張鳳琴
(巢湖學(xué)院化學(xué)與材料工程學(xué)院,安徽巢湖238000)
嗜熱菌是一類最適宜生長(zhǎng)溫度高于50°C,最低生長(zhǎng)溫度不低于30°C,最高生長(zhǎng)溫度在60°C以上的極端環(huán)境微生物[1-2]。對(duì)嗜熱菌的研究,國(guó)外起步較早,在美國(guó)、冰島、俄羅斯及新西蘭等地均有大量嗜熱菌的分類種群被發(fā)現(xiàn)[3-5]。近幾年來,國(guó)內(nèi)在嗜熱菌研究領(lǐng)域也有不少收獲,在云南、廣州、四川、福建、臺(tái)灣和江西等地的多處溫泉中有一些嗜熱菌被分離鑒定[6-8]。嗜熱菌因其超強(qiáng)的耐熱性和獨(dú)特的生理生化特性,在生物科學(xué)研究及工業(yè)生產(chǎn)領(lǐng)域都有著獨(dú)特的作用[9],嗜熱菌產(chǎn)生的嗜熱酶及其菌體均具有很廣闊的應(yīng)用前景。嗜熱菌的嗜熱酶在高溫下具有很強(qiáng)的穩(wěn)定性,可用于需要高溫催化的食品、醫(yī)藥工業(yè)、環(huán)境保護(hù)、能源等領(lǐng)域,如嗜熱脂肪芽孢桿菌產(chǎn)生的高溫α-淀粉酶可使淀粉完全轉(zhuǎn)化為右旋葡萄糖,嗜熱酶可生產(chǎn)新型藥物,嗜熱酶可降解芳香族化合物、氰化物、有機(jī)磷農(nóng)藥等難降解物質(zhì),嗜熱菌產(chǎn)生的纖維素酶在乙醇發(fā)酵中,可提高乙醇產(chǎn)量。嗜熱菌菌體可直接用于工業(yè)中,如硫化細(xì)菌可用于硫化礦的生物瀝濾和煤炭的脫硫過程[10]。
廬江湯池地?zé)豳Y源豐富,嗜熱菌研究潛力大,但目前仍未見對(duì)廬江地區(qū)嗜熱菌的研究報(bào)道。本研究從廬江湯池溫泉水(約60 ℃,pH 7.0)中分離嗜熱菌,對(duì)分離得到的嗜熱菌進(jìn)行分子生物學(xué)鑒定、形態(tài)學(xué)特征和生理生化特性研究,為其在以后的科學(xué)研究及工業(yè)應(yīng)用提供理論支持和物質(zhì)基礎(chǔ)。
樣品采集于廬江湯池溫泉,東經(jīng)117°01′、北緯31°33′。細(xì)菌DNA 提取試劑盒和PCR 膠回收試劑盒,購(gòu)自大連TaKaRa公司;引物合成和測(cè)序由上海生工生物工程有限公司完成。牛肉膏蛋白胨液體培養(yǎng)基:牛肉膏3.0 g/L、蛋白胨10.0 g/L、氯化鈉5.0 g/L,調(diào)節(jié)pH 至7.2~7.4(固體培養(yǎng)基添加瓊脂14.0 g/L)。牛肉膏、蛋白胨、氯化鈉、瓊脂等藥品均為國(guó)產(chǎn)生物級(jí)。
(1)嗜熱菌分離純化
?。?.2~0.3)mL溫泉水,涂布于牛肉膏蛋白胨固體培養(yǎng)基上,60°C下恒溫培養(yǎng)24 h。經(jīng)過反復(fù)多次純化直至得到單菌落。
(2)菌株的分子生物學(xué)鑒定
菌株基因組DNA 的提取參照細(xì)菌DNA 試劑盒(大連TaKaRa 公司)操作。采用細(xì)菌通用引物擴(kuò)增16S rRNA 基因序列并對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序(上海生工生物工程有限公司)。將測(cè)序結(jié)果與GenBank中已報(bào)道的序列進(jìn)行比對(duì),并用MEGA6的Neighbor joining法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,判定菌株的系統(tǒng)分類地位。
(3)菌株的形態(tài)觀察
將純化菌株用平板劃線法接種于牛肉膏蛋白胨固體培養(yǎng)基上,60°C恒溫培養(yǎng)24 h。觀察菌落生長(zhǎng)情況、形態(tài)、大小、表面、邊緣及顏色等各方面特征。挑取單菌落,對(duì)其進(jìn)行革蘭氏染色,通過光學(xué)顯微鏡觀察菌體形態(tài)和革蘭氏分析。
(4)生理生化特性研究
生化特性鑒定。通過非發(fā)酵細(xì)菌生化鑒定管對(duì)菌株的生化特性進(jìn)行鑒定。該試驗(yàn)選用的非發(fā)酵細(xì)菌生化鑒定管共包含14 個(gè)生化鑒定項(xiàng)目:精氨酸(Arginine)、鳥氨酸(Ornithine)、賴氨酸(Lysine)、氨基酸對(duì)照(Amino acid control)、枸櫞酸鹽(Citrate)、硝酸鹽還原作用(Nitrate reduction)、尿素(Urea)、七葉苷(Esculin)、鄰硝基苯-β-D-吡喃半乳糖苷(ONPG)、蔗糖(Sucrose)、麥芽糖(Maltose)、木糖(Xylose)、葡萄糖(Glucose)、硫化氫(Hydrogen sulfide)和氧化酶(Oxidase)。
不同pH下的生長(zhǎng)情況。將菌液接種于pH分別為3.5、4.0、4.5、5.0、5.5、6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5、9.0、9.5、10.0的牛肉膏蛋白胨液體培養(yǎng)基中。于60°C、160 r/min條件下培養(yǎng)24 h。通過分光光度計(jì)測(cè)定菌體濃度,從而確定菌株生長(zhǎng)的pH 范圍及最適宜pH。
最高耐受溫度的確定。?。?.2~0.3)mL菌液,涂布到牛肉膏蛋白胨固體培養(yǎng)基上,分別于60、65、70、75、80°C生長(zhǎng)24 h,觀察菌株生長(zhǎng)情況,初步確定菌株最高耐受溫度范圍。確定范圍后,再在范圍內(nèi)以1°C為間隔,確定菌株具體的最高耐受溫度。
從湯池溫泉水中分離純化得到一株嗜熱菌,命名為L(zhǎng)JTC-1(NCBI登錄號(hào):KT454966)。
通過PCR擴(kuò)增得到菌株LJTC-1的16S rRNA基因片段,將擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序后與GenBank中已報(bào)道的序列進(jìn)行比對(duì),并將序列上傳至GenBank(接受號(hào):KT454966)。通過構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖1)與進(jìn)化關(guān)系比較親近的屬種進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育學(xué)分析,得知菌株LJTC-1屬于Thermoactinomyces屬,且與Thermoactinomycessp.60X-8(JN578486.1)親緣關(guān)系最親近,二者在同一個(gè)進(jìn)化分支上。
圖1 LJTC-1菌的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹
LJTC-1菌落形態(tài)為白色、不透明、圓形、邊緣不規(guī)則、表面隆起、干燥、似毛狀、直徑在(3.0~5.0)mm,如圖2(a)所示。菌體經(jīng)革蘭氏染色后鏡檢,LJTC-1菌呈鏈珠狀,革蘭氏陽(yáng)性菌,如圖2(b)所示。
圖2 菌株LJTC-1的菌落形態(tài)和革蘭氏染色鏡檢圖片
(1)生理生化特性鑒定
菌株LJTC-1 在精氨酸、鳥氨酸、賴氨酸、氨基酸對(duì)照、枸櫞酸鹽、尿素、OPNG 及氧化酶試驗(yàn)中呈陽(yáng)性;在硝酸鹽還原反應(yīng)、七葉苷、硫化氫試驗(yàn)中呈陰性(見表1)。
表1 生理生化特征
(2)最適宜pH
初步測(cè)定菌株LJTC-1可生長(zhǎng)的pH范圍為5.5~9.0,最適宜pH約為7.5,如表2和圖3所示。
表2 不同pH下菌株生長(zhǎng)情況
圖3 pH對(duì)菌株的影響
(3)最高耐受溫度
通過初步實(shí)驗(yàn)確定菌株LJTC-1在(60~70)°C可生長(zhǎng),在75 ℃以下無法生長(zhǎng),如表3所示。由表3可確定該菌株最高耐受溫度范圍為(70~75)℃,為了進(jìn)一步確定耐受溫度,將該菌株放于71、72、73和74 ℃下培養(yǎng),培養(yǎng)結(jié)果如表4所示。在74 ℃時(shí)菌株仍能生長(zhǎng),而75 ℃不生長(zhǎng),故確定其最高耐受溫度為74 ℃。
表3 不同溫度下菌株生長(zhǎng)情況(Ⅰ)
表4 不同溫度下菌株生長(zhǎng)情況(Ⅱ)
從研究結(jié)果可知,菌株LJTC-1 與Thermoactinomycessp.60X-8(JN578486.1)親緣關(guān)系最親近,Thermoactinomycessp.60X-8(JN578486.1)菌在(15~40)℃范圍內(nèi)可生長(zhǎng)[11],而該菌最高耐受溫度為74 °C。由此推測(cè)廬江湯池地區(qū)獨(dú)特的地理?xiàng)l件和溫泉環(huán)境可能對(duì)造成菌株LJTC-1與親緣關(guān)系相近菌株間差異起到一定作用。
目前,分離得到的嗜熱菌最高耐受溫度多為(65~72)℃[12-14],但Balwinder SS從垃圾堆放處篩選得到能耐受90 ℃高溫的嗜熱菌Geobacillus[4],這可能與采樣點(diǎn)的高溫環(huán)境有關(guān)。嗜熱菌對(duì)高溫具有獨(dú)特的適應(yīng)機(jī)制,主要與細(xì)胞膜、蛋白質(zhì)與遺傳物質(zhì)有關(guān)。嗜熱菌的膜脂具有長(zhǎng)鏈和高飽和度的脂肪酸,能形成很強(qiáng)的疏水鍵,從而使細(xì)胞膜在高溫環(huán)境下保持正常的生理功能[15-16];嗜熱菌蛋白質(zhì)穩(wěn)定的天然結(jié)構(gòu)和細(xì)胞內(nèi)的促進(jìn)熱穩(wěn)定因素,即嗜熱菌蛋白質(zhì)的熱穩(wěn)定性是其耐熱性的主要機(jī)制[17];此外,嗜熱菌DNA結(jié)構(gòu)中G+C%含量較高且螺距較短,有利于DNA的穩(wěn)定,嗜熱菌tRNA周轉(zhuǎn)速度快且其G+C%含量高,因此其tRNA在高溫下的穩(wěn)定性較好,故嗜熱菌的耐熱性與其遺傳物質(zhì)的穩(wěn)定性有關(guān)[18-19]。
安徽廬江湯池地區(qū)地?zé)豳Y源豐富,開發(fā)潛力大。但目前仍未有關(guān)于廬江湯池地區(qū)的嗜熱菌研究,此研究是第一篇關(guān)于廬江湯池溫泉中嗜熱菌的文章,所分離鑒定的菌株LJTC-1是目前唯一一株從廬江湯池溫泉中分離得到的嗜熱菌。該研究結(jié)果可以為當(dāng)?shù)卣畬?duì)廬江湯池溫泉資源保護(hù)和開發(fā)利用提供理論支持,并為其在以后的科學(xué)研究及工業(yè)應(yīng)用方面提供參考。后續(xù)將對(duì)該菌的高溫酶進(jìn)行特性研究并對(duì)其結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,找出其與親緣關(guān)系相近菌株高溫酶之間的差異,并對(duì)嗜熱菌和其高溫酶的應(yīng)用進(jìn)行研究,通過分子生物學(xué)手段將嗜熱酶在性狀更優(yōu)良的微生物中進(jìn)行克隆表達(dá)[20]。