唐 瑤 龔小會(huì) 劉海燕 顧蔚蓉 李笑天,2 彭 婷△
(1復(fù)旦大學(xué)附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院產(chǎn)科 上海 200011;2上海市女性生殖內(nèi)分泌相關(guān)疾病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 上海 200011)
早產(chǎn)是指孕周不足37周的胎兒娩出。早產(chǎn)兒的器官發(fā)育不成熟,出生后近期及遠(yuǎn)期的患病率和死亡率均顯著升高[1]。根據(jù)WHO的數(shù)據(jù),全球每年約數(shù)百萬(wàn)的新生兒死于早產(chǎn)相關(guān)并發(fā)癥,早產(chǎn)也是我國(guó)繼肺炎后低于5歲兒童死亡的最常見原因[1-2]。除外醫(yī)源性早產(chǎn),自發(fā)性早產(chǎn)是早產(chǎn)的主要原因。但是其發(fā)病機(jī)制不清,缺乏及時(shí)有效的干預(yù)措施。
妊娠子宮由靜息至收縮表型轉(zhuǎn)化導(dǎo)致提前不可逆的產(chǎn)程發(fā)動(dòng)是自發(fā)性早產(chǎn)的主要特征,而miRNA被認(rèn)為是子宮平滑肌轉(zhuǎn)化過(guò)程中的重要調(diào)控分子[3-4]。在子宮平滑肌細(xì)胞中,miR-200家族分子調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子ZEB1、ZEB2和STAT 5B,而miR-199a-3p/miR-214調(diào)控靶基因PTGS2,它們的互相作用與雌孕激素對(duì)產(chǎn)程的調(diào)控密切相關(guān)[5-6]。本課題組也發(fā)現(xiàn)一系列miRNA在自發(fā)性早產(chǎn)臨產(chǎn)的子宮平滑肌中表達(dá)失常,其中miR-212-3p與炎癥導(dǎo)致早產(chǎn)子宮平滑肌功能異常密切相關(guān)[4,7]。研究顯示,miRNA能夠通過(guò)旁分泌或外泌體分泌等方式至外周循環(huán)成為游離的miRNA,后者可以局部自我調(diào)控或者作用于其他部位靶基因,參與疾病局部或全身的進(jìn)展。早產(chǎn)孕婦血液中的確存在一系列表達(dá)失常的游離miRNA,研究者們陸續(xù)發(fā)現(xiàn)自發(fā)性早產(chǎn)患者血清中與宮頸長(zhǎng)度、妊娠時(shí)長(zhǎng)、巨大兒以及胎兒性別等有關(guān)的循環(huán)miRNAs[8-10]。但是妊娠子宮作為自發(fā)性早產(chǎn)核心器官,血清中與子宮平滑肌相關(guān)的miRNAs探索卻沒有獲得關(guān)注[11]。
在我們前期發(fā)現(xiàn)的早產(chǎn)子宮平滑肌相關(guān)miRNAs中,miR-212-3p經(jīng)驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)與妊娠子宮平滑肌炎癥應(yīng)激有關(guān),miR-26b-5p和miR-223-3p分別調(diào)控全身炎性反應(yīng)的關(guān)鍵基因和炎癥小體NLRP3,存 在 參 與 早 產(chǎn) 的 理 論 基 礎(chǔ)[4,12-13];miRNA-936和miR-4746-3p因在早產(chǎn)子宮平滑肌中表達(dá)豐度相對(duì)較高,有穩(wěn)定合適的商業(yè)合成引物,檢測(cè)的重復(fù)性較好,因此被納入研究。最后,與雌孕激素調(diào)節(jié)產(chǎn)程密切相關(guān)的miR-199a-3p/miR-214家族也是有價(jià)值的研究靶點(diǎn)[6]。為了找到早產(chǎn)血清特異的miRNA分子,本課題擬從上述8個(gè)miRNAs著手,采用病例-對(duì)照研究,應(yīng)用定制Real-time PCR法尋找自發(fā)性早產(chǎn)患者血清中表達(dá)失常的miRNA,并通過(guò)生物信息學(xué)工具預(yù)測(cè)和構(gòu)建相關(guān)miRNA的作用網(wǎng)絡(luò),以了解其可能的作用,為后續(xù)早產(chǎn)機(jī)制研究提供新的方向。
研究對(duì)象和標(biāo)本采集采用病例-對(duì)照研究,收集2017年5月—2018年8月間復(fù)旦大學(xué)附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院產(chǎn)檢和分娩孕婦的臨床資料和血清,包括自發(fā)性早產(chǎn)42例(病例組)和正常妊娠32例(對(duì)照組)。自發(fā)性早產(chǎn)的診斷標(biāo)準(zhǔn)同早產(chǎn)臨產(chǎn):妊娠滿28周至不滿37周前出現(xiàn)的規(guī)律子宮收縮(每20 min 4次或每60 min內(nèi)8次,間隔5~6 min,持續(xù)時(shí)間達(dá)30 s以上),伴隨宮口擴(kuò)張≥2 cm。對(duì)照組為同期于我院產(chǎn)檢的未足月的孕晚期產(chǎn)檢正常妊娠產(chǎn)婦,無(wú)腹痛腹脹或陰道流液。兩組的排除標(biāo)準(zhǔn)包括:多胎妊娠,輔助生殖,妊娠合并子宮肌瘤,妊娠合并子宮畸形,胎盤植入,胎盤前置,胎兒畸形,生殖道感染、發(fā)熱以及內(nèi)科(孕前糖尿病、血液系統(tǒng)或者免疫系統(tǒng)疾?。┗蛘咄饪坪喜Y(膽囊炎、闌尾炎或胰腺炎)?;颊呷虢M后即刻采集5 mL的外周靜脈血,早產(chǎn)組血樣均采集于患者診斷為自發(fā)性早產(chǎn)診斷時(shí),且在患者診斷時(shí)(即入組時(shí))均進(jìn)行了感染指標(biāo)檢測(cè),包括生殖道病原學(xué)培養(yǎng)、血常規(guī)和CRP;非早產(chǎn)組招募自妊娠32~34周常規(guī)進(jìn)行血檢的孕婦,入組時(shí)均進(jìn)行了血常規(guī)檢驗(yàn)。
全血樣本于常溫促凝管中靜置30 min,然后于低溫離心機(jī)1 900×g離心10 min,上清液吸出后分裝并保存于-80℃冰箱?;颊咭话闩R床資料的采集包括年齡、產(chǎn)孕次、BMI、是否有妊娠期合并癥,通過(guò)電子檔案采集了早產(chǎn)組和非早產(chǎn)組病人的血常規(guī)報(bào)告以及早產(chǎn)組病人的病原學(xué)培養(yǎng)和CRP報(bào)告;該研究需隨訪至分娩后,獲得的妊娠結(jié)局資料包括分娩孕周及新生兒體重及APGAR評(píng)分。本研究獲得了復(fù)旦大學(xué)附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院倫理委員會(huì)的批準(zhǔn)(批件號(hào)2017-15),所有患者均簽署書面知情同意書。
Real-time PCR檢驗(yàn)根據(jù)試劑盒的步驟,取200μL的血清加入Trizol裂解液,并在其中加入3.5μL cel-mir-39-3p的工作液作為外參以監(jiān)測(cè)miRNA提取和逆轉(zhuǎn)錄的效率,采用離心柱法提取血清中的總RNA,隨后進(jìn)行cDNA合成,所有試劑盒采購(gòu)自德國(guó)QIAGEN公司(貨號(hào)217184和218161)。基于ABI 7500 HT實(shí)驗(yàn)平臺(tái),采用miScript SYBR Real time PCR試劑盒(貨號(hào)218073)和定制化miScript miRNA PCR板(貨號(hào)331231),同時(shí)檢測(cè)血清中8條候選miRNA(包括
miR-199a-3p,miR-936,miR-4746-3p,miR-26b-5p,miR-214-3p,miR-214-5p,miR-212-3p和miR-223-3p),3條候選內(nèi)參miRNA(包括miR-16-5p,let-7d-5p和RNU 6-6P)以及cel-mir-39-3p、陰性和陽(yáng)性對(duì)照作為質(zhì)控。定制化PCR板中的引物均來(lái)自QIAGEN已商品化的產(chǎn)品。PCR反應(yīng)采用10μL反應(yīng)體系,反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性15 min,然后94℃變性15 s、55℃退火30 s和70℃延伸30 s,共45個(gè)循環(huán)后反應(yīng)結(jié)束,確認(rèn)Real-time PCR的擴(kuò)增曲線和融解曲線,進(jìn)行PCR相對(duì)定量。目的基因miRNA的表達(dá)水平根據(jù)PCR擴(kuò)增曲線所得CT值,CT值的閾值設(shè)置為40?;贜orm finder算法[14],計(jì)算3條候選內(nèi)參hsa-miR-16-5p,let-7d-5p和RNU6-6P的穩(wěn)定系數(shù),并選擇表達(dá)最為穩(wěn)定的分子作為內(nèi)參,比較內(nèi)參基因與目的基因的CT值,得出各標(biāo)本之間目的基因表達(dá)量的多少。計(jì)算公式:ΔCT=
生物信息學(xué)分析采用數(shù)據(jù)庫(kù)miRDB(mirdb.org)和miRTarBase(mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw)同時(shí)預(yù)測(cè)差異表達(dá)miRNA的靶基因,預(yù)測(cè)結(jié)果的交集作為差異表達(dá)miRNA的靶基因并納入后續(xù)分析。采用STRING(string-db.org)獲得靶基因互相關(guān)系后,基于MNC算法計(jì)算靶基因中的熱點(diǎn)基因,取排在前50位的熱點(diǎn)基因信息,導(dǎo)入Cytoscape軟件進(jìn)行生物學(xué)通路的富集分析及熱點(diǎn)基因互作網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建[15]。
統(tǒng)計(jì)學(xué)方法采用SPSS 17.0軟件分析,連續(xù)性變量采用±s或中位數(shù)M(IQR)表示,組間比較采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)或Mann-Whitney U檢驗(yàn);計(jì)數(shù)資料用率表示,組間比較采用用χ2檢驗(yàn)或Fisher精確概率法。連續(xù)性變量的相關(guān)性分析采用Pearson相關(guān)分析。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。采用Benjamini-Hochberg法對(duì)多次組間比較的P值進(jìn)行矯正,矯正后FDR<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
早產(chǎn)和非早產(chǎn)孕婦臨床資料比較研究共納入42位早產(chǎn)孕婦和32位非早產(chǎn)孕婦,一般情況及臨床特征見表1。兩組在入組年齡、初產(chǎn)婦比例、采樣孕周、體重指數(shù)、妊娠期高血壓疾病及妊娠期糖尿病方面無(wú)顯著差異。早產(chǎn)組全血白細(xì)胞數(shù)目(white blood cell,WBC)和中性粒細(xì)胞數(shù)目(neutrophils,N)均顯著高于非早產(chǎn)組(P均<0.05,表1)。早產(chǎn)組中,5例感染指標(biāo)C-反應(yīng)蛋白(C-reaction protein,CRP)升高,測(cè)量值分別為10、10、32、34、42 mg/L(參考范圍<10 mg/L,低于10 mg/L不回報(bào)數(shù)值);7例生殖道病原體培養(yǎng)結(jié)果異常,產(chǎn)后回報(bào)為解脲支原體攜帶者(參考范圍:陰性)。
表1 研究對(duì)象的臨床特征和妊娠結(jié)局Tab 1 Clinical characteristicsand pregnancy outcomes of the studied population
非早產(chǎn)組中有3例患者于本機(jī)構(gòu)外分娩,她們?cè)诒緳C(jī)構(gòu)末次產(chǎn)前檢查時(shí)間均為孕37周后,電話隨訪后確定分娩結(jié)局,患者均否認(rèn)新生兒不良結(jié)局。早產(chǎn)組胎兒的分娩體重顯著低于非早產(chǎn)組胎兒的出生體重(P<0.001),兩組胎兒性別比例無(wú)顯著差異(P=0.33)。本研究中,早產(chǎn)組的3例患兒1 min Apgar評(píng)分7分,復(fù)蘇后出生5 min Apgar評(píng)分均恢復(fù)正常。非早產(chǎn)組的新生兒出生Apgar評(píng)分和5 min后Apgar評(píng)分均正常范圍內(nèi)。
早產(chǎn)和非早產(chǎn)組的血清miRNA表達(dá)情況比較根據(jù)Normfinder算法,穩(wěn)定值數(shù)值越小、分子表達(dá)越穩(wěn)定。本研究中候選內(nèi)參miR-16-5p、let-7d-5p和RNU 6-6P的穩(wěn)定值分別為0.44、0.16和0.66,故以let-7d-5p為內(nèi)參計(jì)算血清miRNA分子的相對(duì)表達(dá)量。表2展示了目標(biāo)血清miRNAs的相對(duì)表達(dá)水平及組間比較,早產(chǎn)組孕婦血清miR-936和miR-26b-5p的相對(duì)表達(dá)量較非早產(chǎn)組的分子相對(duì)表達(dá)量顯著升高(FDR均為0.036)。
表2 早產(chǎn)組和非早產(chǎn)組血清miRNA相對(duì)表達(dá)情況及比較Tab 2 Comparison of the relative expression levels of circulated miRNAs in NPand PTL groups
不同白細(xì)胞水平早產(chǎn)和非早產(chǎn)組的血清miRNA表達(dá)情況比較妊娠期WBC無(wú)公認(rèn)的參考范圍,因此基于ROC受試者曲線取約登指數(shù)最大處的WBC值作為截?cái)嘀担碬BC=10.55×109/L),將所有人再次分為WBC升高組和WBC正常組(表3)。WBC升高組的23人中僅包括了4例非早產(chǎn)人群。WBC正常組共51人,早產(chǎn)和非早產(chǎn)人群比例相當(dāng)。WBC升高組中,miR-936和miR-26b-5p在早產(chǎn)中雖表現(xiàn)出升高趨勢(shì)但不顯著。在WBC正常組中,miR-26b-5p和miR-936在早產(chǎn)人群中均顯著升高(P均<0.05)。
表3 以WBC水平分層后早產(chǎn)組和非早產(chǎn)組血清miRNA相對(duì)表達(dá)情況及比較Tab 3 Comparison of the relative expression levels of circulated miRNAs in NPand NLPgroups after stratified with WBC level
N和WBC的測(cè)量值互相呈顯著強(qiáng)的正相關(guān)(Pearson相關(guān)系數(shù)0.929,P<0.001),根據(jù)N進(jìn)行分層分析可以得到相似的分層統(tǒng)計(jì)結(jié)果。在早產(chǎn)人群中再根據(jù)CRP升高與否、WBC升高與否以及攜帶支原體與否分別進(jìn)行亞組分析,miR-26b-5p和miR-936水平均無(wú)顯著變化(P均>0.05)。
早產(chǎn)組中調(diào)控失常miRNA的生物信息分析共有266個(gè)基因同時(shí)被數(shù)據(jù)庫(kù)miRDB和miRTarBase預(yù)測(cè)到是miR-936或miR-26b-5p的靶基因。利用STRING數(shù)據(jù)庫(kù)獲得靶基因的互作關(guān)系,并最終獲得前50位關(guān)鍵基因(Hub genes),包括miR-936的靶基因MBNL 1、FGF 2和HIST 1H 2BK,以及miR-26b-5p的靶基因PTEN、EP300及EZH 2等?;蚋患治觯℅ene Enrichment Analysis)結(jié)果顯示,主要富集的靶向通路包括細(xì)胞周期調(diào)控、miRNA調(diào)控、磷脂酰肌醇3-激酶活性的正調(diào)節(jié)及心肌細(xì)胞調(diào)控等方向(圖1)。
圖1 前50位關(guān)鍵靶基因的基因富集分析和互相作用Fig 1 Gene enrichment analysis and gene interaction network of top 50 hub genes
妊娠子宮提前由靜息表型轉(zhuǎn)為收縮表型是自發(fā)性早產(chǎn)主要臨床特征,它是自發(fā)性早產(chǎn)疾病進(jìn)展的核心器官。本研究首次從子宮平滑肌角度出發(fā),測(cè)定了孕婦血清中子宮平滑肌相關(guān)miRNAs的表達(dá),發(fā)現(xiàn)血清miR-936和miR-26b-5p在自發(fā)性早產(chǎn)中異常升高。本文也針對(duì)miR-936和miR-26b-5p有實(shí)驗(yàn)室證據(jù)支持的靶基因中尋找關(guān)鍵基因進(jìn)行功能富集和基因本位分析,初步了解了miR-936和miR-26b-5p可能的作用通路。
人類外周血單核細(xì)胞在感染大腸埃希菌或西氏菌屬后表達(dá)高水平的miR-26b-5p分子,miR-26b-5p調(diào)節(jié)了約20%與敗血癥死亡率顯著有關(guān)的關(guān)鍵基因[12,16];miR-26b-5p也能夠調(diào)控炎癥因子COX2及其合成產(chǎn)物PGE2[17]。在免疫性疾病如銀屑病中,miR-26b-5p在皮下脂肪組織中顯著升高與免疫相關(guān)單核細(xì)胞、纖維細(xì)胞及血管內(nèi)皮細(xì)胞中膽固醇代謝的調(diào)控密切相關(guān)[18]。綜上,miR-26b-5p是一個(gè)重要的炎癥和免疫調(diào)控分子。盡管如此,本研究數(shù)據(jù)提示血清miR-26b-5p與早產(chǎn)的關(guān)系獨(dú)立于炎癥。近期國(guó)際的臨床研究提示自發(fā)性早產(chǎn)中磷脂代謝異常,有趣的是,我們預(yù)測(cè)的miR-26b-5p關(guān)鍵靶點(diǎn)也富集于磷脂代謝調(diào)節(jié)過(guò)程,miR-26b-5p是否參與上述過(guò)程需要進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證[19]。
與本文報(bào)道的結(jié)果相反,Wang等[20]發(fā)現(xiàn)早產(chǎn)中miR-26b-5p異常降低,胎盤中miR-26b-5p下調(diào)是維生素D缺乏導(dǎo)致早產(chǎn)的重要調(diào)控分子。由于本文的研究對(duì)象為經(jīng)濟(jì)和營(yíng)養(yǎng)條件較好的國(guó)內(nèi)一線城市患者,維生素D缺乏導(dǎo)致的早產(chǎn)并非主因,并且本研究聚焦于血清而非胎盤,不同的人群和樣本類型可能造成研究間的差異。
目前暫無(wú)研究提及miR-936在早產(chǎn)中的作用。miR-936靶向的FGF 2是本文預(yù)測(cè)靶基因作用網(wǎng)絡(luò)的熱點(diǎn)基因之一,可以調(diào)控心肌細(xì)胞的增殖及正性調(diào)控細(xì)胞內(nèi)磷脂酰肌醇3-激酶活性等過(guò)程。本研究結(jié)果也提示,miR-936和miR-26b-5p還可能與機(jī)體的細(xì)胞周期調(diào)控和miRNA調(diào)控等功能有關(guān)。盡管如此,miR-26b-5p在組織和血清中的分子作用機(jī)制差異以及miR-26b-5p和miR-936在子宮平滑肌和外周器官的作用機(jī)制還需要進(jìn)一步研究。
目前,受限于研究技術(shù)、分析方法及研究人群,早產(chǎn)血清中表達(dá)失控的miRNAs在不同研究間的異質(zhì)性較強(qiáng)。甚至在2015年,Elovitz等[21]基于該課題組Array技術(shù)篩查結(jié)果認(rèn)為早產(chǎn)患者血清miRNA與未早產(chǎn)者無(wú)明顯區(qū)別。但是后來(lái)其他科研團(tuán)隊(duì)基于實(shí)時(shí)PCR和RNA測(cè)序等技術(shù),陸續(xù)發(fā)現(xiàn)了與宮頸長(zhǎng)度、妊娠時(shí)長(zhǎng)、巨大兒以及胎兒性別等有關(guān)的循環(huán)miRNA[8,10,22]。同時(shí),隨著RNA研究技術(shù)的不斷發(fā)展成熟,不限于循環(huán)中游離的miRNA這一形式,外泌體來(lái)源的miRNA、甚至環(huán)狀RNA都被證實(shí)在早產(chǎn)孕婦中呈現(xiàn)特異的表達(dá)譜[23-24]。因此,尋找早產(chǎn)血清中表達(dá)失控RNA分子仍是早產(chǎn)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。
本課題探索了可能與早產(chǎn)有關(guān)的多種miRNAs在血清中的表達(dá),采用穩(wěn)定的Real-time PCR測(cè)定法及科學(xué)的血清miRNA內(nèi)參篩選及鑒定法是課題的優(yōu)勢(shì)之一。不足在于:本課題為小樣本的探索性研究,限制了差異性統(tǒng)計(jì)分析以及分層分析或亞組分析的把握度,需要在更大規(guī)模的人群中進(jìn)行驗(yàn)證;其次,由于缺乏正常分娩發(fā)動(dòng)產(chǎn)婦作為參照,miR-936和miR-26b-5p與正常產(chǎn)程關(guān)系不能明確;最后,雖然通過(guò)生物信息方法預(yù)測(cè)了相關(guān)miRNA的功能,后續(xù)需要在體外實(shí)驗(yàn)中證實(shí)miR-936和miR-26b-5p的功能及分子機(jī)制。
本研究結(jié)果顯示血清miR-936和miR-26b-5p水平在早產(chǎn)孕婦中顯著升高,并通過(guò)生物信息法初步了解了miR-936和miR-26b-5p可能的生物學(xué)作用,為早產(chǎn)發(fā)病機(jī)制的研究提供了新的方向。
作者貢獻(xiàn)聲明唐瑤 論文撰寫,實(shí)驗(yàn)分析。龔小會(huì) 標(biāo)本采集,實(shí)驗(yàn)分析,論文修改。劉海燕標(biāo)本采集。顧蔚蓉,李笑天 論文修改,數(shù)據(jù)審核。彭婷 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),論文修改。
利益沖突聲明所有作者均聲明不存在利益沖突。
復(fù)旦學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版)2022年2期