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罕見病實驗室診斷技術(shù)的進(jìn)展

2021-03-09 11:49王增閣
檢驗醫(yī)學(xué) 2021年2期
關(guān)鍵詞:組學(xué)染色體基因組

張 儀, 王增閣, 王 劍

(上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬上海兒童醫(yī)學(xué)中心遺傳分子診斷科,上海 200127)

罕見病又稱“孤兒病”,是單病種發(fā)病率很低、極少見的疾病。此類疾病臨床表型異質(zhì)性大,在診療過程中易漏診、誤診,加之治療方法有限,不僅影響患兒的生存質(zhì)量,亦使其家庭背負(fù)巨大的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)[1]。因此,罕見病的有效診治是醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中亟待解決的一個問題。目前,國際上已確認(rèn)約7 000種罕見病,患者總數(shù)約占人類疾病患者總數(shù)的10%[2-3]。隨著罕見病診斷技術(shù)的進(jìn)步,不斷有新的病種被識別。我國人口基數(shù)大,使得罕見病并不“罕見”,然而多數(shù)臨床醫(yī)生未接受過系統(tǒng)的遺傳學(xué)培訓(xùn),限制了罕見病診斷技術(shù)以及治療方法的有效運(yùn)用[4]。

早發(fā)現(xiàn)、早診斷、早干預(yù)是控制罕見病病情發(fā)展的重要措施,而許多罕見病缺少規(guī)范化臨床實驗室診斷標(biāo)準(zhǔn),規(guī)范化診斷技術(shù)是提高罕見病診治效率的重要環(huán)節(jié)。本文就罕見病實驗室診斷技術(shù)作一綜述,旨在概括性分析各項技術(shù)的優(yōu)缺點(diǎn),幫助臨床醫(yī)生系統(tǒng)了解罕見病診斷技術(shù)的發(fā)展歷程及趨勢,理解和選擇用于不同疾病的診斷技術(shù)。

1 細(xì)胞遺傳學(xué)技術(shù)

1.1 染色體核型分析

染色體核型分析作為細(xì)胞遺傳學(xué)檢測的常用方法,自20世紀(jì)60年代問世至今,一直是臨床檢測染色體數(shù)目或結(jié)構(gòu)異常的常規(guī)技術(shù),以G顯帶核型分析為主,分辨率為5~7 Mb,是從細(xì)胞水平分析遺傳物質(zhì),多用于檢測三倍體、節(jié)段非整倍體及大范圍染色體結(jié)構(gòu)異常等,可檢測染色體平衡易位及倒位。臨床上常用于不孕不育癥、超聲提示異常、有致畸因素接觸史、流產(chǎn)史或有家族史等患者的產(chǎn)前診斷,常見的染色體疾病如21-三體綜合征、Klinefelter綜合征、Tuner綜合征、染色體易位等均可采用此技術(shù)進(jìn)行診斷。染色體核型分析實驗操作較為簡便,可直觀體現(xiàn)細(xì)胞遺傳物質(zhì)的全景,但分辨率較低、實驗周期較長,且結(jié)果分析對專業(yè)性要求高。近年來,隨著生物信息學(xué)技術(shù)的發(fā)展,CytoGPS等工具能夠幫助收集、整合核型數(shù)據(jù),提高數(shù)據(jù)的實用性,使下游的數(shù)據(jù)分析更為方便[5-6]。

1.2 熒光標(biāo)記原位雜交(fluorescence in situ hybridization,F(xiàn)ISH)

FISH是將探針標(biāo)記上熒光素來檢測DNA序列的一種雜交方法,能夠分析染色體數(shù)目,幫助解析染色體(質(zhì))空間結(jié)構(gòu),研究染色質(zhì)結(jié)構(gòu)變異,包括易位、缺失、重復(fù)等。此方法具有簡便易行、定位準(zhǔn)確、靈敏度高及特異性高等優(yōu)勢,在臨床診療中主要用于產(chǎn)前診斷和植入前診斷,檢測細(xì)胞或組織樣本是否存在染色體或基因異常,為各種遺傳病的診斷、分型和預(yù)后提供有力依據(jù)[7-8]。FISH的分辨率高于染色體核型分析,在人類中期染色體上的分辨率水平為1~3 Mb,但檢測位點(diǎn)有限,只能通過制備特異性探針檢測已知位點(diǎn)。但即使多色熒光原位雜交(multiple-fluorescence in situ hybridization,M-FISH)的出現(xiàn)彌補(bǔ)了位點(diǎn)上的不足[5],也不能完全克服FISH的局限性。隨著FISH技術(shù)的發(fā)展與完善,其分辨率得到改善,靈敏度不斷提高,DNA纖維熒光原位雜交、比較基因組原位雜交(comparative genomic hybridization,CGH)、三維熒光原位雜交(three-dimensional fluorescence in situ hybridization,3D-FISH)等技術(shù)的出現(xiàn)和推廣,相信未來FISH技術(shù)在罕見病實驗室診斷方面的應(yīng)用也會有所突破[9]。

1.3 染色體微陣列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)

CMA是通過掃描全基因組檢測染色體數(shù)目或結(jié)構(gòu)異常的一項技術(shù),又被稱為 “分子核型”,可檢測各種拷貝數(shù)變異(copy number variation,CNV)、單親二倍體、雜合性缺失及嵌合體等染色體異常,并可對染色體的非平衡性變化進(jìn)行準(zhǔn)確的檢測和定位[10]。由于CMA可更直觀、準(zhǔn)確地描述異?;蚱蔚膩碓?,因此被認(rèn)為是罕見病CNV檢測的金標(biāo)準(zhǔn)[11]。CMA目前已廣泛應(yīng)用于胚胎植入前診斷、產(chǎn)前診斷、新生兒篩查及血液病診斷等領(lǐng)域,針對多發(fā)畸形、孤獨(dú)癥、智力障礙、神經(jīng)肌肉疾病、先天性心臟病及先天性代謝性疾病等進(jìn)行診斷。CMA具有高通量的特點(diǎn),既能全面掃描基因組,又兼具極高的分辨率,可檢出>1 kb的基因組CNV,因此可用于傳統(tǒng)技術(shù)不能解決的疑難復(fù)雜疾病的診斷[12]。CMA也具有一定的局限性:(1)不能檢測染色體平衡易位及倒位;(2)針對同一樣本,不同檢測平臺得出的結(jié)果存在一定的差異;(3)常會出現(xiàn)一些臨床意義不明的CNV,導(dǎo)致結(jié)果難以判讀。盡管如此,大量的研究結(jié)果仍顯示出CMA在罕見病診斷,尤其是產(chǎn)前診斷中的巨大優(yōu)勢[12]。近年來,CMA逐漸向集成化、小型化發(fā)展,芯片實驗室的開發(fā)將CMA檢測步驟集成在小型化平臺上,無標(biāo)記檢測技術(shù)還將進(jìn)一步簡化未來的CMA設(shè)備[13]。

1.4 單分子光學(xué)圖譜技術(shù)

單分子光學(xué)圖譜技術(shù)可針對單個DNA分子描繪出有序的全基因組限制性內(nèi)切酶酶切位點(diǎn)圖譜,在分析髙復(fù)雜區(qū)重復(fù)序列和基因組結(jié)構(gòu)變異等方面有極大優(yōu)勢。該技術(shù)通過內(nèi)切酶對基因組DNA進(jìn)行原位切割并標(biāo)記熒光,切割后DNA片段的順序保持不變,經(jīng)超長單分子高分辨率熒光成像生成酶切位點(diǎn)分布圖。將此技術(shù)與高通量測序技術(shù)結(jié)合,能夠保持測序數(shù)據(jù)的序列順序,克服讀長短產(chǎn)生的誤差,可輔助基因組精確組裝[14]。單分子光學(xué)圖譜技術(shù)還能用于致病性結(jié)構(gòu)變異的檢測,包括基因組內(nèi)的DNA片段插入、缺失、重復(fù)、倒位、易位及DNA拷貝數(shù)變化等。美國BioNano公司推出的光學(xué)圖譜平臺用于臨床檢測的有效性已得到驗證,該技術(shù)能夠成功鑒定出經(jīng)典結(jié)構(gòu)變異疾病——杜氏肌營養(yǎng)不良癥的各種結(jié)構(gòu)變異,有望取代肩肱肌營養(yǎng)不良癥的分子診斷“金標(biāo)準(zhǔn)”——Southern印記雜交技術(shù)[15-16]。該技術(shù)能夠提供全基因組范圍內(nèi)的結(jié)構(gòu)變異及其順序,能夠檢測倒位和平衡易位等大小為kb級別的平衡變異,具有很高的靈敏度,但該技術(shù)無法檢測到微小片段的缺失或插入。目前,該技術(shù)的樣本處理、檢測及數(shù)據(jù)分析流程正在不斷被優(yōu)化,相信單分子光學(xué)圖譜技術(shù)的臨床應(yīng)用未來可期。

2 分子遺傳學(xué)技術(shù)

2.1 基因組水平

2.1.1 聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)相關(guān)技術(shù) PCR通過對特定DNA分子進(jìn)行指數(shù)級擴(kuò)增的方式,引領(lǐng)診斷技術(shù)真正邁入“分子時代”。實時熒光定量PCR在基因位點(diǎn)分型、拷貝數(shù)變異檢測等方面有一定的應(yīng)用價值,但由于其通量較低(單次只能對幾個目標(biāo)位點(diǎn)或區(qū)域進(jìn)行檢測),限制了其在罕見病診斷上的應(yīng)用。另外,還有一些基于PCR的衍生技術(shù),如限制性片段長度多態(tài)分析(restriction fragment length polymorphism,RFLP)及高分辨率熔解曲線(high resolution melting,HRM)等,可檢測罕見病基因點(diǎn)突變類型[17];PCR結(jié)合Southern印跡雜交技術(shù)可用于檢測三核苷酸重復(fù)序列突變(如脆性X綜合征及脊髓小腦共濟(jì)失調(diào))[18]。

2.1.2 第1代測序(Sanger測序) 20世紀(jì)70年代,Sanger測序的問世標(biāo)志著測序時代的開始。此技術(shù)基于雙脫氧鏈終止法原理,具有高度準(zhǔn)確及快速簡捷的特性 。在技術(shù)上,Sanger測序能從單個堿基水平進(jìn)行分析,彌補(bǔ)了細(xì)胞遺傳學(xué)技術(shù)分辨率較低的問題。在適用范圍上,對于臨床上診斷較明確的單基因疾病,能得到更直接、準(zhǔn)確的結(jié)果,如ATP7B基因突變導(dǎo)致肝豆?fàn)詈俗儾19]、TYR及OCA2基因突變導(dǎo)致白化病[20]等。迄今為止,Sanger測序仍是測序的“金標(biāo)準(zhǔn)”,在人類基因組計劃中起到了關(guān)鍵性作用。相對于其他基因檢測技術(shù),Sanger測序的準(zhǔn)確性更高,在基因小突變檢測及驗證方面具有很高的應(yīng)用價值。但Sanger測序不適用于沒有明確候選基因或候選基因數(shù)量較多的情況。

2.1.3 第2代測序(next-generation sequencing,NGS) NGS實現(xiàn)了大規(guī)模平行測序,可對全基因組進(jìn)行序列分析[21],主要包括全基因組測序(whole genome sequencing,WGS)、全外顯子組測序(whole exome sequencing,WES)與目標(biāo)捕獲測序??傮w而言,NGS具有通量大、精度高及數(shù)據(jù)豐富等優(yōu)勢,使得研究人員能夠精準(zhǔn)定位其感興趣的基因。WANG等[22]通過WES首次報道了HFM1雙等位基因突變可導(dǎo)致人類隱性原發(fā)性卵巢功能不全。SCHOLL等[23]對醛固酮增多癥和高血壓患者進(jìn)行WES,發(fā)現(xiàn)至少1個CLCN2突變與醛固酮增多癥存在關(guān)聯(lián)。在NGS未出現(xiàn)之前,鑒定新致病基因主要是依靠家系遺傳連鎖分析,不僅需要大家系、多個樣本參與,而且周期較長,定位不準(zhǔn)確[24],而WES只需對少數(shù)家系成員進(jìn)行測序分析即可鑒定。如何對海量的數(shù)據(jù)進(jìn)行準(zhǔn)確解讀是NGS面臨的重大問題,需要依靠專業(yè)的遺傳學(xué)與生物信息學(xué)分析團(tuán)隊來得到可靠的分析結(jié)果。隨著測序費(fèi)用的不斷降低,生物信息的快速更迭,使結(jié)果的分析更加全面、更加精確。目前,NGS已成為罕見病基因診斷的主要方法,其不僅能檢測幾個堿基的基因小突變,也能分析基因組CNV。但由于NGS的讀長一般只有150 bp左右,導(dǎo)致其無法準(zhǔn)確檢測三堿基重復(fù)疾病和具有同源性基因疾病的相關(guān)基因,如CYP21A2基因、SMN1基因等。

2.1.4 第3代測序 第3代測序即單分子測序,無需PCR擴(kuò)增即可實現(xiàn)對單個DNA分子的測序。目前,第3代測序技術(shù)主要有2種,即單分子實時測序技術(shù)(Single-Molecule Real-Time sequencing technology,SMRT)和納米孔測序技術(shù),前者通過檢測不同堿基標(biāo)記的熒光信號進(jìn)行測序,后者則通過檢測不同堿基通過納米孔的電信號進(jìn)行測序[25]。第3代測序克服了NGS的許多不足,不僅發(fā)揮了單分子測序的優(yōu)勢,并且具有超長讀長,SMRT平均讀長可達(dá)10 kb,納米孔測序技術(shù)可達(dá)5 kb;測序速度快且無需前期擴(kuò)增,有效避免了擴(kuò)增引入的系統(tǒng)偏向性;能夠用于檢測高度雜合的基因組、大的結(jié)構(gòu)變異等[26-27]。MERKER等[28]利用第3代測序技術(shù)檢測到PRKAR1A基因的結(jié)構(gòu)變異,從而診斷出1例Carney綜合征。盡管有諸多優(yōu)勢,但第3代測序錯誤率較高,SMRT可達(dá)到15%[29],雖然是隨機(jī)性錯誤,可通過多次測序克服,但其在臨床診斷中的應(yīng)用仍有限。隨著技術(shù)進(jìn)步,第3代測序必定向長讀長、低錯誤率發(fā)展,從而高效診斷罕見病。

2.1.5 多重連接探針擴(kuò)增技術(shù)(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA) MLPA是近年來發(fā)展起來的一項DNA定性分析和相對定量分析技術(shù)。其原理是針對目標(biāo)基因設(shè)計多對雜交探針,在完成雜交連接等一系列反應(yīng)后,將目標(biāo)基因的拷貝數(shù)等比例轉(zhuǎn)化為可供擴(kuò)增的雜交探針的數(shù)目,多用于檢測人類基因組序列中的微缺失和微重復(fù),識別DNA甲基化狀態(tài),檢測單核苷酸多態(tài)性和點(diǎn)突變,量化mRNA,可用于診斷脊髓性肌肉萎縮癥、假肥大型進(jìn)行性肌營養(yǎng)不良癥及Prader-Willi/Angelman綜合征等疾病的診斷[30]。MLPA操作簡便、靈敏度高、特異性強(qiáng)、重復(fù)性好,但對雜質(zhì)極其敏感,當(dāng)存在罕見的多態(tài)性或點(diǎn)突變時,可能會減少探針信號,因此需要結(jié)合其他技術(shù)進(jìn)行檢測。MLPA對非整倍體異常的檢測效能與經(jīng)典染色體核型分析一致,能快速檢測出染色體非平衡結(jié)構(gòu)異常及經(jīng)典方法不能檢測到的微小CNV,但MLPA無法檢測低水平嵌合、女性三倍體和平衡染色體異常,如倒位和易位等[31]。

2.2 轉(zhuǎn)錄組水平

NGS可對轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測序,即RNA測序。RNA測序可檢測樣本中全部RNA的變異和表達(dá)水平,包括mRNA、微小RNA(microRNA,miRNA)、長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)等,不僅可診斷某些致病機(jī)制涉及特定RNA的罕見病,還可幫助識別剪接位點(diǎn)變異所致蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄水平異常導(dǎo)致的罕見病。CUMMINGS等[32]利用RNA測序從遺傳學(xué)角度診斷罕見肌肉疾病,檢測骨骼肌樣本RNA,表明RNA測序能夠有效鑒別位于外顯子區(qū)或深內(nèi)含子區(qū)的有害剪接位點(diǎn)變異,總體診斷率可達(dá)35%。RNA測序在外周血RNA分析中的應(yīng)用可提高臨床診斷率,并減少意義不明變異對罕見病診斷的干擾;結(jié)合SpliceAI等預(yù)測軟件進(jìn)行剪接分析,可確定診斷級別的重要剪接異常,并闡明一些意義不明變異所產(chǎn)生的功能學(xué)效應(yīng)[33]。RNA測序的臨床應(yīng)用面臨著RNA易降解、組織樣本獲得困難、對照獲得困難及生物信息學(xué)分析等諸多問題,但若這些問題能得到有效解決,RNA測序?qū)⒖赡艹蔀楹币姴≡\斷的重要方法。

3 蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)可分為蛋白質(zhì)分離、蛋白質(zhì)鑒定、蛋白質(zhì)定量和蛋白質(zhì)生物信息學(xué)分析。經(jīng)典方法如色譜分析等可通過檢測蛋白質(zhì)水平等來輔助診斷疾病,但通量有限,無法滿足臨床需求。

蛋白質(zhì)芯片、質(zhì)譜等技術(shù)的出現(xiàn),實現(xiàn)了對蛋白質(zhì)表達(dá)水平、轉(zhuǎn)錄后修飾等的高通量檢測,在疾病蛋白質(zhì)組學(xué)及藥物開發(fā)等領(lǐng)域被廣泛應(yīng)用[34]。蛋白質(zhì)芯片主要分為:(1)分析蛋白質(zhì)芯片,通過抗體捕獲蛋白質(zhì)來檢測其表達(dá)水平及結(jié)合親和力;(2)功能蛋白質(zhì)芯片,分析蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)、核酸、藥物等之間的相互作用;(3)反相蛋白質(zhì)芯片,將待測組織細(xì)胞裂解物固定于芯片,進(jìn)行定量分析及磷酸化水平、細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等的檢測[34]。質(zhì)譜技術(shù)通過檢測不同質(zhì)荷比的離子及繪制圖譜來分析蛋白質(zhì)的性質(zhì),結(jié)合同位素標(biāo)記法可進(jìn)行準(zhǔn)確定量。目前,臨床常用的質(zhì)譜方法包括液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜、基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜等[34]。ROYAL等[35]應(yīng)用質(zhì)譜分析成功診斷出1例免疫熒光法檢測免疫球蛋白陰性的單克隆免疫球蛋白沉積?。╩onoclonal immunoglobulin deposition disease,MIDD)。VU等[36]應(yīng)用液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜成功檢測到Tay-Sachs病患者神經(jīng)干細(xì)胞的GM2神經(jīng)節(jié)苷脂沉積[36]。GUO等[37]建立了一種基于二維納米超高效液相色譜和質(zhì)譜分析的方法,可從弗里德希氏共濟(jì)失調(diào)患者血小板中檢測到frataxin蛋白水平下調(diào),該方法可用于疾病的輔助診斷或干預(yù)效果的判斷。蛋白質(zhì)水平檢測是罕見病診斷的重要組成部分,蛋白質(zhì)組學(xué)分析結(jié)果可能與疾病表型直接相關(guān)。

此外,X射線晶體學(xué)、核磁共振波譜等技術(shù)可以解析蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu),從蛋白質(zhì)性質(zhì)上為罕見病診斷提供依據(jù)。但由于蛋白質(zhì)翻譯后的修飾及氨基酸殘基之間相互作用等因素的影響,蛋白質(zhì)水平檢測的復(fù)雜程度遠(yuǎn)高于基因水平檢測。這要求在發(fā)展核酸水平診斷技術(shù)的同時,也要注重蛋白質(zhì)水平診斷平臺的開發(fā)。

4 代謝組學(xué)分析

代謝組學(xué)分析可通過系統(tǒng)化研究小分子(相對分子質(zhì)量<1 500 000)代謝產(chǎn)物,進(jìn)行定性或定量分析,提示疾病發(fā)生過程中隱藏的生化機(jī)制,幫助篩查、診斷罕見病。代謝組學(xué)診斷方法主要包括靶向和非靶向2種,前者僅檢測目標(biāo)代謝產(chǎn)物相對于對照樣本的變化情況,而后者全面比較分析樣本和對照樣本代謝成分的顯著差異,并通過生物信息學(xué)和數(shù)據(jù)庫聯(lián)系對應(yīng)生化通路。主要技術(shù)包括核磁共振波譜、質(zhì)譜法、色譜法以及色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)。代謝組學(xué)檢測已在臨床上用于新生兒遺傳代謝病的篩查。GRAHAM等[38]評估、整合了WGS數(shù)據(jù)和液相色譜-質(zhì)譜非靶向代謝組學(xué)數(shù)據(jù),確定了引起先天性代謝病的變異及其優(yōu)先級,提示代謝組學(xué)檢測對于罕見病,尤其是遺傳代謝病的篩查、診斷具有重要意義。代謝水平的變化可實時揭示機(jī)體生理病理狀態(tài),代謝組學(xué)所反映的異常指標(biāo)可能是疾病表型最為直接的證據(jù)。但代謝組學(xué)分析對檢測人員相關(guān)專業(yè)技術(shù)和經(jīng)驗有很強(qiáng)的依賴性,生物體代謝物組成的復(fù)雜性及水平差異給分析方法的通量、精確定量、檢測靈敏度和檢測范圍帶來了巨大的挑戰(zhàn),因此代謝組學(xué)要在罕見病實驗室診斷上充分發(fā)揮作用還有很長一段路要走。目前,學(xué)者們愈發(fā)傾向于通過集成多組學(xué)技術(shù),將基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)結(jié)合起來,以克服單組學(xué)技術(shù)的不足,并將其更加全面、準(zhǔn)確地應(yīng)用于包括罕見病診斷在內(nèi)的生物醫(yī)學(xué)研究中,這為罕見病的實驗室診斷提供了新思路[39]。

5 生化檢測

生化指標(biāo)檢測也可輔助診斷罕見病,如血清銅藍(lán)蛋白<80 mg/L是診斷Wilson病的有力證據(jù)[19];經(jīng)典型21-羥化酶缺陷癥患者血漿17-羥孕酮水平通常超過100 μg/L,是重要的診斷指標(biāo)[40]。另外,酶活性測定也可結(jié)合臨床癥狀對疾病進(jìn)行診斷,如酸性α-糖苷酶活性測定法是診斷Ⅱ型糖原累積病的金標(biāo)準(zhǔn)[41]。值得注意的是,代謝物的生化檢測雖能為一些罕見遺傳代謝病的診治提供思路,但由于某些標(biāo)志物特異性不高,其對于疾病診斷的意義仍有待進(jìn)一步的研究結(jié)果加以證實。

6 人工智能(artificial intelligence,AI)技術(shù)

目前,將AI技術(shù)與罕見病實驗室診斷相結(jié)合是一個熱門話題。AI技術(shù)可將多維度和規(guī)?;拇髷?shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為臨床可用的知識,在NGS的變異分析方面有著可觀的應(yīng)用前景,能夠幫助分析變異可能產(chǎn)生的臨床效應(yīng),進(jìn)行變異分類,并且能夠預(yù)測剪接位點(diǎn)變異,因此可作為高通量測序技術(shù)的數(shù)據(jù)分析方法[42-43]。美國Genomenon公司開發(fā)的Mastermind軟件可識別任何臨床背景下包含給定變異的所有研究,并依據(jù)臨床相關(guān)性排序,提供全面的基因變異譜,從而縮短工作周期、提高診斷效率[42]。美國Illumina公司開發(fā)的SpliceAI軟件可以預(yù)測基因組剪接位點(diǎn)的位置,并分析高通量測序技術(shù)數(shù)據(jù),有效識別可造成異常剪接事件的非編碼基因變異[43]。此外,人臉識別是一項關(guān)鍵的AI技術(shù),能夠通過辨別特殊面容幫助診斷罕見病。美國數(shù)字醫(yī)療公司開發(fā)的Face2Gene系統(tǒng)可通過照片識別疾病相關(guān)的面部特征,從而輔助識別罕見病[44]。因此,充分發(fā)揮AI技術(shù)的優(yōu)勢,尤其是其在實驗室數(shù)據(jù)分析方面的高效利用,將會大幅提升罕見病實驗室診斷平臺的工作效率。

7 總結(jié)

罕見病的表型及遺傳學(xué)異質(zhì)性,使其易被漏診和誤診,錯過最佳干預(yù)時期。因此,提高罕見病的實驗室診斷效率是目前優(yōu)化罕見病診治流程中極為重要的環(huán)節(jié)之一。隨著科技的進(jìn)步,針對罕見病的診斷技術(shù)已有了極大的發(fā)展,相關(guān)技術(shù)的優(yōu)缺點(diǎn)見表1。經(jīng)典的細(xì)胞遺傳學(xué)和分子遺傳學(xué)技術(shù)仍扮演著不可替代的重要角色,而單分子光譜技術(shù)、高通量測序、多組學(xué)分析、AI技術(shù)等新技術(shù)的推廣和應(yīng)用,可彌補(bǔ)已有方法的不足。

續(xù)表1

目前,隨著“精準(zhǔn)醫(yī)療”時代的到來,各類前沿的檢測技術(shù)逐步被應(yīng)用于臨床。臨床一線工作者需根據(jù)患者不同的臨床特征擇優(yōu)選取診斷方法,將前沿技術(shù)與傳統(tǒng)方法交替組合使用,才能更高效、更準(zhǔn)確地診斷疾病。相信隨著罕見病診斷技術(shù)的不斷迭代,尤其是與婦產(chǎn)科學(xué)、生殖醫(yī)學(xué)、遺傳學(xué)及AI技術(shù)的相互滲透,人類會將生物分子與疾病之間的關(guān)系闡述得越來越透徹。屆時,一定會有更為準(zhǔn)確、簡便的實驗室診斷技術(shù)被開發(fā)出來,用以造福全人類。

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