沈 俊,陳 瑩,王 鑫,張林艷,顧 兵,裴 兵,楊 歡
1徐州醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)技術(shù)學(xué)院,江蘇 徐州 221004;2蘇州工業(yè)園區(qū)疾病防治中心,江蘇 蘇州 215100;3羅氏診斷產(chǎn)品(上海)有限公司專(zhuān)業(yè)和分子診斷部,上海 200131;4宿遷市第一人民醫(yī)院臨床檢驗(yàn)科,江蘇 宿遷 223800
隨著醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)的發(fā)展,臨床醫(yī)學(xué)實(shí)踐中各種疾病的早期診斷對(duì)體外診斷技術(shù)的靈敏度、檢測(cè)限、檢測(cè)速度等性能指標(biāo)提出了越來(lái)越高的要求,這使得許多傳統(tǒng)的、常規(guī)的體外診斷技術(shù)逐漸不能滿足疾病診斷的需要。同時(shí),隨著“一帶一路”建設(shè)的展開(kāi)和對(duì)外開(kāi)放的進(jìn)一步加深,我國(guó)防控輸入性疾?。?]和對(duì)外醫(yī)療援助[2]的難度與需求也空前增高,不同的應(yīng)用環(huán)境也對(duì)實(shí)驗(yàn)診斷技術(shù)的分析速度、檢測(cè)成本、操作難度等提出了各種各樣的要求。近年來(lái),隨著納米技術(shù)的發(fā)展,納米材料在體外診斷領(lǐng)域的應(yīng)用也引起了越來(lái)越多的關(guān)注和研究。這些基于納米材料的檢測(cè)技術(shù)常常具有高靈敏度、高特異度、檢測(cè)速度快等特點(diǎn),因而在早期診斷、快速診斷、及時(shí)檢驗(yàn)(point-of-care testing,POCT)等方面具有極大的潛力。此前,李萬(wàn)萬(wàn)等[3]和張?zhí)K琳等[4]分別對(duì)基于納米材料的體外診斷技術(shù)進(jìn)行了介紹,其中前者側(cè)重對(duì)納米材料的介紹;后者側(cè)重于醫(yī)學(xué)研究。本文將對(duì)應(yīng)用于臨床檢驗(yàn)與診斷領(lǐng)域的常見(jiàn)納米材料,以及近年來(lái)基于納米材料的蛋白、核酸檢測(cè)技術(shù)等方面的最新研究進(jìn)展作一綜述。
納米材料是指在三維空間中至少有一維處于納米尺寸(0.1~100 nm),或由它們作為基本單元構(gòu)成的材料,具有獨(dú)特的磁性、光學(xué)、熱力學(xué)性質(zhì)等尺寸依賴性理化性質(zhì)。隨著納米技術(shù)的發(fā)展,納米材料在體外診斷領(lǐng)域的應(yīng)用也引起了越來(lái)越多的關(guān)注。在表面修飾抗體、探針或其他生物識(shí)別元件后,可使納米材料在自身特性的基礎(chǔ)上獲得對(duì)特定檢測(cè)對(duì)象的靶向性。在眾多納米材料中,磁性納米粒(magnetic nanoparticle,MNP)、量子點(diǎn)(guantum dot,QD)和納米金粒子(gold nanoparticles,AuNP)在體外診斷領(lǐng)域的研究較為常見(jiàn)。
MNP是一種具有超順磁性的納米材料,即當(dāng)外磁場(chǎng)存在時(shí),MNP具有磁性,而當(dāng)外磁場(chǎng)撤離時(shí)磁性消失。在MNP上連接單克隆抗體、核酸探針等,靶向捕獲目標(biāo)物質(zhì)后,通過(guò)外加磁場(chǎng),使目標(biāo)物質(zhì)被吸附而滯留于磁場(chǎng)中,而使其他物質(zhì)被分離。通過(guò)這種磁分離技術(shù),可達(dá)到在短時(shí)間內(nèi)完成分離和富集的目的,從而提高檢出率。張俊仙等[5]用抗酸染色、普通PCR和磁納米捕獲-PCR方法檢測(cè)確診肺結(jié)核病患者痰標(biāo)本中的結(jié)核分枝桿菌,結(jié)果顯示由于結(jié)核分枝桿菌得到濃縮、聚集和純化,除去了不利于PCR擴(kuò)增的抑制因子,磁納米捕獲-PCR技術(shù)的檢測(cè)陽(yáng)性率遠(yuǎn)高于抗酸染色檢查(27.0%)和普通PCR檢測(cè)(47.4%),達(dá)到了82.9%。此外,徐源[6]、黃偉等[7]團(tuán)隊(duì)也利用MNP的富集純化能力,分別構(gòu)建了對(duì)外周血循環(huán)腫瘤細(xì)胞(circulating tumor cells,CTC)和手足口病腸道病毒的檢測(cè)方法,均具有較為可靠的診斷性能。
熒光標(biāo)記技術(shù)是指將能發(fā)射熒光的物質(zhì)通過(guò)共價(jià)結(jié)合或物理吸附等方式標(biāo)記于所研究分子的某個(gè)基團(tuán)上,用它的熒光特性來(lái)反映研究對(duì)象的信息。面世以來(lái),熒光標(biāo)記技術(shù)以其獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)和特性在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域獲得了極為廣泛的應(yīng)用。目前常用的傳統(tǒng)熒光染料主要有熒光素染料、羅丹明類(lèi)染料、菁染料等,在不同的檢測(cè)方法中發(fā)揮著重要作用[8],但與此同時(shí),這些染料也存在著光淬滅率高、對(duì)pH值敏感、發(fā)射光譜寬等問(wèn)題。
QD 又稱(chēng)膠體半導(dǎo)體納米晶,是一種具有獨(dú)特光物理性質(zhì)的半導(dǎo)體納米晶,自20 世紀(jì)80 年代發(fā)現(xiàn)以來(lái),迅速成為納米科學(xué)和納米技術(shù)的前沿[9]。QD 具有抗光漂白性強(qiáng)、激發(fā)光譜寬、發(fā)射光譜窄、不易化學(xué)降解、熒光壽命長(zhǎng)、發(fā)射光的顏色隨粒徑變化等特點(diǎn)[10],可突破傳統(tǒng)染料的局限性,實(shí)現(xiàn)在同一激發(fā)波長(zhǎng)下對(duì)不同物質(zhì)的檢測(cè)。QD 可用于檢測(cè)各種抗原物質(zhì)、病原體和生物分子,也可用于對(duì)組織、細(xì)胞進(jìn)行免疫標(biāo)記等[11],在分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、藥物篩選、生物大分子相互作用等研究中有極大的應(yīng)用前景[12]。
Suzuki 等[10]用QD 和抗體開(kāi)發(fā)了一種量子點(diǎn)連接免疫吸附法(QLISA),并基于這種方法建立了一種微量IL-6的檢測(cè)方法,可用于0.05 ng/mL 級(jí)別IL-6的檢測(cè)。Zhou等[13]對(duì)一種基于QD的高靈敏度肌鈣蛋白的檢測(cè)方法進(jìn)行了評(píng)估,該方法將1~2 h 的檢測(cè)時(shí)長(zhǎng)縮短至12 min,且使用全血標(biāo)本,保證了對(duì)急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)較高的診斷效率,更適用于POCT的檢測(cè)和快速診斷。
AuNP 作為人類(lèi)最早認(rèn)識(shí)并應(yīng)用的納米材料之一,在整個(gè)納米材料研究領(lǐng)域中占據(jù)著重要地位。AuNP具有易于表面修飾、較高的生物相容性、獨(dú)特的光學(xué)特性等特點(diǎn)[14],應(yīng)用于諸多體外診斷的檢測(cè)體系中,如在生物條形碼技術(shù)(bio-barcode assay,BCA)中,利用AuNP 比表面積大、易于表面修飾等特性,在AuNP上修飾了大量單鏈DNA,這是實(shí)現(xiàn)該技術(shù)“信號(hào)擴(kuò)增”的關(guān)鍵[15-16];借助AuNP的納米材料表面能量轉(zhuǎn)移(nanometal surface energy transfer,NSET)特性,Yuan等[17]構(gòu)建了一種能對(duì)尿液標(biāo)本中精胺進(jìn)行痕量檢測(cè)的方法,證明了其能成為有機(jī)染料猝滅劑的替代品,可以為各種生物分析物構(gòu)建可激活探針;此外,也有研究者發(fā)現(xiàn),在PCR反應(yīng)體系中加入適量的AuNP,可減少引物和單鏈DNA 模板之間的錯(cuò)配,提高PCR反應(yīng)的特異性[18]。
鄰位連接技術(shù)(proximity ligation assay,PLA)是一種將蛋白定量檢測(cè)轉(zhuǎn)化為核酸定量檢測(cè)的技術(shù),是用于檢測(cè)目標(biāo)蛋白或蛋白之間相互作用的特殊免疫分析方法。在PLA技術(shù)中,一對(duì)可識(shí)別目標(biāo)蛋白不同抗原表位的抗體通過(guò)共價(jià)交聯(lián)或者生物素-親和素分別與一條寡核苷酸探針(單鏈DNA)相連。這對(duì)抗體結(jié)合在目標(biāo)蛋白的相鄰表位后,加入一段可分別與前述兩個(gè)探針互補(bǔ)的寡聚脫氧核苷酸(connector oligonucleotides),在連接酶的作用下,3段單鏈DNA形成的雜交分子被連接形成一條新的DNA片段,隨即通過(guò)熒光定量PCR技術(shù)對(duì)DNA進(jìn)行定量,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)蛋白的定量檢測(cè)[19]。2007年,Schallmeiner 等[20]報(bào)道了一種3PLA 技術(shù),提升了敏感性和檢測(cè)范圍;之后在2013 年,Nong 等[21]介紹了一種具有高特異性、樣本量變化范圍廣(從幾微升到幾毫升)的固相PLA技術(shù)?;诩{米材料的鄰位連接技術(shù)(nanoparticle-based proximity ligation assay,NP-PLA)是由Chen等[22]在PLA及其衍生技術(shù)基礎(chǔ)上開(kāi)發(fā)的超靈敏檢測(cè)技術(shù)。Chen等[22]在PLA中引入納米粒子,不再將核酸探針與抗體耦聯(lián),而是將納米粒子耦聯(lián)在抗體上后,將生物素化的核酸探針結(jié)合在納米粒子表面空余的親和素位點(diǎn)上,由此,NP-PLA 兼具了3PLA 和固相PLA 的優(yōu)點(diǎn)。隨后,Chen 等[22]使用這一技術(shù)完成了對(duì)人絨毛膜促性腺激素(human chorionic gonadotropin,hCG)的檢測(cè)和定量,其檢測(cè)限低至2.6 fmol/L,幾乎是ELISA 技術(shù)的1 000倍。
AuNP 是一種無(wú)毒、易于表面修飾、具有較高生物相容性和獨(dú)特光學(xué)特性的納米材料[14]。AuNP 由于其局部表面等離子共振(surface plasmon resonance,SPR)、表面增強(qiáng)拉曼散射(surface enhancement of Raman scattering,SERS)和熒光共振能量轉(zhuǎn)移(F?rster resonance energy transfer,F(xiàn)RET)等獨(dú)特的物理和光學(xué)性質(zhì)被應(yīng)用于諸多領(lǐng)域[23]。在此討論AuNP在蛋白質(zhì)檢測(cè)中的應(yīng)用。
金納米簇(gold nanoclusters,AuNC)是一種小于2 nm 的新型熒光材料,由2~100 個(gè)金原子組成。根據(jù)組成和大小的不同,AuNC 的發(fā)射光譜可在紫外區(qū)到近紅外區(qū)改變,利用AuNC的這一特性,可選擇背景干擾小的波長(zhǎng)[23]。由于AuNC 易于聚集,因此適當(dāng)?shù)呐潴w對(duì)于穩(wěn)定其熒光和大小必不可少,常用的配體有牛血清白蛋白(bovine serum albumin,BSA)等[24-25]。將AuNC 作為熒光基團(tuán),選用某種特定的物質(zhì)作為淬滅基團(tuán),通過(guò)FERT 淬滅其熒光;當(dāng)兩者形成的這一體系遇到目標(biāo)物質(zhì)時(shí),AuNC 與淬滅基團(tuán)分離,淬滅作用消失而使熒光恢復(fù),以實(shí)現(xiàn)目標(biāo)物質(zhì)的檢測(cè)(圖1)[24-27]。根據(jù)AuNC 的這種性質(zhì),Xu 等[24]設(shè)計(jì)并制備了一種基于AuNC 和AuNP 的新型熒光探針,用于尿液L-半胱氨酸的檢測(cè)。Menon 等[25]使用BSA-AuNC 標(biāo)記胰島素抗體,構(gòu)建了一種檢出限為1.1×10-10g/mL 的胰島素檢測(cè)方法。
圖1 基于AuNC的檢測(cè)技術(shù)模式圖Figure 1 Basic principles of protein detection using AuNC
NSET 是一種類(lèi)似于FRET 的現(xiàn)象。AuNP 已被證明是一種高效的能量受體,當(dāng)AuNP 和熒光基團(tuán)接近到一定范圍時(shí),熒光基團(tuán)的能量即轉(zhuǎn)移至AuNP 表面,發(fā)生熒光淬滅。兩者不同之處在于FRET 有著嚴(yán)格的距離(100?,1?=10-10m)和方向限制,而NSET的偶極-納米表面?zhèn)鬟f距離可以在更長(zhǎng)的距離上具有更高的淬滅效率,因此,AuNP有機(jī)會(huì)成為有機(jī)染料猝滅劑的替代品,為各種生物分析物構(gòu)建可激活的探針[17,23]。Yuan等[17]利用金納米棒、四羧基苯基卟啉和小牛胸腺DNA(ctDNA)的相互作用開(kāi)發(fā)了一種基于NSET的惡性腫瘤生物標(biāo)志物精胺的檢測(cè)方法,實(shí)現(xiàn)了對(duì)尿液標(biāo)本中精胺的痕量檢測(cè)[17]。
在科學(xué)研究和許多疾病的早期診斷和治療中,實(shí)現(xiàn)檢測(cè)超低水平的蛋白質(zhì)標(biāo)志物至關(guān)重要。在這些方法中,NP-PLA 和BCA[15](在后文中詳細(xì)介紹)將不可擴(kuò)增的蛋白質(zhì)檢測(cè)轉(zhuǎn)化為核酸檢測(cè),實(shí)現(xiàn)了蛋白質(zhì)的高靈敏度檢測(cè)。根據(jù)反應(yīng)體系中所用的抗體不同,NP-PLA 和BCA 的檢測(cè)對(duì)象非常廣泛,但同時(shí)意味著其特異性受所用抗體特異性的影響;AuNP 作標(biāo)記物的蛋白檢測(cè)技術(shù),利用AuNP 的FERT或NSET特性,構(gòu)建了類(lèi)似于實(shí)時(shí)熒光PCR中熒光探針的熒光信號(hào)系統(tǒng),并以一定線性范圍內(nèi)熒光強(qiáng)度的增量[24-25]或減量[17]反映物質(zhì)間的相互作用,從而實(shí)現(xiàn)了超低水平的蛋白質(zhì)檢測(cè)。
納米層析試紙條是一類(lèi)基于橫向流動(dòng)檢測(cè)(lateral flow assay,LFA)可用于對(duì)PCR 擴(kuò)增[28-29]、雜交鏈反應(yīng)(hybridization chain reaction,HCR)[30]、環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)[31]等擴(kuò)增獲得的核酸產(chǎn)物進(jìn)行快速驗(yàn)證的裝置。相比傳統(tǒng)的電泳、成像等方法,使用基于納米層析試紙條的納米層析技術(shù)對(duì)核酸產(chǎn)物進(jìn)行驗(yàn)證不需要昂貴的儀器,操作簡(jiǎn)便,且具有耗時(shí)短、特異性強(qiáng)等優(yōu)點(diǎn),適合在設(shè)備條件有限的地區(qū)應(yīng)用,同時(shí)也可以滿足POCT的需求[31-32]。
Ying 等[30]使用納米層析試紙條檢測(cè)通過(guò)雜交鏈反應(yīng)獲得的擴(kuò)增產(chǎn)物復(fù)合體,開(kāi)發(fā)了一種針對(duì)沙門(mén)菌屬16S rRNA 的可視化檢測(cè)方法(圖2),其檢測(cè)限為3×103CFU/mL。
圖2 納米層析試紙條[30]Figure 2 lateral flow nucleic acid test strips[30]
自聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR 技術(shù))出現(xiàn)以來(lái),人類(lèi)對(duì)DNA 和RNA 的檢測(cè)和分析能力不斷進(jìn)步,現(xiàn)已成為診斷疾病的一項(xiàng)重要手段。PCR 技術(shù)是現(xiàn)代生物學(xué)和體外診斷領(lǐng)域中最基本且最受歡迎的技術(shù)之一,可將極微量的DNA 擴(kuò)增數(shù)百萬(wàn)倍,使其達(dá)到可檢測(cè)的水平,被廣泛應(yīng)用于諸多領(lǐng)域。自該技術(shù)誕生以來(lái),大量研究人員從試劑、儀器和PCR 程序?qū)用鎸?duì)其進(jìn)行了改進(jìn)和優(yōu)化,大大提高了擴(kuò)增效率,并逐漸發(fā)展出巢式PCR、多重PCR、RT-PCR、熒光定量PCR、數(shù)字PCR 等適用于不同目的、高靈敏度的方法[33]。但與敏感性的提高相比,PCR 技術(shù)的特異性仍未達(dá)到標(biāo)準(zhǔn),并在對(duì)富含GC片段、DNA長(zhǎng)片段擴(kuò)增分析中存在一定問(wèn)題[18],盡管人們發(fā)現(xiàn)在PCR體系中加入如二甲基亞砜[34]、BSA[34]、單鏈結(jié)合蛋白(single strand DNA-binding protein,SSB)[35]等作為增強(qiáng)劑(enhencer)可促進(jìn)PCR 擴(kuò)增,但總體效果仍不甚理想。
隨著納米技術(shù)在生命科學(xué)領(lǐng)域的逐步滲透,納米材料輔助PCR(nanoPCR)技術(shù)受到了廣泛關(guān)注?,F(xiàn)有研究表明,納米粒子在PCR反應(yīng)體系中的作用主要體現(xiàn)在3個(gè)方面。①與DNA 分子結(jié)合:納米粒子(如AuNP、碳納米管等)可與單鏈DNA結(jié)合,從而減少引物和單鏈DNA模板之間的錯(cuò)配。此外,一些納米粒子也可以促進(jìn)PCR 反應(yīng)過(guò)程中DNA 模板的雙鏈解離,降低解鏈溫度[18,36-37]。②與DNA 聚合酶相互作用:一些納米粒子可增強(qiáng)DNA 聚合酶的活性,但過(guò)高濃度的納米粒子會(huì)對(duì)DNA聚合酶產(chǎn)生抑制作用,這種抑制作用在一定程度上可以通過(guò)增加DNA聚合酶使用量來(lái)抵消[18,37]。③納米粒子具有優(yōu)良的熱傳導(dǎo)性,可使PCR反應(yīng)體系更快地達(dá)到設(shè)定溫度,提高擴(kuò)增效率,并使引物和模板之間更高效地配對(duì)[18,36]。
有研究報(bào)道了一種對(duì)食腦阿米巴原蟲(chóng)的NanoPCR 檢測(cè)方法,他們將石墨烯氧化物、氧化銅和氧化鋁3種納米材料加入普通PCR體系中,實(shí)現(xiàn)了對(duì)幾種阿米巴的快速診斷,且核酸擴(kuò)增產(chǎn)物的電泳條帶灰度值為不加納米粒子對(duì)照組的1.25~2倍,可見(jiàn)其擴(kuò)增產(chǎn)率增加[36]。Yang 等[37]在PCR 體系中加入不同濃度的AuNP,分別使用Pfu聚合酶和Taq聚合酶成功擴(kuò)增了富含鳥(niǎo)嘌呤(G)和胞嘧啶(C)的片段,為基因組中富GC片段的擴(kuò)增提供了一種可行的方法。
上世紀(jì)70年代中期,以雙脫氧鏈終止法(Sanger法)[39]為代表的第1 代測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn)開(kāi)啟了人類(lèi)對(duì)基因組探索的歷程。1990—2003 年的人類(lèi)基因組計(jì)劃(human genome project,HGP)直接推動(dòng)了測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,此后,測(cè)序技術(shù)發(fā)展迅猛,第2代、第3代測(cè)序技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生。
納米孔是一種納米大小的孔,由生物分子自組裝或在固體基質(zhì)上進(jìn)行物理鉆孔形成,可分為生物納米孔、固態(tài)納米孔以及由兩者結(jié)合而成的復(fù)合納米孔3類(lèi)。納米孔測(cè)序的基本原理是將電流應(yīng)用于納米級(jí)的分子孔,然后使遺傳物質(zhì)從中通過(guò),由于構(gòu)成遺傳物質(zhì)的堿基的分子結(jié)構(gòu)和體積存在差異,不同堿基穿過(guò)納米孔時(shí)引起不同的電流變化,由此即可得出所測(cè)DNA 或RNA 的序列信息(圖3)[40-41]。作為一種高通量、高讀長(zhǎng)、實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)輸出[42]的單分子測(cè)序技術(shù),納米孔測(cè)序技術(shù)被認(rèn)為是第3 代測(cè)序技術(shù)的一個(gè)重要發(fā)展方向。此外,納米孔測(cè)序技術(shù)還因具有無(wú)需各種酶的參與、無(wú)需生物分子修飾標(biāo)記或表面固定化技術(shù)、低成本等優(yōu)勢(shì)[40],而在美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院(National Institutes of Health,NIH)的“1 000美元基因組計(jì)劃”中脫穎而出。目前,由牛津納米孔技術(shù)公司(Oxford Nanopore Technology,ONT)開(kāi)發(fā)的幾代產(chǎn)品已開(kāi)始應(yīng)用于體外診斷和公共衛(wèi)生等領(lǐng)域。
圖3 納米孔測(cè)序Figure 3 Nanopore sequencing
此前,納米孔測(cè)序技術(shù)因?yàn)殄e(cuò)誤率相對(duì)較高、需要多次處理消除測(cè)序錯(cuò)誤等問(wèn)題而影響了其對(duì)于第2 代測(cè)序技術(shù)(next-generation sequencing technology,NGS)的競(jìng)爭(zhēng)力[41,43-44],但隨著該測(cè)序技術(shù)的成熟完善帶來(lái)的測(cè)序準(zhǔn)確率的提高,其高通量、高讀長(zhǎng)、實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)輸出以及可以進(jìn)行直接RNA測(cè)序的優(yōu)勢(shì)逐漸得以體現(xiàn)。ORSINI 等[45]開(kāi)發(fā)了一種基于納米孔測(cè)序的快速檢測(cè)BCR-ABL1 融合基因的方法,這對(duì)急性白血病等急需得出診斷結(jié)果的疾病診斷有極大意義。使用納米孔測(cè)序技術(shù)以原生RNA形式對(duì)流感病毒基因組進(jìn)行直接測(cè)序,顛覆了以往先用逆轉(zhuǎn)錄酶合成DNA 后測(cè)序的流程,避免了CG偏倚,同時(shí)保留了基因組中的堿基修飾信息,在相關(guān)領(lǐng)域研究中具有重大價(jià)值[41]。除此以外也有利用納米孔測(cè)序技術(shù)在西非疫區(qū)實(shí)驗(yàn)室對(duì)埃博拉病毒進(jìn)行測(cè)序[46]和在7~12.5 h內(nèi)得到結(jié)核分枝桿菌鑒定全基因組測(cè)序的結(jié)果,并借此得出種屬鑒定和耐藥性推測(cè)的報(bào)道[47]。在新型冠狀病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)大流行期間,納米孔測(cè)序方法在病毒基因組測(cè)序[48]、進(jìn)一步開(kāi)發(fā)和完善檢測(cè)技術(shù)以應(yīng)對(duì)病毒變異[49-50]的過(guò)程中發(fā)揮著重要作用。
目前,實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù)是核酸檢測(cè)技術(shù)中的主流方法,具有極高的普及率。因此,在評(píng)價(jià)核酸檢測(cè)技術(shù)時(shí),往往需要以該技術(shù)為參照。在上述核酸檢測(cè)技術(shù)中,納米層析技術(shù)作為一種單純的核酸產(chǎn)物的檢測(cè)手段,實(shí)驗(yàn)步驟必然會(huì)多于集擴(kuò)增、產(chǎn)物檢測(cè)于一體的實(shí)時(shí)熒光PCR方法,因此應(yīng)選擇諸如LAMP 等設(shè)備要求不高的核酸擴(kuò)增方法,開(kāi)發(fā)適用于現(xiàn)場(chǎng)的即時(shí)檢驗(yàn)方法;PCR 方法普遍具有升降溫過(guò)程長(zhǎng)、耗時(shí)、具有一定假陰性率的缺點(diǎn),在體系中加入納米粒子后擴(kuò)增效率和敏感性得到提升;納米孔測(cè)序技術(shù)作為一種高通量、高讀長(zhǎng)的測(cè)序技術(shù),已在多個(gè)研究和應(yīng)用領(lǐng)域中發(fā)揮作用,是核酸檢測(cè)技術(shù)的強(qiáng)力補(bǔ)充。
生物傳感器是將生物活性材料與適當(dāng)?shù)霓D(zhuǎn)導(dǎo)元件組合在一起用來(lái)選擇性并且可逆性地檢測(cè)各種類(lèi)型樣品中的生物化學(xué)物質(zhì)濃度或活性的裝置[51],主要由識(shí)別元件和理化轉(zhuǎn)換器構(gòu)成。生物傳感器常可分為光學(xué)傳感器、電化學(xué)傳感器和壓電傳感器,具有響應(yīng)迅速、靈敏度高、可實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)和多重檢測(cè)、使用便捷、檢測(cè)成本低、體積小等優(yōu)點(diǎn)[52],對(duì)海關(guān)和傳染病暴發(fā)現(xiàn)場(chǎng)的疾病防控以及相對(duì)落后國(guó)家或地區(qū)的疾病診斷具有重要意義。納米生物傳感器是將納米材料(如金納米簇[17]、金納米線[53]、碳量子點(diǎn)[54]等)與生物傳感器結(jié)合制成的復(fù)雜儀器,綜合應(yīng)用光、電、聲、色等各種先進(jìn)檢測(cè)技術(shù),以實(shí)現(xiàn)對(duì)核酸、蛋白質(zhì)、酶活性、微生物等[53-56]乃至重金屬離子等環(huán)境有毒物質(zhì)[57]進(jìn)行檢測(cè)的復(fù)雜儀器,對(duì)臨床檢測(cè)、食品安全、環(huán)境監(jiān)測(cè)、國(guó)家安全等多個(gè)領(lǐng)域產(chǎn)生影響。Aghili 等[53]研發(fā)了一種用于檢測(cè)血清中帕金森?。≒arkinson’s disease,PD)生物標(biāo)志物miR-195 的DNA 雜交電化學(xué)納米生物傳感器(圖4),使用納米材料增加電極的有效表面積,大大提高了檢測(cè)的靈敏度,可用于PD的早期診斷。Srivastava等[58]報(bào)道了一種基于表面增強(qiáng)拉曼光譜的納米生物傳感器,用于大腸埃希菌的檢測(cè),具有高度特異性,實(shí)驗(yàn)證實(shí)其具有較低的檢測(cè)限(1.5×102CFU/mL,可達(dá)單個(gè)細(xì)菌的濃度水平)。
圖4 基于DNA雜交的電化學(xué)納米生物傳感器[53]Figure 4 Electrochemical nanobiosensor based on DNA hybridization[53]
BCA 技術(shù)是本世紀(jì)初出現(xiàn)的一項(xiàng)以“信號(hào)放大”為基礎(chǔ)的新型分子診斷技術(shù)。該技術(shù)的檢測(cè)體系中包含AuNP和MNP兩種納米粒子,其中,表面帶有單克隆抗體(或單鏈DNA)的MNP 主要用于被檢測(cè)物質(zhì)的分離,表面帶有多克隆抗體(或單鏈DNA)及大量“條碼DNA”的AuNP 用于捕獲被檢測(cè)物質(zhì)。當(dāng)目標(biāo)物質(zhì)存在時(shí),兩種納米顆粒與被目標(biāo)物質(zhì)形成“AuNP-目標(biāo)物-MNP”三明治結(jié)構(gòu)(圖5)。利用磁場(chǎng)分離這一“三明治”結(jié)構(gòu)后,使用一定方法釋放生物條形碼DNA,并進(jìn)行后續(xù)檢測(cè)。2003年首次報(bào)道用該技術(shù)成功進(jìn)行了前列腺特異性抗原(prostate specific antigen,PSA)的檢測(cè),由于AuNP 表面結(jié)合有大量的生物條形碼DNA,可將檢測(cè)靈敏度提高2~3個(gè)數(shù)量級(jí);Thaxton 等[59]使用BCA技術(shù)成功對(duì)前列腺癌根治性前列腺切除術(shù)后的男性血清中常規(guī)方法無(wú)法檢出的低濃度PSA 進(jìn)行了檢測(cè),從而實(shí)現(xiàn)了對(duì)前列腺癌復(fù)發(fā)狀況的預(yù)測(cè);Yin 等[60]也使用BCA技術(shù)對(duì)藍(lán)舌病毒外核蛋白VP7進(jìn)行了特異性檢測(cè),其檢測(cè)限為0.1 fg/mL。其巧妙之處在于將無(wú)法擴(kuò)增的蛋白檢測(cè)轉(zhuǎn)化為有多種擴(kuò)增和檢測(cè)手段的核酸檢測(cè),從而為蛋白質(zhì)檢測(cè)提供了新思路。
圖5 BCA在蛋白質(zhì)檢測(cè)[15]和DNA檢測(cè)[16]中所形成的三明治結(jié)構(gòu)Figure 5 Sandwich structures formed in protein[15]and DNA[16]detection using BCA
除在蛋白質(zhì)檢測(cè)中的應(yīng)用外,BCA 技術(shù)還在2007 年被報(bào)道用于枯草芽孢桿菌雙鏈DNA 的檢測(cè)[16];Aminia等[61]用針對(duì)銅綠假單胞菌外毒素A基因的兩種核酸探針、AuNP 和MNP,構(gòu)建了外毒素A基因片段的檢測(cè)體系。用磁場(chǎng)分離出“AuNP-目標(biāo)核酸分子-MNP”的三明治結(jié)構(gòu)后,他們用二硫蘇糖醇溶液釋放結(jié)合在AuNP 上的DNA 條形碼并用熒光分光光度法進(jìn)行檢測(cè),其檢測(cè)限低至1.2 ng/mL,且具有檢測(cè)速度快、選擇性好、線性范圍寬等優(yōu)點(diǎn)。此外,BCA 技術(shù)也衍生出一些變體。Lin 等[62]開(kāi)發(fā)了一種基于納米酶的生物條碼熒光檢測(cè)技術(shù),他們利用鉑-金納米粒(Pt-AuNP)的過(guò)氧化物酶活性催化amplex red(AR)產(chǎn)生可檢測(cè)的熒光信號(hào),實(shí)現(xiàn)了對(duì)艾滋病病毒和乙肝病毒DNA 的同時(shí)檢測(cè)。此類(lèi)方法相比基于PCR 的核酸檢測(cè)技術(shù)更適用于POCT。
納米科學(xué)是20世紀(jì)80年代末發(fā)展起來(lái)的新興學(xué)科,與信息科學(xué)、生命科學(xué)并列為21 世紀(jì)最有前途的三大新技術(shù)科學(xué)領(lǐng)域,其應(yīng)用已涉及醫(yī)療衛(wèi)生、感染防控、食品工程、廢水處理等大量領(lǐng)域。目前,在臨床體外診斷檢測(cè)領(lǐng)域,特性各異的納米材料已成為研究者們優(yōu)化現(xiàn)有方法、開(kāi)發(fā)新檢測(cè)技術(shù)的重要元件?;诩{米材料的檢測(cè)方法對(duì)相關(guān)標(biāo)志物(PSA、HCG等)檢測(cè)中表現(xiàn)出的高特異性、低檢測(cè)限(表1),使其在某些疾病,特別是前列腺癌等惡性腫瘤的早期診斷和預(yù)后評(píng)估中具有較大的應(yīng)用價(jià)值[22,59]。在病原體檢測(cè)方面,將納米材料加入PCR反應(yīng)體系后,可提高PCR反應(yīng)的靈敏性和特異性[38];在臨床上遇到難以分離鑒定的病原體時(shí),可將測(cè)序技術(shù)作為最后手段使用,但目前常用的二代測(cè)序技術(shù)的速度、成本等因素還不能完全滿足臨床感染快速診斷的需求,而納米孔測(cè)序雖然仍在不斷改進(jìn)完善中,卻因其低成本、使用簡(jiǎn)單、高讀長(zhǎng)、設(shè)備和環(huán)境要求低等特性,在病原體鑒定、白血病等基因突變引起的急性病快速診斷中顯示出獨(dú)特優(yōu)勢(shì)[45,47]。在熒光檢測(cè)中,以QD為主的納米材料具有抗光漂白性強(qiáng)、激發(fā)光譜寬、發(fā)射光譜窄等特點(diǎn),且可通過(guò)調(diào)整粒徑大小改變發(fā)射光波長(zhǎng)避開(kāi)易受到干擾的波段,從而使得整個(gè)檢測(cè)體系更具抗干擾性。得益于QD 的這一特性,開(kāi)發(fā)者和臨床工作者們可以在實(shí)際應(yīng)用中嘗試使用全血標(biāo)本代替血清,簡(jiǎn)化檢測(cè)流程,使之更加適合POCT,且縮短了檢驗(yàn)周期[13,63],更好地符合臨床需要。由此可預(yù)見(jiàn),納米技術(shù)與臨床檢驗(yàn)診斷的結(jié)合終將給體外診斷技術(shù)和醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)行業(yè)帶來(lái)一場(chǎng)變革。
表1 各種基于納米材料的體外診斷技術(shù)對(duì)比Table 1 Comparison of in-vitro diagnostics based nanomaterials
值得注意的是,基于納米材料的檢驗(yàn)方法常常需要對(duì)納米材料進(jìn)行表征,開(kāi)發(fā)可重復(fù)程序,以保證檢測(cè)的準(zhǔn)確性和可重復(fù)性[64],這在臨床實(shí)踐中可行性較低。因此,大部分納米檢測(cè)技術(shù)進(jìn)入臨床應(yīng)用仍需依賴體外診斷企業(yè)的投入和納米技術(shù)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展;同時(shí),盡管該類(lèi)技術(shù)有眾多優(yōu)勢(shì),但在進(jìn)入臨床應(yīng)用之前,還需要一定人力物力的投入,培養(yǎng)相應(yīng)的技術(shù)人員,這也使得基于納米材料的檢驗(yàn)技術(shù)距離臨床大規(guī)模應(yīng)用尚有距離。而在生產(chǎn)、使用、廢棄過(guò)程中進(jìn)入環(huán)境的納米材料,可造成一定的生態(tài)效應(yīng)和人群暴露。根據(jù)國(guó)內(nèi)外納米毒理學(xué)的研究,納米材料可以通過(guò)引起人體氧化應(yīng)激反應(yīng)和炎癥反應(yīng)、誘導(dǎo)或抑制細(xì)胞自噬、在生理環(huán)境中吸附一系列蛋白質(zhì)形成“蛋白冠”等方式,對(duì)細(xì)胞和機(jī)體產(chǎn)生毒性作用[65-66]。因此,在應(yīng)用納米材料的同時(shí),也應(yīng)加快制定完善的納米技術(shù)標(biāo)準(zhǔn),避免走上“先污染后治理”的老路。
總之,基于納米材料的體外診斷技術(shù)由于靈敏度高、檢測(cè)快速等特點(diǎn),具有臨床應(yīng)用的巨大潛力。與此同時(shí),由于傳統(tǒng)檢測(cè)技術(shù)仍能應(yīng)對(duì)日常工作中的大部分需求,以及納米檢驗(yàn)技術(shù)本身存在的商品化程度不足、產(chǎn)業(yè)鏈不成熟、自身技術(shù)不完善、需要相應(yīng)技術(shù)人員等原因,該類(lèi)技術(shù)進(jìn)入臨床應(yīng)用仍面臨一定阻礙??梢灶A(yù)見(jiàn)的是,隨著醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)學(xué)和納米科學(xué)的發(fā)展,以及體外診斷公司和區(qū)域檢驗(yàn)中心的興起,未來(lái)這類(lèi)技術(shù)將不斷進(jìn)入臨床應(yīng)用,并揚(yáng)長(zhǎng)避短地滿足不同臨床需要,更好地服務(wù)臨床醫(yī)學(xué)乃至全人類(lèi)。
南京醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版)2021年3期