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家蠶絲氨酸蛋白酶基因BmSPH33對(duì)BmNPV誘導(dǎo)的免疫響應(yīng)

2021-05-25 08:52:12張永紅邵榆嵐蘇振國(guó)白興榮
關(guān)鍵詞:中腸絲氨酸家蠶

張永紅,邵榆嵐,蘇振國(guó),白興榮

(云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蠶桑蜜蜂研究所,云南 蒙自 661101)

【研究意義】絲氨酸蛋白酶(Serine protease,SP)是一類以絲氨酸為催化中心的蛋白質(zhì)水解酶基因家族,在昆蟲體內(nèi)參與了食物消化、發(fā)育、先天免疫等[1-3]。家蠶絲氨酸蛋白酶基因家族包括BmSP(Bombyxmoriserine protease,BmSP)和同源體BmSPH(Bombyxmoriserine protease homolog,BmSPH)[4],它們是家蠶先天免疫通路中調(diào)控級(jí)聯(lián)的關(guān)鍵酶類[5],所以研究BmSPs基因在家蠶免疫應(yīng)答方面的作用具有重要意義?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】絲氨酸蛋白酶(SPs)普遍存在于生物體中,是一類含有保守催化三聯(lián)殘基His、Asp和Ser的蛋白質(zhì)水解酶[6],它們通常以非酶催化活性的前體存在,其前肽必須被修剪才能激活,趙萍等[7]在家蠶基因組中共鑒定到143個(gè)BmSPs基因,分別標(biāo)記為BmSP1—BmSP143,其中包括51個(gè)BmSPs和94個(gè)BmSPHs。BmSPs基因在家蠶體內(nèi)組織和時(shí)期表達(dá)量不同,進(jìn)而發(fā)揮著不同的功能[8]。已有研究發(fā)現(xiàn)BmSPs基因家族成員中BmSP2作為中腸消化酶,對(duì)家蠶核型多角體病毒(Bombyxmorinucleopolyhedrovirus,BmNPV)具有免疫作用[9],且BmSP25基因在BmNPV的感染誘導(dǎo)下產(chǎn)生了免疫響應(yīng)[10]、BmSP142在家蠶感染BmNPV與BmBDV(Bombyxmoribidensovirus,BmBDV)后均表現(xiàn)為上調(diào)[11],BmSP36與BmSP141參與家蠶的食物消化過程[12-13]、BmSP95在家蠶蛹皮蛻化過程中發(fā)揮著功能[14]。絲氨酸蛋白酶同源物(SPHs)在氨基酸序列上與SPs相似,但由于一個(gè)或多個(gè)催化殘基發(fā)生突變而缺乏酶催化活性[15],但它們參與了前酚氧化酶(proPO)激活系統(tǒng),導(dǎo)致黑色素化。研究發(fā)現(xiàn)家蠶絲氨酸蛋白酶同源體BmSPH-1具有幼蟲-蛹轉(zhuǎn)化、蛹表皮黑色素化和家蠶天然免疫的雙重作用[16]?!颈狙芯壳腥朦c(diǎn)】家蠶絲氨酸蛋白酶BmSPs在家蠶腸道內(nèi)主要參與食物消化,還參與宿主的免疫應(yīng)答過程,至今未見BmSPH33基因?qū)mNPV免疫響應(yīng)機(jī)理方面的報(bào)道?!緮M解決的關(guān)鍵問題】獲得BmSPH33基因序列并結(jié)合其轉(zhuǎn)錄情況,另外家蠶感染BmNPV后該基因表達(dá)模式明確誘導(dǎo)響應(yīng)機(jī)理,為弄清BmSPH33基因在參與家蠶先天免疫方面發(fā)揮作用提供依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 供試材料

供試家蠶品種為大造(P50),純化后的BmNPV病毒粒子由云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蠶桑蜜蜂研究所保存。TaKaRa寶生物工程(大連)有限公司產(chǎn)品:RNAiSo Plus Total RNA提取試劑盒、One Step RNA PCR Kit (AMV)與PrimeScriptTMRT reagent kit with gDNA Eraser反轉(zhuǎn)錄試劑盒、PCR Mixture、SYBR Primix ExTaqTMII (Tli RNaseH Plus) qRT-PCR試劑盒;生工生物工程(上海)股份有限公司產(chǎn)品:PCR引物、瓊脂糖凝膠回收試劑盒等試劑。

1.2 試驗(yàn)方法

1.2.1 家蠶組織樣品收集 家蠶大造(P50)品種幼蟲在27 ℃條件下用新鮮桑葉飼養(yǎng)至5齡第3天,解剖幼蟲并收集頭部、血液、體壁、中腸、脂肪體、絲腺、精巢和卵巢;BmNPV添毒實(shí)驗(yàn)中,正常飼育的5齡起蠶平均分為2組,其中一組按照BmNPV多角體懸浮液5.13×107PIB·mL-1的濃度喂食家蠶10 μl·頭-1;另外一組同樣喂食10 μl ddH2O。兩組家蠶添食后常規(guī)桑葉飼養(yǎng)。在不同時(shí)間4、8、12、24和48 h分別解剖家蠶并收集中腸樣品,其中添食ddH2O家蠶的中腸樣品為對(duì)照。

1.2.2 BmSPH33序列分析 登錄家蠶基因組數(shù)據(jù)庫(kù)SilkwormDB,獲取BmSPH33基因ORF序列,利用生物學(xué)在線軟件對(duì)BmSPH33蛋白的分子量、等電點(diǎn)、信號(hào)肽、蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)、三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè),其中理論等電點(diǎn)與分子量預(yù)測(cè)軟件ExPASy(http://web.expasy.org/)、信號(hào)肽預(yù)測(cè)軟件SignalP v5.0(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)、功能結(jié)構(gòu)域軟件CDD(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi)、二級(jí)結(jié)構(gòu)軟件PSIPRED(http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred/)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)軟件SWISS-MODLE(https://swissmodel.expasy.org/);利用MEGA5.0軟件對(duì)BmSPH33與其它物種SPH33序列生成.fasta與.mega文件,結(jié)合GeneDoc軟件進(jìn)行多序列比對(duì);根據(jù)MEGA5.0 中Neighbor-joining方法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹[17]。

1.2.3 家蠶組織樣品總RNA提取及cDNA合成 利用液氮將家蠶不同組織樣品和不同時(shí)期處理的中腸樣品充分研磨,按照RNAiSo Plus Total RNA提取試劑盒操作步驟抽提RNA,超微量核酸蛋白測(cè)定儀檢測(cè)RNA樣品濃度和純度,將抽提的RNA根據(jù)One Step RNA PCR Kit (AMV)說明反轉(zhuǎn)錄成cDNA。

1.2.4 家蠶不同組織BmSPH33基因轉(zhuǎn)錄情況 設(shè)計(jì)BmSPH33基因RT-PCR引物(表1)。以家蠶肌動(dòng)蛋白基因Bmactin3為內(nèi)參基因,家蠶不同組織cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,反應(yīng)體系為25 μl:10×PCR buffer(Mg2+plus) 2.5 μl,2.5 mmol·L-1dNTPs 2 μl,5 U·μl-1r-Taq聚合酶 0.25 μl,10 μmol·L-1上下游引物 0.5 μl,cDNA模板0.5 μl,ddH2O補(bǔ)齊25 μl;反應(yīng)條件為:94 ℃ 4 min;(94 ℃ 30 s,60 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s)× 30 cycles;72 ℃ 10 min;12 ℃ forever,擴(kuò)增產(chǎn)物用1 %的瓊脂糖凝膠檢測(cè)。

1.2.5 qRT-PCR檢測(cè)BmSPH33基因?qū)mNPV感染的響應(yīng) 利用primer5.0設(shè)計(jì)BmSPH33基因熒光定量特異引物(表 1),以不同時(shí)間段ddH2O與BmNPV處理的家蠶中腸組織cDNA為模板,Bmactin3為內(nèi)參基因進(jìn)行qRT-PCR,參照SYBR Primix ExTaqTMII (Tli RNaseH Plus)試劑盒說明進(jìn)行配制,反應(yīng)體系為20 μl(SYBR Premix ExTaqII 10 μl,ROX Reference Dye 50× 0.4 μl,F(xiàn)/R Primers 0.4 μl,cDNA 1 μl,ddH2O 補(bǔ)齊20 μl),擴(kuò)增程序:95 ℃30 s;(95 ℃ 30s,60 ℃ 30 s)× 40 cycles。ABI StepOnePlus儀器記錄實(shí)驗(yàn)結(jié)果,不同處理的樣品設(shè)置3個(gè)重復(fù),收集基因的Ct值數(shù)據(jù),最后根據(jù)2-△△Ct計(jì)算BmSPH33基因的相對(duì)表達(dá)量[18]。

表1 試驗(yàn)引物Table 1 Research primers

2 結(jié)果與分析

2.1 BmSPH33基因序列生物信息學(xué)分析

對(duì)SilkwormDB公布的BmSPH33基因ORF進(jìn)行序列分析,BmSPH33ORF全長(zhǎng)為840 bp,編碼279個(gè)氨基酸殘基,軟件預(yù)測(cè)無信號(hào)肽序列,為非分泌型蛋白,去除信號(hào)肽后理論分子量大小為22.95 kDa,等電點(diǎn)為5.98。NCBI CDD在線預(yù)測(cè)軟件發(fā)現(xiàn),40~277位氨基酸為類胰蛋白酶絲氨酸蛋白酶結(jié)構(gòu)域(Trysin-like serine protease domain,Tryp_SPc domain)。利用PSIPRED Server在線軟件預(yù)測(cè)BmSPH33蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)(圖1),預(yù)測(cè)結(jié)果發(fā)現(xiàn),BmSPH33蛋白由5個(gè)α螺旋、14個(gè)β折疊和一些無規(guī)則卷曲構(gòu)成;利用SWISS-MODEL軟件預(yù)測(cè)三級(jí)結(jié)構(gòu)(圖2),其二級(jí)結(jié)構(gòu)及三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)特征一致而且以β折疊構(gòu)成為主。

圖1 預(yù)測(cè)的BmSPH33蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)Fig.1 Secondary structure for BmSPH33 protein by server

圖2 預(yù)測(cè)的BmSPH33蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)Fig.2 Tertiary structure of for BmSPH33 protein by server

BmSPH33的氨基酸序列(GenBank登錄號(hào):AK378171.1)與NCBI上登錄的蓓帶夜蛾SPH33(GenBank登錄號(hào):ACR15983.2)進(jìn)行序列比對(duì)。結(jié)果顯示,各序列中均含有類胰蛋白酶絲氨酸蛋白酶結(jié)構(gòu)域(圖3)?;诓煌锓NSPH33蛋白氨基酸序列,利用MEGA5.0軟件,采用鄰接法對(duì)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹(圖4),遺傳進(jìn)化結(jié)果顯示,BmSPH33與蓓帶夜蛾(Mamestraconfigurata)和冬尺蠖蛾(Operophterabrumata)SPH33在親緣關(guān)系上較近,其中不同節(jié)肢動(dòng)物的物種SPH33未聚在同一分支,而植物大葉杜鵑(Danausplexippusplexippus)SPH33與家蠶(Bombyxmori)、蓓帶夜蛾(Mamestraconfigurata)和冬尺蠖蛾(Operophterabrumata)遺傳距離相近。

BmSPH33:家蠶SPH33;MacoSPH33:蓓帶夜蛾SPH33BmSPH33:Bombyx mori SPH33;MacoSPH33:Mamestra configurata SPH33圖3 BmSPH33與MacoSPH33氨基酸序列比對(duì)分析Fig.3 Sequence alignment of amino acid between BmSPH33 and MacoSPH33

圖4 BmSPH33與其同源氨基酸序列進(jìn)化分析Fig.4 Evolution analysis of amino acid between BmSPH33 with other homologues sequence

1:頭;2:血液;3:體壁;4:中腸;5:脂肪體;6:絲腺;7:精巢;8:卵巢1. Head;2: Hemocyte;3: Integument;4: Midgut;5: Fat body;6: Silkgland;7: Testis;8: Ovary圖5 家蠶不同組織BmSPH33基因轉(zhuǎn)錄分析Fig.5 Transcription analysis of BmSPH33 gene in different tissues of Bombyx mori

2.2 BmSPH33基因組織表達(dá)譜分析

利用RT-PCR對(duì)5齡第3天家蠶各組織BmSPH33基因轉(zhuǎn)錄情況進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果發(fā)現(xiàn),BmSPH33在家蠶中腸組織中特異性表達(dá)(圖5)。

2.3 BmNPV感染家蠶后BmSPH33的轉(zhuǎn)錄分析

為探討B(tài)mSPH33基因在家蠶感染BmNPV病毒反應(yīng)中可能的作用,利用實(shí)時(shí)熒光定量qRT-PCR對(duì)對(duì)照組(添食ddH2O)和實(shí)驗(yàn)組(添食BmNPV)BmSPH33基因表達(dá)情況進(jìn)行檢測(cè),確定BmSPH33基因轉(zhuǎn)錄水平是否發(fā)生變化。定量結(jié)果發(fā)現(xiàn)家蠶在感染BmNPV后BmSPH33基因發(fā)生響應(yīng)(圖6),在感染BmNPV 4 h后BmSPH33基因轉(zhuǎn)錄水平升高,而感染8、12、24、48 h時(shí)呈現(xiàn)下調(diào),這說明家蠶在感染BmNPV后產(chǎn)生了應(yīng)激響應(yīng),其中BmSPH33基因mRNA轉(zhuǎn)錄水平發(fā)生變化。BmSPH33基因mRNA轉(zhuǎn)錄反應(yīng)受到BmNPV病毒的誘導(dǎo),提示BmSPH33基因在大造(P50)家蠶品種的抗病毒作用中發(fā)揮功能。

圖6 BmNPV對(duì)BmSPH33基因轉(zhuǎn)錄水平的影響Fig.6 Effects of BmNPV inoculation on transcriptional level of BmSPH33 gene

3 討 論

絲氨酸蛋白酶SPs參與了昆蟲的消化、發(fā)育和免疫應(yīng)答,是一類重要的蛋白水解酶。研究BmSPH33與MacoSPH33氨基酸序列比對(duì)發(fā)現(xiàn),它們含有保守的Trypsin-like serine protease的結(jié)構(gòu)域,類胰蛋白酶絲氨酸蛋白酶是一種Clip結(jié)構(gòu)域絲氨酸蛋白酶,被認(rèn)為能參與昆蟲先天免疫的蛋白酶[19-20],其結(jié)構(gòu)含有保守的TAAHC、DIAL和GDSGGP特征基序。昆蟲經(jīng)過絲氨酸蛋白酶等一些酶級(jí)聯(lián)反應(yīng)能將非活化前體酚氧化酶酶原(prophenoloxidase,proPO)催化形成活性的酚氧化酶原(Phenoloxidase,PO),PO能把酚類氧化成醌類物質(zhì),通過生成黑色素沉積在病原物表面,進(jìn)而黑化和包裹作用消滅病原微生物[21]。SPs蛋白通過剪切羧基端的一些特殊氨基酸而活化proPO[5]。

DNA microarray研究發(fā)現(xiàn)64個(gè)表達(dá)的SPs和SPHs基因中有38個(gè)基因中腸轉(zhuǎn)錄,其中大部分在中腸表達(dá),一些中腸SPHs基因可能由于缺少活性位點(diǎn)殘基而處于非活動(dòng)狀態(tài),但在其它鱗翅目昆蟲中也發(fā)現(xiàn)了表達(dá)[22],而且SPH1和SPH2還參與煙草天蛾的proPO活化過程[23];家蠶BmSPH1證實(shí)了還參與家蠶的免疫響應(yīng)[16, 24]。家蠶中腸是消化桑葉并吸收營(yíng)養(yǎng)的重要場(chǎng)所,BmNPV病毒粒子隨著食物進(jìn)入中腸,它作為防御病毒入侵的第一道屏障,BmSPH33基因在家蠶中腸組織中特異表達(dá)(圖5),研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),BmSPH33基因轉(zhuǎn)錄水平在感染4 h時(shí)上調(diào),其余時(shí)間點(diǎn)(8、12、24和48 h)下調(diào),基因轉(zhuǎn)錄水平發(fā)生變化,表明BmSPH33基因表達(dá)受BmNPV誘導(dǎo)而參與家蠶幼蟲免疫應(yīng)答過程。

絲氨酸蛋白酶在真核細(xì)胞和原核生物中是高度保守和普遍存在的,它們已經(jīng)進(jìn)化成一個(gè)豐富而功能多樣的酶群。絲氨酸蛋白酶是一類主要的消化蛋白酶,占鱗翅目昆蟲消化活性的95 %[25],由于BmSPH33與其BmSPs成員具有Tryp_SPc domain,昆蟲絲氨酸蛋白酶家族作為絲氨酸為活性中心的典型蛋白質(zhì)水解酶,結(jié)合其中腸特異表達(dá),說明該蛋白主要參與食物消化,家蠶感染BmNPV后基因轉(zhuǎn)錄水平發(fā)生變化,推測(cè)該基因在家蠶免疫方面起到了輔助作用,但具體功能還有待進(jìn)一步驗(yàn)證。

4 結(jié) 論

BmSPH33基因在家蠶中腸組織中特異表達(dá),且在家蠶感染BmNPV后發(fā)生響應(yīng),推測(cè)該基因參與家蠶免疫應(yīng)答過程,結(jié)合BmSPH33含有高度保守的胰蛋白酶樣的底物基序,為弄清絲氨酸蛋白酶同源體BmSPHs在消化及免疫應(yīng)答方面的機(jī)制提供參考。

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