王藝,馬可妮,劉靈,裴瑞景,王睿,馬萍,,姜飛,李洪春,(.徐州醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)技術(shù)學(xué)院,江蘇徐州 004;.徐州醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科,江蘇徐州 00)
自2009年首次發(fā)現(xiàn)產(chǎn)新德里金屬β-內(nèi)酰胺酶(New Delhi metallo-β-lactamase, NDM)的耐碳青霉烯類腸桿菌目細(xì)菌(carbapenem-resistant Enterobacterales,CRE)以來,該類細(xì)菌引起的感染及全球播散已經(jīng)成為一個(gè)重大的公共衛(wèi)生問題。我國已有多個(gè)城市和地區(qū)報(bào)道CRE克隆流行[1-3],一項(xiàng)縱向大規(guī)模CRE研究的數(shù)據(jù)顯示,NDM金屬酶主要存在于大腸埃希菌中[4],據(jù)CHINET數(shù)據(jù)監(jiān)測(cè)網(wǎng)顯示大腸埃希菌是引起血流感染和尿路感染最主要的病原菌,產(chǎn)NDM大腸埃希菌通常同時(shí)攜帶多種超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(extended-spectrum β-lactamase,ESBLs),導(dǎo)致多重耐藥而僅對(duì)替加環(huán)素和黏菌素等極少數(shù)抗菌藥物敏感,給臨床治療該類細(xì)菌引起的感染帶來極大困難。
阿維巴坦是一種新型β-內(nèi)酰胺酶抑制劑,體外對(duì)腸桿菌科細(xì)菌產(chǎn)生的ESBLs、KPC 酶和OXA-48酶有活性,但對(duì)以NDM為代表的金屬β-內(nèi)酰胺酶(metallo-β-lactamases, MBLs)無抑制作用[5]。而氨曲南對(duì)MBLs保持穩(wěn)定,但被大多數(shù)ESBLs水解,兩種藥物聯(lián)合使用時(shí),阿維巴坦能保護(hù)氨曲南免受ESBLs水解,使氨曲南維持抗菌活性[6],但該組合在國內(nèi)的臨床病例應(yīng)用報(bào)道較少。本研究旨在評(píng)估氨曲南聯(lián)合頭孢他啶/阿維巴坦對(duì)產(chǎn)NDM金屬酶的大腸埃希菌的體外抗菌活性,為該組合治療產(chǎn)金屬酶的碳青霉烯耐藥大腸埃希菌引起的感染提供數(shù)據(jù)支持。
1.1菌株來源及鑒定 收集徐州醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院2018—2020年臨床分離的碳青霉烯耐藥[亞胺培南(IPM)最低抑菌濃度(minimum inhibitory concentration, MIC)≥4 μg/mL]大腸埃希菌30株,分離自血液、尿液樣本各15株。所有菌株經(jīng)Vitek 2 Compact GN鑒定卡和質(zhì)譜確認(rèn)。
1.2主要儀器與試劑 Vitek 2 Compact全自動(dòng)細(xì)菌分析儀(法國生物梅里埃公司),MALDI-TOF MS儀(德國布魯克公司),哥倫比亞血瓊脂平板、M-H平板(上??片敿喂?,頭孢他啶/阿維巴坦、氨曲南E-test紙條(溫州康泰公司),碳青霉烯酶檢測(cè)緩沖液(珠海迪爾公司)、PCR擴(kuò)增儀、GelX1850凝膠成像儀(美國Bio-Rad公司),DYY-8C電泳儀(北京六一儀器廠),1 000 bp DNA marker、PCR mix(日本TaKaRa公司),引物合成(上海生工生物公司),3730XL測(cè)序分析儀(美國 ABI 公司)。
1.3藥敏試驗(yàn) 用Vitek 2 Compact及配套N335和XN04藥敏卡對(duì)菌株進(jìn)行藥物敏感性測(cè)定,并采用E-test紙條法測(cè)定菌株對(duì)氨曲南和頭孢他啶/阿維巴坦的MIC,結(jié)果判讀基于美國臨床和實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)協(xié)會(huì)(Clinical and Laboratory Standards Institute,CLSI)2021年判定標(biāo)準(zhǔn)[7]。
1.4聯(lián)合藥敏試驗(yàn) 采用氨曲南和頭孢他啶/阿維巴坦雙E-test紙條檢測(cè)二者的體外協(xié)同作用[8]。改進(jìn)方法為:取0.5麥?zhǔn)蠞岫葐挝粷舛鹊拇竽c埃希菌菌懸液涂布M-H平板,然后將氨曲南和頭孢他啶/阿維巴坦E-test紙條完全重合后垂直插入平板中,37 ℃反應(yīng)18~24 h后,在頭孢他啶/阿維巴坦存在條件下讀取氨曲南的MIC值[8]。大腸埃希菌ATCC 25922為對(duì)照菌株。
1.5碳青霉烯酶表型檢測(cè) 參照碳青霉烯酶檢測(cè)緩沖液試劑說明書進(jìn)行操作。用無菌接種環(huán)刮取血平板上過夜培養(yǎng)的至少3個(gè)純菌落配制0.5麥?zhǔn)蠞岫葐挝粷舛鹊木鷳乙海坎糓-H平板,干燥3~5 min;貼4張IPM紙片并在其中3張紙片分別滴加10 μL乙二胺四乙酸(EDTA)、10 μL 3′-氨基苯硼酸(3-aminobenzeneboronic acid,APB)以及10 μL EDTA+10 μL APB,各紙片中心距離≥25 mm。35 ℃培養(yǎng)18~24 h后,測(cè)量抑菌圈直徑大小。結(jié)果判讀:與單獨(dú)IPM紙片相比,IPM+APB抑菌圈直徑≥5 mm,提示產(chǎn)絲氨酸酶;IPM+EDTA抑菌圈直徑≥5 mm,提示產(chǎn)金屬酶;IPM+APB和IPM+EDTA抑菌圈無明顯擴(kuò)大,但I(xiàn)PM+APB+EDTA抑菌圈直徑≥5 mm,提示同時(shí)產(chǎn)絲氨酸酶+金屬酶。
1.6細(xì)菌DNA提取及耐藥基因檢測(cè) 用煮沸法提取細(xì)菌DNA。PCR方法擴(kuò)增4種碳青霉烯酶基因(NDM、KPC、IMP、VIM)、5種ESBL基因(CTX-M-1group、CTX-M-9group、SHV、TEM、CMY),靶基因引物序列參照文獻(xiàn)[9],引物由上海生工生物公司合成。反應(yīng)體系共50 μL,包括2×PCR Master Mix 25 μL,10 μmol/L上、下游引物各3 μL,DNA模板3 μL,滅菌ddH2O 16 μL。反應(yīng)參數(shù):94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃ 45 s,54 ℃(NDM、KPC、IMP、VIM、SHV、TEM、CMY)/52 ℃(CTX-M-1group、CTX-M-9group)45 s,72 ℃ 60 s,30個(gè)循環(huán);72 ℃ 10 min。產(chǎn)物經(jīng)12 g/L瓊脂糖凝膠電泳后,用凝膠成像分析系統(tǒng)分析,陽性條帶送上海生工生物公司在3730XL測(cè)序分析儀上進(jìn)行Sanger測(cè)序。
1.7多位點(diǎn)序列分型(multi-locus sequence typing, MLST) 采用PCR方法對(duì)大腸埃希菌進(jìn)行MLST。對(duì)7個(gè)管家基因(adk、fumC、gyrB、icd、mdh、purA、recA)進(jìn)行擴(kuò)增,反應(yīng)體系同1.6,引物序列及退火溫度見表1。PCR 產(chǎn)物純化后送上海生工生物公司在3730XL測(cè)序分析儀上進(jìn)行Sanger雙向測(cè)序后拼接,將測(cè)序數(shù)據(jù)提交至MLST網(wǎng)站(https://pubmlst.org/bigsdb?db=pubmlst_escherichia_seqdef),確定菌株ST型。
表1 管家基因擴(kuò)增引物序列
2.1藥敏結(jié)果及氨曲南與頭孢他啶/阿維巴坦體外協(xié)同作用 30株大腸埃希菌對(duì)替加環(huán)素和多黏菌素耐藥率為0,對(duì)阿米卡星耐藥率為46.7%(14/30),對(duì)氨曲南耐藥率為90%(27/30,MIC范圍:8~≥256 μg/mL,MIC50≥256 μg/mL,MIC90≥256 μg/mL),對(duì)頭孢他啶/阿維巴坦的耐藥率為100%(MIC范圍:128~≥256 μg/mL,MIC50≥256 μg/mL,MIC90≥256 μg/mL)。30株大腸埃希菌均顯示出氨曲南與頭孢他啶/阿維巴坦之間協(xié)同作用,氨曲南MIC50和MIC90分別下降至2 μg/mL和4 μg/mL,其中,27株對(duì)氨曲南耐藥的大腸埃希菌在頭孢他啶/阿維巴坦存在情況下25株對(duì)氨曲南敏感(MIC范圍<0.064~4 μg/mL),1株對(duì)氨曲南中介(MIC=8 μg/mL),1株仍對(duì)氨曲南耐藥(16 μg/mL)。見表2、圖1。
表2 30株大腸埃希菌對(duì)氨曲南、頭孢他啶/阿維巴坦及氨曲南聯(lián)合頭孢他啶/阿維巴坦的藥敏結(jié)果(μg/mL)
注:左,氨曲南MIC≥256 μg/mL;中,氨曲南聯(lián)合頭孢他啶/阿維巴坦MIC=1 μg/mL;右,頭孢他啶/阿維巴坦MIC≥256 μg/mL。
2.2碳青霉烯酶表型檢測(cè)結(jié)果 與單獨(dú)IPM紙片相比,30株大腸埃希菌IPM+APB抑菌圈直徑無明顯變化,IPM+EDTA以及IPM+EDTA+APB抑菌圈直徑≥5 mm,提示細(xì)菌產(chǎn)金屬酶。見圖2。
注:A,IPM;B,IPM+EDTA;C,IPM+APB;D,IPM+EDTA+APB。
2.3耐藥基因檢測(cè)結(jié)果 30株大腸埃希菌中攜帶NDM-5基因26株,攜帶NDM-7基因2株,攜帶NDM-1和NDM-9基因各1株;15株攜帶TEM-1基因,22株攜帶CTX-M-1組基因(10株攜帶CTX-M-15,12株攜帶CTX-M-55),9株攜帶CTX-M-9組基因(均為CTX-M-27)。未檢出KPC、IMP、VIM、SHV基因。
2.4MLST分型結(jié)果 30株大腸埃希菌共檢出8種ST型,其中以ST167為主(n=12,40%),其次為ST405和ST410均6株,ST448 2株,ST744、ST746、ST361、ST2705各1株。見圖3。
注:不同顏色點(diǎn)代表不同ST型,點(diǎn)的大小代表菌株數(shù)量,線上數(shù)字代表不同ST型間管家基因差異數(shù)。
頭孢他啶/阿維巴坦已被廣泛用于治療以產(chǎn)KPC為代表的絲氨酸酶的革蘭陰性桿菌引起的感染[10]。而對(duì)于產(chǎn)金屬酶的多重耐藥革蘭陰性桿菌,國外已有多項(xiàng)病例研究表明,氨曲南聯(lián)合頭孢他啶/阿維巴坦的組合能夠治療產(chǎn)NDM-1和OXA-48的肺炎克雷伯菌、產(chǎn)NDM-1和AmpC的銅綠假單胞菌以及產(chǎn)NDM-1和KPC-4的陰溝腸桿菌引起的感染并取得良好療效[8,11-13],主要是利用阿維巴坦來保護(hù)氨曲南免受ESBLs水解,使氨曲南維持抗菌活性。國內(nèi)一項(xiàng)多中心體外研究顯示,94.7%的CRE因攜帶一種或多種ESBLs對(duì)氨曲南耐藥,但在聯(lián)合阿維巴坦之后,氨曲南耐藥菌株中96.9%的CRE菌株氨曲南/阿維巴坦的MIC≤1 μg/mL[14]。
本研究對(duì)30株CRE進(jìn)行碳青霉烯酶基因和ESBLs基因檢測(cè),結(jié)果發(fā)現(xiàn)所有大腸埃希菌均產(chǎn)NDM基因,86.7%的菌株(26/30)同時(shí)攜帶NDM基因和1種或1種以上ESBLs基因,其中88.5%的菌株(23/26)對(duì)氨曲南耐藥,所有菌株對(duì)頭孢他啶/阿維巴坦耐藥。氨曲南聯(lián)合頭孢他啶/阿維巴坦之后,對(duì)聯(lián)產(chǎn)NDM金屬酶和ESBLs的大腸埃希菌具有顯著的協(xié)同作用,氨曲南耐藥菌株中91.3%(21/23)的菌株藥敏結(jié)果由耐藥變?yōu)槊舾?,另?株細(xì)菌氨曲南MIC分別下降至8 μg/mL(中介)和16 μg/mL(耐藥)。13.3%的菌株(4/30)只攜帶NDM基因,但仍對(duì)氨曲南耐藥(MIC≥8 μg/mL),原因可能是攜帶本研究檢測(cè)之外的其他類型的ESBLs。在聯(lián)合頭孢他啶/阿維巴坦后,4株細(xì)菌氨曲南的MIC由8 μg/mL(耐藥)下降至2 μg/mL(敏感)。研究報(bào)道,通過體外篩選的對(duì)氨曲南聯(lián)合頭孢他啶/阿維巴坦耐藥的細(xì)菌,其耐藥機(jī)制與CMY基因突變有關(guān)(Tyr150Ser 或Asn346His)[15]。在用微量肉湯稀釋法確認(rèn)E.coli13耐藥菌株對(duì)氨曲南聯(lián)合頭孢他啶/阿維巴坦MIC為16 μg/mL后進(jìn)行CMY基因檢測(cè),但未檢測(cè)到該基因,說明氨曲南聯(lián)合頭孢他啶/阿維巴坦耐藥還存在其他未知的機(jī)制,有待進(jìn)一步研究。另外,相對(duì)于傳統(tǒng)的微量肉湯稀釋法,本研究采用氨曲南和頭孢他啶/阿維巴坦雙E-test紙條法檢測(cè)二者的體外協(xié)同作用,為實(shí)驗(yàn)室提供了一種簡(jiǎn)便、快速的檢測(cè)手段。
30株大腸埃希菌檢測(cè)出8種ST型,包括國內(nèi)較為常見的ST167、ST405和ST410及其他少見ST型,氨曲南聯(lián)合頭孢他啶/阿維巴坦均對(duì)其表現(xiàn)出協(xié)同作用,說明這種藥物組合可以廣泛應(yīng)用于治療不同ST型產(chǎn)NDM金屬酶的大腸埃希菌感染。
文獻(xiàn)報(bào)道,在用頭孢他啶/阿維巴坦和氨曲南治療產(chǎn)金屬酶腸桿菌科細(xì)菌感染時(shí),需要監(jiān)測(cè)二者的血藥濃度,保證給藥間隔期間在頭孢他啶/阿維巴坦存在的情況下,氨曲南的藥物濃度大于MIC,以確保治療效果[13]。同時(shí),Ⅱ期臨床試驗(yàn)也證明在臨床許可濃度下,氨曲南聯(lián)合頭孢他啶/阿維巴坦在治療產(chǎn)金屬酶腸桿菌科細(xì)菌引起的復(fù)雜性腹腔感染方面表現(xiàn)出的良好的安全性和有效性[16]。綜上所述,氨曲南聯(lián)合頭孢他啶/阿維巴坦對(duì)產(chǎn)NDM金屬酶大腸埃希菌表現(xiàn)出較強(qiáng)的體外抗菌活性,可以作為該類耐藥菌感染的一種治療選擇。