王路梅,郭 惠,童 晶,吳畏畏,劉庭君,鄭東宇
鼠傷寒沙門菌是沙門菌屬中引起小兒腸道感染最常見(jiàn)的致病血清型[1-2],屬于沙門菌群B群。人群對(duì)鼠傷寒沙門菌普遍易感,嬰幼兒多為顯性感染,以胃腸型為主[3],相關(guān)研究中多是以兒童為研究對(duì)象,嬰幼兒(0~3歲)感染資料尚不足。嬰幼兒免疫功能尚未完善,抵抗力較弱,抗菌藥物是治療兒童鼠傷寒沙門菌腸炎的重要手段,多重耐藥鼠傷寒沙門菌已在世界各地陸續(xù)報(bào)道[4-5],耐頭孢菌素鼠傷寒沙門氏菌的出現(xiàn)及數(shù)量的增加已經(jīng)引起全世界的關(guān)注,成為臨床治療的難點(diǎn)。為了掌握鼠傷寒沙門菌在嬰幼兒腹瀉人群中的流行情況,了解其多重耐藥特征,防止多重耐藥菌在弱勢(shì)人群中的傳播,遏制不合理抗生素應(yīng)用,本研究對(duì)2014—2018年徐州地區(qū)嬰幼兒腹瀉人群進(jìn)行了鼠傷寒沙門菌監(jiān)測(cè),并對(duì)其耐藥特征和多耐藥菌株之間的分子流行病學(xué)關(guān)系進(jìn)行探討。
1.1 材 料
1.1.1 標(biāo)本來(lái)源 依托全國(guó)食源性疾病監(jiān)測(cè)系統(tǒng),收集2014-2018年徐州市醫(yī)院1 343份嬰幼兒(0~3歲)腹瀉病患者糞便標(biāo)本,病例以腹瀉癥狀為主訴,近1周內(nèi)未使用過(guò)抗生素,每日排便大于3次及3次以上,且糞便性狀異常。
1.1.2 質(zhì)控菌株 血清分型質(zhì)控菌株為鼠傷寒沙門氏菌ATCC140128,藥敏試驗(yàn)質(zhì)控菌株為大腸埃希氏菌ATCC25922,上述菌株購(gòu)自中國(guó)工業(yè)微生物菌種保藏中心(CICC),脈沖場(chǎng)凝膠電泳分子量標(biāo)準(zhǔn)菌株為沙門氏菌H9812,由江蘇省疾病預(yù)防控制中心食安所提供。
1.1.3 主要儀器和試劑 VITEK 2 COMPACT全自動(dòng)細(xì)菌鑒定及藥敏分析系統(tǒng)(法國(guó)梅里埃公司);PCR擴(kuò)增儀、脈沖場(chǎng)凝膠電泳系統(tǒng)、凝膠成像系統(tǒng)(美國(guó)Bio-Rad公司);SBG增菌液(廣州環(huán)凱微生物試劑有限公司);科瑪嘉沙門顯色培養(yǎng)基(上??片敿挝⑸锛夹g(shù)有限公司);沙門氏菌屬診斷血清(寧波天潤(rùn)生物制品研究所及丹麥S&A);Vitek GN鑒定卡、GN 13、GN 14藥敏測(cè)試卡(法國(guó)梅里埃公司);藥敏測(cè)試用紙片:頭孢他啶30μg、頭孢他啶/克拉維酸30/10μg和頭孢噻肟30μg、頭孢噻肟/克拉維酸30/10μg,(英國(guó)OXID公司);限制性內(nèi)切酶Xba I、Bl n I購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司;脈沖場(chǎng)電泳用瓊脂糖為Sea Kem○RGold Agarose低熔點(diǎn)瓊脂(美國(guó)Ca mbrex公司);蛋白酶K為德國(guó)Merck公司產(chǎn)品。質(zhì)粒小提取試劑盒(DP106)為天根生化科技公司產(chǎn)品。
1.2 方 法
1.2.1 分離鑒定 按照《GB 4789.4-2016食品安全國(guó)家標(biāo)準(zhǔn) 食品微生物學(xué)檢驗(yàn) 沙門菌檢驗(yàn)》、2014-2018《全國(guó)食源性疾病監(jiān)測(cè)工作手冊(cè)》進(jìn)行沙門菌的分離、鑒定病原學(xué)表型檢測(cè)。
1.2.2 沙門菌血清分型 按照考夫曼抗原表[6],將鼠傷寒沙門氏菌分為雙相的鼠傷寒沙門菌血清型(1,4,12:i:1,2)和單相變體的鼠傷寒沙門菌變種血清型(1,4,12:i:—)。
1.2.3 耐藥模型檢測(cè) 采用VITEK 2 Co mpact GN13和GN14藥敏系統(tǒng)的最低抑菌濃度法(MIC)測(cè)定72株菌對(duì)10類抗生素18種代表藥物的敏感性。參照CLSI M100-S26[7]《美國(guó)臨床和實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)協(xié)會(huì)抗菌藥物敏感性試驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)》進(jìn)行抗生素分類和判斷結(jié)果。按照臨床實(shí)際用藥規(guī)范[8],排除對(duì)沙門菌無(wú)效的一代頭孢,根據(jù)多重耐藥定義[9],對(duì)上述3類或3類以上抗菌藥物不敏感定義為MDR(multidrug resistant),對(duì)上述6類或6類以上抗菌藥物不敏感定義為XDR(extensive drug resistant)。
1.2.4 產(chǎn)ESBLs表型檢測(cè) 按照CLSI M100-S26[7]中的雙紙片協(xié)同法來(lái)確定鼠傷寒沙門菌的產(chǎn)超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(ESBLs)耐藥表型,并且嚴(yán)格進(jìn)行質(zhì)量控制。
1.2.5 產(chǎn)ESBLs耐藥基因CTX-M檢測(cè)及產(chǎn)物確定 對(duì)產(chǎn)ESBLs表型菌株檢測(cè)常見(jiàn)耐藥基因CTXM及其亞型,按照細(xì)菌質(zhì)粒提取參考小提試劑盒說(shuō)明書(shū)的堿裂解法對(duì)細(xì)菌質(zhì)粒DNA進(jìn)行提取,對(duì)6種特異耐藥基因[5]進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性5 min;94℃變性15 s,退火15 s,72℃延伸30 s,反應(yīng)共30個(gè)循環(huán);72℃延伸5 min。PCR陽(yáng)性擴(kuò)增片段送上海生物工程公司測(cè)序驗(yàn)證,使用BLAST在Gen Bank上查詢比較,確定基因亞型。
1.2.6 PFGE分型及數(shù)據(jù)分析 PFGE操作實(shí)驗(yàn)操作過(guò)程采用Pulse Net標(biāo)準(zhǔn)操作手冊(cè)規(guī)定進(jìn)行。PFGE結(jié)果采用Bio Nu merics(Applied—maths公司,ver6.6)進(jìn)行分析處理,采用UPGMA法進(jìn)行聚類分析。
1.3 統(tǒng)計(jì)處理 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)計(jì)算用Excel 2007構(gòu)建病原菌流行特征,分析統(tǒng)計(jì)耐藥情況,采用SPSS 16.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。兩組間比較采用卡方檢驗(yàn)或者校正卡方檢驗(yàn),單向有序計(jì)數(shù)資料的變化趨勢(shì)用趨勢(shì)卡方分析,檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05。
2.1 鼠傷寒沙門菌在嬰幼兒腹瀉人群中的流行病學(xué)特征
2.1.1 時(shí)間分布 2014-2018年,1 343份腹瀉嬰幼兒標(biāo)本中,共檢出178株沙門氏菌(13.25%),其中鼠傷寒沙門菌檢出72株(5.36%)。2014-2018年沙門菌(χ2趨勢(shì)=21.23,P<0.01)和鼠傷寒沙門菌(χ2趨勢(shì)=16.02,P<0.01)檢出率均呈逐年上升趨勢(shì);5年間,鼠傷寒血清型在沙門菌中的占比亦呈逐年增高的趨勢(shì)(χ2趨勢(shì)=18.47,P<0.01),2018年達(dá)到最高為62.50%,見(jiàn)表1。沙門菌全年均有檢出,鼠傷寒沙門菌僅在2-11月才有檢出,沙門菌檢出高峰出現(xiàn)在6月(19.25%),鼠傷寒沙門菌檢出高峰出現(xiàn)在5月(8.16%),5-10月沙門菌的檢出率均處于較高水平,見(jiàn)圖1。
表1 2014-2018年徐州地區(qū)嬰幼兒腹瀉人群中鼠傷寒沙門菌檢出情況Tab.1 Detection of salmonella typhus in infant and infant diarrhea patients in Xuzhou region from 2014 to 2018
圖1 2014-2018年患兒鼠傷寒沙門菌及沙門菌感染發(fā)病時(shí)間Fig.1 Onset time of salmonella typhus and salmonella infection in children from 2014 to 2018
2.1.2 年齡、性別分布 1 343例嬰幼兒腹瀉人群年齡范圍為0 d~3歲,平均年齡1歲2個(gè)月,中位數(shù)為1歲4個(gè)月;72例鼠傷寒檢出人群的年齡范圍為:7 d~3歲,沙門菌和鼠傷寒沙門菌在1~3歲幼兒組的檢出率均高于<1歲嬰兒組(χ2=88.91,P<0.01;χ2=80.53,P<0.01)(見(jiàn)表2);男患兒鼠傷寒檢出率為54.9%(45/859),女患兒為13.22%(27/484);男女病例之比為1.67∶1,檢出率在性別間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.02,P>0.05)。
2.1.3 臨床感染特征和飲食史 1 343份腹瀉患兒樣本中,膿血便中鼠傷寒沙門菌的檢出率為22.84%(37/162),高于稀便的3.89%(13/334)、水樣便的2.89%(12/415)、粘液便的2.62%(10/382)(χ2=105.66,P<0.01),米泔樣便、鮮血便和其他便未有檢出鼠傷寒沙門菌。56.9%(41/72)的鼠傷寒感染患兒出現(xiàn)發(fā)熱。經(jīng)過(guò)餐飲史調(diào)查表明,48.6%(35例)陽(yáng)檢患兒為正常飯菜飲食,23.6%(17例)為混合飲食,12.5%(9例)為母乳喂養(yǎng),15.28%(11例)為奶粉喂養(yǎng)。
表2 72株鼠傷寒沙門菌在嬰幼兒腹瀉人群中年齡分布Tab.2 Age distribution of 72 strains of salmonella typhimurium in infant diarrhea population
2.2 72 株鼠傷寒沙門菌耐藥情況 藥敏結(jié)果顯示,耐藥率>90%的抗生素有:一代頭孢類藥和頭霉素類、氨基糖苷類的阿米卡星,慶大霉素,妥布霉素;耐藥率>80%的抗生素有:青霉素類的氨芐西林、β-內(nèi)酰胺酶抑制劑復(fù)合物中的氨芐西林/舒巴坦。耐藥率<10%的抗生素有:哌拉西林/他坐巴坦,厄他培南,亞胺培南,呋喃妥因,左氧氟沙星。產(chǎn)ESBLs表型陽(yáng)性株對(duì)氨芐西林/他唑巴坦、頭孢吡肟、氨曲南的耐藥率高于非產(chǎn)ESBLs表型株(χ2=4.57,P<0.05;χ2=38.66,P<0.01;χ2=45.53,P<0.01),單相變體的鼠傷寒沙門菌變種血清型(1,4,,12:i:-)和雙相的鼠傷寒沙門菌血清型(1,4,12:i:1,2)之間的耐藥特征差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),詳見(jiàn)表3。
表3 72株鼠傷寒沙門菌耐藥情況[耐藥數(shù)(%)]Tab.3 Drug resistance of 72 strains of Salmonella typhimurium[numberof drug resistance(%)]
A M-氨芐西林、A MS-氨芐西林/舒巴坦、TZP-哌拉西林/他唑巴坦、CFZ-頭孢唑林、CTT-頭孢替坦、CAZ-頭孢他啶、CTR-頭孢曲松、FEP-頭孢吡肟、ATM-氨曲南、ETP-厄他培南、I MP-亞胺培南、AK-阿米卡星、GM-慶大霉素、TM-妥布霉素、CIP-環(huán)丙沙星、LEV-左氧氟沙星、F/M-呋喃妥因、SXT-甲氧芐啶/磺胺甲惡唑。
2.3 耐藥模型及多重耐藥情況 65株(90.28%)鼠傷寒沙門菌為多重耐藥菌,其中,30株(41.67%)為MDR,呈現(xiàn)XDR耐藥的有35株(48.61%),72株鼠傷寒沙門菌對(duì)18種抗生素的耐藥譜呈37種模型;最多對(duì)9類14種抗生素耐藥,詳見(jiàn)表4。
表4 72株鼠傷寒沙門菌的多重耐藥模型Tab.4 Model of multiple drug resistance of 72 strains of salmonella camphoris in mice
2.4 產(chǎn)ESBLs鼠傷寒的耐藥表型及CTX-M各耐藥基因檢測(cè) 72株鼠傷寒沙門菌中,15株(20.83%)產(chǎn)ESBLs表型,其中13株攜帶CTX-M通用基因,3株來(lái)自2014年,2株來(lái)自2015年,8株來(lái)自2016年,2株來(lái)自2018年。對(duì)13株菌進(jìn)行耐藥基因擴(kuò)增分型,結(jié)果顯示4株blaCTX-M-1、9株bla CTX-M-9擴(kuò)增結(jié)果陽(yáng)性。對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序,序列通過(guò)BLAST比對(duì),發(fā)現(xiàn)分別與已知的blaCTX-M-1、blaCTX-M-9序列100%同源。CTXM-2組及CTX-M-8/CTX-M-25組擴(kuò)增結(jié)果均為陰性,陰性對(duì)照成立。
2.5 PFGE圖譜聚類分析結(jié)果 72株鼠傷寒沙門菌可分為66個(gè)PFGE帶型,相似度在57.2%~100%之間變化,按照90%以上的相似度,可分為11個(gè)聚類。37株菌的相似度在90%~96.6%之間變化,包含多重耐藥菌和非多重耐藥菌;相同耐藥譜的菌株之間帶型相似度均<80%;12株鼠傷寒沙門菌變種之間的PFGE圖譜特征相似度<80%;9株多重耐藥鼠傷寒沙門菌出現(xiàn)4簇100%一致帶型,其中1簇為2株2018年不同時(shí)間分離的鼠傷寒沙門菌和鼠傷寒沙門菌變種,均為多重耐藥菌。1簇為2017年5月13日分離的鼠傷寒沙門菌。1簇為分別于2016年、2018年分離的2株鼠傷寒沙門菌,1簇分別為2016年、2017年、2018年分離的3株鼠傷寒沙門菌。2株非多重耐藥鼠傷寒沙門菌出現(xiàn)一簇100%一致帶型,為分別于2017年5月和10月分離,詳見(jiàn)圖2。
2.6 院內(nèi)感染流行病學(xué)調(diào)查 172例鼠傷寒患兒中,1例為2016年9月1日發(fā)現(xiàn)新生兒院內(nèi)感染。對(duì)其父母親、護(hù)理人員的糞便、手標(biāo)本、產(chǎn)婦傷口、產(chǎn)道等樣本進(jìn)行連續(xù)3天病原檢索,均未檢出病原菌;產(chǎn)婦為剖宮產(chǎn),近1周內(nèi)無(wú)細(xì)菌感染史。2016年8月24日患兒出生時(shí)一切正常,于7天后出現(xiàn)哭鬧不適,膿血便(11次/日);糞便培養(yǎng)檢出鼠傷寒沙門菌。遂查看該醫(yī)院同一病區(qū)近1個(gè)月內(nèi)住院病人資料,2016年8月27-30日,同一病區(qū)有2例住院患者為鼠傷寒沙門菌感染。患兒發(fā)病后,醫(yī)院加強(qiáng)消毒處理,醫(yī)院外環(huán)境、護(hù)士標(biāo)本中均未檢出病原。綜上,此例為嬰兒出生后在院內(nèi)發(fā)生的交叉感染。
鼠傷寒沙門菌是目前世界各國(guó)分離率最高的沙門菌型之一,主要以兒童感染為主[10],在我國(guó)臨床感染沙門菌中27.4%是由鼠傷寒沙門菌引起的[11]。2014-2018年徐州地區(qū)嬰幼兒腹瀉人群中鼠傷寒感染率在沙門菌中的占比為40.45%,其中2018年高達(dá)62.50%,并呈逐年上升的趨勢(shì)。和文獻(xiàn)中兒童鼠傷寒感染數(shù)據(jù)范圍(16.0%~68.6%)相比,處于較高水平[12-16]。0~3歲的腹瀉人群中,以1~3歲幼兒年齡組檢出率較高,相對(duì)于0~1歲的嬰兒時(shí)期,幼兒的戶外活動(dòng)頻繁,易食用不潔食品及飲品,感染的風(fēng)險(xiǎn)增加。本組研究中,最小嬰兒發(fā)病年齡僅7 d,小于羅文雄[17]報(bào)道的36 d,經(jīng)調(diào)查,本例為剖宮產(chǎn)后住院期間感染,其他地區(qū)亦出現(xiàn)鼠傷寒沙門菌引發(fā)的初生嬰兒院內(nèi)交叉感染報(bào)道[18],提示初生嬰兒院內(nèi)感染的風(fēng)險(xiǎn);因此,嬰幼兒腹瀉患者已成為該地區(qū)鼠傷寒沙門菌感染重點(diǎn)人群,今后應(yīng)從飲食衛(wèi)生和院內(nèi)感染方面加以控制鼠傷寒沙門菌的污染。
圖2 72株鼠傷寒沙門菌的PFGE圖譜聚類分析Fig.2 Cluster analysis of PFGE map of 72 strains of salmonella typhus
脈沖場(chǎng)凝膠電泳(PFGE)現(xiàn)已被廣泛用于多種病原體暴發(fā)流行、院內(nèi)感染的溯源分析中。經(jīng)過(guò)對(duì)72株鼠傷寒沙門氏菌進(jìn)行PFGE分子分型研究顯示,100%一致帶型最多的有3株菌,無(wú)明顯的優(yōu)勢(shì)帶型。提示嬰幼兒人群攜帶的鼠傷寒沙門氏菌基因型呈多樣性,沒(méi)有優(yōu)勢(shì)的流行基因型。此外,72株鼠傷寒沙門氏菌PFGE帶型無(wú)3例以上的地域、時(shí)間的聚集性,反映鼠傷寒沙門氏菌在該地區(qū)嬰幼兒人群中呈散發(fā)流行。值得關(guān)注的是,72株鼠傷寒沙門菌中,有9株多重耐菌出現(xiàn)4簇100%一致帶型,提示多重耐藥鼠傷寒菌株在嬰幼兒人群存在小范圍傳播的可能。因此,仍需繼續(xù)關(guān)注相關(guān)耐藥菌的水平傳播。
單相變體鼠傷寒沙門氏菌(1,4,[5],12:i:-)是鼠傷寒沙門菌的一種血清型,定義為鼠傷寒沙門菌變種,已被證明與鼠傷寒沙門菌具有相似的毒力和耐藥特征。本研究中檢出12株鼠傷寒沙門變種,耐藥情況產(chǎn)生了一致的結(jié)論。通過(guò)PFGE分子分型溯源,未發(fā)現(xiàn)單相變體血清型菌株出現(xiàn)聚集性趨勢(shì),但是樣本量尚少,需要加大樣本量,深入研究。
總體看來(lái),徐州地區(qū)鼠傷寒沙門菌嬰幼兒分離株的多重耐藥形勢(shì)嚴(yán)峻,呈現(xiàn)MDR和XDR的菌株共占比90.28%。ESBLs表型陽(yáng)性株占20.83%,產(chǎn)ESBLs的菌株應(yīng)避免使用青霉素類、頭孢菌素類和氨曲南類藥物。產(chǎn)ESBLs鼠傷寒沙門菌的耐藥基因是以攜帶blaCTX-M-1和bla CTX-M-9亞型為主,亞型分布地區(qū)的差異與各地臨床使用的抗菌藥物不同有關(guān)。作為兒童治療沙門菌感染的首選藥物,三代頭孢類的頭孢他定(25.00%)和頭孢曲松(37.50%)耐藥率令人擔(dān)憂,在近期的兒科感染使用中應(yīng)加以控制,四代頭孢類的頭孢吡肟的耐藥率目前低于20%,仍是頭孢類最佳選擇。哌拉西林/他唑巴坦及碳青霉烯類的厄他培南和亞胺培南目前耐藥率仍呈現(xiàn)較低的水平,左氧氟沙星雖然耐藥率較低(8.33%),但是對(duì)兒童軟骨發(fā)育有影響,僅用于治療嚴(yán)重沙門菌或多耐藥感染。
由于嬰幼兒人群的鼠傷寒感染相關(guān)資料尚少,期望通過(guò)本研究能提高臨床對(duì)鼠傷寒沙門菌感染及耐藥性的認(rèn)識(shí),遏制兒科不合理抗生素應(yīng)用。