陳 衎,唐金艷,馬曉蓉,韓 璐
(1新疆醫(yī)科大學(xué)第四臨床醫(yī)學(xué)院,烏魯木齊 830011;2新疆醫(yī)科大學(xué)第四附屬醫(yī)院婦科,烏魯木齊 830000)
左歸飲由熟地黃、枸杞子、山萸肉、山藥、茯苓、炙甘草6味組成,為純甘壯水之劑,主治真陰不足所致諸癥,臨床上婦科常用其治療早發(fā)性卵巢功能不全(Premature ovarian insufficiency,POI)、絕經(jīng)綜合征(Menopause syndrome,MPS)和閉經(jīng)(Amenorrhea)等[1]。中醫(yī)“異病同治”是中醫(yī)基礎(chǔ)理論的重要組成部分之一,是指不同疾病在其發(fā)生、發(fā)展過程中出現(xiàn)相同病機(jī),故著眼于這一病機(jī),對不同的疾病,采取同一方法治療[2]。由于POI、MPS、閉經(jīng)患者均存在腎陰虛證,具有補(bǔ)陰填精功效的左歸飲在“異病同治”理論基礎(chǔ)上具有一定依據(jù)[3],但其“異病同治”的具體作用機(jī)制尚不明確。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是基于網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘及分析的一種方法,基于現(xiàn)代生物信息技術(shù),通過對藥物、活性成分、作用靶點(diǎn)、疾病間的相互關(guān)系,發(fā)掘及闡述中藥治療相關(guān)疾病的潛在作用機(jī)制,從客觀角度幫助我們進(jìn)行中醫(yī)藥的研究[4]。本研究采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法,基于中醫(yī)“異病同治”的理念,探究左歸飲“異病同治”的作用機(jī)制,現(xiàn)報(bào)道如下。
1.1 左歸飲活性成分及靶點(diǎn)蛋白的預(yù)測利用TC?MSP(http://tcmspw.com/tcmsp.php)數(shù)據(jù)庫,分別搜索熟地黃、枸杞子、山萸肉、山藥、茯苓、炙甘草的主要化學(xué)成分,對比藥物動(dòng)力學(xué)參數(shù)(ADME),將其標(biāo)準(zhǔn)設(shè)定為口服生物利用度(OB)≥30%、類藥性(DL)≥0.18,初步挑選左歸飲的潛在藥物活性化合物,選取具有明確作用靶點(diǎn)的活性成分作為左歸飲候選活性化合物,提取蛋白質(zhì)靶點(diǎn),并通過Uniprot數(shù)據(jù)庫(https://www.uniprot.org/)規(guī)范靶點(diǎn)蛋白名稱。
1.2 疾病相關(guān)靶點(diǎn)的預(yù)測在GeneCards數(shù)據(jù)庫(https://www.genecards.org/)中 以“Premature ovarian insufficiency”、“Menopause syndrome”、“Amenorrhea”分別檢索POI、MPS、閉經(jīng)3種疾病的相關(guān)靶點(diǎn)基因,獲得POI、MPS、閉經(jīng)3種疾病的治療靶點(diǎn)。
1.3 左歸飲及疾病的共有靶點(diǎn)構(gòu)建為明確左歸飲活性成分靶點(diǎn)與POI、MPS、閉經(jīng)疾病靶點(diǎn)間的緊密關(guān)系,將已獲得的左歸飲活性成分靶點(diǎn)與3種疾病的作用靶點(diǎn)經(jīng)由Venn在線工具(http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html)分別取其交集,繪制韋恩圖,獲得四者交集靶點(diǎn)及左歸飲治療各病的交集靶點(diǎn),將四者交集靶點(diǎn)作為左歸飲“異病同治”的共同作用靶點(diǎn)。
1.4 構(gòu)建左歸飲與疾病交集基因的蛋白-蛋白相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)將“異病同治”靶點(diǎn)導(dǎo)入STRING數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org),取最小相互作用閾值“Highest confidence>0.9”,并隱藏游離點(diǎn),并通過Cy?toscape3.7.0軟件進(jìn)行PPI網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建。
1.5 “異病同治”靶點(diǎn)的富集分析為闡明左歸飲治療POI、MPS、閉經(jīng)3種疾病靶點(diǎn)所涉及的細(xì)胞組分(CC)、分子功能(MF)、生物過程(BP)和信號通路中的作用,利用DAVID數(shù)據(jù)庫(https://david.ncifcrf.gov/),將左歸飲“異病同治”靶點(diǎn)進(jìn)行GO分析和KEGG分析,將GO及KEGG分析結(jié)果的P值由小到大排序(P值越小表明富集結(jié)果顯著性越高),并將分析結(jié)果排名前十的GO條目通過微生信在線作圖平臺(tái)(http://www.bioinformatics.com.cn/)進(jìn)行可視化展示。
1.6 構(gòu)建左歸飲“異病同治”活性成分-靶點(diǎn)-關(guān)鍵通路網(wǎng)絡(luò)圖將左歸飲“異病同治”靶點(diǎn)經(jīng)KEGG通路富集分析后的前15條關(guān)鍵通路與左歸飲的活性成分、作用靶點(diǎn)相對應(yīng),通過Cytoscape3.7.0軟件構(gòu)建相關(guān)網(wǎng)絡(luò)圖,直觀地展現(xiàn)左歸飲對這3種疾病的“異病同治”網(wǎng)絡(luò)關(guān)系,預(yù)測出該網(wǎng)絡(luò)中的核心基因,闡述左歸飲治療POI、MPS、閉經(jīng)的潛在作用機(jī)制。
2.1 左歸飲有效活性成分及作用靶點(diǎn)蛋白的篩選結(jié)果通過TCMSP數(shù)據(jù)庫檢索獲得熟地黃活性成分2個(gè),山藥活性成分16個(gè)、枸杞子活性成分45個(gè)、甘草92個(gè)、茯苓15個(gè)、山茱萸20個(gè),合并去重并刪除無明確靶點(diǎn)的活性成分后獲得左歸飲活性成分127個(gè),見表1。通過TCMSP查詢127個(gè)活性成分作用的靶點(diǎn)信息,合并去重后最終預(yù)測出左歸飲的相關(guān)靶點(diǎn)262個(gè)。
表1 左歸飲組成藥物共有的活性物質(zhì)
2.2 疾病靶點(diǎn)的收集結(jié)果通過GeneCards數(shù)據(jù)庫分別檢索POI、MPS、閉經(jīng)的相關(guān)疾病基因,得到POI靶點(diǎn)基因4 873個(gè),MPS靶點(diǎn)基因3 408個(gè),閉經(jīng)靶點(diǎn)基因1 412個(gè),將其與左歸飲化合物對應(yīng)靶點(diǎn)取交集,獲得左歸飲治療POI靶點(diǎn)205個(gè),治療MPS靶點(diǎn)基因178個(gè),治療閉經(jīng)靶點(diǎn)基因70個(gè),將左歸飲治療三者的治療靶點(diǎn)取交集,獲得左歸飲“異病同治”共有靶點(diǎn)66個(gè),見圖1。
圖1 左歸飲治療POI、MPS、閉經(jīng)韋恩圖
2.3 PPI網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建及分析結(jié)果將左歸飲“異病同治”靶點(diǎn)經(jīng)STRING數(shù)據(jù)庫獲取PPI網(wǎng)絡(luò)圖,隱藏游離點(diǎn)后得到共有靶點(diǎn)59個(gè)。通過Cytoscape3.7.0軟件繪制PPI網(wǎng)絡(luò)圖,該網(wǎng)絡(luò)圖含節(jié)點(diǎn)59個(gè),節(jié)點(diǎn)度值越高,顏色越藍(lán),圖像越大,經(jīng)軟件分析可得平均節(jié)點(diǎn)度值為6.203,選取節(jié)點(diǎn)度值最多的前20個(gè)靶點(diǎn)基因作為左歸飲“異病同治”的核心候選基因,并基于STRING數(shù)據(jù)庫選取左歸飲治療POI、MPS、閉經(jīng)的節(jié)點(diǎn)度值排名前20的靶點(diǎn)基因作為左歸飲治療3種疾病的核心候選基因,見表2。
圖2 左歸飲“異病同治”基因PPI網(wǎng)絡(luò)圖
左歸飲“異病同治”核心靶點(diǎn)有TP53、STAT3、TNF、AKT1、IL6等,其中左歸飲治療閉經(jīng)與左歸飲“異病同治”基因的前二十完全相符,說明左歸飲治療POI、MPS基因幾乎包含左歸飲治療閉經(jīng)的靶點(diǎn)基因,提示POI、MPS與閉經(jīng)之間在病因、癥狀、治療上具有一定的趨同性,并為閉經(jīng)是POI、MPS伴隨癥狀提供一定支持,且“異病同治”排名靠前的基因:AKT1、TP53、IL6在左歸飲治療POI疾病靶點(diǎn)中分別位于第1位、第4位、第2位,在左歸飲治療MPS疾病靶點(diǎn)中分別位于第1位、第3位、第2位,說明左歸飲發(fā)揮“異病同治”主要功效的核心基因?yàn)門P53、AKT1和IL6,且左歸飲治療POI、MPS的核心基因數(shù)相同的有19個(gè),其節(jié)點(diǎn)度值排名大致相同,提示左歸飲治療POI與MPS的作用靶點(diǎn)大致相同,兩者在疾病病因、臨床治療趨同性高,這也與指南所說明的兩者在疾病病因、臨床表現(xiàn)、治療方法上的相對一致性相符,見表2。
表2 左歸飲治療POI、MPS、閉經(jīng)靶點(diǎn)及“異病同治”靶點(diǎn)的預(yù)測結(jié)果(排名前20靶點(diǎn)基因)
2.4 “異病同治”靶點(diǎn)的GO分析左歸飲“異病同治”的GO富集分析涉及相關(guān)條目525個(gè),其中BP 413個(gè),CC 45個(gè),MF 67個(gè),選取各自富集程度前10的相關(guān)條目,左歸飲“異病同治”GO富集分析主要涉及藥物反應(yīng)、基因表達(dá)的正調(diào)控、RNA聚合酶II啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄的正調(diào)控、細(xì)胞缺氧反應(yīng)、相同蛋白質(zhì)結(jié)合、酶結(jié)合、類固醇受體活性等,其反應(yīng)主要集中在細(xì)胞外液,見表3。對所選GO分析繪制柱形圖,GO分析圖橫坐標(biāo)分別為GO-BP、GO-CC,GO-MF排名前10條目,縱坐標(biāo)為該對應(yīng)條目對應(yīng)的P值,條形圖越高說明P值越小,富集程度越高,見圖3。
表3 GO富集分析BP、CC、MF前10條目
圖3 左歸飲“異病同治”靶點(diǎn)GO分析圖
2.5 “異病同治”靶點(diǎn)的KEGG分析通過DAVID數(shù)據(jù)庫對左歸飲“異病同治”靶點(diǎn)進(jìn)行KEGG分析,導(dǎo)出分析結(jié)果,從而得到86條KEGG信號通路,將其中P值最小的前15條信號通路作為左歸飲“異病同治”的主要信號通路,見表4。制作富集氣泡圖,圖中P值代表該信號通路的富集程度,P值越小,則富集程度越大,顏色越紅,反之P值越大則富集程度越小,顏色越綠。氣泡的大小代表所富集的基因個(gè)數(shù)。參與左歸飲“異病同治”治療作用的信號通路主要有HIF-1信號通路、乙型肝炎(Hepatitis B)信號通路、FoxO信號通路、癌癥(Cancer)信號通路等。由此可見,左歸飲是通過多靶點(diǎn),多通路來進(jìn)行“異病同治”效果,見圖4。
2.6 左歸飲“異病同治”活性成分-靶點(diǎn)-信號通路網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建結(jié)果將前面得到的左歸飲“異病同治”活性成分、潛在作用靶點(diǎn)及KEGG篩選出來的前15條信號通路一一對應(yīng),制作左歸飲“異病同治”活性成分-靶點(diǎn)-信號通路圖,左歸飲“異病同治”通過多種活性成分作用于多個(gè)靶點(diǎn),經(jīng)不同信號通路發(fā)揮治療作用。主要活性成分包含槲皮素(MOL000098)、山柰酚(MOL000422)、柚皮素(MOL004328)、刺芒柄花素(MOL000392)、甘草查爾酮A(MOL000497)、薯蕷皂素(MOL000546)等,故推測這些物質(zhì)是左歸飲“異病同治”作用的主要活性成分。主要靶點(diǎn)為TP53、STAT3、TNF、AKT1、IL6等,涉及的主要信號通路有HIF-1信號通路、Hepatitis B信號通路、Cancer信號通路、FoxO信號通路等,見圖5。
表4 KEGG富集分析前15信號通路
圖4 KEGG富集分析前15信號通路富集氣泡圖
圖5 左歸飲“異病同治”活性成分-靶點(diǎn)-信號通路網(wǎng)絡(luò)圖
POI、閉經(jīng)、MPS都是婦科常見且難治的內(nèi)分泌疾病,嚴(yán)重影響了女性的生活質(zhì)量及身心健康,且病因都涉及到腎虛[5-7],癥狀及治療方式也相互交叉[8-10]。POI患者癥狀與MPS癥狀大致相同,都有因雌激素下降所導(dǎo)致的月經(jīng)異常、潮熱盜汗、骨質(zhì)疏松等表現(xiàn),而POI患者后期會(huì)導(dǎo)致閉經(jīng)的發(fā)生,且MPS終末期也會(huì)有閉經(jīng)的癥狀,而長時(shí)間的閉經(jīng)也會(huì)增加POI的發(fā)病率,同時(shí)也是MPS的最終轉(zhuǎn)歸。三者的關(guān)系不僅穿插于女性整個(gè)生命周期,并與卵巢功能失衡有關(guān),且在病因病機(jī)、伴隨并發(fā)癥、治療方案等層面有著一定的趨同性[11-12]。左歸丸是中醫(yī)經(jīng)典的補(bǔ)陰填精方劑,臨床上常作為基礎(chǔ)方治療腎陰虛證,具有調(diào)節(jié)卵巢功能、抗氧化、調(diào)節(jié)免疫、延緩衰老等作用[13]。中醫(yī)從整體出發(fā),予以辨證論治,是以“異病同治”之基礎(chǔ),且中藥通過君臣佐使相互配伍,從多靶點(diǎn)、多信號通路實(shí)現(xiàn)藥物之間的協(xié)同治療作用,是其“異病同治”之手段。由于中藥之間“異病同治”的具體作用機(jī)制尚不明確,故采用基于現(xiàn)代生物技術(shù)的數(shù)據(jù)挖掘方法-網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué),來發(fā)現(xiàn)藥物、活性成分、作用靶點(diǎn)、疾病間的相互關(guān)系,來進(jìn)一步挖掘及闡述中藥及中藥復(fù)方治療相關(guān)疾病的潛在作用機(jī)制。
本研究通過對左歸飲活性物質(zhì)的篩選,共篩選出其活性成分127個(gè),主要為類固醇化合物:槲皮素、山柰酚、柚皮素、刺芒柄花素、甘草查爾酮A,薯蕷皂素等,此類化合物對卵巢功能具有一定調(diào)節(jié)作用,可以一定程度治療POI、MPS和閉經(jīng)[14-16]。相關(guān)研究發(fā)現(xiàn),中藥所含類固醇化合物具有擬雌激素樣作用,通過外源性補(bǔ)充此類藥物,可以緩解機(jī)體低雌激素狀態(tài),調(diào)節(jié)內(nèi)分泌功能,維持腎-天癸-沖任-胞宮軸功能的平衡,緩解卵巢衰老,從而促進(jìn)卵巢功能的恢復(fù)[17],并干預(yù)機(jī)體骨質(zhì)代謝,對治療雌激素過低導(dǎo)致的骨質(zhì)疏松有一定的作用[18],這也與西醫(yī)HRT治療因激素紊亂或缺乏所致POI、MPS、閉經(jīng)有著一定的趨同性,并可緩解因激素紊亂或缺乏所導(dǎo)致的如生殖器萎縮[19]、心腦血管疾病[20]、阿爾茲海默病[21]等一系列并發(fā)癥。上述活性成分共涉及相關(guān)靶點(diǎn)262個(gè),主要有TP53、AKT1、STAT3、TNF、IL6等,目前已有相關(guān)研究發(fā)現(xiàn),TP53、AKT1、STAT3、TNF、IL6等靶點(diǎn)參與細(xì)胞生長的調(diào)控[22-25],其正常表達(dá)時(shí)可調(diào)節(jié)卵巢顆粒細(xì)胞的增值分化,維持卵巢正常生理功能,為各級卵泡生長發(fā)育提供合適環(huán)境,延緩卵巢衰老過程,當(dāng)其異常表達(dá)時(shí),會(huì)引起局部氧化應(yīng)激異常,誘導(dǎo)顆粒細(xì)胞自噬及凋亡,引起卵泡閉鎖,導(dǎo)致卵巢功能受損,加速其衰老進(jìn)程,導(dǎo)致卵巢的病理性改變,從而造成POI[26-27],或造成MPS的提前發(fā)生[28],引起閉經(jīng),同時(shí),也對骨質(zhì)疏松疾病的發(fā)生有著直接關(guān)系[29]。故此,我們可以猜測左歸飲是通過調(diào)節(jié)以上靶點(diǎn)起到“異病同治”的作用。
經(jīng)KEGG信號通路分析富集到左歸飲“異病同治”涉及的信號通路主要有HIF-1信號通路、Hepati?tis B信號通路、FoxO信號通路、Cancer信號通路等,其中HIF-1信號通路、Fox O信號通路在POI、MPS、閉經(jīng)三病的研究中均有報(bào)道,且與三者發(fā)生機(jī)制、治療作用研究聯(lián)系緊密。HIF-1是組織細(xì)胞缺氧狀態(tài)下廣泛存在的一種轉(zhuǎn)錄因子,在機(jī)體氧化應(yīng)激過程中起著關(guān)鍵作用。HIF-1信號通路可以特異性表達(dá)于卵巢顆粒細(xì)胞,且與雌激素受體的表達(dá)呈正相關(guān),而雌激素受體主要存在于卵囊泡膜細(xì)胞,這表明HIF-1信號通路可能直接作用于卵巢[30],并通過糾正局部組織缺氧狀態(tài),改善局部氧化應(yīng)激水平,減少卵泡閉鎖,促進(jìn)卵泡的發(fā)育及黃體功能的調(diào)節(jié)[31],維持卵巢功能,防止卵巢早衰[32],并參與骨質(zhì)疏松發(fā)病過程,抑制其過度表達(dá)可以降低相關(guān)骨代謝水平,緩解POI、MPS伴隨的骨質(zhì)疏松癥狀[33],同時(shí),可以降低FSH水平,提高E2含量,恢復(fù)各級卵泡數(shù)[34],在一定程度上改善POI、MPS伴隨的月經(jīng)紊亂及閉經(jīng)。Fox O是PI3K-AKT信號通路下游靶點(diǎn)之一,參與卵巢顆粒細(xì)胞增值、生長分化、凋亡衰老等一系列生命過程的調(diào)控,并與女性生殖功能及月經(jīng)相關(guān)密切[35]。有研究發(fā)現(xiàn),當(dāng)PI3K-AKT信號通路過度激活時(shí),會(huì)引起Fox O的異常表達(dá),使其喪失轉(zhuǎn)錄活性,導(dǎo)致各級卵泡減少和卵巢萎縮,引發(fā)POI[36]。當(dāng)Fox O正常表達(dá)時(shí),可以有效緩解雌激素過低導(dǎo)致的骨質(zhì)疏松癥狀[37],并能調(diào)節(jié)月經(jīng),對POI、MPS、閉經(jīng)三病具有一定程度上的治療效果。
本文著眼于中醫(yī)“異病同治”相關(guān)理論,基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)相關(guān)方法,將現(xiàn)代生物學(xué)信息技術(shù)與傳統(tǒng)中醫(yī)藥理論相結(jié)合,直觀體現(xiàn)了左歸飲“異病同治”作用是通過多成分、多靶點(diǎn)的方式發(fā)揮其功效,初步探討了壽左歸飲“異病同治”的復(fù)雜作用機(jī)制。該研究發(fā)現(xiàn),左歸飲主要通過提高機(jī)體抗氧化能力,抑制細(xì)胞凋亡等發(fā)揮“異病同治”作用,并激發(fā)與卵巢發(fā)育有關(guān)相關(guān)蛋白的表達(dá),發(fā)揮擬雌激素樣作用,刺激原始卵泡和卵母細(xì)胞的生長發(fā)育,從而延緩卵巢衰老,維持其正常生理功能,從而對POI、MPS及閉經(jīng)起到一定治療作用。雖然本研究為左歸飲“異病同治”提供了一定的方向及數(shù)據(jù)支持,但缺乏相關(guān)研究,對于各靶點(diǎn)、信號通路之間關(guān)系的闡述不夠充分。由于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)有其缺陷所在,以此所預(yù)測的核心靶點(diǎn)主要集中在枸杞子、甘草中,并未集中在君藥熟地,可能與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)應(yīng)用指標(biāo)選取及相關(guān)數(shù)據(jù)庫長期未更新有關(guān),且中藥復(fù)方之間化學(xué)成分的復(fù)雜作用機(jī)制尚不明確,故此研究具有一定的局限性,需要學(xué)者們進(jìn)一步的研究發(fā)現(xiàn)。
新疆醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)2021年6期