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基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的瞼板腺形態(tài)人工智能分析系統(tǒng)的構(gòu)建

2021-10-13 11:15朱敏穎林曉蕾張祖輝戴琦
浙江醫(yī)學(xué) 2021年18期
關(guān)鍵詞:板腺腺體眼瞼

朱敏穎 林曉蕾 張祖輝 戴琦

瞼板腺功能障礙(meibomian gland dysfunction,MGD)是一種慢性、彌漫性瞼板腺異常,可引起淚膜異常、眼部刺激癥狀、炎癥反應(yīng)及眼表損害[1]。目前MGD的病因及發(fā)病機(jī)制尚不明確,但有研究發(fā)現(xiàn)瞼板腺形態(tài)和功能存在密切關(guān)聯(lián)。Pult等[2]發(fā)現(xiàn)瞼板腺形態(tài)缺失與淚膜脂質(zhì)層厚度和穩(wěn)定性密切相關(guān)。Yin等[3]研究認(rèn)為瞼板腺形態(tài)上不均勻缺失與MGD密切相關(guān)。Ban等[4]認(rèn)為上眼瞼瞼板腺缺失與瞼板腺分泌分?jǐn)?shù)及淚膜脂質(zhì)層相關(guān)。目前Arita等[5]的分級(jí)法是使用較多的評(píng)價(jià)瞼板腺形態(tài)缺失的指標(biāo),但其人工標(biāo)注工作量大、效率低、誤差大?;谏疃葘W(xué)習(xí)的人工智能(artificial intelligence,AI)系統(tǒng)在分類及圖像識(shí)別方面的效率和精度都遠(yuǎn)高于圖像處理算法和早期的機(jī)器學(xué)習(xí)算法,且成本大幅降低,是目前醫(yī)學(xué)診斷當(dāng)中最火熱和最具有前景的發(fā)展方向。深度學(xué)習(xí)經(jīng)過多年的發(fā)展,人們提出了許多深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),其中,卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(convolutional neural network,CNN)已被成熟應(yīng)用于人臉識(shí)別、文字識(shí)別、圖像檢索等多個(gè)領(lǐng)域[6-7]。對(duì)于物體識(shí)別、圖片分類等,CNN的準(zhǔn)確率可以接近甚至優(yōu)于人工分析方式[8-9]。Wang等[10]和Zhou等[11]使用CNN對(duì)瞼板腺萎縮進(jìn)行分級(jí),結(jié)果證明AI技術(shù)對(duì)瞼板腺萎縮的自動(dòng)評(píng)價(jià)是有效的。但目前研究主要關(guān)注整個(gè)瞼板區(qū)域和萎縮區(qū)域的識(shí)別,并沒有對(duì)每根瞼板腺腺體進(jìn)行檢測(cè)和評(píng)價(jià)。筆者團(tuán)隊(duì)前期研究提出瞼板腺彎曲度及瞼板腺密度兩項(xiàng)定量評(píng)價(jià)指標(biāo)[12],可以成為AI系統(tǒng)的進(jìn)階評(píng)價(jià)指標(biāo)。本研究建立的AI系統(tǒng)是基于CNN的U-Net網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建的,該系統(tǒng)能夠自動(dòng)處理瞼板腺圖片,識(shí)別出瞼板腺的單根腺體,并使用前期提出的瞼板腺量化評(píng)價(jià)指標(biāo)來準(zhǔn)確評(píng)估瞼板腺的各項(xiàng)形態(tài)參數(shù)。

1 對(duì)象和方法

1.1 對(duì)象 選取2020年12月至2021年3月在溫州醫(yī)科大學(xué)附屬眼視光醫(yī)院杭州院區(qū)就診的60例受試者作為研究對(duì)象。其中阻塞性MGD患者32例(MGD組),健康志愿者28例(正常組)。MGD組男16例,女16例;年齡 22~50(33.28±9.28)歲;正常組男 11 例,女 17 例;年齡8~51(25.25±11.19)歲。兩組受試者性別比較差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),但年齡比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01)。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)患有眼部疾病或已知影響眼前節(jié)解剖結(jié)構(gòu)情況的患者,如有眼部炎癥、眼部手術(shù)史、佩戴隱形眼鏡和(或)外傷史;(2)有影響瞼板腺功能的全身用藥史的患者;(3)患有任何其他已知會(huì)影響淚膜的眼部疾病或全身性疾病者。所有患者均由兩位經(jīng)驗(yàn)豐富的眼科醫(yī)生根據(jù)眼部癥狀、瞼緣異常和瞼板腺評(píng)分診斷為阻塞性MGD。如果滿足以下3個(gè)標(biāo)準(zhǔn)中的任何一個(gè),則患者被診斷為阻塞性MGD:(1)眼部癥狀評(píng)分≥3分;(2)瞼緣評(píng)分≥2分;和(或)(3)瞼板腺評(píng)分≥3分[13]。只測(cè)量受試者的右眼。本研究經(jīng)溫州醫(yī)科大學(xué)附屬眼視光醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)審批通過,所有受試者均簽署知情同意書。

1.2 AI模型的訓(xùn)練和測(cè)試

1.2.1 圖像預(yù)處理 使用眼表分析儀(德國 OCULUS Optikgerate GmbH歐科路光學(xué)儀器有限責(zé)任公司,型號(hào):Keratography 5M)拍攝60例受試者右眼上下眼瞼的瞼板腺圖像,并將其分為40幅訓(xùn)練圖像和20幅測(cè)試圖像。訓(xùn)練圖像中的瞼板腺由兩位高級(jí)職稱醫(yī)師手動(dòng)標(biāo)注。在訓(xùn)練前,研究小組對(duì)40幅訓(xùn)練圖像進(jìn)行了如下的預(yù)處理。

(1)圖像轉(zhuǎn)換為灰度,如下所示:

Igray=Ir×0.299+Ig×0.587+Ib×0.114

其中,Igray是灰度值,Ir是RGB圖像的R通道的值,Ig是RGB圖像的G通道的值,Ib是RGB圖像的B通道的值。

(2)標(biāo)準(zhǔn)化。使用以下公式對(duì)圖像進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化:

其中,Xstd是像素標(biāo)準(zhǔn)值,Xgray是像素灰度值,μ是像素平均值,σ是像素標(biāo)準(zhǔn)偏差。

(3)歸一化。使用以下公式對(duì)圖像進(jìn)行歸一化:

其中,Xnorm是像素歸一化值。

(4)直方圖用限制對(duì)比度自適應(yīng)直方圖均衡調(diào)整。瞼板腺圖像不均勻,有些圖像對(duì)比度低,有些曝光過度。因此,采用對(duì)比度受限的自適應(yīng)直方圖均衡化算法來提高全局對(duì)比度,防止在相對(duì)均勻的圖像區(qū)域過度放大噪聲。

(5)伽馬校正。每個(gè)像素的亮度由以下公式調(diào)整:

其中,X[范圍從(0,1)]是圖像中的原始像素值,Y是調(diào)整后的像素值。

原始的圖像(a)和預(yù)處理完成的圖像(b)見圖1。

圖1 原始圖像(a)和預(yù)處理圖像(b)

由于數(shù)據(jù)集只有40幅圖像,并且太小而無法訓(xùn)練一個(gè)CNN,因此筆者通過從每個(gè)訓(xùn)練圖像中隨機(jī)選擇子圖像塊來進(jìn)行數(shù)據(jù)增強(qiáng),然后,使用80%的子圖像用于培訓(xùn),剩下的20%用于驗(yàn)證。圖2顯示了從40萬個(gè)子圖像中獲得的40幅圖像。

圖2 子圖像示例

1.2.2 系統(tǒng)設(shè)計(jì)與訓(xùn)練 本研究所使用的CNN結(jié)構(gòu)是基于U-Net網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建的。卷積層的濾波器數(shù)量為32、64、128、64和32。交叉熵用于損失函數(shù),Adam用于學(xué)習(xí)速率優(yōu)化。每個(gè)卷積層以整流線性單元(ReLU)作為激活函數(shù),在兩個(gè)連續(xù)的卷積層之間使用0.2的丟失率來防止模型過度擬合。CNN模型的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)見圖3。

圖3 卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)模型的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)

在GTX 1070 8 G GPU上進(jìn)行120代計(jì)算,并使用4個(gè)小批量補(bǔ)丁,對(duì)迷你U-Net的訓(xùn)練持續(xù)大約15 h后,驗(yàn)證集獲得了最高0.895的交并比(intersection-ofunion,IoU),表明該模型已經(jīng)過訓(xùn)練完成,可以從圖像中提瞼板腺。

預(yù)測(cè)圖像的大小通常>64×64像素,因此研究人員需要將預(yù)測(cè)圖像分成多個(gè)64×64像素的子畫面。最后,將所有子圖的結(jié)果合并,得到最終的預(yù)測(cè)結(jié)果。為了減少預(yù)測(cè)誤差,研究人員使用5個(gè)像素作為水平和垂直步長來預(yù)測(cè)每個(gè)子畫面。這意味著每個(gè)子畫面將產(chǎn)生25個(gè)預(yù)測(cè)結(jié)果,研究人員將這25個(gè)預(yù)測(cè)結(jié)果的平均值作為子畫面的預(yù)測(cè)結(jié)果。

研究人員通過傳統(tǒng)的圖像處理方法對(duì)圖像進(jìn)行預(yù)測(cè),得到預(yù)測(cè)結(jié)果。提取步驟如下:(1)對(duì)圖像進(jìn)行中值濾波;(2)將圖像二值化;(3)在圖像中找到瞼板腺的輪廓。如果兩個(gè)等高線之間的垂直距離很小,則認(rèn)為這些等高線屬于同一個(gè)瞼板腺并且是連接在一起的。提取的瞼板腺在圖4中以灰白色顯示。

圖4 提取的瞼板腺

1.3 評(píng)價(jià)指標(biāo)

1.3.1 瞼板腺功能指標(biāo)

1.3.1.1 眼表疾病指數(shù)(ocular surface disease index,OSDI)[14]所有受試者均接受OSDI問卷和眼部癥狀問卷調(diào)查,并回答是否存在14種MGD相關(guān)的眼部癥狀:眼疲勞、分泌物、異物感、干燥、不適感、黏稠感、疼痛、溢淚、瘙癢、發(fā)紅、沉重感、眩光、過度眨眼和瞼板腺囊腫或瞼腺炎。根據(jù)出現(xiàn)的這些癥狀的數(shù)量,對(duì)癥狀從0~14進(jìn)行評(píng)分,分?jǐn)?shù)越高,說明癥狀越明顯。

1.3.1.2 淚河高度(tear meniscus height,TMH) 使用眼表分析儀測(cè)量淚河高度并進(jìn)行瞼板腺紅外拍照,TMH測(cè)量方法采用眨眼5 s后測(cè)量下眼瞼中央TMH,正常值在0.20 mm左右。

1.3.1.3 淚膜破裂時(shí)間(tear film break-up time,TBUT)和角膜熒光素染色(corneal fluorescein staining,CFS)評(píng)分[13]滴入熒光素后進(jìn)行CFS評(píng)分和TBUT測(cè)定。TBUT測(cè)定3次,取其平均值,正常值為>10 s。CFS評(píng)分標(biāo)準(zhǔn)如下:在5個(gè)區(qū)域(中央、顳、鼻、上、下)評(píng)估角膜熒光素染色(0個(gè)點(diǎn)=0,1~5個(gè)點(diǎn)=1,6~15個(gè)點(diǎn)=2,16~30個(gè)點(diǎn)=3,>30個(gè)點(diǎn)=4);如果發(fā)現(xiàn)融合染色,染料擴(kuò)散到周圍的上皮或基質(zhì),則根據(jù)融合區(qū)域的數(shù)量或角膜絲狀物的存在進(jìn)行評(píng)分(1個(gè)融合區(qū)域,加1分;2個(gè)或2個(gè)以上融合區(qū)域,加2分),染色評(píng)分范圍為0~20分,分?jǐn)?shù)越高,說明角膜上皮損傷越重。

1.3.1.4 瞼緣異常評(píng)分 根據(jù)黏膜交界處前后移位、血管充盈、瞼板腺孔堵塞、眼瞼邊緣不規(guī)則4項(xiàng)參數(shù)對(duì)眼瞼邊緣異常進(jìn)行評(píng)分,每項(xiàng)評(píng)分0~4分,分?jǐn)?shù)越高說明瞼緣異常程度越大。

1.3.1.5 瞼板腺表達(dá)能力評(píng)分[15]評(píng)分標(biāo)準(zhǔn)如下:0分,清亮的瞼脂容易排出;1分,輕微壓力下排出混濁的瞼脂;2分,超過中等壓力下才能排出混濁的瞼脂;3分,即使很大的壓力下也無瞼脂排出。每個(gè)眼瞼瞼板腺表達(dá)能力評(píng)分范圍為0~45分,分?jǐn)?shù)越低說明瞼板腺分泌功能越接近正常。

1.3.1.6 瞼板腺評(píng)分[16]評(píng)分標(biāo)準(zhǔn)如下:0分,無萎縮;1分,萎縮面積<1/3的瞼板總面積;2分,萎縮面積介于1/3~2/3的瞼板總面積;3分,萎縮面積>2/3的瞼板總面積。將上下瞼的瞼板腺評(píng)分相加,得到每只眼睛的瞼板腺評(píng)分范圍為0~6,分?jǐn)?shù)越高,說明瞼板腺萎縮越嚴(yán)重。

1.3.2 瞼板腺形態(tài)指標(biāo) 提取瞼板腺腺體后,計(jì)算腺體的以下指標(biāo)。

(1)瞼板腺密度。計(jì)算每根瞼板腺的面積(Smg)(以像素為單位),然后用每個(gè)瞼板上所有腺體面積總和與瞼板的面積(St)作對(duì)比,公式如下:

(2)平均眼瞼瞼板腺寬度。所有瞼板腺寬度總和除以腺體數(shù)量,包括平均上眼瞼瞼板腺寬度、平均下眼瞼瞼板腺寬度、平均全眼瞼瞼板腺寬度。

(3)平均眼瞼瞼板腺長度。所有瞼板腺長度總和除以腺體數(shù)量,包括平均上眼瞼瞼板腺長度、平均下眼瞼瞼板腺長度、平均全眼瞼瞼板腺長度。

(4)平均眼瞼瞼板腺彎曲度。所有瞼板腺彎曲度總和除以腺體數(shù)量,包括平均上眼瞼瞼板腺彎曲度、平均下眼瞼瞼板腺彎曲度、平均全眼瞼瞼板腺彎曲度。

2 結(jié)果

2.1 兩組受試者瞼板腺功能指標(biāo)比較 與正常組比較,MGD組患者TBUT減少,瞼板腺表達(dá)能力評(píng)分降低,OSDI、瞼緣異常評(píng)分和瞼板腺評(píng)分均升高,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均 P<0.01),見表 1。

表1 兩組受試者瞼板腺功能指標(biāo)比較

2.2 兩組受試者瞼板腺形態(tài)指標(biāo)比較 與正常組比較,MGD患者平均上眼瞼瞼板腺長度、平均下眼瞼瞼板腺長度和平均全眼瞼瞼板腺長度均明顯縮短,上眼瞼瞼板腺密度、下眼瞼瞼板腺密度和全眼瞼瞼板腺密度均明顯減小,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P<0.01)。兩組受試者平均眼瞼瞼板腺寬度和彎曲度比較差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均 P>0.05),見表 2。

表2 兩組受試者瞼板腺形態(tài)指標(biāo)比較

2.3 60例受試者瞼板腺形態(tài)指標(biāo)與功能指標(biāo)的相關(guān)性分析 平均上眼瞼瞼板腺長度與TBUT、瞼板腺表達(dá)能力評(píng)分均呈正相關(guān)(均P<0.05),與OSDI、瞼板腺評(píng)分均呈負(fù)相關(guān)(均P<0.05);平均上眼瞼瞼板腺寬度與瞼緣異常評(píng)分、瞼板腺評(píng)分均呈正相關(guān)(均P<0.05);平均上眼瞼瞼板腺彎曲度與瞼板腺表達(dá)能力評(píng)分呈負(fù)相關(guān)(P<0.05);瞼板腺密度與TBUT、瞼板腺表達(dá)能力評(píng)分均呈正相關(guān)(均P<0.05),與CFS評(píng)分、瞼板腺評(píng)分均呈負(fù)相關(guān)(均P<0.05)。平均下眼瞼瞼板腺長度與TBUT、瞼板腺表達(dá)能力評(píng)分均呈正相關(guān)(均P<0.05),與瞼緣異常評(píng)分、瞼板腺評(píng)分均呈負(fù)相關(guān)(均P<0.05);平均下眼瞼瞼板腺寬度與TBUT呈正相關(guān)(P<0.05),與瞼板腺評(píng)分呈負(fù)相關(guān)(P<0.05);瞼板腺密度與TBUT、瞼板腺表達(dá)能力評(píng)分均呈正相關(guān)(P<0.05),與CFS評(píng)分、瞼板腺評(píng)分均呈負(fù)相關(guān)(均P<0.05)。平均全眼瞼瞼板腺長度與TBUT、瞼板腺表達(dá)能力評(píng)分均呈正相關(guān)(均P<0.05),與 OSDI、瞼板腺評(píng)分均呈負(fù)相關(guān)(均 P<0.05);瞼板腺密度與TBUT、瞼板腺表達(dá)能力評(píng)分均呈正相關(guān)(均 P<0.05),與 OSDI、CFS評(píng)分、瞼緣異常評(píng)分、瞼板腺評(píng)分均呈負(fù)相關(guān)(均P<0.05),見表3。

表3 瞼板腺形態(tài)指標(biāo)與功能指標(biāo)的相關(guān)性分析(r值)

3 討論

本研究介紹了一個(gè)基于CNN的AI系統(tǒng),該系統(tǒng)使用了計(jì)算機(jī)視覺領(lǐng)域的最新技術(shù)[17-18],可以自動(dòng)分析瞼板腺的形態(tài),包括瞼板腺長度、寬度、密度和彎曲度。計(jì)算機(jī)會(huì)在不斷的訓(xùn)練中自動(dòng)提取圖片的高維度特征并建立這些特征與結(jié)果間的內(nèi)在聯(lián)系。這就在一定程度上排除了人為主觀因素可能對(duì)結(jié)果產(chǎn)生的干擾。自動(dòng)獲取瞼板腺腺體并計(jì)算其形態(tài)特征是一個(gè)巨大的挑戰(zhàn),以往的研究對(duì)輸入圖像有嚴(yán)格的要求,如果眼瞼區(qū)域出現(xiàn)皺褶、反光等干擾因素時(shí),會(huì)導(dǎo)致腺體的形狀從規(guī)則的條狀變形為片狀或分散狀,檢測(cè)結(jié)果并不理想[19-20]。為了解決這一問題,本研究的算法對(duì)圖像識(shí)別進(jìn)行了優(yōu)化,并將這些算法與傳統(tǒng)的數(shù)字圖像處理算法(如對(duì)比度調(diào)整、低通濾波、腐蝕、膨脹等)相結(jié)合,提高了相同背景下瞼板腺的識(shí)別率。此外,由于使用了先進(jìn)的圖像分割模型和U-Net系統(tǒng),即使在本研究中受試者人數(shù)較少,檢測(cè)瞼板腺形態(tài)的準(zhǔn)確性也非常高(IoU達(dá)到0.895,重復(fù)率達(dá)到100%)。目前筆者團(tuán)隊(duì)僅使用GTX 1070 8 G GPU已經(jīng)可以在100 ms內(nèi)處理一張圖片,隨著算力的提高,使得數(shù)萬幅圖像在毫秒內(nèi)同時(shí)完成分析成為可能。計(jì)算機(jī)輔助的瞼板腺分析系統(tǒng)可以大大提高分析的準(zhǔn)確性和效率,降低分析的成本,克服人工標(biāo)記主觀上的誤差。瞼板腺形態(tài)的詳細(xì)分析是確定MGD嚴(yán)重程度的重要指標(biāo)[21-22]。本研究比較了正常組和MGD組瞼板腺長度、寬度、彎曲度和密度的差異。結(jié)果顯示,MGD組患者平均瞼板腺長度較正常組明顯縮短,瞼板腺密度也較正常組明顯減小,但兩組平均瞼板腺寬度和彎曲度無明顯差異。MGD患者的瞼板腺分泌物排出阻力增加,瞼板腺腺體的壓力過大,眼表情況的進(jìn)一步惡化,導(dǎo)致瞼板腺病變的加重,瞼板腺長度縮短,并且出現(xiàn)腺體的萎縮,導(dǎo)致瞼板腺密度開始降低。如果病情得不到控制,瞼板腺功能障礙進(jìn)一步加重,瞼板腺密度會(huì)進(jìn)一步降低,直至接近0%。與之前的研究[23-26]相似,本研究中AI系統(tǒng)顯示瞼板腺的腺體長度和密度與癥狀、淚膜穩(wěn)定性、瞼緣異常評(píng)分和瞼板腺表達(dá)能力均相關(guān),說明瞼板腺的腺體長度和密度可以作為計(jì)算機(jī)輔助的MGD診斷的有效指標(biāo)。與以往的研究[5,26-28]不同,本研究采用高性能、高精度的AI系統(tǒng),可以提取每個(gè)腺體并分析其長度、寬度、彎曲度等,每根腺體提取積累后在計(jì)算腺體面積和整個(gè)瞼板面積的比例,精確度較傳統(tǒng)的腺體面積計(jì)算方法大大提高。結(jié)果表明,AI系統(tǒng)能夠準(zhǔn)確地得到瞼板腺的缺失面積,減少了由于分級(jí)過渡區(qū)附近的誤差而導(dǎo)致的分級(jí)系統(tǒng)的不一致性和可變性。如果想要在人工分析中采用筆者團(tuán)隊(duì)的這種瞼板腺分析方法是不現(xiàn)實(shí)的,因?yàn)檫@種分析方法需要大量的人工工作量,不可能作為常規(guī)的評(píng)估指標(biāo),但是AI系統(tǒng)的特點(diǎn)恰恰適合這種需要大量分析工作的任務(wù)。

本研究也有局限性。研究中使用的算法是一種通用算法。如果將該算法進(jìn)一步發(fā)展成為專門針對(duì)瞼板腺圖像的一種特殊算法,則瞼板腺形態(tài)識(shí)別有望獲得更高的準(zhǔn)確率。此外,本研究的樣本量也較小,未來的研究中,筆者團(tuán)隊(duì)將招募更多的受試者來訓(xùn)練和測(cè)試AI系統(tǒng)。

綜上所述,基于CNN的AI系統(tǒng)只需幾十個(gè)訓(xùn)練實(shí)例就可以自動(dòng)檢測(cè)和識(shí)別瞼板腺。它是一個(gè)準(zhǔn)確、高效的瞼板腺形態(tài)學(xué)評(píng)價(jià)系統(tǒng),在臨床上,該系統(tǒng)可以大大提高M(jìn)GD診斷的靈敏度和準(zhǔn)確度,減少觀察者主觀方面導(dǎo)致的誤差,降低醫(yī)務(wù)人員的工作量。在未來的研究中,將通過AI系統(tǒng)得到瞼板腺形態(tài)各項(xiàng)參數(shù),并進(jìn)行一種更加細(xì)致的量化評(píng)分,從而提出一種新的客觀的MGD形態(tài)學(xué)診斷標(biāo)準(zhǔn),這具有非常大的市場前景和臨床意義。

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