鄭舒文,王柏森,李志明,王圣治
(遼寧中醫(yī)藥大學(xué) 1.研究生學(xué)院,沈陽(yáng) 110847;2.附屬醫(yī)院腎內(nèi)科,沈陽(yáng) 110032)
慢性腎小球腎炎(chronic glomerulonephritis,CGN)是我國(guó)最常見(jiàn)的慢性腎臟病之一,病程較長(zhǎng)者可致慢性腎衰竭,其病理機(jī)制尚未明確且無(wú)特效藥物[1-2]。抑郁癥主要表現(xiàn)為情緒低落,對(duì)周邊事物漠不關(guān)心,產(chǎn)生自責(zé)心理[3-4],嚴(yán)重影響患者的健康和生活質(zhì)量[5],其發(fā)病可能與多種因素有關(guān)[6-10]??挂钟羲幹委熢诙唐诰哂幸欢ㄗ饔茫洳涣挤磻?yīng)亦不容忽視[11-12]。CGN和抑郁癥目前均無(wú)明確病理機(jī)制及特效藥,而中醫(yī)在慢性疾病治療方面具有一定的優(yōu)勢(shì)。中醫(yī)異病同治是中醫(yī)基礎(chǔ)重要理論之一,不同疾病其病機(jī)相同即可用同一藥方治療。參苓白術(shù)散出自《太平惠民和劑局方》[13]。已有研究[14]表明,加味參苓白術(shù)散治療脾腎兩虛型CGN,療效確切,改善臨床癥狀效果顯著;也有研究[15]表明,以參苓白術(shù)散為底方,運(yùn)用健脾益氣法治療老年抑郁癥患者,總有效率91%。由于CGN和抑郁癥均有脾虛證,而參苓白術(shù)散有益氣補(bǔ)脾的作用,為異病同治提供了理論依據(jù)。
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)主要通過(guò)建立“成分-靶標(biāo)-通路-疾病”網(wǎng)絡(luò)的方法分析藥物的作用機(jī)制[16],由此可知一種靶點(diǎn)可調(diào)控多種疾病,這種調(diào)控過(guò)程和中醫(yī)的異病同治類(lèi)似。參苓白術(shù)散治療CGN和抑郁癥均效果良好,因此,本研究擬通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)及分子對(duì)接的方法分析其異病同治的作用機(jī)制,以證明中醫(yī)藥在2種疾病中的作用。
運(yùn)用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)數(shù)據(jù)庫(kù)和分析平臺(tái)(http://tcmspw.com/tcmsp.php),搜索參苓白術(shù)散方組成中10種中藥的活性成分,以口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%和類(lèi)藥性指數(shù)(drug like index,DL)≥0.18[17]為條件,對(duì)收集的信息進(jìn)行篩選。并利用 Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.uniprot.org)的注釋文件將藥物靶點(diǎn)基因規(guī)范化。
利用GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.genecards.org)和OMIM數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.omim.org),獲取CGN和抑郁癥的對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)。將該靶點(diǎn)及參苓白術(shù)散對(duì)應(yīng)的靶點(diǎn)導(dǎo)入在線(xiàn)軟件Venny 2.1.0(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/)取交集,并繪制韋恩圖。
用Cytoscape3.8.2軟件構(gòu)建參苓白術(shù)散治療CGN和抑郁癥的“中藥-活性成分-共同靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)。對(duì)上述網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行拓?fù)浞治觯渲?,度的?shù)值越大,該成分越有可能為參苓白術(shù)散治療的潛在活性成分。
在STRING數(shù)據(jù)庫(kù)(http://string-db.org)中上傳共有靶點(diǎn),并將物種設(shè)置成人類(lèi),取最高置信度,數(shù)值0.900,其余參數(shù)設(shè)置為默認(rèn),獲得蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(protein-protein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)。將結(jié)果導(dǎo)入Cytoscape軟件可視化,拓?fù)浞治龊筮x取度值較高的前10個(gè)靶點(diǎn),即參苓白術(shù)散異病同治的核心靶點(diǎn)。
將共同靶點(diǎn)導(dǎo)入DAVID 6.8數(shù)據(jù)庫(kù)(https://david.ncifcrf.gov/),限定物種為人類(lèi),對(duì)參苓白術(shù)散“異病同治”的作用靶點(diǎn)進(jìn)行富集分析,按P值從小到大排序,繪制排名前20的結(jié)果圖。
從TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)和RCSB蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.rcsb.org/)分別下載活性成分的分子結(jié)構(gòu),以及核心靶點(diǎn)對(duì)應(yīng)蛋白的晶體結(jié)構(gòu),并導(dǎo)入Sybyl-X2.1.1軟件進(jìn)行分子對(duì)接。若對(duì)接得分>4.25,表明分子與蛋白具有對(duì)接活性;若對(duì)接得分>5,表明具有較好的對(duì)接活性;若對(duì)接結(jié)果>7,則認(rèn)為具有高度的對(duì)接活性。
從TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得參苓白術(shù)散中10味中藥的活性成分,其中,人參22種、白術(shù)7種、茯苓15種、桔梗7種、白扁豆1種、甘草92種、蓮子心11種、薏苡仁9種、山藥16種、砂仁10種,將活性成分對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)刪除重復(fù)后獲得225個(gè)靶點(diǎn),將結(jié)果繪制“成分-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖(圖1)。
圖1 “成分-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖Fig.1 "Component-target" network diagram
在GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)和OMIM數(shù)據(jù)庫(kù)中,CGN對(duì)應(yīng)刪除重復(fù)后靶點(diǎn)1 806個(gè),抑郁癥對(duì)應(yīng)刪除重復(fù)后靶點(diǎn)12 997個(gè)。在Venny2.1.0中得到參苓白術(shù)散異病同治2種疾病潛在作用靶點(diǎn)共計(jì)103個(gè),并繪制韋恩圖(圖2)。
圖2 共有作用靶點(diǎn)韋恩圖Fig.2 Venn diagram of common action target
在參苓白術(shù)散異病同治2種疾病的“中藥-活性成分-共同靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖(圖3)中,活性成分槲皮素(MOL000098)、木犀草素(MOL000006)、山奈酚(MOL000422)為參苓白術(shù)散異病同治的關(guān)鍵活性成分,其中,槲皮素作用于75個(gè)靶點(diǎn),網(wǎng)絡(luò)度最好。
構(gòu)建的PPI網(wǎng)絡(luò)圖共有節(jié)點(diǎn)97個(gè),邊912個(gè)。其中,參苓白術(shù)散異病同治的核心靶點(diǎn)是STAT3、JUN、RELA、MAPK1、TP53、AKT1、HSP90AA1、MAPK14、IL6、ESR1。
共獲得參苓白術(shù)散與疾病共有靶點(diǎn)的基因本體論(gene ontology,GO)富集結(jié)果508條(P<0.05),共同靶點(diǎn)主要影響生物學(xué)結(jié)果(biological process,BP)383條,主要包括DNA模板轉(zhuǎn)錄的正調(diào)節(jié)、RNA聚合酶Ⅱ啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄的正調(diào)控、對(duì)藥物的反應(yīng);結(jié)果中,細(xì)胞的組成(cellular component,CC)43 條,主要包括胞外區(qū)、細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞外間隙;分子功能(molecular function,MF)的結(jié)果82條,主要包括蛋白質(zhì)結(jié)合、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合、酶結(jié)合等。
京都基因和基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析涉及信號(hào)通路109條(P<0.05),其中,腫瘤壞死因子(tumor necrosis factor,TNF)信號(hào)通路、Toll樣受體信號(hào)通路、缺氧誘導(dǎo)因子1(hypoxia-inducible factor-1,HIF-1)信號(hào)通路、以磷脂酰肌醇 3-激酶/蛋白激酶 B(phosphatidylinositol 3 kinase-protein kinase B,PI3K-Akt)信號(hào)、核苷酸結(jié)合寡聚化結(jié)構(gòu)域(nucleotide-binding oligomerization domain,NOD)樣受體信號(hào)通路為參苓白術(shù)散異病同治的主要的“明星通路”。
對(duì)接結(jié)果顯示,分子與晶體均具有結(jié)合活性。其中α-絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶(RAC-alpha serine/threonine-protein kinase,AKT)1與3種蛋白晶體均具有較好的對(duì)接活性,與槲皮素對(duì)接得分7.617,具有高度的對(duì)接活性。依據(jù)對(duì)接得分值繪制熱圖(圖4),同時(shí)繪制AKT1與3種活性成分對(duì)接構(gòu)象(圖5)。
圖4 對(duì)接得分值熱圖Fig.4 Docking scoring value heat map
圖5 AKT1與槲皮素、木犀草素、山奈酚對(duì)接構(gòu)象Fig.5 Docking conformation of AKT1 with quercetin,luteolin and kaempferol
中醫(yī)理論認(rèn)為,CGN與抑郁癥的共同發(fā)病機(jī)制在于脾失健運(yùn)。參苓白術(shù)散作為補(bǔ)益脾胃的經(jīng)典方劑,已被臨床廣泛應(yīng)用。異病同治是中醫(yī)辨證論治的基本特點(diǎn)之一,也是《黃帝內(nèi)經(jīng)》原文中“治病必求于本”的重要體現(xiàn)[18]。在古代醫(yī)書(shū)中雖未記載CGN病名,但根據(jù)其癥狀,可從醫(yī)家經(jīng)典中發(fā)現(xiàn)一些線(xiàn)索。如《黃帝內(nèi)經(jīng)》中有“慢腎風(fēng)”“風(fēng)水”“水脹”等病名;《金匱要略》中也提到十一類(lèi)水腫;這些疾病的臨床表現(xiàn)與CGN類(lèi)似[19-21]。脾虛是CGN的核心病機(jī),正所謂“四季脾旺不受邪”[22]。脾失固攝則精微物質(zhì)下泄,尿中出現(xiàn)蛋白等物質(zhì)[23],脾虛則土不制水故出現(xiàn)水腫。海派名醫(yī)童少伯從脾論治CGN,認(rèn)為CGN病本在脾,脾在中焦調(diào)控肺腎兩臟[24]?!饵S帝內(nèi)經(jīng)》有云“脾在志為思”“思傷脾”,憂(yōu)思過(guò)度則會(huì)傷及脾臟,脾的運(yùn)化功能與西醫(yī)消化系統(tǒng)相似,現(xiàn)代研究[25-26]表明腸道菌群可影響神經(jīng)遞質(zhì)、HPA軸等,從而導(dǎo)致抑郁癥。
槲皮素是參苓白術(shù)散中對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)最多的核心成分。已有研究[27-28]表明,槲皮素有抗炎、抗氧化、預(yù)防神經(jīng)凋亡等作用,戴恩來(lái)等[29]研究表明槲皮素干預(yù)可修復(fù)足細(xì)胞損傷,進(jìn)而保護(hù)腎小球?yàn)V過(guò)膜。華深等[30]通過(guò)對(duì)小鼠進(jìn)行應(yīng)激刺激并用槲皮素進(jìn)行干預(yù),闡明了槲皮素對(duì)抑郁癥的治療效果及機(jī)制。
本研究中,KEGG分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),參苓白術(shù)散作用于109個(gè)信號(hào)通路,其中TNF信號(hào)通路等5種信號(hào)通路相關(guān)性較高。TNF信號(hào)通路作為一種炎癥信號(hào)通路,介導(dǎo)多種炎癥反應(yīng),調(diào)控多種炎性細(xì)胞因子的表達(dá),TNF信號(hào)通路及其下游白細(xì)胞介素-6等炎性細(xì)胞因子在抑郁癥患者外周血中濃度增加[31],在腎組織中TNF信號(hào)通路及下游表達(dá)升高則會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞因子失衡,進(jìn)而增加CGN的疾病進(jìn)展的風(fēng)險(xiǎn)[32]。Toll樣受體可觸發(fā)產(chǎn)生免疫復(fù)合物,與腎臟損傷有一定的聯(lián)系[33]。研究[34]發(fā)現(xiàn),慢性腎炎患者外周血淋巴細(xì)胞中,Toll樣受體表達(dá)顯著上調(diào),引起炎癥損傷。通過(guò)調(diào)控Toll樣受體信號(hào)通路可修復(fù)神經(jīng)損傷,達(dá)到抗抑郁的效果[35]。HIF-1和NOD樣受體信號(hào)通路參與多種炎癥反應(yīng),NOD樣受體信號(hào)通路可以激活下游核因子κB信號(hào)通路[36],這些炎癥反應(yīng)均參與CGN和抑郁癥發(fā)生和發(fā)展,調(diào)控上述2種信號(hào)通路在疾病抗炎治療中起重要的作用。PI3K-AKT信號(hào)通路參與多種自身免疫性疾病,在多種慢性腎臟病中顯著上調(diào)并參與炎癥和增殖,且該通路與抑郁癥的關(guān)系明確,多種抗抑郁藥物通過(guò)該通路發(fā)揮作用,如文拉法辛可通過(guò)該通路抑制神經(jīng)元凋亡[37],從而發(fā)揮抗抑郁的作用。
本研究通過(guò)2種技術(shù)對(duì)參苓白術(shù)散治療CGN及抑郁癥的作用機(jī)制進(jìn)行了分析,與異病同治理論相對(duì)應(yīng)。將參苓白術(shù)散治療2種疾病的共同靶點(diǎn)構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò),發(fā)現(xiàn)10個(gè)核心靶點(diǎn)作用于RNA聚合酶Ⅱ啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄的正調(diào)控、DNA模板轉(zhuǎn)錄的正調(diào)節(jié)、對(duì)藥物的反應(yīng)等生物學(xué)過(guò)程,調(diào)節(jié)多種信號(hào)通路,繼而調(diào)控CGN與抑郁癥。分子對(duì)接結(jié)果顯示,上述10個(gè)核心靶點(diǎn)與參苓白術(shù)散的主要活性成分都具有對(duì)接活性,也從側(cè)面證明了參苓白術(shù)散主要是通過(guò)這些核心靶點(diǎn)對(duì)CGN及抑郁癥發(fā)揮異病同治的作用。值得注意的是,AKT1與這3種活性成分都具有最高的對(duì)接得分。AKT1也是PI3K-AKT信號(hào)通路的重要組成部分,該通路也是參苓白術(shù)散異病同治過(guò)程中的“明星通路”,也從一定程度上反映了參苓白術(shù)散可以通過(guò)這些核心靶點(diǎn)發(fā)揮異病同治的作用。
綜上所述,本研究在微觀上證明了異病同治理論的可行性,豐富了其內(nèi)涵。雖然應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接的方法可以探究中藥在CGN與抑郁癥的作用機(jī)制,但其本身具有一定的局限性,因此,仍然需要進(jìn)一步研究驗(yàn)證。