歷史時期考古中，王朝的變更對考古學遺存的影響研究，一直是考古類型學與分期研究中的難點。這一難點可以說首先表現(xiàn)在考古學地層如何反映王朝的變更；其次表現(xiàn)在王朝變更的重大歷史事件，在考古學遺存中沒有明確紀年的情況下，重大歷史事件如何反映在考古學遺存中。這一兩難問題，在商周考古玉器改形器的研究中，得到了思考的機會和個案研究的突破。

——吳桂兵

多元一體文化格局下的中華文明歷史研究，需要從中原地區(qū)核心文化的研究視角考察其與各地文化之間的內在關聯(lián)，更需要從各地文化的重要考古發(fā)現(xiàn)回望中原地區(qū)核心文化的重要價值和深遠影響。三星堆祭祀坑的考古新發(fā)現(xiàn)，不僅對于深入開展三星堆文化研究具有重要的學術意義，更為華夏文明多元一體格局的研究提供了非常重要的考古新資料，將極大促進考古工作和歷史研究的深入展開。

——李宏飛

中華文明探源工程已經取得的成就有目共睹，未來我們應該加強文化基因、文明機制、文明動因等上層建筑方面內涵的探討，或者說屬于精神、理念和思想層次的研究。集中探索“中華之源、中華之根、中華之魂”，尤其是“中華之魂”，從上層建筑的角度回答“為什么中華文明5000 多年延綿不斷”的深層次原因，以及“中華文明為什么會有這樣的標識”等重大問題。

——高江濤

通過考古、語言和遺傳學的跨學科交叉研究解析人類史前歷史，把自然科學的技術方法全面地引入考古學和語言學研究中，綜合多學科視角，定性研究與定量研究相結合，全方位、多角度探索族群起源和文化演變中的關鍵問題，我們能夠讓人類生物遺傳譜系的研究與考古和語言文化譜系互相借鑒、互相印證、互相補充，從而進一步回答好中華文明起源、形成、發(fā)展的基本圖景、內在機制以及各區(qū)域文明演進路徑等重大問題。

——王傳超