張永曉,李英華(衡水市人民醫(yī)院 血液內(nèi)科,河北 衡水 053000)
骨髓增生異常綜合征(myelodysplastic syndrome,MDS)是一種異質(zhì)性血液系統(tǒng)惡性腫瘤,以細(xì)胞減少為特征并伴有轉(zhuǎn)化為急性髓細(xì)胞白血?。╝cute myeloid leukemia,AML)的危險[1-2]。miRNA 是一類長度為18~22 個核苷酸的非編碼微小RNA,通過與3′UTR不完全堿基互補配對在轉(zhuǎn)錄后抑制靶基因的表達(dá),導(dǎo)致靶基因mRNA 的翻譯阻滯[3-4]。miRNA 廣泛參與人類多種疾病的發(fā)生與發(fā)展,其中包括MDS[5-6]。miR-17-5p作為miR-17家族成員之一,參與調(diào)節(jié)神經(jīng)母細(xì)胞瘤、AML 和MDS 等多種腫瘤的進(jìn)展[7-9]。有研究結(jié)果[10]顯示,含SET結(jié)構(gòu)域蛋白2(SET domain containing 2,SETD2)參與AML的發(fā)病機(jī)制,雖其在MDS 中的作用也有相關(guān)報道,但其潛在的調(diào)控機(jī)制仍尚未明了。本課題觀察MDS 患者骨髓中miR-17-5p 和SETD2 的表達(dá),探討MDS 細(xì)胞SKM-1中干預(yù)miR-17-5p、過表達(dá)SETD2、干預(yù)SETD2 處理后細(xì)胞的增殖與凋亡水平,以揭示miR-17-5p 調(diào)控MDS細(xì)胞增殖與凋亡的機(jī)制,為臨床MDS的精準(zhǔn)治療提供實驗依據(jù)。
收集2019 年3 月至2021 年5 月衡水市人民醫(yī)院就診的35例MDS患者的骨髓組織標(biāo)本,患者確診依據(jù)為《骨髓增生異常綜合征中國診斷與治療指南》(2019 年版),標(biāo)記為MDS 組,所有患者均為未進(jìn)行任何治療的初診原發(fā)性MDS。同時收集35 例健康體檢者的骨髓組織標(biāo)本,標(biāo)記為對照組。所有標(biāo)本采集前均告知患者并簽署知情同意書。MDS細(xì)胞系SKM-1來自本醫(yī)院。
CCK-8 試劑盒購自日本同仁公司,Annexin Ⅴ/FITC 細(xì)胞凋亡檢測試劑盒購自日本TaKaRa 公司,LipofectamineTM3000 轉(zhuǎn)染試劑購自賽默飛世爾科技(中國)有限公司,雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒購自上海碧云天生物技術(shù)有限公司,兔抗SETD2、cleaved caspase-3(C-caspase-3)、C-caspase-9 抗體購自上海艾博抗(Abcam)貿(mào)易有限公司,辣根過氧化物酶(HRP)標(biāo)記的山羊抗兔二抗購自北京博爾西科技有限公司,實驗中所有引物、核酸序列均由上海吉瑪基因股份有限公司提供。
將SKM-1細(xì)胞置于含有10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)液中,于37 ℃、5%CO2的培養(yǎng)箱中培養(yǎng),每2 d更換一次培養(yǎng)液。
將培養(yǎng)48 h的SKM-1細(xì)胞分為NC組(不做任何處理)、si-miR-17-5p 組(轉(zhuǎn)染si-miR-17-5p mimic)、si-miR-CN 組(轉(zhuǎn)染si-miR-CN)、miR-17-5p 組(轉(zhuǎn)染miR-17-5p mimic)、miR-CN 組(轉(zhuǎn) 染miR-NC)、pcDNA 組(轉(zhuǎn)染pcDNA)、pcDNA-SETD2 組(轉(zhuǎn)染pcDNA-SETD2)、si-SETD2 組(轉(zhuǎn)染siSETD2)、si-NC(轉(zhuǎn)染siRNA)、si-miR-17-5p+si-CN 組(共轉(zhuǎn)染si-miR-17-5p 和si-CN)、si-miR-17-5p+si-SETD2 組(共轉(zhuǎn)染 si-miR-17-5p和si-SETD2)。按照LipofectamineTM3000轉(zhuǎn)染試劑說明書方法,將各個重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染至SKM-1 細(xì)胞中,轉(zhuǎn)染12 h 時更換新鮮培養(yǎng)液。qPCR 或WB 實驗檢測轉(zhuǎn)染效率,確定轉(zhuǎn)染成功后方可進(jìn)行后續(xù)研究。
用RNA抽提試劑盒提取各組待檢測細(xì)胞中總RNA,再用逆轉(zhuǎn)錄試劑逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,最后用qPCR試劑盒檢測cDNA中miR-17-5p、SETD2 mRNA的表達(dá)水平。引 物 序 列:miR-17-5p F 為5′-TCTAGATCCCGA GGACTG-3′,R為5′-ATCGTGACCTGAACC-3′;SETD2 F 為5′-AACGGGAGGCTCAGAAACAA-3′,R 為5′-GTGGGTAACCAGCAAAGGGA-3′;U6 F 為5′-AAC GCTTCACGAATTTGCGT-3′,R 為5′ -CCAAGC TTATGACAGCCATCATC -3′ ;GAPDH F 為 5′-TGAGATCAACGTGTTCCAGTG-3′,R 為5′-ACC AGATGAAATG TGCCCC-3′。qPCR反應(yīng)條件:95 ℃預(yù)變性2 min;95 ℃變性30 s,60 ℃退火30 s,72 ℃延伸50 s,共進(jìn)行41個循環(huán);最后72 ℃保持5 min。以U6、GAPDH 為內(nèi)參,以2-△△Ct法計算miR-17-5p 和SETD2 mRNA的相對表達(dá)量。
取各組對數(shù)生長期細(xì)胞,用RIPA 細(xì)胞裂解液冰上裂解30 min,提取細(xì)胞總蛋白。對蛋白進(jìn)行定量、變性處理,離心取上清用于蛋白電泳上樣,進(jìn)行10%SDS-PAGE,將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移至PVDF膜上,用含有2.5%脫脂奶粉的封閉液37 ℃下處理2 h。將PVDF膜浸入稀釋的兔抗SETD2(1∶1 000)、C-caspase-3(1∶1 000)、C-caspase-9(1∶1 500)、β-actin(1∶800)一抗中,4 ℃下處理過夜。次日,充分清洗后,加入HRP標(biāo)記的山羊抗兔二抗(1∶500),37 ℃下處理2 h。清洗后,用ECL電化學(xué)發(fā)光法顯影、曝光。ImageJ軟件分析蛋白條帶的灰度值,以目的蛋白與內(nèi)參蛋白的灰度值之比表示目的蛋白的相對表達(dá)量。
將各組細(xì)胞密度調(diào)整至1×105個/mL,取100 μL加入96 孔板中,依次加入20 μL CCK-8 溶液,分別在24、48和72 h時,上酶標(biāo)儀檢測490 nm波長處每孔的光密度(D)值,以D值表示細(xì)胞的增殖能力。
將各組細(xì)胞用600 μL 結(jié)合緩沖液懸浮后,依次加入Annexin Ⅴ/FITC、PI染色液各5 μL,避光下放置20 min 后,快速上流式細(xì)胞儀檢測SKM-1 細(xì)胞的凋亡率。細(xì)胞總凋亡率=早期凋亡率+晚期凋亡率。
通過TargetScan 軟件預(yù)測miR-17-5p 與SETD2之間存在的互補結(jié)合位點。將含有野生型(WT)或突變型(MUT)SETD2 3'UTR 中含miR-17-5p 結(jié)合位點的核苷酸序列克隆到pGL3 熒光素酶報告質(zhì)粒載體。將對數(shù)生長期SKM-1細(xì)胞接種在24孔板(2×105個/孔),然 后 用LipofectamineTM3000 將miR-17-5p mimic、miR-NC 與WT 或MUT報告質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染至SKM-1 細(xì)胞,繼續(xù)培養(yǎng)48 h,使用雙熒光素酶試劑盒測定細(xì)胞的熒光活性。
qPCR、WB、CCK-8 和流式細(xì)胞術(shù)等實驗均重復(fù)3 次。采用SPSS22.0 統(tǒng)計學(xué)軟件對實驗數(shù)據(jù)進(jìn)行處理。符合正態(tài)分布的計量數(shù)據(jù)以表示,兩組數(shù)據(jù)間比較采用獨立樣本t檢驗,多組數(shù)據(jù)間比較采用單因素方差分析,miR-17-5p與SETD2 mRNA表達(dá)之間的關(guān)系采用Pearson相關(guān)性分析,以P<0.05或P<0.01表示差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。
qPCR 和WB 法檢測結(jié)果顯示,與對照組相比,MDS 骨髓組織中miR-17-5p 表達(dá)水平顯著升高(11.65±4.69vs1.00±0.32,t=13.403,P<0.01),SETD2 mRNA 和蛋白表達(dá)均顯著降低(0.41±0.22vs1.00±0.34,t=8.619,P<0.01;0.21±0.07vs0.68±0.14,t=9.008,P<0.01;圖1A)。Pearson 相關(guān)性分析結(jié)果(圖1B)顯示,MDS骨髓組織中miR-17-5p 表達(dá)與SETD2 mRNA表達(dá)之間呈顯著負(fù)相關(guān)(r=-0.546,P<0.01)。
圖1 MDS骨髓組織中SETD2表達(dá)(A)和miR-17-5p與SETD2 mRNA表達(dá)的相關(guān)性分析(B)
CCK-8 法檢測結(jié)果顯示,與NC 組和si-miR-NC組相比,si-miR-17-5p 組SKM-1 細(xì)胞中miR-17-5p表達(dá)顯著降低(0.24±0.05vs1.00±0.07、0.98±0.12,F(xiàn)=234.349,P<0.01);在轉(zhuǎn)染24、48 和72 h 時,細(xì)胞增殖能力均顯著降低(t24h:0.32±0.04vs0.39±0.04、0.38±0.05,F(xiàn)=6.789,P<0.01;t48h:0.45±0.05vs0.67±0.08、0.65±0.06,F(xiàn)=31.968,P<0.01;t72h:0.73±0.09vs1.12±0.13、1.14±0.14,F(xiàn)=32.348,P<0.01)。結(jié)果表明,干擾miR-17-5p 表達(dá)可顯著降低SKM-1 細(xì)胞的增殖能力。
流式細(xì)胞術(shù)檢測結(jié)果顯示,與NC 組和si-miR-NC組相比,si-miR-17-5p 組SKM-1 細(xì)胞凋亡率顯著升高[(13.36±2.54)%vs(3.26±0.60)%、(3.46±0.69)%,F(xiàn)=123.533,P<0.01 ;圖2A] 。WB法檢測結(jié)果顯示,si-miR-17-5p 組SKM-1細(xì)胞中C-caspase-3、C-caspase-9 表達(dá)水平顯著升高(0.37±0.05vs0.15±0.03、0.13±0.04,F(xiàn)=95.760,P<0.01;0.43±0.07vs0.08±0.03、0.11±0.04,F(xiàn)=137.311,P<0.01;圖2B)。結(jié)果表明,干擾miR-17-5p表達(dá)可誘導(dǎo)SKM-1細(xì)胞凋亡。
圖2 干擾miR-17-5p對SKM-1細(xì)胞凋亡(A)及其相關(guān)蛋白表達(dá)(B)的影響
通過預(yù)測軟件TargetScan 預(yù)測到miR-17-5p 與SETD2之間存在連續(xù)6個互補的核苷酸結(jié)合位點(圖3A)。雙熒光素酶報告基因?qū)嶒灲Y(jié)果(圖3B)顯示,與miR-NC 組相比,轉(zhuǎn)染miR-17-5p mimic 后,WT 組細(xì)胞的熒光素酶活性顯著降低(t=13.389,P<0.01),而MUT組細(xì)胞的熒光素酶活性變化不顯著(t=0.651,P>0.05)。WB 法檢測結(jié)果顯示,與miR-NC 組相比,miR-17-5p mimic組細(xì)胞中SETD2蛋白表達(dá)顯著降低(0.06±0.01vs0.24±0.05,t=10.590,P<0.01);與si-miRNC組相比,si-miR-17-5p mimic組細(xì)胞中SETD2蛋白表達(dá)顯著升高(0.43±0.07vs0.21±0.05,t=7.672,P<0.01;圖3C)。結(jié)果表明,miR-17-5p 靶向負(fù)調(diào)控SETD2蛋白的表達(dá)。
圖3 SKM-1細(xì)胞中miR-17-5p靶向調(diào)控SETD2的表達(dá)
轉(zhuǎn)染pcDNA-SETD2后,WB、CCK-8和流式細(xì)胞術(shù)檢測結(jié)果(表1和圖4)顯示,與NC組和pcDNA組相比,pcDNA-SETD2組SKM-1細(xì)胞中SETD2 蛋白表達(dá)顯著升高(均P<0.01),轉(zhuǎn)染后24、48和72 h時細(xì)胞增殖活力均顯著降低(均P<0.01)、細(xì)胞凋亡率顯著升高(P<0.01),細(xì)胞中C-caspase-3 和C-caspase-9 表達(dá)均顯著升高(均P<0.01)。結(jié)果表明,過表達(dá)SETD2 可明顯降低SKM-1細(xì)胞的增殖能力并促進(jìn)細(xì)胞凋亡。
表1 過表達(dá)SETD2對SKM-1細(xì)胞增殖、凋亡及其相關(guān)蛋白表達(dá)的影響
圖4 過表達(dá)SETD2對SKM-1細(xì)胞凋亡(A)及SETD2、C-caspase-9和C-caspase-3表達(dá)(B)的影響
轉(zhuǎn)染si-miR-17-5p后,WB、CCK-8法和流式細(xì)胞術(shù)檢測結(jié)果(表2和圖5)顯示,與si-miR-NC組相比,si-miR-17-5p 組細(xì)胞中SETD2 蛋白表達(dá)顯著升高(P<0.01);在24、48和72 h時細(xì)胞的增殖能力均顯著降低(均P<0.01),細(xì)胞凋亡率顯著升高(P<0.01),細(xì)胞中C-caspase-3 和C-caspase-9 表達(dá)均顯著升高(均P<0.01);與si-miR-17-5p+si-NC組相比,si-miR-17-5p+si-SETD2組細(xì)胞中SETD2蛋白的表達(dá)水平顯著降低(P<0.01),在24、48、72 h 細(xì)胞增殖能力均顯著升高(均P<0.01),細(xì)胞凋亡率顯著降低(P<0.01),C-caspase-3 和C-caspase-9 表達(dá)均顯著降低(均P<0.01)。結(jié)果表明,沉默SETD2 可部分逆轉(zhuǎn)干擾miR-17-5p對SKM-1細(xì)胞的增殖抑制、凋亡促進(jìn)作用。
圖5 同時干擾SETD2和miR-17-5p對SKM-1細(xì)胞凋亡(A)及其相關(guān)蛋白表達(dá)(B)的影響
表2 同時干擾SETD2和miR-17-5p對SKM-1細(xì)胞增殖和凋亡及其相關(guān)蛋白表達(dá)的影響
MDS是一種以造血功能低下為特征的克隆性干細(xì)胞疾病,具有向AML 轉(zhuǎn)化的高風(fēng)險[11]。miRNA 在多種腫瘤中作為抑癌基因或致癌基因發(fā)揮其作用,調(diào)控細(xì)胞的增殖與凋亡[12-14],也可能在MDS的發(fā)生發(fā)展中起重要作用。近期的研究結(jié)果[15]顯示,miR-17-5p作為lncRNA HOTAIR 在AML 中表達(dá)異常升高并促進(jìn)AML細(xì)胞的分化,其機(jī)制為靶向抑制下游miR-17-5p表達(dá)而上調(diào)p21。HE等[16]研究發(fā)現(xiàn),miR-17/20a參與缺氧誘導(dǎo)因子1 介導(dǎo)的MDS 細(xì)胞的分化過程。VASILATOU 等[17]研究發(fā)現(xiàn),miR-17-5p 在高危MDS患者中的表達(dá)水平顯著高于低危MDS 患者,并且其表達(dá)水平與MDS患者的總生存率有關(guān)。本研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),miR-17-5p 在MDS 骨髓組織中高表達(dá),這與前述研究者的研究結(jié)論相一致。為了探究miR-17-5p參與MDS 發(fā)展的調(diào)控機(jī)制,研究者[18]還檢測了干擾miR-17-5p表達(dá)對MDS細(xì)胞增殖與凋亡的影響,結(jié)果發(fā)現(xiàn)干擾miR-17-5p 表達(dá)顯著抑制MDS 細(xì)胞的增殖并促進(jìn)細(xì)胞凋亡,同時還下調(diào)凋亡相關(guān)蛋白C-caspase-3和C-caspase-9的表達(dá)。研究結(jié)果揭示了miR-17-5p 在MDS 發(fā)生發(fā)展過程中起重要作用。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),SETD2 在MDS 中作為miR-17-5p的靶基因而表達(dá)失調(diào),這也許與miR-17-5p 在MDS中的調(diào)控作用存在一定的相關(guān)性。
MDS 發(fā)展為AML 與基因突變有關(guān)。據(jù)報道[18],含有2 個SETD2 變異體的SET 結(jié)構(gòu)域為AML 患者預(yù)后不良的危險因素。但是SETD2 在MDS 中的作用機(jī)制仍有待深入研究。LI 等[19]研究發(fā)現(xiàn),SETD2基因低表達(dá)與MDS 患者不良預(yù)后密切相關(guān),并且其可通過上調(diào)骨髓細(xì)胞中散亂蛋白3的表達(dá)促進(jìn)MDS轉(zhuǎn)化為AML。CHEN 等[20]也報道,SETD2 在MDS 中低表達(dá)與患者生存期縮短顯著相關(guān),其具有促進(jìn)MDS 向AML 轉(zhuǎn)化的功能,提示SETD2 是治療MDS轉(zhuǎn)化為AML 的潛在靶點。上述研究結(jié)果均表明,SETD2 在MDS 中扮演致病基因的角色。本研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),SETD2 在MDS 中呈顯著低表達(dá),這與上述研究者的研究結(jié)果相一致。此外本研究還發(fā)現(xiàn),過表達(dá)SETD2的MDS細(xì)胞增殖能力顯著下降、凋亡能力明顯增強(qiáng),而沉默SETD2 卻可以顯著逆轉(zhuǎn)干擾miR-17-5p 對MDS 細(xì)胞增殖抑制和凋亡促進(jìn)作用。研究結(jié)果說明,不僅miR-17-5p 可負(fù)向調(diào)控SETD2在MDS 組織中的表達(dá),SETD2 也具有逆向調(diào)控miR-17-5p表達(dá)的作用。
綜上所述,本研究結(jié)果表明MDS骨髓中miR-17-5p高表達(dá),其作用是調(diào)控MDS 細(xì)胞的增殖與凋亡能力,產(chǎn)生這種作用的機(jī)制與miR-17-5p 靶向負(fù)調(diào)控SETD2相關(guān),此結(jié)果為MDS的治療提供了新的靶點。