吳家園,賴天文,潘振宇,李筱,劉華鋒,呂軍
2019年12月,武漢市出現(xiàn)了一系列非典型病毒性肺炎病例。2020年1月7日,我國確認(rèn)這類疾病的病原為一種新型冠狀病毒,1月12日世界衛(wèi)生組織將其命名為2019-nCoV,該病原感染所致的肺炎稱為新型冠狀病毒肺炎(novel coronavirus pneumonia,NCP)。被發(fā)現(xiàn)之后,該疾病在全國各地乃至周邊國家迅速擴散,各地疑似/確診病例數(shù)在短時間內(nèi)急劇上升。截至2月17日24時,我國已累計報告確診NCP病例72 436例,累計死亡病例1868例,其中,湖北累計確診59 989例(武漢42 752例),累計死亡1789例(武漢1381例)[1]。
由于疫情暴發(fā)突然,直至2020年1月23日后,全國和各地的衛(wèi)生健康委員會公布的疫情數(shù)據(jù)才日趨準(zhǔn)確[2]。由于急性傳染病的流行具有擴散快,地方性和季節(jié)性等特點,新興的大數(shù)據(jù)分析手段并不適用,需要利用傳統(tǒng)的傳染病動力學(xué)模型來分析和預(yù)測疫情的發(fā)展。在傳染病動力學(xué)模型中,基本再生數(shù)(R0)是評估傳染病傳播能力的關(guān)鍵指標(biāo),其定義是指在一個由易感者構(gòu)成的群體中,單個已被感染的個體在喪失傳播病毒能力之前平均能感染的人數(shù)[3]。R0反映了傳染性疾病暴發(fā)的潛力和嚴(yán)重程度,數(shù)值越高表示疫情越嚴(yán)重。由于NCP疫情暴發(fā)于春節(jié)前夕,大規(guī)模的春運人口流動和人群聚集加快了疫情發(fā)展,給我國疫情的防控帶來了嚴(yán)峻的考驗。疫情暴發(fā)后,各地政府相繼啟動了重大突發(fā)公共衛(wèi)生事件Ⅰ級響應(yīng),并采取了一系列嚴(yán)厲的防控措施,包括全面排查疑似/確診患者并隔離觀察或治療,嚴(yán)格公共場所開放管理,出行限制,禁止聚會,加強健康管理等,在一定程度上減少了人群的流動性和接觸率,有效地控制了疫情的發(fā)展。但長期的管控也給人民群眾的日常生活和各行各業(yè)的生產(chǎn)帶來了諸多不便,對我國的經(jīng)濟發(fā)展也帶來了很大的影響。目前我國的NCP疫情已經(jīng)到了防控的關(guān)鍵時期,利用合適的模型來估算現(xiàn)階段的R0以及預(yù)測其未來的趨勢,有助于及時準(zhǔn)確地評估干預(yù)措施的有效性,預(yù)測措施需要維持的時間,為部署下一階段的疫情防控提供有力的證據(jù)以及減少群眾的恐慌情緒。
本研究通過利用國家衛(wèi)生健康委員會公布的NCP疫情的官方數(shù)據(jù),構(gòu)建NCP傳播的SIR模型,并對本次疫情的R0進(jìn)行估計和預(yù)測,旨在評估疫情的現(xiàn)狀,從而預(yù)測疫情的發(fā)展趨勢,為疫情防控提供依據(jù)與支持。
1.1 數(shù)據(jù)來源本文數(shù)據(jù)來源于國家衛(wèi)健委截至2020年2月18日24時的官方統(tǒng)計數(shù)據(jù)[1]。除了全國的統(tǒng)計數(shù)據(jù),我們還提取本次疫情發(fā)源地和最嚴(yán)重的湖北省,以及部分具有代表性(如累計確診人數(shù)較多,人口密度較大,或外來務(wù)工較多)的省市(廣東、河南、浙江和上海)的統(tǒng)計數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,以全面評估和預(yù)測我國NCP疫情發(fā)展趨勢。全國及各省市自治區(qū)2018年底的人口數(shù)來源于國家統(tǒng)計局官方數(shù)據(jù)[4],全國為14億人,湖北省為5917萬,廣東省為11 346萬,河南省為9605萬,浙江省為5737萬,上海市為2424萬。
1.2 SIR模型我們采用SIR模型來描述我國NCP疫情的發(fā)展趨勢。在SIR模型中,疫區(qū)內(nèi)的人群被分為三個部分,分別為易感人群(Susceptible,S)、感染人群(Infected,I)和移除人群(Removed,R)。其中,易感人群指尚未染病但容易被感染的人群,感染人群指已感染并可以傳播給他人的人群,移除人群指不再參與感染與被感染過程的人群(包括病愈且具有免疫能力或已死亡人群)。S(t),I(t)和R(t)分別表示t時刻易感人群、感染人群和移出人群的數(shù)量,同時假設(shè)該傳染病滿足以下法則:①疫區(qū)內(nèi)的總?cè)丝跀?shù)(N)保持恒定;②單位時間內(nèi),感染人群所能感染的人數(shù)與易感人群的人數(shù)成正比,感染強度為β;③單位時間內(nèi),感染人群中移除的人數(shù)與感染人群的數(shù)量成正比,移除概率為γ。據(jù)此我們可得以下經(jīng)典SIR模型的微分方程組[5]:
其中,N=S(t)+I(t)+R(t),β是感染人群每天平均接觸的易感人數(shù)k和傳染概率b的乘積,γ取決于可傳播的時間長度C,γ=1/C。
1.3 指數(shù)平滑法指數(shù)平滑法是由Robert G. Brown所提出,是估計時間序列趨勢性的一種常用方法,主要是通過對以往實際觀察值的差異性賦權(quán)(序列中近期的數(shù)據(jù)賦予較大的權(quán)重,遠(yuǎn)期的數(shù)據(jù)賦予較小的權(quán)重)來實現(xiàn)歷史數(shù)據(jù)的加權(quán)修勻,從而提取時間序列中的確定性信息[6]。其突出的優(yōu)點在于預(yù)測結(jié)果既反映最新的信息,也不好遺漏歷史信息,并且隨著時間的流逝,過去數(shù)據(jù)的影響逐漸減小,主要用于中短期的預(yù)測[7]。本研究將SIR模型與指數(shù)平滑法相結(jié)合,通過計算基本再生數(shù)R0預(yù)測值與真實值之間的殘差平方之和,即進(jìn)行估計與預(yù)測。本研究本研究所有計算和模型擬合過程均采用R語言(3.6.1版本)的deSolve包和sweep包來完成。
2.1 我國當(dāng)前NCP疫情的分析與預(yù)測表1列出了從2020年1月17日至2月18日我國NCP疫情發(fā)展過程中R0的具體數(shù)據(jù)。其中,R0的最大值為2.94,見于疫情初期(1月19日),隨后,R0呈波動下降的趨勢,至2月18日,達(dá)到本觀察期內(nèi)的最小值1.31(圖1),說明我國目前所采取的疫情防控措施是積極有效的。
表1 2020年1月17日至2月18日我國新型冠狀病毒肺炎疫情的基本再生數(shù)R0
圖1 2020年1月17日至2月18日我國新型冠狀病毒肺炎基本再生數(shù)的變化趨勢
圖2顯示了指數(shù)平滑法對我國NCP基本再生數(shù)R0未來趨勢的預(yù)測結(jié)果。依據(jù)目前的數(shù)據(jù)的預(yù)測結(jié)果顯示,大約在2月底,我國NCP疫情的基本再生數(shù)R0將回落到低于1的水平,預(yù)示著疫情可能迎來“拐點”,形勢正逐漸好轉(zhuǎn)。大約在3月中下旬,基本再生數(shù)R0將回落到低于0的水平,預(yù)示著疫情將走向消亡。
2.2 各省市NCP疫情發(fā)展趨勢的分析圖3展示了各?。ㄊ?、自治區(qū))NCP疫情基本再生數(shù)R0的變化趨勢。各?。ㄊ?、自治區(qū))NCP疫情基本再生數(shù)R0均在疫情初期達(dá)到最高值。作為疫情起源地,湖北省疫情初期的基本再生數(shù)R0最高(6.19),急劇下降到2的水平后,保持一個緩慢下降的趨勢,說明盡管湖北省所采取的一系列疫情防控措施取得了一定的效果,但現(xiàn)階段的防疫形勢仍有壓力。而湖北省以外的各?。ㄊ?、自治區(qū))的基本再生數(shù)R0在疫情初期達(dá)到峰值(2.43)之后,保持一個波動下降的趨勢,并且下降的速度較快。幾個累計確診病例數(shù)最多的省份,如廣東、河南、浙江,以及人口密度較大的地區(qū),如上海市,也保持一個波動下降的趨勢,說明這些省市在疫情早期所實施的防控措施已經(jīng)起到了效果。
圖2 我國新型冠狀病毒肺炎基本再生數(shù)的變化與預(yù)測
圖3 各?。ㄊ小⒆灾螀^(qū))新型冠狀病毒肺炎基本再生數(shù)的變化趨勢
本研究結(jié)果顯示,全國NCP基本再生數(shù)R0在疫情初期最高,為2.94,與Imai[8]的估算結(jié)果(2.8~3.3)相吻合,略低于美國東北大學(xué)的報告結(jié)果(3.2~3.9)[9],說明本研究的估算結(jié)果還是較為準(zhǔn)確的。與2003年同樣由冠狀病毒引起的SARS疫情相比,NCP疫情的基本再生數(shù)R0與之持平,說明NCP傳播能力與SARS相當(dāng),同樣屬于中等傳染能力的傳染性疾病。通常將基本再生數(shù)R0區(qū)間上限作為傳染病最大傳播力的參考參數(shù),很多已知傳染病的傳播能力都高于NCP,如寨卡病毒(1.4~6.6)[10],中東呼吸綜合癥(2.0~6.7)[11],天花(2.5~6.0)[12],故可認(rèn)為NCP并不具體特別突出的傳染能力。根據(jù)我國對抗SARS的經(jīng)驗,越早采取嚴(yán)格的防控措施越有利于盡早控制疫情。
作為疫情發(fā)源地,湖北省的基本再生數(shù)R0在全國各省(市,自治區(qū))中最高,并在疫情初期(1月中旬)達(dá)到峰值,并且傳播勢頭顯得比SARS還要兇猛,這是在無任何有效干預(yù)和防控手段的情況下疫情自然傳播的結(jié)果。自1月21日起,政府果斷采取各種防控措施,有效的遏制了NCP疫情的蔓延勢頭,基本再生數(shù)R0快速下降至2的水平,并維持波動下降的趨勢。從預(yù)測的結(jié)果來看,湖北省NCP疫情暴發(fā)在未來的一段時間內(nèi)仍繼續(xù)持續(xù),其可能的原因在于:①湖北當(dāng)?shù)氐尼t(yī)療資源嚴(yán)重不足,不能及時發(fā)現(xiàn)、收治和隔離已感染的患者,導(dǎo)致未能及時控制感染者人數(shù)(I);②將CT影像結(jié)果作為湖北省重災(zāi)區(qū)NCP“臨床診斷病例”的診斷依據(jù),在一定程度上增加了新增患者的例數(shù);③同樣具有傳播病毒能力的無癥狀感染者未及時就診,增加了傳播時間(C)。目前湖北省,尤其是武漢市,每天新增確診例數(shù)仍高達(dá)1600多例,說明此次疫情的傳染源仍未得到有效的控制。鑒于之前湖北省和武漢市醫(yī)療資源嚴(yán)重不足,許多感染者無法得到及時救治和隔離的情況,調(diào)動更多的資源支援疫情重災(zāi)區(qū),有利于集中力量撲滅疫情,防止疫情的進(jìn)一步蔓延。
與湖北省相比,其他省份的疫情防控形勢比較樂觀,基本再生數(shù)呈持續(xù)下降的趨勢,尤其是累計確診病例數(shù)最多的幾個省份。經(jīng)歷了SARS疫情之后,各地對付急性傳染病疫情有了更豐富的經(jīng)驗。如廣東省,從發(fā)現(xiàn)首輸入性病例到啟動重大突發(fā)公共衛(wèi)生事件Ⅰ級響應(yīng),僅僅不到一個月的時間;河南省采取的“硬核”防疫,2019年12月底已實行交通管制,21日起停止銷售活禽,新增130個定點醫(yī)院和525個發(fā)熱門診。本研究的結(jié)果也進(jìn)一步說了目前各省市所采取的防控措施是積極有效的,同時,也得益于民眾防范意識的提升以及十多年來我國醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)的進(jìn)步。
對于傳染病疫情的防控,關(guān)鍵在于快速將疾病再生數(shù)R0控制在1以下[13]。在傳染病動力學(xué)理論里,基本再生數(shù)R0取決于感染人群每天平均接觸的易感人數(shù)(k),傳染概率(b),以及可傳播的時間長度(C),其中k又與感染人群(I)和易感人群(S)的數(shù)量有密切關(guān)聯(lián)[14]?;诹餍胁W(xué)調(diào)查結(jié)果,我們對于新型冠狀病毒的傳播途徑有了更加清晰的認(rèn)識,包括空氣飛沫和氣溶膠傳播,接觸傳播以及可能的糞口傳播。目前政府所采取的各種防控措施,包括:集中收治和隔離感染者,可以有效減少感染人數(shù)(I);限制出行、取消聚會,減少人群的接觸幾率,可以有效減低感染者接觸易感者的數(shù)量(k);戴口罩、勤洗手,做好個人清潔衛(wèi)生,可以降低傳染概率(b);出現(xiàn)疑似癥狀或者與高危人群有密切接觸后,自行隔離或接受醫(yī)學(xué)觀察,可縮短傳播時間(C)。因此,繼續(xù)保持目前的防控手段不松懈,對控制疫情的發(fā)展是非常重要的。
需要警惕的是,由于節(jié)后“返工潮”的來臨,可能對各地NCP疫情的防控帶來巨大的壓力,尤其是勞務(wù)輸入性省市,包括廣東、浙江、上海等。為防止疫情的二次爆發(fā),積極落實早發(fā)現(xiàn)、早報告、早隔離、早治療是仍控制NCP疫情的首要手段。同時宣傳正確的生活習(xí)慣,注重個人衛(wèi)生,加強自我保護,包括正確佩戴口罩,正確洗手,合理膳食,適量運動,戒煙限酒,心理平衡;在到達(dá)目的地后,自覺在家隔離14 d,都將有助于控制疫情。
本研究的研究數(shù)據(jù)來源于公開數(shù)據(jù),僅考慮了已確診的和有癥狀的感染者,但在病例報告過程中可能存在漏報或報告不及時等情況,同時未涵蓋無癥狀感染者,所以我們的研究存在一定的局限性和信息偏倚,可能會導(dǎo)致基本再生數(shù)R0的估算結(jié)果不能真實反映疫情的實際情況。同時,本研究的假設(shè)相對較為理想,這可能會導(dǎo)致對預(yù)測結(jié)果造成一定的影響。
綜上所述,本文通過估計NCP疫情基本再生數(shù)R0,預(yù)測疫情未來的發(fā)展趨勢。結(jié)果表明,在現(xiàn)有的高效防控措施下,我國NCP疫情正逐步得到控制,但湖北省的防控形勢仍十分嚴(yán)峻。繼續(xù)保持目前的防控手段不松懈,對控制疫情的發(fā)展非常關(guān)鍵。同時,調(diào)動更多的資源支援疫情重災(zāi)區(qū)湖北省,有利于集中力量撲滅疫情,防止疫情的進(jìn)一步蔓延。