朱傳華,謝琳,劉安民
膠質(zhì)瘤是神經(jīng)中樞系統(tǒng)最常見的原發(fā)惡性腫瘤,且傳統(tǒng)手術(shù)、化療、放療及目前已有的靶向治療對膠質(zhì)瘤的治療效果不佳。目前對于膠質(zhì)瘤的病因仍不清楚,因此探討其發(fā)病機制對于膠質(zhì)瘤的診療具有重要意義[1]。蛋白二硫鍵異構(gòu)酶家族成員4(protein disulfide isomerase family a member 4,PDIA4)定位于細胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)發(fā)揮功能,參與蛋白質(zhì)折疊、硫醇-二硫鍵交換反應(yīng)和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激反應(yīng)。近些年來越來越多研究表明,PDIA4基因是腫瘤診斷和治療的潛在靶標(biāo)[2],但其在膠質(zhì)瘤發(fā)生發(fā)展中的作用機制不明。本研究利用RNAi技術(shù)沉默PDIA4表達,探索其對膠質(zhì)瘤增殖和凋亡的影響。
人膠質(zhì)瘤細胞系U251、U87、HA1800由中山大學(xué)孫逸仙紀(jì)念醫(yī)院醫(yī)學(xué)研究中心提供。DMEM高糖培養(yǎng)基、胎牛血清、細胞用青霉素/鏈霉素和EDTA胰酶購自美國Gibco公司;星形膠質(zhì)細胞培養(yǎng)基購自ScienCell公司;alarma blue試劑購于Sigma公司;LipofectamineTM3000、BCA蛋白定量試劑盒、ECL化學(xué)發(fā)光試劑盒購自美國Invitrogen公司;RNA-Quick Purification Kit購自上海奕杉生物;cDNA Synthesis SuperMix和SYBR Green Master Mix購自上海翊圣生物;4%多聚甲醛、結(jié)晶紫染液購自上海碧云天生物技術(shù)有限公司;蛋白提取RIPA裂解液購自康為世紀(jì)公司;cleaved-caspase-3、cleavedcaspase-7單克隆抗體、羊抗兔二抗購自CST公司。引物由蘇州泓迅生物科技公司合成,靶向PDIA4的小干擾RNA及陰性對照購自上海吉瑪制藥技術(shù)有限公司,siRNA序列:si-PDIA4#768 5′-GCAAGCGUUCUCCUCCAAUTT-3′,si-PDIA4#1829 5′-GCCUGGUCAUCGCCAAGAUTT-3′,siNC 5′-UUCUCCGAACGUGUCACGUTT-3′。
從CGGA(中國腦膠質(zhì)瘤基因組圖譜計劃)網(wǎng) 站(http://cgga.org.cn/)下 載mRNAseq_693[3]和mRNAseq_325[4]的RNAseq數(shù)據(jù)及相應(yīng)臨床數(shù)據(jù),使用R語言的“sva”和“l(fā)imma”包進行批次校正,應(yīng)用kruskal檢驗分析基因表達量和腫瘤級別的相關(guān)性,利用“survival”和“survminer”u語言包進行生存分析并作圖,基因高表達組和低表達組通過中位值劃分。
將膠質(zhì)瘤細胞U87和U251與正常星形膠質(zhì)細胞HA1800于培養(yǎng)箱(37℃恒溫,5%CO2)中培養(yǎng),U87和U251使用含100 U/mL青霉素和100μg/mL鏈霉素和10%胎牛血清的DMEM高糖培養(yǎng)基,HA1800使用星形膠質(zhì)細胞培養(yǎng)基。每3 d消化傳代一次。
將各組細胞抽提總RNA,按試劑盒說明書逆轉(zhuǎn)錄,獲得的cDNA稀釋10倍后作為模板,以GAPDH為內(nèi)參,按照qPCR試劑說明書指示在BIO-RAD實時熒光定量PCR儀進行qPCR檢測。PCR引物序列:
qPCR反應(yīng)條件:95℃30 s;95℃5 s、60℃30 s,共40個循環(huán)。RT-qPCR的結(jié)果以2-△△Ct表示目的基因mRNA的相對表達量,△△Ct=(處理組Ct靶基因-處理組CtGAPDH)-(陰性對照組Ct靶基因-陰性對照組CtGAPDH)。
將5×104個/孔數(shù)目的細胞接種在6孔板上,待細胞融合度達到70%時,按照轉(zhuǎn)染試劑說明書轉(zhuǎn)染細胞。將未轉(zhuǎn)染細胞、轉(zhuǎn)染siNC、轉(zhuǎn)染siPDIA4 768、轉(zhuǎn)染siPDIA4 1829的細胞分別稱為:空白組、陰性對照組、si#768組和si#1829組。
收集各組轉(zhuǎn)染48 h后的細胞,使用RIPA裂解液冰上裂解15 min,離心后取上清使用BCA試劑盒蛋白定量,校準(zhǔn)蛋白濃度后與蛋白上樣緩沖液混勻于100℃孵育10 min,凝膠電泳后通過電泳轉(zhuǎn)膜至PVDF膜,5%脫脂牛奶封閉1 h,加一抗(1∶1000)于4℃孵育過夜;TBST洗膜后加二抗(1∶5000)室溫孵育1 h,TBST洗膜后用ECL熒光發(fā)光試劑盒顯影,凝膠成像系統(tǒng)拍攝分析,使用Image J軟件分析條帶灰度值。
收集轉(zhuǎn)染8 h后的細胞,以2×103個/孔的細胞密度分別接種于96孔平底細胞培養(yǎng)板中。細胞分別繼續(xù)培養(yǎng)1 d、3 d、5 d后用每孔換alarma blue工作液100μL,37℃細胞培養(yǎng)箱孵育1 h后,在酶標(biāo)儀上檢測吸收波長530 nm,發(fā)射波長590 nm的熒光強度。
收集轉(zhuǎn)染8 h后的細胞,以2×103個/孔的細胞密度分別接種于6孔細胞培養(yǎng)板中,細胞培養(yǎng)14 d后,4%多聚甲醛溶液固定15 min,500μL結(jié)晶紫染液染色15 min,清洗烘干后拍照計數(shù)。
各組細胞轉(zhuǎn)染24 h后換完全培養(yǎng)基培養(yǎng)48 h,收集細胞和上清,PBS重懸后離心收集細胞,用含5μL Annexin V-FITC和10μL PI染料的凋亡染色緩沖液重懸細胞,室溫避光孵育20 min,流式上機檢測FITC和PI通道相應(yīng)的信號值。
以上所有實驗均重復(fù)3次。使用Graphpad Prism 8.0及SPSS 25.0對實驗數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析和圖片繪圖。數(shù)據(jù)用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,組間均數(shù)比較用單因素方差分析,兩組之間比較采用t檢驗,生存分析應(yīng)用Log-rank檢驗。檢驗水準(zhǔn)α=0.05。
PDIA4表達水平在WHOⅡ-Ⅳ級膠質(zhì)瘤中分別為4.37±0.77、4.80±0.83和5.60±0.94,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(F=140.58,P<0.05),kruskal檢驗分析PDIA4表達量和膠質(zhì)瘤級別的具有相關(guān)性(P<0.05)。用LSD-t法進行兩兩比較WHOⅡ級與WHOⅢ級相比、WHOⅢ級與WHOⅣ相比(均P<0.05),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(圖1A)。Kaplan-Meier生存分析PDIA4高表達組5年生存率16.23%,PDIA4低表達組60.20%,Log-rank檢驗(Log-rank=264.32,P<0.001),兩組生存差異有統(tǒng)計學(xué)意義(圖1B)。
圖1 CGGA膠質(zhì)瘤數(shù)據(jù)中PDIA4的表達水平與膠質(zhì)瘤級別和總體生存期的關(guān)系 A:各級別膠質(zhì)瘤PDIA4的表達水平;B:PDIA4高表達和低表達組的總生存曲線
膠質(zhì)瘤細胞株U251和U87相對于正常星形膠質(zhì)細胞株HA1800的2-△△Ct值分別是3.03±0.38和1.87±8.35,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(F=58.44,P<0.05)。多重比較顯示,U251和U87的PDIA4表達水平均高于HA1800(均P<0.05),且U251要高于U87(P<0.05),故選擇U251進行后續(xù)實驗。
相比于空白組和陰性對照組,si#768組和si#1829組細胞PDIA4蛋白表達量降低(F=92.63,P<0.001)(圖2,表1),差異有統(tǒng)計學(xué)意義。多重比較顯示si#768組和si#1829組的PDIA4蛋白表達量均低于空白組和對照組(均P<0.001),且si#768組和si#1829組之間,空白組和陰性對照組之間的差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(均P>0.05)。
圖2 蛋白免疫印記實驗檢測siRNA沉默效果
表1 PDIA4在細胞株中敲降效果驗證(n=3)
si#768組和si#1829組細胞增殖速度均低于空白組和陰性對照組(圖3),第5d各組的熒光強度:空白組(300.00±4.53)、陰性對照組(282.33±2.71)、si#768組(108.67±8.45)、si#1829組(42.00±.0.65)(F=487.59,P<0.01)。多重比較顯示si#768組和si#1829組的熒光強度均低于空白組和對照組(均P<0.01),且空白組和陰性對照組之間的差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),si#768組和si#1829組之間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。
si#768組(158.00±55.15)和si#1829組(110.50±11.92)的克隆集落形成數(shù)目明顯低于空白組(393.00±96.15)和陰性對照組(382.50±82.84)(F=49.34,P<0.05),差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(圖4A,B)。多重比較顯示si#768組和si#1829組的克隆集落形成數(shù)目均低于空白組和對照組(均P<0.001),且si#768組和si#1829組之間,空白組和陰性對照組之間的差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(均P>0.05)。
圖3 阿爾瑪藍實驗檢測各組細胞的增殖水平 與空白組和陰性對照組比較,**P<0.01,***P<0.001)
空白組、陰性對照組、si#768組和si#1829組凋亡率分別為(3.72±7.11)%、(6.53±0.13)%、(7.67±0.11)%、(19.50±9.30)%,si#768組和si#1829組細胞凋亡比例高于空白組和陰性對照組(F=51.06,P<0.05),差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(圖5)。多重比較顯示si#768組和si#1829組的細胞凋亡比例均高于空白組和對照組(均P<0.05),且si#768組和si#1829組之間,空白組和陰性對照組之間的差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(均P>0.05)。
圖4 克隆形成實驗檢測各組細胞克隆形成能力 A:各組細胞克隆集落掃描圖;B:各組細胞克隆形成集落計數(shù)統(tǒng)計圖(mean±SD,n=3,**與空白組和陰性對照組比較,P<0.01,***與空白組和陰性對照組比較,P<0.001)
圖5 流式細胞儀檢測各組細胞的凋亡情況
相比于陰性對照組,si#768組和si#1829組cleaved-caspase 3、cleaved-caspase 7表達量均有升高(圖6,表2),cleaved-caspase 3表達水平差異有統(tǒng)計學(xué)意義(F=19.58,P<0.05),cleaved-caspase7表達水平差異有統(tǒng)計學(xué)意義(F=12.61,P<0.05)。多重比較顯示,si#768組和si#1829組cleaved-caspase 3和cleaved-caspase 7表達水平均高于陰性對照組(均P<0.05),差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
圖6 蛋白免疫印跡實驗檢測各組細胞凋亡相關(guān)蛋白表達情況
表2 不同處理組凋亡相關(guān)蛋白相對表達量(n=3)
本研究分析CGGA數(shù)據(jù)庫,發(fā)現(xiàn)PDIA4表達水平膠質(zhì)瘤級別相關(guān),且其表達水平越高,患者預(yù)后越差,這與先前研究報道的結(jié)果相符[5]。膠質(zhì)瘤的發(fā)生是一個多因素參與的病理過程,因其分子機制多樣性[6],導(dǎo)致治療和預(yù)后不理想。作為在多種腫瘤中均高表達的蛋白,PDIA4能發(fā)揮分子伴侶的功能[7],促進蛋白質(zhì)合成,這恰是腫瘤細胞快速增殖所需要的,提示PDIA4在腫瘤的發(fā)生和發(fā)展中可能具有重要作用。后續(xù)實驗發(fā)現(xiàn)PDIA4在膠質(zhì)瘤細胞中高表達,表明PDIA4可能是膠質(zhì)瘤的特異性分子標(biāo)記物。
進一步研究PDIA4在膠質(zhì)瘤中發(fā)揮的功能,通過siRNA沉默膠質(zhì)瘤細胞的PDIA4表達后,觀察到細胞增殖減慢,Yao等[8]在卵巢癌研究發(fā)現(xiàn)類似的現(xiàn)象,表明PDIA4高表達是膠質(zhì)瘤細胞快速增殖所需要的。有研究證實PDIA4是前列腺癌細胞凋亡的負調(diào)控因子[9],我們的研究發(fā)現(xiàn)沉默PDIA4的膠質(zhì)瘤細胞凋亡比例升高,這提示PDIA4可能也參與了膠質(zhì)瘤細胞凋亡進程。
細胞凋亡是細胞在多種基因調(diào)控下,用于維持細胞穩(wěn)態(tài)的程序性自殺模式[10]。為進一步探索下游機制,檢測發(fā)現(xiàn)實驗組的cleaved-caspase 3、cleavedcaspase 7表達均有升高,而caspase 3和caspase 7是經(jīng)典凋亡通路的觀察指標(biāo),作為細胞凋亡的主要執(zhí)行者,需要通過蛋白水解形成剪切體發(fā)揮功能,啟動細胞凋亡。由此推測,沉默PDIA4可能通過激活caspase通路來促進膠質(zhì)瘤細胞凋亡。
綜上所述,沉默PDIA4可以明顯抑制膠質(zhì)瘤細胞的增殖,促進細胞凋亡,其機制可能是通過激活caspase通路,但是對于否有其他信號通路參與仍需要進行更深入的研究。同時本研究仍存在明顯的不足:首先實驗僅進行了沉默PDIA4,沒有進行過表達實驗,也未在正常膠質(zhì)細胞中進行實驗,難以明確基因基本功能;其次,僅在數(shù)據(jù)庫和細胞水平對該基因進行功能探索,缺少確實的臨床數(shù)據(jù)和動物實驗,未來的研究需要對其進一步的完善。