杜 崴,李 森,公菲菲,劉 娟,高 陽,熊 雄,王金耀,亢秀萍
(1. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 園藝學(xué)院/山西省設(shè)施蔬菜提質(zhì)增效協(xié)同創(chuàng)新中心,山西 太谷,030801; 2. 大同黃花產(chǎn)業(yè)發(fā)展研究院,山西 大同,037004)
黃花菜(Hemerocallis citrina),萱草屬多年生草本植物,具有很高的觀賞價值,其花蕾具有多種藥用功能,可食用,是我國特色蔬菜之一[1]。‘大同黃花’是山西大同區(qū)域主栽的黃花菜地方品種,被列為國家地理標(biāo)志保護產(chǎn)品。黃花菜單朵花期僅1 d,同一種質(zhì)在不同經(jīng)緯度地區(qū)的開花存在差異,但都具有明顯的夜開晝閉的節(jié)律特征,是研究開花節(jié)律的模式植物。植物開花節(jié)律受多種開花途徑的共同影響,在模式植物擬南芥中已明確有光周期途徑、自主途徑、赤霉素途徑、春化途徑及年齡途徑5 條開花信號途徑[2-4],這5 條途徑共同作用于生物鐘中央振蕩器,構(gòu)成了復(fù)雜的開花節(jié)律調(diào)控網(wǎng)絡(luò)[5-6]。
有研究表明,牽牛、曇花、月見草和夜來香等植物的開花節(jié)律均受到不同光/暗時長的調(diào)控[7],從光照轉(zhuǎn)變?yōu)楹诎祷蛘邚暮诎缔D(zhuǎn)變?yōu)楣庹站鶗淖冎参锏拈_花節(jié)律[8]。光周期對開花節(jié)律的影響最早是在煙草突變體中發(fā)現(xiàn)的,且不同植物開花節(jié)律和光周期途徑在很大程度上具有保守性[9]。睡蓮可通過延長光周期促進提前開放,而光周期縮短則導(dǎo)致睡蓮花開閉節(jié)律的縮短[10]。植物通過感知晝夜長度變化,使外源光周期信號與開花生物鐘之間形成復(fù)雜的互作,從而引起一系列開花基因的激活或抑制,最終導(dǎo)致開花節(jié)律的改變[11]。除外源光照條件,植物內(nèi)源碳水化合物也對植物開花節(jié)律具有調(diào)節(jié)作用[12]。
CONSTANS (CO)基因是擬南芥光周期途徑中的關(guān)鍵基因,它通過誘導(dǎo)FLOWERING LOCUS T (FT)、SUPPRESSOR OF OVEREREXPRESSION OF CONATANS 1 (SOC1)等下游基因的轉(zhuǎn)錄表達促使植株開花[13],而其表達水平及蛋白穩(wěn)定性受外界光周期和生物鐘的調(diào)控。目前CO 家族相關(guān)基因在許多植物中已被克隆,CO 家族共有17 個成員,它們在N 端具有高度保守的B-box 型鋅指結(jié)構(gòu),C 端則含有一個CCT 結(jié)構(gòu)域[14]。CO 家族基因在功能上存在差異,在擬南芥中COL1 和COL2 表達受生物鐘調(diào)控,但在調(diào)節(jié)開花上未起到顯著作用[15],COL3 過表達可延遲擬南芥開花,同時還促進側(cè)根的發(fā)育與芽的伸長[16]。在大豆中,基因COL2 對開花節(jié)律無顯著影響,而COL5 則可促進開花[17]。月季中CO 基因可以激活FT 的表達,促進植株對光周期的響應(yīng)而提前開花[18]。
為探索不同光周期對黃花菜開花節(jié)律的影響,明確黃花菜開花過程中CO 家族相關(guān)基因的功能,豐富黃花菜開花調(diào)控機制,本研究以‘大同黃花’為材料,跟蹤觀察不同光周期下黃花菜開花過程,并測定碳水化合物含量,對光周期開花途徑基因HcCOL14 進行克隆及表達特性分析,為深入研究CO 基因在黃花菜光周期開花途徑中的分子機理奠定基礎(chǔ)。
本研究選取‘大同黃花’(Hemerocallis citrina cv.‘DatongHuanghua’)作為試驗材料,材料栽培于山西農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝站萱草屬植物種質(zhì)資源圃。
1.2.1 晝夜顛倒試驗 將盆栽的‘大同黃花’在抽薹現(xiàn)蕾后轉(zhuǎn)移到兩個培養(yǎng)室內(nèi),在其外部進行遮光處理,兩個培養(yǎng)室補光燈的時間設(shè)置為:對照為5:00開,21:00 關(guān);處理為 17:00 開,9:00 關(guān)。同時將‘大同黃花’帶有花蕾的花葶從基部剪下來插在裝有水的瓶子里,放在2 個培養(yǎng)室內(nèi),每天換1 次水并修剪花葶基部。使用360 智能攝像頭對單朵花進行實時監(jiān)測,記錄其開口時間點(即花瓣和花萼都打開,雌蕊雄蕊同時出現(xiàn)在花瓣中間[19])。
1.2.2 大田不同光周期處理試驗 根據(jù)山西省晉中市太谷區(qū)7 月光周期條件(5:00 由黑暗期進入光照期、20:00 由光照期進入黑暗期),用不同遮光材料(黑布、黑白膜)對‘大同黃花’整株進行遮光處理,設(shè)置3 個不同的晝/夜時長處理,分別為:處理1,于開花前1 天20:00 時進行遮光,次日8:00 除去遮光材料,形成晝/ 夜時長12/12 h(8:00—20:00 光照/20:00—8:00 黑暗)光周期條件;處理2,于開花前1 天20:00 時進行遮光,次日10:00 除去遮光材料,形成晝/夜時長10/14 h(10:00—20:00 光照/20:00—10:00 黑暗)光周期條件;處理3,于開花前1 天20:00 時進行遮光,次日12:00 除去遮光材料,形成晝/夜時長8/16 h(12:00—20:00 光照/20:00—12:00 黑暗)光周期條件。利用自然光照下晝/夜時長15/9 h(5:00—20:00 光照/20:00—5:00 黑暗)作為對照。除晝夜時長不一外,其他環(huán)境條件盡量保持一致。自當(dāng)日17:00 起,使用360 智能攝像頭對單朵花進行實時監(jiān)測,觀察并記錄其開口時間點。
1.2.3 不同組織部位遮光處理試驗 用黑布對‘大同黃花’葉片進行全天遮光處理,用黑色遮光袋對整個花序進行全天遮光處理,每天17:00 起每隔 15 min 對當(dāng)天將要開放的花朵進行觀察。
1.2.4 花器官不同光周期處理試驗 用黑色遮光袋于開花前1 天對‘大同黃花’的整枝花序和單蕾分別進行不同光周期遮光處理,晝/夜時長處理為15/9 h、12/12 h、10/14 h、8/16 h(處理方式與整株不同光周期處理試驗相同)。使用360 智能攝像頭進行實時監(jiān)測,記錄開口時間點。
對黑白膜整株處理的‘大同黃花’在開口前后6 h 及各處理開口時間點的樣品進行統(tǒng)一采集,由于8/16 h 晝/夜處理下‘大同黃花’開口時間不穩(wěn)定,故僅選取15/9 h(CK)、12/12 h、10/14 h 處理下的開口時間點作為采集時間,并選取8/16 h 與10/14 h 同一時間開口樣品進行采集。對采集樣品中碳水化合物含量進行測定,其中淀粉測定采用蒽酮比色法,果糖、蔗糖測定采用間苯二酚法[20]。
從黃花菜和萱草花器官轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中挖掘光周期途徑核心基因CO,使用TBtools 繪制熱圖分析各基因表達水平。利用ExPASy(https://web.expasy.org/translate/)對CO 家族相關(guān)基因核苷酸序列編碼的氨基酸序列進行預(yù)測,基于氨基酸序列利用在線分析工 具SMART(http://smart.embl-heidelberg.de/smart/ save_user_preferences.pl)完成保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測。
本研究選取CO 家族中在2 組樣品間表達水平差異倍數(shù)較大的Unigene0000694 進行基因克隆和熒光定量驗證。根據(jù)轉(zhuǎn)錄組中Unigene0000694 的參考序列,在UTR 區(qū)設(shè)計特異性擴增引物cCO- F 和cCO-R,以黃花菜開花后2 h(20:00)樣品的cDNA 為模板,進行PCR 擴增。RNA 的提取、cDNA 反轉(zhuǎn)錄程序、PCR 擴增條件、產(chǎn)物回收及T載的連接方法同公菲菲[21],連接后送北京華大基因進行Sanger 測序。得到序列后使用DNAMAN 與參考序列比對,在ExPASy 將核苷酸序列轉(zhuǎn)換氨基酸序列后在NCBI-blastp 進行同源性比對,并利用MEGA5.0 將該蛋白與擬南芥的17 個CO-like 蛋白進行進化樹分析。
由于單蕾遮光處理的開口時間較穩(wěn)定,且與整枝花序遮光處理開口時間基本一致,本研究對單蕾遮光處理樣品進行表達特性分析。根據(jù)克隆序列設(shè)計實時熒光定量引物qCO-F、qCO-R,見表1。以反轉(zhuǎn)錄生成的cDNA 第一鏈經(jīng)稀釋后作為模板,選用AP4 作為內(nèi)參基因[22],使用Applied Biosystems 7500 型 定 量PCR 儀, 采 用TaKaRa 公 司 的TB Green? Premix Ex Taq? II (Tli RNaseH Plus) 試 劑盒,進行實時熒光定量試驗。RT-qPCR 反應(yīng)條件及反應(yīng)程序同公菲菲[21]。使用Microsoft Excel 2007進行數(shù)據(jù)分析。
表1 引物序列名稱及說明Table 1 Primer sequence name and description
對‘大同黃花’進行晝夜顛倒處理后,發(fā)現(xiàn)其開口時間與正常光周期處理下相差約12 h。其中在土培條件下,晝夜顛倒后約7 d 時間可將‘大同黃花’開口時間由17:00 調(diào)整為7:30。而瓶插條件下約4 d時間就可使開花時間穩(wěn)定在6:30 左右(表2)。
在大田分別用黑布、黑白膜對‘大同黃花’進行遮光處理,各處理下‘大同黃花’開口時間如表2 所示。由表可知,用黑布對整株進行處理時,各光周期處理下‘大同黃花’開口時間差異顯著,其中晝/夜時長8/16 h 比15/9 h 光周期處理下開口時間晚約3 h。用黑白膜進行整株處理時,晝/夜時長15/9 h、12/12 h 和10/14 h 處理下開口時間依次延遲1 h 左右,而8/16 h 光周期處理下‘大同黃花’開口時間表現(xiàn)出不穩(wěn)定。
表2 不同光周期處理下開花節(jié)律Table 2 Flowering rhythm under different photoperiod treatments
基于前2 種遮光材料光周期處理結(jié)果,通過對‘大同黃花’不同組織部位進行遮光處理,發(fā)現(xiàn)對葉片進行遮光后開口時間未發(fā)生變化,而對花蕾進行遮光時‘大同黃花’開口時間顯著延遲,由此得出花蕾是黃花菜光周期開花響應(yīng)關(guān)鍵部位。于是采用黑色遮光袋對整枝花葶進行遮光處理,自然光周期下開口時間在18:00,晝/ 夜時長12/12 h、10/14 h、8/16 h 處理下開口時間依次延遲約1 h。進一步,用黑色遮光袋進行單蕾遮光處理,發(fā)現(xiàn)其開口時間基本與對整枝花葶進行遮光處理時一致。在各材料的光周期處理下,‘大同黃花’開口時間大部分均表現(xiàn)出穩(wěn)定。
以上結(jié)果表明,花蕾是‘大同黃花’開花生物鐘的重要響應(yīng)部位,光周期的改變會影響‘大同黃花’開花節(jié)律,證明光周期在‘大同黃花’開花調(diào)控中起著重要的作用。
對不同光周期下‘大同黃花’開花過程中碳水化合物含量進行測定,結(jié)果如圖1 所示。由圖可知,開花過程中不同光周期處理下‘大同黃花’糖含量均表現(xiàn)為:蔗糖>果糖>淀粉。在CK(15/9 h)開口前6 h(12:00)不同光周期處理下‘大同黃花’果糖含量均有微弱差異,晝/夜12/12 h 處理果糖含量最高,10/14 h 與8/16 h 處理果糖含量差別不大。在18:00—24:00 各處理開花過程中果糖含量變化不明顯,且含量較為接近。除CK 外各處理在24:00時果糖含量均低于12:00 時。在不同光周期處理下‘大同黃花’蔗糖和淀粉含量變化趨勢基本一致,在12:00 時蔗糖和淀粉含量均保持較高,12:00—18:00 時迅速下降,之后緩慢下降至各處理開口時間點后含量小幅上升,最終保持在小范圍內(nèi)波動。
在光周期開花途徑中,高等植物可以通過感知外部環(huán)境的光周期變化及光照時間等信號,來調(diào)節(jié)植物內(nèi)部基因的表達模式,從而調(diào)控開花節(jié)律。CONSTANS (CO)基因是光周期途徑中監(jiān)測晝夜長度的重要元件,在開花基因和生物鐘之間發(fā)揮著重要作用。在黃花菜和萱草花器官轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中共篩選到27 個CONSTANS-like(COL) 家族相關(guān)基因,使用TBtools 繪制熱圖分析各基因表達水平,運用SMART 程序在線預(yù)測COL 家族相關(guān)基因的蛋白質(zhì)保守結(jié)構(gòu)域,如圖2 所示。分析發(fā)現(xiàn)Unigene0000694 基因在兩組樣品間差異倍數(shù)最大,且序列結(jié)構(gòu)較完整,N 端具有高度保守的B-box 結(jié)構(gòu)域,C 端含有1 個CCT 結(jié)構(gòu)域。故推測該基因可能在黃花菜光周期開花調(diào)控過程中發(fā)揮著重要作用。
圖1 不同光周期處理下碳水化合物含量變化Fig.1 Changes in carbohydrate content under different photoperiod treatments
圖2 CO 家族相關(guān)基因表達水平及保守結(jié)構(gòu)域分析Fig.2 Expression level and conserved domain analysis of CO family genes
由上述結(jié)果可知Unigene0000694 基因在2 組樣品間差異倍數(shù)最大,且序列結(jié)構(gòu)較完整。本研究根據(jù)轉(zhuǎn)錄組中COL14 基因的參考序列,在UTR 區(qū)設(shè)計特異性擴增引物cCO-F 和cCO-R,以黃花菜開花后2 h(20:00)樣品的cDNA 為模板,進行PCR 擴增。擴增產(chǎn)物經(jīng)1.5% TAE 瓊脂糖凝膠電泳分離,見圖3??寺〉玫紺OL14 基因的cDNA 全長共計1 588 bp,利用NCBI-ORF Finder 分析CO 基因編碼區(qū),其片段長1 422 bp,編碼473 個氨基酸。由NCBICD Search 預(yù)測其保守結(jié)構(gòu)域可知,在蛋白序列的N端有1 個Bbox1_BBX-like 保守結(jié)構(gòu)域,位于氨基酸序列的17 ~60 位點,在60 ~85 位點也存在1個B_box_SF super family,且C 端具有1 個CCT 結(jié)構(gòu)域 ,位于序列的422 ~464 位點,該蛋白具有典型CONSTANS 蛋白的保守結(jié)構(gòu)。經(jīng)過NCBI-blastp進行序列比對(表3),Unigene0000694 與AoCOL-14(XP_020261158.1)、AoCOL-14(XP_020248360.1)、E g C O L-1 4(X P_0 1 0 9 0 7 0 7 8.1)、P d C O L-13(XP_008801132.1) 編碼的蛋白同源性比較高,擁有相同保守域,同時將Unigene0000694 的氨基酸序列與擬南芥的17 個CO-like 蛋白進行進化分析,圖4 顯 示Unigene0000694 與AtCO14 和AtCO15 聚 為 1 支屬于Group Ш,將本基因命名為HcCOL14 基因,與轉(zhuǎn)錄組注釋結(jié)果一致。
圖3 HcCOL 基因PCR 擴增及CDS 序列和其推導(dǎo)的氨基酸序列Fig.3 The results of PCR product and CDS sequence and derived amino acid sequence of HcCOL gene
表3 Unigene000694 氨基酸序列NCBI-blastp 部分結(jié)果Table 3 NCBI-blast partial results of Unigene000694 amino acid sequence
圖4 Unigene000694 與擬南芥CO-like 蛋白的系統(tǒng)進化分析Fig.4 Phylogenetic analysis of Unigene000694 and Arabidopsis CO-like protein
CONSTANS (CO) 基因在光周期途徑中起著核心調(diào)控因子的作用。對4 種不同光周期處理下‘大同黃花’開花過程中CO 家族相關(guān)基因HcCOL14進行表達特性分析,結(jié)果如圖5 所示。由圖可知在12:00—19:00 時HcCOL14 基因在4 種光周期處理下表達量均保持上升。在19:00—24:00 時12/12 h 和CK(15/9 h) 2 種光周期條件下HcCOL14 具有相似表達規(guī)律,即在20:00 前表達量持續(xù)上升,在進入黑暗時(20:00)出現(xiàn)峰值后表達量出現(xiàn)波動。而10/14 h 晝/夜處理則剛好相反,在19:00 時HcCOL14 表達量下降,于20:00 后開始上升并在21:00 時達到峰值。8/16 h 晝/夜處理在20:00 前表達量逐漸上升,20:00 達到峰值后逐漸下降。
圖5 不同光周期處理下HcCOL14 基因的表達分析Fig.5 Expression analysis of HcCOL14 gene under different photoperiod treatments
在植物的生命周期中,開花不僅是生殖過程的重要組成部分,還是一個易受環(huán)境條件影響的關(guān)鍵發(fā)育階段。光周期是直接影響植物開花的主要環(huán)境因素之一,植物通過感知光周期變化來調(diào)節(jié)開花節(jié)律[23]。本研究首次對‘大同黃花’不同部位進行遮光處理,并且對不同光周期下‘大同黃花’開口時間進行觀察,發(fā)現(xiàn)‘大同黃花’的花蕾為光周期重要響應(yīng)部位,花蕾可通過感知外界光/暗變化從而改變開花節(jié)律。有研究表明當(dāng)睡蓮的光周期從晝/夜時長16/8 h(7:00—23:00 光照/23:00—7:00 黑暗)改變?yōu)?2/12 h(9:00—21:00光照/21:00—9:00黑暗)時,其開花節(jié)律由7:00—10:00—14:00—18:00 調(diào) 整 到9:00—10:00—12:30—17:00[24]。本試驗證明在一定范圍內(nèi)縮短光周期可延遲開花,與該研究結(jié)果一致。牽牛的開花也受花前光/暗條件的影響,在8 h 或12 h 黑暗期后開花節(jié)律保持穩(wěn)定,但在僅4 h 黑暗期后或連續(xù)光照條件下則會使開花顯著延遲[25],與本試驗結(jié)論相反。推測可能是由于牽牛的開花由花前黑暗時間長短決定,當(dāng)黑暗期積累到一定時長后才會開花,而睡蓮和黃花菜的開花則受光照期長短調(diào)控。
除光周期外,溫度亦是植物生長發(fā)育的重要影響因子,且對開花有著巨大影響[26]。Balasubramanian 等人通過對擬南芥在不同溫度下開花情況的研究發(fā)現(xiàn),當(dāng)達到臨界閾值之后,即使微小的溫度變化也可以誘導(dǎo)植物的開花[27]。同時也有研究證明:環(huán)境溫度升高可促進擬南芥開花,而較低的溫度則會延遲開花[15]。在本研究中用黑白膜對整株‘大同黃花’進行晝/夜時長8/16 h 處理時,較其他2種遮光材料處理下開花時間表現(xiàn)出明顯提前,且其開口時間基本介于黑白膜處理下晝/夜時長12/12 h與10/14 h 之間,并表現(xiàn)出極度不穩(wěn)定性,這可能與黑白膜內(nèi)溫度升高有關(guān)。對黑白膜內(nèi)溫度進行測定,發(fā)現(xiàn)在8:00—10:00 時膜內(nèi)外溫差基本穩(wěn)定在4 ℃左右,而在12:00 時膜內(nèi)外溫差則升高到9 ℃。由此推測,在晝/夜時長為8/16 h 的黑白膜處理下,環(huán)境溫度的升高可能是導(dǎo)致‘大同黃花’開口時間不穩(wěn)定的重要原因。
在大多數(shù)物種中,開花伴隨著貯藏碳水化合物的轉(zhuǎn)化及糖類的運輸。許多植物的花瓣細胞中含有大量淀粉,在開放前不久,淀粉可迅速轉(zhuǎn)化為葡萄糖和果糖,從而調(diào)節(jié)滲透壓促使花瓣打開[28]。本研究中不同光周期條件下‘大同黃花’開花前碳水化合物含量均高于開花后,且碳水化合物含量始終保持為:蔗糖>果糖>淀粉。
CONSTANS (CO)是一種具有B-box 結(jié)構(gòu)域的鋅指轉(zhuǎn)錄因子,CO 編碼的蛋白位于開花基因和生物鐘之間,是監(jiān)測光周期變化的必要元件,它通過感知光周期和生物鐘信號從而激活下游相關(guān)基因的表達,最終誘導(dǎo)植物開花[29]。不同物種CONSTANSlike 家族成員在光周期開花途徑中表達模式已被廣泛報道。劉芳等對小擬南芥ApCOL1 基因進行研究,發(fā)現(xiàn)其在SD 和LD 兩種光照條件下具有相似的晝夜表達特征[30]。石玉波分析了在不同光周期下百子蓮ApCOL 基因的表達節(jié)律,發(fā)現(xiàn)其均在黑暗期出現(xiàn)表達峰值,而在光照期下調(diào)表達[31]。本研究克隆得到HcCOL14 基因,該基因編碼的蛋白具有CO 家族基因典型的B-box 和CCT 結(jié)構(gòu)域。除晝/夜時長10/14 h 外,其它不同光周期下HcCOL14 基因在光暗交替時期均呈現(xiàn)出高表達,推測該基因可能在黃花菜花發(fā)育過程以及開花調(diào)控過程中發(fā)揮一定作用。
本研究通過對‘大同黃花’光周期響應(yīng)部位及不同光周期下黃花菜開口時間進行研究,為調(diào)控黃花菜開花節(jié)律奠定了基礎(chǔ),對深入探討黃花菜開花機理、揭示植物開花機制多樣性具有重要意義。