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LncRNA MIR4697HG通過靶向miR-193a-3p調(diào)控HMGA2表達(dá)促進(jìn)膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展

2022-05-26 08:12丁錦榮劉小江李軍管義祥南通大學(xué)附屬海安醫(yī)院神經(jīng)外科江蘇南通226600
中國老年學(xué)雜志 2022年10期
關(guān)鍵詞:印跡熒光素酶膠質(zhì)瘤

丁錦榮 劉小江 李軍 管義祥 (南通大學(xué)附屬海安醫(yī)院神經(jīng)外科,江蘇 南通 226600)

膠質(zhì)瘤是最常見的顱內(nèi)惡性腫瘤,它起源于膠質(zhì)細(xì)胞,是人類腫瘤死亡的主要原因之一〔1,2〕。根據(jù)報道,腦腫瘤的發(fā)病率為21/100 000,約占人類所有癌癥的2%,其中,膠質(zhì)瘤的發(fā)病率約占腦腫瘤的60%〔3〕。盡管膠質(zhì)瘤的治療發(fā)展迅速,其預(yù)后和生存率仍面臨著挑戰(zhàn)。因此,迫切需要探索膠質(zhì)瘤進(jìn)展的確切分子機制,開發(fā)新的有效治療策略,以改善患者預(yù)后。長鏈非編碼RNA(LncRNA)是一類長度超過200核苷酸的非編碼RNA,最初被認(rèn)為是基因組轉(zhuǎn)錄的“噪音”,是RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄的副產(chǎn)品,沒有生物學(xué)功能〔4,5〕。研究表明,LncRNA廣泛參與許多重要的調(diào)控過程,可能可以作為膠質(zhì)瘤等多種人類癌癥的治療靶點〔6〕。LncRNA MIR4697 host gene(MIR4697HG)與肺腺癌臨床特征相關(guān)〔7〕,MIR4697HG在卵巢癌中高表達(dá),促進(jìn)卵巢癌細(xì)胞的生長和轉(zhuǎn)移〔8〕。而尚未對膠質(zhì)瘤中的MIR4697HG進(jìn)行研究。微小RNA(miRNA/miR)是一類小的非編碼RNA,其異常表達(dá)對于各種癌癥的發(fā)生發(fā)展有重要意義〔9〕。結(jié)直腸癌中miR-193a-3p下調(diào)表達(dá),上調(diào)其表達(dá)抑制結(jié)直腸癌細(xì)胞增殖和發(fā)展〔10〕。但目前miR-193a-3p在膠質(zhì)瘤中的生物學(xué)功能尚未明確。高遷移率族蛋白(HMG)A2被發(fā)現(xiàn)在膠質(zhì)瘤中過表達(dá),促膠質(zhì)瘤的侵襲和不良預(yù)后〔11〕,F(xiàn)oxD2-AS1通過miR-185-5P靶向調(diào)控HMGA2表達(dá),促進(jìn)膠質(zhì)瘤的發(fā)生與發(fā)展〔12〕?;诖?,本研究對LncRNA MIR4697HG影響膠質(zhì)瘤細(xì)胞增殖、遷移和侵襲能力進(jìn)行評價,并結(jié)合miR-193a-3p和HMGA2初步探討其潛在的作用機制。

1 材料與方法

1.1主要試劑 正常星形膠質(zhì)細(xì)胞HA、膠質(zhì)瘤細(xì)胞U-251MG購自美國典型培養(yǎng)物保藏中心(ATCC);DMEM培養(yǎng)基、胎牛血清購自Gibco公司;逆轉(zhuǎn)錄試劑盒、實時熒光定量-聚合酶鏈反應(yīng)(qPCR)試劑盒購自日本TaKaRa公司;β-肌動蛋白(β-actin)、HMGA2、細(xì)胞周期蛋白(Cyclin)D1、基質(zhì)金屬蛋白酶(MMP)-2、MMP-9蛋白抗體購自美國Cellular Signaling Technology公司;辣根過氧化物酶標(biāo)記二抗購自北京博奧森生物技術(shù)有限公司;Lipofectamine 2000購自美國Invitrogen公司;miR-con、miR-193a-3p、si-con、si-MIR4697HG、anti-miR-con、anti-miR-193a-3p、熒光素酶報告載體購自上海Gene Pharma公司;噻唑藍(lán)(MTT)購自Sigma-Aldrich公司。

1.2細(xì)胞培養(yǎng) HA、U-251MG細(xì)胞中加入含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基,置于37℃、5%CO2、飽和濕潤的培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。待細(xì)胞密度達(dá)約70%,使用胰酶消化、傳代。

1.3qPCR檢測LncRNA MIR4697HG、miR-193a-3p、HMGA2 mRNA表達(dá) 選取生長狀態(tài)良好的HA、U-251MG細(xì)胞,接入TRIzol試劑提取總RNA,并逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,以合成的cDNA為模板,按照qPCR試劑盒的說明進(jìn)行反應(yīng)。LncRNA MIR4697HG正向引物序列為5′- TTCCCCAGGAGGGACTTTGA-3′,反向引物序列為5′-GTGTGTCCTCAGACCACCAG-3′。miR-193a-3p引物序列參照王培蓓等〔13〕的報道,HMGA2正向引物序列為5′-AAAGCAGCTCAAAAGAAAGCA-3′,反向引物序列為5′-TGTTGTGGCCATTTCCTAGGT-3′。LncRNA MIR4-697HG、miR-193a-3p、HMGA2 mRNA表達(dá)量依照2-ΔΔCt法計算。

1.4Western印跡檢測HMGA2蛋白表達(dá) 使用放射免疫沉淀試驗(RIPA)裂解液提取HA、U-251MG細(xì)胞蛋白,吸取適量蛋白進(jìn)行10%十二烷基硫酸鈉(SDS)-聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE),分離蛋白樣品,并轉(zhuǎn)至聚偏氟乙烯膜(PVDF),之后用5%脫脂奶粉封閉1 h,加入HMGA2一抗4℃孵育過夜,同時以β-actin作為對照,經(jīng)Tris-HCl-Tween緩沖鹽溶液(TBST)漂洗10 min,重復(fù)3次后,加入二抗孵育2 h,TBST漂洗,曝光顯影,分析HMGA2蛋白條帶灰度值。

1.5細(xì)胞轉(zhuǎn)染 轉(zhuǎn)染前24 h,在6孔板中接種U-251MG細(xì)胞,當(dāng)細(xì)胞達(dá)約70%密度時,按照Lipofectamine 2000試劑說明書指示,將miR-193a-3p、si-MIR4697HG、anti-miR-193a-3p及其陰性對照轉(zhuǎn)染入U-251MG細(xì)胞。轉(zhuǎn)染48 h后,收集U-251MG細(xì)胞,參照1.3、1.4所述方法檢測LncRNA MIR4697HG、miR-193a-3p、HMGA2 mRNA和HMGA2蛋白、CyclinD1、MMP-2、MMP-9表達(dá),并進(jìn)行其他指標(biāo)檢測。

1.6生物信息學(xué)預(yù)測和雙熒光素酶活性檢測 StarBase網(wǎng)站(http://starbase.sysu.edu.cn/)對MIR4697HG與miR-193a-3p、miR-193a-3p與HMGA2的靶向結(jié)合進(jìn)行預(yù)測,發(fā)現(xiàn)MIR4697HG與miR-193a-3p、miR-193a-3p與HMGA2有部分核苷酸序列可分別形成互補配對。構(gòu)建含有miR-193a-3p結(jié)合位點的LncRNA MIR4697HG-3′野生型(MIR4697HG-3′WT)及突變型(MIR4697HG-3′MUT)報告基因載體,在U-251MG細(xì)胞中轉(zhuǎn)染miR-193a-3p和LncRNA MIR4697HG WT及MUT報告基因載體。構(gòu)建含有miR-193a-3p結(jié)合位點的HMGA2-3′非編碼區(qū)(3′UTR)HMGA2-3′UTR-WT及HMGA2-3′UTR-MUT報告基因載體,在U-251MG細(xì)胞中轉(zhuǎn)染miR-193a-3p mimics和HMGA2-3′UTR WT及MUT報告基因載體。之后,進(jìn)行雙熒光素酶活性檢測。

1.7MTT檢測細(xì)胞增殖 收集U-251MG細(xì)胞,在96孔板中接種1×104個/ml,培養(yǎng)48 h,添加100 μl MTT溶液,37℃孵育4 h,加入200 μl二甲基亞砜,37℃振蕩培養(yǎng)10 min,反應(yīng)結(jié)束后置酶標(biāo)儀檢測U-251MG細(xì)胞的吸光(OD)值,檢測波長設(shè)為490 nm。細(xì)胞存活率(%)=實驗組OD值/對照組OD值×100%

1.8Transwell檢測細(xì)胞遷移和侵襲 檢測U-251MG細(xì)胞遷移和侵襲時,用無血清培養(yǎng)基稀釋細(xì)胞密度為1×105個/ml,加入Transwell上室(檢測細(xì)胞遷移不加基質(zhì)膠。檢測細(xì)胞侵襲時,事先在Transwell上室涂布與無血清培養(yǎng)基充分混合的基質(zhì)膠,靜置3~4 h),并在下室加入500 μl包含10%胎牛血清的培養(yǎng)基。孵育24 h后,無菌棉簽擦除多余細(xì)胞,甲醛和結(jié)晶紫分別進(jìn)行固定與染色,顯微鏡下觀察、統(tǒng)計。

1.9統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS22.0軟件進(jìn)行t檢驗、單因素方差分析、SNK-q檢驗。

2 結(jié) 果

2.1膠質(zhì)瘤細(xì)胞中LncRNA MIR4697HG、miR-193a-3p和HMGA2表達(dá) 與正常星形膠質(zhì)細(xì)胞HA比較,膠質(zhì)瘤細(xì)胞U-251MG中LncRNA MIR4697-HG、HMGA2 mRNA和HMGA2蛋白表達(dá)量明顯升高,而miR-193a-3p表達(dá)量顯著降低(P<0.05)。見圖1,表1。

圖1 Western印跡檢測HMGA2蛋白的表達(dá)

表1 膠質(zhì)瘤細(xì)胞中LncRNA MIR4697HG、HMGA2和 miR-193a-3p表達(dá)量

2.2LncRNA MIR4697HG靶向miR-193a-3p,miR-193a-3p靶向HMGA2 StarBase在線預(yù)測軟件顯示,miR4697HG與miR-193a-3p、miR-193a-3p與HMGA2具有靶向結(jié)合位點(圖2)。雙熒光素酶活性檢測結(jié)果顯示,相比于miR-con與MIR4697HG-3′WT報告質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染,miR-193a-3p與MIR4697HG-3′WT共轉(zhuǎn)染顯著抑制熒光素酶相對活性(P<0.05),而miR-con或miR-193a-3p與MIR4697HG-3′MUT共轉(zhuǎn)染對熒光素酶相對活性無明顯影響(P>0.05),見表2。同時,相較于miR-con與HMGA2-3′UTR-WT共轉(zhuǎn)染,miR-193a-3p與HMGA2-3′UTR-WT共轉(zhuǎn)染明顯降低熒光素酶相對活性(P<0.05),miR-con或miR-193a-3p與HMGA2-3′UTR-MUT共轉(zhuǎn)染對熒光素酶相對活性無明顯影響(P>0.05),見表3。

2.3低表達(dá)LncRNA MIR4697HG抑制膠質(zhì)瘤U-251MG細(xì)胞增殖、遷移和侵襲,影響miR-193a-3p和HMGA2的表達(dá) 在U-251MG細(xì)胞中轉(zhuǎn)染si-MIR4697HG,發(fā)現(xiàn)MIR4697HG mRNA表達(dá)量明顯低于si-con組,說明轉(zhuǎn)染有效。與si-con組比較,低表達(dá)LncRNA MIR4697HG miR-193a-3p表達(dá)量明顯增加(P<0.05)。而HMGA2、CyclinD1、MMP-2和MMP-9蛋白表達(dá)量明顯減少(P<0.05)。低表達(dá)LncRNA MIR4697HG的U-251MG細(xì)胞存活率明顯低于si-con組(P<0.05)。相較于si-con組,低表達(dá)LncRNA MIR4697HG細(xì)胞遷移數(shù)量和細(xì)胞侵襲數(shù)量明顯減少(P<0.05),見圖3,表4。

A StarBase對miR-193a-3p和LncRNA MIR4697HG結(jié)合進(jìn)行預(yù)測示意;B StarBase對HMGA2和miR-193a-3p結(jié)合進(jìn)行預(yù)測示意圖2 miR-193a-3p靶向LncRNA MIR4697HG, HMGA2靶向miR-193a-3p

表2 雙熒光素酶活性實驗

表3 miR-con或miR-193a-3p與HMGA2-3′UTR WT及MUT報告質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染U-251MG細(xì)胞后 雙熒光素酶活性檢測

A:Transwell檢測膠質(zhì)瘤的遷移和侵襲(結(jié)晶紫染色,×10);B:Western印跡檢測HMGA2、CyclinD1、MMP-2和MMP-9蛋白表達(dá) 1~3:NC組,si-con組,si-MIR4697HG組

表4 低表達(dá)LncRNA MIR4697HG抑制膠質(zhì)瘤U-251MG細(xì)胞增殖、遷移和侵襲, 影響miR-193a-3p和HMGA2的表達(dá)

2.4高表達(dá)miR-193a-3p抑制膠質(zhì)瘤細(xì)胞U-251MG增殖、遷移和侵襲,影響HMGA2的表達(dá) 在U-251MG細(xì)胞中轉(zhuǎn)染miR-193a-3p后miR-193a-3p表達(dá)量明顯高于miR-con組(P<0.05),表明轉(zhuǎn)染成功。與miR-con組比較,高表達(dá)miR-193a-3p HMGA2、CyclinD1、MMP-2和MMP-9、細(xì)胞存活率、細(xì)胞遷移數(shù)量和細(xì)胞侵襲數(shù)量明顯減少(P<0.05),見圖4、表5。

A:Transwell檢測膠質(zhì)瘤的遷移和侵襲(結(jié)晶紫染色,×10);B:Western印跡檢測HMGA2、CyclinD1、MMP-2和MMP-9蛋白表達(dá) 1~3:NC組,miR-con組,miR-193a-3p組

表5 高表達(dá)miR-193a-3p抑制膠質(zhì)瘤細(xì)胞U-251MG增殖、遷移和侵襲,影響HMGA2的表達(dá)

2.5敲減miR-193a-3p可部分逆轉(zhuǎn)MIR4697HG低表達(dá)對U-251MG細(xì)胞增殖、遷移和侵襲的影響 與si-MIR4697HG+anti-miR-con組比較,si-MIR4697HG與anti-miR-193a-3p共轉(zhuǎn)染顯著提高CyclinD1、MMP-2、MMP-9蛋白表達(dá)量、細(xì)胞存活率、細(xì)胞遷移數(shù)量和細(xì)胞侵襲數(shù)量(P<0.05),見表6、圖5。

2.6高表達(dá)HMGA2可部分逆轉(zhuǎn)MIR4697HG低表達(dá)對U-251MG細(xì)胞增殖、遷移和侵襲的影響 與si-MIR4697HG+pcDNA-con組比較,si-MIR4697HG與pcDNA-HMGA2共轉(zhuǎn)染顯著提高HMGA2、CyclinD1、MMP-2、MMP-9蛋白表達(dá)量、細(xì)胞存活率、細(xì)胞遷移數(shù)量和細(xì)胞侵襲數(shù)量(P<0.05),見圖6、表7。

表6 敲減miR-193a-3p可部分逆轉(zhuǎn)MIR4697HG低表達(dá)對U-251MG細(xì)胞增殖、遷移和侵襲的影響

A:Transwell檢測膠質(zhì)瘤的遷移和侵襲(結(jié)晶紫染色,×10);B:Western印跡檢測CyclinD1、MMP2和MMP9蛋白表達(dá); 1~2:si-MIR 4697HG+pcDNA-con組,si-MIR 4697HG+anti-miR-193a-3p組

A:Transwell檢測膠質(zhì)瘤的遷移和侵襲(結(jié)晶紫染色,×10);B:Western印跡檢測HMGA2、CyclinD1、MMP-2和MMP-9蛋白表達(dá); 1~2:si-MIR 4697HG+pcDNA-con組,si-MIR 4697HG+pcDNA-HMGA2組

表7 高表達(dá)HMGA2可部分逆轉(zhuǎn)MIR4697HG低表達(dá)對U-251MG細(xì)胞增殖、遷移和侵襲的影響

3 討 論

膠質(zhì)瘤是成人中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤中發(fā)病率和死亡率最高的腫瘤。雖然治療膠質(zhì)瘤的方法有所進(jìn)步,但由于治療方案有限,患者的總體生存中值在診斷后往往低于12~18個月〔14〕。研究證實LncRNA在膠質(zhì)瘤形成中的功能作用〔15〕。例如,抑制lncRNA ZEB1-AS1可抑制U87MG膠質(zhì)母細(xì)胞瘤細(xì)胞的增殖和侵襲并促進(jìn)細(xì)胞凋亡〔16〕。lncRNA GAS5的過表達(dá)抑制了膠質(zhì)瘤U251和U87細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲,并誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡〔17〕。本研究結(jié)果與Zhang等〔8〕報道一致。作為一種高度保守的內(nèi)源性非編碼RNA,miRNA通過與靶基因的3′UTR結(jié)合,調(diào)控靶基因表達(dá),在包括發(fā)育、細(xì)胞增殖和分化在內(nèi)的多種生物學(xué)事件中發(fā)揮重要作用。miR-193a-3p在大多數(shù)癌癥中充當(dāng)抑癌基因,如胰腺導(dǎo)管腺癌〔18〕、胃癌〔19〕、前列腺癌〔20〕等。miR-193a-3p在結(jié)直腸癌組織中下調(diào),并與患者的預(yù)后密切相關(guān)〔21〕。本研究qPCR結(jié)果與miR-193a-3p過表達(dá)抑制肺癌細(xì)胞增殖和遷移的研究相符〔22〕,提示在膠質(zhì)瘤中,miR-193a-3p可能扮演著抑癌基因的角色,抑制膠質(zhì)瘤細(xì)胞增殖、遷移和侵襲。HMGA2被證明在膠質(zhì)瘤中促進(jìn)增殖、侵襲、遷移和不良預(yù)后〔23〕。本研究結(jié)果表明LncRNA MIR4697HG可能通過靶向miR-193a-3p并調(diào)控HMGA2表達(dá),從而影響膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展。

綜上,LncRNA MIR4697HG在膠質(zhì)瘤細(xì)胞中表達(dá)顯著上調(diào),抑制其表達(dá)則明顯抑制膠質(zhì)瘤細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲能力,其作用機制與靶向miR-193a-3p調(diào)控HMGA2表達(dá)有關(guān)。另外,miR-193a-3p在膠質(zhì)瘤細(xì)胞中明顯下調(diào),上調(diào)其表達(dá)導(dǎo)致膠質(zhì)瘤細(xì)胞增殖、遷移和侵襲的抑制。本研究對膠質(zhì)瘤發(fā)病機制進(jìn)行初步探索,為膠質(zhì)瘤提供了潛在的生物標(biāo)志物和治療靶點。

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