得對前列腺癌發(fā)病的分子生物學(xué)機(jī)制及疾病進(jìn)展的認(rèn)識有了跨越式進(jìn)步。研究發(fā)現(xiàn)歐洲超過一半的前列腺癌患者存在TMPRSS2::ERG基因融合[26],因此有研究者認(rèn)為TMPRSS2::ERG融合基因可作為前列腺癌的預(yù)測生物標(biāo)志物。但是更深入的研究發(fā)現(xiàn)TMPRSS2::ERG融合基因的發(fā)生率在不同種族和地理群體之間存在很大差異。即使在同一種族的研究中,TMPRSS2::ERG基因融合的頻率也各不相同,其原因可能是因?yàn)樗眉夹g(shù)
的敏感性、研究中所包括的樣本數(shù)量、用于確定陽性信號的標(biāo)準(zhǔn)、檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性、研究設(shè)計(jì)以及臨床終點(diǎn)不同。
本研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),作為TMPRSS2::ETS融合基因家族最常見的成員,TMPRSS2::ERG融合基因在中國前列腺癌患者中的發(fā)生率為16.7%,與日本和韓國患者一致,但低于西方國家和印度患者的發(fā)生率,與西非融合發(fā)生率接近(18%)[27]。本研究亞組分析結(jié)果顯示經(jīng)尿道電切術(shù)所獲得的標(biāo)本TMPRSS2::ERG檢出率最高(23.7%),穿刺活檢檢出率為17.9%,而接受根治切除術(shù)患者的標(biāo)本檢出率最低(12.4%)。日本前列腺癌患者根治標(biāo)本的發(fā)生率為16.3%~28%[28-29],韓國根治切除標(biāo)本的發(fā)生率為24.4%[30],西非活檢標(biāo)本發(fā)生率為18%[27],與我國大多報(bào)道結(jié)論一致。而在歐美穿刺標(biāo)本中發(fā)生率為44%[31],根治標(biāo)本發(fā)生率為59%[32],遠(yuǎn)高于我國大多數(shù)報(bào)道結(jié)果,這說明TMPRSS2::ERG融合基因具有種族差異性。根據(jù)檢測技術(shù)(FISH、IHC、RT-PCR/IHC、RNA-seq)將所納入研究分為4組進(jìn)行分析,結(jié)果提示使用FISH檢測TMPRSS2::ERG融合基因檢出率較高,但異質(zhì)性較高,考慮可能是因?yàn)闃颖玖俊㈥栃越Y(jié)果判斷標(biāo)準(zhǔn)不同、檢測標(biāo)本類型多樣的原因。根據(jù)地理方位(北方、南方、東部和西部)將所納入研究分為4組進(jìn)行分析。融合率最低的是中國西部地區(qū)的前列腺癌患者,其次是中國東部地區(qū),最高的是中國南方患者。有報(bào)道中國南方患者融合基因發(fā)生率超過70%[4,7],東部地區(qū)患者基因融合發(fā)生率超過50%[33],這與報(bào)道的亞洲前列腺癌患者的基因融合率低[5]不一致,其可能原因?yàn)檠芯筷?duì)列、臨床終點(diǎn)、檢測方法的多樣性及使用的樣本量較小,需要進(jìn)一步的研究予以證實(shí)。一般認(rèn)為,亞洲國家飲食西化可能與前列腺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)增高有關(guān),南方經(jīng)濟(jì)發(fā)達(dá),西化對飲食和生活方式有較大影響。中國各地區(qū)TMPRSS2::ERG基因融合頻率不同,考慮可能與地理、飲食習(xí)慣、環(huán)境污染有關(guān)。
本研究的不足是存在較明顯的異質(zhì)性(I2=58%)。使用逐一剔除研究法進(jìn)行敏感性分析,結(jié)果變化不明顯。當(dāng)基于標(biāo)本獲取方式開展亞組分析時(shí),各組異質(zhì)性均有一定程度降低,尿道電切組無異質(zhì)性,穿刺活檢組低異質(zhì)性,提示標(biāo)本獲取方式可能是引起異質(zhì)性的原因。此外,在本文中納入的研究類型包括橫斷面研究、病例對照研究和隨訪研究,提示可能存在方法學(xué)異質(zhì)性。因此在未來的研究中可能還有其他重要的變量需要考慮,擴(kuò)大研究樣本量,開展多中心的研究,使數(shù)據(jù)更加同質(zhì)化。
綜上所述,我們發(fā)現(xiàn)中國前列腺癌患者中,TMPRSS2::ETS融合基因家族的主要成員,TMPRSS2::ERG融合發(fā)生率較低,因此,不同于歐美國家,TMPRSS2::ERG融合基因不適合作為國內(nèi)前列腺癌患者的診斷標(biāo)志,而多個(gè)相關(guān)基因的聯(lián)合檢測可能更有助于前列腺癌的篩查和診斷。