林裕勝,江錦秀,張靖鵬,游 偉,胡奇林
(福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所,福建 福州 350013)
【研究意義】星狀病毒是重要的傳染病原之一,對人類健康和動(dòng)物養(yǎng)殖業(yè)已構(gòu)成威脅,特別是給養(yǎng)殖業(yè)造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。開展罹病雛鵝新型鵝星狀病毒的分離鑒定,可為新型鵝星狀病毒的致病機(jī)制研究和疫苗研發(fā)積累素材、提供理論參考。【前人研究進(jìn)展】星狀病毒(Astroviruses,AstV)分為哺乳動(dòng)物星狀病毒屬(Mamastrovirus)和禽星狀病毒屬(Avastrovirus),已被證實(shí)的哺乳動(dòng)物星狀病毒屬有19種,禽星狀病毒屬有3種[1?3]。其中禽星狀病毒1型主要為火雞星狀病毒1型(Turkey astrovirus 1, TAstV-1);禽星狀病毒2型包括禽腎炎病毒1型(Avian nephritis virus 1, ANV-1)和腎炎病毒 2型 (Avian nephritis virus 2 ANV-2); 禽星狀病毒3型包括鴨星狀病毒1型(Duck astrovirus 1, DAstV)、火雞星狀病毒2型(Turkey astrovirus,TAstV-2)和一些未經(jīng)分類的星狀病毒[3]。星狀病毒基因組的高度變異使其對環(huán)境和宿主具有很強(qiáng)的適應(yīng)能力,甚至可跨種傳播[4?5]。2017年以來,國內(nèi)多省市爆發(fā)了一種以痛風(fēng)為主要特征的致死性傳染病,5~20日齡雛鵝感染后精神沉郁、食欲減退、消瘦、四肢癱瘓等,死亡率高達(dá)30%,剖檢可見患病鵝內(nèi)臟、翅腿部關(guān)節(jié)及喙部等處出現(xiàn)白色尿酸鹽沉積;經(jīng)病原分離鑒定、動(dòng)物回歸試驗(yàn)以及序列分析,確定為新型鵝星狀病毒(Novel goose astrovirus,GAstV)[6?9]。【本研究切入點(diǎn)】2019年8月,福建省南平市某鵝場雛鵝大量出現(xiàn)關(guān)節(jié)腫脹,剖檢有尿酸鹽沉積的傳染性疾病,在5~20日齡的雛鵝中發(fā)病率高達(dá)40%,死亡率為80%,然而引起該病的病原尚不清楚?!緮M解決的關(guān)鍵問題】為明確其病因,本研究通過采集患病雛鵝的心、肝、脾、肺、腎等組織進(jìn)行PCR檢測和病原分離鑒定,最終確定引起該場發(fā)病的病原為新型鵝星狀病毒,對分離的新型鵝星狀病毒的ORF2部分基因進(jìn)行克隆測序分析,明確其遺傳進(jìn)化規(guī)律,為后續(xù)疫苗研制和開展相關(guān)基礎(chǔ)研究提供重要素材。
3份心肝脾肺腎組織樣品均采自福建省南平市某發(fā)病鵝場,患病鵝臨床癥狀為關(guān)節(jié)腫大,精神沉郁,剖檢可見肝臟、肺臟、腎臟及關(guān)節(jié)腔有嚴(yán)重的尿酸鹽沉積。
健康鵝胚由福建長樂灰鵝保種場提供,該場種鵝所產(chǎn)種蛋、孵出的雛鵝未發(fā)生過痛風(fēng)病,鵝星狀病毒PCR檢測結(jié)果為陰性,鵝星狀病毒抗體檢測結(jié)果為陰性;DH5α感受態(tài)細(xì)胞、TranScript One-Step gDNA Removal and cDNA Synthesis Super Mix反轉(zhuǎn)錄試劑盒、病毒DNA/RNA提取試劑盒購自北京全式金生物技術(shù)有限公司;膠回收試劑盒購自康寧生命科學(xué)(吳江)有限公司;pMD19-T載體、DL2000均購自寶生物工程(大連)有限公司。
無菌采集患病雛鵝心、肝、肺、腎、脾等組織并進(jìn)行細(xì)菌分離,同時(shí)對采集的肝臟、脾臟和腎臟等組織,在生物安全柜內(nèi)用滅菌剪刀剪碎后按照1∶10加 入 無 菌PBS(pH7.4、0.01 mol·L?1)進(jìn) 行 研磨,反復(fù)凍融3次后,3 000 r·min?1離心15 min,上清液0.22 μm濾器過濾后?20 ℃冰箱保存。
根據(jù)GenBank已公布的新型鵝星狀病毒ORF2基因(No: MN399857.1)序列,Oligo 7.9軟件設(shè)計(jì)1對新型鵝星狀病毒特異性檢測引物,引物序列:P1: 5′- AT TACCCATGAAGGCCGAGAGGAAGCTTGAGAAA-3′/P2:5′- GTTCAAGATGCGGCCGAGCTTTTATG GTATCTAT-3′,退火溫度55 ℃,擴(kuò)增片段為383 bp。鵝細(xì)小病毒(Goose parovovirus, GPV)、禽流感病毒(Avian influence virus, AIV)、禽呼腸孤病毒(Avian orthoreovirus, ARV)、新城疫病毒(Newcastle disease virus, NDV)、鵝多瘤病毒(Goose polyoma virus, GPoV)及鵝圓環(huán)病毒(Goose circovirus, GoCV)等鵝常見病毒檢測的引物序列參照參考文獻(xiàn)[10](表1),所有引物均由福州擎科生物工程有限公司合成。
取過濾后的上清液,經(jīng)尿囊膜接種11日齡鵝胚,37 ℃孵育,每天早晚各照胚1次,棄掉24 h內(nèi)死亡鵝胚,連續(xù)觀察7 d,并做好記錄,收集尿囊液和病變明顯的組織臟器。收獲的組織和尿囊液經(jīng)研磨處理后繼續(xù)接種鵝胚,連續(xù)盲傳5次,取3~5代次尿囊液及組織臟器研磨液進(jìn)行后續(xù)檢測。
利用全式金DNARNA試劑盒,按照說明書操作步驟提取組織樣品和研磨液中的DNA和RNA。
應(yīng)用北京全式金生物技術(shù)有限公司商品化反轉(zhuǎn)錄試劑盒將提取的樣本總 RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA,反轉(zhuǎn)錄體系(10 μL):Random Primer 1 μL,RNase-freewater 5.0 μL,TranScript RT/RI Enzyme Mix 1.0 μL,gDNA Remover 1.0 μL,Reaction Mix 10 μL,RNA模板2.0 μL。反應(yīng)程序?yàn)椋?5 ℃ 10 min,42 ℃ 30 min,85 ℃ 5 s,4 ℃終止。
表 1 鵝常見病毒引物Table 1 Primers for common goose viruses
以上述cDNA和DNA為模板,用合成的新型鵝星狀病毒、禽流感病毒、新城疫病毒、呼腸孤病毒、鵝細(xì)小病毒、鵝圓環(huán)病毒及鵝多瘤病毒等引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增檢測[10]。PCR反應(yīng)體系(20 μL):Mix 10 μL,上 游 引 物1.0 μL,下 游 引 物1.0 μL,DNA/cDNA模板2 μL,雙蒸水補(bǔ)足至20 μL。反應(yīng)程序?yàn)椋?5 ℃預(yù)變性 5 min,95 ℃ 變性 30 s,55~60 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,進(jìn)行35個(gè)循環(huán),72 ℃延伸10 min,4 ℃終止反應(yīng)。
將設(shè)計(jì)好ORF2基因引物對1.5中研磨液提取的核酸進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增條件參照1.8中進(jìn)行,退火溫度為55 ℃,擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)膠回收純化試劑盒純化后與pMD19-T載體連接,轉(zhuǎn)化至 DH5α感受態(tài)細(xì)胞中。挑取單個(gè)菌落進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng),經(jīng)菌液PCR鑒定為陽性克隆后,送至福州尚亞生物科技有限公司測序。利用DNAStar.Lasergene.v7.1軟件對測定的ORF2基因序列與GenBank上公布的32株新型鵝星狀病毒株(表2)進(jìn)行相似性對比分析并構(gòu)建遺傳進(jìn)化樹。
除設(shè)計(jì)的新型鵝星狀病毒特異性引物對3份組織研磨液在380 bp左右處有擴(kuò)增條帶外,其余鵝常見病毒病均未擴(kuò)增,圖1中僅展現(xiàn)新型鵝星狀病毒引物擴(kuò)增片段。
為進(jìn)一步明確是否有細(xì)菌感染,對患病雛鵝心臟、肝臟、脾臟、肺臟和腎臟組織進(jìn)行細(xì)菌分離,結(jié)果均未分離到細(xì)菌,排除是由細(xì)菌感染引起的。組織研磨液處理后接種11日齡鵝胚后,7日內(nèi)鵝胚均未出現(xiàn)死亡。第1代至第5代鵝胚均出現(xiàn)全身廣泛性出血點(diǎn)和出現(xiàn)斑,剖檢胚體可見肝臟出血點(diǎn),第3代后鵝胚出現(xiàn)尿囊膜增厚,解剖胚體可見肝臟組織壞死(圖2)。取鵝胚第3代到第5代尿囊液和組織研磨液進(jìn)行鵝常見病毒PCR和RT-PCR擴(kuò)增,結(jié)果顯示,僅有新型鵝星狀病毒在380 bp處有特異性的擴(kuò)增條帶,其他病原未有擴(kuò)增條帶(圖3)。表明分離的毒株為新型鵝星狀病毒。
測序結(jié)果經(jīng)NCBI在線比對分析后,與新型鵝星狀病毒的同源性最高,表明分離株為新型鵝星狀病毒:命名為 FJ-NP 株。將FJ-NP 株ORF2基因擴(kuò)增序列與下載的32株新型鵝星狀病毒進(jìn)行相似性分析和遺傳進(jìn)化分析,相似性結(jié)果顯示FJ-NP株 ORF2基因核苷酸序列與32株參考株的相似性為97.69%~99.74%,其中與黑龍江AstV-Goose-2018-HLJ01和河南(AstVHN02-Goose-1119-18、AstV-AH02-Goose-0715-18、AstVHB02-Goose-0310-19)相似性最高均為99.74%,與北京HN1G株相似性最低為97.4%;遺傳進(jìn)化樹結(jié)果顯示分離株與安徽(GD AHAU2、AHAU3、AHAU5)株、黑龍江AstV-Goose-2018-HLJ01株和河南(AstVHN02-Goose-1119-18、AstV-AH02-Goose-0715-18、AstVHB02-Goose-0310-19、AstV-HN03-Goose-0402-19)株在同一進(jìn)化分支上,與湖北AstV-HBXG-Goose-2019株、北京HN1G株、福建GTF-04株親緣關(guān)系較遠(yuǎn),暗示該流行毒株可能為安徽和河南的變異株(圖4~6)。
表 2 新型鵝星狀病毒參考毒株Table 2 Reference strains for novel goose astrovirus
圖 1 臨床樣品中新型鵝星狀病毒RT-PCR檢測Fig. 1 RT-PCR detection of novel goose astrovirus in clinical samples
圖 2 死亡鵝胚體變化Fig. 2 Pathologic changes in goose embryo
圖 3 分離株新型鵝星狀病毒RT-PCR檢測結(jié)果Fig. 3 RT-PCR result on isolated strain of novel goose astrovirus
圖 4 FJ-NP 株ORF2基因PCR擴(kuò)增圖Fig. 4 RT-PCR amplification of FJ-NP ORF2 genes
圖 5 ORF2部分基因核苷酸同源性比較Fig. 5 Homology of partial ORF2 gene nucleotide
圖 6 ORF2部分基因遺傳進(jìn)化分析Fig. 6 Phylogenetic tree analysis based on partial ORF2 gene
星狀病毒可引起雛鴨腸炎、腹瀉、病毒性肝炎,雞的腸炎,以及降低各種禽類孵化率等,但在鵝群中的感染報(bào)道近幾年才有。Zhang等[6]于2015年在江蘇、安徽、廣東、山東和福建等地采集病料中檢測到星狀病毒,通過病原分離鑒定以及全基因測序證實(shí)分離到的星狀病毒與禽類和人的星狀病毒存在一定差異,結(jié)合其剖檢癥狀以內(nèi)臟和關(guān)節(jié)腔尿酸鹽沉積為主,有別于傳統(tǒng)星狀病毒剖檢特征,故命名為新型鵝星狀病毒。
南平市是福建省養(yǎng)鵝主要地區(qū),近年來多有關(guān)于新型鵝星狀病毒在該地區(qū)發(fā)生的報(bào)道,已成為制約養(yǎng)鵝業(yè)的主要疫病之一。2019年南平市某養(yǎng)鵝場大量雛鵝出現(xiàn)關(guān)節(jié)腫大,剖檢內(nèi)臟和關(guān)節(jié)有大量的尿酸鹽沉積,疑似感染了新型鵝星狀病毒。本團(tuán)隊(duì)通過實(shí)地調(diào)研、臨床癥狀和剖檢病變初步判斷該養(yǎng)鵝場感染了新型鵝星狀病毒感染。通過對采集樣品進(jìn)行病原分離、RT-PCR檢測和克隆測序分析,最終成功分離到了1株新型鵝星狀病毒,命名為FJ-NP。國內(nèi)外的研究結(jié)果顯示引起鵝痛風(fēng)的原因較多,比如高鈣高蛋白飼料引發(fā)機(jī)體蛋白質(zhì)代謝障礙和腎臟損傷,缺水導(dǎo)致的尿酸血癥,以及磺胺類藥物引起的中毒和腎臟損傷等,因此在臨床診斷過程中應(yīng)當(dāng)注意鑒別診斷[11?13]。目前新型鵝星狀病毒的起源、宿主范圍,變異程度,分子發(fā)病機(jī)制和潛在的人畜共患風(fēng)險(xiǎn)等情況仍不清,有待于進(jìn)一步研究。根據(jù)ORF2基因編碼的衣殼蛋白序列,禽星狀病毒可分為3型即禽星狀病毒1、2和3型[14?17]。本研究通過PCR擴(kuò)增獲得了分離株ORF2基因部分序列,隨后進(jìn)行克隆測序,對測序結(jié)果開展遺傳進(jìn)化分析,結(jié)果顯示該分離株ORF2核苷酸序列與GenBank上發(fā)表的32株新型鵝星狀病毒的同源性均在97%以上,且與黑龍江AstV-Goose-2018-HLJ01和河南(AstVHN02-Goose-1119-18、AstV-AH02-Goose-0715-18、AstVHB02-Goose-0310-19)相似性最高均為99.74%,遺傳進(jìn)化樹結(jié)果顯示與安徽(GD AHAU2、AHAU3、AHAU5)株、黑龍江AstV-Goose-2018-HLJ01株和河南(AstV-HN02-Goose-1119-18、AstV-AH02-Goose-0715-18、AstV-HB02-Goose-0310-19、AstV-HN03-Goose-0402-19)株在同一進(jìn)化分支上,與2014年北京HN1G株親緣關(guān)系較遠(yuǎn),表明當(dāng)前流行的新型鵝星狀病毒已發(fā)生變異。
鑒于該病為新發(fā)病,目前對該病的流行病學(xué)及致病機(jī)制等研究尚未深入,同時(shí)疫苗研制仍處于實(shí)驗(yàn)室階段,尚未有商品化疫苗可進(jìn)行預(yù)防。因此,加快疫苗研制和致病機(jī)制的研究對于該病的科學(xué)防控具有重要的作用。本研究為我省在新型鵝星狀病毒相關(guān)工作積累了研究素材,并提供了理論依據(jù)。